data_SMR-57e4c6718b0499c324883468ed36b7d7_2 _entry.id SMR-57e4c6718b0499c324883468ed36b7d7_2 _struct.entry_id SMR-57e4c6718b0499c324883468ed36b7d7_2 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q96RK0/ CIC_HUMAN, Protein capicua homolog Estimated model accuracy of this model is 0.007, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q96RK0' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 5 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 303638.048 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP CIC_HUMAN Q96RK0 1 ;MKPMKKACTGLSGPGSGSKSPPATRAKALRRRGAGEGDKPEEEDDEAQQPQPQSGPEEAEEGEEEEAERG PGAEGPPLELHPGDPAPGPAEDPKGDGEAGRWEPSLSRKTATFKSRAPKKKYVEEHGAGSSGVAGAPEER VRTPEEASGLGVPPRPPTSTRSSSTDTASEHSADLEDEPAEACGPGPWPPGSTSGSYDLRQLRSQRVLAR RGDGLFLPAVVRQVRRSQDLGVQFPGDRALTFYEGVPGAGVDVVLDATPPPGALVVGTAVCTCVEPGVAA YREGVVVEVATKPAAYKVRLSPGPSSQPGLPGSLPQPPQPLHREPEEAVWVARSSLRLLRPPWEPETMLR KPPTGPEEEQAEPGATLPPCPAALDPKQPEDAEVSKISFGGNLGTHCEEGEEKHPPALGTPALLPLPPPQ LLSPPPKSPAFVGPGRPGEQPSPCQEGSQGGSRSSSVASLEKGTAPAARARTPLTAAQQKYKKGDVVCTP SGIRKKFNGKQWRRLCSRDGCMKESQRRGYCSRHLSMRTKEMEGLADSGPGGAGRPAAVAAREGSTEFDW GDETSRDSEASSVAARGDSRPRLVAPADLSRFEFDECEAAVMLVSLGSSRSGTPSFSPVSTQSPFSPAPS PSPSPLFGFRPANFSPINASPVIQRTAVRSRHLSASTPKAGVLTPPDLGPHPPPPAPRERHSSGILPTFQ TNLTFTVPISPGRRKTELLPHPGALGAPGAGGGGAAPDFPKSDSLDSGVDSVSHTPTPSTPAGFRAVSPA VPFSRSRQPSPLLLLPPPAGLTSDPGPSVRRVPAVQRDSPVIVRNPDVPLPSKFPGEVGTAGEVRAGGPG RGCRETPVPPGVASGKPGLPPPLPAPVPITVPPAAPTAVAQPMPAFGLASSPFQPVAFHPSPAALLPVLV PSSYTSHPAPKKEVIMGRPGTVWTNVEPRSVAVFPWHSLVPFLAPSQPDPSVQPSEAQQPASHPVASNQS KEPAESAAVAHERPPGGTGSADPERPPGATCPESPGPGPPHPLGVVESGKGPPPTTEEEASGPPGEPRLD SETESDHDDAFLSIMSPEIQLPLPPGKRRTQSLSALPKERDSSSEKDGRSPNKREKDHIRRPMNAFMIFS KRHRALVHQRHPNQDNRTVSKILGEWWYALGPKEKQKYHDLAFQVKEAHFKAHPDWKWCNKDRKKSSSEA KPTSLGLAGGHKETRERSMSETGTAAAPGVSSELLSVAAQTLLSSDTKAPGSSSCGAERLHTVGGPGSAR PRAFSHSGVHSLDGGEVDSQALQELTQMVSGPASYSGPKPSTQYGAPGPFAAPGEGGALAATGRPPLLPT RASRSQRAASEDMTSDEERMVICEEEGDDDVIADDGFGTTDIDLKCKERVTDSESGDSSGEDPEGNKGFG RKVFSPVIRSSFTHCRPPLDPEPPGPPDPPVAFGKGYGSAPSSSASSPASSSASAATSFSLGSGTFKAQE SGQGSTAGPLRPPPPGAGGPATPSKATRFLPMDPATFRRKRPESVGGLEPPGPSVIAAPPSGGGNILQTL VLPPNKEEQEGGGARVPSAPAPSLAYGAPAAPLSRPAATMVTNVVRPVSSTPVPIASKPFPTSGRAEASP NDTAGARTEMGTGSRVPGGSPLGVSLVYSDKKSAAATSPAPHLVAGPLLGTVGKAPATVTNLLVGTPGYG APAPPAVQFIAQGAPGGGTTAGSGAGAGSGPNGPVPLGILQPGALGKAGGITQVQYILPTLPQQLQVAPA PAPAPGTKAAAPSGPAPTTSIRFTLPPGTSTNGKVLAATAPTPGIPILQSVPSAPPPKAQSVSPVQAPPP GGSAQLLPGKVLVPLAAPSMSVRGGGAGQPLPLVSPPFSVPVQNGAQPPSKIIQLTPVPVSTPSGLVPPL SPATLPGPTSQPQKVLLPSSTRITYVQSAGGHALPLGTSPASSQAGTVTSYGPTSSVALGFTSLGPSGPA FVQPLLSAGQAPLLAPGQVGVSPVPSPQLPPACAAPGGPVITAFYSGSPAPTSSAPLAQPSQAPPSLVYT VATSTTPPAATILPKGPPAPATATPAPTSPFPSATAGSMTYSLVAPKAQRPSPKAPQKVKAAIASIPVGS FEAGASGRPGPAPRQPLEPGPVREPTAPESELEGQPTPPAPPPLPETWTPTARSSPPLPPPAEERTSAKG PETMASKFPSSSSDWRVPGQGLENRGEPPTPPSPAPAPAVAPGGSSESSSGRAAGDTPERKEAAGTGKKV KVRPPPLKKTFDSVDNRVLSEVDFEERFAELPEFRPEEVLPSPTLQSLATSPRAILGSYRKKRKNSTDLD SAPEDPTSPKRKMRRRSSCSSEPNTPKSAKCEGDIFTFDRTGTEAEDVLGELEYDKVPYSSLRRTLDQRR ALVMQLFQDHGFFPSAQATAAFQARYADIFPSKVCLQLKIREVRQKIMQAATPTEQPPGAEAPLPVPPPT GTAAAPAPTPSPAGGPDPTSPSSDSGTAQAAPPLPPPPESGPGQPGWEGAPQPSPPPPGPSTAATGR ; 'Protein capicua homolog' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2517 1 2517 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . CIC_HUMAN Q96RK0 . 1 2517 9606 'Homo sapiens (Human)' 2024-05-29 5C96D30F6C7F6065 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MKPMKKACTGLSGPGSGSKSPPATRAKALRRRGAGEGDKPEEEDDEAQQPQPQSGPEEAEEGEEEEAERG PGAEGPPLELHPGDPAPGPAEDPKGDGEAGRWEPSLSRKTATFKSRAPKKKYVEEHGAGSSGVAGAPEER VRTPEEASGLGVPPRPPTSTRSSSTDTASEHSADLEDEPAEACGPGPWPPGSTSGSYDLRQLRSQRVLAR RGDGLFLPAVVRQVRRSQDLGVQFPGDRALTFYEGVPGAGVDVVLDATPPPGALVVGTAVCTCVEPGVAA YREGVVVEVATKPAAYKVRLSPGPSSQPGLPGSLPQPPQPLHREPEEAVWVARSSLRLLRPPWEPETMLR KPPTGPEEEQAEPGATLPPCPAALDPKQPEDAEVSKISFGGNLGTHCEEGEEKHPPALGTPALLPLPPPQ LLSPPPKSPAFVGPGRPGEQPSPCQEGSQGGSRSSSVASLEKGTAPAARARTPLTAAQQKYKKGDVVCTP SGIRKKFNGKQWRRLCSRDGCMKESQRRGYCSRHLSMRTKEMEGLADSGPGGAGRPAAVAAREGSTEFDW GDETSRDSEASSVAARGDSRPRLVAPADLSRFEFDECEAAVMLVSLGSSRSGTPSFSPVSTQSPFSPAPS 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A 1 2393 PHE 2393 2393 PHE PHE A . A 1 2394 PRO 2394 2394 PRO PRO A . A 1 2395 SER 2395 2395 SER SER A . A 1 2396 ALA 2396 2396 ALA ALA A . A 1 2397 GLN 2397 2397 GLN GLN A . A 1 2398 ALA 2398 2398 ALA ALA A . A 1 2399 THR 2399 2399 THR THR A . A 1 2400 ALA 2400 2400 ALA ALA A . A 1 2401 ALA 2401 2401 ALA ALA A . A 1 2402 PHE 2402 2402 PHE PHE A . A 1 2403 GLN 2403 2403 GLN GLN A . A 1 2404 ALA 2404 2404 ALA ALA A . A 1 2405 ARG 2405 2405 ARG ARG A . A 1 2406 TYR 2406 2406 TYR TYR A . A 1 2407 ALA 2407 2407 ALA ALA A . A 1 2408 ASP 2408 2408 ASP ASP A . A 1 2409 ILE 2409 2409 ILE ILE A . A 1 2410 PHE 2410 2410 PHE PHE A . A 1 2411 PRO 2411 2411 PRO PRO A . A 1 2412 SER 2412 2412 SER SER A . A 1 2413 LYS 2413 2413 LYS LYS A . A 1 2414 VAL 2414 2414 VAL VAL A . A 1 2415 CYS 2415 2415 CYS CYS A . A 1 2416 LEU 2416 2416 LEU LEU A . A 1 2417 GLN 2417 2417 GLN GLN A . A 1 2418 LEU 2418 2418 LEU LEU A . A 1 2419 LYS 2419 2419 LYS LYS A . A 1 2420 ILE 2420 2420 ILE ILE A . A 1 2421 ARG 2421 2421 ARG ARG A . A 1 2422 GLU 2422 2422 GLU GLU A . A 1 2423 VAL 2423 2423 VAL VAL A . A 1 2424 ARG 2424 2424 ARG ARG A . A 1 2425 GLN 2425 2425 GLN GLN A . A 1 2426 LYS 2426 2426 LYS LYS A . A 1 2427 ILE 2427 2427 ILE ILE A . A 1 2428 MET 2428 2428 MET MET A . A 1 2429 GLN 2429 2429 GLN GLN A . A 1 2430 ALA 2430 2430 ALA ALA A . A 1 2431 ALA 2431 2431 ALA ALA A . A 1 2432 THR 2432 ? ? ? A . A 1 2433 PRO 2433 ? ? ? A . A 1 2434 THR 2434 ? ? ? A . A 1 2435 GLU 2435 ? ? ? A . A 1 2436 GLN 2436 ? ? ? A . A 1 2437 PRO 2437 ? ? ? A . A 1 2438 PRO 2438 ? ? ? A . A 1 2439 GLY 2439 ? ? ? A . A 1 2440 ALA 2440 ? ? ? A . A 1 2441 GLU 2441 ? ? ? A . A 1 2442 ALA 2442 ? ? ? A . A 1 2443 PRO 2443 ? ? ? A . A 1 2444 LEU 2444 ? ? ? A . A 1 2445 PRO 2445 ? ? ? A . A 1 2446 VAL 2446 ? ? ? A . A 1 2447 PRO 2447 ? ? ? A . A 1 2448 PRO 2448 ? ? ? A . A 1 2449 PRO 2449 ? ? ? A . A 1 2450 THR 2450 ? ? ? A . A 1 2451 GLY 2451 ? ? ? A . A 1 2452 THR 2452 ? ? ? A . A 1 2453 ALA 2453 ? ? ? A . A 1 2454 ALA 2454 ? ? ? A . A 1 2455 ALA 2455 ? ? ? A . A 1 2456 PRO 2456 ? ? ? A . A 1 2457 ALA 2457 ? ? ? A . A 1 2458 PRO 2458 ? ? ? A . A 1 2459 THR 2459 ? ? ? A . A 1 2460 PRO 2460 ? ? ? A . A 1 2461 SER 2461 ? ? ? A . A 1 2462 PRO 2462 ? ? ? A . A 1 2463 ALA 2463 ? ? ? A . A 1 2464 GLY 2464 ? ? ? A . A 1 2465 GLY 2465 ? ? ? A . A 1 2466 PRO 2466 ? ? ? A . A 1 2467 ASP 2467 ? ? ? A . A 1 2468 PRO 2468 ? ? ? A . A 1 2469 THR 2469 ? ? ? A . A 1 2470 SER 2470 ? ? ? A . A 1 2471 PRO 2471 ? ? ? A . A 1 2472 SER 2472 ? ? ? A . A 1 2473 SER 2473 ? ? ? A . A 1 2474 ASP 2474 ? ? ? A . A 1 2475 SER 2475 ? ? ? A . A 1 2476 GLY 2476 ? ? ? A . A 1 2477 THR 2477 ? ? ? A . A 1 2478 ALA 2478 ? ? ? A . A 1 2479 GLN 2479 ? ? ? A . A 1 2480 ALA 2480 ? ? ? A . A 1 2481 ALA 2481 ? ? ? A . A 1 2482 PRO 2482 ? ? ? A . A 1 2483 PRO 2483 ? ? ? A . A 1 2484 LEU 2484 ? ? ? A . A 1 2485 PRO 2485 ? ? ? A . A 1 2486 PRO 2486 ? ? ? A . A 1 2487 PRO 2487 ? ? ? A . A 1 2488 PRO 2488 ? ? ? A . A 1 2489 GLU 2489 ? ? ? A . A 1 2490 SER 2490 ? ? ? A . A 1 2491 GLY 2491 ? ? ? A . A 1 2492 PRO 2492 ? ? ? A . A 1 2493 GLY 2493 ? ? ? A . A 1 2494 GLN 2494 ? ? ? A . A 1 2495 PRO 2495 ? ? ? A . A 1 2496 GLY 2496 ? ? ? A . A 1 2497 TRP 2497 ? ? ? A . A 1 2498 GLU 2498 ? ? ? A . A 1 2499 GLY 2499 ? ? ? A . A 1 2500 ALA 2500 ? ? ? A . A 1 2501 PRO 2501 ? ? ? A . A 1 2502 GLN 2502 ? ? ? A . A 1 2503 PRO 2503 ? ? ? A . A 1 2504 SER 2504 ? ? ? A . A 1 2505 PRO 2505 ? ? ? A . A 1 2506 PRO 2506 ? ? ? A . A 1 2507 PRO 2507 ? ? ? A . A 1 2508 PRO 2508 ? ? ? A . A 1 2509 GLY 2509 ? ? ? A . A 1 2510 PRO 2510 ? ? ? A . A 1 2511 SER 2511 ? ? ? A . A 1 2512 THR 2512 ? ? ? A . A 1 2513 ALA 2513 ? ? ? A . A 1 2514 ALA 2514 ? ? ? A . A 1 2515 THR 2515 ? ? ? A . A 1 2516 GLY 2516 ? ? ? A . A 1 2517 ARG 2517 ? ? ? A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Protein capicua homolog {PDB ID=7m5w, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=7m5w.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by BLAST to 7m5w, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 2' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-04 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-29 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MGSSHHHHHHSSGLVPRGSHMDGRSPNKREKDHIRRPMNAFMIFSKRHRALVHQRHPNQDNRTVSKILGE WWYALGPKEKQKYHDLAFQVKEAHFKAHPDWKWCNKDRKKSSSEFKVPYSSLRRTLDQRRALVMQLFQDH GFFPSAQATAAFQARYADIFPSKVCLQLKIREVRQKIMQAATPTEQ ; ;MGSSHHHHHHSSGLVPRGSHMDGRSPNKREKDHIRRPMNAFMIFSKRHRALVHQRHPNQDNRTVSKILGE WWYALGPKEKQKYHDLAFQVKEAHFKAHPDWKWCNKDRKKSSSEFKVPYSSLRRTLDQRRALVMQLFQDH GFFPSAQATAAFQARYADIFPSKVCLQLKIREVRQKIMQAATPTEQ ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 116 186 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 7m5w 2023-10-18 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2517 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2517 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'BLAST e-value' . 3.16e-30 100.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MKPMKKACTGLSGPGSGSKSPPATRAKALRRRGAGEGDKPEEEDDEAQQPQPQSGPEEAEEGEEEEAERGPGAEGPPLELHPGDPAPGPAEDPKGDGEAGRWEPSLSRKTATFKSRAPKKKYVEEHGAGSSGVAGAPEERVRTPEEASGLGVPPRPPTSTRSSSTDTASEHSADLEDEPAEACGPGPWPPGSTSGSYDLRQLRSQRVLARRGDGLFLPAVVRQVRRSQDLGVQFPGDRALTFYEGVPGAGVDVVLDATPPPGALVVGTAVCTCVEPGVAAYREGVVVEVATKPAAYKVRLSPGPSSQPGLPGSLPQPPQPLHREPEEAVWVARSSLRLLRPPWEPETMLRKPPTGPEEEQAEPGATLPPCPAALDPKQPEDAEVSKISFGGNLGTHCEEGEEKHPPALGTPALLPLPPPQLLSPPPKSPAFVGPGRPGEQPSPCQEGSQGGSRSSSVASLEKGTAPAARARTPLTAAQQKYKKGDVVCTPSGIRKKFNGKQWRRLCSRDGCMKESQRRGYCSRHLSMRTKEMEGLADSGPGGAGRPAAVAAREGSTEFDWGDETSRDSEASSVAARGDSRPRLVAPADLSRFEFDECEAAVMLVSLGSSRSGTPSFSPVSTQSPFSPAPSPSPSPLFGFRPANFSPINASPVIQRTAVRSRHLSASTPKAGVLTPPDLGPHPPPPAPRERHSSGILPTFQTNLTFTVPISPGRRKTELLPHPGALGAPGAGGGGAAPDFPKSDSLDSGVDSVSHTPTPSTPAGFRAVSPAVPFSRSRQPSPLLLLPPPAGLTSDPGPSVRRVPAVQRDSPVIVRNPDVPLPSKFPGEVGTAGEVRAGGPGRGCRETPVPPGVASGKPGLPPPLPAPVPITVPPAAPTAVAQPMPAFGLASSPFQPVAFHPSPAALLPVLVPSSYTSHPAPKKEVIMGRPGTVWTNVEPRSVAVFPWHSLVPFLAPSQPDPSVQPSEAQQPASHPVASNQSKEPAESAAVAHERPPGGTGSADPERPPGATCPESPGPGPPHPLGVVESGKGPPPTTEEEASGPPGEPRLDSETESDHDDAFLSIMSPEIQLPLPPGKRRTQSLSALPKERDSSSEKDGRSPNKREKDHIRRPMNAFMIFSKRHRALVHQRHPNQDNRTVSKILGEWWYALGPKEKQKYHDLAFQVKEAHFKAHPDWKWCNKDRKKSSSEAKPTSLGLAGGHKETRERSMSETGTAAAPGVSSELLSVAAQTLLSSDTKAPGSSSCGAERLHTVGGPGSARPRAFSHSGVHSLDGGEVDSQALQELTQMVSGPASYSGPKPSTQYGAPGPFAAPGEGGALAATGRPPLLPTRASRSQRAASEDMTSDEERMVICEEEGDDDVIADDGFGTTDIDLKCKERVTDSESGDSSGEDPEGNKGFGRKVFSPVIRSSFTHCRPPLDPEPPGPPDPPVAFGKGYGSAPSSSASSPASSSASAATSFSLGSGTFKAQESGQGSTAGPLRPPPPGAGGPATPSKATRFLPMDPATFRRKRPESVGGLEPPGPSVIAAPPSGGGNILQTLVLPPNKEEQEGGGARVPSAPAPSLAYGAPAAPLSRPAATMVTNVVRPVSSTPVPIASKPFPTSGRAEASPNDTAGARTEMGTGSRVPGGSPLGVSLVYSDKKSAAATSPAPHLVAGPLLGTVGKAPATVTNLLVGTPGYGAPAPPAVQFIAQGAPGGGTTAGSGAGAGSGPNGPVPLGILQPGALGKAGGITQVQYILPTLPQQLQVAPAPAPAPGTKAAAPSGPAPTTSIRFTLPPGTSTNGKVLAATAPTPGIPILQSVPSAPPPKAQSVSPVQAPPPGGSAQLLPGKVLVPLAAPSMSVRGGGAGQPLPLVSPPFSVPVQNGAQPPSKIIQLTPVPVSTPSGLVPPLSPATLPGPTSQPQKVLLPSSTRITYVQSAGGHALPLGTSPASSQAGTVTSYGPTSSVALGFTSLGPSGPAFVQPLLSAGQAPLLAPGQVGVSPVPSPQLPPACAAPGGPVITAFYSGSPAPTSSAPLAQPSQAPPSLVYTVATSTTPPAATILPKGPPAPATATPAPTSPFPSATAGSMTYSLVAPKAQRPSPKAPQKVKAAIASIPVGSFEAGASGRPGPAPRQPLEPGPVREPTAPESELEGQPTPPAPPPLPETWTPTARSSPPLPPPAEERTSAKGPETMASKFPSSSSDWRVPGQGLENRGEPPTPPSPAPAPAVAPGGSSESSSGRAAGDTPERKEAAGTGKKVKVRPPPLKKTFDSVDNRVLSEVDFEERFAELPEFRPEEVLPSPTLQSLATSPRAILGSYRKKRKNSTDLDSAPEDPTSPKRKMRRRSSCSSEPNTPKSAKCEGDIFTFDRTGTEAEDVLGELEYDKVPYSSLRRTLDQRRALVMQLFQDHGFFPSAQATAAFQARYADIFPSKVCLQLKIREVRQKIMQAATPTEQPPGAEAPLPVPPPTGTAAAPAPTPSPAGGPDPTSPSSDSGTAQAAPPLPPPPESGPGQPGWEGAPQPSPPPPGPSTAATGR 2 1 2 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------KVPYSSLRRTLDQRRALVMQLFQDHGFFPSAQATAAFQARYADIFPSKVCLQLKIREVRQKIMQAATPTEQ--------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 7m5w.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 2' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . 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A -0.101 -10.117 6.987 1 1 A SER 0.690 1 ATOM 30 C CB . SER 2371 2371 ? A 0.412 -12.633 5.819 1 1 A SER 0.690 1 ATOM 31 O OG . SER 2371 2371 ? A 0.217 -13.771 4.975 1 1 A SER 0.690 1 ATOM 32 N N . LEU 2372 2372 ? A 1.543 -9.320 5.684 1 1 A LEU 0.710 1 ATOM 33 C CA . LEU 2372 2372 ? A 1.872 -8.214 6.561 1 1 A LEU 0.710 1 ATOM 34 C C . LEU 2372 2372 ? A 0.753 -7.193 6.654 1 1 A LEU 0.710 1 ATOM 35 O O . LEU 2372 2372 ? A 0.306 -6.830 7.738 1 1 A LEU 0.710 1 ATOM 36 C CB . LEU 2372 2372 ? A 3.178 -7.517 6.107 1 1 A LEU 0.710 1 ATOM 37 C CG . LEU 2372 2372 ? A 4.246 -7.404 7.209 1 1 A LEU 0.710 1 ATOM 38 C CD1 . LEU 2372 2372 ? A 5.498 -6.719 6.639 1 1 A LEU 0.710 1 ATOM 39 C CD2 . LEU 2372 2372 ? A 3.743 -6.652 8.452 1 1 A LEU 0.710 1 ATOM 40 N N . ARG 2373 2373 ? A 0.213 -6.773 5.488 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 41 C CA . ARG 2373 2373 ? A -0.913 -5.861 5.421 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 42 C C . ARG 2373 2373 ? A -2.167 -6.475 6.021 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 43 O O . ARG 2373 2373 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #