data_SMR-1c1aa9601f73920146365469b76d8035_3 _entry.id SMR-1c1aa9601f73920146365469b76d8035_3 _struct.entry_id SMR-1c1aa9601f73920146365469b76d8035_3 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q9UMN6/ KMT2B_HUMAN, Histone-lysine N-methyltransferase 2B Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q9UMN6' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' ZN non-polymer 'ZINC ION' Zn 65.380 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 342820.630 1 . 2 non-polymer man 'ZINC ION' 65.380 2 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP KMT2B_HUMAN Q9UMN6 1 ;MAAAAGGGSCPGPGSARGRFPGRPRGAGGGGGRGGRGNGAERVRVALRRGGGATGPGGAEPGEDTALLRL LGLRRGLRRLRRLWAGPRVQRGRGRGRGRGWGPSRGCVPEEESSDGESDEEEFQGFHSDEDVAPSSLRSA LRSQRGRAPRGRGRKHKTTPLPPPRLADVAPTPPKTPARKRGEEGTERMVQALTELLRRAQAPQAPRSRA CEPSTPRRSRGRPPGRPAGPCRRKQQAVVVAEAAVTIPKPEPPPPVVPVKHQTGSWKCKEGPGPGPGTPR RGGQSSRGGRGGRGRGRGGGLPFVIKFVSRAKKVKMGQLSLGLESGQGQGQHEESWQDVPQRRVGSGQGG SPCWKKQEQKLDDEEEEKKEEEEKDKEGEEKEERAVAEEMMPAAEKEEAKLPPPPLTPPAPSPPPPLPPP STSPPPPLCPPPPPPVSPPPLPSPPPPPAQEEQEESPPPVVPATCSRKRGRPPLTPSQRAEREAARAGPE GTSPPTPTPSTATGGPPEDSPTVAPKSTTFLKNIRQFIMPVVSARSSRVIKTPRRFMDEDPPKPPKVEVS PVLRPPITTSPPVPQEPAPVPSPPRAPTPPSTPVPLPEKRRSILREPTFRWTSLTRELPPPPPAPPPPPA PSPPPAPATSSRRPLLLRAPQFTPSEAHLKIYESVLTPPPLGAPEAPEPEPPPADDSPAEPEPRAVGRTN HLSLPRFAPVVTTPVKAEVSPHGAPALSNGPQTQAQLLQPLQALQTQLLPQALPPPQPQLQPPPSPQQMP PLEKARIAGVGSLPLSGVEEKMFSLLKRAKVQLFKIDQQQQQKVAASMPLSPGGQMEEVAGAVKQISDRG PVRSEDESVEAKRERPSGPESPVQGPRIKHVCRHAAVALGQARAMVPEDVPRLSALPLRDRQDLATEDTS SASETESVPSRSRRGKVEAAGPGGESEPTGSGGTLAHTPRRSLPSHHGKKMRMARCGHCRGCLRVQDCGS CVNCLDKPKFGGPNTKKQCCVYRKCDKIEARKMERLAKKGRTIVKTLLPWDSDESPEASPGPPGPRRGAG AGGPREEVVAHPGPEEQDSLLQRKSARRCVKQRPSYDIFEDSDDSEPGGPPAPRRRTPRENELPLPEPEE QSRPRKPTLQPVLQLKARRRLDKDALAPGPFASFPNGWTGKQKSPDGVHRVRVDFKEDCDLENVWLMGGL SVLTSVPGGPPMVCLLCASKGLHELVFCQVCCDPFHPFCLEEAERPLPQHHDTWCCRRCKFCHVCGRKGR GSKHLLECERCRHAYHPACLGPSYPTRATRKRRHWICSACVRCKSCGATPGKNWDVEWSGDYSLCPRCTQ LYEKGNYCPICTRCYEDNDYESKMMQCAQCDHWVHAKCEGLSDEDYEILSGLPDSVLYTCGPCAGAAQPR WREALSGALQGGLRQVLQGLLSSKVVGPLLLCTQCGPDGKQLHPGPCGLQAVSQRFEDGHYKSVHSFMED MVGILMRHSEEGETPDRRAGGQMKGLLLKLLESAFGWFDAHDPKYWRRSTRLPNGVLPNAVLPPSLDHVY AQWRQQEPETPESGQPPGDPSAAFQGKDPAAFSHLEDPRQCALCLKYGDADSKEAGRLLYIGQNEWTHVN CAIWSAEVFEENDGSLKNVHAAVARGRQMRCELCLKPGATVGCCLSSCLSNFHFMCARASYCIFQDDKKV FCQKHTDLLDGKEIVNPDGFDVLRRVYVDFEGINFKRKFLTGLEPDAINVLIGSIRIDSLGTLSDLSDCE GRLFPIGYQCSRLYWSTVDARRRCWYRCRILEYRPWGPREEPAHLEAAEENQTIVHSPAPSSEPPGGEDP PLDTDVLVPGAPERHSPIQNLDPPLRPDSGSAPPPAPRSFSGARIKVPNYSPSRRPLGGVSFGPLPSPGS PSSLTHHIPTVGDPDFPAPPRRSRRPSPLAPRPPPSRWASPPLKTSPQLRVPPPTSVVTALTPTSGELAP PGPAPSPPPPEDLGPDFEDMEVVSGLSAADLDFAASLLGTEPFQEEIVAAGAMGSSHGGPGDSSEEESSP TSRYIHFPVTVVSAPGLAPSATPGAPRIEQLDGVDDGTDSEAEAVQQPRGQGTPPSGPGVVRAGVLGAAG DRARPPEDLPSEIVDFVLKNLGGPGDGGAGPREESLPPAPPLANGSQPSQGLTASPADPTRTFAWLPGAP GVRVLSLGPAPEPPKPATSKIILVNKLGQVFVKMAGEGEPVPPPVKQPPLPPTISPTAPTSWTLPPGPLL GVLPVVGVVRPAPPPPPPPLTLVLSSGPASPPRQAIRVKRVSTFSGRSPPAPPPYKAPRLDEDGEASEDT PQVPGLGSGGFSRVRMKTPTVRGVLDLDRPGEPAGEESPGPLQERSPLLPLPEDGPPQVPDGPPDLLLES QWHHYSGEASSSEEEPPSPDDKENQAPKRTGPHLRFEISSEDGFSVEAESLEGAWRTLIEKVQEARGHAR LRHLSFSGMSGARLLGIHHDAVIFLAEQLPGAQRCQHYKFRYHQQGEGQEEPPLNPHGAARAEVYLRKCT FDMFNFLASQHRVLPEGATCDEEEDEVQLRSTRRATSLELPMAMRFRHLKKTSKEAVGVYRSAIHGRGLF CKRNIDAGEMVIEYSGIVIRSVLTDKREKFYDGKGIGCYMFRMDDFDVVDATMHGNAARFINHSCEPNCF SRVIHVEGQKHIVIFALRRILRGEELTYDYKFPIEDASNKLPCNCGAKRCRRFLN ; 'Histone-lysine N-methyltransferase 2B' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2715 1 2715 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . KMT2B_HUMAN Q9UMN6 . 1 2715 9606 'Homo sapiens (Human)' 2000-05-01 C0615B981BBEB7BF # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MAAAAGGGSCPGPGSARGRFPGRPRGAGGGGGRGGRGNGAERVRVALRRGGGATGPGGAEPGEDTALLRL LGLRRGLRRLRRLWAGPRVQRGRGRGRGRGWGPSRGCVPEEESSDGESDEEEFQGFHSDEDVAPSSLRSA LRSQRGRAPRGRGRKHKTTPLPPPRLADVAPTPPKTPARKRGEEGTERMVQALTELLRRAQAPQAPRSRA CEPSTPRRSRGRPPGRPAGPCRRKQQAVVVAEAAVTIPKPEPPPPVVPVKHQTGSWKCKEGPGPGPGTPR RGGQSSRGGRGGRGRGRGGGLPFVIKFVSRAKKVKMGQLSLGLESGQGQGQHEESWQDVPQRRVGSGQGG SPCWKKQEQKLDDEEEEKKEEEEKDKEGEEKEERAVAEEMMPAAEKEEAKLPPPPLTPPAPSPPPPLPPP STSPPPPLCPPPPPPVSPPPLPSPPPPPAQEEQEESPPPVVPATCSRKRGRPPLTPSQRAEREAARAGPE GTSPPTPTPSTATGGPPEDSPTVAPKSTTFLKNIRQFIMPVVSARSSRVIKTPRRFMDEDPPKPPKVEVS PVLRPPITTSPPVPQEPAPVPSPPRAPTPPSTPVPLPEKRRSILREPTFRWTSLTRELPPPPPAPPPPPA 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A 1 2551 SER 2551 ? ? ? A . A 1 2552 THR 2552 ? ? ? A . A 1 2553 ARG 2553 ? ? ? A . A 1 2554 ARG 2554 ? ? ? A . A 1 2555 ALA 2555 ? ? ? A . A 1 2556 THR 2556 ? ? ? A . A 1 2557 SER 2557 ? ? ? A . A 1 2558 LEU 2558 ? ? ? A . A 1 2559 GLU 2559 ? ? ? A . A 1 2560 LEU 2560 ? ? ? A . A 1 2561 PRO 2561 ? ? ? A . A 1 2562 MET 2562 ? ? ? A . A 1 2563 ALA 2563 ? ? ? A . A 1 2564 MET 2564 ? ? ? A . A 1 2565 ARG 2565 ? ? ? A . A 1 2566 PHE 2566 ? ? ? A . A 1 2567 ARG 2567 ? ? ? A . A 1 2568 HIS 2568 ? ? ? A . A 1 2569 LEU 2569 ? ? ? A . A 1 2570 LYS 2570 ? ? ? A . A 1 2571 LYS 2571 ? ? ? A . A 1 2572 THR 2572 ? ? ? A . A 1 2573 SER 2573 ? ? ? A . A 1 2574 LYS 2574 ? ? ? A . A 1 2575 GLU 2575 ? ? ? A . A 1 2576 ALA 2576 ? ? ? A . A 1 2577 VAL 2577 ? ? ? A . A 1 2578 GLY 2578 ? ? ? A . A 1 2579 VAL 2579 ? ? ? A . A 1 2580 TYR 2580 ? ? ? A . A 1 2581 ARG 2581 ? ? ? A . A 1 2582 SER 2582 ? ? ? A . A 1 2583 ALA 2583 ? ? ? A . A 1 2584 ILE 2584 ? ? ? A . A 1 2585 HIS 2585 ? ? ? A . A 1 2586 GLY 2586 ? ? ? A . A 1 2587 ARG 2587 ? ? ? A . A 1 2588 GLY 2588 ? ? ? A . A 1 2589 LEU 2589 ? ? ? A . A 1 2590 PHE 2590 ? ? ? A . A 1 2591 CYS 2591 ? ? ? A . A 1 2592 LYS 2592 ? ? ? A . A 1 2593 ARG 2593 ? ? ? A . A 1 2594 ASN 2594 ? ? ? A . A 1 2595 ILE 2595 ? ? ? A . A 1 2596 ASP 2596 ? ? ? A . A 1 2597 ALA 2597 ? ? ? A . A 1 2598 GLY 2598 ? ? ? A . A 1 2599 GLU 2599 ? ? ? A . A 1 2600 MET 2600 ? ? ? A . A 1 2601 VAL 2601 ? ? ? A . A 1 2602 ILE 2602 ? ? ? A . A 1 2603 GLU 2603 ? ? ? A . A 1 2604 TYR 2604 ? ? ? A . A 1 2605 SER 2605 ? ? ? A . A 1 2606 GLY 2606 ? ? ? A . A 1 2607 ILE 2607 ? ? ? A . A 1 2608 VAL 2608 ? ? ? A . A 1 2609 ILE 2609 ? ? ? A . A 1 2610 ARG 2610 ? ? ? A . A 1 2611 SER 2611 ? ? ? A . A 1 2612 VAL 2612 ? ? ? A . A 1 2613 LEU 2613 ? ? ? A . A 1 2614 THR 2614 ? ? ? A . A 1 2615 ASP 2615 ? ? ? A . A 1 2616 LYS 2616 ? ? ? A . A 1 2617 ARG 2617 ? ? ? A . A 1 2618 GLU 2618 ? ? ? A . A 1 2619 LYS 2619 ? ? ? A . A 1 2620 PHE 2620 ? ? ? A . A 1 2621 TYR 2621 ? ? ? A . A 1 2622 ASP 2622 ? ? ? A . A 1 2623 GLY 2623 ? ? ? A . A 1 2624 LYS 2624 ? ? ? A . A 1 2625 GLY 2625 ? ? ? A . A 1 2626 ILE 2626 ? ? ? A . A 1 2627 GLY 2627 ? ? ? A . A 1 2628 CYS 2628 ? ? ? A . A 1 2629 TYR 2629 ? ? ? A . A 1 2630 MET 2630 ? ? ? A . A 1 2631 PHE 2631 ? ? ? A . A 1 2632 ARG 2632 ? ? ? A . A 1 2633 MET 2633 ? ? ? A . A 1 2634 ASP 2634 ? ? ? A . A 1 2635 ASP 2635 ? ? ? A . A 1 2636 PHE 2636 ? ? ? A . A 1 2637 ASP 2637 ? ? ? A . A 1 2638 VAL 2638 ? ? ? A . A 1 2639 VAL 2639 ? ? ? A . A 1 2640 ASP 2640 ? ? ? A . A 1 2641 ALA 2641 ? ? ? A . A 1 2642 THR 2642 ? ? ? A . A 1 2643 MET 2643 ? ? ? A . A 1 2644 HIS 2644 ? ? ? A . A 1 2645 GLY 2645 ? ? ? A . A 1 2646 ASN 2646 ? ? ? A . A 1 2647 ALA 2647 ? ? ? A . A 1 2648 ALA 2648 ? ? ? A . A 1 2649 ARG 2649 ? ? ? A . A 1 2650 PHE 2650 ? ? ? A . A 1 2651 ILE 2651 ? ? ? A . A 1 2652 ASN 2652 ? ? ? A . A 1 2653 HIS 2653 ? ? ? A . A 1 2654 SER 2654 ? ? ? A . A 1 2655 CYS 2655 ? ? ? A . A 1 2656 GLU 2656 ? ? ? A . A 1 2657 PRO 2657 ? ? ? A . A 1 2658 ASN 2658 ? ? ? A . A 1 2659 CYS 2659 ? ? ? A . A 1 2660 PHE 2660 ? ? ? A . A 1 2661 SER 2661 ? ? ? A . A 1 2662 ARG 2662 ? ? ? A . A 1 2663 VAL 2663 ? ? ? A . A 1 2664 ILE 2664 ? ? ? A . A 1 2665 HIS 2665 ? ? ? A . A 1 2666 VAL 2666 ? ? ? A . A 1 2667 GLU 2667 ? ? ? A . A 1 2668 GLY 2668 ? ? ? A . A 1 2669 GLN 2669 ? ? ? A . A 1 2670 LYS 2670 ? ? ? A . A 1 2671 HIS 2671 ? ? ? A . A 1 2672 ILE 2672 ? ? ? A . A 1 2673 VAL 2673 ? ? ? A . A 1 2674 ILE 2674 ? ? ? A . A 1 2675 PHE 2675 ? ? ? A . A 1 2676 ALA 2676 ? ? ? A . A 1 2677 LEU 2677 ? ? ? A . A 1 2678 ARG 2678 ? ? ? A . A 1 2679 ARG 2679 ? ? ? A . A 1 2680 ILE 2680 ? ? ? A . A 1 2681 LEU 2681 ? ? ? A . A 1 2682 ARG 2682 ? ? ? A . A 1 2683 GLY 2683 ? ? ? A . A 1 2684 GLU 2684 ? ? ? A . A 1 2685 GLU 2685 ? ? ? A . A 1 2686 LEU 2686 ? ? ? A . A 1 2687 THR 2687 ? ? ? A . A 1 2688 TYR 2688 ? ? ? A . A 1 2689 ASP 2689 ? ? ? A . A 1 2690 TYR 2690 ? ? ? A . 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A . # # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 ZN 1 2 2 ZN '_' . C 2 ZN 1 3 3 ZN '_' . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'MLL1 PHD3-Bromo {PDB ID=3lqj, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=3lqj.1.A}' 'template structure' . 2 'ZINC ION {PDB ID=3lqj, label_asym_id=E, auth_asym_id=A, SMTL ID=3lqj.1._.2}' 'template structure' . 3 'ZINC ION {PDB ID=3lqj, label_asym_id=F, auth_asym_id=A, SMTL ID=3lqj.1._.3}' 'template structure' . 4 . target . 5 'ZINC ION' target . 6 'Target-template alignment by HHblits to 3lqj, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 7 'model 3' 'model coordinates' . 8 SMTL 'reference database' . 9 PDB 'reference database' . 10 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 4 2 1 8 3 1 9 4 2 10 5 3 4 6 3 5 7 3 1 8 3 2 9 3 3 10 3 6 11 4 1 12 4 2 13 4 3 14 4 6 15 4 5 16 5 7 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 8 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-04 9 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-29 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 4 'reference database' 2 5 . # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . B 2 . C 2 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A 2 2 'reference database' non-polymer 1 2 B E 3 1 A 3 3 'reference database' non-polymer 1 3 C F 3 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;SGNFCPLCDKCYDDDDYESKMMQCGKCDRWVHSKCENLSDEMYEILSNLPESVAYTCVNCTERHPAEWRL ALEKELQISLKQVLTALLNSRTTSHLLRYRQQQPLDLEGVKRKMDQGNYTSVLEFSDDIVKIIQAAINSD GGQPEIKKANSMVKSFFIRQMERVFPWFSVKKSRFWEPNKVSS ; ;SGNFCPLCDKCYDDDDYESKMMQCGKCDRWVHSKCENLSDEMYEILSNLPESVAYTCVNCTERHPAEWRL ALEKELQISLKQVLTALLNSRTTSHLLRYRQQQPLDLEGVKRKMDQGNYTSVLEFSDDIVKIIQAAINSD GGQPEIKKANSMVKSFFIRQMERVFPWFSVKKSRFWEPNKVSS ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 2 181 # # loop_ _ma_template_non_poly.template_id _ma_template_non_poly.comp_id _ma_template_non_poly.details 2 ZN 'ZINC ION' 3 ZN 'ZINC ION' # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 3lqj 2017-07-26 2 PDB . 3lqj 2017-07-26 3 PDB . 3lqj 2017-07-26 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2715 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 6 1 2717 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 2.6e-18 42.697 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 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2 1 2 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_atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . 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CYS 1338 1338 ? A 69.785 24.794 15.349 1 1 A CYS 0.630 1 ATOM 30 S SG . CYS 1338 1338 ? A 69.769 24.584 17.168 1 1 A CYS 0.630 1 ATOM 31 N N . PRO 1339 1339 ? A 72.322 27.031 16.155 1 1 A PRO 0.630 1 ATOM 32 C CA . PRO 1339 1339 ? A 73.710 27.179 16.592 1 1 A PRO 0.630 1 ATOM 33 C C . PRO 1339 1339 ? A 74.204 26.005 17.422 1 1 A PRO 0.630 1 ATOM 34 O O . PRO 1339 1339 ? A 75.404 25.766 17.454 1 1 A PRO 0.630 1 ATOM 35 C CB . PRO 1339 1339 ? A 73.697 28.482 17.415 1 1 A PRO 0.630 1 ATOM 36 C CG . PRO 1339 1339 ? A 72.250 28.599 17.899 1 1 A PRO 0.630 1 ATOM 37 C CD . PRO 1339 1339 ? A 71.466 28.069 16.704 1 1 A PRO 0.630 1 ATOM 38 N N . ILE 1340 1340 ? A 73.308 25.311 18.152 1 1 A ILE 0.620 1 ATOM 39 C CA . ILE 1340 1340 ? A 73.663 24.203 19.029 1 1 A ILE 0.620 1 ATOM 40 C C . ILE 1340 1340 ? A 73.959 22.910 18.276 1 1 A ILE 0.620 1 ATOM 41 O O . ILE 1340 1340 ? A 74.942 22.232 18.557 1 1 A ILE 0.620 1 ATOM 42 C CB . ILE 1340 1340 ? 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THR 1433 1433 ? A 41.555 6.256 56.095 1 1 A THR 0.270 1 ATOM 746 O O . THR 1433 1433 ? A 41.429 5.428 56.994 1 1 A THR 0.270 1 ATOM 747 C CB . THR 1433 1433 ? A 40.148 8.139 56.915 1 1 A THR 0.270 1 ATOM 748 O OG1 . THR 1433 1433 ? A 39.147 8.018 55.912 1 1 A THR 0.270 1 ATOM 749 C CG2 . THR 1433 1433 ? A 40.168 9.617 57.338 1 1 A THR 0.270 1 ATOM 750 N N . GLN 1434 1434 ? A 41.760 5.864 54.815 1 1 A GLN 0.320 1 ATOM 751 C CA . GLN 1434 1434 ? A 41.880 4.477 54.399 1 1 A GLN 0.320 1 ATOM 752 C C . GLN 1434 1434 ? A 42.784 4.387 53.192 1 1 A GLN 0.320 1 ATOM 753 O O . GLN 1434 1434 ? A 42.571 5.069 52.194 1 1 A GLN 0.320 1 ATOM 754 C CB . GLN 1434 1434 ? A 40.509 3.864 53.996 1 1 A GLN 0.320 1 ATOM 755 C CG . GLN 1434 1434 ? A 40.539 2.348 53.622 1 1 A GLN 0.320 1 ATOM 756 C CD . GLN 1434 1434 ? A 40.918 1.963 52.174 1 1 A GLN 0.320 1 ATOM 757 O OE1 . GLN 1434 1434 ? A 40.554 2.544 51.148 1 1 A GLN 0.320 1 ATOM 758 N NE2 . GLN 1434 1434 ? 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LEU 1449 1449 ? A 45.781 16.031 48.752 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 854 C C . LEU 1449 1449 ? A 46.946 16.532 49.555 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 855 O O . LEU 1449 1449 ? A 47.914 17.036 49.004 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 856 C CB . LEU 1449 1449 ? A 44.703 17.127 48.767 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 857 C CG . LEU 1449 1449 ? A 43.486 16.778 47.907 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 858 C CD1 . LEU 1449 1449 ? A 42.581 17.997 47.759 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 859 C CD2 . LEU 1449 1449 ? A 43.921 16.314 46.521 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 860 N N . GLN 1450 1450 ? A 46.917 16.358 50.885 1 1 A GLN 0.740 1 ATOM 861 C CA . GLN 1450 1450 ? A 48.014 16.739 51.753 1 1 A GLN 0.740 1 ATOM 862 C C . GLN 1450 1450 ? A 49.324 16.040 51.411 1 1 A GLN 0.740 1 ATOM 863 O O . GLN 1450 1450 ? A 50.415 16.583 51.570 1 1 A GLN 0.740 1 ATOM 864 C CB . GLN 1450 1450 ? A 47.632 16.438 53.211 1 1 A GLN 0.740 1 ATOM 865 C CG . GLN 1450 1450 ? A 46.484 17.326 53.738 1 1 A GLN 0.740 1 ATOM 866 C CD . GLN 1450 1450 ? 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# loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #