data_SMR-92fc71191c7b3fb27e692e62c0ee72f3_1 _entry.id SMR-92fc71191c7b3fb27e692e62c0ee72f3_1 _struct.entry_id SMR-92fc71191c7b3fb27e692e62c0ee72f3_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q9Y520 (isoform 2)/ PRC2C_HUMAN, Protein PRRC2C Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q9Y520 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 351553.878 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP PRC2C_HUMAN Q9Y520 1 ;MSEKSGQSTKAKDGKKYATLSLFNTYKGKSLETQKTTARHGLQSLGKVGISRRMPPPANLPSLKAENKGN DPNVNIVPKDGTGWASKQEQHEEEKTPEVPPAQPKPGVAAPPEVAPAPKSWASNKQGGQGDGIQVNSQFQ QEFPSLQAAGDQEKKEKETNDDNYGPGPSLRPPNVACWRDGGKAAGSPSSSDQDEKLPGQDESTAGTSEQ NDILKVVEKRIACGPPQAKLNGQQAALASQYRAMMPPYMFQQYPRMTYPPLHGPMRFPPSLSETNKGLRG RGPPPSWASEPERPSILSASELKELDKFDNLDAEADEGWAGAQMEVDYTEQLNFSDDDEQGSNSPKENNS EDQGSKASENNENKKETDEVSNTKSSSQIPAQPSVAKVPYGKGPSFNQERGTSSHLPPPPKLLAQQHPPP DRQAVPGRPGPFPSKQQVADEDEIWKQRRRQQSEISAAVERARKRREEEERRMEEQRKAACAEKLKRLDE KLGILEKQPSPEEIREREREKEREREKELEKEQEQEREKEREKDRERQQEKEKELEKEQEKQREMEKERK QEKEKELERQKEKEKELQKMKEQEKECELEKEREKLEEKIEPREPNLEPMVEKQESENSCNKEEEPVFTR QDSNRSEKEATPVVHETEPESGSQPRPAVLSGYFKQFQKSLPPRFQRQQEQMKQQQWQQQQQQGVLPQTV PSQPSSSTVPPPPHRPLYQPMQPHPQHLASMGFDPRWLMMQSYMDPRMMSGRPAMDIPPIHPGMIPPKPL MRRDQMEGSPNSSESFEHIARSARDHAISLSEPRMLWGSDPYPHAEPQQATTPKATEEPEDVRSEAALDQ EQITAAYSVEHNQLEAHPKADFIRESSEAQVQKFLSRSVEDVRPHHTDANNQSACFEAPDQKTLSAPQEE RISAVESQPSRKRSVSHGSNHTQKPDEQRSEPSAGIPKVTSRCIDSKEPIERPEEKPKKEGFIRSSEGPK PEKVYKSKSETRWGPRPSSNRREEVNDRPVRRSGPIKKPVLRDMKEEREQRKEKEGEKAEKVTEKVVVKP EKTEKKDLPPPPPPPQPPAPIQPQSVPPPIQPEAEKFPSTETATLAQKPSQDTEKPLEPVSTVQVEPAVK TVNQQTMAAPVVKEEKQPEKVISKDLVIERPRPDSRPAVKKESTLPPRTYWKEARERDWFPDQGYRGRGR GEYYSRGRSYRGSYGGRGRGGRGHTRDYPQYRDNKPRAEHIPSGPLRQREESETRSESSDFEVVPKRRRQ RGSETDTDSEIHESASDKDSLSKGKLPKREERPENKKPVKPHSSFKPDNHVRIDNRLLEKPYVRDDDKAK PGFLPKGEPTRRGRGGTFRRGGRDPGGRPSRPSTLRRPAYRDNQWNPRQSEVPKPEDGEPPRRHEQFIPI AADKRPPKFERKFDPARERPRRQRPTRPPRQDKPPRFRRLREREAASKSNEVVAVPTNGTVNNVAQEPVN TLGDISGNKTPDLSNQNSSDQANEEWETASESSDFNERRERDEKKNADLNAQTVVKVGENVLPPKREIAK RSFSSQRPVDRQNRRGNNGPPKSGRNFSGPRNERRSGPPSKSGKRGPFDDQPAGTTGVDLINGSSAHHQE GVPNGTGQKNSKDSTGKKREDPKPGPKKPKEKVDALSQFDLNNYASVVIIDDHPEVTVIEDPQSNLNDDG FTEVVSKKQQKRLQDEERRKKEEQVIQVWNKKNANEKGRSQTSKLPPRFAKKQATGIQQAQSSASVPPLA SAPLPPSTSASVPASTSAPLPATLTPVPASTSAPVPASTLAPVLASTSAPVPASPLAPVSASASVSASVP ASTSAAAITSSSAPASAPAPTPILASVSTPASVTILASASIPILASALASTSAPTPAPAASSPAAPVITA PTIPASAPTASVPLAPASASAPAPAPTPVSAPNPAPPAPAQTQAQTHKPVQNPLQTTSQSSKQPPPSIRL PSAQTPNGTDYVASGKSIQTPQSHGTLTAELWDNKVAPPAVLNDISKKLGPISPPQPPSVSAWNKPLTSF GSAPSSEGAKNGQESGLEIGTDTIQFGAPASNGNENEVVPVLSEKSADKIPEPKEQRQKQPRAGPIKAQK LPDLSPVENKEHKPGPIGKERSLKNRKVKDAQQVEPEGQEKPSPATVRSTDPVTTKETKAVSEMSTEIGT MISVSSAEYGTNAKMESARKAWENSPNVREKGSPVTSTAPPIATGVSSSASGPSTANYNSFSSASMPQIP VASVTPTASLSGAGTYTTSSLSTKSTTTSDPPNICKVKPQQLQTSSLPSASHFSQLSCMPSLIAQQQQNP QVYVSQSAAAQIPAFYMDTSHLFNTQHARLAPPSLAQQQGFQPGLSQPTSVQQIPIPIYAPLQGQHQAQL SLGAGPAVSQAQELFSSSLQPYRSQPAFMQSSLSQPSVVLSGTAIHNFPTVQHQELAKAQSGLAFQQTSN TQPIPILYEHQLGQASGLGGSQLIDTHLLQARANLTQASNLYSGQVQQPGQTNFYNTAQSPSALQQVTVP LPASQLSLPNFGSTGQPLIALPQTLQPPLQHTTPQAQAQSLSRPAQVSQPFRGLIPAGTQHSMIATTGKM SEMELKAFGSGIDIKPGTPPIAGRSTTPTSSPFRATSTSPNSQSSKMNSIVYQKQFQSAPATVRMTQPFP TQFAPQAKQRAEVLQSTQRFFSEQQQSKQIGGGKAQKVDSDSSKPPETLTDPPGVCQEKVEEKPPPAPSI ATKPVRTGPIKPQAIKTEETKS ; 'Protein PRRC2C' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2752 1 2752 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . PRC2C_HUMAN Q9Y520 Q9Y520-2 1 2752 9606 'Homo sapiens (Human)' 2011-07-27 523B278DD55A9333 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MSEKSGQSTKAKDGKKYATLSLFNTYKGKSLETQKTTARHGLQSLGKVGISRRMPPPANLPSLKAENKGN DPNVNIVPKDGTGWASKQEQHEEEKTPEVPPAQPKPGVAAPPEVAPAPKSWASNKQGGQGDGIQVNSQFQ QEFPSLQAAGDQEKKEKETNDDNYGPGPSLRPPNVACWRDGGKAAGSPSSSDQDEKLPGQDESTAGTSEQ NDILKVVEKRIACGPPQAKLNGQQAALASQYRAMMPPYMFQQYPRMTYPPLHGPMRFPPSLSETNKGLRG RGPPPSWASEPERPSILSASELKELDKFDNLDAEADEGWAGAQMEVDYTEQLNFSDDDEQGSNSPKENNS EDQGSKASENNENKKETDEVSNTKSSSQIPAQPSVAKVPYGKGPSFNQERGTSSHLPPPPKLLAQQHPPP DRQAVPGRPGPFPSKQQVADEDEIWKQRRRQQSEISAAVERARKRREEEERRMEEQRKAACAEKLKRLDE KLGILEKQPSPEEIREREREKEREREKELEKEQEQEREKEREKDRERQQEKEKELEKEQEKQREMEKERK QEKEKELERQKEKEKELQKMKEQEKECELEKEREKLEEKIEPREPNLEPMVEKQESENSCNKEEEPVFTR 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A 1 2600 SER 2600 ? ? ? A . A 1 2601 GLY 2601 ? ? ? A . A 1 2602 ILE 2602 ? ? ? A . A 1 2603 ASP 2603 ? ? ? A . A 1 2604 ILE 2604 ? ? ? A . A 1 2605 LYS 2605 ? ? ? A . A 1 2606 PRO 2606 ? ? ? A . A 1 2607 GLY 2607 ? ? ? A . A 1 2608 THR 2608 ? ? ? A . A 1 2609 PRO 2609 ? ? ? A . A 1 2610 PRO 2610 ? ? ? A . A 1 2611 ILE 2611 ? ? ? A . A 1 2612 ALA 2612 ? ? ? A . A 1 2613 GLY 2613 ? ? ? A . A 1 2614 ARG 2614 ? ? ? A . A 1 2615 SER 2615 ? ? ? A . A 1 2616 THR 2616 ? ? ? A . A 1 2617 THR 2617 ? ? ? A . A 1 2618 PRO 2618 ? ? ? A . A 1 2619 THR 2619 ? ? ? A . A 1 2620 SER 2620 ? ? ? A . A 1 2621 SER 2621 ? ? ? A . A 1 2622 PRO 2622 ? ? ? A . A 1 2623 PHE 2623 ? ? ? A . A 1 2624 ARG 2624 ? ? ? A . A 1 2625 ALA 2625 ? ? ? A . A 1 2626 THR 2626 ? ? ? A . A 1 2627 SER 2627 ? ? ? A . A 1 2628 THR 2628 ? ? ? A . A 1 2629 SER 2629 ? ? ? A . A 1 2630 PRO 2630 ? ? ? A . A 1 2631 ASN 2631 ? ? ? A . A 1 2632 SER 2632 ? ? ? A . A 1 2633 GLN 2633 ? ? ? A . A 1 2634 SER 2634 ? ? ? A . A 1 2635 SER 2635 ? ? ? A . A 1 2636 LYS 2636 ? ? ? A . A 1 2637 MET 2637 ? ? ? A . A 1 2638 ASN 2638 ? ? ? A . A 1 2639 SER 2639 ? ? ? A . A 1 2640 ILE 2640 ? ? ? A . A 1 2641 VAL 2641 ? ? ? A . A 1 2642 TYR 2642 ? ? ? A . A 1 2643 GLN 2643 ? ? ? A . A 1 2644 LYS 2644 ? ? ? A . A 1 2645 GLN 2645 ? ? ? A . A 1 2646 PHE 2646 ? ? ? A . A 1 2647 GLN 2647 ? ? ? A . A 1 2648 SER 2648 ? ? ? A . A 1 2649 ALA 2649 ? ? ? A . A 1 2650 PRO 2650 ? ? ? A . A 1 2651 ALA 2651 ? ? ? A . A 1 2652 THR 2652 ? ? ? A . A 1 2653 VAL 2653 ? ? ? A . A 1 2654 ARG 2654 ? ? ? A . A 1 2655 MET 2655 ? ? ? A . A 1 2656 THR 2656 ? ? ? A . A 1 2657 GLN 2657 ? ? ? A . A 1 2658 PRO 2658 ? ? ? A . A 1 2659 PHE 2659 ? ? ? A . A 1 2660 PRO 2660 ? ? ? A . A 1 2661 THR 2661 ? ? ? A . A 1 2662 GLN 2662 ? ? ? A . A 1 2663 PHE 2663 ? ? ? A . A 1 2664 ALA 2664 ? ? ? A . A 1 2665 PRO 2665 ? ? ? A . A 1 2666 GLN 2666 ? ? ? A . A 1 2667 ALA 2667 ? ? ? A . A 1 2668 LYS 2668 ? ? ? A . A 1 2669 GLN 2669 ? ? ? A . 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A 1 2740 ILE 2740 ? ? ? A . A 1 2741 LYS 2741 ? ? ? A . A 1 2742 PRO 2742 ? ? ? A . A 1 2743 GLN 2743 ? ? ? A . A 1 2744 ALA 2744 ? ? ? A . A 1 2745 ILE 2745 ? ? ? A . A 1 2746 LYS 2746 ? ? ? A . A 1 2747 THR 2747 ? ? ? A . A 1 2748 GLU 2748 ? ? ? A . A 1 2749 GLU 2749 ? ? ? A . A 1 2750 THR 2750 ? ? ? A . A 1 2751 LYS 2751 ? ? ? A . A 1 2752 SER 2752 ? ? ? A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'mL64 {PDB ID=7nsj, label_asym_id=VA, auth_asym_id=Bv, SMTL ID=7nsj.47.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 7nsj, label_asym_id=VA' 'target-template alignment' . 4 'model 1' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-04 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-29 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A VA 48 1 Bv # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MAAPVQQARTLLRLVTTLGQGSRGYRARPPPRRSQEPRWPDPDDPLTPRWQLSPRYAAKQFARHGAASGV AAGSLWPSQEQLRELEAEEREWYPSLAAMQESLRVQQLAEEQKRQAREQLIEECMAKMPQMIENWRQQQQ ERREKEQADKDRRARLQAEAQERLGYHVDPRSARFQELLQDMEKQHRKRLKEEKQRKKKEARAAAMAAAA AQDPADSETPSS ; ;MAAPVQQARTLLRLVTTLGQGSRGYRARPPPRRSQEPRWPDPDDPLTPRWQLSPRYAAKQFARHGAASGV AAGSLWPSQEQLRELEAEEREWYPSLAAMQESLRVQQLAEEQKRQAREQLIEECMAKMPQMIENWRQQQQ ERREKEQADKDRRARLQAEAQERLGYHVDPRSARFQELLQDMEKQHRKRLKEEKQRKKKEARAAAMAAAA AQDPADSETPSS ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 96 133 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 7nsj 2024-10-09 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2752 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2752 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 1.500 18.421 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MSEKSGQSTKAKDGKKYATLSLFNTYKGKSLETQKTTARHGLQSLGKVGISRRMPPPANLPSLKAENKGNDPNVNIVPKDGTGWASKQEQHEEEKTPEVPPAQPKPGVAAPPEVAPAPKSWASNKQGGQGDGIQVNSQFQQEFPSLQAAGDQEKKEKETNDDNYGPGPSLRPPNVACWRDGGKAAGSPSSSDQDEKLPGQDESTAGTSEQNDILKVVEKRIACGPPQAKLNGQQAALASQYRAMMPPYMFQQYPRMTYPPLHGPMRFPPSLSETNKGLRGRGPPPSWASEPERPSILSASELKELDKFDNLDAEADEGWAGAQMEVDYTEQLNFSDDDEQGSNSPKENNSEDQGSKASENNENKKETDEVSNTKSSSQIPAQPSVAKVPYGKGPSFNQERGTSSHLPPPPKLLAQQHPPPDRQAVPGRPGPFPSKQQVADEDEIWKQRRRQQSEISAAVERARKRREEEERRMEEQRKAACAEKLKRLDEKLGILEKQPSPEEIREREREKEREREKELEKEQEQEREKEREKDRERQQEKEKELEKEQEKQREMEKERKQEKEKELERQKEKEKELQKMKEQEKECELEKEREKLEEKIEPREPNLEPMVEKQESENSCNKEEEPVFTRQDSNRSEKEATPVVHETEPESGSQPRPAVLSGYFKQFQKSLPPRFQRQQEQMKQQQWQQQQQQGVLPQTVPSQPSSSTVPPPPHRPLYQPMQPHPQHLASMGFDPRWLMMQSYMDPRMMSGRPAMDIPPIHPGMIPPKPLMRRDQMEGSPNSSESFEHIARSARDHAISLSEPRMLWGSDPYPHAEPQQATTPKATEEPEDVRSEAALDQEQITAAYSVEHNQLEAHPKADFIRESSEAQVQKFLSRSVEDVRPHHTDANNQSACFEAPDQKTLSAPQEERISAVESQPSRKRSVSHGSNHTQKPDEQRSEPSAGIPKVTSRCIDSKEPIERPEEKPKKEGFIRSSEGPKPEKVYKSKSETRWGPRPSSNRREEVNDRPVRRSGPIKKPVLRDMKEEREQRKEKEGEKAEKVTEKVVVKPEKTEKKDLPPPPPPPQPPAPIQPQSVPPPIQPEAEKFPSTETATLAQKPSQDTEKPLEPVSTVQVEPAVKTVNQQTMAAPVVKEEKQPEKVISKDLVIERPRPDSRPAVKKESTLPPRTYWKEARERDWFPDQGYRGRGRGEYYSRGRSYRGSYGGRGRGGRGHTRDYPQYRDNKPRAEHIPSGPLRQREESETRSESSDFEVVPKRRRQRGSETDTDSEIHESASDKDSLSKGKLPKREERPENKKPVKPHSSFKPDNHVRIDNRLLEKPYVRDDDKAKPGFLPKGEPTRRGRGGTFRRGGRDPGGRPSRPSTLRRPAYRDNQWNPRQSEVPKPEDGEPPRRHEQFIPIAADKRPPKFERKFDPARERPRRQRPTRPPRQDKPPRFRRLREREAASKSNEVVAVPTNGTVNNVAQEPVNTLGDISGNKTPDLSNQNSSDQANEEWETASESSDFNERRERDEKKNADLNAQTVVKVGENVLPPKREIAKRSFSSQRPVDRQNRRGNNGPPKSGRNFSGPRNERRSGPPSKSGKRGPFDDQPAGTTGVDLINGSSAHHQEGVPNGTGQKNSKDSTGKKREDPKPGPKKPKEKVDALSQFDLNNYASVVIIDDHPEVTVIEDPQSNLNDDGFTEVVSKKQQKRLQDEERRKKEEQVIQVWNKKNANEKGRSQTSKLPPRFAKKQATGIQQAQSSASVPPLASAPLPPSTSASVPASTSAPLPATLTPVPASTSAPVPASTLAPVLASTSAPVPASPLAPVSASASVSASVPASTSAAAITSSSAPASAPAPTPILASVSTPASVTILASASIPILASALASTSAPTPAPAASSPAAPVITAPTIPASAPTASVPLAPASASAPAPAPTPVSAPNPAPPAPAQTQAQTHKPVQNPLQTTSQSSKQPPPSIRLPSAQTPNGTDYVASGKSIQTPQSHGTLTAELWDNKVAPPAVLNDISKKLGPISPPQPPSVSAWNKPLTSFGSAPSSEGAKNGQESGLEIGTDTIQFGAPASNGNENEVVPVLSEKSADKIPEPKEQRQKQPRAGPIKAQKLPDLSPVENKEHKPGPIGKERSLKNRKVKDAQQVEPEGQEKPSPATVRSTDPVTTKETKAVSEMSTEIGTMISVSSAEYGTNAKMESARKAWENSPNVREKGSPVTSTAPPIATGVSSSASGPSTANYNSFSSASMPQIPVASVTPTASLSGAGTYTTSSLSTKSTTTSDPPNICKVKPQQLQTSSLPSASHFSQLSCMPSLIAQQQQNPQVYVSQSAAAQIPAFYMDTSHLFNTQHARLAPPSLAQQQGFQPGLSQPTSVQQIPIPIYAPLQGQHQAQLSLGAGPAVSQAQELFSSSLQPYRSQPAFMQSSLSQPSVVLSGTAIHNFPTVQHQELAKAQSGLAFQQTSNTQPIPILYEHQLGQASGLGGSQLIDTHLLQARANLTQASNLYSGQVQQPGQTNFYNTAQSPSALQQVTVPLPASQLSLPNFGSTGQPLIALPQTLQPPLQHTTPQAQAQSLSRPAQVSQPFRGLIPAGTQHSMIATTGKMSEMELKAFGSGIDIKPGTPPIAGRSTTPTSSPFRATSTSPNSQSSKMNSIVYQKQFQSAPATVRMTQPFPTQFAPQAKQRAEVLQSTQRFFSEQQQSKQIGGGKAQKVDSDSSKPPETLTDPPGVCQEKVEEKPPPAPSIATKPVRTGPIKPQAIKTEETKS 2 1 2 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------LAAMQESLRVQQLAEEQ-KRQAREQLIEECMAKMPQMIE--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 7nsj.47' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 1' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id 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A 226.550 336.598 242.823 1 1 A GLY 0.440 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O S # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.596 2 1 3 0 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 455 ILE 1 0.340 2 1 A 456 SER 1 0.420 3 1 A 457 ALA 1 0.570 4 1 A 458 ALA 1 0.620 5 1 A 459 VAL 1 0.630 6 1 A 460 GLU 1 0.590 7 1 A 461 ARG 1 0.580 8 1 A 462 ALA 1 0.740 9 1 A 463 ARG 1 0.590 10 1 A 464 LYS 1 0.700 11 1 A 465 ARG 1 0.620 12 1 A 466 ARG 1 0.590 13 1 A 467 GLU 1 0.630 14 1 A 468 GLU 1 0.650 15 1 A 469 GLU 1 0.660 16 1 A 470 GLU 1 0.650 17 1 A 471 ARG 1 0.600 18 1 A 472 ARG 1 0.590 19 1 A 473 MET 1 0.620 20 1 A 474 GLU 1 0.640 21 1 A 475 GLU 1 0.620 22 1 A 476 GLN 1 0.650 23 1 A 477 ARG 1 0.580 24 1 A 478 LYS 1 0.660 25 1 A 479 ALA 1 0.750 26 1 A 480 ALA 1 0.740 27 1 A 481 CYS 1 0.640 28 1 A 482 ALA 1 0.670 29 1 A 483 GLU 1 0.610 30 1 A 484 LYS 1 0.610 31 1 A 485 LEU 1 0.590 32 1 A 486 LYS 1 0.570 33 1 A 487 ARG 1 0.540 34 1 A 488 LEU 1 0.600 35 1 A 489 ASP 1 0.460 36 1 A 490 GLU 1 0.470 37 1 A 491 LYS 1 0.530 38 1 A 492 LEU 1 0.470 39 1 A 493 GLY 1 0.440 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #