data_SMR-d1f3f2e5ff3e67ce93903ce679bb1d94_4 _entry.id SMR-d1f3f2e5ff3e67ce93903ce679bb1d94_4 _struct.entry_id SMR-d1f3f2e5ff3e67ce93903ce679bb1d94_4 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - P45481/ CBP_MOUSE, Histone lysine acetyltransferase CREBBP Estimated model accuracy of this model is 0.001, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P45481' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' ZN non-polymer 'ZINC ION' Zn 65.380 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 309731.636 1 . 2 non-polymer man 'ZINC ION' 65.380 3 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP CBP_MOUSE P45481 1 ;MAENLLDGPPNPKRAKLSSPGFSANDNTDFGSLFDLENDLPDELIPNGELSLLNSGNLVPDAASKHKQLS ELLRGGSGSSINPGIGNVSASSPVQQGLGGQAQGQPNSTNMASLGAMGKSPLNQGDSSTPNLPKQAASTS GPTPPASQALNPQAQKQVGLVTSSPATSQTGPGICMNANFNQTHPGLLNSNSGHSLMNQAQQGQAQVMNG SLGAAGRGRGAGMPYPAPAMQGATSSVLAETLTQVSPQMAGHAGLNTAQAGGMTKMGMTGTTSPFGQPFS QTGGQQMGATGVNPQLASKQSMVNSLPAFPTDIKNTSVTTVPNMSQLQTSVGIVPTQAIATGPTADPEKR KLIQQQLVLLLHAHKCQRREQANGEVRACSLPHCRTMKNVLNHMTHCQAGKACQVAHCASSRQIISHWKN CTRHDCPVCLPLKNASDKRNQQTILGSPASGIQNTIGSVGAGQQNATSLSNPNPIDPSSMQRAYAALGLP YMNQPQTQLQPQVPGQQPAQPPAHQQMRTLNALGNNPMSIPAGGITTDQQPPNLISESALPTSLGATNPL MNDGSNSGNIGSLSTIPTAAPPSSTGVRKGWHEHVTQDLRSHLVHKLVQAIFPTPDPAALKDRRMENLVA YAKKVEGDMYESANSRDEYYHLLAEKIYKIQKELEEKRRSRLHKQGILGNQPALPASGAQPPVIPPAQSV RPPNGPLPLPVNRMQVSQGMNSFNPMSLGNVQLPQAPMGPRAASPMNHSVQMNSMASVPGMAISPSRMPQ PPNMMGTHANNIMAQAPTQNQFLPQNQFPSSSGAMSVNSVGMGQPAAQAGVSQGQVPGAALPNPLNMLAP QASQLPCPPVTQSPLHPTPPPASTAAGMPSLQHPTAPGMTPPQPAAPTQPSTPVSSGQTPTPTPGSVPSA AQTQSTPTVQAAAQAQVTPQPQTPVQPPSVATPQSSQQQPTPVHTQPPGTPLSQAAASIDNRVPTPSSVT SAETSSQQPGPDVPMLEMKTEVQTDDAEPEPTESKGEPRSEMMEEDLQGSSQVKEETDTTEQKSEPMEVE EKKPEVKVEAKEEEENSSNDTASQSTSPSQPRKKIFKPEELRQALMPTLEALYRQDPESLPFRQPVDPQL LGIPDYFDIVKNPMDLSTIKRKLDTGQYQEPWQYVDDVWLMFNNAWLYNRKTSRVYKFCSKLAEVFEQEI DPVMQSLGYCCGRKYEFSPQTLCCYGKQLCTIPRDAAYYSYQNRYHFCEKCFTEIQGENVTLGDDPSQPQ TTISKDQFEKKKNDTLDPEPFVDCKECGRKMHQICVLHYDIIWPSGFVCDNCLKKTGRPRKENKFSAKRL QTTRLGNHLEDRVNKFLRRQNHPEAGEVFVRVVASSDKTVEVKPGMKSRFVDSGEMSESFPYRTKALFAF EEIDGVDVCFFGMHVQNTALIAPHQIQGRVYISYLDSIHFFRPRCLRTAVYHEILIGYLEYVKKLGYVTG HIWACPPSEGDDYIFHCHPPDQKIPKPKRLQEWYKKMLDKAFAERIINDYKDIFKQANEDRLTSAKELPY FEGDFWPNVLEESIKELEQEEEERKKEESTAASETPEGSQGDSKNAKKKNNKKTNKNKSSISRANKKKPS MPNVSNDLSQKLYATMEKHKEVFFVIHLHAGPVISTQPPIVDPDPLLSCDLMDGRDAFLTLARDKHWEFS SLRRSKWSTLCMLVELHTQGQDRFVYTCNECKHHVETRWHCTVCEDYDLCINCYNTKSHTHKMVKWGLGL DDEGSSQGEPQSKSPQESRRLSIQRCIQSLVHACQCRNANCSLPSCQKMKRVVQHTKGCKRKTNGGCPVC KQLIALCCYHAKHCQENKCPVPFCLNIKHKLRQQQIQHRLQQAQLMRRRMATMNTRNVPQQSLPSPTSAP PGTPTQQPSTPQTPQPPAQPQPSPVNMSPAGFPNVARTQPPTIVSAGKPTNQVPAPPPPAQPPPAAVEAA RQIEREAQQQQHLYRANINNGMPPGRAGMGTPGSQMTPVGLNVPRPNQVSGPVMSSMPPGQWQQAPIPQQ QPMPGMPRPVMSMQAQAAVAGPRMPNVQPPRSISPSALQDLLRTLKSPSSPQQQQQVLNILKSNPQLMAA FIKQRTAKYVANQPGMQPQPGLQSQPGMQPQPGMHQQPSLQNLNAMQAGVPRPGVPPPQPAMGGLNPQGQ ALNIMNPGHNPNMTNMNPQYREMVRRQLLQHQQQQQQQQQQQQQQQNSASLAGGMAGHSQFQQPQGPGGY APAMQQQRMQQHLPIQGSSMGQMAAPMGQLGQMGQPGLGADSTPNIQQALQQRILQQQQMKQQIGSPGQP NPMSPQQHMLSGQPQASHLPGQQIATSLSNQVRSPAPVQSPRPQSQPPHSSPSPRIQPQPSPHHVSPQTG SPHPGLAVTMASSMDQGHLGNPEQSAMLPQLNTPNRSALSSELSLVGDTTGDTLEKFVEGL ; 'Histone lysine acetyltransferase CREBBP' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2441 1 2441 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . CBP_MOUSE P45481 . 1 2441 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2011-07-27 D89AF52B7BD33347 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no B ;MAENLLDGPPNPKRAKLSSPGFSANDNTDFGSLFDLENDLPDELIPNGELSLLNSGNLVPDAASKHKQLS ELLRGGSGSSINPGIGNVSASSPVQQGLGGQAQGQPNSTNMASLGAMGKSPLNQGDSSTPNLPKQAASTS GPTPPASQALNPQAQKQVGLVTSSPATSQTGPGICMNANFNQTHPGLLNSNSGHSLMNQAQQGQAQVMNG SLGAAGRGRGAGMPYPAPAMQGATSSVLAETLTQVSPQMAGHAGLNTAQAGGMTKMGMTGTTSPFGQPFS QTGGQQMGATGVNPQLASKQSMVNSLPAFPTDIKNTSVTTVPNMSQLQTSVGIVPTQAIATGPTADPEKR KLIQQQLVLLLHAHKCQRREQANGEVRACSLPHCRTMKNVLNHMTHCQAGKACQVAHCASSRQIISHWKN CTRHDCPVCLPLKNASDKRNQQTILGSPASGIQNTIGSVGAGQQNATSLSNPNPIDPSSMQRAYAALGLP YMNQPQTQLQPQVPGQQPAQPPAHQQMRTLNALGNNPMSIPAGGITTDQQPPNLISESALPTSLGATNPL MNDGSNSGNIGSLSTIPTAAPPSSTGVRKGWHEHVTQDLRSHLVHKLVQAIFPTPDPAALKDRRMENLVA 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A 1 2366 ILE 2366 ? ? ? B . A 1 2367 GLN 2367 ? ? ? B . A 1 2368 PRO 2368 ? ? ? B . A 1 2369 GLN 2369 ? ? ? B . A 1 2370 PRO 2370 ? ? ? B . A 1 2371 SER 2371 ? ? ? B . A 1 2372 PRO 2372 ? ? ? B . A 1 2373 HIS 2373 ? ? ? B . A 1 2374 HIS 2374 ? ? ? B . A 1 2375 VAL 2375 ? ? ? B . A 1 2376 SER 2376 ? ? ? B . A 1 2377 PRO 2377 ? ? ? B . A 1 2378 GLN 2378 ? ? ? B . A 1 2379 THR 2379 ? ? ? B . A 1 2380 GLY 2380 ? ? ? B . A 1 2381 SER 2381 ? ? ? B . A 1 2382 PRO 2382 ? ? ? B . A 1 2383 HIS 2383 ? ? ? B . A 1 2384 PRO 2384 ? ? ? B . A 1 2385 GLY 2385 ? ? ? B . A 1 2386 LEU 2386 ? ? ? B . A 1 2387 ALA 2387 ? ? ? B . A 1 2388 VAL 2388 ? ? ? B . A 1 2389 THR 2389 ? ? ? B . A 1 2390 MET 2390 ? ? ? B . A 1 2391 ALA 2391 ? ? ? B . A 1 2392 SER 2392 ? ? ? B . A 1 2393 SER 2393 ? ? ? B . A 1 2394 MET 2394 ? ? ? B . A 1 2395 ASP 2395 ? ? ? B . A 1 2396 GLN 2396 ? ? ? B . A 1 2397 GLY 2397 ? ? ? B . A 1 2398 HIS 2398 ? ? ? B . A 1 2399 LEU 2399 ? ? ? B . A 1 2400 GLY 2400 ? ? ? B . A 1 2401 ASN 2401 ? ? ? B . A 1 2402 PRO 2402 ? ? ? B . A 1 2403 GLU 2403 ? ? ? B . A 1 2404 GLN 2404 ? ? ? B . A 1 2405 SER 2405 ? ? ? B . A 1 2406 ALA 2406 ? ? ? B . A 1 2407 MET 2407 ? ? ? B . A 1 2408 LEU 2408 ? ? ? B . A 1 2409 PRO 2409 ? ? ? B . A 1 2410 GLN 2410 ? ? ? B . A 1 2411 LEU 2411 ? ? ? B . A 1 2412 ASN 2412 ? ? ? B . A 1 2413 THR 2413 ? ? ? B . A 1 2414 PRO 2414 ? ? ? B . A 1 2415 ASN 2415 ? ? ? B . A 1 2416 ARG 2416 ? ? ? B . A 1 2417 SER 2417 ? ? ? B . A 1 2418 ALA 2418 ? ? ? B . A 1 2419 LEU 2419 ? ? ? B . A 1 2420 SER 2420 ? ? ? B . A 1 2421 SER 2421 ? ? ? B . A 1 2422 GLU 2422 ? ? ? B . A 1 2423 LEU 2423 ? ? ? B . A 1 2424 SER 2424 ? ? ? B . A 1 2425 LEU 2425 ? ? ? B . A 1 2426 VAL 2426 ? ? ? B . A 1 2427 GLY 2427 ? ? ? B . A 1 2428 ASP 2428 ? ? ? B . A 1 2429 THR 2429 ? ? ? B . A 1 2430 THR 2430 ? ? ? B . A 1 2431 GLY 2431 ? ? ? B . A 1 2432 ASP 2432 ? ? ? B . A 1 2433 THR 2433 ? ? ? B . A 1 2434 LEU 2434 ? ? ? B . A 1 2435 GLU 2435 ? ? ? B . A 1 2436 LYS 2436 ? ? ? B . A 1 2437 PHE 2437 ? ? ? B . A 1 2438 VAL 2438 ? ? ? B . A 1 2439 GLU 2439 ? ? ? B . A 1 2440 GLY 2440 ? ? ? B . A 1 2441 LEU 2441 ? ? ? B . # # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 ZN 1 1 1 ZN '_' . C 2 ZN 1 2 2 ZN '_' . D 2 ZN 1 3 3 ZN '_' . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'E1A-associated protein p300 {PDB ID=1p4q, label_asym_id=B, auth_asym_id=B, SMTL ID=1p4q.1.B}' 'template structure' . 2 'ZINC ION {PDB ID=1p4q, label_asym_id=C, auth_asym_id=B, SMTL ID=1p4q.1._.1}' 'template structure' . 3 'ZINC ION {PDB ID=1p4q, label_asym_id=D, auth_asym_id=B, SMTL ID=1p4q.1._.2}' 'template structure' . 4 'ZINC ION {PDB ID=1p4q, label_asym_id=E, auth_asym_id=B, SMTL ID=1p4q.1._.3}' 'template structure' . 5 . target . 6 'ZINC ION' target . 7 'Target-template alignment by HHblits to 1p4q, label_asym_id=B' 'target-template alignment' . 8 'model 4' 'model coordinates' . 9 SMTL 'reference database' . 10 PDB 'reference database' . 11 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 5 2 1 9 3 1 10 4 2 11 5 3 5 6 3 6 7 3 1 8 3 2 9 3 3 10 3 4 11 3 7 12 4 1 13 4 2 14 4 3 15 4 4 16 4 7 17 4 6 18 5 8 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 9 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-04 10 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-29 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 5 'reference database' 2 6 . # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . B 2 . C 2 . D 2 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A B 2 1 B 2 2 'reference database' non-polymer 1 2 B C 3 1 B 3 3 'reference database' non-polymer 1 3 C D 3 1 B 4 4 'reference database' non-polymer 1 4 D E 3 1 B # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MGSGAHTADPEKRKLIQQQLVLLLHAHKCQRREQANGEVRQCNLPHCRTMKNVLNHMTHCQSGKSCQVAH CASSRQIISHWKNCTRHDCPVCLPLKNAGDK ; ;MGSGAHTADPEKRKLIQQQLVLLLHAHKCQRREQANGEVRQCNLPHCRTMKNVLNHMTHCQSGKSCQVAH CASSRQIISHWKNCTRHDCPVCLPLKNAGDK ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 5 101 # # loop_ _ma_template_non_poly.template_id _ma_template_non_poly.comp_id _ma_template_non_poly.details 2 ZN 'ZINC ION' 3 ZN 'ZINC ION' 4 ZN 'ZINC ION' # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 1p4q 2024-10-16 2 PDB . 1p4q 2024-10-16 3 PDB . 1p4q 2024-10-16 4 PDB . 1p4q 2024-10-16 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2441 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 7 1 2441 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 2.1e-18 92.784 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MAENLLDGPPNPKRAKLSSPGFSANDNTDFGSLFDLENDLPDELIPNGELSLLNSGNLVPDAASKHKQLSELLRGGSGSSINPGIGNVSASSPVQQGLGGQAQGQPNSTNMASLGAMGKSPLNQGDSSTPNLPKQAASTSGPTPPASQALNPQAQKQVGLVTSSPATSQTGPGICMNANFNQTHPGLLNSNSGHSLMNQAQQGQAQVMNGSLGAAGRGRGAGMPYPAPAMQGATSSVLAETLTQVSPQMAGHAGLNTAQAGGMTKMGMTGTTSPFGQPFSQTGGQQMGATGVNPQLASKQSMVNSLPAFPTDIKNTSVTTVPNMSQLQTSVGIVPTQAIATGPTADPEKRKLIQQQLVLLLHAHKCQRREQANGEVRACSLPHCRTMKNVLNHMTHCQAGKACQVAHCASSRQIISHWKNCTRHDCPVCLPLKNASDKRNQQTILGSPASGIQNTIGSVGAGQQNATSLSNPNPIDPSSMQRAYAALGLPYMNQPQTQLQPQVPGQQPAQPPAHQQMRTLNALGNNPMSIPAGGITTDQQPPNLISESALPTSLGATNPLMNDGSNSGNIGSLSTIPTAAPPSSTGVRKGWHEHVTQDLRSHLVHKLVQAIFPTPDPAALKDRRMENLVAYAKKVEGDMYESANSRDEYYHLLAEKIYKIQKELEEKRRSRLHKQGILGNQPALPASGAQPPVIPPAQSVRPPNGPLPLPVNRMQVSQGMNSFNPMSLGNVQLPQAPMGPRAASPMNHSVQMNSMASVPGMAISPSRMPQPPNMMGTHANNIMAQAPTQNQFLPQNQFPSSSGAMSVNSVGMGQPAAQAGVSQGQVPGAALPNPLNMLAPQASQLPCPPVTQSPLHPTPPPASTAAGMPSLQHPTAPGMTPPQPAAPTQPSTPVSSGQTPTPTPGSVPSAAQTQSTPTVQAAAQAQVTPQPQTPVQPPSVATPQSSQQQPTPVHTQPPGTPLSQAAASIDNRVPTPSSVTSAETSSQQPGPDVPMLEMKTEVQTDDAEPEPTESKGEPRSEMMEEDLQGSSQVKEETDTTEQKSEPMEVEEKKPEVKVEAKEEEENSSNDTASQSTSPSQPRKKIFKPEELRQALMPTLEALYRQDPESLPFRQPVDPQLLGIPDYFDIVKNPMDLSTIKRKLDTGQYQEPWQYVDDVWLMFNNAWLYNRKTSRVYKFCSKLAEVFEQEIDPVMQSLGYCCGRKYEFSPQTLCCYGKQLCTIPRDAAYYSYQNRYHFCEKCFTEIQGENVTLGDDPSQPQTTISKDQFEKKKNDTLDPEPFVDCKECGRKMHQICVLHYDIIWPSGFVCDNCLKKTGRPRKENKFSAKRLQTTRLGNHLEDRVNKFLRRQNHPEAGEVFVRVVASSDKTVEVKPGMKSRFVDSGEMSESFPYRTKALFAFEEIDGVDVCFFGMHVQNTALIAPHQIQGRVYISYLDSIHFFRPRCLRTAVYHEILIGYLEYVKKLGYVTGHIWACPPSEGDDYIFHCHPPDQKIPKPKRLQEWYKKMLDKAFAERIINDYKDIFKQANEDRLTSAKELPYFEGDFWPNVLEESIKELEQEEEERKKEESTAASETPEGSQGDSKNAKKKNNKKTNKNKSSISRANKKKPSMPNVSNDLSQKLYATMEKHKEVFFVIHLHAGPVISTQPPIVDPDPLLSCDLMDGRDAFLTLARDKHWEFSSLRRSKWSTLCMLVELHTQGQDRFVYTCNECKHHVETRWHCTVCEDYDLCINCYNTKSHTHKMVKWGLGLDDEGSSQGEPQSKSPQESRRLSIQRCIQSLVHACQCRNANCSLPSCQKMKRVVQHTKGCKRKTNGGCPVCKQLIALCCYHAKHCQENKCPVPFCLNIKHKLRQQQIQHRLQQAQLMRRRMATMNTRNVPQQSLPSPTSAPPGTPTQQPSTPQTPQPPAQPQPSPVNMSPAGFPNVARTQPPTIVSAGKPTNQVPAPPPPAQPPPAAVEAARQIEREAQQQQHLYRANINNGMPPGRAGMGTPGSQMTPVGLNVPRPNQVSGPVMSSMPPGQWQQAPIPQQQPMPGMPRPVMSMQAQAAVAGPRMPNVQPPRSISPSALQDLLRTLKSPSSPQQQQQVLNILKSNPQLMAAFIKQRTAKYVANQPGMQPQPGLQSQPGMQPQPGMHQQPSLQNLNAMQAGVPRPGVPPPQPAMGGLNPQGQALNIMNPGHNPNMTNMNPQYREMVRRQLLQHQQQQQQQQQQQQQQQNSASLAGGMAGHSQFQQPQGPGGYAPAMQQQRMQQHLPIQGSSMGQMAAPMGQLGQMGQPGLGADSTPNIQQALQQRILQQQQMKQQIGSPGQPNPMSPQQHMLSGQPQASHLPGQQIATSLSNQVRSPAPVQSPRPQSQPPHSSPSPRIQPQPSPHHVSPQTGSPHPGLAVTMASSMDQGHLGNPEQSAMLPQLNTPNRSALSSELSLVGDTTGDTLEKFVEGL 2 1 2 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AHTADPEKRKLIQQQLVLLLHAHKCQRREQANGEVRQCNLPHCRTMKNVLNHMTHCQSGKSCQVAHCASSRQIISHWKNCTRHDCPVCLPLKNAGDK----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 1p4q.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 4' . 8 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . 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A 3.346 -4.646 -4.264 1 1 B LEU 0.780 1 ATOM 142 C CD2 . LEU 359 359 ? A 1.480 -4.974 -5.913 1 1 B LEU 0.780 1 ATOM 143 N N . LEU 360 360 ? A 0.967 -1.871 -1.713 1 1 B LEU 0.770 1 ATOM 144 C CA . LEU 360 360 ? A 1.100 -1.699 -0.282 1 1 B LEU 0.770 1 ATOM 145 C C . LEU 360 360 ? A -0.115 -2.107 0.531 1 1 B LEU 0.770 1 ATOM 146 O O . LEU 360 360 ? A 0.037 -2.606 1.644 1 1 B LEU 0.770 1 ATOM 147 C CB . LEU 360 360 ? A 1.490 -0.235 -0.018 1 1 B LEU 0.770 1 ATOM 148 C CG . LEU 360 360 ? A 2.885 -0.060 0.584 1 1 B LEU 0.770 1 ATOM 149 C CD1 . LEU 360 360 ? A 3.554 1.094 -0.176 1 1 B LEU 0.770 1 ATOM 150 C CD2 . LEU 360 360 ? A 2.832 0.073 2.110 1 1 B LEU 0.770 1 ATOM 151 N N . LEU 361 361 ? A -1.341 -1.880 0.032 1 1 B LEU 0.750 1 ATOM 152 C CA . LEU 361 361 ? A -2.678 -2.190 0.531 1 1 B LEU 0.750 1 ATOM 153 C C . LEU 361 361 ? A -2.984 -3.669 0.455 1 1 B LEU 0.750 1 ATOM 154 O O . LEU 361 361 ? A -3.446 -4.285 1.412 1 1 B LEU 0.750 1 ATOM 155 C CB . LEU 361 361 ? 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A -2.109 -11.388 9.166 1 1 B ARG 0.550 1 ATOM 212 C CB . ARG 368 368 ? A -2.092 -8.380 8.440 1 1 B ARG 0.550 1 ATOM 213 C CG . ARG 368 368 ? A -1.847 -7.743 9.823 1 1 B ARG 0.550 1 ATOM 214 C CD . ARG 368 368 ? A -1.190 -6.373 9.672 1 1 B ARG 0.550 1 ATOM 215 N NE . ARG 368 368 ? A -1.135 -5.728 11.021 1 1 B ARG 0.550 1 ATOM 216 C CZ . ARG 368 368 ? A -0.679 -4.485 11.229 1 1 B ARG 0.550 1 ATOM 217 N NH1 . ARG 368 368 ? A -0.197 -3.754 10.227 1 1 B ARG 0.550 1 ATOM 218 N NH2 . ARG 368 368 ? A -0.685 -3.962 12.452 1 1 B ARG 0.550 1 ATOM 219 N N . ARG 369 369 ? A -2.018 -11.461 6.938 1 1 B ARG 0.510 1 ATOM 220 C CA . ARG 369 369 ? A -2.745 -12.709 6.851 1 1 B ARG 0.510 1 ATOM 221 C C . ARG 369 369 ? A -1.898 -13.902 7.240 1 1 B ARG 0.510 1 ATOM 222 O O . ARG 369 369 ? A -2.411 -14.970 7.558 1 1 B ARG 0.510 1 ATOM 223 C CB . ARG 369 369 ? A -3.278 -12.884 5.417 1 1 B ARG 0.510 1 ATOM 224 C CG . ARG 369 369 ? A -4.540 -13.757 5.312 1 1 B ARG 0.510 1 ATOM 225 C CD . ARG 369 369 ? A -5.517 -13.294 4.219 1 1 B ARG 0.510 1 ATOM 226 N NE . ARG 369 369 ? A -4.786 -13.126 2.913 1 1 B ARG 0.510 1 ATOM 227 C CZ . ARG 369 369 ? A -4.352 -14.126 2.131 1 1 B ARG 0.510 1 ATOM 228 N NH1 . ARG 369 369 ? A -4.558 -15.396 2.453 1 1 B ARG 0.510 1 ATOM 229 N NH2 . ARG 369 369 ? A -3.666 -13.851 1.022 1 1 B ARG 0.510 1 ATOM 230 N N . GLU 370 370 ? A -0.568 -13.702 7.234 1 1 B GLU 0.500 1 ATOM 231 C CA . GLU 370 370 ? A 0.420 -14.693 7.571 1 1 B GLU 0.500 1 ATOM 232 C C . GLU 370 370 ? A 0.805 -14.572 9.027 1 1 B GLU 0.500 1 ATOM 233 O O . GLU 370 370 ? A 0.688 -15.505 9.813 1 1 B GLU 0.500 1 ATOM 234 C CB . GLU 370 370 ? A 1.663 -14.545 6.655 1 1 B GLU 0.500 1 ATOM 235 C CG . GLU 370 370 ? A 1.402 -13.697 5.398 1 1 B GLU 0.500 1 ATOM 236 C CD . GLU 370 370 ? A 2.531 -13.677 4.383 1 1 B GLU 0.500 1 ATOM 237 O OE1 . GLU 370 370 ? A 3.625 -13.120 4.632 1 1 B GLU 0.500 1 ATOM 238 O OE2 . GLU 370 370 ? A 2.229 -14.037 3.208 1 1 B GLU 0.500 1 ATOM 239 N N . GLN 371 371 ? 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'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.602 2 1 3 0.000879 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 342 GLY 1 0.190 2 1 A 343 PRO 1 0.200 3 1 A 344 THR 1 0.500 4 1 A 345 ALA 1 0.540 5 1 A 346 ASP 1 0.560 6 1 A 347 PRO 1 0.640 7 1 A 348 GLU 1 0.670 8 1 A 349 LYS 1 0.600 9 1 A 350 ARG 1 0.580 10 1 A 351 LYS 1 0.670 11 1 A 352 LEU 1 0.680 12 1 A 353 ILE 1 0.670 13 1 A 354 GLN 1 0.670 14 1 A 355 GLN 1 0.700 15 1 A 356 GLN 1 0.710 16 1 A 357 LEU 1 0.740 17 1 A 358 VAL 1 0.730 18 1 A 359 LEU 1 0.780 19 1 A 360 LEU 1 0.770 20 1 A 361 LEU 1 0.750 21 1 A 362 HIS 1 0.750 22 1 A 363 ALA 1 0.800 23 1 A 364 HIS 1 0.720 24 1 A 365 LYS 1 0.700 25 1 A 366 CYS 1 0.700 26 1 A 367 GLN 1 0.620 27 1 A 368 ARG 1 0.550 28 1 A 369 ARG 1 0.510 29 1 A 370 GLU 1 0.500 30 1 A 371 GLN 1 0.520 31 1 A 372 ALA 1 0.690 32 1 A 373 ASN 1 0.630 33 1 A 374 GLY 1 0.630 34 1 A 375 GLU 1 0.480 35 1 A 376 VAL 1 0.520 36 1 A 377 ARG 1 0.280 37 1 A 378 ALA 1 0.350 38 1 A 379 CYS 1 0.480 39 1 A 380 SER 1 0.470 40 1 A 381 LEU 1 0.570 41 1 A 382 PRO 1 0.620 42 1 A 383 HIS 1 0.680 43 1 A 384 CYS 1 0.730 44 1 A 385 ARG 1 0.670 45 1 A 386 THR 1 0.720 46 1 A 387 MET 1 0.710 47 1 A 388 LYS 1 0.690 48 1 A 389 ASN 1 0.730 49 1 A 390 VAL 1 0.730 50 1 A 391 LEU 1 0.710 51 1 A 392 ASN 1 0.710 52 1 A 393 HIS 1 0.730 53 1 A 394 MET 1 0.680 54 1 A 395 THR 1 0.660 55 1 A 396 HIS 1 0.650 56 1 A 397 CYS 1 0.620 57 1 A 398 GLN 1 0.570 58 1 A 399 ALA 1 0.560 59 1 A 400 GLY 1 0.560 60 1 A 401 LYS 1 0.490 61 1 A 402 ALA 1 0.520 62 1 A 403 CYS 1 0.570 63 1 A 404 GLN 1 0.490 64 1 A 405 VAL 1 0.600 65 1 A 406 ALA 1 0.570 66 1 A 407 HIS 1 0.650 67 1 A 408 CYS 1 0.680 68 1 A 409 ALA 1 0.660 69 1 A 410 SER 1 0.640 70 1 A 411 SER 1 0.700 71 1 A 412 ARG 1 0.620 72 1 A 413 GLN 1 0.630 73 1 A 414 ILE 1 0.700 74 1 A 415 ILE 1 0.690 75 1 A 416 SER 1 0.710 76 1 A 417 HIS 1 0.720 77 1 A 418 TRP 1 0.640 78 1 A 419 LYS 1 0.680 79 1 A 420 ASN 1 0.710 80 1 A 421 CYS 1 0.670 81 1 A 422 THR 1 0.500 82 1 A 423 ARG 1 0.380 83 1 A 424 HIS 1 0.380 84 1 A 425 ASP 1 0.460 85 1 A 426 CYS 1 0.610 86 1 A 427 PRO 1 0.600 87 1 A 428 VAL 1 0.620 88 1 A 429 CYS 1 0.620 89 1 A 430 LEU 1 0.570 90 1 A 431 PRO 1 0.590 91 1 A 432 LEU 1 0.560 92 1 A 433 LYS 1 0.540 93 1 A 434 ASN 1 0.560 94 1 A 435 ALA 1 0.570 95 1 A 436 SER 1 0.420 96 1 A 437 ASP 1 0.300 97 1 A 438 LYS 1 0.260 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #