data_SMR-6ab8300aba61d7a652ad4e9e66cac476_2 _entry.id SMR-6ab8300aba61d7a652ad4e9e66cac476_2 _struct.entry_id SMR-6ab8300aba61d7a652ad4e9e66cac476_2 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - E9Q5F9 (isoform 2)/ SETD2_MOUSE, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2 Estimated model accuracy of this model is 0.081, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries E9Q5F9 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 5 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 331648.857 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP SETD2_MOUSE E9Q5F9 1 ;MKPLPSQQPPPKMGDFYDPEHPTPEEEENEAKIENVQKTGFIKGPVFKGVASSRFLPKGTKTKVNLEEQG RQKVSFSFSFTKKTLQNRFLTALSNEKQSDSPNSPAPPLQVDSNPKVKMDAGDTFPATEESSPPKSRVEL GRIHFKKHLLHVTSRPQLAASTTAASPLPPTTQLPAVLAESMIDSPPSSPPPPPPPPQASSPSPPAQISE PVALPQPPATALMTSPPGPLPGDVAVRAQKESPVKSGPEVLEVDTKQDIVSNSLEEHTVQTLKEQADHLL QKEDSHIGKEEEVSDGSKISLSSKKASSKKKSSQFEGTFLGSESDEDSVRTSSSQRSHDLKSSTSIDKER DFKKSSAPSKSEDLGKSSRSKTERDDRYCSYSKLERDTRYVSSRCRSERDRRRSRSRSRSDRASRTSLSY SRSERSHYYDSERRYHRSSPYRERTRYSRPYTDNRARESSDSEDEYKKTYPRRTSAHSYRDLRTSSSYSK FDRDCKTETSYLEMERRGKYTSKLERESKRTSEHETIKRCCSPPNELGFRRGSSYSKHDNSTSRYKSALS KSISKNDKFKNSFCCTELNEENKQSHSFSLQTPCSKGSELRTINKISEREKTGSPTPSNQLNDSPTFKKL DESPVLKPEFIGHDGRESIKELELSKVKNDQLRNFCSIELNVNGSPETEADVATFCTSKTDAISMTSDDS VTGSEVSPLIKACMLSSNGFQNVGRCRERDSDDTCRQHNTSKSPFREMEPLLSPHHDKLMSLPVKTIDYP KTLIKEPVDKRHSCCKTKDSDIYCSPNENPEAENAEPSAMTISSHSFVNVHLESKTVICDNREPTDRHSE NTCDEYKQSIGSTSSASHNHFDGLYEPIGSSGISSLQSPPSGIRCEENTSPTLDAVESKKGIDFLKYARK ETDVGSALPDSGKGFSWENRHNNVLSGQSLQEAQEEGNSILHERRGRPEIPLDEEQRGHTHISDDSEVVF PYDLNLTMEDSDGITYTLKCDSSGNAPEIVSTVHEDYSGSSASSSDESDSEDTESDDSSIPRNRLQSVVV VPKNSTLPMEETSPCSSRSSQSYKHYSDRWEDGLETRRHAYEEEYESKGCSQTEKYFLHKGTERSAESCY SQFGRKADNHLPDIAHAQSDGVDSTSQTDSRSDHLGHLNPEDTLRAKTSRPQELPVYSDDFEDLPNKSRQ QMIFSNRPDSSRLGKTELSFSSSCDISRMDGLHSSEELRNLGWDFSQQERPTTTYQQPDSSYGTCGTHKY QQSTEHYGGTHNYWQGNGYWDPRSAGRPPGTGLAYDRIQGQVPDSLTDDREEEEHWDQRSGSHFSSPSNK FFFHQKDKGSVQAPEISSNSIKDALVMNERKDFSKNFEKNDIKERGPPKKRRQELESDSESDGELQARKK VRVEMEQGESSVPQHSELMGPSCAMDDFRDPQRWKEFAKLGKMPCYFDLIEENVYLTERKKNKSHRDIKR MQCECTPLSKDERAQGEVACGEDCLNRLLMIECSSRCPNGDYCSNRRFQRKQHADVEVILTEKKGWGLRA AKDLPSNTFVLEYCGEVLDHKEFKARVKEYARNKNIHYYFMALKNDEIIDATQKGNCSRFMNHSCEPNCE TQKWTVNGQLRVGFFTTKLVPSGSELTFDYQFQRYGKEAQKCFCGSANCRGYLGGENRVSIRAAGGKMKK ERSRKKDSVDGELEALMENGEGLSDKNQVLSLSRLMVRIETLEQKLTCLKLIQNTHSQSCLKSFLERHGL SLLWIWMAELGDGRESNQKLQEEIIKTLEHLPIPTKNMLEESKVLPIIQRWSQTKTAVPQLSEGDGYSSE NTSRAHTPLNTPDPSAKPSTEMDTDTPKKLIFRRLKIISENSMDSAVSDVTSELECKDGKEDLDQLETVT VEEDEELQSQQLLPQQLCESKVESEATIEVSKLPTSEPEADTETEPKDSNGTKLEETIAEETPSQDEEEG VSDVESERSQEPPDKTVDISDLATKLLDSWKDLKEVYRIPKKSQTEKESTAERGRDAAAFRDQTAPKTPN RSRERDPDKQSQNKEKRKRRGSLSPPSSAYERGTKRPDDRYDTPTSKKKVRIKDRNKLSTEERRKLFEQE VAQREAQKQQQQMQNLGMTSPLPFDSLGYNASHHPFAGYPPGYPMQAYVDPSNPNAGKVLLPTPSMDPVC SPAPYDHAQPLVGHSTESLAAPPSVPVVPHVAASVEVSSSQYVAQNESVVHQDSNVPVMPVQAPGPVQGQ NYNVWESNQQSVSVQQQYSPAQSQTTIYYQGQTCSTVYSVTSPYSQTTPPIVQSYAQPSLQYIQGQQIFT AHPQGVVVQPTAAVTSIVAPGQPQSLQPPEMVVTNNLLDLPPPSPPKPKTIVLPPNWKTARDPEGKIYYY HVITRQTQWDPPTWESPGDDASLEHEAEMDLGTPTYDENPMKTSKKPKTAEADTSSELAKKSKEVFRKEM SQFIVQCLNPYRKPDCKVGRITTTEDFKHLARKLTHGVMNKELKYCKNPEDLECNENVKHKTKEYIKKYM QKFGAVYKPKEDTELE ; 'Histone-lysine N-methyltransferase SETD2' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2536 1 2536 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . SETD2_MOUSE E9Q5F9 E9Q5F9-2 1 2536 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2011-04-05 990ECF2CD8D56008 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MKPLPSQQPPPKMGDFYDPEHPTPEEEENEAKIENVQKTGFIKGPVFKGVASSRFLPKGTKTKVNLEEQG RQKVSFSFSFTKKTLQNRFLTALSNEKQSDSPNSPAPPLQVDSNPKVKMDAGDTFPATEESSPPKSRVEL GRIHFKKHLLHVTSRPQLAASTTAASPLPPTTQLPAVLAESMIDSPPSSPPPPPPPPQASSPSPPAQISE PVALPQPPATALMTSPPGPLPGDVAVRAQKESPVKSGPEVLEVDTKQDIVSNSLEEHTVQTLKEQADHLL QKEDSHIGKEEEVSDGSKISLSSKKASSKKKSSQFEGTFLGSESDEDSVRTSSSQRSHDLKSSTSIDKER DFKKSSAPSKSEDLGKSSRSKTERDDRYCSYSKLERDTRYVSSRCRSERDRRRSRSRSRSDRASRTSLSY SRSERSHYYDSERRYHRSSPYRERTRYSRPYTDNRARESSDSEDEYKKTYPRRTSAHSYRDLRTSSSYSK FDRDCKTETSYLEMERRGKYTSKLERESKRTSEHETIKRCCSPPNELGFRRGSSYSKHDNSTSRYKSALS KSISKNDKFKNSFCCTELNEENKQSHSFSLQTPCSKGSELRTINKISEREKTGSPTPSNQLNDSPTFKKL 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;MKPLPSQQPPPKMGDFYDPEHPTPEEEENEAKIENVQKTGFIKGPVFKGVASSRFLPKGTKTKVNLEEQG RQKVSFSFSFTKKTLQNRFLTALSNEKQSDSPNSPAPPLQVDSNPKVKMDAGDTFPATEESSPPKSRVEL GRIHFKKHLLHVTSRPQLAASTTAASPLPPTTQLPAVLAESMIDSPPSSPPPPPPPPQASSPSPPAQISE PVALPQPPATALMTSPPGPLPGDVAVRAQKESPVKSGPEVLEVDTKQDIVSNSLEEHTVQTLKEQADHLL QKEDSHIGKEEEVSDGSKISLSSKKASSKKKSSQFEGTFLGSESDEDSVRTSSSQRSHDLKSSTSIDKER DFKKSSAPSKSEDLGKSSRSKTERDDRYCSYSKLERDTRYVSSRCRSERDRRRSRSRSRSDRASRTSLSY SRSERSHYYDSERRYHRSSPYRERTRYSRPYTDNRARESSDSEDEYKKTYPRRTSAHSYRDLRTSSSYSK FDRDCKTETSYLEMERRGKYTSKLERESKRTSEHETIKRCCSPPNELGFRRGSSYSKHDNSTSRYKSALS KSISKNDKFKNSFCCTELNEENKQSHSFSLQTPCSKGSELRTINKISEREKTGSPTPSNQLNDSPTFKKL DESPVLKPEFIGHDGRESIKELELSKVKNDQLRNFCSIELNVNGSPETEADVATFCTSKTDAISMTSDDS VTGSEVSPLIKACMLSSNGFQNVGRCRERDSDDTCRQHNTSKSPFREMEPLLSPHHDKLMSLPVKTIDYP KTLIKEPVDKRHSCCKTKDSDIYCSPNENPEAENAEPSAMTISSHSFVNVHLESKTVICDNREPTDRHSE NTCDEYKQSIGSTSSASHNHFDGLYEPIGSSGISSLQSPPSGIRCEENTSPTLDAVESKKGIDFLKYARK ETDVGSALPDSGKGFSWENRHNNVLSGQSLQEAQEEGNSILHERRGRPEIPLDEEQRGHTHISDDSEVVF 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A 1 2329 ALA 2329 ? ? ? A . A 1 2330 PRO 2330 ? ? ? A . A 1 2331 GLY 2331 ? ? ? A . A 1 2332 GLN 2332 ? ? ? A . A 1 2333 PRO 2333 ? ? ? A . A 1 2334 GLN 2334 ? ? ? A . A 1 2335 SER 2335 ? ? ? A . A 1 2336 LEU 2336 ? ? ? A . A 1 2337 GLN 2337 ? ? ? A . A 1 2338 PRO 2338 ? ? ? A . A 1 2339 PRO 2339 ? ? ? A . A 1 2340 GLU 2340 ? ? ? A . A 1 2341 MET 2341 ? ? ? A . A 1 2342 VAL 2342 ? ? ? A . A 1 2343 VAL 2343 ? ? ? A . A 1 2344 THR 2344 ? ? ? A . A 1 2345 ASN 2345 ? ? ? A . A 1 2346 ASN 2346 ? ? ? A . A 1 2347 LEU 2347 ? ? ? A . A 1 2348 LEU 2348 ? ? ? A . A 1 2349 ASP 2349 ? ? ? A . A 1 2350 LEU 2350 ? ? ? A . A 1 2351 PRO 2351 ? ? ? A . A 1 2352 PRO 2352 ? ? ? A . A 1 2353 PRO 2353 ? ? ? A . A 1 2354 SER 2354 ? ? ? A . A 1 2355 PRO 2355 ? ? ? A . A 1 2356 PRO 2356 ? ? ? A . A 1 2357 LYS 2357 ? ? ? A . A 1 2358 PRO 2358 ? ? ? A . A 1 2359 LYS 2359 ? ? ? A . A 1 2360 THR 2360 ? ? ? A . A 1 2361 ILE 2361 ? ? ? A . A 1 2362 VAL 2362 ? ? ? A . A 1 2363 LEU 2363 ? ? ? A . A 1 2364 PRO 2364 ? ? ? A . A 1 2365 PRO 2365 ? ? ? A . A 1 2366 ASN 2366 ? ? ? A . A 1 2367 TRP 2367 ? ? ? A . A 1 2368 LYS 2368 ? ? ? A . A 1 2369 THR 2369 ? ? ? A . A 1 2370 ALA 2370 ? ? ? A . A 1 2371 ARG 2371 ? ? ? A . A 1 2372 ASP 2372 ? ? ? A . A 1 2373 PRO 2373 ? ? ? A . A 1 2374 GLU 2374 ? ? ? A . A 1 2375 GLY 2375 ? ? ? A . A 1 2376 LYS 2376 ? ? ? A . A 1 2377 ILE 2377 ? ? ? A . A 1 2378 TYR 2378 ? ? ? A . A 1 2379 TYR 2379 ? ? ? A . A 1 2380 TYR 2380 ? ? ? A . A 1 2381 HIS 2381 ? ? ? A . A 1 2382 VAL 2382 ? ? ? A . A 1 2383 ILE 2383 ? ? ? A . A 1 2384 THR 2384 ? ? ? A . A 1 2385 ARG 2385 ? ? ? A . A 1 2386 GLN 2386 ? ? ? A . A 1 2387 THR 2387 ? ? ? A . A 1 2388 GLN 2388 ? ? ? A . A 1 2389 TRP 2389 ? ? ? A . A 1 2390 ASP 2390 ? ? ? A . A 1 2391 PRO 2391 ? ? ? A . A 1 2392 PRO 2392 ? ? ? A . A 1 2393 THR 2393 ? ? ? A . A 1 2394 TRP 2394 ? ? ? A . A 1 2395 GLU 2395 ? ? ? A . A 1 2396 SER 2396 ? ? ? A . A 1 2397 PRO 2397 ? ? ? A . A 1 2398 GLY 2398 ? ? ? A . A 1 2399 ASP 2399 ? ? ? A . A 1 2400 ASP 2400 ? ? ? A . A 1 2401 ALA 2401 ? ? ? A . A 1 2402 SER 2402 ? ? ? A . A 1 2403 LEU 2403 ? ? ? A . A 1 2404 GLU 2404 ? ? ? A . A 1 2405 HIS 2405 ? ? ? A . A 1 2406 GLU 2406 ? ? ? A . A 1 2407 ALA 2407 ? ? ? A . A 1 2408 GLU 2408 ? ? ? A . A 1 2409 MET 2409 ? ? ? A . A 1 2410 ASP 2410 ? ? ? A . A 1 2411 LEU 2411 ? ? ? A . A 1 2412 GLY 2412 ? ? ? A . A 1 2413 THR 2413 ? ? ? A . A 1 2414 PRO 2414 ? ? ? A . A 1 2415 THR 2415 ? ? ? A . A 1 2416 TYR 2416 ? ? ? A . A 1 2417 ASP 2417 ? ? ? A . A 1 2418 GLU 2418 ? ? ? A . A 1 2419 ASN 2419 ? ? ? A . A 1 2420 PRO 2420 ? ? ? A . A 1 2421 MET 2421 ? ? ? A . A 1 2422 LYS 2422 ? ? ? A . A 1 2423 THR 2423 ? ? ? A . A 1 2424 SER 2424 ? ? ? A . A 1 2425 LYS 2425 ? ? ? A . A 1 2426 LYS 2426 ? ? ? A . A 1 2427 PRO 2427 ? ? ? A . A 1 2428 LYS 2428 ? ? ? A . A 1 2429 THR 2429 ? ? ? A . A 1 2430 ALA 2430 ? ? ? A . A 1 2431 GLU 2431 ? ? ? A . A 1 2432 ALA 2432 ? ? ? A . A 1 2433 ASP 2433 ? ? ? A . A 1 2434 THR 2434 2434 THR THR A . A 1 2435 SER 2435 2435 SER SER A . A 1 2436 SER 2436 2436 SER SER A . A 1 2437 GLU 2437 2437 GLU GLU A . A 1 2438 LEU 2438 2438 LEU LEU A . A 1 2439 ALA 2439 2439 ALA ALA A . A 1 2440 LYS 2440 2440 LYS LYS A . A 1 2441 LYS 2441 2441 LYS LYS A . A 1 2442 SER 2442 2442 SER SER A . A 1 2443 LYS 2443 2443 LYS LYS A . A 1 2444 GLU 2444 2444 GLU GLU A . A 1 2445 VAL 2445 2445 VAL VAL A . A 1 2446 PHE 2446 2446 PHE PHE A . A 1 2447 ARG 2447 2447 ARG ARG A . A 1 2448 LYS 2448 2448 LYS LYS A . A 1 2449 GLU 2449 2449 GLU GLU A . A 1 2450 MET 2450 2450 MET MET A . A 1 2451 SER 2451 2451 SER SER A . A 1 2452 GLN 2452 2452 GLN GLN A . A 1 2453 PHE 2453 2453 PHE PHE A . A 1 2454 ILE 2454 2454 ILE ILE A . A 1 2455 VAL 2455 2455 VAL VAL A . A 1 2456 GLN 2456 2456 GLN GLN A . A 1 2457 CYS 2457 2457 CYS CYS A . A 1 2458 LEU 2458 2458 LEU LEU A . A 1 2459 ASN 2459 2459 ASN ASN A . A 1 2460 PRO 2460 2460 PRO PRO A . A 1 2461 TYR 2461 2461 TYR TYR A . A 1 2462 ARG 2462 2462 ARG ARG A . A 1 2463 LYS 2463 2463 LYS LYS A . A 1 2464 PRO 2464 2464 PRO PRO A . A 1 2465 ASP 2465 2465 ASP ASP A . A 1 2466 CYS 2466 2466 CYS CYS A . A 1 2467 LYS 2467 2467 LYS LYS A . A 1 2468 VAL 2468 2468 VAL VAL A . A 1 2469 GLY 2469 2469 GLY GLY A . A 1 2470 ARG 2470 2470 ARG ARG A . A 1 2471 ILE 2471 2471 ILE ILE A . A 1 2472 THR 2472 2472 THR THR A . A 1 2473 THR 2473 2473 THR THR A . A 1 2474 THR 2474 2474 THR THR A . A 1 2475 GLU 2475 2475 GLU GLU A . A 1 2476 ASP 2476 2476 ASP ASP A . A 1 2477 PHE 2477 2477 PHE PHE A . A 1 2478 LYS 2478 2478 LYS LYS A . A 1 2479 HIS 2479 2479 HIS HIS A . A 1 2480 LEU 2480 2480 LEU LEU A . A 1 2481 ALA 2481 2481 ALA ALA A . A 1 2482 ARG 2482 2482 ARG ARG A . A 1 2483 LYS 2483 2483 LYS LYS A . A 1 2484 LEU 2484 2484 LEU LEU A . A 1 2485 THR 2485 2485 THR THR A . A 1 2486 HIS 2486 2486 HIS HIS A . A 1 2487 GLY 2487 2487 GLY GLY A . A 1 2488 VAL 2488 2488 VAL VAL A . A 1 2489 MET 2489 2489 MET MET A . A 1 2490 ASN 2490 2490 ASN ASN A . A 1 2491 LYS 2491 2491 LYS LYS A . A 1 2492 GLU 2492 2492 GLU GLU A . A 1 2493 LEU 2493 2493 LEU LEU A . A 1 2494 LYS 2494 2494 LYS LYS A . A 1 2495 TYR 2495 2495 TYR TYR A . A 1 2496 CYS 2496 2496 CYS CYS A . A 1 2497 LYS 2497 2497 LYS LYS A . A 1 2498 ASN 2498 2498 ASN ASN A . A 1 2499 PRO 2499 2499 PRO PRO A . A 1 2500 GLU 2500 2500 GLU GLU A . A 1 2501 ASP 2501 2501 ASP ASP A . A 1 2502 LEU 2502 2502 LEU LEU A . A 1 2503 GLU 2503 2503 GLU GLU A . A 1 2504 CYS 2504 2504 CYS CYS A . A 1 2505 ASN 2505 2505 ASN ASN A . A 1 2506 GLU 2506 2506 GLU GLU A . A 1 2507 ASN 2507 2507 ASN ASN A . A 1 2508 VAL 2508 2508 VAL VAL A . A 1 2509 LYS 2509 2509 LYS LYS A . A 1 2510 HIS 2510 2510 HIS HIS A . A 1 2511 LYS 2511 2511 LYS LYS A . A 1 2512 THR 2512 2512 THR THR A . A 1 2513 LYS 2513 2513 LYS LYS A . A 1 2514 GLU 2514 2514 GLU GLU A . A 1 2515 TYR 2515 2515 TYR TYR A . A 1 2516 ILE 2516 2516 ILE ILE A . A 1 2517 LYS 2517 2517 LYS LYS A . A 1 2518 LYS 2518 2518 LYS LYS A . A 1 2519 TYR 2519 2519 TYR TYR A . A 1 2520 MET 2520 2520 MET MET A . A 1 2521 GLN 2521 2521 GLN GLN A . A 1 2522 LYS 2522 2522 LYS LYS A . A 1 2523 PHE 2523 2523 PHE PHE A . A 1 2524 GLY 2524 2524 GLY GLY A . A 1 2525 ALA 2525 2525 ALA ALA A . A 1 2526 VAL 2526 2526 VAL VAL A . A 1 2527 TYR 2527 2527 TYR TYR A . A 1 2528 LYS 2528 2528 LYS LYS A . A 1 2529 PRO 2529 2529 PRO PRO A . A 1 2530 LYS 2530 2530 LYS LYS A . A 1 2531 GLU 2531 2531 GLU GLU A . A 1 2532 ASP 2532 2532 ASP ASP A . A 1 2533 THR 2533 2533 THR THR A . A 1 2534 GLU 2534 ? ? ? A . A 1 2535 LEU 2535 ? ? ? A . A 1 2536 GLU 2536 ? ? ? A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Huntingtin interacting protein B {PDB ID=2a7o, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=2a7o.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by BLAST to 2a7o, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 2' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-04 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-29 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GSHMTAEADTSSELAKKSKEVFRKEMSQFIVQCLNPYRKPDCKVGRITTTEDFKHLARKLTHGVMNKELK YCKNPEDLECNENVKHKTKEYIKKYMQKFGAVYKPKEDTELE ; ;GSHMTAEADTSSELAKKSKEVFRKEMSQFIVQCLNPYRKPDCKVGRITTTEDFKHLARKLTHGVMNKELK YCKNPEDLECNENVKHKTKEYIKKYMQKFGAVYKPKEDTELE ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 5 112 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 2a7o 2024-05-22 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2536 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2536 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'BLAST e-value' . 6.31e-67 100.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MKPLPSQQPPPKMGDFYDPEHPTPEEEENEAKIENVQKTGFIKGPVFKGVASSRFLPKGTKTKVNLEEQGRQKVSFSFSFTKKTLQNRFLTALSNEKQSDSPNSPAPPLQVDSNPKVKMDAGDTFPATEESSPPKSRVELGRIHFKKHLLHVTSRPQLAASTTAASPLPPTTQLPAVLAESMIDSPPSSPPPPPPPPQASSPSPPAQISEPVALPQPPATALMTSPPGPLPGDVAVRAQKESPVKSGPEVLEVDTKQDIVSNSLEEHTVQTLKEQADHLLQKEDSHIGKEEEVSDGSKISLSSKKASSKKKSSQFEGTFLGSESDEDSVRTSSSQRSHDLKSSTSIDKERDFKKSSAPSKSEDLGKSSRSKTERDDRYCSYSKLERDTRYVSSRCRSERDRRRSRSRSRSDRASRTSLSYSRSERSHYYDSERRYHRSSPYRERTRYSRPYTDNRARESSDSEDEYKKTYPRRTSAHSYRDLRTSSSYSKFDRDCKTETSYLEMERRGKYTSKLERESKRTSEHETIKRCCSPPNELGFRRGSSYSKHDNSTSRYKSALSKSISKNDKFKNSFCCTELNEENKQSHSFSLQTPCSKGSELRTINKISEREKTGSPTPSNQLNDSPTFKKLDESPVLKPEFIGHDGRESIKELELSKVKNDQLRNFCSIELNVNGSPETEADVATFCTSKTDAISMTSDDSVTGSEVSPLIKACMLSSNGFQNVGRCRERDSDDTCRQHNTSKSPFREMEPLLSPHHDKLMSLPVKTIDYPKTLIKEPVDKRHSCCKTKDSDIYCSPNENPEAENAEPSAMTISSHSFVNVHLESKTVICDNREPTDRHSENTCDEYKQSIGSTSSASHNHFDGLYEPIGSSGISSLQSPPSGIRCEENTSPTLDAVESKKGIDFLKYARKETDVGSALPDSGKGFSWENRHNNVLSGQSLQEAQEEGNSILHERRGRPEIPLDEEQRGHTHISDDSEVVFPYDLNLTMEDSDGITYTLKCDSSGNAPEIVSTVHEDYSGSSASSSDESDSEDTESDDSSIPRNRLQSVVVVPKNSTLPMEETSPCSSRSSQSYKHYSDRWEDGLETRRHAYEEEYESKGCSQTEKYFLHKGTERSAESCYSQFGRKADNHLPDIAHAQSDGVDSTSQTDSRSDHLGHLNPEDTLRAKTSRPQELPVYSDDFEDLPNKSRQQMIFSNRPDSSRLGKTELSFSSSCDISRMDGLHSSEELRNLGWDFSQQERPTTTYQQPDSSYGTCGTHKYQQSTEHYGGTHNYWQGNGYWDPRSAGRPPGTGLAYDRIQGQVPDSLTDDREEEEHWDQRSGSHFSSPSNKFFFHQKDKGSVQAPEISSNSIKDALVMNERKDFSKNFEKNDIKERGPPKKRRQELESDSESDGELQARKKVRVEMEQGESSVPQHSELMGPSCAMDDFRDPQRWKEFAKLGKMPCYFDLIEENVYLTERKKNKSHRDIKRMQCECTPLSKDERAQGEVACGEDCLNRLLMIECSSRCPNGDYCSNRRFQRKQHADVEVILTEKKGWGLRAAKDLPSNTFVLEYCGEVLDHKEFKARVKEYARNKNIHYYFMALKNDEIIDATQKGNCSRFMNHSCEPNCETQKWTVNGQLRVGFFTTKLVPSGSELTFDYQFQRYGKEAQKCFCGSANCRGYLGGENRVSIRAAGGKMKKERSRKKDSVDGELEALMENGEGLSDKNQVLSLSRLMVRIETLEQKLTCLKLIQNTHSQSCLKSFLERHGLSLLWIWMAELGDGRESNQKLQEEIIKTLEHLPIPTKNMLEESKVLPIIQRWSQTKTAVPQLSEGDGYSSENTSRAHTPLNTPDPSAKPSTEMDTDTPKKLIFRRLKIISENSMDSAVSDVTSELECKDGKEDLDQLETVTVEEDEELQSQQLLPQQLCESKVESEATIEVSKLPTSEPEADTETEPKDSNGTKLEETIAEETPSQDEEEGVSDVESERSQEPPDKTVDISDLATKLLDSWKDLKEVYRIPKKSQTEKESTAERGRDAAAFRDQTAPKTPNRSRERDPDKQSQNKEKRKRRGSLSPPSSAYERGTKRPDDRYDTPTSKKKVRIKDRNKLSTEERRKLFEQEVAQREAQKQQQQMQNLGMTSPLPFDSLGYNASHHPFAGYPPGYPMQAYVDPSNPNAGKVLLPTPSMDPVCSPAPYDHAQPLVGHSTESLAAPPSVPVVPHVAASVEVSSSQYVAQNESVVHQDSNVPVMPVQAPGPVQGQNYNVWESNQQSVSVQQQYSPAQSQTTIYYQGQTCSTVYSVTSPYSQTTPPIVQSYAQPSLQYIQGQQIFTAHPQGVVVQPTAAVTSIVAPGQPQSLQPPEMVVTNNLLDLPPPSPPKPKTIVLPPNWKTARDPEGKIYYYHVITRQTQWDPPTWESPGDDASLEHEAEMDLGTPTYDENPMKTSKKPKTAEADTSSELAKKSKEVFRKEMSQFIVQCLNPYRKPDCKVGRITTTEDFKHLARKLTHGVMNKELKYCKNPEDLECNENVKHKTKEYIKKYMQKFGAVYKPKEDTELE 2 1 2 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TAEADTSSELAKKSKEVFRKEMSQFIVQCLNPYRKPDCKVGRITTTEDFKHLARKLTHGVMNKELKYCKNPEDLECNENVKHKTKEYIKKYMQKFGAVYKPKEDTELE # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 2a7o.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 2' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . THR 2434 2434 ? A -3.219 -23.076 3.577 1 1 A THR 0.500 1 ATOM 2 C CA . THR 2434 2434 ? A -2.169 -22.515 4.513 1 1 A THR 0.500 1 ATOM 3 C C . THR 2434 2434 ? A -2.271 -21.003 4.702 1 1 A THR 0.500 1 ATOM 4 O O . THR 2434 2434 ? A -1.390 -20.364 5.256 1 1 A THR 0.500 1 ATOM 5 C CB . THR 2434 2434 ? A -0.782 -22.870 3.956 1 1 A THR 0.500 1 ATOM 6 O OG1 . THR 2434 2434 ? A -0.697 -22.586 2.560 1 1 A THR 0.500 1 ATOM 7 C CG2 . THR 2434 2434 ? A -0.549 -24.381 4.133 1 1 A THR 0.500 1 ATOM 8 N N . SER 2435 2435 ? A -3.384 -20.358 4.274 1 1 A SER 0.520 1 ATOM 9 C CA . SER 2435 2435 ? A -3.418 -18.926 4.020 1 1 A SER 0.520 1 ATOM 10 C C . SER 2435 2435 ? A -3.683 -18.076 5.238 1 1 A SER 0.520 1 ATOM 11 O O . SER 2435 2435 ? A -3.647 -16.859 5.160 1 1 A SER 0.520 1 ATOM 12 C CB . SER 2435 2435 ? A -4.499 -18.557 2.978 1 1 A SER 0.520 1 ATOM 13 O OG . SER 2435 2435 ? A -4.394 -19.404 1.831 1 1 A SER 0.520 1 ATOM 14 N N . SER 2436 2436 ? A -3.950 -18.687 6.407 1 1 A SER 0.810 1 ATOM 15 C CA . SER 2436 2436 ? A -4.068 -18.006 7.684 1 1 A SER 0.810 1 ATOM 16 C C . SER 2436 2436 ? A -2.705 -17.508 8.170 1 1 A SER 0.810 1 ATOM 17 O O . SER 2436 2436 ? A -2.560 -16.339 8.511 1 1 A SER 0.810 1 ATOM 18 C CB . SER 2436 2436 ? A -4.716 -18.954 8.736 1 1 A SER 0.810 1 ATOM 19 O OG . SER 2436 2436 ? A -4.044 -20.218 8.742 1 1 A SER 0.810 1 ATOM 20 N N . GLU 2437 2437 ? A -1.669 -18.386 8.148 1 1 A GLU 0.780 1 ATOM 21 C CA . GLU 2437 2437 ? A -0.272 -18.110 8.453 1 1 A GLU 0.780 1 ATOM 22 C C . GLU 2437 2437 ? A 0.565 -17.609 7.290 1 1 A GLU 0.780 1 ATOM 23 O O . GLU 2437 2437 ? A 1.444 -16.769 7.493 1 1 A GLU 0.780 1 ATOM 24 C CB . GLU 2437 2437 ? A 0.421 -19.362 9.022 1 1 A GLU 0.780 1 ATOM 25 C CG . GLU 2437 2437 ? A 0.398 -20.572 8.066 1 1 A GLU 0.780 1 ATOM 26 C CD . GLU 2437 2437 ? A 1.142 -21.761 8.657 1 1 A GLU 0.780 1 ATOM 27 O OE1 . GLU 2437 2437 ? A 2.397 -21.716 8.667 1 1 A GLU 0.780 1 ATOM 28 O OE2 . GLU 2437 2437 ? A 0.445 -22.725 9.060 1 1 A GLU 0.780 1 ATOM 29 N N . LEU 2438 2438 ? A 0.277 -18.025 6.028 1 1 A LEU 0.800 1 ATOM 30 C CA . LEU 2438 2438 ? A 0.904 -17.488 4.819 1 1 A LEU 0.800 1 ATOM 31 C C . LEU 2438 2438 ? A 0.669 -16.000 4.776 1 1 A LEU 0.800 1 ATOM 32 O O . LEU 2438 2438 ? A 1.569 -15.202 4.609 1 1 A LEU 0.800 1 ATOM 33 C CB . LEU 2438 2438 ? A 0.246 -18.096 3.549 1 1 A LEU 0.800 1 ATOM 34 C CG . LEU 2438 2438 ? A 0.918 -17.962 2.158 1 1 A LEU 0.800 1 ATOM 35 C CD1 . LEU 2438 2438 ? A 0.161 -18.895 1.197 1 1 A LEU 0.800 1 ATOM 36 C CD2 . LEU 2438 2438 ? A 0.907 -16.549 1.552 1 1 A LEU 0.800 1 ATOM 37 N N . ALA 2439 2439 ? A -0.591 -15.612 5.061 1 1 A ALA 0.860 1 ATOM 38 C CA . ALA 2439 2439 ? A -0.989 -14.245 5.159 1 1 A ALA 0.860 1 ATOM 39 C C . ALA 2439 2439 ? A -0.468 -13.514 6.352 1 1 A ALA 0.860 1 ATOM 40 O O . ALA 2439 2439 ? A -0.318 -12.303 6.278 1 1 A ALA 0.860 1 ATOM 41 C CB . ALA 2439 2439 ? A -2.494 -14.145 5.187 1 1 A ALA 0.860 1 ATOM 42 N N . LYS 2440 2440 ? A -0.127 -14.152 7.487 1 1 A LYS 0.810 1 ATOM 43 C CA . LYS 2440 2440 ? A 0.504 -13.429 8.583 1 1 A LYS 0.810 1 ATOM 44 C C . LYS 2440 2440 ? A 1.777 -12.755 8.128 1 1 A LYS 0.810 1 ATOM 45 O O . LYS 2440 2440 ? A 1.964 -11.575 8.351 1 1 A LYS 0.810 1 ATOM 46 C CB . LYS 2440 2440 ? A 0.852 -14.330 9.788 1 1 A LYS 0.810 1 ATOM 47 C CG . LYS 2440 2440 ? A -0.367 -14.882 10.536 1 1 A LYS 0.810 1 ATOM 48 C CD . LYS 2440 2440 ? A -1.214 -13.807 11.235 1 1 A LYS 0.810 1 ATOM 49 C CE . LYS 2440 2440 ? A -2.476 -14.346 11.915 1 1 A LYS 0.810 1 ATOM 50 N NZ . LYS 2440 2440 ? A -2.086 -15.297 12.970 1 1 A LYS 0.810 1 ATOM 51 N N . LYS 2441 2441 ? A 2.576 -13.532 7.375 1 1 A LYS 0.810 1 ATOM 52 C CA . LYS 2441 2441 ? A 3.752 -13.085 6.689 1 1 A LYS 0.810 1 ATOM 53 C C . LYS 2441 2441 ? A 3.433 -12.243 5.468 1 1 A LYS 0.810 1 ATOM 54 O O . LYS 2441 2441 ? A 4.011 -11.189 5.273 1 1 A LYS 0.810 1 ATOM 55 C CB . LYS 2441 2441 ? A 4.614 -14.320 6.351 1 1 A LYS 0.810 1 ATOM 56 C CG . LYS 2441 2441 ? A 4.842 -15.231 7.578 1 1 A LYS 0.810 1 ATOM 57 C CD . LYS 2441 2441 ? A 5.394 -14.508 8.826 1 1 A LYS 0.810 1 ATOM 58 C CE . LYS 2441 2441 ? A 6.806 -13.952 8.630 1 1 A LYS 0.810 1 ATOM 59 N NZ . LYS 2441 2441 ? A 7.204 -13.103 9.768 1 1 A LYS 0.810 1 ATOM 60 N N . SER 2442 2442 ? A 2.467 -12.658 4.624 1 1 A SER 0.870 1 ATOM 61 C CA . SER 2442 2442 ? A 2.096 -11.916 3.426 1 1 A SER 0.870 1 ATOM 62 C C . SER 2442 2442 ? A 1.604 -10.514 3.717 1 1 A SER 0.870 1 ATOM 63 O O . SER 2442 2442 ? A 2.041 -9.585 3.068 1 1 A SER 0.870 1 ATOM 64 C CB . SER 2442 2442 ? A 1.094 -12.652 2.497 1 1 A SER 0.870 1 ATOM 65 O OG . SER 2442 2442 ? A 1.313 -12.298 1.133 1 1 A SER 0.870 1 ATOM 66 N N . LYS 2443 2443 ? A 0.747 -10.273 4.741 1 1 A LYS 0.840 1 ATOM 67 C CA . LYS 2443 2443 ? A 0.322 -8.921 5.093 1 1 A LYS 0.840 1 ATOM 68 C C . LYS 2443 2443 ? A 1.452 -7.990 5.535 1 1 A LYS 0.840 1 ATOM 69 O O . LYS 2443 2443 ? A 1.500 -6.837 5.115 1 1 A LYS 0.840 1 ATOM 70 C CB . LYS 2443 2443 ? A -0.754 -8.847 6.220 1 1 A LYS 0.840 1 ATOM 71 C CG . LYS 2443 2443 ? 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A 5.543 -8.281 3.613 1 1 A VAL 0.870 1 ATOM 86 C C . VAL 2445 2445 ? A 4.838 -7.299 2.691 1 1 A VAL 0.870 1 ATOM 87 O O . VAL 2445 2445 ? A 5.373 -6.233 2.447 1 1 A VAL 0.870 1 ATOM 88 C CB . VAL 2445 2445 ? A 5.900 -9.576 2.887 1 1 A VAL 0.870 1 ATOM 89 C CG1 . VAL 2445 2445 ? A 6.657 -9.301 1.570 1 1 A VAL 0.870 1 ATOM 90 C CG2 . VAL 2445 2445 ? A 6.790 -10.447 3.798 1 1 A VAL 0.870 1 ATOM 91 N N . PHE 2446 2446 ? A 3.573 -7.533 2.282 1 1 A PHE 0.870 1 ATOM 92 C CA . PHE 2446 2446 ? A 2.787 -6.668 1.421 1 1 A PHE 0.870 1 ATOM 93 C C . PHE 2446 2446 ? A 2.775 -5.223 1.892 1 1 A PHE 0.870 1 ATOM 94 O O . PHE 2446 2446 ? A 3.100 -4.315 1.139 1 1 A PHE 0.870 1 ATOM 95 C CB . PHE 2446 2446 ? A 1.326 -7.215 1.374 1 1 A PHE 0.870 1 ATOM 96 C CG . PHE 2446 2446 ? A 0.280 -6.212 0.981 1 1 A PHE 0.870 1 ATOM 97 C CD1 . PHE 2446 2446 ? A 0.448 -5.419 -0.154 1 1 A PHE 0.870 1 ATOM 98 C CD2 . PHE 2446 2446 ? A -0.782 -5.923 1.842 1 1 A PHE 0.870 1 ATOM 99 C CE1 . PHE 2446 2446 ? 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A -7.639 12.147 3.196 1 1 A ASP 0.600 1 ATOM 821 O OD2 . ASP 2532 2532 ? A -7.568 10.902 5.017 1 1 A ASP 0.600 1 ATOM 822 N N . THR 2533 2533 ? A -10.347 12.554 4.186 1 1 A THR 0.600 1 ATOM 823 C CA . THR 2533 2533 ? A -11.539 11.718 4.152 1 1 A THR 0.600 1 ATOM 824 C C . THR 2533 2533 ? A -11.540 10.707 5.337 1 1 A THR 0.600 1 ATOM 825 O O . THR 2533 2533 ? A -10.505 10.594 6.046 1 1 A THR 0.600 1 ATOM 826 C CB . THR 2533 2533 ? A -11.586 10.997 2.789 1 1 A THR 0.600 1 ATOM 827 O OG1 . THR 2533 2533 ? A -12.814 10.362 2.462 1 1 A THR 0.600 1 ATOM 828 C CG2 . THR 2533 2533 ? A -10.438 9.983 2.619 1 1 A THR 0.600 1 ATOM 829 O OXT . THR 2533 2533 ? A -12.583 10.031 5.550 1 1 A THR 0.600 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O S # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.846 2 1 3 0.081 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 2434 THR 1 0.500 2 1 A 2435 SER 1 0.520 3 1 A 2436 SER 1 0.810 4 1 A 2437 GLU 1 0.780 5 1 A 2438 LEU 1 0.800 6 1 A 2439 ALA 1 0.860 7 1 A 2440 LYS 1 0.810 8 1 A 2441 LYS 1 0.810 9 1 A 2442 SER 1 0.870 10 1 A 2443 LYS 1 0.840 11 1 A 2444 GLU 1 0.840 12 1 A 2445 VAL 1 0.870 13 1 A 2446 PHE 1 0.870 14 1 A 2447 ARG 1 0.850 15 1 A 2448 LYS 1 0.860 16 1 A 2449 GLU 1 0.870 17 1 A 2450 MET 1 0.890 18 1 A 2451 SER 1 0.940 19 1 A 2452 GLN 1 0.890 20 1 A 2453 PHE 1 0.900 21 1 A 2454 ILE 1 0.930 22 1 A 2455 VAL 1 0.930 23 1 A 2456 GLN 1 0.890 24 1 A 2457 CYS 1 0.930 25 1 A 2458 LEU 1 0.920 26 1 A 2459 ASN 1 0.880 27 1 A 2460 PRO 1 0.870 28 1 A 2461 TYR 1 0.860 29 1 A 2462 ARG 1 0.790 30 1 A 2463 LYS 1 0.800 31 1 A 2464 PRO 1 0.770 32 1 A 2465 ASP 1 0.720 33 1 A 2466 CYS 1 0.780 34 1 A 2467 LYS 1 0.780 35 1 A 2468 VAL 1 0.870 36 1 A 2469 GLY 1 0.900 37 1 A 2470 ARG 1 0.800 38 1 A 2471 ILE 1 0.870 39 1 A 2472 THR 1 0.860 40 1 A 2473 THR 1 0.850 41 1 A 2474 THR 1 0.850 42 1 A 2475 GLU 1 0.820 43 1 A 2476 ASP 1 0.880 44 1 A 2477 PHE 1 0.890 45 1 A 2478 LYS 1 0.870 46 1 A 2479 HIS 1 0.890 47 1 A 2480 LEU 1 0.920 48 1 A 2481 ALA 1 0.960 49 1 A 2482 ARG 1 0.880 50 1 A 2483 LYS 1 0.900 51 1 A 2484 LEU 1 0.940 52 1 A 2485 THR 1 0.930 53 1 A 2486 HIS 1 0.920 54 1 A 2487 GLY 1 0.930 55 1 A 2488 VAL 1 0.930 56 1 A 2489 MET 1 0.880 57 1 A 2490 ASN 1 0.880 58 1 A 2491 LYS 1 0.850 59 1 A 2492 GLU 1 0.830 60 1 A 2493 LEU 1 0.830 61 1 A 2494 LYS 1 0.770 62 1 A 2495 TYR 1 0.710 63 1 A 2496 CYS 1 0.740 64 1 A 2497 LYS 1 0.720 65 1 A 2498 ASN 1 0.770 66 1 A 2499 PRO 1 0.830 67 1 A 2500 GLU 1 0.780 68 1 A 2501 ASP 1 0.800 69 1 A 2502 LEU 1 0.850 70 1 A 2503 GLU 1 0.850 71 1 A 2504 CYS 1 0.900 72 1 A 2505 ASN 1 0.850 73 1 A 2506 GLU 1 0.830 74 1 A 2507 ASN 1 0.850 75 1 A 2508 VAL 1 0.900 76 1 A 2509 LYS 1 0.870 77 1 A 2510 HIS 1 0.880 78 1 A 2511 LYS 1 0.870 79 1 A 2512 THR 1 0.920 80 1 A 2513 LYS 1 0.900 81 1 A 2514 GLU 1 0.870 82 1 A 2515 TYR 1 0.910 83 1 A 2516 ILE 1 0.930 84 1 A 2517 LYS 1 0.890 85 1 A 2518 LYS 1 0.870 86 1 A 2519 TYR 1 0.900 87 1 A 2520 MET 1 0.890 88 1 A 2521 GLN 1 0.870 89 1 A 2522 LYS 1 0.880 90 1 A 2523 PHE 1 0.850 91 1 A 2524 GLY 1 0.890 92 1 A 2525 ALA 1 0.860 93 1 A 2526 VAL 1 0.870 94 1 A 2527 TYR 1 0.840 95 1 A 2528 LYS 1 0.870 96 1 A 2529 PRO 1 0.890 97 1 A 2530 LYS 1 0.800 98 1 A 2531 GLU 1 0.800 99 1 A 2532 ASP 1 0.600 100 1 A 2533 THR 1 0.600 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #