data_SMR-b99d5f454e627e40999dca6504b8c938_18
_entry.id SMR-b99d5f454e627e40999dca6504b8c938_18
_struct.entry_id SMR-b99d5f454e627e40999dca6504b8c938_18
_struct.pdbx_model_details
;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries:

  - O15078/ CE290_HUMAN, Centrosomal protein of 290 kDa

Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE).
;
_struct.pdbx_structure_determination_methodology computational
_struct.title 'Model for UniProtKB entries O15078'
_audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic
_audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic
_audit_conform.dict_version 1.4.6
#
loop_
_citation.id
_citation.title
_citation.journal_abbrev
_citation.journal_volume
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_citation.page_last
_citation.year
_citation.pdbx_database_id_PubMed
_citation.pdbx_database_id_DOI
primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality'
'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132
2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes'
'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427
3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1)
1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667
4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation'
Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828
5
'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology'
'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579
10.1107/S0907444913007051
6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500
10.1186/1471-2105-10-421
7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation'
'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7
#
#
loop_
_citation_author.citation_id
_citation_author.name
_citation_author.ordinal
primary 'Bienert, S.' 1
primary 'Waterhouse, A.' 2
primary 'de Beer, T.A.P.' 3
primary 'Tauriello, G.' 4
primary 'Studer, G.' 5
primary 'Bordoli, L.' 6
primary 'Schwede, T.' 7
2 'Waterhouse, A.' 8
2 'Bertoni, M.' 9
2 'Bienert, S.' 10
2 'Studer, G.' 11
2 'Tauriello, G.' 12
2 'Gumienny, R.' 13
2 'Heer, F.T.' 14
2 'de Beer, T.A.P.' 15
2 'Rempfer, C.' 16
2 'Bordoli, L.' 17
2 'Lepore, R.' 18
2 'Schwede, T.' 19
3 'Studer, G.' 20
3 'Tauriello, G.' 21
3 'Bienert, S.' 22
3 'Biasini, M.' 23
3 'Johner, N.' 24
3 'Schwede, T.' 25
4 'Studer, G.' 26
4 'Rempfer, C.' 27
4 'Waterhouse, A.M.' 28
4 'Gumienny, R.' 29
4 'Haas, J.' 30
4 'Schwede, T.' 31
5 'Biasini, M.' 32
5 'Schmidt, T.' 33
5 'Bienert, S.' 34
5 'Mariani, V.' 35
5 'Studer, G.' 36
5 'Haas, J.' 37
5 'Johner, N.' 38
5 'Schenk, A.D.' 39
5 'Philippsen, A.' 40
5 'Schwede, T.' 41
6 'Camacho, C.' 42
6 'Coulouris, G.' 43
6 'Avagyan, V.' 44
6 'Ma, N.' 45
6 'Papadopoulos, J.' 46
6 'Bealer, K.' 47
6 'Madden, T.L.' 48
7 'Steinegger, M.' 49
7 'Meier, M.' 50
7 'Mirdita, M.' 51
7 'Vohringer, H.' 52
7 'Haunsberger, S.J.' 53
7 'Soding, J.' 54
#
#
loop_
_software.pdbx_ordinal
_software.name
_software.classification
_software.description
_software.version
_software.type
_software.location
_software.citation_id
1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3
package https://swissmodel.expasy.org 2
2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library
https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3
3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1
library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4
4 OpenStructure 'data processing'
'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package
https://openstructure.org/ 5
5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6
6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0
package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7
#
#
loop_
_ma_software_group.ordinal_id
_ma_software_group.group_id
_ma_software_group.software_id
_ma_software_group.parameter_group_id
1 1 6 .
2 2 1 .
3 2 4 .
4 2 5 .
5 2 6 .
6 3 1 .
7 3 4 .
8 4 1 .
9 4 2 .
10 4 4 .
11 5 3 .
12 6 1 .
13 6 3 .
14 6 4 .
#
#
loop_
_audit_author.name
_audit_author.pdbx_ordinal
'Bienert, S.' 1
'Waterhouse, A.' 2
'de Beer, T.A.P.' 3
'Tauriello, G.' 4
'Studer, G.' 5
'Bordoli, L.' 6
'Schwede, T.' 7
#
#
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.type
_chem_comp.name
_chem_comp.formula
_chem_comp.formula_weight
_chem_comp.ma_provenance
ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core'
ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core'
ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core'
ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core'
CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core'
GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core'
GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core'
GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core'
HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core'
ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core'
LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core'
LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core'
MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core'
PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core'
PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core'
SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core'
THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core'
TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core'
TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core'
VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core'
#
#
loop_
_entity.id
_entity.type
_entity.src_method
_entity.pdbx_description
_entity.formula_weight
_entity.pdbx_number_of_molecules
_entity.details
1 polymer man . 335516.654 1 .
#
#
loop_
_struct_ref.id
_struct_ref.entity_id
_struct_ref.db_name
_struct_ref.db_code
_struct_ref.pdbx_db_accession
_struct_ref.pdbx_align_begin
_struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code
_struct_ref.details
1 1 UNP CE290_HUMAN O15078 1
;MPPNINWKEIMKVDPDDLPRQEELADNLLISLSKVEVNELKSEKQENVIHLFRITQSLMKMKAQEVELAL
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KEAERTAELAEADAREKDKELVEALKRLKDYESGVYGLEDAVVEIKNCKNQIKIRDREIEILTKEINKLE
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QLGVELTSPVAASEEFEDEEESPVNFPIY
;
'Centrosomal protein of 290 kDa'
#
#
loop_
_struct_ref_seq.align_id
_struct_ref_seq.ref_id
_struct_ref_seq.seq_align_beg
_struct_ref_seq.seq_align_end
_struct_ref_seq.db_align_beg
_struct_ref_seq.db_align_end
1 1 1 2479 1 2479
#
#
loop_
_ma_target_ref_db_details.target_entity_id
_ma_target_ref_db_details.db_name
_ma_target_ref_db_details.db_name_other_details
_ma_target_ref_db_details.db_code
_ma_target_ref_db_details.db_accession
_ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform
_ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin
_ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end
_ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id
_ma_target_ref_db_details.organism_scientific
_ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date
_ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum
1 UNP . CE290_HUMAN O15078 . 1 2479 9606 'Homo sapiens (Human)' 2006-10-17
7CA87D53FAF036FC
#
#
loop_
_entity_poly.entity_id
_entity_poly.type
_entity_poly.nstd_linkage
_entity_poly.nstd_monomer
_entity_poly.pdbx_strand_id
_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code
_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can
1 polypeptide(L) no no E
;MPPNINWKEIMKVDPDDLPRQEELADNLLISLSKVEVNELKSEKQENVIHLFRITQSLMKMKAQEVELAL
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;

;MPPNINWKEIMKVDPDDLPRQEELADNLLISLSKVEVNELKSEKQENVIHLFRITQSLMKMKAQEVELAL
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;

#
#
loop_
_entity_poly_seq.entity_id
_entity_poly_seq.num
_entity_poly_seq.mon_id
_entity_poly_seq.hetero
1 1 MET .
1 2 PRO .
1 3 PRO .
1 4 ASN .
1 5 ILE .
1 6 ASN .
1 7 TRP .
1 8 LYS .
1 9 GLU .
1 10 ILE .
1 11 MET .
1 12 LYS .
1 13 VAL .
1 14 ASP .
1 15 PRO .
1 16 ASP .
1 17 ASP .
1 18 LEU .
1 19 PRO .
1 20 ARG .
1 21 GLN .
1 22 GLU .
1 23 GLU .
1 24 LEU .
1 25 ALA .
1 26 ASP .
1 27 ASN .
1 28 LEU .
1 29 LEU .
1 30 ILE .
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1 32 LEU .
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1 2447 LYS .
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1 2456 LEU .
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1 2459 PRO .
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1 2462 ALA .
1 2463 SER .
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1 2465 GLU .
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1 2468 ASP .
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1 2471 GLU .
1 2472 SER .
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#
#
loop_
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_struct_asym.entity_id
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A 1 .
#
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loop_
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A 1 1 MET 1 ? ? ? E .
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A 1 2227 LYS 2227 ? ? ? E .
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A 1 2229 ASN 2229 ? ? ? E .
A 1 2230 LEU 2230 ? ? ? E .
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#
#
loop_
_ma_data.id
_ma_data.name
_ma_data.content_type
_ma_data.content_type_other_details
1
'CDK5 regulatory subunit-associated protein 2 {PDB ID=9g40, label_asym_id=E, auth_asym_id=v, SMTL ID=9g40.1.E}'
'template structure' .
2 . target .
3 'Target-template alignment by HHblits to 9g40, label_asym_id=E'
'target-template alignment' .
4 'model 18' 'model coordinates' .
5 SMTL 'reference database' .
6 PDB 'reference database' .
7 'Template search output' other 'Results of the sequence search'
#
#
loop_
_ma_data_group.ordinal_id
_ma_data_group.group_id
_ma_data_group.data_id
1 1 2
2 1 5
3 1 6
4 2 7
5 3 2
6 3 1
7 3 3
8 4 1
9 4 3
10 5 4
#
#
loop_
_ma_data_ref_db.data_id
_ma_data_ref_db.name
_ma_data_ref_db.location_url
_ma_data_ref_db.version
_ma_data_ref_db.release_date
5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-04
6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-29
#
#
loop_
_ma_target_entity.entity_id
_ma_target_entity.data_id
_ma_target_entity.origin
1 2 'reference database'
#
#
loop_
_ma_target_entity_instance.asym_id
_ma_target_entity_instance.entity_id
_ma_target_entity_instance.details
A 1 .
#
#
loop_
_ma_template_trans_matrix.id
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3]
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_ma_template_trans_matrix.tr_vector[2]
_ma_template_trans_matrix.tr_vector[3]
1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000
1.000000 0 0 0
#
#
loop_
_ma_template_details.ordinal_id
_ma_template_details.template_id
_ma_template_details.template_origin
_ma_template_details.template_entity_type
_ma_template_details.template_trans_matrix_id
_ma_template_details.template_data_id
_ma_template_details.target_asym_id
_ma_template_details.template_label_asym_id
_ma_template_details.template_label_entity_id
_ma_template_details.template_model_num
_ma_template_details.template_auth_asym_id
1 1 'reference database' polymer 1 1 A E 4 1 v
#
#
loop_
_ma_template_poly.template_id
_ma_template_poly.seq_one_letter_code
_ma_template_poly.seq_one_letter_code_can
1
;MMDLVLEEDVTVPGTLSGCSGLVPSVPDDLDGINPNAGLGNGLLPNVSEETVSPTRARNMKDFENQITEL
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GAFINLLAPLFNEKATLLLESRPDLLKVVRELLLGQLFLTEQEVSGEHLDGKTEKTPKQKGELVHFVQTN
SFSKPHDELKLSCEAQLVKAGEVPKVGLKDASVQTVATEGDLLRFKHEATREAWEEKPINTALSAEHRPE
NLHGVPGWQAALLSLPGITNREAKKSRLPILIKPSRSLGNMYRLPATQEVVTQLQSQILELQGELKEFKT
CNKQLHQKLILAEAVMEGRPTPDKTLLNAQPPVGAAYQDSPGEQKGIKTTSSVWRDKEMDSDQQRSYEID
SEICPPDDLASLPSCKENPEDVLSPTSVATYLSSKSQPSAKVSVMGTDQSESINTSNETEYLKQKIHDLE
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PEMIDSRVLENLKQQLEEQEYKLQKEQNLNMQLFSEIHNLQNKFRDLSPPRYDSLVQSQARELSLQRQQI
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TSSTLQSRLKEQLARGAEKAQEGALTLAVQAVSIPEVPLQPDKHDGDKYPMESDNSFDLFDSSQAVTPKS
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MDIQTQEAPSSTSQELGTKGPHPAPLSKFVSSVSTAKLTLEEAYRRLKLLWRVSLPEDGQCPLHCEQIGE
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PGS
;

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TELLASKEDEDTIKIGEDDEINFLSDQHLQQSNEIMKDLSKGGCKNGYLRHTESKISDCDGAHAPGCLEE
GAFINLLAPLFNEKATLLLESRPDLLKVVRELLLGQLFLTEQEVSGEHLDGKTEKTPKQKGELVHFVQTN
SFSKPHDELKLSCEAQLVKAGEVPKVGLKDASVQTVATEGDLLRFKHEATREAWEEKPINTALSAEHRPE
NLHGVPGWQAALLSLPGITNREAKKSRLPILIKPSRSLGNMYRLPATQEVVTQLQSQILELQGELKEFKT
CNKQLHQKLILAEAVMEGRPTPDKTLLNAQPPVGAAYQDSPGEQKGIKTTSSVWRDKEMDSDQQRSYEID
SEICPPDDLASLPSCKENPEDVLSPTSVATYLSSKSQPSAKVSVMGTDQSESINTSNETEYLKQKIHDLE
TELEGYQNFIFQLQKHSQCSEAIITVLCGTEGAQDGLSKPKNGSDGEEMTFSSLHQVRYVKHVKILGPLA
PEMIDSRVLENLKQQLEEQEYKLQKEQNLNMQLFSEIHNLQNKFRDLSPPRYDSLVQSQARELSLQRQQI
KDGHGICVISRQHMNTMIKAFEELLQASDVDYCVAEGFQEQLNQCAELLEKLEKLFLNGKSVGVEMNTQN
ELMERIEEDNLTYQHLLPESPEPSASHALSDYETSEKSFFSRDQKQDNETEKTSVMVNSFSQDLLMEHIQ
EIRTLRKRLEESIKTNEKLRKQLERQGSEFVQGSTSIFASGSELHSSLTSEIHFLRKQNQALNAMLIKGS
RDKQKENDKLRESLSRKTVSLEHLQREYASVKEENERLQKEGSEKERHNQQLIQEVRCSGQELSRVQEEV
KLRQQLLSQNDKLLQSLRVELKAYEKLDEEHRRLREASGEGWKGQDPFRDLHSLLMEIQALRLQLERSIE
TSSTLQSRLKEQLARGAEKAQEGALTLAVQAVSIPEVPLQPDKHDGDKYPMESDNSFDLFDSSQAVTPKS
VSETPPLSGNDTDSLSCDSGSSATSTPCVSRLVTGHHLWASKNGRHVLGLIEDYEALLKQISQGQRLLAE
MDIQTQEAPSSTSQELGTKGPHPAPLSKFVSSVSTAKLTLEEAYRRLKLLWRVSLPEDGQCPLHCEQIGE
MKAEVTKLHKKLFEQEKKLQNTMKLLQLSKRQEKVIFDQLVVTHKILRKARGNLELRPGGAHPGTCSPSR
PGS
;

#
#
loop_
_ma_template_poly_segment.id
_ma_template_poly_segment.template_id
_ma_template_poly_segment.residue_number_begin
_ma_template_poly_segment.residue_number_end
1 1 72 352
#
#
loop_
_ma_template_ref_db_details.template_id
_ma_template_ref_db_details.db_name
_ma_template_ref_db_details.db_name_other_details
_ma_template_ref_db_details.db_accession_code
_ma_template_ref_db_details.db_version_date
1 PDB . 9g40 2024-10-09
#
#
loop_
_ma_target_template_poly_mapping.id
_ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id
_ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id
_ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin
_ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end
1 1 A 1 2479
#
#
loop_
_ma_alignment_info.alignment_id
_ma_alignment_info.data_id
_ma_alignment_info.software_group_id
_ma_alignment_info.alignment_length
_ma_alignment_info.alignment_type
_ma_alignment_info.alignment_mode
1 3 1 2506 'target-template pairwise alignment' local
#
#
loop_
_ma_alignment_details.ordinal_id
_ma_alignment_details.alignment_id
_ma_alignment_details.template_segment_id
_ma_alignment_details.target_asym_id
_ma_alignment_details.score_type
_ma_alignment_details.score_type_other_details
_ma_alignment_details.score_value
_ma_alignment_details.percent_sequence_identity
_ma_alignment_details.sequence_identity_denominator
_ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details
1 1 1 A 'HHblits e-value' . 0.002 18.898
'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' .
#
#
loop_
_ma_alignment.ordinal_id
_ma_alignment.alignment_id
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_ma_alignment.sequence
1 1 1
MPPNINWKEIMKVDPDDLPRQEELADNLLISLSKVEVNELKSEKQENVIHLFRITQSLMKMKAQEVELALEEVEKAGEEQAKFEN-QLKTKVMKLENELEMAQQSAGGRDTRFLRNEICQLEKQLEQKDRELEDMEKELEKEKKVNEQLAL----RNEEAENENSKL-RRENKRLKKKNEQLCQDIIDYQKQIDSQKET-----------------LLSRRGEDSDYRSQLSKKNYELIQYLDEIQTLTEANEKIEVQNQEMRKNLEE-SVQEMEKMTDEYNRMKAIVHQTDNVIDQLKKENDHYQLQVQELTDLLKSKNEEDDPIM---VAVNAKVEEWKLILSSKDDEIIEYQQMLHNLREKLKNAQLDADKSNVMALQQGIQERDSQIKMLTEQVEQYTKEMEKNTCIIEDLKNELQRNKGASTLSQQTHMKIQSTLDILKEKTKEAERTAELAEADAREKDKELVEALKRLKDYESGVYGLEDAVVEIKNCKNQIKIRDREIEILTKEINKLELKISDFLDENEALRERVGLEPKTMIDLTEFRNSKHLKQQQYRAENQILLKEIESLEEERLDLKKKIRQMAQERGKRSATSGLTTEDLNLTENISQGDRISERKLDLLSLKNMSEAQSKNEFLSRELIEKERDLERSRTVIAKFQNKLKELVEENKQLEEGMKEILQAIKEMQKDPDVKGGETSLIIPSLERLVNAIESKNAEGIFDASLHLKAQVDQLTGRNEELRQELRESRKEAINYSQQLAKANLKIDHLEKETSLLRQSEGSNVVFKGIDLPDGIAPSSASIINSQNEYLIHLLQELENKEKKLKNLEDSLEDYNRKFAVIRHQQSLLYKEYLSEKETWKTESKTIKEEKRKLEDQVQQDAIKVKEYNNLLNALQMDSDEMKKILAENSRKITVLQVNEKSLIRQYTTLVELERQLRKENEKQKNELLSMEAEVCEKIGCLQRFKEMAIFKIAALQKVVDNSVSLSELELANKQYNELTAKYRDILQKDNMLVQRTSNLEHLECENISLKEQVESINKELEITKEKLHTIEQAWEQETKLGNESSMDKAKKSITNSDIVSISKKITMLEMKELNERQRAEHCQKMYEHLRTSLKQMEERNFELETKFAELTKINLDAQKVEQMLRDELADSVSKAVSDADRQRILELEKNEMELKVEVSKLREISDIARRQVEILNAQQQSRDKEVESLRMQLLDYQAQSDEKSLIAKLHQHNVSLQLSEATALGKLESITSKLQKMEAYNLRLEQKLDEKEQALYYARLEGRNRAKHLRQTIQSLRRQFSGALPLAQQEKFSKTMIQLQNDKLKIMQEMKNSQQEHRNMENKTLEMELKLKGLEELISTLKDTKGAQKVINWHMKIEELRLQELKLNRELVKDKEEIKYLNNIISEYERTISSLEEEIVQQNKFHEERQMAWDQREVDLERQLDIFDRQQNEILNAAQKFEEATGSIPDPSLPLPNQLEIALRKIKENIRIILETRATCKSLEEKLKEKESALRLAEQNILSRDKVINELRLRLPATAEREKLIAELGRKEMEPKSHHTLKIAHQTIANMQARLNQKEEVLKKYQRLLEKAREEQREIVKKHEEDLHILHHRLELQADSSLNKFKQTAWDLMKQSPTPVPTNKHFIRLAEMEQTVAEQDDSLSSLLVKLKKVSQDLERQREITELKVKEFENIKLQLQENHEDEVKKVKAEVEDLKYLLDQSQKESQCLKSELQAQKEANSRAPTTTMRNLVERLKSQLALKEKQQKALSRALLELRAEMTAAAEERIISATSQKEAHLNVQQIVDRHTRELKTQVEDLNENLLKLKEALKTSKNRENSLTDNLNDLNNELQKKQKAYNKILREKEEIDQENDELKRQIKRLTSGLQGKPLTDNKQSLIEELQRKVKKLENQLEGKVEEVDLKPMKEKNAKEELIRWEEGKKWQAKIEGIRNKLKEKEGEVFTLTKQLNTLKDLFAKADKEKLTLQRKLKTTGMTVDQVLGIRALESEKELEELKKRNLDLENDILYMRAHQALPRDSVVEDLHLQNRYLQEKLHALEKQFSKDTYSKPSISGIESDDHCQREQELQKENLKLSSENIELKFQLEQANKDLPRLKNQVRDLKEMCEFLKKEKAEVQRKLGHVRGSGRSGKTIPELEKTIGLMKKVVEKVQRENEQLKKASGILTSEKMANIEQENEKLKAELEKLKAHLGHQLSMHYESKTKGTEKIIAENERLRKELKKETDAAEKLRIAKNNLEILNEKMTVQLEETGKRLQFAESRGPQLEGADSKSWKSIVVTRMYETKLKELETDIAKKNQSITDLKQLVKEATEREQKVNKYNEDLEQQIKILKHVPEGAETEQGLKRELQVLRLANHQLDKEKAELIHQIEANKDQSGAESTIPDADQLKEKIKDLETQLKMSDLEKQHLKEEIKKLKKELENFDPSFFEEIEDLKYNYKEEVKKNILLEEKVKKLSEQLGVELTSPVAASEEFEDEEESPVNFPIY
2 1 2
----------------------------------------------------------------------------------KENFNLKLRIYFLEERMQQE--FHG--PTEHIYKTNIELKVEVESLKRELQEREQLLIKASKAVESLAEAGGSEIQRVKEDARKKVQQVEDLLTKRILLLEKDVTAAQAELEKAFAGTETEKALRLRLESKLSEMKKMHEGDLAMALVLDEKDRLIEELKLSLKSKEALIQCLKEEKSQMACPDENVSSGELRGLCAAPREEK--ERETEAAQMEHQKERNSFEERIQALEEDLREKEREIATEKKNSLKRDKAIQGLTMALKSKEKKVEELNSEIEKLSAAFAKAR-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
#
#
loop_
_ma_protocol_step.ordinal_id
_ma_protocol_step.protocol_id
_ma_protocol_step.step_id
_ma_protocol_step.method_type
_ma_protocol_step.step_name
_ma_protocol_step.details
_ma_protocol_step.software_group_id
_ma_protocol_step.input_data_group_id
_ma_protocol_step.output_data_group_id
1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2
1 2
2 1 2 'template selection' 'template selection'
'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.162}' 3 2 4
3 1 3 modeling 'homology modeling'
'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 9g40.1' 4 3 5
#
#
loop_
_ma_model_list.ordinal_id
_ma_model_list.model_id
_ma_model_list.model_group_id
_ma_model_list.model_name
_ma_model_list.model_group_name
_ma_model_list.data_id
_ma_model_list.model_type
_ma_model_list.model_type_other_details
1 1 1 'model 18' . 4 'Homology model' .
#
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
ATOM 1 N N . PHE 83 83 ? A 213.889 230.568 215.403 1 1 E PHE 0.440 1
ATOM 2 C CA . PHE 83 83 ? A 213.518 231.413 216.586 1 1 E PHE 0.440 1
ATOM 3 C C . PHE 83 83 ? A 214.712 231.781 217.467 1 1 E PHE 0.440 1
ATOM 4 O O . PHE 83 83 ? A 214.954 232.954 217.687 1 1 E PHE 0.440 1
ATOM 5 C CB . PHE 83 83 ? A 212.363 230.733 217.358 1 1 E PHE 0.440 1
ATOM 6 C CG . PHE 83 83 ? A 211.660 231.723 218.251 1 1 E PHE 0.440 1
ATOM 7 C CD1 . PHE 83 83 ? A 211.897 231.743 219.634 1 1 E PHE 0.440 1
ATOM 8 C CD2 . PHE 83 83 ? A 210.725 232.623 217.714 1 1 E PHE 0.440 1
ATOM 9 C CE1 . PHE 83 83 ? A 211.195 232.627 220.465 1 1 E PHE 0.440 1
ATOM 10 C CE2 . PHE 83 83 ? A 210.028 233.511 218.543 1 1 E PHE 0.440 1
ATOM 11 C CZ . PHE 83 83 ? A 210.261 233.512 219.920 1 1 E PHE 0.440 1
ATOM 12 N N . GLU 84 84 ? A 215.547 230.811 217.921 1 1 E GLU 0.600 1
ATOM 13 C CA . GLU 84 84 ? A 216.745 231.081 218.711 1 1 E GLU 0.600 1
ATOM 14 C C . GLU 84 84 ? A 217.736 232.060 218.083 1 1 E GLU 0.600 1
ATOM 15 O O . GLU 84 84 ? A 218.188 232.994 218.731 1 1 E GLU 0.600 1
ATOM 16 C CB . GLU 84 84 ? A 217.445 229.744 218.973 1 1 E GLU 0.600 1
ATOM 17 C CG . GLU 84 84 ? A 216.620 228.791 219.865 1 1 E GLU 0.600 1
ATOM 18 C CD . GLU 84 84 ? A 217.358 227.465 220.062 1 1 E GLU 0.600 1
ATOM 19 O OE1 . GLU 84 84 ? A 218.422 227.283 219.418 1 1 E GLU 0.600 1
ATOM 20 O OE2 . GLU 84 84 ? A 216.844 226.642 220.854 1 1 E GLU 0.600 1
ATOM 21 N N . ASN 85 85 ? A 218.031 231.935 216.771 1 1 E ASN 0.560 1
ATOM 22 C CA . ASN 85 85 ? A 218.840 232.914 216.043 1 1 E ASN 0.560 1
ATOM 23 C C . ASN 85 85 ? A 218.286 234.344 216.080 1 1 E ASN 0.560 1
ATOM 24 O O . ASN 85 85 ? A 219.026 235.302 216.268 1 1 E ASN 0.560 1
ATOM 25 C CB . ASN 85 85 ? A 219.030 232.488 214.561 1 1 E ASN 0.560 1
ATOM 26 C CG . ASN 85 85 ? A 219.911 231.242 214.507 1 1 E ASN 0.560 1
ATOM 27 O OD1 . ASN 85 85 ? A 220.615 230.921 215.459 1 1 E ASN 0.560 1
ATOM 28 N ND2 . ASN 85 85 ? A 219.885 230.514 213.367 1 1 E ASN 0.560 1
ATOM 29 N N . GLN 86 86 ? A 216.955 234.503 215.935 1 1 E GLN 0.550 1
ATOM 30 C CA . GLN 86 86 ? A 216.244 235.764 216.082 1 1 E GLN 0.550 1
ATOM 31 C C . GLN 86 86 ? A 216.281 236.327 217.494 1 1 E GLN 0.550 1
ATOM 32 O O . GLN 86 86 ? A 216.392 237.529 217.684 1 1 E GLN 0.550 1
ATOM 33 C CB . GLN 86 86 ? A 214.771 235.634 215.636 1 1 E GLN 0.550 1
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ATOM 36 O OE1 . GLN 86 86 ? A 212.372 234.589 214.600 1 1 E GLN 0.550 1
ATOM 37 N NE2 . GLN 86 86 ? A 212.692 235.535 212.571 1 1 E GLN 0.550 1
ATOM 38 N N . LEU 87 87 ? A 216.182 235.476 218.533 1 1 E LEU 0.580 1
ATOM 39 C CA . LEU 87 87 ? A 216.428 235.880 219.907 1 1 E LEU 0.580 1
ATOM 40 C C . LEU 87 87 ? A 217.848 236.365 220.138 1 1 E LEU 0.580 1
ATOM 41 O O . LEU 87 87 ? A 218.060 237.404 220.756 1 1 E LEU 0.580 1
ATOM 42 C CB . LEU 87 87 ? A 216.155 234.718 220.883 1 1 E LEU 0.580 1
ATOM 43 C CG . LEU 87 87 ? A 214.671 234.374 221.071 1 1 E LEU 0.580 1
ATOM 44 C CD1 . LEU 87 87 ? A 214.563 233.023 221.792 1 1 E LEU 0.580 1
ATOM 45 C CD2 . LEU 87 87 ? A 213.944 235.477 221.859 1 1 E LEU 0.580 1
ATOM 46 N N . LYS 88 88 ? A 218.860 235.647 219.606 1 1 E LYS 0.620 1
ATOM 47 C CA . LYS 88 88 ? A 220.251 236.056 219.711 1 1 E LYS 0.620 1
ATOM 48 C C . LYS 88 88 ? A 220.514 237.414 219.075 1 1 E LYS 0.620 1
ATOM 49 O O . LYS 88 88 ? A 221.096 238.295 219.702 1 1 E LYS 0.620 1
ATOM 50 C CB . LYS 88 88 ? A 221.203 235.014 219.066 1 1 E LYS 0.620 1
ATOM 51 C CG . LYS 88 88 ? A 221.239 233.635 219.753 1 1 E LYS 0.620 1
ATOM 52 C CD . LYS 88 88 ? A 221.788 233.671 221.189 1 1 E LYS 0.620 1
ATOM 53 C CE . LYS 88 88 ? A 221.898 232.298 221.857 1 1 E LYS 0.620 1
ATOM 54 N NZ . LYS 88 88 ? A 222.875 231.485 221.108 1 1 E LYS 0.620 1
ATOM 55 N N . THR 89 89 ? A 220.024 237.639 217.836 1 1 E THR 0.630 1
ATOM 56 C CA . THR 89 89 ? A 220.165 238.917 217.140 1 1 E THR 0.630 1
ATOM 57 C C . THR 89 89 ? A 219.482 240.071 217.840 1 1 E THR 0.630 1
ATOM 58 O O . THR 89 89 ? A 220.025 241.169 217.910 1 1 E THR 0.630 1
ATOM 59 C CB . THR 89 89 ? A 219.736 238.933 215.672 1 1 E THR 0.630 1
ATOM 60 O OG1 . THR 89 89 ? A 218.384 238.558 215.462 1 1 E THR 0.630 1
ATOM 61 C CG2 . THR 89 89 ? A 220.599 237.955 214.873 1 1 E THR 0.630 1
ATOM 62 N N . LYS 90 90 ? A 218.271 239.854 218.390 1 1 E LYS 0.640 1
ATOM 63 C CA . LYS 90 90 ? A 217.576 240.829 219.213 1 1 E LYS 0.640 1
ATOM 64 C C . LYS 90 90 ? A 218.279 241.182 220.516 1 1 E LYS 0.640 1
ATOM 65 O O . LYS 90 90 ? A 218.408 242.359 220.843 1 1 E LYS 0.640 1
ATOM 66 C CB . LYS 90 90 ? A 216.139 240.367 219.532 1 1 E LYS 0.640 1
ATOM 67 C CG . LYS 90 90 ? A 215.235 240.371 218.292 1 1 E LYS 0.640 1
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ATOM 74 O O . VAL 91 91 ? A 221.191 242.139 222.866 1 1 E VAL 0.670 1
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ATOM 78 N N . MET 92 92 ? A 221.577 240.840 221.084 1 1 E MET 0.590 1
ATOM 79 C CA . MET 92 92 ? A 222.750 241.579 220.631 1 1 E MET 0.590 1
ATOM 80 C C . MET 92 92 ? A 222.470 243.038 220.292 1 1 E MET 0.590 1
ATOM 81 O O . MET 92 92 ? A 223.256 243.928 220.608 1 1 E MET 0.590 1
ATOM 82 C CB . MET 92 92 ? A 223.366 240.927 219.372 1 1 E MET 0.590 1
ATOM 83 C CG . MET 92 92 ? A 224.028 239.561 219.618 1 1 E MET 0.590 1
ATOM 84 S SD . MET 92 92 ? A 224.478 238.693 218.084 1 1 E MET 0.590 1
ATOM 85 C CE . MET 92 92 ? A 225.866 239.790 217.677 1 1 E MET 0.590 1
ATOM 86 N N . LYS 93 93 ? A 221.327 243.319 219.629 1 1 E LYS 0.610 1
ATOM 87 C CA . LYS 93 93 ? A 220.875 244.677 219.385 1 1 E LYS 0.610 1
ATOM 88 C C . LYS 93 93 ? A 220.619 245.446 220.683 1 1 E LYS 0.610 1
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ATOM 103 N N . GLU 95 95 ? A 221.981 244.677 223.770 1 1 E GLU 0.570 1
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ATOM 112 N N . ASN 96 96 ? A 224.130 246.105 222.482 1 1 E ASN 0.560 1
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ATOM 115 O O . ASN 96 96 ? A 224.847 249.501 222.703 1 1 E ASN 0.560 1
ATOM 116 C CB . ASN 96 96 ? A 224.731 247.166 220.313 1 1 E ASN 0.560 1
ATOM 117 C CG . ASN 96 96 ? A 225.649 246.050 219.820 1 1 E ASN 0.560 1
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ATOM 119 N ND2 . ASN 96 96 ? A 225.446 245.605 218.555 1 1 E ASN 0.560 1
ATOM 120 N N . GLU 97 97 ? A 222.795 248.698 222.409 1 1 E GLU 0.510 1
ATOM 121 C CA . GLU 97 97 ? A 222.134 249.875 222.960 1 1 E GLU 0.510 1
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ATOM 125 C CG . GLU 97 97 ? A 220.061 249.824 221.410 1 1 E GLU 0.510 1
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ATOM 127 O OE1 . GLU 97 97 ? A 217.924 249.277 222.376 1 1 E GLU 0.510 1
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ATOM 135 C CD1 . LEU 98 98 ? A 221.638 245.963 228.215 1 1 E LEU 0.460 1
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ATOM 146 N N . MET 100 100 ? A 226.438 251.456 224.323 1 1 E MET 0.370 1
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ATOM 154 N N . ALA 101 101 ? A 225.909 253.923 225.599 1 1 E ALA 0.340 1
ATOM 155 C CA . ALA 101 101 ? A 225.760 255.030 226.528 1 1 E ALA 0.340 1
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ATOM 157 O O . ALA 101 101 ? A 227.703 254.161 227.719 1 1 E ALA 0.340 1
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ATOM 159 O OXT . ALA 101 101 ? A 226.814 256.057 228.447 1 1 E ALA 0.340 1
#
#
loop_
_atom_type.symbol
C
N
O
S
#
#
loop_
_ma_qa_metric.id
_ma_qa_metric.name
_ma_qa_metric.description
_ma_qa_metric.type
_ma_qa_metric.mode
_ma_qa_metric.type_other_details
_ma_qa_metric.software_group_id
1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].'
'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5
2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].'
'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5
3 GMQE
'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.'
'normalized score' global . 6
#
#
loop_
_ma_qa_metric_global.ordinal_id
_ma_qa_metric_global.model_id
_ma_qa_metric_global.metric_id
_ma_qa_metric_global.metric_value
1 1 2 0.543
2 1 3 0
#
#
loop_
_ma_qa_metric_local.ordinal_id
_ma_qa_metric_local.model_id
_ma_qa_metric_local.label_asym_id
_ma_qa_metric_local.label_seq_id
_ma_qa_metric_local.label_comp_id
_ma_qa_metric_local.metric_id
_ma_qa_metric_local.metric_value
1 1 A 83 PHE 1 0.440
2 1 A 84 GLU 1 0.600
3 1 A 85 ASN 1 0.560
4 1 A 86 GLN 1 0.550
5 1 A 87 LEU 1 0.580
6 1 A 88 LYS 1 0.620
7 1 A 89 THR 1 0.630
8 1 A 90 LYS 1 0.640
9 1 A 91 VAL 1 0.670
10 1 A 92 MET 1 0.590
11 1 A 93 LYS 1 0.610
12 1 A 94 LEU 1 0.600
13 1 A 95 GLU 1 0.570
14 1 A 96 ASN 1 0.560
15 1 A 97 GLU 1 0.510
16 1 A 98 LEU 1 0.460
17 1 A 99 GLU 1 0.420
18 1 A 100 MET 1 0.370
19 1 A 101 ALA 1 0.340
#
#
loop_
_pdbx_data_usage.id
_pdbx_data_usage.type
_pdbx_data_usage.details
_pdbx_data_usage.url
1 license
;This SWISS-MODEL protein model is copyright.
It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational
Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the
Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This
model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons
Attribution-ShareAlike 4.0 International License
(https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you
can copy and redistribute the model in any medium or format,
transform and build upon the model for any purpose, even
commercially, under the following terms:
Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to
the license, and indicate if changes were made. You may do so in any
reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor
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you must distribute your contributions under the same license as the
original.
No additional restrictions - you may not apply legal terms or
technological measures that legally restrict others from doing
anything the license permits.
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CC BY-SA 4.0 license at this link:
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;
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2 disclaimer
;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for
proteins. The results of any theoretical modelling procedure is
NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may
contain significant errors. This is especially true for automated
modeling since there is no human intervention during model
building. Please read the header section and the logfile carefully
to know what templates and alignments were used during the model
building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is
provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied.
;
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#