data_SMR-56662efdc8263ae3d3d67df254ab2251_5 _entry.id SMR-56662efdc8263ae3d3d67df254ab2251_5 _struct.entry_id SMR-56662efdc8263ae3d3d67df254ab2251_5 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q9BV73/ CP250_HUMAN, Centrosome-associated protein CEP250 Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q9BV73' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 325503.511 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP CP250_HUMAN Q9BV73 1 ;METRSPGLNNMKPQSLQLVLEEQVLALQQQMAENQAASWRKLKNSQEAQQRQATLVRKLQAKVLQYRSWC QELEKRLEATGGPIPQRWENVEEPNLDELLVRLEEEQQRCESLAEVNTQLRLHMEKADVVNKALREDVEK LTVDWSRARDELMRKESQWQMEQEFFKGYLKGEHGRLLSLWREVVTFRRHFLEMKSATDRDLMELKAEHV RLSGSLLTCCLRLTVGAQSREPNGSGRMDGREPAQLLLLLAKTQELEKEAHERSQELIQLKSQGDLEKAE LQDRVTELSALLTQSQKQNEDYEKMIKALRETVEILETNHTELMEHEASLSRNAQEEKLSLQQVIKDITQ VMVEEGDNIAQGSGHENSLELDSSIFSQFDYQDADKALTLVRSVLTRRRQAVQDLRQQLAGCQEAVNLLQ QQHDQWEEEGKALRQRLQKLTGERDTLAGQTVDLQGEVDSLSKERELLQKAREELRQQLEVLEQEAWRLR RVNVELQLQGDSAQGQKEEQQEELHLAVRERERLQEMLMGLEAKQSESLSELITLREALESSHLEGELLR QEQTEVTAALARAEQSIAELSSSENTLKTEVADLRAAAVKLSALNEALALDKVGLNQQLLQLEEENQSVC SRMEAAEQARNALQVDLAEAEKRREALWEKNTHLEAQLQKAEEAGAELQADLRDIQEEKEEIQKKLSESR HQQEAATTQLEQLHQEAKRQEEVLARAVQEKEALVREKAALEVRLQAVERDRQDLAEQLQGLSSAKELLE SSLFEAQQQNSVIEVTKGQLEVQIQTVTQAKEVIQGEVRCLKLELDTERSQAEQERDAAARQLAQAEQEG KTALEQQKAAHEKEVNQLREKWEKERSWHQQELAKALESLEREKMELEMRLKEQQTEMEAIQAQREEERT QAESALCQMQLETEKERVSLLETLLQTQKELADASQQLERLRQDMKVQKLKEQETTGILQTQLQEAQREL KEAARQHRDDLAALQEESSSLLQDKMDLQKQVEDLKSQLVAQDDSQRLVEQEVQEKLRETQEYNRIQKEL EREKASLTLSLMEKEQRLLVLQEADSIRQQELSALRQDMQEAQGEQKELSAQMELLRQEVKEKEADFLAQ EAQLLEELEASHITEQQLRASLWAQEAKAAQLQLRLRSTESQLEALAAEQQPGNQAQAQAQLASLYSALQ QALGSVCESRPELSGGGDSAPSVWGLEPDQNGARSLFKRGPLLTALSAEAVASALHKLHQDLWKTQQTRD VLRDQVQKLEERLTDTEAEKSQVHTELQDLQRQLSQNQEEKSKWEGKQNSLESELMELHETMASLQSRLR RAELQRMEAQGERELLQAAKENLTAQVEHLQAAVVEARAQASAAGILEEDLRTARSALKLKNEEVESERE RAQALQEQGELKVAQGKALQENLALLTQTLAEREEEVETLRGQIQELEKQREMQKAALELLSLDLKKRNQ EVDLQQEQIQELEKCRSVLEHLPMAVQEREQKLTVQREQIRELEKDRETQRNVLEHQLLELEKKDQMIES QRGQVQDLKKQLVTLECLALELEENHHKMECQQKLIKELEGQRETQRVALTHLTLDLEERSQELQAQSSQ IHDLESHSTVLARELQERDQEVKSQREQIEELQRQKEHLTQDLERRDQELMLQKERIQVLEDQRTRQTKI LEEDLEQIKLSLRERGRELTTQRQLMQERAEEGKGPSKAQRGSLEHMKLILRDKEKEVECQQEHIHELQE LKDQLEQQLQGLHRKVGETSLLLSQREQEIVVLQQQLQEAREQGELKEQSLQSQLDEAQRALAQRDQELE ALQQEQQQAQGQEERVKEKADALQGALEQAHMTLKERHGELQDHKEQARRLEEELAVEGRRVQALEEVLG DLRAESREQEKALLALQQQCAEQAQEHEVETRALQDSWLQAQAVLKERDQELEALRAESQSSRHQEEAAR ARAEALQEALGKAHAALQGKEQHLLEQAELSRSLEASTATLQASLDACQAHSRQLEEALRIQEGEIQDQD LRYQEDVQQLQQALAQRDEELRHQQEREQLLEKSLAQRVQENMIQEKQNLGQEREEEEIRGLHQSVRELQ LTLAQKEQEILELRETQQRNNLEALPHSHKTSPMEEQSLKLDSLEPRLQRELERLQAALRQTEAREIEWR EKAQDLALSLAQTKASVSSLQEVAMFLQASVLERDSEQQRLQDELELTRRALEKERLHSPGATSTAELGS RGEQGVQLGEVSGVEAEPSPDGMEKQSWRQRLEHLQQAVARLEIDRSRLQRHNVQLRSTLEQVERERRKL KREAMRAAQAGSLEISKATASSPTQQDGRGQKNSDAKCVAELQKEVVLLQAQLTLERKQKQDYITRSAQT SRELAGLHHSLSHSLLAVAQAPEATVLEAETRRLDESLTQSLTSPGPVLLHPSPSTTQAASR ; 'Centrosome-associated protein CEP250' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2442 1 2442 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . CP250_HUMAN Q9BV73 . 1 2442 9606 'Homo sapiens (Human)' 2003-05-09 BC2B8A36E07B8272 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no T ;METRSPGLNNMKPQSLQLVLEEQVLALQQQMAENQAASWRKLKNSQEAQQRQATLVRKLQAKVLQYRSWC QELEKRLEATGGPIPQRWENVEEPNLDELLVRLEEEQQRCESLAEVNTQLRLHMEKADVVNKALREDVEK LTVDWSRARDELMRKESQWQMEQEFFKGYLKGEHGRLLSLWREVVTFRRHFLEMKSATDRDLMELKAEHV RLSGSLLTCCLRLTVGAQSREPNGSGRMDGREPAQLLLLLAKTQELEKEAHERSQELIQLKSQGDLEKAE LQDRVTELSALLTQSQKQNEDYEKMIKALRETVEILETNHTELMEHEASLSRNAQEEKLSLQQVIKDITQ VMVEEGDNIAQGSGHENSLELDSSIFSQFDYQDADKALTLVRSVLTRRRQAVQDLRQQLAGCQEAVNLLQ QQHDQWEEEGKALRQRLQKLTGERDTLAGQTVDLQGEVDSLSKERELLQKAREELRQQLEVLEQEAWRLR RVNVELQLQGDSAQGQKEEQQEELHLAVRERERLQEMLMGLEAKQSESLSELITLREALESSHLEGELLR QEQTEVTAALARAEQSIAELSSSENTLKTEVADLRAAAVKLSALNEALALDKVGLNQQLLQLEEENQSVC 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A 1 2258 PRO 2258 ? ? ? T . A 1 2259 SER 2259 ? ? ? T . A 1 2260 PRO 2260 ? ? ? T . A 1 2261 ASP 2261 ? ? ? T . A 1 2262 GLY 2262 ? ? ? T . A 1 2263 MET 2263 ? ? ? T . A 1 2264 GLU 2264 ? ? ? T . A 1 2265 LYS 2265 ? ? ? T . A 1 2266 GLN 2266 ? ? ? T . A 1 2267 SER 2267 ? ? ? T . A 1 2268 TRP 2268 ? ? ? T . A 1 2269 ARG 2269 ? ? ? T . A 1 2270 GLN 2270 ? ? ? T . A 1 2271 ARG 2271 ? ? ? T . A 1 2272 LEU 2272 ? ? ? T . A 1 2273 GLU 2273 ? ? ? T . A 1 2274 HIS 2274 ? ? ? T . A 1 2275 LEU 2275 ? ? ? T . A 1 2276 GLN 2276 ? ? ? T . A 1 2277 GLN 2277 ? ? ? T . A 1 2278 ALA 2278 ? ? ? T . A 1 2279 VAL 2279 ? ? ? T . A 1 2280 ALA 2280 ? ? ? T . A 1 2281 ARG 2281 ? ? ? T . A 1 2282 LEU 2282 ? ? ? T . A 1 2283 GLU 2283 ? ? ? T . A 1 2284 ILE 2284 ? ? ? T . A 1 2285 ASP 2285 ? ? ? T . A 1 2286 ARG 2286 ? ? ? T . A 1 2287 SER 2287 ? ? ? T . A 1 2288 ARG 2288 ? ? ? T . A 1 2289 LEU 2289 ? ? ? T . A 1 2290 GLN 2290 ? ? ? T . A 1 2291 ARG 2291 ? ? ? T . A 1 2292 HIS 2292 ? ? ? T . A 1 2293 ASN 2293 ? ? ? T . A 1 2294 VAL 2294 ? ? ? T . A 1 2295 GLN 2295 ? ? ? T . A 1 2296 LEU 2296 ? ? ? T . A 1 2297 ARG 2297 ? ? ? T . A 1 2298 SER 2298 ? ? ? T . A 1 2299 THR 2299 ? ? ? T . A 1 2300 LEU 2300 ? ? ? T . A 1 2301 GLU 2301 ? ? ? T . A 1 2302 GLN 2302 ? ? ? T . A 1 2303 VAL 2303 ? ? ? T . A 1 2304 GLU 2304 ? ? ? T . A 1 2305 ARG 2305 ? ? ? T . A 1 2306 GLU 2306 ? ? ? T . A 1 2307 ARG 2307 ? ? ? T . A 1 2308 ARG 2308 ? ? ? T . A 1 2309 LYS 2309 ? ? ? T . A 1 2310 LEU 2310 ? ? ? T . A 1 2311 LYS 2311 ? ? ? T . A 1 2312 ARG 2312 ? ? ? T . A 1 2313 GLU 2313 ? ? ? T . A 1 2314 ALA 2314 ? ? ? T . A 1 2315 MET 2315 ? ? ? T . A 1 2316 ARG 2316 ? ? ? T . A 1 2317 ALA 2317 ? ? ? T . A 1 2318 ALA 2318 ? ? ? T . A 1 2319 GLN 2319 ? ? ? T . A 1 2320 ALA 2320 ? ? ? T . A 1 2321 GLY 2321 ? ? ? T . A 1 2322 SER 2322 ? ? ? T . A 1 2323 LEU 2323 ? ? ? T . A 1 2324 GLU 2324 ? ? ? T . A 1 2325 ILE 2325 ? ? ? T . A 1 2326 SER 2326 ? ? ? T . A 1 2327 LYS 2327 ? ? ? T . A 1 2328 ALA 2328 ? ? ? T . A 1 2329 THR 2329 ? ? ? T . A 1 2330 ALA 2330 ? ? ? T . A 1 2331 SER 2331 ? ? ? T . A 1 2332 SER 2332 ? ? ? T . A 1 2333 PRO 2333 ? ? ? T . A 1 2334 THR 2334 ? ? ? T . A 1 2335 GLN 2335 ? ? ? T . A 1 2336 GLN 2336 ? ? ? T . A 1 2337 ASP 2337 ? ? ? T . A 1 2338 GLY 2338 ? ? ? T . A 1 2339 ARG 2339 ? ? ? T . A 1 2340 GLY 2340 ? ? ? T . A 1 2341 GLN 2341 ? ? ? T . A 1 2342 LYS 2342 ? ? ? T . A 1 2343 ASN 2343 ? ? ? T . A 1 2344 SER 2344 ? ? ? T . A 1 2345 ASP 2345 ? ? ? T . A 1 2346 ALA 2346 ? ? ? T . A 1 2347 LYS 2347 ? ? ? T . A 1 2348 CYS 2348 ? ? ? T . A 1 2349 VAL 2349 ? ? ? T . A 1 2350 ALA 2350 ? ? ? T . A 1 2351 GLU 2351 ? ? ? T . A 1 2352 LEU 2352 ? ? ? T . A 1 2353 GLN 2353 ? ? ? T . A 1 2354 LYS 2354 ? ? ? T . A 1 2355 GLU 2355 ? ? ? T . A 1 2356 VAL 2356 ? ? ? T . A 1 2357 VAL 2357 ? ? ? T . A 1 2358 LEU 2358 ? ? ? T . A 1 2359 LEU 2359 ? ? ? T . A 1 2360 GLN 2360 ? ? ? T . A 1 2361 ALA 2361 ? ? ? T . A 1 2362 GLN 2362 ? ? ? T . A 1 2363 LEU 2363 ? ? ? T . A 1 2364 THR 2364 ? ? ? T . A 1 2365 LEU 2365 ? ? ? T . A 1 2366 GLU 2366 ? ? ? T . A 1 2367 ARG 2367 ? ? ? T . A 1 2368 LYS 2368 ? ? ? T . A 1 2369 GLN 2369 ? ? ? T . A 1 2370 LYS 2370 ? ? ? T . A 1 2371 GLN 2371 ? ? ? T . A 1 2372 ASP 2372 ? ? ? T . A 1 2373 TYR 2373 ? ? ? T . A 1 2374 ILE 2374 ? ? ? T . A 1 2375 THR 2375 ? ? ? T . A 1 2376 ARG 2376 ? ? ? T . A 1 2377 SER 2377 ? ? ? T . A 1 2378 ALA 2378 ? ? ? T . A 1 2379 GLN 2379 ? ? ? T . A 1 2380 THR 2380 ? ? ? T . A 1 2381 SER 2381 ? ? ? T . A 1 2382 ARG 2382 ? ? ? T . A 1 2383 GLU 2383 ? ? ? T . A 1 2384 LEU 2384 ? ? ? T . A 1 2385 ALA 2385 ? ? ? T . A 1 2386 GLY 2386 ? ? ? T . A 1 2387 LEU 2387 ? ? ? T . A 1 2388 HIS 2388 ? ? ? T . A 1 2389 HIS 2389 ? ? ? T . A 1 2390 SER 2390 ? ? ? T . A 1 2391 LEU 2391 ? ? ? T . A 1 2392 SER 2392 ? ? ? T . A 1 2393 HIS 2393 ? ? ? T . A 1 2394 SER 2394 ? ? ? T . A 1 2395 LEU 2395 ? ? ? T . A 1 2396 LEU 2396 ? ? ? T . A 1 2397 ALA 2397 ? ? ? T . A 1 2398 VAL 2398 ? ? ? T . A 1 2399 ALA 2399 ? ? ? T . A 1 2400 GLN 2400 ? ? ? T . A 1 2401 ALA 2401 ? ? ? T . A 1 2402 PRO 2402 ? ? ? T . A 1 2403 GLU 2403 ? ? ? T . A 1 2404 ALA 2404 ? ? ? T . A 1 2405 THR 2405 ? ? ? T . A 1 2406 VAL 2406 ? ? ? T . A 1 2407 LEU 2407 ? ? ? T . A 1 2408 GLU 2408 ? ? ? T . A 1 2409 ALA 2409 ? ? ? T . A 1 2410 GLU 2410 ? ? ? T . A 1 2411 THR 2411 ? ? ? T . A 1 2412 ARG 2412 ? ? ? T . A 1 2413 ARG 2413 ? ? ? T . A 1 2414 LEU 2414 ? ? ? T . A 1 2415 ASP 2415 ? ? ? T . A 1 2416 GLU 2416 ? ? ? T . A 1 2417 SER 2417 ? ? ? T . A 1 2418 LEU 2418 ? ? ? T . A 1 2419 THR 2419 ? ? ? T . A 1 2420 GLN 2420 ? ? ? T . A 1 2421 SER 2421 ? ? ? T . A 1 2422 LEU 2422 ? ? ? T . A 1 2423 THR 2423 ? ? ? T . A 1 2424 SER 2424 ? ? ? T . A 1 2425 PRO 2425 ? ? ? T . A 1 2426 GLY 2426 ? ? ? T . A 1 2427 PRO 2427 ? ? ? T . A 1 2428 VAL 2428 ? ? ? T . A 1 2429 LEU 2429 ? ? ? T . A 1 2430 LEU 2430 ? ? ? T . A 1 2431 HIS 2431 ? ? ? T . A 1 2432 PRO 2432 ? ? ? T . A 1 2433 SER 2433 ? ? ? T . A 1 2434 PRO 2434 ? ? ? T . A 1 2435 SER 2435 ? ? ? T . A 1 2436 THR 2436 ? ? ? T . A 1 2437 THR 2437 ? ? ? T . A 1 2438 GLN 2438 ? ? ? T . A 1 2439 ALA 2439 ? ? ? T . A 1 2440 ALA 2440 ? ? ? T . A 1 2441 SER 2441 ? ? ? T . A 1 2442 ARG 2442 ? ? ? T . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Tropomyosin alpha-1 chain {PDB ID=7utl, label_asym_id=T, auth_asym_id=b, SMTL ID=7utl.1.T}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 7utl, label_asym_id=T' 'target-template alignment' . 4 'model 5' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-04 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-29 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A T 2 1 b # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MDAIKKKMQMLKLDKENALDRAEQAEADKKAAEDRSKQLEDELVSLQKKLKGTEDELDKYSEALKDAQEK LELAEKKATDAEADVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIESRAQKDEEK MEIQEIQLKEAKHIAEDADRKYEEVARKLVIIESDLERAEERAELSEGKCAELEEELKTVTNNLKSLEAQ AEKYSQKEDRYEEEIKVLSDKLKEAETRAEFAERSVTKLEKSIDDLEDELYAQKLKYKAISEELDHALND MTSI ; ;MDAIKKKMQMLKLDKENALDRAEQAEADKKAAEDRSKQLEDELVSLQKKLKGTEDELDKYSEALKDAQEK LELAEKKATDAEADVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIESRAQKDEEK MEIQEIQLKEAKHIAEDADRKYEEVARKLVIIESDLERAEERAELSEGKCAELEEELKTVTNNLKSLEAQ AEKYSQKEDRYEEEIKVLSDKLKEAETRAEFAERSVTKLEKSIDDLEDELYAQKLKYKAISEELDHALND MTSI ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 112 282 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 7utl 2022-09-21 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2442 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2442 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 5.3e-06 18.713 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 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2 1 2 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# # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.216}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 7utl.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 5' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . 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A 193.948 203.886 281.509 1 1 T SER 0.730 1 ATOM 964 C CB . SER 764 764 ? A 194.057 206.070 279.102 1 1 T SER 0.730 1 ATOM 965 O OG . SER 764 764 ? A 194.918 206.456 278.033 1 1 T SER 0.730 1 ATOM 966 N N . ALA 765 765 ? A 191.946 204.247 280.569 1 1 T ALA 0.780 1 ATOM 967 C CA . ALA 765 765 ? A 191.179 203.783 281.711 1 1 T ALA 0.780 1 ATOM 968 C C . ALA 765 765 ? A 191.424 202.302 282.026 1 1 T ALA 0.780 1 ATOM 969 O O . ALA 765 765 ? A 191.598 201.937 283.180 1 1 T ALA 0.780 1 ATOM 970 C CB . ALA 765 765 ? A 189.669 204.049 281.505 1 1 T ALA 0.780 1 ATOM 971 N N . LYS 766 766 ? A 191.500 201.416 281.008 1 1 T LYS 0.730 1 ATOM 972 C CA . LYS 766 766 ? A 191.812 200.001 281.185 1 1 T LYS 0.730 1 ATOM 973 C C . LYS 766 766 ? A 193.182 199.731 281.797 1 1 T LYS 0.730 1 ATOM 974 O O . LYS 766 766 ? A 193.275 198.971 282.755 1 1 T LYS 0.730 1 ATOM 975 C CB . LYS 766 766 ? A 191.658 199.201 279.867 1 1 T LYS 0.730 1 ATOM 976 C CG . LYS 766 766 ? 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'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.780 2 1 3 0 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 646 ASP 1 0.640 2 1 A 647 LEU 1 0.650 3 1 A 648 ALA 1 0.720 4 1 A 649 GLU 1 0.700 5 1 A 650 ALA 1 0.780 6 1 A 651 GLU 1 0.740 7 1 A 652 LYS 1 0.770 8 1 A 653 ARG 1 0.730 9 1 A 654 ARG 1 0.720 10 1 A 655 GLU 1 0.770 11 1 A 656 ALA 1 0.830 12 1 A 657 LEU 1 0.750 13 1 A 658 TRP 1 0.670 14 1 A 659 GLU 1 0.740 15 1 A 660 LYS 1 0.740 16 1 A 661 ASN 1 0.740 17 1 A 662 THR 1 0.760 18 1 A 663 HIS 1 0.710 19 1 A 664 LEU 1 0.760 20 1 A 665 GLU 1 0.770 21 1 A 666 ALA 1 0.840 22 1 A 667 GLN 1 0.790 23 1 A 668 LEU 1 0.790 24 1 A 669 GLN 1 0.810 25 1 A 670 LYS 1 0.790 26 1 A 671 ALA 1 0.840 27 1 A 672 GLU 1 0.780 28 1 A 673 GLU 1 0.790 29 1 A 674 ALA 1 0.850 30 1 A 675 GLY 1 0.830 31 1 A 676 ALA 1 0.840 32 1 A 677 GLU 1 0.770 33 1 A 678 LEU 1 0.770 34 1 A 679 GLN 1 0.770 35 1 A 680 ALA 1 0.840 36 1 A 681 ASP 1 0.770 37 1 A 682 LEU 1 0.780 38 1 A 683 ARG 1 0.760 39 1 A 684 ASP 1 0.810 40 1 A 685 ILE 1 0.800 41 1 A 686 GLN 1 0.840 42 1 A 687 GLU 1 0.850 43 1 A 688 GLU 1 0.850 44 1 A 689 LYS 1 0.850 45 1 A 690 GLU 1 0.880 46 1 A 691 GLU 1 0.880 47 1 A 692 ILE 1 0.870 48 1 A 693 GLN 1 0.870 49 1 A 694 LYS 1 0.860 50 1 A 695 LYS 1 0.850 51 1 A 696 LEU 1 0.830 52 1 A 697 SER 1 0.840 53 1 A 698 GLU 1 0.820 54 1 A 699 SER 1 0.840 55 1 A 700 ARG 1 0.760 56 1 A 701 HIS 1 0.770 57 1 A 702 GLN 1 0.810 58 1 A 703 GLN 1 0.800 59 1 A 704 GLU 1 0.790 60 1 A 705 ALA 1 0.840 61 1 A 706 ALA 1 0.840 62 1 A 707 THR 1 0.800 63 1 A 708 THR 1 0.810 64 1 A 709 GLN 1 0.780 65 1 A 710 LEU 1 0.780 66 1 A 711 GLU 1 0.800 67 1 A 712 GLN 1 0.810 68 1 A 713 LEU 1 0.810 69 1 A 714 HIS 1 0.770 70 1 A 715 GLN 1 0.820 71 1 A 716 GLU 1 0.820 72 1 A 717 ALA 1 0.880 73 1 A 718 LYS 1 0.830 74 1 A 719 ARG 1 0.790 75 1 A 720 GLN 1 0.830 76 1 A 721 GLU 1 0.840 77 1 A 722 GLU 1 0.850 78 1 A 723 VAL 1 0.860 79 1 A 724 LEU 1 0.810 80 1 A 725 ALA 1 0.870 81 1 A 726 ARG 1 0.760 82 1 A 727 ALA 1 0.860 83 1 A 728 VAL 1 0.810 84 1 A 729 GLN 1 0.790 85 1 A 730 GLU 1 0.790 86 1 A 731 LYS 1 0.790 87 1 A 732 GLU 1 0.790 88 1 A 733 ALA 1 0.860 89 1 A 734 LEU 1 0.800 90 1 A 735 VAL 1 0.810 91 1 A 736 ARG 1 0.740 92 1 A 737 GLU 1 0.790 93 1 A 738 LYS 1 0.800 94 1 A 739 ALA 1 0.840 95 1 A 740 ALA 1 0.850 96 1 A 741 LEU 1 0.790 97 1 A 742 GLU 1 0.800 98 1 A 743 VAL 1 0.800 99 1 A 744 ARG 1 0.730 100 1 A 745 LEU 1 0.780 101 1 A 746 GLN 1 0.790 102 1 A 747 ALA 1 0.840 103 1 A 748 VAL 1 0.800 104 1 A 749 GLU 1 0.790 105 1 A 750 ARG 1 0.750 106 1 A 751 ASP 1 0.790 107 1 A 752 ARG 1 0.740 108 1 A 753 GLN 1 0.810 109 1 A 754 ASP 1 0.810 110 1 A 755 LEU 1 0.790 111 1 A 756 ALA 1 0.850 112 1 A 757 GLU 1 0.780 113 1 A 758 GLN 1 0.760 114 1 A 759 LEU 1 0.740 115 1 A 760 GLN 1 0.730 116 1 A 761 GLY 1 0.770 117 1 A 762 LEU 1 0.710 118 1 A 763 SER 1 0.740 119 1 A 764 SER 1 0.730 120 1 A 765 ALA 1 0.780 121 1 A 766 LYS 1 0.730 122 1 A 767 GLU 1 0.730 123 1 A 768 LEU 1 0.730 124 1 A 769 LEU 1 0.740 125 1 A 770 GLU 1 0.750 126 1 A 771 SER 1 0.780 127 1 A 772 SER 1 0.800 128 1 A 773 LEU 1 0.770 129 1 A 774 PHE 1 0.750 130 1 A 775 GLU 1 0.780 131 1 A 776 ALA 1 0.850 132 1 A 777 GLN 1 0.780 133 1 A 778 GLN 1 0.780 134 1 A 779 GLN 1 0.780 135 1 A 780 ASN 1 0.770 136 1 A 781 SER 1 0.770 137 1 A 782 VAL 1 0.780 138 1 A 783 ILE 1 0.740 139 1 A 784 GLU 1 0.740 140 1 A 785 VAL 1 0.770 141 1 A 786 THR 1 0.760 142 1 A 787 LYS 1 0.750 143 1 A 788 GLY 1 0.790 144 1 A 789 GLN 1 0.750 145 1 A 790 LEU 1 0.750 146 1 A 791 GLU 1 0.750 147 1 A 792 VAL 1 0.770 148 1 A 793 GLN 1 0.740 149 1 A 794 ILE 1 0.750 150 1 A 795 GLN 1 0.750 151 1 A 796 THR 1 0.750 152 1 A 797 VAL 1 0.770 153 1 A 798 THR 1 0.760 154 1 A 799 GLN 1 0.740 155 1 A 800 ALA 1 0.770 156 1 A 801 LYS 1 0.720 157 1 A 802 GLU 1 0.720 158 1 A 803 VAL 1 0.740 159 1 A 804 ILE 1 0.720 160 1 A 805 GLN 1 0.730 161 1 A 806 GLY 1 0.790 162 1 A 807 GLU 1 0.750 163 1 A 808 VAL 1 0.770 164 1 A 809 ARG 1 0.710 165 1 A 810 CYS 1 0.740 166 1 A 811 LEU 1 0.740 167 1 A 812 LYS 1 0.730 168 1 A 813 LEU 1 0.710 169 1 A 814 GLU 1 0.700 170 1 A 815 LEU 1 0.600 171 1 A 816 ASP 1 0.530 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #