data_SMR-869660c40d57305827d19a74c1fdb59d_6 _entry.id SMR-869660c40d57305827d19a74c1fdb59d_6 _struct.entry_id SMR-869660c40d57305827d19a74c1fdb59d_6 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q9Y520 (isoform 2)/ PRC2C_HUMAN, Protein PRRC2C Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q9Y520 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 339271.268 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP PRC2C_HUMAN Q9Y520 1 ;MMPPYMFQQYPRMTYPPLHGPMRFPPSLSETNKGLRGRGPPPSWASEPERPSILSASELKELDKFDNLDA EADEGWAGAQMEVDYTEQLNFSDDDEQGSNSPKENNSEDQGSKASENNENKKETDEVSNTKSSSQIPAQP SVAKVPYGKGPSFNQERGTSSHLPPPPKLLAQQHPPPDRQAVPGRPGPFPSKQQVADEDEIWKQRRRQQS EISAAVERARKRREEEERRMEEQRKAACAEKLKRLDEKLGILEKQPSPEEIREREREKEREREKELEKEQ EQEREKEREKDRERQQEKEKELEKEQEKQREMEKERKQEKEKELERQKEKEKELQKMKEQEKECELEKER EKLEEKIEPREPNLEPMVEKQESENSCNKEEEPVFTRQDSNRSEKEATPVVHETEPESGSQPRPAVLSGY FKQFQKSLPPRFQRQQEQMKQQQWQQQQQQGVLPQTVPSQPSSSTVPPPPHRPLYQPMQPHPQHLASMGF DPRWLMMQSYMDPRMMSGRPAMDIPPIHPGMIPPKPLMRRDQMEGSPNSSESFEHIARSARDHAISLSEP RMLWGSDPYPHAEPQQATTPKATEEPEDVRSEAALDQEQITAAYSVEHNQLEAHPKADFIRESSEAQVQK FLSRSVEDVRPHHTDANNQSACFEAPDQKTLSAPQEERISAVESQPSRKRSVSHGSNHTQKPDEQRSEPS AGIPKVTSRCIDSKEPIERPEEKPKKEGFIRSSEGPKPEKVYKSKSETRWGPRPSSNRREEVNDRPVRRS GPIKKPVLRDMKEEREQRKEKEGEKAEKVTEKVVVKPEKTEKKDLPPPPPPPQPPAPIQPQSVPPPIQPE AEKFPSTETATLAQKPSQDTEKPLEPVSTVQVEPAVKTVNQQTMAAPVVKEEKQPEKVISKDLVIERPRP DSRPAVKKESTLPPRTYWKEARERDWFPDQGYRGRGRGEYYSRGRSYRGSYGGRGRGGRGHTRDYPQYRD NKPRAEHIPSGPLRQREESETRSESSDFEVVPKRRRQRGSETDTDSEIHESASDKDSLSKGKLPKREERP ENKKPVKPHSSFKPDNHVRIDNRLLEKPYVRDDDKAKPGFLPKGEPTRRGRGGTFRRGGRDPGGRPSRPS TLRRPAYRDNQWNPRQSEVPKPEDGEPPRRHEQFIPIAADKRPPKFERKFDPARERPRRQRPTRPPRQDK PPRFRRLREREAASKSNEVVAVPTNGTVNNVAQEPVNTLGDISGNKTPDLSNQNSSDQANEEWETASESS DFNERRERDEKKNADLNAQTVVKVGENVLPPKREIAKRSFSSQRPVDRQNRRGNNGPPKSGRNFSGPRNE RRSGPPSKSGKRGPFDDQPAGTTGVDLINGSSAHHQEGVPNGTGQKNSKDSTGKKREDPKPGPKKPKEKV DALSQFDLNNYASVVIIDDHPEVTVIEDPQSNLNDDGFTEVVSKKQQKRLQDEERRKKEEQVIQVWNKKN ANEKGRSQTSKLPPRFAKKQATGIQQAQSSASVPPLASAPLPPSTSASVPASTSAPLPATLTPVPASTSA PVPASTLAPVLASTSAPVPASPLAPVSASASVSASVPASTSAAAITSSSAPASAPAPTPILASVSTPASV TILASASIPILASALASTSAPTPAPAASSPAAPVITAPTIPASAPTASVPLAPASASAPAPAPTPVSAPN PAPPAPAQTQAQTHKPVQNPLQTTSQSSKQPPPSIRLPSAQTPNGTDYVASGKSIQTPQSHGTLTAELWD NKVAPPAVLNDISKKLGPISPPQPPSVSAWNKPLTSFGSAPSSEGAKNGQESGLEIGTDTIQFGAPASNG NENEVVPVLSEKSADKIPEPKEQRQKQPRAGPIKAQKLPDLSPVENKEHKPGPIGKERSLKNRKVKDAQQ VEPEGQEKPSPATVRSTDPVTTKETKAVSEMSTEIGTMISVSSAEYGTNAKESVTDYTTPSSSLPNTVAT NNTKMEDTLVNNVPLPNTLPLPKRETIQQSSSLTSVPPTTFSLTFKMESARKAWENSPNVREKGSPVTST APPIATGVSSSASGPSTANYNSFSSASMPQIPVASVTPTASLSGAGTYTTSSLSTKSTTTSDPPNICKVK PQQLQTSSLPSASHFSQLSCMPSLIAQQQQNPQVYVSQSAAAQIPAFYMDTSHLFNTQHARLAPPSLAQQ QGFQPGLSQPTSVQQIPIPIYAPLQGQHQAQLSLGAGPAVSQAQELFSSSLQPYRSQPAFMQSSLSQPSV VLSGTAIHNFPTVQHQELAKAQSGLAFQQTSNTQPIPILYEHQLGQASGLGGSQLIDTHLLQARANLTQA SNLYSGQVQQPGQTNFYNTAQSPSALQQVTVPLPASQLSLPNFGSTGQPLIALPQTLQPPLQHTTPQAQA QSLSRPAQVSQPFRGLIPAGTQHSMIATTGKMSEMELKAFGSGIDIKPGTPPIAGRSTTPTSSPFRATST SPNSQSSKMNSIVYQKQFQSAPATVRMTQPFPTQFAPQILSQPNLVPPLVRAPHTNTFPAPVQRPPMALA SQMPPPLTTGLMSHARLPHVARGPCGSLSGVRGNQAQAALKAEQDMKAKQRAEVLQSTQRFFSEQQQSKQ IGGGKAQKVDSDSSKPPETLTDPPGVCQEKVEEKPPPAPSIATKPVRTGPIKPQAIKTEETKS ; 'Protein PRRC2C' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2653 1 2653 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . PRC2C_HUMAN Q9Y520 Q9Y520-2 1 2653 9606 'Homo sapiens (Human)' 2011-07-27 5B06B2406E7FC347 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no B ;MMPPYMFQQYPRMTYPPLHGPMRFPPSLSETNKGLRGRGPPPSWASEPERPSILSASELKELDKFDNLDA EADEGWAGAQMEVDYTEQLNFSDDDEQGSNSPKENNSEDQGSKASENNENKKETDEVSNTKSSSQIPAQP SVAKVPYGKGPSFNQERGTSSHLPPPPKLLAQQHPPPDRQAVPGRPGPFPSKQQVADEDEIWKQRRRQQS EISAAVERARKRREEEERRMEEQRKAACAEKLKRLDEKLGILEKQPSPEEIREREREKEREREKELEKEQ EQEREKEREKDRERQQEKEKELEKEQEKQREMEKERKQEKEKELERQKEKEKELQKMKEQEKECELEKER EKLEEKIEPREPNLEPMVEKQESENSCNKEEEPVFTRQDSNRSEKEATPVVHETEPESGSQPRPAVLSGY FKQFQKSLPPRFQRQQEQMKQQQWQQQQQQGVLPQTVPSQPSSSTVPPPPHRPLYQPMQPHPQHLASMGF DPRWLMMQSYMDPRMMSGRPAMDIPPIHPGMIPPKPLMRRDQMEGSPNSSESFEHIARSARDHAISLSEP RMLWGSDPYPHAEPQQATTPKATEEPEDVRSEAALDQEQITAAYSVEHNQLEAHPKADFIRESSEAQVQK 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A 1 2634 LYS 2634 ? ? ? B . A 1 2635 PRO 2635 ? ? ? B . A 1 2636 VAL 2636 ? ? ? B . A 1 2637 ARG 2637 ? ? ? B . A 1 2638 THR 2638 ? ? ? B . A 1 2639 GLY 2639 ? ? ? B . A 1 2640 PRO 2640 ? ? ? B . A 1 2641 ILE 2641 ? ? ? B . A 1 2642 LYS 2642 ? ? ? B . A 1 2643 PRO 2643 ? ? ? B . A 1 2644 GLN 2644 ? ? ? B . A 1 2645 ALA 2645 ? ? ? B . A 1 2646 ILE 2646 ? ? ? B . A 1 2647 LYS 2647 ? ? ? B . A 1 2648 THR 2648 ? ? ? B . A 1 2649 GLU 2649 ? ? ? B . A 1 2650 GLU 2650 ? ? ? B . A 1 2651 THR 2651 ? ? ? B . A 1 2652 LYS 2652 ? ? ? B . A 1 2653 SER 2653 ? ? ? B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Ribosomal RNA-processing protein 17 {PDB ID=7naf, label_asym_id=B, auth_asym_id=5, SMTL ID=7naf.1.B}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 7naf, label_asym_id=B' 'target-template alignment' . 4 'model 6' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-04 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-29 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A B 2 1 5 # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;NRQILTRGKQSKKFGTDEVTFDKDSRLDYLTGFHKRKLQRQKKAQEFIKEQERLRKIEERQKIRQERKEV MEEQLKTFKESLNLKFRYLTKNERRINQRKANDNK ; ;NRQILTRGKQSKKFGTDEVTFDKDSRLDYLTGFHKRKLQRQKKAQEFIKEQERLRKIEERQKIRQERKEV MEEQLKTFKESLNLKFRYLTKNERRINQRKANDNK ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 49 92 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 7naf 2024-06-05 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2653 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2653 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 70.000 27.273 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MMPPYMFQQYPRMTYPPLHGPMRFPPSLSETNKGLRGRGPPPSWASEPERPSILSASELKELDKFDNLDAEADEGWAGAQMEVDYTEQLNFSDDDEQGSNSPKENNSEDQGSKASENNENKKETDEVSNTKSSSQIPAQPSVAKVPYGKGPSFNQERGTSSHLPPPPKLLAQQHPPPDRQAVPGRPGPFPSKQQVADEDEIWKQRRRQQSEISAAVERARKRREEEERRMEEQRKAACAEKLKRLDEKLGILEKQPSPEEIREREREKEREREKELEKEQEQEREKEREKDRERQQEKEKELEKEQEKQREMEKERKQEKEKELERQKEKEKELQKMKEQEKECELEKEREKLEEKIEPREPNLEPMVEKQESENSCNKEEEPVFTRQDSNRSEKEATPVVHETEPESGSQPRPAVLSGYFKQFQKSLPPRFQRQQEQMKQQQWQQQQQQGVLPQTVPSQPSSSTVPPPPHRPLYQPMQPHPQHLASMGFDPRWLMMQSYMDPRMMSGRPAMDIPPIHPGMIPPKPLMRRDQMEGSPNSSESFEHIARSARDHAISLSEPRMLWGSDPYPHAEPQQATTPKATEEPEDVRSEAALDQEQITAAYSVEHNQLEAHPKADFIRESSEAQVQKFLSRSVEDVRPHHTDANNQSACFEAPDQKTLSAPQEERISAVESQPSRKRSVSHGSNHTQKPDEQRSEPSAGIPKVTSRCIDSKEPIERPEEKPKKEGFIRSSEGPKPEKVYKSKSETRWGPRPSSNRREEVNDRPVRRSGPIKKPVLRDMKEEREQRKEKEGEKAEKVTEKVVVKPEKTEKKDLPPPPPPPQPPAPIQPQSVPPPIQPEAEKFPSTETATLAQKPSQDTEKPLEPVSTVQVEPAVKTVNQQTMAAPVVKEEKQPEKVISKDLVIERPRPDSRPAVKKESTLPPRTYWKEARERDWFPDQGYRGRGRGEYYSRGRSYRGSYGGRGRGGRGHTRDYPQYRDNKPRAEHIPSGPLRQREESETRSESSDFEVVPKRRRQRGSETDTDSEIHESASDKDSLSKGKLPKREERPENKKPVKPHSSFKPDNHVRIDNRLLEKPYVRDDDKAKPGFLPKGEPTRRGRGGTFRRGGRDPGGRPSRPSTLRRPAYRDNQWNPRQSEVPKPEDGEPPRRHEQFIPIAADKRPPKFERKFDPARERPRRQRPTRPPRQDKPPRFRRLREREAASKSNEVVAVPTNGTVNNVAQEPVNTLGDISGNKTPDLSNQNSSDQANEEWETASESSDFNERRERDEKKNADLNAQTVVKVGENVLPPKREIAKRSFSSQRPVDRQNRRGNNGPPKSGRNFSGPRNERRSGPPSKSGKRGPFDDQPAGTTGVDLINGSSAHHQEGVPNGTGQKNSKDSTGKKREDPKPGPKKPKEKVDALSQFDLNNYASVVIIDDHPEVTVIEDPQSNLNDDGFTEVVSKKQQKRLQDEERRKKEEQVIQVWNKKNANEKGRSQTSKLPPRFAKKQATGIQQAQSSASVPPLASAPLPPSTSASVPASTSAPLPATLTPVPASTSAPVPASTLAPVLASTSAPVPASPLAPVSASASVSASVPASTSAAAITSSSAPASAPAPTPILASVSTPASVTILASASIPILASALASTSAPTPAPAASSPAAPVITAPTIPASAPTASVPLAPASASAPAPAPTPVSAPNPAPPAPAQTQAQTHKPVQNPLQTTSQSSKQPPPSIRLPSAQTPNGTDYVASGKSIQTPQSHGTLTAELWDNKVAPPAVLNDISKKLGPISPPQPPSVSAWNKPLTSFGSAPSSEGAKNGQESGLEIGTDTIQFGAPASNGNENEVVPVLSEKSADKIPEPKEQRQKQPRAGPIKAQKLPDLSPVENKEHKPGPIGKERSLKNRKVKDAQQVEPEGQEKPSPATVRSTDPVTTKETKAVSEMSTEIGTMISVSSAEYGTNAKESVTDYTTPSSSLPNTVATNNTKMEDTLVNNVPLPNTLPLPKRETIQQSSSLTSVPPTTFSLTFKMESARKAWENSPNVREKGSPVTSTAPPIATGVSSSASGPSTANYNSFSSASMPQIPVASVTPTASLSGAGTYTTSSLSTKSTTTSDPPNICKVKPQQLQTSSLPSASHFSQLSCMPSLIAQQQQNPQVYVSQSAAAQIPAFYMDTSHLFNTQHARLAPPSLAQQQGFQPGLSQPTSVQQIPIPIYAPLQGQHQAQLSLGAGPAVSQAQELFSSSLQPYRSQPAFMQSSLSQPSVVLSGTAIHNFPTVQHQELAKAQSGLAFQQTSNTQPIPILYEHQLGQASGLGGSQLIDTHLLQARANLTQASNLYSGQVQQPGQTNFYNTAQSPSALQQVTVPLPASQLSLPNFGSTGQPLIALPQTLQPPLQHTTPQAQAQSLSRPAQVSQPFRGLIPAGTQHSMIATTGKMSEMELKAFGSGIDIKPGTPPIAGRSTTPTSSPFRATSTSPNSQSSKMNSIVYQKQFQSAPATVRMTQPFPTQFAPQILSQPNLVPPLVRAPHTNTFPAPVQRPPMALASQMPPPLTTGLMSHARLPHVARGPCGSLSGVRGNQAQAALKAEQDMKAKQRAEVLQSTQRFFSEQQQSKQIGGGKAQKVDSDSSKPPETLTDPPGVCQEKVEEKPPPAPSIATKPVRTGPIKPQAIKTEETKS 2 1 2 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------KEQERLRKIEERQKIRQERKEVMEEQLKTFKESLNLKFRYLTKN------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 7naf.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 6' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . VAL 216 216 ? A 153.141 242.315 198.528 1 1 B VAL 0.460 1 ATOM 2 C CA . VAL 216 216 ? A 154.631 242.173 198.492 1 1 B VAL 0.460 1 ATOM 3 C C . VAL 216 216 ? A 155.265 242.151 199.871 1 1 B VAL 0.460 1 ATOM 4 O O . VAL 216 216 ? A 155.741 241.104 200.269 1 1 B VAL 0.460 1 ATOM 5 C CB . VAL 216 216 ? A 155.205 243.183 197.512 1 1 B VAL 0.460 1 ATOM 6 C CG1 . VAL 216 216 ? A 156.737 243.038 197.452 1 1 B VAL 0.460 1 ATOM 7 C CG2 . VAL 216 216 ? A 154.618 242.903 196.107 1 1 B VAL 0.460 1 ATOM 8 N N . GLU 217 217 ? A 155.206 243.241 200.679 1 1 B GLU 0.570 1 ATOM 9 C CA . GLU 217 217 ? A 155.837 243.265 201.999 1 1 B GLU 0.570 1 ATOM 10 C C . GLU 217 217 ? A 155.491 242.147 202.970 1 1 B GLU 0.570 1 ATOM 11 O O . GLU 217 217 ? A 156.366 241.581 203.615 1 1 B GLU 0.570 1 ATOM 12 C CB . GLU 217 217 ? A 155.547 244.611 202.711 1 1 B GLU 0.570 1 ATOM 13 C CG . GLU 217 217 ? A 156.389 245.777 202.146 1 1 B GLU 0.570 1 ATOM 14 C CD . GLU 217 217 ? A 157.873 245.400 202.062 1 1 B GLU 0.570 1 ATOM 15 O OE1 . GLU 217 217 ? A 158.515 245.116 203.114 1 1 B GLU 0.570 1 ATOM 16 O OE2 . GLU 217 217 ? A 158.346 245.265 200.908 1 1 B GLU 0.570 1 ATOM 17 N N . ARG 218 218 ? A 154.215 241.736 203.080 1 1 B ARG 0.600 1 ATOM 18 C CA . ARG 218 218 ? A 153.851 240.571 203.874 1 1 B ARG 0.600 1 ATOM 19 C C . ARG 218 218 ? A 154.501 239.269 203.403 1 1 B ARG 0.600 1 ATOM 20 O O . ARG 218 218 ? A 154.931 238.445 204.207 1 1 B ARG 0.600 1 ATOM 21 C CB . ARG 218 218 ? A 152.316 240.383 203.881 1 1 B ARG 0.600 1 ATOM 22 C CG . ARG 218 218 ? A 151.542 241.523 204.576 1 1 B ARG 0.600 1 ATOM 23 C CD . ARG 218 218 ? A 150.026 241.291 204.526 1 1 B ARG 0.600 1 ATOM 24 N NE . ARG 218 218 ? A 149.346 242.422 205.234 1 1 B ARG 0.600 1 ATOM 25 C CZ . ARG 218 218 ? A 148.016 242.594 205.242 1 1 B ARG 0.600 1 ATOM 26 N NH1 . ARG 218 218 ? A 147.200 241.780 204.580 1 1 B ARG 0.600 1 ATOM 27 N NH2 . ARG 218 218 ? A 147.495 243.610 205.925 1 1 B ARG 0.600 1 ATOM 28 N N . ALA 219 219 ? A 154.611 239.064 202.075 1 1 B ALA 0.670 1 ATOM 29 C CA . ALA 219 219 ? A 155.304 237.932 201.507 1 1 B ALA 0.670 1 ATOM 30 C C . ALA 219 219 ? A 156.805 237.974 201.764 1 1 B ALA 0.670 1 ATOM 31 O O . ALA 219 219 ? A 157.417 236.951 202.061 1 1 B ALA 0.670 1 ATOM 32 C CB . ALA 219 219 ? A 154.988 237.797 200.009 1 1 B ALA 0.670 1 ATOM 33 N N . ARG 220 220 ? A 157.428 239.169 201.697 1 1 B ARG 0.640 1 ATOM 34 C CA . ARG 220 220 ? A 158.822 239.354 202.058 1 1 B ARG 0.640 1 ATOM 35 C C . ARG 220 220 ? A 159.100 239.034 203.521 1 1 B ARG 0.640 1 ATOM 36 O O . ARG 220 220 ? A 160.030 238.299 203.836 1 1 B ARG 0.640 1 ATOM 37 C CB . ARG 220 220 ? A 159.275 240.805 201.754 1 1 B ARG 0.640 1 ATOM 38 C CG . ARG 220 220 ? A 160.791 241.047 201.891 1 1 B ARG 0.640 1 ATOM 39 C CD . ARG 220 220 ? A 161.202 242.522 201.756 1 1 B ARG 0.640 1 ATOM 40 N NE . ARG 220 220 ? A 160.727 243.273 202.957 1 1 B ARG 0.640 1 ATOM 41 C CZ . ARG 220 220 ? A 161.377 243.265 204.126 1 1 B ARG 0.640 1 ATOM 42 N NH1 . ARG 220 220 ? A 162.507 242.594 204.328 1 1 B ARG 0.640 1 ATOM 43 N NH2 . ARG 220 220 ? A 160.908 244.017 205.114 1 1 B ARG 0.640 1 ATOM 44 N N . LYS 221 221 ? A 158.248 239.525 204.444 1 1 B LYS 0.680 1 ATOM 45 C CA . LYS 221 221 ? A 158.378 239.261 205.866 1 1 B LYS 0.680 1 ATOM 46 C C . LYS 221 221 ? A 158.215 237.797 206.242 1 1 B LYS 0.680 1 ATOM 47 O O . LYS 221 221 ? A 159.004 237.255 207.011 1 1 B LYS 0.680 1 ATOM 48 C CB . LYS 221 221 ? A 157.345 240.093 206.664 1 1 B LYS 0.680 1 ATOM 49 C CG . LYS 221 221 ? A 157.640 241.601 206.656 1 1 B LYS 0.680 1 ATOM 50 C CD . LYS 221 221 ? A 156.534 242.409 207.355 1 1 B LYS 0.680 1 ATOM 51 C CE . LYS 221 221 ? A 156.801 243.916 207.309 1 1 B LYS 0.680 1 ATOM 52 N NZ . LYS 221 221 ? A 155.737 244.654 208.028 1 1 B LYS 0.680 1 ATOM 53 N N . ARG 222 222 ? A 157.206 237.088 205.688 1 1 B ARG 0.680 1 ATOM 54 C CA . ARG 222 222 ? A 157.056 235.665 205.949 1 1 B ARG 0.680 1 ATOM 55 C C . ARG 222 222 ? A 158.197 234.836 205.393 1 1 B ARG 0.680 1 ATOM 56 O O . ARG 222 222 ? A 158.587 233.841 205.998 1 1 B ARG 0.680 1 ATOM 57 C CB . ARG 222 222 ? A 155.685 235.097 205.510 1 1 B ARG 0.680 1 ATOM 58 C CG . ARG 222 222 ? A 155.463 235.017 203.990 1 1 B ARG 0.680 1 ATOM 59 C CD . ARG 222 222 ? A 154.058 234.533 203.631 1 1 B ARG 0.680 1 ATOM 60 N NE . ARG 222 222 ? A 153.952 234.512 202.139 1 1 B ARG 0.680 1 ATOM 61 C CZ . ARG 222 222 ? A 152.832 234.188 201.479 1 1 B ARG 0.680 1 ATOM 62 N NH1 . ARG 222 222 ? A 151.716 233.848 202.117 1 1 B ARG 0.680 1 ATOM 63 N NH2 . ARG 222 222 ? A 152.827 234.226 200.150 1 1 B ARG 0.680 1 ATOM 64 N N . ARG 223 223 ? A 158.780 235.256 204.249 1 1 B ARG 0.690 1 ATOM 65 C CA . ARG 223 223 ? A 159.971 234.633 203.717 1 1 B ARG 0.690 1 ATOM 66 C C . ARG 223 223 ? A 161.177 234.759 204.649 1 1 B ARG 0.690 1 ATOM 67 O O . ARG 223 223 ? A 161.836 233.777 204.969 1 1 B ARG 0.690 1 ATOM 68 C CB . ARG 223 223 ? A 160.294 235.202 202.323 1 1 B ARG 0.690 1 ATOM 69 C CG . ARG 223 223 ? A 161.501 234.507 201.672 1 1 B ARG 0.690 1 ATOM 70 C CD . ARG 223 223 ? A 161.941 235.067 200.313 1 1 B ARG 0.690 1 ATOM 71 N NE . ARG 223 223 ? A 162.108 236.562 200.386 1 1 B ARG 0.690 1 ATOM 72 C CZ . ARG 223 223 ? A 163.123 237.176 201.016 1 1 B ARG 0.690 1 ATOM 73 N NH1 . ARG 223 223 ? A 164.168 236.529 201.499 1 1 B ARG 0.690 1 ATOM 74 N NH2 . ARG 223 223 ? A 163.100 238.504 201.138 1 1 B ARG 0.690 1 ATOM 75 N N . GLU 224 224 ? A 161.455 235.956 205.199 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 76 C CA . GLU 224 224 ? A 162.527 236.134 206.169 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 77 C C . GLU 224 224 ? A 162.282 235.361 207.463 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 78 O O . GLU 224 224 ? A 163.188 234.766 208.047 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 79 C CB . GLU 224 224 ? A 162.815 237.642 206.365 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 80 C CG . GLU 224 224 ? A 163.403 238.220 205.047 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 81 C CD . GLU 224 224 ? A 163.410 239.730 204.898 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 82 O OE1 . GLU 224 224 ? A 163.192 240.492 205.875 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 83 O OE2 . GLU 224 224 ? A 163.572 240.176 203.721 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 84 N N . GLU 225 225 ? A 161.017 235.269 207.912 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 85 C CA . GLU 225 225 ? A 160.629 234.383 208.992 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 86 C C . GLU 225 225 ? A 160.868 232.894 208.732 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 87 O O . GLU 225 225 ? A 161.376 232.180 209.596 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 88 C CB . GLU 225 225 ? A 159.138 234.611 209.346 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 89 C CG . GLU 225 225 ? A 158.910 235.822 210.283 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 90 C CD . GLU 225 225 ? A 159.519 235.563 211.655 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 91 O OE1 . GLU 225 225 ? A 159.600 234.368 212.052 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 92 O OE2 . GLU 225 225 ? A 159.942 236.522 212.339 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 93 N N . GLU 226 226 ? A 160.535 232.348 207.544 1 1 B GLU 0.680 1 ATOM 94 C CA . GLU 226 226 ? A 160.864 230.963 207.232 1 1 B GLU 0.680 1 ATOM 95 C C . GLU 226 226 ? A 162.346 230.701 207.072 1 1 B GLU 0.680 1 ATOM 96 O O . GLU 226 226 ? A 162.843 229.688 207.562 1 1 B GLU 0.680 1 ATOM 97 C CB . GLU 226 226 ? A 160.034 230.373 206.076 1 1 B GLU 0.680 1 ATOM 98 C CG . GLU 226 226 ? A 160.311 230.942 204.674 1 1 B GLU 0.680 1 ATOM 99 C CD . GLU 226 226 ? A 159.232 230.537 203.674 1 1 B GLU 0.680 1 ATOM 100 O OE1 . GLU 226 226 ? A 158.324 229.757 204.069 1 1 B GLU 0.680 1 ATOM 101 O OE2 . GLU 226 226 ? A 159.283 231.049 202.527 1 1 B GLU 0.680 1 ATOM 102 N N . GLU 227 227 ? A 163.102 231.642 206.470 1 1 B GLU 0.700 1 ATOM 103 C CA . GLU 227 227 ? A 164.552 231.596 206.405 1 1 B GLU 0.700 1 ATOM 104 C C . GLU 227 227 ? A 165.197 231.548 207.788 1 1 B GLU 0.700 1 ATOM 105 O O . GLU 227 227 ? A 166.044 230.699 208.053 1 1 B GLU 0.700 1 ATOM 106 C CB . GLU 227 227 ? A 165.082 232.808 205.601 1 1 B GLU 0.700 1 ATOM 107 C CG . GLU 227 227 ? A 164.736 232.713 204.089 1 1 B GLU 0.700 1 ATOM 108 C CD . GLU 227 227 ? A 164.866 234.021 203.311 1 1 B GLU 0.700 1 ATOM 109 O OE1 . GLU 227 227 ? A 165.103 235.104 203.902 1 1 B GLU 0.700 1 ATOM 110 O OE2 . GLU 227 227 ? A 164.678 233.978 202.061 1 1 B GLU 0.700 1 ATOM 111 N N . ARG 228 228 ? A 164.728 232.385 208.740 1 1 B ARG 0.690 1 ATOM 112 C CA . ARG 228 228 ? A 165.149 232.329 210.132 1 1 B ARG 0.690 1 ATOM 113 C C . ARG 228 228 ? A 164.835 231.007 210.822 1 1 B ARG 0.690 1 ATOM 114 O O . ARG 228 228 ? A 165.687 230.436 211.501 1 1 B ARG 0.690 1 ATOM 115 C CB . ARG 228 228 ? A 164.492 233.479 210.931 1 1 B ARG 0.690 1 ATOM 116 C CG . ARG 228 228 ? A 164.967 233.581 212.395 1 1 B ARG 0.690 1 ATOM 117 C CD . ARG 228 228 ? A 164.322 234.718 213.201 1 1 B ARG 0.690 1 ATOM 118 N NE . ARG 228 228 ? A 162.838 234.497 213.283 1 1 B ARG 0.690 1 ATOM 119 C CZ . ARG 228 228 ? A 162.240 233.757 214.221 1 1 B ARG 0.690 1 ATOM 120 N NH1 . ARG 228 228 ? A 162.901 233.110 215.175 1 1 B ARG 0.690 1 ATOM 121 N NH2 . ARG 228 228 ? A 160.913 233.676 214.211 1 1 B ARG 0.690 1 ATOM 122 N N . ARG 229 229 ? A 163.623 230.437 210.628 1 1 B ARG 0.680 1 ATOM 123 C CA . ARG 229 229 ? A 163.293 229.130 211.181 1 1 B ARG 0.680 1 ATOM 124 C C . ARG 229 229 ? A 164.211 228.021 210.673 1 1 B ARG 0.680 1 ATOM 125 O O . ARG 229 229 ? A 164.674 227.184 211.444 1 1 B ARG 0.680 1 ATOM 126 C CB . ARG 229 229 ? A 161.829 228.721 210.870 1 1 B ARG 0.680 1 ATOM 127 C CG . ARG 229 229 ? A 160.767 229.536 211.636 1 1 B ARG 0.680 1 ATOM 128 C CD . ARG 229 229 ? A 159.340 228.981 211.505 1 1 B ARG 0.680 1 ATOM 129 N NE . ARG 229 229 ? A 158.904 229.044 210.069 1 1 B ARG 0.680 1 ATOM 130 C CZ . ARG 229 229 ? A 158.185 230.048 209.549 1 1 B ARG 0.680 1 ATOM 131 N NH1 . ARG 229 229 ? 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'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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