data_SMR-ec1cb34a1d807233bad43858f55e07db_1 _entry.id SMR-ec1cb34a1d807233bad43858f55e07db_1 _struct.entry_id SMR-ec1cb34a1d807233bad43858f55e07db_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q3TLH4/ PRC2C_MOUSE, Protein PRRC2C Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q3TLH4' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 362566.994 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP PRC2C_MOUSE Q3TLH4 1 ;MSEKSGQSTKAKDGKKYATLSLFNTYKGKSLETQKTTVAARHGLQSLGKVGISRRMPPPANLPSLKAENK GNDPNVNIVPKDGTGWASKQEQHEEEKAPEVSPAQPKPGVAAPPEVAPAPKSWASNKQGGQGDGIQVNSQ FQQEFPSLQAAGDQEKKEKEANDENYGPGPSLRPPNVACWRDGGKSAGSPSSDQDEKQLGQDESTAITSE QNDILKVVEKRIACGPPQAKLNGQQPALASQYRAMMPPYMFQQYPRMAYPPLHGPMRFPPSLSEANKSLR GRGPPPSWASEPERPSILSASELKELDKFDNLDAEADEGWAGAQMEVDYTEQLNFSDDDEQGSTSPKESS SEDQTAKTPESTENRKEVDEASSTKSSSQIPAQPPVTKSPYGKGPPFNQERGPSSHLPPPPKLLAQQHPP PPDRQIPGRQGPFPSKPPVPDNDEIWKQRRKQQSEISAAVERARKRREEEERRMEEQRKAACAEKLKQLD EKLGIIEKQPSPEELREREREKERERELEKEKERELEKEQEKQREMERARQQEKELEQQREKEQELQRLR EQEKEGEPKEQEKEEKVEPQEPVVEPATENQESENNCKKEEEPIFTRQDSNRSEKETTQVVQEAEPESGA QPRPGYFKQFQKSLPPRFQRQQEQMKQQQWQQQQQQQQQGVLPQTVPSQPSNGSVPPPPHRPLYQPMQPH PQHLASMGFDPRWLMMQSYMDPRMISGRPAMDIPPIHPGMIPPKPLIRRDQMEGSPNSSESFEHIARSAR DHGISLSEPRMMWGSDPYHAEPQQAATPKSAEETGDARPETAMDHEHMTAAYPVEHSQLETHSKTDVARD STETEEQKFLSRSLEDVKPRHVDTNTQSACFDVIDQKSLPTSAEERISALESQPARKRSVSHGSNHAQNA EEQRNEPSVSIPKVINRCMDSKETVEKPEEKPRKDGFLRSSEGPKPEKVYKSKSETRWGPRPSSNRREEG NDRPVRRSGPIKKPVLRDMKEEREQRKEKEGEKLEKVTEKVVKAEKPEKKDLPLPLPPPAPAQPQPQPLV SPPVQPEPEKPPSTETSTLTQKPSQDEKPLEPVGSVQVEPVVKTVNQQSVAAPTVKEEKPPEKVINKDVG IERSRPDSRLAVKKDSSLPTRTYWKEARDRDWFPDQGYRGRGRGEYYSRGRSYRGSYGGRGRGGRGHTRE YPQYRDNKPRTEHVPSGPLRQREESETRSESSDFEVVPKRRRQRGSETDTDSEVHESASDKDSVSKGKLP KREERPENKKPVKPQSSFKPENHVRIDNRPLEKPYIREEDKSKPGFLPKGEPTRRGRGGTFRRGGRDPGG RPSRPATLRRPAYRDNQWNTRQAEPPKPEDGEPPRRHEQFMPIPADKRPPKFERKFDPARERPRRQRPTR PPRQDKPPRFRRLREREAASKTSEVLVPSNGTANNVVQEPVNPPADISGNKTPDLSNQNSSDQANEEWET ASESSDFNERRERDEKKNADKSSQAVVKAGESVLPPKREIAKRSFSSQRPGVDRQNRRGNNGPPKSGRNF SGPRNERRNGPPSKGGKRGPFDDQASGTAGADPVSGNSAHHQEGVPNGAGQKNSKDAAGKKREDTKPGPK KPKEKVDALSQFDLNNYASVVIIDDHPEVTVIEDPQSNLNDDGFTEVVSKKQQKRLQDEERRKKEEQVVQ VWSKKNIGEKGRSQTSKLPPRFAKKQATGTQQIQAPPSAPVPVSSSAPGLTAPAAAAPASTPAPVPILAS ATALVPVSTPAPVLTSCPAPVPTSASAPVPASTSSPVTASSSSQPSVPAPTPVLASASTTVSVPILTSAS IPILASALAPATVSSPTPVVSATAVPSISTPAVPASAPTASVPLAPASAASTVPPPASTVQTQTQTQTHK PVQSPLPPSAPSSKQPPPSIRLPSAQTSNGTDFVAAGKSMPTSQSHGSLTAELWDSKVAAPAVLNDISKK LGPISPPQPPSVSAWNKPLTSFGSATSSEGTRNGQESGVEIGIDTIQFGAPASNGNENEVVPVLSEKATD KVPEPKEQRQKQPRAGPIKAQKLPDLSLVENKEHKPGPIGKERSLKNRKVKDAQQVEPEGQEKPSPAVVR STDPETAKETKAVSEMSAEIGAMISVSSAEYGSDAKESVTDYTTPSSSLPNTVATNNAKMEDTLVNNVPL PNTLPLPKRETIQQSSSLTSVPPTTFSLTFKMESARKAWENSPNLREKGSPVTSTAPPIVSGVSSSASGP STANYSSFSSASMPQIPVASVTPTASLSGAGTYTTSSLSTKSTTTSDPPNICKVKPQQLQTSSLPSASHF SQLSCMPSLIAQQQQSPQVYVSQSAAAQIPAFYMDTSHLFNTQHARLAPPSLAQQQGFQPGLSQPTSVQQ IPIPIYAPLQGQHQAQLSLGAGPAVSQAQELFSSSIQPYRSQPAFMQSSLSQPSVVLSGTAIHNFPAVQH QELAKAQSGLAFQQTSNPQPIPILYDHQLGQASGLGSSQLIDTHLLQARANLTQASNLYSGQVQQPGQTN FYNTAQSPSALQQVTVPLPASQLSLTNFGSTGQPLIALPQTLQPQLQHTTPQAQAQSLSRPAQVSQPFRG LIPAGTQHSMMATTGKMSEMELKAFGSGIDIKPGTPPIGGRSTTPTSSPFRATSTSPNSQSSKMNSVVYQ KQFQSAPATVRMAQPFPAQFAPQILSQPNLVPPLVRAPHTNTFPAPVQRPPMALASQMPPPLTTGLMSHA RLPHVARGPCGSLSGVRGNQAQAALKAEQDLKAKQRAEVLQSTQRFFSEQQQNKQIGGKTQRVDSDTSNP ETLSDPPGTCPEKVEEKPPPAPTITTKPVRTGPIKPQAIKTEETKS ; 'Protein PRRC2C' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2846 1 2846 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . PRC2C_MOUSE Q3TLH4 . 1 2846 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2013-01-09 2AEFFE844FBC60C8 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MSEKSGQSTKAKDGKKYATLSLFNTYKGKSLETQKTTVAARHGLQSLGKVGISRRMPPPANLPSLKAENK GNDPNVNIVPKDGTGWASKQEQHEEEKAPEVSPAQPKPGVAAPPEVAPAPKSWASNKQGGQGDGIQVNSQ FQQEFPSLQAAGDQEKKEKEANDENYGPGPSLRPPNVACWRDGGKSAGSPSSDQDEKQLGQDESTAITSE QNDILKVVEKRIACGPPQAKLNGQQPALASQYRAMMPPYMFQQYPRMAYPPLHGPMRFPPSLSEANKSLR GRGPPPSWASEPERPSILSASELKELDKFDNLDAEADEGWAGAQMEVDYTEQLNFSDDDEQGSTSPKESS SEDQTAKTPESTENRKEVDEASSTKSSSQIPAQPPVTKSPYGKGPPFNQERGPSSHLPPPPKLLAQQHPP PPDRQIPGRQGPFPSKPPVPDNDEIWKQRRKQQSEISAAVERARKRREEEERRMEEQRKAACAEKLKQLD EKLGIIEKQPSPEELREREREKERERELEKEKERELEKEQEKQREMERARQQEKELEQQREKEQELQRLR EQEKEGEPKEQEKEEKVEPQEPVVEPATENQESENNCKKEEEPIFTRQDSNRSEKETTQVVQEAEPESGA 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A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1 {PDB ID=7o9m, label_asym_id=YA, auth_asym_id=q, SMTL ID=7o9m.49.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 7o9m, label_asym_id=YA' 'target-template alignment' . 4 'model 1' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-04 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-29 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A YA 51 1 q # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MAASVRQARSLLGVAATLAPGSRGYRARPPPRRRPGPRWPDPEDLLTPRWQLGPRYAAKQFARYGAASGV VPGSLWPSPEQLRELEAEEREWYPSLATMQESLRVKQLAEEQKRREREQHIAECMAKMPQMIVNWQQQQR ENWEKAQADKERRARLQAEAQELLGYQVDPRSARFQELLQDLEKKERKRLKEEKQKRKKEARAAALAAAV AQDPAASGAPSS ; ;MAASVRQARSLLGVAATLAPGSRGYRARPPPRRRPGPRWPDPEDLLTPRWQLGPRYAAKQFARYGAASGV VPGSLWPSPEQLRELEAEEREWYPSLATMQESLRVKQLAEEQKRREREQHIAECMAKMPQMIVNWQQQQR ENWEKAQADKERRARLQAEAQELLGYQVDPRSARFQELLQDLEKKERKRLKEEKQKRKKEARAAALAAAV AQDPAASGAPSS ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 94 136 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 7o9m 2021-06-30 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2846 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2846 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 1.300 16.279 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MSEKSGQSTKAKDGKKYATLSLFNTYKGKSLETQKTTVAARHGLQSLGKVGISRRMPPPANLPSLKAENKGNDPNVNIVPKDGTGWASKQEQHEEEKAPEVSPAQPKPGVAAPPEVAPAPKSWASNKQGGQGDGIQVNSQFQQEFPSLQAAGDQEKKEKEANDENYGPGPSLRPPNVACWRDGGKSAGSPSSDQDEKQLGQDESTAITSEQNDILKVVEKRIACGPPQAKLNGQQPALASQYRAMMPPYMFQQYPRMAYPPLHGPMRFPPSLSEANKSLRGRGPPPSWASEPERPSILSASELKELDKFDNLDAEADEGWAGAQMEVDYTEQLNFSDDDEQGSTSPKESSSEDQTAKTPESTENRKEVDEASSTKSSSQIPAQPPVTKSPYGKGPPFNQERGPSSHLPPPPKLLAQQHPPPPDRQIPGRQGPFPSKPPVPDNDEIWKQRRKQQSEISAAVERARKRREEEERRMEEQRKAACAEKLKQLDEKLGIIEKQPSPEELREREREKERERELEKEKERELEKEQEKQREMERARQQEKELEQQREKEQELQRLREQEKEGEPKEQEKEEKVEPQEPVVEPATENQESENNCKKEEEPIFTRQDSNRSEKETTQVVQEAEPESGAQPRPGYFKQFQKSLPPRFQRQQEQMKQQQWQQQQQQQQQGVLPQTVPSQPSNGSVPPPPHRPLYQPMQPHPQHLASMGFDPRWLMMQSYMDPRMISGRPAMDIPPIHPGMIPPKPLIRRDQMEGSPNSSESFEHIARSARDHGISLSEPRMMWGSDPYHAEPQQAATPKSAEETGDARPETAMDHEHMTAAYPVEHSQLETHSKTDVARDSTETEEQKFLSRSLEDVKPRHVDTNTQSACFDVIDQKSLPTSAEERISALESQPARKRSVSHGSNHAQNAEEQRNEPSVSIPKVINRCMDSKETVEKPEEKPRKDGFLRSSEGPKPEKVYKSKSETRWGPRPSSNRREEGNDRPVRRSGPIKKPVLRDMKEEREQRKEKEGEKLEKVTEKVVKAEKPEKKDLPLPLPPPAPAQPQPQPLVSPPVQPEPEKPPSTETSTLTQKPSQDEKPLEPVGSVQVEPVVKTVNQQSVAAPTVKEEKPPEKVINKDVGIERSRPDSRLAVKKDSSLPTRTYWKEARDRDWFPDQGYRGRGRGEYYSRGRSYRGSYGGRGRGGRGHTREYPQYRDNKPRTEHVPSGPLRQREESETRSESSDFEVVPKRRRQRGSETDTDSEVHESASDKDSVSKGKLPKREERPENKKPVKPQSSFKPENHVRIDNRPLEKPYIREEDKSKPGFLPKGEPTRRGRGGTFRRGGRDPGGRPSRPATLRRPAYRDNQWNTRQAEPPKPEDGEPPRRHEQFMPIPADKRPPKFERKFDPARERPRRQRPTRPPRQDKPPRFRRLREREAASKTSEVLVPSNGTANNVVQEPVNPPADISGNKTPDLSNQNSSDQANEEWETASESSDFNERRERDEKKNADKSSQAVVKAGESVLPPKREIAKRSFSSQRPGVDRQNRRGNNGPPKSGRNFSGPRNERRNGPPSKGGKRGPFDDQASGTAGADPVSGNSAHHQEGVPNGAGQKNSKDAAGKKREDTKPGPKKPKEKVDALSQFDLNNYASVVIIDDHPEVTVIEDPQSNLNDDGFTEVVSKKQQKRLQDEERRKKEEQVVQVWSKKNIGEKGRSQTSKLPPRFAKKQATGTQQIQAPPSAPVPVSSSAPGLTAPAAAAPASTPAPVPILASATALVPVSTPAPVLTSCPAPVPTSASAPVPASTSSPVTASSSSQPSVPAPTPVLASASTTVSVPILTSASIPILASALAPATVSSPTPVVSATAVPSISTPAVPASAPTASVPLAPASAASTVPPPASTVQTQTQTQTHKPVQSPLPPSAPSSKQPPPSIRLPSAQTSNGTDFVAAGKSMPTSQSHGSLTAELWDSKVAAPAVLNDISKKLGPISPPQPPSVSAWNKPLTSFGSATSSEGTRNGQESGVEIGIDTIQFGAPASNGNENEVVPVLSEKATDKVPEPKEQRQKQPRAGPIKAQKLPDLSLVENKEHKPGPIGKERSLKNRKVKDAQQVEPEGQEKPSPAVVRSTDPETAKETKAVSEMSAEIGAMISVSSAEYGSDAKESVTDYTTPSSSLPNTVATNNAKMEDTLVNNVPLPNTLPLPKRETIQQSSSLTSVPPTTFSLTFKMESARKAWENSPNLREKGSPVTSTAPPIVSGVSSSASGPSTANYSSFSSASMPQIPVASVTPTASLSGAGTYTTSSLSTKSTTTSDPPNICKVKPQQLQTSSLPSASHFSQLSCMPSLIAQQQQSPQVYVSQSAAAQIPAFYMDTSHLFNTQHARLAPPSLAQQQGFQPGLSQPTSVQQIPIPIYAPLQGQHQAQLSLGAGPAVSQAQELFSSSIQPYRSQPAFMQSSLSQPSVVLSGTAIHNFPAVQHQELAKAQSGLAFQQTSNPQPIPILYDHQLGQASGLGSSQLIDTHLLQARANLTQASNLYSGQVQQPGQTNFYNTAQSPSALQQVTVPLPASQLSLTNFGSTGQPLIALPQTLQPQLQHTTPQAQAQSLSRPAQVSQPFRGLIPAGTQHSMMATTGKMSEMELKAFGSGIDIKPGTPPIGGRSTTPTSSPFRATSTSPNSQSSKMNSVVYQKQFQSAPATVRMAQPFPAQFAPQILSQPNLVPPLVRAPHTNTFPAPVQRPPMALASQMPPPLTTGLMSHARLPHVARGPCGSLSGVRGNQAQAALKAEQDLKAKQRAEVLQSTQRFFSEQQQNKQIGGKTQRVDSDTSNPETLSDPPGTCPEKVEEKPPPAPTITTKPVRTGPIKPQAIKTEETKS 2 1 2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------PSLATMQESLRVKQLAEE-QKRREREQHIAECMAKMPQMIVNWQ--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 7o9m.49' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 1' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . SER 454 454 ? A 319.836 382.817 319.508 1 1 A SER 0.190 1 ATOM 2 C CA . SER 454 454 ? A 319.363 384.020 320.303 1 1 A SER 0.190 1 ATOM 3 C C . SER 454 454 ? A 320.556 384.700 320.935 1 1 A SER 0.190 1 ATOM 4 O O . SER 454 454 ? A 321.579 384.043 321.091 1 1 A SER 0.190 1 ATOM 5 C CB . SER 454 454 ? A 318.368 383.582 321.424 1 1 A SER 0.190 1 ATOM 6 O OG . SER 454 454 ? A 317.768 384.637 322.210 1 1 A SER 0.190 1 ATOM 7 N N . GLU 455 455 ? A 320.475 386.000 321.276 1 1 A GLU 0.300 1 ATOM 8 C CA . GLU 455 455 ? A 321.515 386.743 321.952 1 1 A GLU 0.300 1 ATOM 9 C C . GLU 455 455 ? A 321.648 386.368 323.404 1 1 A GLU 0.300 1 ATOM 10 O O . GLU 455 455 ? A 320.726 385.779 323.997 1 1 A GLU 0.300 1 ATOM 11 C CB . GLU 455 455 ? A 321.200 388.242 321.887 1 1 A GLU 0.300 1 ATOM 12 C CG . GLU 455 455 ? A 321.210 388.795 320.448 1 1 A GLU 0.300 1 ATOM 13 C CD . GLU 455 455 ? A 320.890 390.289 320.432 1 1 A GLU 0.300 1 ATOM 14 O OE1 . GLU 455 455 ? A 320.850 390.848 319.310 1 1 A GLU 0.300 1 ATOM 15 O OE2 . GLU 455 455 ? A 320.675 390.859 321.534 1 1 A GLU 0.300 1 ATOM 16 N N . ILE 456 456 ? A 322.805 386.685 324.017 1 1 A ILE 0.360 1 ATOM 17 C CA . ILE 456 456 ? A 323.100 386.432 325.418 1 1 A ILE 0.360 1 ATOM 18 C C . ILE 456 456 ? A 322.092 387.137 326.322 1 1 A ILE 0.360 1 ATOM 19 O O . ILE 456 456 ? A 321.462 386.525 327.151 1 1 A ILE 0.360 1 ATOM 20 C CB . ILE 456 456 ? A 324.533 386.841 325.764 1 1 A ILE 0.360 1 ATOM 21 C CG1 . ILE 456 456 ? A 325.526 385.956 324.968 1 1 A ILE 0.360 1 ATOM 22 C CG2 . ILE 456 456 ? A 324.803 386.744 327.287 1 1 A ILE 0.360 1 ATOM 23 C CD1 . ILE 456 456 ? A 326.978 386.453 325.000 1 1 A ILE 0.360 1 ATOM 24 N N . SER 457 457 ? A 321.816 388.436 326.053 1 1 A SER 0.470 1 ATOM 25 C CA . SER 457 457 ? A 320.901 389.248 326.846 1 1 A SER 0.470 1 ATOM 26 C C . SER 457 457 ? A 319.494 388.712 326.911 1 1 A SER 0.470 1 ATOM 27 O O . SER 457 457 ? A 318.898 388.606 327.978 1 1 A SER 0.470 1 ATOM 28 C CB . SER 457 457 ? A 320.814 390.679 326.266 1 1 A SER 0.470 1 ATOM 29 O OG . SER 457 457 ? A 322.099 391.298 326.320 1 1 A SER 0.470 1 ATOM 30 N N . ALA 458 458 ? A 318.938 388.294 325.759 1 1 A ALA 0.510 1 ATOM 31 C CA . ALA 458 458 ? A 317.643 387.663 325.715 1 1 A ALA 0.510 1 ATOM 32 C C . ALA 458 458 ? A 317.612 386.271 326.354 1 1 A ALA 0.510 1 ATOM 33 O O . ALA 458 458 ? A 316.646 385.906 327.010 1 1 A ALA 0.510 1 ATOM 34 C CB . ALA 458 458 ? A 317.110 387.662 324.273 1 1 A ALA 0.510 1 ATOM 35 N N . ALA 459 459 ? A 318.678 385.447 326.210 1 1 A ALA 0.540 1 ATOM 36 C CA . ALA 459 459 ? A 318.780 384.170 326.897 1 1 A ALA 0.540 1 ATOM 37 C C . ALA 459 459 ? A 318.781 384.284 328.421 1 1 A ALA 0.540 1 ATOM 38 O O . ALA 459 459 ? A 318.086 383.524 329.103 1 1 A ALA 0.540 1 ATOM 39 C CB . ALA 459 459 ? A 320.059 383.439 326.442 1 1 A ALA 0.540 1 ATOM 40 N N . VAL 460 460 ? A 319.529 385.262 328.971 1 1 A VAL 0.600 1 ATOM 41 C CA . VAL 460 460 ? A 319.574 385.608 330.387 1 1 A VAL 0.600 1 ATOM 42 C C . VAL 460 460 ? A 318.226 386.074 330.914 1 1 A VAL 0.600 1 ATOM 43 O O . VAL 460 460 ? A 317.775 385.606 331.961 1 1 A VAL 0.600 1 ATOM 44 C CB . VAL 460 460 ? A 320.645 386.664 330.659 1 1 A VAL 0.600 1 ATOM 45 C CG1 . VAL 460 460 ? A 320.646 387.148 332.124 1 1 A VAL 0.600 1 ATOM 46 C CG2 . VAL 460 460 ? A 322.027 386.062 330.353 1 1 A VAL 0.600 1 ATOM 47 N N . GLU 461 461 ? A 317.524 386.957 330.173 1 1 A GLU 0.600 1 ATOM 48 C CA . GLU 461 461 ? A 316.188 387.430 330.485 1 1 A GLU 0.600 1 ATOM 49 C C . GLU 461 461 ? A 315.158 386.323 330.526 1 1 A GLU 0.600 1 ATOM 50 O O . GLU 461 461 ? A 314.368 386.184 331.460 1 1 A GLU 0.600 1 ATOM 51 C CB . GLU 461 461 ? A 315.757 388.473 329.426 1 1 A GLU 0.600 1 ATOM 52 C CG . GLU 461 461 ? A 314.368 389.108 329.663 1 1 A GLU 0.600 1 ATOM 53 C CD . GLU 461 461 ? A 314.195 389.722 331.054 1 1 A GLU 0.600 1 ATOM 54 O OE1 . GLU 461 461 ? A 315.158 389.914 331.848 1 1 A GLU 0.600 1 ATOM 55 O OE2 . GLU 461 461 ? A 313.002 389.961 331.400 1 1 A GLU 0.600 1 ATOM 56 N N . ARG 462 462 ? A 315.205 385.432 329.516 1 1 A ARG 0.570 1 ATOM 57 C CA . ARG 462 462 ? A 314.387 384.244 329.483 1 1 A ARG 0.570 1 ATOM 58 C C . ARG 462 462 ? A 314.658 383.303 330.642 1 1 A ARG 0.570 1 ATOM 59 O O . ARG 462 462 ? A 313.740 382.743 331.230 1 1 A ARG 0.570 1 ATOM 60 C CB . ARG 462 462 ? A 314.589 383.436 328.183 1 1 A ARG 0.570 1 ATOM 61 C CG . ARG 462 462 ? A 313.980 384.039 326.908 1 1 A ARG 0.570 1 ATOM 62 C CD . ARG 462 462 ? A 313.741 383.003 325.800 1 1 A ARG 0.570 1 ATOM 63 N NE . ARG 462 462 ? A 315.057 382.392 325.417 1 1 A ARG 0.570 1 ATOM 64 C CZ . ARG 462 462 ? A 315.858 382.889 324.474 1 1 A ARG 0.570 1 ATOM 65 N NH1 . ARG 462 462 ? A 315.529 384.013 323.855 1 1 A ARG 0.570 1 ATOM 66 N NH2 . ARG 462 462 ? 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A 314.952 389.348 334.748 1 1 A ARG 0.670 1 ATOM 80 C CZ . ARG 464 464 ? A 313.697 389.728 335.007 1 1 A ARG 0.670 1 ATOM 81 N NH1 . ARG 464 464 ? A 313.140 389.598 336.212 1 1 A ARG 0.670 1 ATOM 82 N NH2 . ARG 464 464 ? A 312.957 390.236 334.031 1 1 A ARG 0.670 1 ATOM 83 N N . LYS 465 465 ? A 313.108 385.116 333.955 1 1 A LYS 0.770 1 ATOM 84 C CA . LYS 465 465 ? A 311.677 384.925 334.053 1 1 A LYS 0.770 1 ATOM 85 C C . LYS 465 465 ? A 311.297 383.500 334.407 1 1 A LYS 0.770 1 ATOM 86 O O . LYS 465 465 ? A 310.503 383.301 335.300 1 1 A LYS 0.770 1 ATOM 87 C CB . LYS 465 465 ? A 310.945 385.410 332.785 1 1 A LYS 0.770 1 ATOM 88 C CG . LYS 465 465 ? A 310.841 386.944 332.761 1 1 A LYS 0.770 1 ATOM 89 C CD . LYS 465 465 ? A 310.072 387.475 331.540 1 1 A LYS 0.770 1 ATOM 90 C CE . LYS 465 465 ? A 309.866 388.994 331.572 1 1 A LYS 0.770 1 ATOM 91 N NZ . LYS 465 465 ? A 309.318 389.476 330.286 1 1 A LYS 0.770 1 ATOM 92 N N . ARG 466 466 ? 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A 287.424 361.414 368.620 1 1 A GLU 0.520 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O S # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.626 2 1 3 0 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 454 SER 1 0.190 2 1 A 455 GLU 1 0.300 3 1 A 456 ILE 1 0.360 4 1 A 457 SER 1 0.470 5 1 A 458 ALA 1 0.510 6 1 A 459 ALA 1 0.540 7 1 A 460 VAL 1 0.600 8 1 A 461 GLU 1 0.600 9 1 A 462 ARG 1 0.570 10 1 A 463 ALA 1 0.790 11 1 A 464 ARG 1 0.670 12 1 A 465 LYS 1 0.770 13 1 A 466 ARG 1 0.680 14 1 A 467 ARG 1 0.680 15 1 A 468 GLU 1 0.720 16 1 A 469 GLU 1 0.700 17 1 A 470 GLU 1 0.680 18 1 A 471 GLU 1 0.660 19 1 A 472 ARG 1 0.600 20 1 A 473 ARG 1 0.570 21 1 A 474 MET 1 0.620 22 1 A 475 GLU 1 0.620 23 1 A 476 GLU 1 0.620 24 1 A 477 GLN 1 0.700 25 1 A 478 ARG 1 0.630 26 1 A 479 LYS 1 0.680 27 1 A 480 ALA 1 0.760 28 1 A 481 ALA 1 0.790 29 1 A 482 CYS 1 0.740 30 1 A 483 ALA 1 0.760 31 1 A 484 GLU 1 0.680 32 1 A 485 LYS 1 0.700 33 1 A 486 LEU 1 0.680 34 1 A 487 LYS 1 0.640 35 1 A 488 GLN 1 0.680 36 1 A 489 LEU 1 0.680 37 1 A 490 ASP 1 0.630 38 1 A 491 GLU 1 0.610 39 1 A 492 LYS 1 0.670 40 1 A 493 LEU 1 0.640 41 1 A 494 GLY 1 0.670 42 1 A 495 ILE 1 0.630 43 1 A 496 ILE 1 0.530 44 1 A 497 GLU 1 0.520 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #