data_SMR-fd48852b5a83700b39eac00e17f0af6f_1 _entry.id SMR-fd48852b5a83700b39eac00e17f0af6f_1 _struct.entry_id SMR-fd48852b5a83700b39eac00e17f0af6f_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q8IVL1/ NAV2_HUMAN, Neuron navigator 2 Estimated model accuracy of this model is 0.042, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q8IVL1' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 5 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 313320.095 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP NAV2_HUMAN Q8IVL1 1 ;MPAILVASKMKSGLPKPVHSAAPILHVPPARAGPQPCYLKLGSKVEVSKTTYPSQIPLKSQVLQGLQEPA GEGLPLRKSGSVENGFDTQIYTDWANHYLAKSGHKRLIRDLQQDVTDGVLLAQIIQVVANEKIEDINGCP KNRSQMIENIDACLNFLAAKGINIQGLSAEEIRNGNLKAILGLFFSLSRYKQQQQQPQKQHLSSPLPPAV SQVAGAPSQCQAGTPQQQVPVTPQAPCQPHQPAPHQQSKAQAEMQSSASSKDSSQSKIIRFTLGQKKISR LPGPTARVSAAGSEAKTRGGSTTANNRRSQSFNNYDKSKPVTSPPPPPSSHEKEPLASSASSHPGMSDNA PASLESGSSSTPTNCSTSSAIPQPGAATKPWRSKSLSVKHSATVSMLSVKPPGPEAPRPTPEAMKPAPNN QKSMLEKLKLFNSKGGSKAGEGPGSRDTSCERLETLPSFEESEELEAASRMLTTVGPASSSPKIALKGIA QRTFSRALTNKKSSLKGNEKEKEKQQREKDKEKSKDLAKRASVTERLDLKEEPKEDPSGAAVPEMPKKSS KIASFIPKGGKLNSAKKEPMAPSHSGIPKPGMKSMPGKSPSAPAPSKEGERSRSGKLSSGLPQQKPQLDG RHSSSSSSLASSEGKGPGGTTLNHSISSQTVSGSVGTTQTTGSNTVSVQLPQPQQQYNHPNTATVAPFLY RSQTDTEGNVTAESSSTGVSVEPSHFTKTGQPALEELTGEDPEARRLRTVKNIADLRQNLEETMSSLRGT QVTHSTLETTFDTNVTTEMSGRSILSLTGRPTPLSWRLGQSSPRLQAGDAPSMGNGYPPRANASRFINTE SGRYVYSAPLRRQLASRGSSVCHVDVSDKAGDEMDLEGISMDAPGYMSDGDVLSKNIRTDDITSGYMTDG GLGLYTRRLNRLPDGMAVVRETLQRNTSLGLGDADSWDDSSSVSSGISDTIDNLSTDDINTSSSISSYAN TPASSRKNLDVQTDAEKHSQVERNSLWSGDDVKKSDGGSDSGIKMEPGSKWRRNPSDVSDESDKSTSGKK NPVISQTGSWRRGMTAQVGITMPRTKPSAPAGALKTPGTGKTDDAKVSEKGRLSPKASQVKRSPSDAGRS SGDESKKPLPSSSRTPTANANSFGFKKQSGSAAGLAMITASGVTVTSRSATLGKIPKSSALVSRSAGRKS SMDGAQNQDDGYLALSSRTNLQYRSLPRPSKSNSRNGAGNRSSTSSIDSNISSKSAGLPVPKLREPSKTA LGSSLPGLVNQTDKEKGISSDNESVASCNSVKVNPAAQPVSSPAQTSLQPGAKYPDVASPTLRRLFGGKP TKQVPIATAENMKNSVVISNPHATMTQQGNLDSPSGSGVLSSGSSSPLYSKNVDLNQSPLASSPSSAHSA PSNSLTWGTNASSSSAVSKDGLGFQSVSSLHTSCESIDISLSSGGVPSHNSSTGLIASSKDDSLTPFVRT NSVKTTLSESPLSSPAASPKFCRSTLPRKQDSDPHLDRNTLPKKGLRYTPTSQLRTQEDAKEWLRSHSAG GLQDTAANSPFSSGSSVTSPSGTRFNFSQLASPTTVTQMSLSNPTMLRTHSLSNADGQYDPYTDSRFRNS SMSLDEKSRTMSRSGSFRDGFEEESWEKSSVDNFVSRLHSSLHFSLPLFHHARYELVHGSSLSLVSSTSS VYSTPEEKCQSEIRKLRRELDASQEKVSALTTQLTANAHLVAAFEQSLGNMTIRLQSLTMTAEQKDSELN ELRKTIELLKKQNAAAQAAINGVINTPELNCKGNGTAQSADLRIRRQHSSDSVSSINSATSHSSVGSNIE SDSKKKKRKNWVNELRSSFKQAFGKKKSPKSASSHSDIEEMTDSSLPSSPKLPHNGSTGSTPLLRNSHSN SLISECMDSEAETVMQLRNELRDKEMKLTDIRLEALSSAHQLDQLREAMNRMQSEIEKLKAENDRLKSES QGSGCSRAPSQVSISASPRQSMGLSQHSLNLTESTSLDMLLDDTGECSARKEGGRHVKIVVSFQEEMKWK EDSRPHLFLIGCIGVSGKTKWDVLDGVVRRLFKEYIIHVDPVSQLGLNSDSVLGYSIGEIKRSNTSETPE LLPCGYLVGENTTISVTVKGLAENSLDSLVFESLIPKPILQRYVSLLIEHRRIILSGPSGTGKTYLANRL SEYIVLREGRELTDGVIATFNVDHKSSKELRQYLSNLADQCNSENNAVDMPLVIILDNLHHVSSLGEIFN GLLNCKYHKCPYIIGTMNQATSSTPNLQLHHNFRWVLCANHTEPVKGFLGRFLRRKLMETEISGRVRNME LVKIIDWIPKVWHHLNRFLEAHSSSDVTIGPRLFLSCPIDVDGSRVWFTDLWNYSIIPYLLEAVREGLQL YGRRAPWEDPAKWVMDTYPWAASPQQHEWPPLLQLRPEDVGFDGYSMPREGSTSKQMPPSDAEGDPLMNM LMRLQEAANYSSPQSYDSDSNSNSHHDDILDSSLESTL ; 'Neuron navigator 2' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2488 1 2488 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . 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A 1 2340 GLY 2340 ? ? ? A . A 1 2341 PRO 2341 ? ? ? A . A 1 2342 ARG 2342 ? ? ? A . A 1 2343 LEU 2343 ? ? ? A . A 1 2344 PHE 2344 ? ? ? A . A 1 2345 LEU 2345 ? ? ? A . A 1 2346 SER 2346 ? ? ? A . A 1 2347 CYS 2347 ? ? ? A . A 1 2348 PRO 2348 ? ? ? A . A 1 2349 ILE 2349 ? ? ? A . A 1 2350 ASP 2350 ? ? ? A . A 1 2351 VAL 2351 ? ? ? A . A 1 2352 ASP 2352 ? ? ? A . A 1 2353 GLY 2353 ? ? ? A . A 1 2354 SER 2354 ? ? ? A . A 1 2355 ARG 2355 ? ? ? A . A 1 2356 VAL 2356 ? ? ? A . A 1 2357 TRP 2357 ? ? ? A . A 1 2358 PHE 2358 ? ? ? A . A 1 2359 THR 2359 ? ? ? A . A 1 2360 ASP 2360 ? ? ? A . A 1 2361 LEU 2361 ? ? ? A . A 1 2362 TRP 2362 ? ? ? A . A 1 2363 ASN 2363 ? ? ? A . A 1 2364 TYR 2364 ? ? ? A . A 1 2365 SER 2365 ? ? ? A . A 1 2366 ILE 2366 ? ? ? A . A 1 2367 ILE 2367 ? ? ? A . A 1 2368 PRO 2368 ? ? ? A . A 1 2369 TYR 2369 ? ? ? A . A 1 2370 LEU 2370 ? ? ? A . A 1 2371 LEU 2371 ? ? ? A . A 1 2372 GLU 2372 ? ? ? A . A 1 2373 ALA 2373 ? ? ? A . A 1 2374 VAL 2374 ? ? ? A . A 1 2375 ARG 2375 ? ? ? A . A 1 2376 GLU 2376 ? ? ? A . A 1 2377 GLY 2377 ? ? ? A . A 1 2378 LEU 2378 ? ? ? A . A 1 2379 GLN 2379 ? ? ? A . A 1 2380 LEU 2380 ? ? ? A . A 1 2381 TYR 2381 ? ? ? A . A 1 2382 GLY 2382 ? ? ? A . A 1 2383 ARG 2383 ? ? ? A . A 1 2384 ARG 2384 ? ? ? A . A 1 2385 ALA 2385 ? ? ? A . A 1 2386 PRO 2386 ? ? ? A . A 1 2387 TRP 2387 ? ? ? A . A 1 2388 GLU 2388 ? ? ? A . A 1 2389 ASP 2389 ? ? ? A . A 1 2390 PRO 2390 ? ? ? A . A 1 2391 ALA 2391 ? ? ? A . A 1 2392 LYS 2392 ? ? ? A . A 1 2393 TRP 2393 ? ? ? A . A 1 2394 VAL 2394 ? ? ? A . A 1 2395 MET 2395 ? ? ? A . A 1 2396 ASP 2396 ? ? ? A . A 1 2397 THR 2397 ? ? ? A . A 1 2398 TYR 2398 ? ? ? A . A 1 2399 PRO 2399 ? ? ? A . A 1 2400 TRP 2400 ? ? ? A . A 1 2401 ALA 2401 ? ? ? A . A 1 2402 ALA 2402 ? ? ? A . A 1 2403 SER 2403 ? ? ? A . A 1 2404 PRO 2404 ? ? ? A . A 1 2405 GLN 2405 ? ? ? A . A 1 2406 GLN 2406 ? ? ? A . A 1 2407 HIS 2407 ? ? ? A . A 1 2408 GLU 2408 ? ? ? A . A 1 2409 TRP 2409 ? ? ? A . A 1 2410 PRO 2410 ? ? ? A . A 1 2411 PRO 2411 ? ? ? A . A 1 2412 LEU 2412 ? ? ? A . A 1 2413 LEU 2413 ? ? ? A . A 1 2414 GLN 2414 ? ? ? A . A 1 2415 LEU 2415 ? ? ? A . A 1 2416 ARG 2416 ? ? ? A . A 1 2417 PRO 2417 ? ? ? A . A 1 2418 GLU 2418 ? ? ? A . A 1 2419 ASP 2419 ? ? ? A . A 1 2420 VAL 2420 ? ? ? A . A 1 2421 GLY 2421 ? ? ? A . A 1 2422 PHE 2422 ? ? ? A . A 1 2423 ASP 2423 ? ? ? A . A 1 2424 GLY 2424 ? ? ? A . A 1 2425 TYR 2425 ? ? ? A . A 1 2426 SER 2426 ? ? ? A . A 1 2427 MET 2427 ? ? ? A . A 1 2428 PRO 2428 ? ? ? A . A 1 2429 ARG 2429 ? ? ? A . A 1 2430 GLU 2430 ? ? ? A . A 1 2431 GLY 2431 ? ? ? A . A 1 2432 SER 2432 ? ? ? A . A 1 2433 THR 2433 ? ? ? A . A 1 2434 SER 2434 ? ? ? A . A 1 2435 LYS 2435 ? ? ? A . A 1 2436 GLN 2436 ? ? ? A . A 1 2437 MET 2437 ? ? ? A . A 1 2438 PRO 2438 ? ? ? A . A 1 2439 PRO 2439 ? ? ? A . A 1 2440 SER 2440 ? ? ? A . A 1 2441 ASP 2441 ? ? ? A . A 1 2442 ALA 2442 ? ? ? A . A 1 2443 GLU 2443 ? ? ? A . A 1 2444 GLY 2444 ? ? ? A . A 1 2445 ASP 2445 ? ? ? A . A 1 2446 PRO 2446 ? ? ? A . A 1 2447 LEU 2447 ? ? ? A . A 1 2448 MET 2448 ? ? ? A . A 1 2449 ASN 2449 ? ? ? A . A 1 2450 MET 2450 ? ? ? A . A 1 2451 LEU 2451 ? ? ? A . A 1 2452 MET 2452 ? ? ? A . A 1 2453 ARG 2453 ? ? ? A . A 1 2454 LEU 2454 ? ? ? A . A 1 2455 GLN 2455 ? ? ? A . A 1 2456 GLU 2456 ? ? ? A . A 1 2457 ALA 2457 ? ? ? A . A 1 2458 ALA 2458 ? ? ? A . A 1 2459 ASN 2459 ? ? ? A . A 1 2460 TYR 2460 ? ? ? A . A 1 2461 SER 2461 ? ? ? A . A 1 2462 SER 2462 ? ? ? A . A 1 2463 PRO 2463 ? ? ? A . A 1 2464 GLN 2464 ? ? ? A . A 1 2465 SER 2465 ? ? ? A . A 1 2466 TYR 2466 ? ? ? A . A 1 2467 ASP 2467 ? ? ? A . A 1 2468 SER 2468 ? ? ? A . A 1 2469 ASP 2469 ? ? ? A . A 1 2470 SER 2470 ? ? ? A . A 1 2471 ASN 2471 ? ? ? A . A 1 2472 SER 2472 ? ? ? A . A 1 2473 ASN 2473 ? ? ? A . A 1 2474 SER 2474 ? ? ? A . A 1 2475 HIS 2475 ? ? ? A . A 1 2476 HIS 2476 ? ? ? A . A 1 2477 ASP 2477 ? ? ? A . A 1 2478 ASP 2478 ? ? ? A . A 1 2479 ILE 2479 ? ? ? A . A 1 2480 LEU 2480 ? ? ? A . A 1 2481 ASP 2481 ? ? ? A . A 1 2482 SER 2482 ? ? ? A . A 1 2483 SER 2483 ? ? ? A . A 1 2484 LEU 2484 ? ? ? A . A 1 2485 GLU 2485 ? ? ? A . A 1 2486 SER 2486 ? ? ? A . A 1 2487 THR 2487 ? ? ? A . A 1 2488 LEU 2488 ? ? ? A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Neuron navigator 2 isoform 4 {PDB ID=2yrn, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=2yrn.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by BLAST to 2yrn, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 1' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-04 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-29 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GSSGSSGKRKPVIHGLEDQKRIYTDWANHYLAKSGHKRLIRDLQQDVTDGVLLAQIIQVVANEKIEDING CPKNRSQMIENIDACLNFLAAKGINIQGLSAEEIRNGNLKAILGLFFSLSRYKQQQQQP ; ;GSSGSSGKRKPVIHGLEDQKRIYTDWANHYLAKSGHKRLIRDLQQDVTDGVLLAQIIQVVANEKIEDING CPKNRSQMIENIDACLNFLAAKGINIQGLSAEEIRNGNLKAILGLFFSLSRYKQQQQQP ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 8 122 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 2yrn 2024-05-29 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2488 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2490 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'BLAST e-value' . 5.52e-60 92.920 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MPAILVASKMKSGLPKPVHSAAPILHVPPARAGPQPCYLKLGSKVEVSKTTYPSQIPLKSQVLQGLQEPAGEGLPLRKSGSVENGFDTQ--IYTDWANHYLAKSGHKRLIRDLQQDVTDGVLLAQIIQVVANEKIEDINGCPKNRSQMIENIDACLNFLAAKGINIQGLSAEEIRNGNLKAILGLFFSLSRYKQQQQQPQKQHLSSPLPPAVSQVAGAPSQCQAGTPQQQVPVTPQAPCQPHQPAPHQQSKAQAEMQSSASSKDSSQSKIIRFTLGQKKISRLPGPTARVSAAGSEAKTRGGSTTANNRRSQSFNNYDKSKPVTSPPPPPSSHEKEPLASSASSHPGMSDNAPASLESGSSSTPTNCSTSSAIPQPGAATKPWRSKSLSVKHSATVSMLSVKPPGPEAPRPTPEAMKPAPNNQKSMLEKLKLFNSKGGSKAGEGPGSRDTSCERLETLPSFEESEELEAASRMLTTVGPASSSPKIALKGIAQRTFSRALTNKKSSLKGNEKEKEKQQREKDKEKSKDLAKRASVTERLDLKEEPKEDPSGAAVPEMPKKSSKIASFIPKGGKLNSAKKEPMAPSHSGIPKPGMKSMPGKSPSAPAPSKEGERSRSGKLSSGLPQQKPQLDGRHSSSSSSLASSEGKGPGGTTLNHSISSQTVSGSVGTTQTTGSNTVSVQLPQPQQQYNHPNTATVAPFLYRSQTDTEGNVTAESSSTGVSVEPSHFTKTGQPALEELTGEDPEARRLRTVKNIADLRQNLEETMSSLRGTQVTHSTLETTFDTNVTTEMSGRSILSLTGRPTPLSWRLGQSSPRLQAGDAPSMGNGYPPRANASRFINTESGRYVYSAPLRRQLASRGSSVCHVDVSDKAGDEMDLEGISMDAPGYMSDGDVLSKNIRTDDITSGYMTDGGLGLYTRRLNRLPDGMAVVRETLQRNTSLGLGDADSWDDSSSVSSGISDTIDNLSTDDINTSSSISSYANTPASSRKNLDVQTDAEKHSQVERNSLWSGDDVKKSDGGSDSGIKMEPGSKWRRNPSDVSDESDKSTSGKKNPVISQTGSWRRGMTAQVGITMPRTKPSAPAGALKTPGTGKTDDAKVSEKGRLSPKASQVKRSPSDAGRSSGDESKKPLPSSSRTPTANANSFGFKKQSGSAAGLAMITASGVTVTSRSATLGKIPKSSALVSRSAGRKSSMDGAQNQDDGYLALSSRTNLQYRSLPRPSKSNSRNGAGNRSSTSSIDSNISSKSAGLPVPKLREPSKTALGSSLPGLVNQTDKEKGISSDNESVASCNSVKVNPAAQPVSSPAQTSLQPGAKYPDVASPTLRRLFGGKPTKQVPIATAENMKNSVVISNPHATMTQQGNLDSPSGSGVLSSGSSSPLYSKNVDLNQSPLASSPSSAHSAPSNSLTWGTNASSSSAVSKDGLGFQSVSSLHTSCESIDISLSSGGVPSHNSSTGLIASSKDDSLTPFVRTNSVKTTLSESPLSSPAASPKFCRSTLPRKQDSDPHLDRNTLPKKGLRYTPTSQLRTQEDAKEWLRSHSAGGLQDTAANSPFSSGSSVTSPSGTRFNFSQLASPTTVTQMSLSNPTMLRTHSLSNADGQYDPYTDSRFRNSSMSLDEKSRTMSRSGSFRDGFEEESWEKSSVDNFVSRLHSSLHFSLPLFHHARYELVHGSSLSLVSSTSSVYSTPEEKCQSEIRKLRRELDASQEKVSALTTQLTANAHLVAAFEQSLGNMTIRLQSLTMTAEQKDSELNELRKTIELLKKQNAAAQAAINGVINTPELNCKGNGTAQSADLRIRRQHSSDSVSSINSATSHSSVGSNIESDSKKKKRKNWVNELRSSFKQAFGKKKSPKSASSHSDIEEMTDSSLPSSPKLPHNGSTGSTPLLRNSHSNSLISECMDSEAETVMQLRNELRDKEMKLTDIRLEALSSAHQLDQLREAMNRMQSEIEKLKAENDRLKSESQGSGCSRAPSQVSISASPRQSMGLSQHSLNLTESTSLDMLLDDTGECSARKEGGRHVKIVVSFQEEMKWKEDSRPHLFLIGCIGVSGKTKWDVLDGVVRRLFKEYIIHVDPVSQLGLNSDSVLGYSIGEIKRSNTSETPELLPCGYLVGENTTISVTVKGLAENSLDSLVFESLIPKPILQRYVSLLIEHRRIILSGPSGTGKTYLANRLSEYIVLREGRELTDGVIATFNVDHKSSKELRQYLSNLADQCNSENNAVDMPLVIILDNLHHVSSLGEIFNGLLNCKYHKCPYIIGTMNQATSSTPNLQLHHNFRWVLCANHTEPVKGFLGRFLRRKLMETEISGRVRNMELVKIIDWIPKVWHHLNRFLEAHSSSDVTIGPRLFLSCPIDVDGSRVWFTDLWNYSIIPYLLEAVREGLQLYGRRAPWEDPAKWVMDTYPWAASPQQHEWPPLLQLRPEDVGFDGYSMPREGSTSKQMPPSDAEGDPLMNMLMRLQEAANYSSPQSYDSDSNSNSHHDDILDSSLESTL 2 1 2 -----------------------------------------------------------------------------KRKPVIHGLEDQKRIYTDWANHYLAKSGHKRLIRDLQQDVTDGVLLAQIIQVVANEKIEDINGCPKNRSQMIENIDACLNFLAAKGINIQGLSAEEIRNGNLKAILGLFFSLSRY------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 2yrn.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 1' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . 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A 4.900 -5.569 -11.849 1 1 A HIS 0.820 1 ATOM 160 N NE2 . HIS 97 97 ? A 5.664 -5.053 -10.856 1 1 A HIS 0.820 1 ATOM 161 N N . TYR 98 98 ? A 1.570 -5.026 -8.763 1 1 A TYR 0.810 1 ATOM 162 C CA . TYR 98 98 ? A 1.673 -6.246 -7.982 1 1 A TYR 0.810 1 ATOM 163 C C . TYR 98 98 ? A 0.365 -6.994 -7.881 1 1 A TYR 0.810 1 ATOM 164 O O . TYR 98 98 ? A 0.350 -8.200 -7.681 1 1 A TYR 0.810 1 ATOM 165 C CB . TYR 98 98 ? A 2.138 -5.969 -6.544 1 1 A TYR 0.810 1 ATOM 166 C CG . TYR 98 98 ? A 3.547 -5.493 -6.512 1 1 A TYR 0.810 1 ATOM 167 C CD1 . TYR 98 98 ? A 4.627 -6.369 -6.689 1 1 A TYR 0.810 1 ATOM 168 C CD2 . TYR 98 98 ? A 3.802 -4.144 -6.275 1 1 A TYR 0.810 1 ATOM 169 C CE1 . TYR 98 98 ? A 5.941 -5.881 -6.692 1 1 A TYR 0.810 1 ATOM 170 C CE2 . TYR 98 98 ? A 5.105 -3.649 -6.299 1 1 A TYR 0.810 1 ATOM 171 C CZ . TYR 98 98 ? A 6.176 -4.512 -6.523 1 1 A TYR 0.810 1 ATOM 172 O OH . TYR 98 98 ? A 7.489 -4.020 -6.504 1 1 A TYR 0.810 1 ATOM 173 N N . LEU 99 99 ? A -0.765 -6.299 -8.049 1 1 A LEU 0.820 1 ATOM 174 C CA . LEU 99 99 ? A -2.031 -6.970 -8.195 1 1 A LEU 0.820 1 ATOM 175 C C . LEU 99 99 ? A -2.244 -7.546 -9.582 1 1 A LEU 0.820 1 ATOM 176 O O . LEU 99 99 ? A -2.456 -8.741 -9.752 1 1 A LEU 0.820 1 ATOM 177 C CB . LEU 99 99 ? A -3.157 -5.965 -7.902 1 1 A LEU 0.820 1 ATOM 178 C CG . LEU 99 99 ? A -3.341 -5.674 -6.405 1 1 A LEU 0.820 1 ATOM 179 C CD1 . LEU 99 99 ? A -4.375 -4.559 -6.208 1 1 A LEU 0.820 1 ATOM 180 C CD2 . LEU 99 99 ? A -3.717 -6.920 -5.573 1 1 A LEU 0.820 1 ATOM 181 N N . ALA 100 100 ? A -2.156 -6.735 -10.646 1 1 A ALA 0.790 1 ATOM 182 C CA . ALA 100 100 ? A -2.471 -7.192 -11.991 1 1 A ALA 0.790 1 ATOM 183 C C . ALA 100 100 ? A -1.546 -8.286 -12.490 1 1 A ALA 0.790 1 ATOM 184 O O . ALA 100 100 ? A -1.982 -9.196 -13.249 1 1 A ALA 0.790 1 ATOM 185 C CB . ALA 100 100 ? A -2.383 -6.014 -12.971 1 1 A ALA 0.790 1 ATOM 186 N N . LYS 101 101 ? A -0.277 -8.287 -12.082 1 1 A LYS 0.710 1 ATOM 187 C CA . LYS 101 101 ? A 0.719 -9.309 -12.343 1 1 A LYS 0.710 1 ATOM 188 C C . LYS 101 101 ? A 0.319 -10.678 -11.789 1 1 A LYS 0.710 1 ATOM 189 O O . LYS 101 101 ? A 0.696 -11.712 -12.356 1 1 A LYS 0.710 1 ATOM 190 C CB . LYS 101 101 ? A 2.132 -8.938 -11.781 1 1 A LYS 0.710 1 ATOM 191 C CG . LYS 101 101 ? A 2.329 -9.255 -10.281 1 1 A LYS 0.710 1 ATOM 192 C CD . LYS 101 101 ? A 3.688 -8.894 -9.671 1 1 A LYS 0.710 1 ATOM 193 C CE . LYS 101 101 ? A 4.800 -9.752 -10.263 1 1 A LYS 0.710 1 ATOM 194 N NZ . LYS 101 101 ? A 5.899 -9.914 -9.290 1 1 A LYS 0.710 1 ATOM 195 N N . SER 102 102 ? A -0.427 -10.728 -10.661 1 1 A SER 0.740 1 ATOM 196 C CA . SER 102 102 ? A -0.833 -11.932 -9.941 1 1 A SER 0.740 1 ATOM 197 C C . SER 102 102 ? A -2.213 -12.374 -10.409 1 1 A SER 0.740 1 ATOM 198 O O . SER 102 102 ? A -2.858 -13.228 -9.776 1 1 A SER 0.740 1 ATOM 199 C CB . SER 102 102 ? A -0.749 -11.765 -8.378 1 1 A SER 0.740 1 ATOM 200 O OG . SER 102 102 ? A -1.652 -10.801 -7.837 1 1 A SER 0.740 1 ATOM 201 N N . GLY 103 103 ? A -2.693 -11.831 -11.550 1 1 A GLY 0.670 1 ATOM 202 C CA . GLY 103 103 ? A -4.008 -12.072 -12.144 1 1 A GLY 0.670 1 ATOM 203 C C . GLY 103 103 ? A -5.148 -11.540 -11.342 1 1 A GLY 0.670 1 ATOM 204 O O . GLY 103 103 ? A -6.187 -12.229 -11.187 1 1 A GLY 0.670 1 ATOM 205 N N . HIS 104 104 ? A -5.047 -10.317 -10.837 1 1 A HIS 0.660 1 ATOM 206 C CA . HIS 104 104 ? A -6.056 -9.700 -10.025 1 1 A HIS 0.660 1 ATOM 207 C C . HIS 104 104 ? A -6.758 -8.659 -10.869 1 1 A HIS 0.660 1 ATOM 208 O O . HIS 104 104 ? A -6.210 -7.568 -11.111 1 1 A HIS 0.660 1 ATOM 209 C CB . HIS 104 104 ? A -5.424 -9.047 -8.791 1 1 A HIS 0.660 1 ATOM 210 C CG . HIS 104 104 ? A -6.387 -8.481 -7.828 1 1 A HIS 0.660 1 ATOM 211 N ND1 . HIS 104 104 ? A -7.200 -9.284 -7.064 1 1 A HIS 0.660 1 ATOM 212 C CD2 . HIS 104 104 ? A -6.553 -7.186 -7.495 1 1 A HIS 0.660 1 ATOM 213 C CE1 . HIS 104 104 ? A -7.834 -8.457 -6.266 1 1 A HIS 0.660 1 ATOM 214 N NE2 . HIS 104 104 ? A -7.482 -7.166 -6.487 1 1 A HIS 0.660 1 ATOM 215 N N . LYS 105 105 ? A -7.961 -8.965 -11.363 1 1 A LYS 0.540 1 ATOM 216 C CA . LYS 105 105 ? A -8.783 -8.095 -12.219 1 1 A LYS 0.540 1 ATOM 217 C C . LYS 105 105 ? A -9.196 -6.770 -11.627 1 1 A LYS 0.540 1 ATOM 218 O O . LYS 105 105 ? A -9.139 -5.697 -12.334 1 1 A LYS 0.540 1 ATOM 219 C CB . LYS 105 105 ? A -10.146 -8.789 -12.477 1 1 A LYS 0.540 1 ATOM 220 C CG . LYS 105 105 ? A -10.078 -10.026 -13.367 1 1 A LYS 0.540 1 ATOM 221 C CD . LYS 105 105 ? A -11.439 -10.292 -14.032 1 1 A LYS 0.540 1 ATOM 222 C CE . LYS 105 105 ? A -11.636 -11.762 -14.399 1 1 A LYS 0.540 1 ATOM 223 N NZ . LYS 105 105 ? A -12.841 -11.932 -15.241 1 1 A LYS 0.540 1 ATOM 224 N N . ARG 106 106 ? A -9.668 -6.737 -10.400 1 1 A ARG 0.510 1 ATOM 225 C CA . ARG 106 106 ? A -9.944 -5.587 -9.569 1 1 A ARG 0.510 1 ATOM 226 C C . ARG 106 106 ? A -8.692 -4.747 -9.359 1 1 A ARG 0.510 1 ATOM 227 O O . ARG 106 106 ? A -7.590 -5.267 -9.255 1 1 A ARG 0.510 1 ATOM 228 C CB . ARG 106 106 ? A -10.513 -6.044 -8.195 1 1 A ARG 0.510 1 ATOM 229 C CG . ARG 106 106 ? A -10.634 -4.925 -7.130 1 1 A ARG 0.510 1 ATOM 230 C CD . ARG 106 106 ? A -11.009 -5.327 -5.705 1 1 A ARG 0.510 1 ATOM 231 N NE . ARG 106 106 ? A -12.346 -5.975 -5.791 1 1 A ARG 0.510 1 ATOM 232 C CZ . ARG 106 106 ? A -13.079 -6.313 -4.722 1 1 A ARG 0.510 1 ATOM 233 N NH1 . ARG 106 106 ? A -12.650 -6.037 -3.496 1 1 A ARG 0.510 1 ATOM 234 N NH2 . ARG 106 106 ? A -14.249 -6.924 -4.884 1 1 A ARG 0.510 1 ATOM 235 N N . LEU 107 107 ? A -8.829 -3.421 -9.267 1 1 A LEU 0.730 1 ATOM 236 C CA . LEU 107 107 ? A -7.712 -2.537 -9.106 1 1 A LEU 0.730 1 ATOM 237 C C . LEU 107 107 ? A -8.035 -1.595 -7.982 1 1 A LEU 0.730 1 ATOM 238 O O . LEU 107 107 ? A -9.140 -1.584 -7.431 1 1 A LEU 0.730 1 ATOM 239 C CB . LEU 107 107 ? A -7.444 -1.779 -10.426 1 1 A LEU 0.730 1 ATOM 240 C CG . LEU 107 107 ? A -6.774 -2.636 -11.521 1 1 A LEU 0.730 1 ATOM 241 C CD1 . LEU 107 107 ? A -6.819 -1.868 -12.848 1 1 A LEU 0.730 1 ATOM 242 C CD2 . LEU 107 107 ? A -5.311 -2.974 -11.191 1 1 A LEU 0.730 1 ATOM 243 N N . ILE 108 108 ? A -7.029 -0.805 -7.603 1 1 A ILE 0.810 1 ATOM 244 C CA . ILE 108 108 ? A -7.109 0.241 -6.619 1 1 A ILE 0.810 1 ATOM 245 C C . ILE 108 108 ? A -7.621 1.486 -7.275 1 1 A ILE 0.810 1 ATOM 246 O O . ILE 108 108 ? A -6.954 2.079 -8.139 1 1 A ILE 0.810 1 ATOM 247 C CB . ILE 108 108 ? A -5.750 0.492 -6.024 1 1 A ILE 0.810 1 ATOM 248 C CG1 . ILE 108 108 ? A -5.346 -0.800 -5.304 1 1 A ILE 0.810 1 ATOM 249 C CG2 . ILE 108 108 ? A -5.782 1.714 -5.071 1 1 A ILE 0.810 1 ATOM 250 C CD1 . ILE 108 108 ? A -3.918 -0.763 -4.785 1 1 A ILE 0.810 1 ATOM 251 N N . ARG 109 109 ? A -8.836 1.908 -6.906 1 1 A ARG 0.680 1 ATOM 252 C CA . ARG 109 109 ? A -9.384 3.175 -7.336 1 1 A ARG 0.680 1 ATOM 253 C C . ARG 109 109 ? A -8.981 4.323 -6.460 1 1 A ARG 0.680 1 ATOM 254 O O . ARG 109 109 ? A -8.308 5.244 -6.920 1 1 A ARG 0.680 1 ATOM 255 C CB . ARG 109 109 ? A -10.924 3.078 -7.386 1 1 A ARG 0.680 1 ATOM 256 C CG . ARG 109 109 ? A -11.385 2.516 -8.739 1 1 A ARG 0.680 1 ATOM 257 C CD . ARG 109 109 ? A -11.297 3.539 -9.887 1 1 A ARG 0.680 1 ATOM 258 N NE . ARG 109 109 ? A -12.522 4.414 -9.846 1 1 A ARG 0.680 1 ATOM 259 C CZ . ARG 109 109 ? A -13.740 4.039 -10.259 1 1 A ARG 0.680 1 ATOM 260 N NH1 . ARG 109 109 ? A -13.966 2.809 -10.716 1 1 A ARG 0.680 1 ATOM 261 N NH2 . ARG 109 109 ? A -14.760 4.890 -10.188 1 1 A ARG 0.680 1 ATOM 262 N N . ASP 110 110 ? A -9.321 4.261 -5.174 1 1 A ASP 0.800 1 ATOM 263 C CA . ASP 110 110 ? A -9.048 5.301 -4.244 1 1 A ASP 0.800 1 ATOM 264 C C . ASP 110 110 ? A -8.094 4.684 -3.293 1 1 A ASP 0.800 1 ATOM 265 O O . ASP 110 110 ? A -8.492 3.749 -2.560 1 1 A ASP 0.800 1 ATOM 266 C CB . ASP 110 110 ? A -10.332 5.684 -3.490 1 1 A ASP 0.800 1 ATOM 267 C CG . ASP 110 110 ? A -11.062 6.765 -4.250 1 1 A ASP 0.800 1 ATOM 268 O OD1 . ASP 110 110 ? A -11.650 6.447 -5.316 1 1 A ASP 0.800 1 ATOM 269 O OD2 . ASP 110 110 ? A -11.060 7.906 -3.731 1 1 A ASP 0.800 1 ATOM 270 N N . LEU 111 111 ? 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A -9.479 0.884 4.953 1 1 A THR 0.870 1 ATOM 313 C C . THR 116 116 ? A -9.808 -0.385 5.683 1 1 A THR 0.870 1 ATOM 314 O O . THR 116 116 ? A -10.013 -0.384 6.897 1 1 A THR 0.870 1 ATOM 315 C CB . THR 116 116 ? A -10.784 1.522 4.536 1 1 A THR 0.870 1 ATOM 316 O OG1 . THR 116 116 ? A -11.282 0.895 3.366 1 1 A THR 0.870 1 ATOM 317 C CG2 . THR 116 116 ? A -10.477 2.962 4.149 1 1 A THR 0.870 1 ATOM 318 N N . ASP 117 117 ? A -9.845 -1.510 4.956 1 1 A ASP 0.850 1 ATOM 319 C CA . ASP 117 117 ? A -10.086 -2.816 5.509 1 1 A ASP 0.850 1 ATOM 320 C C . ASP 117 117 ? A -8.832 -3.661 5.635 1 1 A ASP 0.850 1 ATOM 321 O O . ASP 117 117 ? A -8.861 -4.728 6.242 1 1 A ASP 0.850 1 ATOM 322 C CB . ASP 117 117 ? A -11.090 -3.548 4.584 1 1 A ASP 0.850 1 ATOM 323 C CG . ASP 117 117 ? A -10.687 -3.380 3.128 1 1 A ASP 0.850 1 ATOM 324 O OD1 . ASP 117 117 ? A -9.652 -3.999 2.747 1 1 A ASP 0.850 1 ATOM 325 O OD2 . ASP 117 117 ? A -11.373 -2.625 2.415 1 1 A ASP 0.850 1 ATOM 326 N N . GLY 118 118 ? 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A -4.496 -5.141 -1.149 1 1 A LEU 0.890 1 ATOM 341 C CB . LEU 120 120 ? A -7.665 -4.092 -1.226 1 1 A LEU 0.890 1 ATOM 342 C CG . LEU 120 120 ? A -7.704 -4.183 -2.773 1 1 A LEU 0.890 1 ATOM 343 C CD1 . LEU 120 120 ? A -8.625 -3.093 -3.351 1 1 A LEU 0.890 1 ATOM 344 C CD2 . LEU 120 120 ? A -6.336 -4.081 -3.458 1 1 A LEU 0.890 1 ATOM 345 N N . LEU 121 121 ? A -5.015 -4.070 0.754 1 1 A LEU 0.920 1 ATOM 346 C CA . LEU 121 121 ? A -3.648 -3.754 1.104 1 1 A LEU 0.920 1 ATOM 347 C C . LEU 121 121 ? A -2.735 -4.984 1.197 1 1 A LEU 0.920 1 ATOM 348 O O . LEU 121 121 ? A -1.709 -5.070 0.521 1 1 A LEU 0.920 1 ATOM 349 C CB . LEU 121 121 ? A -3.669 -3.023 2.468 1 1 A LEU 0.920 1 ATOM 350 C CG . LEU 121 121 ? A -2.329 -2.897 3.229 1 1 A LEU 0.920 1 ATOM 351 C CD1 . LEU 121 121 ? A -1.214 -2.264 2.384 1 1 A LEU 0.920 1 ATOM 352 C CD2 . LEU 121 121 ? A -2.514 -2.101 4.530 1 1 A LEU 0.920 1 ATOM 353 N N . ALA 122 122 ? A -3.106 -6.010 1.999 1 1 A ALA 0.950 1 ATOM 354 C CA . ALA 122 122 ? 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A 13.275 -4.036 -0.221 1 1 A TYR 0.680 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O S # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #