data_SMR-f64e70fad143f4278ad88f2cd32fe37f_6 _entry.id SMR-f64e70fad143f4278ad88f2cd32fe37f_6 _struct.entry_id SMR-f64e70fad143f4278ad88f2cd32fe37f_6 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - P16112 (isoform 2)/ PGCA_HUMAN, Aggrecan core protein Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P16112 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 5 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 302453.935 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP PGCA_HUMAN P16112 1 ;MTTLLWVFVTLRVITAAVTVETSDHDNSLSVSIPQPSPLRVLLGTSLTIPCYFIDPMHPVTTAPSTAPLA PRIKWSRVSKEKEVVLLVATEGRVRVNSAYQDKVSLPNYPAIPSDATLEVQSLRSNDSGVYRCEVMHGIE DSEATLEVVVKGIVFHYRAISTRYTLDFDRAQRACLQNSAIIATPEQLQAAYEDGFHQCDAGWLADQTVR YPIHTPREGCYGDKDEFPGVRTYGIRDTNETYDVYCFAEEMEGEVFYATSPEKFTFQEAANECRRLGARL ATTGQLYLAWQAGMDMCSAGWLADRSVRYPISKARPNCGGNLLGVRTVYVHANQTGYPDPSSRYDAICYT GEDFVDIPENFFGVGGEEDITVQTVTWPDMELPLPRNITEGEARGSVILTVKPIFEVSPSPLEPEEPFTF APEIGATAFAEVENETGEATRPWGFPTPGLGPATAFTSEDLVVQVTAVPGQPHLPGGVVFHYRPGPTRYS LTFEEAQQACLRTGAVIASPEQLQAAYEAGYEQCDAGWLRDQTVRYPIVSPRTPCVGDKDSSPGVRTYGV RPSTETYDVYCFVDRLEGEVFFATRLEQFTFQEALEFCESHNATLATTGQLYAAWSRGLDKCYAGWLADG SLRYPIVTPRPACGGDKPGVRTVYLYPNQTGLPDPLSRHHAFCFRGISAVPSPGEEEGGTPTSPSGVEEW IVTQVVPGVAAVPVEEETTAVPSGETTAILEFTTEPENQTEWEPAYTPVGTSPLPGILPTWPPTGAATEE STEGPSATEVPSASEEPSPSEVPFPSEEPSPSEEPFPSVRPFPSVELFPSEEPFPSKEPSPSEEPSASEE PYTPSPPVPSWTELPSSGEESGAPDVSGDFTGSGDVSGHLDFSGQLSGDRASGLPSGDLDSSGLTSTVGS GLPVESGLPSGDEERIEWPSTPTVGELPSGAEILEGSASGVGDLSGLPSGEVLETSASGVGDLSGLPSGE VLETTAPGVEDISGLPSGEVLETTAPGVEDISGLPSGEVLETTAPGVEDISGLPSGEVLETTAPGVEDIS GLPSGEVLETTAPGVEDISGLPSGEVLETTAPGVEDISGLPSGEVLETAAPGVEDISGLPSGEVLETAAP GVEDISGLPSGEVLETAAPGVEDISGLPSGEVLETAAPGVEDISGLPSGEVLETAAPGVEDISGLPSGEV LETAAPGVEDISGLPSGEVLETAAPGVEDISGLPSGEVLETAAPGVEDISGLPSGEVLETAAPGVEDISG LPSGEVLETAAPGVEDISGLPSGEVLETAAPGVEDISGLPSGEVLETAAPGVEDISGLPSGEVLETAAPG VEDISGLPSGEVLETAAPGVEDISGLPSGEVLETAAPGVEDISGLPSGEVLETAAPGVEDISGLPSGEVL ETTAPGVEEISGLPSGEVLETTAPGVDEISGLPSGEVLETTAPGVEEISGLPSGEVLETSTSAVGDLSGL PSGGEVLEISVSGVEDISGLPSGEVVETSASGIEDVSELPSGEGLETSASGVEDLSRLPSGEEVLEISAS GFGDLSGLPSGGEGLETSASEVGTDLSGLPSGREGLETSASGAEDLSGLPSGKEDLVGSASGDLDLGKLP SGTLGSGQAPETSGLPSGFSGEYSGVDLGSGPPSGLPDFSGLPSGFPTVSLVDSTLVEVVTASTASELEG RGTIGISGAGEISGLPSSELDISGRASGLPSGTELSGQASGSPDVSGEIPGLFGVSGQPSGFPDTSGETS GVTELSGLSSGQPGISGEASGVLYGTSQPFGITDLSGETSGVPDLSGQPSGLPGFSGATSGVPDLVSGTT SGSGESSGITFVDTSLVEVAPTTFKEEEGLGSVELSGLPSGEADLSGKSGMVDVSGQFSGTVDSSGFTSQ TPEFSGLPSGIAEVSGESSRAEIGSSLPSGAYYGSGTPSSFPTVSLVDRTLVESVTQAPTAQEAGEGPSG ILELSGAHSGAPDMSGEHSGFLDLSGLQSGLIEPSGEPPGTPYFSGDFASTTNVSGESSVAMGTSGEASG LPEVTLITSEFVEGVTEPTISQELGQRPPVTHTPQLFESSGKVSTAGDISGATPVLPGSGVEVSSVPESS SETSAYPEAGFGASAAPEASREDSGSPDLSETTSAFHEANLERSSGLGVSGSTLTFQEGEASAAPEVSGE STTTSDVGTEAPGLPSATPTASGDRTEISGDLSGHTSQLGVVISTSIPESEWTQQTQRPAETHLEIESSS LLYSGEETHTVETATSPTDASIPASPEWKRESESTAADQEVCEEGWNKYQGHCYRHFPDRETWVDAERRC REQQSHLSSIVTPEEQEFVNNNAQDYQWIGLNDRTIEGDFRWSDGHPMQFENWRPNQPDNFFAAGEDCVV MIWHEKGEWNDVPCNYHLPFTCKKGTVACGEPPVVEHARTFGQKKDRYEINSLVRYQCTEGFVQRHMPTI RCQPSGHWEEPQITCTDPTTYKRRLQKRSSRHPRRSRPSTAH ; 'Aggrecan core protein' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2492 1 2492 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . PGCA_HUMAN P16112 P16112-2 1 2492 9606 'Homo sapiens (Human)' 2018-03-28 8473F19E0104B24D # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MTTLLWVFVTLRVITAAVTVETSDHDNSLSVSIPQPSPLRVLLGTSLTIPCYFIDPMHPVTTAPSTAPLA PRIKWSRVSKEKEVVLLVATEGRVRVNSAYQDKVSLPNYPAIPSDATLEVQSLRSNDSGVYRCEVMHGIE DSEATLEVVVKGIVFHYRAISTRYTLDFDRAQRACLQNSAIIATPEQLQAAYEDGFHQCDAGWLADQTVR YPIHTPREGCYGDKDEFPGVRTYGIRDTNETYDVYCFAEEMEGEVFYATSPEKFTFQEAANECRRLGARL ATTGQLYLAWQAGMDMCSAGWLADRSVRYPISKARPNCGGNLLGVRTVYVHANQTGYPDPSSRYDAICYT GEDFVDIPENFFGVGGEEDITVQTVTWPDMELPLPRNITEGEARGSVILTVKPIFEVSPSPLEPEEPFTF APEIGATAFAEVENETGEATRPWGFPTPGLGPATAFTSEDLVVQVTAVPGQPHLPGGVVFHYRPGPTRYS LTFEEAQQACLRTGAVIASPEQLQAAYEAGYEQCDAGWLRDQTVRYPIVSPRTPCVGDKDSSPGVRTYGV RPSTETYDVYCFVDRLEGEVFFATRLEQFTFQEALEFCESHNATLATTGQLYAAWSRGLDKCYAGWLADG 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A 1 2380 VAL 2380 2380 VAL VAL A . A 1 2381 MET 2381 2381 MET MET A . A 1 2382 ILE 2382 2382 ILE ILE A . A 1 2383 TRP 2383 2383 TRP TRP A . A 1 2384 HIS 2384 2384 HIS HIS A . A 1 2385 GLU 2385 2385 GLU GLU A . A 1 2386 LYS 2386 2386 LYS LYS A . A 1 2387 GLY 2387 2387 GLY GLY A . A 1 2388 GLU 2388 2388 GLU GLU A . A 1 2389 TRP 2389 2389 TRP TRP A . A 1 2390 ASN 2390 2390 ASN ASN A . A 1 2391 ASP 2391 2391 ASP ASP A . A 1 2392 VAL 2392 2392 VAL VAL A . A 1 2393 PRO 2393 2393 PRO PRO A . A 1 2394 CYS 2394 2394 CYS CYS A . A 1 2395 ASN 2395 2395 ASN ASN A . A 1 2396 TYR 2396 2396 TYR TYR A . A 1 2397 HIS 2397 2397 HIS HIS A . A 1 2398 LEU 2398 2398 LEU LEU A . A 1 2399 PRO 2399 2399 PRO PRO A . A 1 2400 PHE 2400 2400 PHE PHE A . A 1 2401 THR 2401 2401 THR THR A . A 1 2402 CYS 2402 2402 CYS CYS A . A 1 2403 LYS 2403 2403 LYS LYS A . A 1 2404 LYS 2404 2404 LYS LYS A . A 1 2405 GLY 2405 2405 GLY GLY A . A 1 2406 THR 2406 2406 THR THR A . A 1 2407 VAL 2407 2407 VAL VAL A . A 1 2408 ALA 2408 2408 ALA ALA A . A 1 2409 CYS 2409 2409 CYS CYS A . A 1 2410 GLY 2410 2410 GLY GLY A . A 1 2411 GLU 2411 2411 GLU GLU A . A 1 2412 PRO 2412 2412 PRO PRO A . A 1 2413 PRO 2413 2413 PRO PRO A . A 1 2414 VAL 2414 2414 VAL VAL A . A 1 2415 VAL 2415 2415 VAL VAL A . A 1 2416 GLU 2416 2416 GLU GLU A . A 1 2417 HIS 2417 2417 HIS HIS A . A 1 2418 ALA 2418 2418 ALA ALA A . A 1 2419 ARG 2419 2419 ARG ARG A . A 1 2420 THR 2420 2420 THR THR A . A 1 2421 PHE 2421 2421 PHE PHE A . A 1 2422 GLY 2422 2422 GLY GLY A . A 1 2423 GLN 2423 2423 GLN GLN A . A 1 2424 LYS 2424 2424 LYS LYS A . A 1 2425 LYS 2425 2425 LYS LYS A . A 1 2426 ASP 2426 2426 ASP ASP A . A 1 2427 ARG 2427 2427 ARG ARG A . A 1 2428 TYR 2428 2428 TYR TYR A . A 1 2429 GLU 2429 2429 GLU GLU A . A 1 2430 ILE 2430 2430 ILE ILE A . A 1 2431 ASN 2431 2431 ASN ASN A . A 1 2432 SER 2432 2432 SER SER A . A 1 2433 LEU 2433 2433 LEU LEU A . A 1 2434 VAL 2434 2434 VAL VAL A . A 1 2435 ARG 2435 2435 ARG ARG A . A 1 2436 TYR 2436 2436 TYR TYR A . A 1 2437 GLN 2437 2437 GLN GLN A . A 1 2438 CYS 2438 2438 CYS CYS A . A 1 2439 THR 2439 2439 THR THR A . A 1 2440 GLU 2440 2440 GLU GLU A . A 1 2441 GLY 2441 2441 GLY GLY A . A 1 2442 PHE 2442 2442 PHE PHE A . A 1 2443 VAL 2443 2443 VAL VAL A . A 1 2444 GLN 2444 2444 GLN GLN A . A 1 2445 ARG 2445 2445 ARG ARG A . A 1 2446 HIS 2446 2446 HIS HIS A . A 1 2447 MET 2447 2447 MET MET A . A 1 2448 PRO 2448 2448 PRO PRO A . A 1 2449 THR 2449 2449 THR THR A . A 1 2450 ILE 2450 2450 ILE ILE A . A 1 2451 ARG 2451 2451 ARG ARG A . A 1 2452 CYS 2452 2452 CYS CYS A . A 1 2453 GLN 2453 2453 GLN GLN A . A 1 2454 PRO 2454 2454 PRO PRO A . A 1 2455 SER 2455 2455 SER SER A . A 1 2456 GLY 2456 2456 GLY GLY A . A 1 2457 HIS 2457 2457 HIS HIS A . A 1 2458 TRP 2458 2458 TRP TRP A . A 1 2459 GLU 2459 2459 GLU GLU A . A 1 2460 GLU 2460 2460 GLU GLU A . A 1 2461 PRO 2461 2461 PRO PRO A . A 1 2462 GLN 2462 2462 GLN GLN A . A 1 2463 ILE 2463 2463 ILE ILE A . 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A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'E-selectin {PDB ID=8r5m, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=8r5m.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by BLAST to 8r5m, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 6' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-04 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-29 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;WSYNTSTEAMTYDEASAYCQQRYTHLVAIQNKEEIEYLNSILSYSPSYYWIGIRKVNNVWVWVGTQKPLT EEAKNWAPGEPNNRQKDEDCVEIYIKREKDVGMWNDERCSKKKLALCYTAACTNTSCSGHGECVETINNY TCKCDPGFSGLKCEQIVNCTALESPEHGSLVCSHPLGNFSYNSSCSISCDRGYLPSSMETMQCMSSGEWS APIPACNVVECDAVTNPANGFVECFQNPGSFPWNTTCTFDCEEGFELMGAQSLQCTSSGNWDNEKPTCKA ; ;WSYNTSTEAMTYDEASAYCQQRYTHLVAIQNKEEIEYLNSILSYSPSYYWIGIRKVNNVWVWVGTQKPLT EEAKNWAPGEPNNRQKDEDCVEIYIKREKDVGMWNDERCSKKKLALCYTAACTNTSCSGHGECVETINNY TCKCDPGFSGLKCEQIVNCTALESPEHGSLVCSHPLGNFSYNSSCSISCDRGYLPSSMETMQCMSSGEWS APIPACNVVECDAVTNPANGFVECFQNPGSFPWNTTCTFDCEEGFELMGAQSLQCTSSGNWDNEKPTCKA ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 11 216 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8r5m 2024-10-23 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2492 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2537 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'BLAST e-value' . 6.08e-07 34.161 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MTTLLWVFVTLRVITAAVTVETSDHDNSLSVSIPQPSPLRVLLGTSLTIPCYFIDPMHPVTTAPSTAPLAPRIKWSRVSKEKEVVLLVATEGRVRVNSAYQDKVSLPNYPAIPSDATLEVQSLRSNDSGVYRCEVMHGIEDSEATLEVVVKGIVFHYRAISTRYTLDFDRAQRACLQNSAIIATPEQLQAAYEDGFHQCDAGWLADQTVRYPIHTPREGCYGDKDEFPGVRTYGIRDTNETYDVYCFAEEMEGEVFYATSPEKFTFQEAANECRRLGARLATTGQLYLAWQAGMDMCSAGWLADRSVRYPISKARPNCGGNLLGVRTVYVHANQTGYPDPSSRYDAICYTGEDFVDIPENFFGVGGEEDITVQTVTWPDMELPLPRNITEGEARGSVILTVKPIFEVSPSPLEPEEPFTFAPEIGATAFAEVENETGEATRPWGFPTPGLGPATAFTSEDLVVQVTAVPGQPHLPGGVVFHYRPGPTRYSLTFEEAQQACLRTGAVIASPEQLQAAYEAGYEQCDAGWLRDQTVRYPIVSPRTPCVGDKDSSPGVRTYGVRPSTETYDVYCFVDRLEGEVFFATRLEQFTFQEALEFCESHNATLATTGQLYAAWSRGLDKCYAGWLADGSLRYPIVTPRPACGGDKPGVRTVYLYPNQTGLPDPLSRHHAFCFRGISAVPSPGEEEGGTPTSPSGVEEWIVTQVVPGVAAVPVEEETTAVPSGETTAILEFTTEPENQTEWEPAYTPVGTSPLPGILPTWPPTGAATEESTEGPSATEVPSASEEPSPSEVPFPSEEPSPSEEPFPSVRPFPSVELFPSEEPFPSKEPSPSEEPSASEEPYTPSPPVPSWTELPSSGEESGAPDVSGDFTGSGDVSGHLDFSGQLSGDRASGLPSGDLDSSGLTSTVGSGLPVESGLPSGDEERIEWPSTPTVGELPSGAEILEGSASGVGDLSGLPSGEVLETSASGVGDLSGLPSGEVLETTAPGVEDISGLPSGEVLETTAPGVEDISGLPSGEVLETTAPGVEDISGLPSGEVLETTAPGVEDISGLPSGEVLETTAPGVEDISGLPSGEVLETTAPGVEDISGLPSGEVLETAAPGVEDISGLPSGEVLETAAPGVEDISGLPSGEVLETAAPGVEDISGLPSGEVLETAAPGVEDISGLPSGEVLETAAPGVEDISGLPSGEVLETAAPGVEDISGLPSGEVLETAAPGVEDISGLPSGEVLETAAPGVEDISGLPSGEVLETAAPGVEDISGLPSGEVLETAAPGVEDISGLPSGEVLETAAPGVEDISGLPSGEVLETAAPGVEDISGLPSGEVLETAAPGVEDISGLPSGEVLETAAPGVEDISGLPSGEVLETAAPGVEDISGLPSGEVLETAAPGVEDISGLPSGEVLETTAPGVEEISGLPSGEVLETTAPGVDEISGLPSGEVLETTAPGVEEISGLPSGEVLETSTSAVGDLSGLPSGGEVLEISVSGVEDISGLPSGEVVETSASGIEDVSELPSGEGLETSASGVEDLSRLPSGEEVLEISASGFGDLSGLPSGGEGLETSASEVGTDLSGLPSGREGLETSASGAEDLSGLPSGKEDLVGSASGDLDLGKLPSGTLGSGQAPETSGLPSGFSGEYSGVDLGSGPPSGLPDFSGLPSGFPTVSLVDSTLVEVVTASTASELEGRGTIGISGAGEISGLPSSELDISGRASGLPSGTELSGQASGSPDVSGEIPGLFGVSGQPSGFPDTSGETSGVTELSGLSSGQPGISGEASGVLYGTSQPFGITDLSGETSGVPDLSGQPSGLPGFSGATSGVPDLVSGTTSGSGESSGITFVDTSLVEVAPTTFKEEEGLGSVELSGLPSGEADLSGKSGMVDVSGQFSGTVDSSGFTSQTPEFSGLPSGIAEVSGESSRAEIGSSLPSGAYYGSGTPSSFPTVSLVDRTLVESVTQAPTAQEAGEGPSGILELSGAHSGAPDMSGEHSGFLDLSGLQSGLIEPSGEPPGTPYFSGDFASTTNVSGESSVAMGTSGEASGLPEVTLITSEFVEGVTEPTISQELGQRPPVTHTPQLFESSGKVSTAGDISGATPVLPGSGVEVSSVPESSSETSAYPEAGFGASAAPEASREDSGSPDLSETTSAFHEANLERSSGLGVSGSTLTFQEGEASAAPEVSGESTTTSDVGTEAPGLPSATPTASGDRTEISGDLSGHTSQLGVVISTSIPESEWTQQTQRPAETHLEIESSSLLYSGEETHTVETATSPTDASIPASPEWKRESESTAADQEVCEEGWNKYQGHCYRHFPDRETWVDAERRCREQQSHLSSIVTPEEQEFVN---NNAQDYQWIGLNDRTIEGDFRW-SDGHPMQFE--NWRPNQPDNFFAAGEDCV-VMIWHEK--GEWNDVPCNYH---LPFTCKKGTVAC-GEPPVVEHARTFGQKKD--------------------------------RYEINSLVRYQCTEGFVQRHMPTIRCQPSGHWEEPQITCTDPTTYKRRLQKRSSRHPRRSRPSTAH 2 1 2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TYDEASAYCQQRYTHLVAIQNKEEIEYLNSILSYSPSYYWIGI--RKVNNVWVWVGTQKPLTEEAKNWAPGEPNN-RQKDEDCVEIYIKREKDVGMWNDERCSKKKLALCYTAACTNTSCSGHGECVETINNYTCKCDPGFSGLKCEQIVNCTALESPEHGSLVCSHPLGNFSYNSSCSISCDRGYLPSSMETMQCMSSGEWSAPIPAC--------------------------- 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A -21.687 -13.086 30.062 1 1 A HIS 0.660 1 ATOM 132 N NE2 . HIS 2316 2316 ? A -22.562 -13.214 31.089 1 1 A HIS 0.660 1 ATOM 133 N N . LEU 2317 2317 ? A -18.584 -17.481 33.839 1 1 A LEU 0.650 1 ATOM 134 C CA . LEU 2317 2317 ? A -17.910 -18.761 34.021 1 1 A LEU 0.650 1 ATOM 135 C C . LEU 2317 2317 ? A -17.890 -19.558 32.715 1 1 A LEU 0.650 1 ATOM 136 O O . LEU 2317 2317 ? A -18.811 -19.425 31.915 1 1 A LEU 0.650 1 ATOM 137 C CB . LEU 2317 2317 ? A -18.609 -19.583 35.125 1 1 A LEU 0.650 1 ATOM 138 C CG . LEU 2317 2317 ? A -18.447 -19.021 36.550 1 1 A LEU 0.650 1 ATOM 139 C CD1 . LEU 2317 2317 ? A -19.376 -19.772 37.508 1 1 A LEU 0.650 1 ATOM 140 C CD2 . LEU 2317 2317 ? A -17.004 -19.145 37.056 1 1 A LEU 0.650 1 ATOM 141 N N . SER 2318 2318 ? A -16.832 -20.364 32.417 1 1 A SER 0.690 1 ATOM 142 C CA . SER 2318 2318 ? A -16.718 -20.939 31.065 1 1 A SER 0.690 1 ATOM 143 C C . SER 2318 2318 ? A -17.848 -21.876 30.670 1 1 A SER 0.690 1 ATOM 144 O O . SER 2318 2318 ? A -18.199 -22.810 31.390 1 1 A SER 0.690 1 ATOM 145 C CB . SER 2318 2318 ? A -15.385 -21.643 30.659 1 1 A SER 0.690 1 ATOM 146 O OG . SER 2318 2318 ? A -15.312 -21.703 29.226 1 1 A SER 0.690 1 ATOM 147 N N . SER 2319 2319 ? A -18.420 -21.620 29.483 1 1 A SER 0.630 1 ATOM 148 C CA . SER 2319 2319 ? A -19.522 -22.375 28.911 1 1 A SER 0.630 1 ATOM 149 C C . SER 2319 2319 ? A -19.079 -23.078 27.656 1 1 A SER 0.630 1 ATOM 150 O O . SER 2319 2319 ? A -19.889 -23.629 26.917 1 1 A SER 0.630 1 ATOM 151 C CB . SER 2319 2319 ? A -20.704 -21.473 28.499 1 1 A SER 0.630 1 ATOM 152 O OG . SER 2319 2319 ? A -21.372 -20.958 29.645 1 1 A SER 0.630 1 ATOM 153 N N . ILE 2320 2320 ? A -17.769 -23.101 27.376 1 1 A ILE 0.420 1 ATOM 154 C CA . ILE 2320 2320 ? A -17.224 -23.815 26.244 1 1 A ILE 0.420 1 ATOM 155 C C . ILE 2320 2320 ? A -16.482 -24.968 26.876 1 1 A ILE 0.420 1 ATOM 156 O O . ILE 2320 2320 ? A -15.879 -24.817 27.929 1 1 A ILE 0.420 1 ATOM 157 C CB . ILE 2320 2320 ? 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A -12.851 -28.897 24.108 1 1 A THR 0.620 1 ATOM 171 O O . THR 2322 2322 ? A -12.171 -28.356 24.981 1 1 A THR 0.620 1 ATOM 172 C CB . THR 2322 2322 ? A -13.725 -27.127 22.616 1 1 A THR 0.620 1 ATOM 173 O OG1 . THR 2322 2322 ? A -14.847 -26.330 22.279 1 1 A THR 0.620 1 ATOM 174 C CG2 . THR 2322 2322 ? A -13.253 -27.743 21.294 1 1 A THR 0.620 1 ATOM 175 N N . PRO 2323 2323 ? A -12.429 -30.058 23.578 1 1 A PRO 0.690 1 ATOM 176 C CA . PRO 2323 2323 ? A -11.129 -30.678 23.860 1 1 A PRO 0.690 1 ATOM 177 C C . PRO 2323 2323 ? A -9.914 -29.759 23.898 1 1 A PRO 0.690 1 ATOM 178 O O . PRO 2323 2323 ? A -9.189 -29.788 24.888 1 1 A PRO 0.690 1 ATOM 179 C CB . PRO 2323 2323 ? A -11.012 -31.776 22.795 1 1 A PRO 0.690 1 ATOM 180 C CG . PRO 2323 2323 ? A -12.460 -32.229 22.577 1 1 A PRO 0.690 1 ATOM 181 C CD . PRO 2323 2323 ? A -13.276 -30.944 22.770 1 1 A PRO 0.690 1 ATOM 182 N N . GLU 2324 2324 ? A -9.704 -28.915 22.864 1 1 A GLU 0.600 1 ATOM 183 C CA . GLU 2324 2324 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #