data_SMR-c0bd42008ade07c8bfbd86894bbca2a4_2 _entry.id SMR-c0bd42008ade07c8bfbd86894bbca2a4_2 _struct.entry_id SMR-c0bd42008ade07c8bfbd86894bbca2a4_2 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q9BYW2/ SETD2_HUMAN, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2 Estimated model accuracy of this model is 0.081, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q9BYW2' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 334179.960 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP SETD2_HUMAN Q9BYW2 1 ;MKQLQPQPPPKMGDFYDPEHPTPEEEENEAKIENVQKTGFIKGPMFKGVASSRFLPKGTKTKVNLEEQGR QKVSFSFSLTKKTLQNRFLTALGNEKQSDTPNPPAVPLQVDSTPKMKMEIGDTLSTAEESSPPKSRVELG KIHFKKHLLHVTSRPLLATTTAVASPPTHAAPLPAVIAESTTVDSPPSSPPPPPPPAQATTLSSPAPVTE PVALPHTPITVLMAAPVPLPVDVAVRSLKEPPIIIVPESLEADTKQDTISNSLEEHVTQILNEQADISSK KEDSHIGKDEEIPDSSKISLSCKKTGSKKKSSQSEGIFLGSESDEDSVRTSSSQRSHDLKFSASIEKERD FKKSSAPLKSEDLGKPSRSKTDRDDKYFSYSKLERDTRYVSSRCRSERERRRSRSHSRSERGSRTNLSYS RSERSHYYDSDRRYHRSSPYRERTRYSRPYTDNRARESSDSEEEYKKTYSRRTSSHSSSYRDLRTSSYSK SDRDCKTETSYLEMERRGKYSSKLERESKRTSENEAIKRCCSPPNELGFRRGSSYSKHDSSASRYKSTLS KPIPKSDKFKNSFCCTELNEEIKQSHSFSLQTPCSKGSELRMINKNPEREKAGSPAPSNRLNDSPTLKKL DELPIFKSEFITHDSHDSIKELDSLSKVKNDQLRSFCPIELNINGSPGAESDLATFCTSKTDAVLMTSDD SVTGSELSPLVKACMLSSNGFQNISRCKEKDLDDTCMLHKKSESPFRETEPLVSPHQDKLMSMPVMTVDY SKTVVKEPVDTRVSCCKTKDSDIYCTLNDSNPSLCNSEAENIEPSVMKISSNSFMNVHLESKPVICDSRN LTDHSKFACEEYKQSIGSTSSASVNHFDDLYQPIGSSGIASSLQSLPPGIKVDSLTLLKCGENTSPVLDA VLKSKKSSEFLKHAGKETIVEVGSDLPDSGKGFASRENRRNNGLSGKCLQEAQEEGNSILPERRGRPEIS LDERGEGGHVHTSDDSEVVFSSCDLNLTMEDSDGVTYALKCDSSGHAPEIVSTVHEDYSGSSESSNDESD SEDTDSDDSSIPRNRLQSVVVVPKNSTLPMEETSPCSSRSSQSYRHYSDHWEDERLESRRHLYEEKFESI ASKACPQTDKFFLHKGTEKNPEISFTQSSRKQIDNRLPELSHPQSDGVDSTSHTDVKSDPLGHPNSEETV KAKIPSRQQEELPIYSSDFEDVPNKSWQQTTFQNRPDSRLGKTELSFSSSCEIPHVDGLHSSEELRNLGW DFSQEKPSTTYQQPDSSYGACGGHKYQQNAEQYGGTRDYWQGNGYWDPRSGRPPGTGVVYDRTQGQVPDS LTDDREEEENWDQQDGSHFSDQSDKFLLSLQKDKGSVQAPEISSNSIKDTLAVNEKKDFSKNLEKNDIKD RGPLKKRRQEIESDSESDGELQDRKKVRVEVEQGETSVPPGSALVGPSCVMDDFRDPQRWKECAKQGKMP CYFDLIEENVYLTERKKNKSHRDIKRMQCECTPLSKDERAQGEIACGEDCLNRLLMIECSSRCPNGDYCS NRRFQRKQHADVEVILTEKKGWGLRAAKDLPSNTFVLEYCGEVLDHKEFKARVKEYARNKNIHYYFMALK NDEIIDATQKGNCSRFMNHSCEPNCETQKWTVNGQLRVGFFTTKLVPSGSELTFDYQFQRYGKEAQKCFC GSANCRGYLGGENRVSIRAAGGKMKKERSRKKDSVDGELEALMENGEGLSDKNQVLSLSRLMVRIETLEQ KLTCLELIQNTHSQSCLKSFLERHGLSLLWIWMAELGDGRESNQKLQEEIIKTLEHLPIPTKNMLEESKV LPIIQRWSQTKTAVPPLSEGDGYSSENTSRAHTPLNTPDPSTKLSTEADTDTPKKLMFRRLKIISENSMD SAISDATSELEGKDGKEDLDQLENVPVEEEEELQSQQLLPQQLPECKVDSETNIEASKLPTSEPEADAEI EPKESNGTKLEEPINEETPSQDEEEGVSDVESERSQEQPDKTVDISDLATKLLDSWKDLKEVYRIPKKSQ TEKENTTTERGRDAVGFRDQTPAPKTPNRSRERDPDKQTQNKEKRKRRSSLSPPSSAYERGTKRPDDRYD TPTSKKKVRIKDRNKLSTEERRKLFEQEVAQREAQKQQQQMQNLGMTSPLPYDSLGYNAPHHPFAGYPPG YPMQAYVDPSNPNAGKVLLPTPSMDPVCSPAPYDHAQPLVGHSTEPLSAPPPVPVVPHVAAPVEVSSSQY VAQSDGVVHQDSSVAVLPVPAPGPVQGQNYSVWDSNQQSVSVQQQYSPAQSQATIYYQGQTCPTVYGVTS PYSQTTPPIVQSYAQPSLQYIQGQQIFTAHPQGVVVQPAAAVTTIVAPGQPQPLQPSEMVVTNNLLDLPP PSPPKPKTIVLPPNWKTARDPEGKIYYYHVITRQTQWDPPTWESPGDDASLEHEAEMDLGTPTYDENPMK ASKKPKTAEADTSSELAKKSKEVFRKEMSQFIVQCLNPYRKPDCKVGRITTTEDFKHLARKLTHGVMNKE LKYCKNPEDLECNENVKHKTKEYIKKYMQKFGAVYKPKEDTELE ; 'Histone-lysine N-methyltransferase SETD2' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2564 1 2564 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . SETD2_HUMAN Q9BYW2 . 1 2564 9606 'Homo sapiens (Human)' 2010-05-18 2B1BAE5867AB8EAB # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MKQLQPQPPPKMGDFYDPEHPTPEEEENEAKIENVQKTGFIKGPMFKGVASSRFLPKGTKTKVNLEEQGR QKVSFSFSLTKKTLQNRFLTALGNEKQSDTPNPPAVPLQVDSTPKMKMEIGDTLSTAEESSPPKSRVELG KIHFKKHLLHVTSRPLLATTTAVASPPTHAAPLPAVIAESTTVDSPPSSPPPPPPPAQATTLSSPAPVTE PVALPHTPITVLMAAPVPLPVDVAVRSLKEPPIIIVPESLEADTKQDTISNSLEEHVTQILNEQADISSK KEDSHIGKDEEIPDSSKISLSCKKTGSKKKSSQSEGIFLGSESDEDSVRTSSSQRSHDLKFSASIEKERD FKKSSAPLKSEDLGKPSRSKTDRDDKYFSYSKLERDTRYVSSRCRSERERRRSRSHSRSERGSRTNLSYS RSERSHYYDSDRRYHRSSPYRERTRYSRPYTDNRARESSDSEEEYKKTYSRRTSSHSSSYRDLRTSSYSK SDRDCKTETSYLEMERRGKYSSKLERESKRTSENEAIKRCCSPPNELGFRRGSSYSKHDSSASRYKSTLS KPIPKSDKFKNSFCCTELNEEIKQSHSFSLQTPCSKGSELRMINKNPEREKAGSPAPSNRLNDSPTLKKL 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;MKQLQPQPPPKMGDFYDPEHPTPEEEENEAKIENVQKTGFIKGPMFKGVASSRFLPKGTKTKVNLEEQGR QKVSFSFSLTKKTLQNRFLTALGNEKQSDTPNPPAVPLQVDSTPKMKMEIGDTLSTAEESSPPKSRVELG KIHFKKHLLHVTSRPLLATTTAVASPPTHAAPLPAVIAESTTVDSPPSSPPPPPPPAQATTLSSPAPVTE PVALPHTPITVLMAAPVPLPVDVAVRSLKEPPIIIVPESLEADTKQDTISNSLEEHVTQILNEQADISSK KEDSHIGKDEEIPDSSKISLSCKKTGSKKKSSQSEGIFLGSESDEDSVRTSSSQRSHDLKFSASIEKERD FKKSSAPLKSEDLGKPSRSKTDRDDKYFSYSKLERDTRYVSSRCRSERERRRSRSHSRSERGSRTNLSYS RSERSHYYDSDRRYHRSSPYRERTRYSRPYTDNRARESSDSEEEYKKTYSRRTSSHSSSYRDLRTSSYSK SDRDCKTETSYLEMERRGKYSSKLERESKRTSENEAIKRCCSPPNELGFRRGSSYSKHDSSASRYKSTLS KPIPKSDKFKNSFCCTELNEEIKQSHSFSLQTPCSKGSELRMINKNPEREKAGSPAPSNRLNDSPTLKKL DELPIFKSEFITHDSHDSIKELDSLSKVKNDQLRSFCPIELNINGSPGAESDLATFCTSKTDAVLMTSDD SVTGSELSPLVKACMLSSNGFQNISRCKEKDLDDTCMLHKKSESPFRETEPLVSPHQDKLMSMPVMTVDY SKTVVKEPVDTRVSCCKTKDSDIYCTLNDSNPSLCNSEAENIEPSVMKISSNSFMNVHLESKPVICDSRN LTDHSKFACEEYKQSIGSTSSASVNHFDDLYQPIGSSGIASSLQSLPPGIKVDSLTLLKCGENTSPVLDA VLKSKKSSEFLKHAGKETIVEVGSDLPDSGKGFASRENRRNNGLSGKCLQEAQEEGNSILPERRGRPEIS 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A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Huntingtin interacting protein B {PDB ID=2a7o, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=2a7o.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 2a7o, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 2' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-04 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-29 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GSHMTAEADTSSELAKKSKEVFRKEMSQFIVQCLNPYRKPDCKVGRITTTEDFKHLARKLTHGVMNKELK YCKNPEDLECNENVKHKTKEYIKKYMQKFGAVYKPKEDTELE ; ;GSHMTAEADTSSELAKKSKEVFRKEMSQFIVQCLNPYRKPDCKVGRITTTEDFKHLARKLTHGVMNKELK YCKNPEDLECNENVKHKTKEYIKKYMQKFGAVYKPKEDTELE ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 5 112 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 2a7o 2024-05-22 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2564 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2564 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 1.3e-27 100.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MKQLQPQPPPKMGDFYDPEHPTPEEEENEAKIENVQKTGFIKGPMFKGVASSRFLPKGTKTKVNLEEQGRQKVSFSFSLTKKTLQNRFLTALGNEKQSDTPNPPAVPLQVDSTPKMKMEIGDTLSTAEESSPPKSRVELGKIHFKKHLLHVTSRPLLATTTAVASPPTHAAPLPAVIAESTTVDSPPSSPPPPPPPAQATTLSSPAPVTEPVALPHTPITVLMAAPVPLPVDVAVRSLKEPPIIIVPESLEADTKQDTISNSLEEHVTQILNEQADISSKKEDSHIGKDEEIPDSSKISLSCKKTGSKKKSSQSEGIFLGSESDEDSVRTSSSQRSHDLKFSASIEKERDFKKSSAPLKSEDLGKPSRSKTDRDDKYFSYSKLERDTRYVSSRCRSERERRRSRSHSRSERGSRTNLSYSRSERSHYYDSDRRYHRSSPYRERTRYSRPYTDNRARESSDSEEEYKKTYSRRTSSHSSSYRDLRTSSYSKSDRDCKTETSYLEMERRGKYSSKLERESKRTSENEAIKRCCSPPNELGFRRGSSYSKHDSSASRYKSTLSKPIPKSDKFKNSFCCTELNEEIKQSHSFSLQTPCSKGSELRMINKNPEREKAGSPAPSNRLNDSPTLKKLDELPIFKSEFITHDSHDSIKELDSLSKVKNDQLRSFCPIELNINGSPGAESDLATFCTSKTDAVLMTSDDSVTGSELSPLVKACMLSSNGFQNISRCKEKDLDDTCMLHKKSESPFRETEPLVSPHQDKLMSMPVMTVDYSKTVVKEPVDTRVSCCKTKDSDIYCTLNDSNPSLCNSEAENIEPSVMKISSNSFMNVHLESKPVICDSRNLTDHSKFACEEYKQSIGSTSSASVNHFDDLYQPIGSSGIASSLQSLPPGIKVDSLTLLKCGENTSPVLDAVLKSKKSSEFLKHAGKETIVEVGSDLPDSGKGFASRENRRNNGLSGKCLQEAQEEGNSILPERRGRPEISLDERGEGGHVHTSDDSEVVFSSCDLNLTMEDSDGVTYALKCDSSGHAPEIVSTVHEDYSGSSESSNDESDSEDTDSDDSSIPRNRLQSVVVVPKNSTLPMEETSPCSSRSSQSYRHYSDHWEDERLESRRHLYEEKFESIASKACPQTDKFFLHKGTEKNPEISFTQSSRKQIDNRLPELSHPQSDGVDSTSHTDVKSDPLGHPNSEETVKAKIPSRQQEELPIYSSDFEDVPNKSWQQTTFQNRPDSRLGKTELSFSSSCEIPHVDGLHSSEELRNLGWDFSQEKPSTTYQQPDSSYGACGGHKYQQNAEQYGGTRDYWQGNGYWDPRSGRPPGTGVVYDRTQGQVPDSLTDDREEEENWDQQDGSHFSDQSDKFLLSLQKDKGSVQAPEISSNSIKDTLAVNEKKDFSKNLEKNDIKDRGPLKKRRQEIESDSESDGELQDRKKVRVEVEQGETSVPPGSALVGPSCVMDDFRDPQRWKECAKQGKMPCYFDLIEENVYLTERKKNKSHRDIKRMQCECTPLSKDERAQGEIACGEDCLNRLLMIECSSRCPNGDYCSNRRFQRKQHADVEVILTEKKGWGLRAAKDLPSNTFVLEYCGEVLDHKEFKARVKEYARNKNIHYYFMALKNDEIIDATQKGNCSRFMNHSCEPNCETQKWTVNGQLRVGFFTTKLVPSGSELTFDYQFQRYGKEAQKCFCGSANCRGYLGGENRVSIRAAGGKMKKERSRKKDSVDGELEALMENGEGLSDKNQVLSLSRLMVRIETLEQKLTCLELIQNTHSQSCLKSFLERHGLSLLWIWMAELGDGRESNQKLQEEIIKTLEHLPIPTKNMLEESKVLPIIQRWSQTKTAVPPLSEGDGYSSENTSRAHTPLNTPDPSTKLSTEADTDTPKKLMFRRLKIISENSMDSAISDATSELEGKDGKEDLDQLENVPVEEEEELQSQQLLPQQLPECKVDSETNIEASKLPTSEPEADAEIEPKESNGTKLEEPINEETPSQDEEEGVSDVESERSQEQPDKTVDISDLATKLLDSWKDLKEVYRIPKKSQTEKENTTTERGRDAVGFRDQTPAPKTPNRSRERDPDKQTQNKEKRKRRSSLSPPSSAYERGTKRPDDRYDTPTSKKKVRIKDRNKLSTEERRKLFEQEVAQREAQKQQQQMQNLGMTSPLPYDSLGYNAPHHPFAGYPPGYPMQAYVDPSNPNAGKVLLPTPSMDPVCSPAPYDHAQPLVGHSTEPLSAPPPVPVVPHVAAPVEVSSSQYVAQSDGVVHQDSSVAVLPVPAPGPVQGQNYSVWDSNQQSVSVQQQYSPAQSQATIYYQGQTCPTVYGVTSPYSQTTPPIVQSYAQPSLQYIQGQQIFTAHPQGVVVQPAAAVTTIVAPGQPQPLQPSEMVVTNNLLDLPPPSPPKPKTIVLPPNWKTARDPEGKIYYYHVITRQTQWDPPTWESPGDDASLEHEAEMDLGTPTYDENPMKASKKPKTAEADTSSELAKKSKEVFRKEMSQFIVQCLNPYRKPDCKVGRITTTEDFKHLARKLTHGVMNKELKYCKNPEDLECNENVKHKTKEYIKKYMQKFGAVYKPKEDTELE 2 1 2 --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TAEADTSSELAKKSKEVFRKEMSQFIVQCLNPYRKPDCKVGRITTTEDFKHLARKLTHGVMNKELKYCKNPEDLECNENVKHKTKEYIKKYMQKFGAVYKPKEDTELE # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 2a7o.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 2' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . THR 2462 2462 ? A -3.219 -23.076 3.577 1 1 A THR 0.500 1 ATOM 2 C CA . THR 2462 2462 ? A -2.169 -22.515 4.513 1 1 A THR 0.500 1 ATOM 3 C C . THR 2462 2462 ? A -2.271 -21.003 4.702 1 1 A THR 0.500 1 ATOM 4 O O . THR 2462 2462 ? A -1.390 -20.364 5.256 1 1 A THR 0.500 1 ATOM 5 C CB . THR 2462 2462 ? A -0.782 -22.870 3.956 1 1 A THR 0.500 1 ATOM 6 O OG1 . THR 2462 2462 ? A -0.697 -22.586 2.560 1 1 A THR 0.500 1 ATOM 7 C CG2 . THR 2462 2462 ? A -0.549 -24.381 4.133 1 1 A THR 0.500 1 ATOM 8 N N . SER 2463 2463 ? A -3.384 -20.358 4.274 1 1 A SER 0.510 1 ATOM 9 C CA . SER 2463 2463 ? A -3.418 -18.926 4.020 1 1 A SER 0.510 1 ATOM 10 C C . SER 2463 2463 ? A -3.683 -18.076 5.238 1 1 A SER 0.510 1 ATOM 11 O O . SER 2463 2463 ? A -3.647 -16.859 5.160 1 1 A SER 0.510 1 ATOM 12 C CB . SER 2463 2463 ? A -4.499 -18.557 2.978 1 1 A SER 0.510 1 ATOM 13 O OG . SER 2463 2463 ? A -4.394 -19.404 1.831 1 1 A SER 0.510 1 ATOM 14 N N . SER 2464 2464 ? A -3.950 -18.687 6.407 1 1 A SER 0.810 1 ATOM 15 C CA . SER 2464 2464 ? A -4.068 -18.006 7.684 1 1 A SER 0.810 1 ATOM 16 C C . SER 2464 2464 ? A -2.705 -17.508 8.170 1 1 A SER 0.810 1 ATOM 17 O O . SER 2464 2464 ? A -2.560 -16.339 8.511 1 1 A SER 0.810 1 ATOM 18 C CB . SER 2464 2464 ? A -4.716 -18.954 8.736 1 1 A SER 0.810 1 ATOM 19 O OG . SER 2464 2464 ? A -4.044 -20.218 8.742 1 1 A SER 0.810 1 ATOM 20 N N . GLU 2465 2465 ? A -1.669 -18.386 8.148 1 1 A GLU 0.780 1 ATOM 21 C CA . GLU 2465 2465 ? A -0.272 -18.110 8.453 1 1 A GLU 0.780 1 ATOM 22 C C . GLU 2465 2465 ? A 0.565 -17.609 7.290 1 1 A GLU 0.780 1 ATOM 23 O O . GLU 2465 2465 ? A 1.444 -16.769 7.493 1 1 A GLU 0.780 1 ATOM 24 C CB . GLU 2465 2465 ? A 0.421 -19.362 9.022 1 1 A GLU 0.780 1 ATOM 25 C CG . GLU 2465 2465 ? A 0.398 -20.572 8.066 1 1 A GLU 0.780 1 ATOM 26 C CD . GLU 2465 2465 ? A 1.142 -21.761 8.657 1 1 A GLU 0.780 1 ATOM 27 O OE1 . GLU 2465 2465 ? A 2.397 -21.716 8.667 1 1 A GLU 0.780 1 ATOM 28 O OE2 . GLU 2465 2465 ? A 0.445 -22.725 9.060 1 1 A GLU 0.780 1 ATOM 29 N N . LEU 2466 2466 ? A 0.277 -18.025 6.028 1 1 A LEU 0.810 1 ATOM 30 C CA . LEU 2466 2466 ? A 0.904 -17.488 4.819 1 1 A LEU 0.810 1 ATOM 31 C C . LEU 2466 2466 ? A 0.669 -16.000 4.776 1 1 A LEU 0.810 1 ATOM 32 O O . LEU 2466 2466 ? A 1.569 -15.202 4.609 1 1 A LEU 0.810 1 ATOM 33 C CB . LEU 2466 2466 ? A 0.246 -18.096 3.549 1 1 A LEU 0.810 1 ATOM 34 C CG . LEU 2466 2466 ? A 0.918 -17.962 2.158 1 1 A LEU 0.810 1 ATOM 35 C CD1 . LEU 2466 2466 ? A 0.161 -18.895 1.197 1 1 A LEU 0.810 1 ATOM 36 C CD2 . LEU 2466 2466 ? A 0.907 -16.549 1.552 1 1 A LEU 0.810 1 ATOM 37 N N . ALA 2467 2467 ? A -0.591 -15.612 5.061 1 1 A ALA 0.860 1 ATOM 38 C CA . ALA 2467 2467 ? A -0.989 -14.245 5.159 1 1 A ALA 0.860 1 ATOM 39 C C . ALA 2467 2467 ? A -0.468 -13.514 6.352 1 1 A ALA 0.860 1 ATOM 40 O O . ALA 2467 2467 ? A -0.318 -12.303 6.278 1 1 A ALA 0.860 1 ATOM 41 C CB . ALA 2467 2467 ? A -2.494 -14.145 5.187 1 1 A ALA 0.860 1 ATOM 42 N N . LYS 2468 2468 ? A -0.127 -14.152 7.487 1 1 A LYS 0.800 1 ATOM 43 C CA . LYS 2468 2468 ? A 0.504 -13.429 8.583 1 1 A LYS 0.800 1 ATOM 44 C C . LYS 2468 2468 ? A 1.777 -12.755 8.128 1 1 A LYS 0.800 1 ATOM 45 O O . LYS 2468 2468 ? A 1.964 -11.575 8.351 1 1 A LYS 0.800 1 ATOM 46 C CB . LYS 2468 2468 ? A 0.852 -14.330 9.788 1 1 A LYS 0.800 1 ATOM 47 C CG . LYS 2468 2468 ? A -0.367 -14.882 10.536 1 1 A LYS 0.800 1 ATOM 48 C CD . LYS 2468 2468 ? A -1.214 -13.807 11.235 1 1 A LYS 0.800 1 ATOM 49 C CE . LYS 2468 2468 ? A -2.476 -14.346 11.915 1 1 A LYS 0.800 1 ATOM 50 N NZ . LYS 2468 2468 ? A -2.086 -15.297 12.970 1 1 A LYS 0.800 1 ATOM 51 N N . LYS 2469 2469 ? A 2.576 -13.532 7.375 1 1 A LYS 0.800 1 ATOM 52 C CA . LYS 2469 2469 ? A 3.752 -13.085 6.689 1 1 A LYS 0.800 1 ATOM 53 C C . LYS 2469 2469 ? A 3.433 -12.243 5.468 1 1 A LYS 0.800 1 ATOM 54 O O . LYS 2469 2469 ? A 4.011 -11.189 5.273 1 1 A LYS 0.800 1 ATOM 55 C CB . LYS 2469 2469 ? A 4.614 -14.320 6.351 1 1 A LYS 0.800 1 ATOM 56 C CG . LYS 2469 2469 ? A 4.842 -15.231 7.578 1 1 A LYS 0.800 1 ATOM 57 C CD . LYS 2469 2469 ? A 5.394 -14.508 8.826 1 1 A LYS 0.800 1 ATOM 58 C CE . LYS 2469 2469 ? A 6.806 -13.952 8.630 1 1 A LYS 0.800 1 ATOM 59 N NZ . LYS 2469 2469 ? A 7.204 -13.103 9.768 1 1 A LYS 0.800 1 ATOM 60 N N . SER 2470 2470 ? A 2.467 -12.658 4.624 1 1 A SER 0.870 1 ATOM 61 C CA . SER 2470 2470 ? A 2.096 -11.916 3.426 1 1 A SER 0.870 1 ATOM 62 C C . SER 2470 2470 ? A 1.604 -10.514 3.717 1 1 A SER 0.870 1 ATOM 63 O O . SER 2470 2470 ? A 2.041 -9.585 3.068 1 1 A SER 0.870 1 ATOM 64 C CB . SER 2470 2470 ? A 1.094 -12.652 2.497 1 1 A SER 0.870 1 ATOM 65 O OG . SER 2470 2470 ? A 1.313 -12.298 1.133 1 1 A SER 0.870 1 ATOM 66 N N . LYS 2471 2471 ? A 0.747 -10.273 4.741 1 1 A LYS 0.840 1 ATOM 67 C CA . LYS 2471 2471 ? A 0.322 -8.921 5.093 1 1 A LYS 0.840 1 ATOM 68 C C . LYS 2471 2471 ? A 1.452 -7.990 5.535 1 1 A LYS 0.840 1 ATOM 69 O O . LYS 2471 2471 ? A 1.500 -6.837 5.115 1 1 A LYS 0.840 1 ATOM 70 C CB . LYS 2471 2471 ? A -0.754 -8.847 6.220 1 1 A LYS 0.840 1 ATOM 71 C CG . LYS 2471 2471 ? 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A -0.469 -4.422 -0.483 1 1 A PHE 0.870 1 ATOM 100 C CE2 . PHE 2474 2474 ? A -1.733 -4.974 1.481 1 1 A PHE 0.870 1 ATOM 101 C CZ . PHE 2474 2474 ? A -1.593 -4.225 0.315 1 1 A PHE 0.870 1 ATOM 102 N N . ARG 2475 2475 ? A 2.429 -4.980 3.171 1 1 A ARG 0.850 1 ATOM 103 C CA . ARG 2475 2475 ? A 2.359 -3.646 3.726 1 1 A ARG 0.850 1 ATOM 104 C C . ARG 2475 2475 ? A 3.727 -2.976 3.778 1 1 A ARG 0.850 1 ATOM 105 O O . ARG 2475 2475 ? A 3.851 -1.750 3.747 1 1 A ARG 0.850 1 ATOM 106 C CB . ARG 2475 2475 ? A 1.640 -3.630 5.112 1 1 A ARG 0.850 1 ATOM 107 C CG . ARG 2475 2475 ? A 2.489 -4.054 6.335 1 1 A ARG 0.850 1 ATOM 108 C CD . ARG 2475 2475 ? A 3.291 -2.919 6.987 1 1 A ARG 0.850 1 ATOM 109 N NE . ARG 2475 2475 ? A 4.075 -3.469 8.143 1 1 A ARG 0.850 1 ATOM 110 C CZ . ARG 2475 2475 ? A 5.246 -2.974 8.561 1 1 A ARG 0.850 1 ATOM 111 N NH1 . ARG 2475 2475 ? A 5.960 -2.176 7.772 1 1 A ARG 0.850 1 ATOM 112 N NH2 . ARG 2475 2475 ? A 5.759 -3.321 9.735 1 1 A ARG 0.850 1 ATOM 113 N N . LYS 2476 2476 ? 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A 6.419 -6.146 -0.625 1 1 A GLU 0.880 1 ATOM 128 C CD . GLU 2477 2477 ? A 7.821 -6.487 -1.094 1 1 A GLU 0.880 1 ATOM 129 O OE1 . GLU 2477 2477 ? A 8.029 -6.527 -2.328 1 1 A GLU 0.880 1 ATOM 130 O OE2 . GLU 2477 2477 ? A 8.694 -6.687 -0.197 1 1 A GLU 0.880 1 ATOM 131 N N . MET 2478 2478 ? A 4.491 -2.339 -0.174 1 1 A MET 0.900 1 ATOM 132 C CA . MET 2478 2478 ? A 3.532 -1.329 -0.493 1 1 A MET 0.900 1 ATOM 133 C C . MET 2478 2478 ? A 3.834 -0.020 0.196 1 1 A MET 0.900 1 ATOM 134 O O . MET 2478 2478 ? A 3.799 1.024 -0.453 1 1 A MET 0.900 1 ATOM 135 C CB . MET 2478 2478 ? A 2.091 -1.843 -0.242 1 1 A MET 0.900 1 ATOM 136 C CG . MET 2478 2478 ? A 0.999 -0.863 -0.661 1 1 A MET 0.900 1 ATOM 137 S SD . MET 2478 2478 ? A 1.404 -0.071 -2.226 1 1 A MET 0.900 1 ATOM 138 C CE . MET 2478 2478 ? A 1.001 -1.267 -3.489 1 1 A MET 0.900 1 ATOM 139 N N . SER 2479 2479 ? A 4.225 0.003 1.488 1 1 A SER 0.940 1 ATOM 140 C CA . SER 2479 2479 ? A 4.719 1.234 2.111 1 1 A SER 0.940 1 ATOM 141 C C . SER 2479 2479 ? A 5.940 1.782 1.369 1 1 A SER 0.940 1 ATOM 142 O O . SER 2479 2479 ? A 6.009 2.972 1.127 1 1 A SER 0.940 1 ATOM 143 C CB . SER 2479 2479 ? A 5.127 1.141 3.624 1 1 A SER 0.940 1 ATOM 144 O OG . SER 2479 2479 ? A 4.092 1.117 4.630 1 1 A SER 0.940 1 ATOM 145 N N . GLN 2480 2480 ? A 6.912 0.952 0.932 1 1 A GLN 0.890 1 ATOM 146 C CA . GLN 2480 2480 ? A 8.031 1.387 0.095 1 1 A GLN 0.890 1 ATOM 147 C C . GLN 2480 2480 ? A 7.631 1.909 -1.286 1 1 A GLN 0.890 1 ATOM 148 O O . GLN 2480 2480 ? A 8.099 2.950 -1.738 1 1 A GLN 0.890 1 ATOM 149 C CB . GLN 2480 2480 ? A 9.056 0.236 -0.060 1 1 A GLN 0.890 1 ATOM 150 C CG . GLN 2480 2480 ? A 9.696 -0.205 1.277 1 1 A GLN 0.890 1 ATOM 151 C CD . GLN 2480 2480 ? A 10.585 0.891 1.860 1 1 A GLN 0.890 1 ATOM 152 O OE1 . GLN 2480 2480 ? A 10.156 1.703 2.668 1 1 A GLN 0.890 1 ATOM 153 N NE2 . GLN 2480 2480 ? A 11.877 0.892 1.447 1 1 A GLN 0.890 1 ATOM 154 N N . PHE 2481 2481 ? A 6.705 1.215 -1.974 1 1 A PHE 0.900 1 ATOM 155 C CA . PHE 2481 2481 ? 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A -3.537 -0.134 -8.943 1 1 A LYS 0.870 1 ATOM 632 C CA . LYS 2539 2539 ? A -4.617 0.381 -8.137 1 1 A LYS 0.870 1 ATOM 633 C C . LYS 2539 2539 ? A -4.170 1.385 -7.089 1 1 A LYS 0.870 1 ATOM 634 O O . LYS 2539 2539 ? A -4.818 2.399 -6.874 1 1 A LYS 0.870 1 ATOM 635 C CB . LYS 2539 2539 ? A -5.231 -0.833 -7.419 1 1 A LYS 0.870 1 ATOM 636 C CG . LYS 2539 2539 ? A -6.366 -0.549 -6.428 1 1 A LYS 0.870 1 ATOM 637 C CD . LYS 2539 2539 ? A -7.124 -1.844 -6.089 1 1 A LYS 0.870 1 ATOM 638 C CE . LYS 2539 2539 ? A -6.310 -2.943 -5.398 1 1 A LYS 0.870 1 ATOM 639 N NZ . LYS 2539 2539 ? A -5.989 -2.541 -4.024 1 1 A LYS 0.870 1 ATOM 640 N N . THR 2540 2540 ? A -3.035 1.109 -6.408 1 1 A THR 0.920 1 ATOM 641 C CA . THR 2540 2540 ? A -2.415 2.002 -5.430 1 1 A THR 0.920 1 ATOM 642 C C . THR 2540 2540 ? A -1.968 3.297 -6.010 1 1 A THR 0.920 1 ATOM 643 O O . THR 2540 2540 ? A -2.470 4.326 -5.592 1 1 A THR 0.920 1 ATOM 644 C CB . THR 2540 2540 ? A -1.188 1.430 -4.736 1 1 A THR 0.920 1 ATOM 645 O OG1 . THR 2540 2540 ? A -1.608 0.419 -3.855 1 1 A THR 0.920 1 ATOM 646 C CG2 . THR 2540 2540 ? A -0.395 2.438 -3.877 1 1 A THR 0.920 1 ATOM 647 N N . LYS 2541 2541 ? A -1.056 3.358 -6.997 1 1 A LYS 0.900 1 ATOM 648 C CA . LYS 2541 2541 ? A -0.516 4.634 -7.452 1 1 A LYS 0.900 1 ATOM 649 C C . LYS 2541 2541 ? A -1.557 5.526 -8.094 1 1 A LYS 0.900 1 ATOM 650 O O . LYS 2541 2541 ? A -1.467 6.743 -7.996 1 1 A LYS 0.900 1 ATOM 651 C CB . LYS 2541 2541 ? A 0.793 4.560 -8.285 1 1 A LYS 0.900 1 ATOM 652 C CG . LYS 2541 2541 ? A 0.933 3.429 -9.302 1 1 A LYS 0.900 1 ATOM 653 C CD . LYS 2541 2541 ? A -0.045 3.406 -10.475 1 1 A LYS 0.900 1 ATOM 654 C CE . LYS 2541 2541 ? A 0.380 4.212 -11.687 1 1 A LYS 0.900 1 ATOM 655 N NZ . LYS 2541 2541 ? A 1.419 3.396 -12.328 1 1 A LYS 0.900 1 ATOM 656 N N . GLU 2542 2542 ? A -2.587 4.945 -8.730 1 1 A GLU 0.870 1 ATOM 657 C CA . GLU 2542 2542 ? A -3.741 5.643 -9.253 1 1 A GLU 0.870 1 ATOM 658 C C . GLU 2542 2542 ? 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'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.847 2 1 3 0.081 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 2462 THR 1 0.500 2 1 A 2463 SER 1 0.510 3 1 A 2464 SER 1 0.810 4 1 A 2465 GLU 1 0.780 5 1 A 2466 LEU 1 0.810 6 1 A 2467 ALA 1 0.860 7 1 A 2468 LYS 1 0.800 8 1 A 2469 LYS 1 0.800 9 1 A 2470 SER 1 0.870 10 1 A 2471 LYS 1 0.840 11 1 A 2472 GLU 1 0.840 12 1 A 2473 VAL 1 0.880 13 1 A 2474 PHE 1 0.870 14 1 A 2475 ARG 1 0.850 15 1 A 2476 LYS 1 0.860 16 1 A 2477 GLU 1 0.880 17 1 A 2478 MET 1 0.900 18 1 A 2479 SER 1 0.940 19 1 A 2480 GLN 1 0.890 20 1 A 2481 PHE 1 0.900 21 1 A 2482 ILE 1 0.930 22 1 A 2483 VAL 1 0.940 23 1 A 2484 GLN 1 0.890 24 1 A 2485 CYS 1 0.940 25 1 A 2486 LEU 1 0.920 26 1 A 2487 ASN 1 0.880 27 1 A 2488 PRO 1 0.880 28 1 A 2489 TYR 1 0.840 29 1 A 2490 ARG 1 0.790 30 1 A 2491 LYS 1 0.800 31 1 A 2492 PRO 1 0.770 32 1 A 2493 ASP 1 0.710 33 1 A 2494 CYS 1 0.780 34 1 A 2495 LYS 1 0.780 35 1 A 2496 VAL 1 0.870 36 1 A 2497 GLY 1 0.900 37 1 A 2498 ARG 1 0.790 38 1 A 2499 ILE 1 0.880 39 1 A 2500 THR 1 0.860 40 1 A 2501 THR 1 0.860 41 1 A 2502 THR 1 0.860 42 1 A 2503 GLU 1 0.820 43 1 A 2504 ASP 1 0.880 44 1 A 2505 PHE 1 0.890 45 1 A 2506 LYS 1 0.870 46 1 A 2507 HIS 1 0.890 47 1 A 2508 LEU 1 0.930 48 1 A 2509 ALA 1 0.970 49 1 A 2510 ARG 1 0.880 50 1 A 2511 LYS 1 0.900 51 1 A 2512 LEU 1 0.950 52 1 A 2513 THR 1 0.940 53 1 A 2514 HIS 1 0.910 54 1 A 2515 GLY 1 0.930 55 1 A 2516 VAL 1 0.940 56 1 A 2517 MET 1 0.890 57 1 A 2518 ASN 1 0.880 58 1 A 2519 LYS 1 0.850 59 1 A 2520 GLU 1 0.840 60 1 A 2521 LEU 1 0.830 61 1 A 2522 LYS 1 0.780 62 1 A 2523 TYR 1 0.720 63 1 A 2524 CYS 1 0.780 64 1 A 2525 LYS 1 0.730 65 1 A 2526 ASN 1 0.780 66 1 A 2527 PRO 1 0.830 67 1 A 2528 GLU 1 0.790 68 1 A 2529 ASP 1 0.790 69 1 A 2530 LEU 1 0.850 70 1 A 2531 GLU 1 0.850 71 1 A 2532 CYS 1 0.900 72 1 A 2533 ASN 1 0.850 73 1 A 2534 GLU 1 0.830 74 1 A 2535 ASN 1 0.850 75 1 A 2536 VAL 1 0.900 76 1 A 2537 LYS 1 0.870 77 1 A 2538 HIS 1 0.880 78 1 A 2539 LYS 1 0.870 79 1 A 2540 THR 1 0.920 80 1 A 2541 LYS 1 0.900 81 1 A 2542 GLU 1 0.870 82 1 A 2543 TYR 1 0.910 83 1 A 2544 ILE 1 0.930 84 1 A 2545 LYS 1 0.890 85 1 A 2546 LYS 1 0.860 86 1 A 2547 TYR 1 0.900 87 1 A 2548 MET 1 0.900 88 1 A 2549 GLN 1 0.870 89 1 A 2550 LYS 1 0.880 90 1 A 2551 PHE 1 0.820 91 1 A 2552 GLY 1 0.890 92 1 A 2553 ALA 1 0.840 93 1 A 2554 VAL 1 0.880 94 1 A 2555 TYR 1 0.830 95 1 A 2556 LYS 1 0.860 96 1 A 2557 PRO 1 0.890 97 1 A 2558 LYS 1 0.800 98 1 A 2559 GLU 1 0.800 99 1 A 2560 ASP 1 0.600 100 1 A 2561 THR 1 0.600 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #