data_SMR-56662efdc8263ae3d3d67df254ab2251_12 _entry.id SMR-56662efdc8263ae3d3d67df254ab2251_12 _struct.entry_id SMR-56662efdc8263ae3d3d67df254ab2251_12 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q9BV73/ CP250_HUMAN, Centrosome-associated protein CEP250 Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q9BV73' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 325503.511 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP CP250_HUMAN Q9BV73 1 ;METRSPGLNNMKPQSLQLVLEEQVLALQQQMAENQAASWRKLKNSQEAQQRQATLVRKLQAKVLQYRSWC QELEKRLEATGGPIPQRWENVEEPNLDELLVRLEEEQQRCESLAEVNTQLRLHMEKADVVNKALREDVEK LTVDWSRARDELMRKESQWQMEQEFFKGYLKGEHGRLLSLWREVVTFRRHFLEMKSATDRDLMELKAEHV RLSGSLLTCCLRLTVGAQSREPNGSGRMDGREPAQLLLLLAKTQELEKEAHERSQELIQLKSQGDLEKAE LQDRVTELSALLTQSQKQNEDYEKMIKALRETVEILETNHTELMEHEASLSRNAQEEKLSLQQVIKDITQ VMVEEGDNIAQGSGHENSLELDSSIFSQFDYQDADKALTLVRSVLTRRRQAVQDLRQQLAGCQEAVNLLQ QQHDQWEEEGKALRQRLQKLTGERDTLAGQTVDLQGEVDSLSKERELLQKAREELRQQLEVLEQEAWRLR RVNVELQLQGDSAQGQKEEQQEELHLAVRERERLQEMLMGLEAKQSESLSELITLREALESSHLEGELLR QEQTEVTAALARAEQSIAELSSSENTLKTEVADLRAAAVKLSALNEALALDKVGLNQQLLQLEEENQSVC SRMEAAEQARNALQVDLAEAEKRREALWEKNTHLEAQLQKAEEAGAELQADLRDIQEEKEEIQKKLSESR HQQEAATTQLEQLHQEAKRQEEVLARAVQEKEALVREKAALEVRLQAVERDRQDLAEQLQGLSSAKELLE SSLFEAQQQNSVIEVTKGQLEVQIQTVTQAKEVIQGEVRCLKLELDTERSQAEQERDAAARQLAQAEQEG KTALEQQKAAHEKEVNQLREKWEKERSWHQQELAKALESLEREKMELEMRLKEQQTEMEAIQAQREEERT QAESALCQMQLETEKERVSLLETLLQTQKELADASQQLERLRQDMKVQKLKEQETTGILQTQLQEAQREL KEAARQHRDDLAALQEESSSLLQDKMDLQKQVEDLKSQLVAQDDSQRLVEQEVQEKLRETQEYNRIQKEL EREKASLTLSLMEKEQRLLVLQEADSIRQQELSALRQDMQEAQGEQKELSAQMELLRQEVKEKEADFLAQ EAQLLEELEASHITEQQLRASLWAQEAKAAQLQLRLRSTESQLEALAAEQQPGNQAQAQAQLASLYSALQ QALGSVCESRPELSGGGDSAPSVWGLEPDQNGARSLFKRGPLLTALSAEAVASALHKLHQDLWKTQQTRD VLRDQVQKLEERLTDTEAEKSQVHTELQDLQRQLSQNQEEKSKWEGKQNSLESELMELHETMASLQSRLR RAELQRMEAQGERELLQAAKENLTAQVEHLQAAVVEARAQASAAGILEEDLRTARSALKLKNEEVESERE RAQALQEQGELKVAQGKALQENLALLTQTLAEREEEVETLRGQIQELEKQREMQKAALELLSLDLKKRNQ EVDLQQEQIQELEKCRSVLEHLPMAVQEREQKLTVQREQIRELEKDRETQRNVLEHQLLELEKKDQMIES QRGQVQDLKKQLVTLECLALELEENHHKMECQQKLIKELEGQRETQRVALTHLTLDLEERSQELQAQSSQ IHDLESHSTVLARELQERDQEVKSQREQIEELQRQKEHLTQDLERRDQELMLQKERIQVLEDQRTRQTKI LEEDLEQIKLSLRERGRELTTQRQLMQERAEEGKGPSKAQRGSLEHMKLILRDKEKEVECQQEHIHELQE LKDQLEQQLQGLHRKVGETSLLLSQREQEIVVLQQQLQEAREQGELKEQSLQSQLDEAQRALAQRDQELE ALQQEQQQAQGQEERVKEKADALQGALEQAHMTLKERHGELQDHKEQARRLEEELAVEGRRVQALEEVLG DLRAESREQEKALLALQQQCAEQAQEHEVETRALQDSWLQAQAVLKERDQELEALRAESQSSRHQEEAAR ARAEALQEALGKAHAALQGKEQHLLEQAELSRSLEASTATLQASLDACQAHSRQLEEALRIQEGEIQDQD LRYQEDVQQLQQALAQRDEELRHQQEREQLLEKSLAQRVQENMIQEKQNLGQEREEEEIRGLHQSVRELQ LTLAQKEQEILELRETQQRNNLEALPHSHKTSPMEEQSLKLDSLEPRLQRELERLQAALRQTEAREIEWR EKAQDLALSLAQTKASVSSLQEVAMFLQASVLERDSEQQRLQDELELTRRALEKERLHSPGATSTAELGS RGEQGVQLGEVSGVEAEPSPDGMEKQSWRQRLEHLQQAVARLEIDRSRLQRHNVQLRSTLEQVERERRKL KREAMRAAQAGSLEISKATASSPTQQDGRGQKNSDAKCVAELQKEVVLLQAQLTLERKQKQDYITRSAQT SRELAGLHHSLSHSLLAVAQAPEATVLEAETRRLDESLTQSLTSPGPVLLHPSPSTTQAASR ; 'Centrosome-associated protein CEP250' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2442 1 2442 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . CP250_HUMAN Q9BV73 . 1 2442 9606 'Homo sapiens (Human)' 2003-05-09 BC2B8A36E07B8272 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no 1 ;METRSPGLNNMKPQSLQLVLEEQVLALQQQMAENQAASWRKLKNSQEAQQRQATLVRKLQAKVLQYRSWC QELEKRLEATGGPIPQRWENVEEPNLDELLVRLEEEQQRCESLAEVNTQLRLHMEKADVVNKALREDVEK LTVDWSRARDELMRKESQWQMEQEFFKGYLKGEHGRLLSLWREVVTFRRHFLEMKSATDRDLMELKAEHV RLSGSLLTCCLRLTVGAQSREPNGSGRMDGREPAQLLLLLAKTQELEKEAHERSQELIQLKSQGDLEKAE LQDRVTELSALLTQSQKQNEDYEKMIKALRETVEILETNHTELMEHEASLSRNAQEEKLSLQQVIKDITQ VMVEEGDNIAQGSGHENSLELDSSIFSQFDYQDADKALTLVRSVLTRRRQAVQDLRQQLAGCQEAVNLLQ QQHDQWEEEGKALRQRLQKLTGERDTLAGQTVDLQGEVDSLSKERELLQKAREELRQQLEVLEQEAWRLR RVNVELQLQGDSAQGQKEEQQEELHLAVRERERLQEMLMGLEAKQSESLSELITLREALESSHLEGELLR QEQTEVTAALARAEQSIAELSSSENTLKTEVADLRAAAVKLSALNEALALDKVGLNQQLLQLEEENQSVC 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# loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A BA 6 1 U # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MAGSSSLEAVRRKIRSLQEQADAAEERAGTLQRELDYERKLRETAEADVASLNRRIQLVEEELDRAQERL ATALQKLEEAEKAADESERGMKVIESRAQKDEEKMEIQEIQLKEAKHIAEDADRKYEEVARKLVIIESDL ERAEERAELSEGQVRQLEEQLRIMDQTLKALMAAEDKYSQKEDKYEEEIKVLSDKLKEAETRAEFAERSV TKLEKSIDDLEEKVAHAKEENLSMHQMLDQTLLELNNM ; ;MAGSSSLEAVRRKIRSLQEQADAAEERAGTLQRELDYERKLRETAEADVASLNRRIQLVEEELDRAQERL ATALQKLEEAEKAADESERGMKVIESRAQKDEEKMEIQEIQLKEAKHIAEDADRKYEEVARKLVIIESDL ERAEERAELSEGQVRQLEEQLRIMDQTLKALMAAEDKYSQKEDKYEEEIKVLSDKLKEAETRAEFAERSV TKLEKSIDDLEEKVAHAKEENLSMHQMLDQTLLELNNM ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 5 165 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8iai 2024-07-03 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2442 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2442 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 0.001 13.665 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 METRSPGLNNMKPQSLQLVLEEQVLALQQQMAENQAASWRKLKNSQEAQQRQATLVRKLQAKVLQYRSWCQELEKRLEATGGPIPQRWENVEEPNLDELLVRLEEEQQRCESLAEVNTQLRLHMEKADVVNKALREDVEKLTVDWSRARDELMRKESQWQMEQEFFKGYLKGEHGRLLSLWREVVTFRRHFLEMKSATDRDLMELKAEHVRLSGSLLTCCLRLTVGAQSREPNGSGRMDGREPAQLLLLLAKTQELEKEAHERSQELIQLKSQGDLEKAELQDRVTELSALLTQSQKQNEDYEKMIKALRETVEILETNHTELMEHEASLSRNAQEEKLSLQQVIKDITQVMVEEGDNIAQGSGHENSLELDSSIFSQFDYQDADKALTLVRSVLTRRRQAVQDLRQQLAGCQEAVNLLQQQHDQWEEEGKALRQRLQKLTGERDTLAGQTVDLQGEVDSLSKERELLQKAREELRQQLEVLEQEAWRLRRVNVELQLQGDSAQGQKEEQQEELHLAVRERERLQEMLMGLEAKQSESLSELITLREALESSHLEGELLRQEQTEVTAALARAEQSIAELSSSENTLKTEVADLRAAAVKLSALNEALALDKVGLNQQLLQLEEENQSVCSRMEAAEQARNALQVDLAEAEKRREALWEKNTHLEAQLQKAEEAGAELQADLRDIQEEKEEIQKKLSESRHQQEAATTQLEQLHQEAKRQEEVLARAVQEKEALVREKAALEVRLQAVERDRQDLAEQLQGLSSAKELLESSLFEAQQQNSVIEVTKGQLEVQIQTVTQAKEVIQGEVRCLKLELDTERSQAEQERDAAARQLAQAEQEGKTALEQQKAAHEKEVNQLREKWEKERSWHQQELAKALESLEREKMELEMRLKEQQTEMEAIQAQREEERTQAESALCQMQLETEKERVSLLETLLQTQKELADASQQLERLRQDMKVQKLKEQETTGILQTQLQEAQRELKEAARQHRDDLAALQEESSSLLQDKMDLQKQVEDLKSQLVAQDDSQRLVEQEVQEKLRETQEYNRIQKELEREKASLTLSLMEKEQRLLVLQEADSIRQQELSALRQDMQEAQGEQKELSAQMELLRQEVKEKEADFLAQEAQLLEELEASHITEQQLRASLWAQEAKAAQLQLRLRSTESQLEALAAEQQPGNQAQAQAQLASLYSALQQALGSVCESRPELSGGGDSAPSVWGLEPDQNGARSLFKRGPLLTALSAEAVASALHKLHQDLWKTQQTRDVLRDQVQKLEERLTDTEAEKSQVHTELQDLQRQLSQNQEEKSKWEGKQNSLESELMELHETMASLQSRLRRAELQRMEAQGERELLQAAKENLTAQVEHLQAAVVEARAQASAAGILEEDLRTARSALKLKNEEVESERERAQALQEQGELKVAQGKALQENLALLTQTLAEREEEVETLRGQIQELEKQREMQKAALELLSLDLKKRNQEVDLQQEQIQELEKCRSVLEHLPMAVQEREQKLTVQREQIRELEKDRETQRNVLEHQLLELEKKDQMIESQRGQVQDLKKQLVTLECLALELEENHHKMECQQKLIKELEGQRETQRVALTHLTLDLEERSQELQAQSSQIHDLESHSTVLARELQERDQEVKSQREQIEELQRQKEHLTQDLERRDQELMLQKERIQVLEDQRTRQTKILEEDLEQIKLSLRERGRELTTQRQLMQERAEEGKGPSKAQRGSLEHMKLILRDKEKEVECQQEHIHELQELKDQLEQQLQGLHRKVGETSLLLSQREQEIVVLQQQLQEAREQGELKEQSLQSQLDEAQRALAQRDQELEALQQEQQQAQGQEERVKEKADALQGALEQAHMTLKERHGELQDHKEQARRLEEELAVEGRRVQALEEVLGDLRAESREQEKALLALQQQCAEQAQEHEVETRALQDSWLQAQAVLKERDQELEALRAESQSSRHQEEAARARAEALQEALGKAHAALQGKEQHLLEQAELSRSLEASTATLQASLDACQAHSRQLEEALRIQEGEIQDQDLRYQEDVQQLQQALAQRDEELRHQQEREQLLEKSLAQRVQENMIQEKQNLGQEREEEEIRGLHQSVRELQLTLAQKEQEILELRETQQRNNLEALPHSHKTSPMEEQSLKLDSLEPRLQRELERLQAALRQTEAREIEWREKAQDLALSLAQTKASVSSLQEVAMFLQASVLERDSEQQRLQDELELTRRALEKERLHSPGATSTAELGSRGEQGVQLGEVSGVEAEPSPDGMEKQSWRQRLEHLQQAVARLEIDRSRLQRHNVQLRSTLEQVERERRKLKREAMRAAQAGSLEISKATASSPTQQDGRGQKNSDAKCVAELQKEVVLLQAQLTLERKQKQDYITRSAQTSRELAGLHHSLSHSLLAVAQAPEATVLEAETRRLDESLTQSLTSPGPVLLHPSPSTTQAASR 2 1 2 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------SSLEAVRRKIRSLQEQADAAEERAGTLQRELDYERKLRETAEADVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIESRAQKDEEKMEIQEIQLKEAKHIAEDADRKYEEVARKLVIIESDLERAEERAELSEGQVRQLEEQLRIMD------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8iai.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 12' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . LYS 386 386 ? A 300.211 331.831 502.901 1 1 1 LYS 0.450 1 ATOM 2 C CA . LYS 386 386 ? A 299.991 331.913 501.411 1 1 1 LYS 0.450 1 ATOM 3 C C . LYS 386 386 ? A 299.301 333.183 500.937 1 1 1 LYS 0.450 1 ATOM 4 O O . LYS 386 386 ? A 299.831 333.845 500.071 1 1 1 LYS 0.450 1 ATOM 5 C CB . LYS 386 386 ? A 299.288 330.637 500.876 1 1 1 LYS 0.450 1 ATOM 6 C CG . LYS 386 386 ? A 300.149 329.366 501.019 1 1 1 LYS 0.450 1 ATOM 7 C CD . LYS 386 386 ? A 299.438 328.094 500.516 1 1 1 LYS 0.450 1 ATOM 8 C CE . LYS 386 386 ? A 300.292 326.824 500.667 1 1 1 LYS 0.450 1 ATOM 9 N NZ . LYS 386 386 ? A 299.540 325.625 500.226 1 1 1 LYS 0.450 1 ATOM 10 N N . ALA 387 387 ? A 298.147 333.584 501.547 1 1 1 ALA 0.580 1 ATOM 11 C CA . ALA 387 387 ? A 297.390 334.763 501.142 1 1 1 ALA 0.580 1 ATOM 12 C C . ALA 387 387 ? A 298.212 336.055 501.096 1 1 1 ALA 0.580 1 ATOM 13 O O . ALA 387 387 ? A 298.148 336.794 500.121 1 1 1 ALA 0.580 1 ATOM 14 C CB . ALA 387 387 ? A 296.186 334.905 502.102 1 1 1 ALA 0.580 1 ATOM 15 N N . LEU 388 388 ? A 299.086 336.310 502.100 1 1 1 LEU 0.650 1 ATOM 16 C CA . LEU 388 388 ? A 299.999 337.446 502.085 1 1 1 LEU 0.650 1 ATOM 17 C C . LEU 388 388 ? A 300.916 337.494 500.877 1 1 1 LEU 0.650 1 ATOM 18 O O . LEU 388 388 ? A 300.999 338.507 500.194 1 1 1 LEU 0.650 1 ATOM 19 C CB . LEU 388 388 ? A 300.917 337.412 503.332 1 1 1 LEU 0.650 1 ATOM 20 C CG . LEU 388 388 ? A 300.220 337.772 504.654 1 1 1 LEU 0.650 1 ATOM 21 C CD1 . LEU 388 388 ? A 301.207 337.597 505.819 1 1 1 LEU 0.650 1 ATOM 22 C CD2 . LEU 388 388 ? A 299.689 339.215 504.631 1 1 1 LEU 0.650 1 ATOM 23 N N . THR 389 389 ? A 301.583 336.372 500.550 1 1 1 THR 0.660 1 ATOM 24 C CA . THR 389 389 ? A 302.422 336.200 499.366 1 1 1 THR 0.660 1 ATOM 25 C C . THR 389 389 ? A 301.652 336.397 498.076 1 1 1 THR 0.660 1 ATOM 26 O O . THR 389 389 ? A 302.120 337.081 497.175 1 1 1 THR 0.660 1 ATOM 27 C CB . THR 389 389 ? A 303.127 334.853 499.349 1 1 1 THR 0.660 1 ATOM 28 O OG1 . THR 389 389 ? A 303.878 334.699 500.552 1 1 1 THR 0.660 1 ATOM 29 C CG2 . THR 389 389 ? A 304.125 334.730 498.188 1 1 1 THR 0.660 1 ATOM 30 N N . LEU 390 390 ? A 300.413 335.867 497.977 1 1 1 LEU 0.670 1 ATOM 31 C CA . LEU 390 390 ? A 299.527 336.119 496.848 1 1 1 LEU 0.670 1 ATOM 32 C C . LEU 390 390 ? A 299.197 337.597 496.657 1 1 1 LEU 0.670 1 ATOM 33 O O . LEU 390 390 ? A 299.273 338.104 495.541 1 1 1 LEU 0.670 1 ATOM 34 C CB . LEU 390 390 ? A 298.215 335.307 496.972 1 1 1 LEU 0.670 1 ATOM 35 C CG . LEU 390 390 ? A 298.396 333.779 496.851 1 1 1 LEU 0.670 1 ATOM 36 C CD1 . LEU 390 390 ? A 297.080 333.067 497.206 1 1 1 LEU 0.670 1 ATOM 37 C CD2 . LEU 390 390 ? A 298.882 333.358 495.451 1 1 1 LEU 0.670 1 ATOM 38 N N . VAL 391 391 ? A 298.904 338.341 497.749 1 1 1 VAL 0.730 1 ATOM 39 C CA . VAL 391 391 ? A 298.717 339.792 497.720 1 1 1 VAL 0.730 1 ATOM 40 C C . VAL 391 391 ? A 299.958 340.515 497.197 1 1 1 VAL 0.730 1 ATOM 41 O O . VAL 391 391 ? A 299.857 341.382 496.328 1 1 1 VAL 0.730 1 ATOM 42 C CB . VAL 391 391 ? A 298.292 340.345 499.087 1 1 1 VAL 0.730 1 ATOM 43 C CG1 . VAL 391 391 ? A 298.270 341.892 499.117 1 1 1 VAL 0.730 1 ATOM 44 C CG2 . VAL 391 391 ? A 296.883 339.808 499.418 1 1 1 VAL 0.730 1 ATOM 45 N N . ARG 392 392 ? A 301.176 340.116 497.648 1 1 1 ARG 0.680 1 ATOM 46 C CA . ARG 392 392 ? A 302.443 340.630 497.127 1 1 1 ARG 0.680 1 ATOM 47 C C . ARG 392 392 ? A 302.594 340.375 495.632 1 1 1 ARG 0.680 1 ATOM 48 O O . ARG 392 392 ? A 302.929 341.279 494.871 1 1 1 ARG 0.680 1 ATOM 49 C CB . ARG 392 392 ? A 303.695 340.023 497.834 1 1 1 ARG 0.680 1 ATOM 50 C CG . ARG 392 392 ? A 304.125 340.705 499.154 1 1 1 ARG 0.680 1 ATOM 51 C CD . ARG 392 392 ? A 303.245 340.383 500.359 1 1 1 ARG 0.680 1 ATOM 52 N NE . ARG 392 392 ? A 303.865 340.970 501.593 1 1 1 ARG 0.680 1 ATOM 53 C CZ . ARG 392 392 ? 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A 297.787 340.685 493.373 1 1 1 VAL 0.800 1 ATOM 67 C CG1 . VAL 394 394 ? A 296.806 341.717 492.764 1 1 1 VAL 0.800 1 ATOM 68 C CG2 . VAL 394 394 ? A 297.182 339.276 493.221 1 1 1 VAL 0.800 1 ATOM 69 N N . LEU 395 395 ? A 300.228 342.692 493.695 1 1 1 LEU 0.770 1 ATOM 70 C CA . LEU 395 395 ? A 300.835 344.014 493.715 1 1 1 LEU 0.770 1 ATOM 71 C C . LEU 395 395 ? A 302.013 344.151 492.767 1 1 1 LEU 0.770 1 ATOM 72 O O . LEU 395 395 ? A 302.114 345.138 492.041 1 1 1 LEU 0.770 1 ATOM 73 C CB . LEU 395 395 ? A 301.298 344.411 495.136 1 1 1 LEU 0.770 1 ATOM 74 C CG . LEU 395 395 ? A 300.149 344.656 496.134 1 1 1 LEU 0.770 1 ATOM 75 C CD1 . LEU 395 395 ? A 300.706 344.815 497.558 1 1 1 LEU 0.770 1 ATOM 76 C CD2 . LEU 395 395 ? A 299.274 345.863 495.751 1 1 1 LEU 0.770 1 ATOM 77 N N . THR 396 396 ? A 302.906 343.141 492.713 1 1 1 THR 0.780 1 ATOM 78 C CA . THR 396 396 ? A 304.006 343.077 491.748 1 1 1 THR 0.780 1 ATOM 79 C C . THR 396 396 ? 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A 345.985 362.388 367.834 1 1 1 TRP 0.640 1 ATOM 834 C CH2 . TRP 487 487 ? A 346.432 362.663 369.134 1 1 1 TRP 0.640 1 ATOM 835 N N . ARG 488 488 ? A 339.284 362.176 365.173 1 1 1 ARG 0.660 1 ATOM 836 C CA . ARG 488 488 ? A 338.646 361.861 363.909 1 1 1 ARG 0.660 1 ATOM 837 C C . ARG 488 488 ? A 339.006 362.848 362.795 1 1 1 ARG 0.660 1 ATOM 838 O O . ARG 488 488 ? A 339.552 362.451 361.766 1 1 1 ARG 0.660 1 ATOM 839 C CB . ARG 488 488 ? A 337.107 361.813 364.094 1 1 1 ARG 0.660 1 ATOM 840 C CG . ARG 488 488 ? A 336.327 361.353 362.844 1 1 1 ARG 0.660 1 ATOM 841 C CD . ARG 488 488 ? A 334.804 361.322 363.041 1 1 1 ARG 0.660 1 ATOM 842 N NE . ARG 488 488 ? A 334.294 362.719 362.905 1 1 1 ARG 0.660 1 ATOM 843 C CZ . ARG 488 488 ? A 333.959 363.342 361.771 1 1 1 ARG 0.660 1 ATOM 844 N NH1 . ARG 488 488 ? A 334.152 362.766 360.591 1 1 1 ARG 0.660 1 ATOM 845 N NH2 . ARG 488 488 ? A 333.460 364.572 361.802 1 1 1 ARG 0.660 1 ATOM 846 N N . LEU 489 489 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #