data_SMR-562cc52c95caf01bdeb1e96012417c03_7 _entry.id SMR-562cc52c95caf01bdeb1e96012417c03_7 _struct.entry_id SMR-562cc52c95caf01bdeb1e96012417c03_7 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q9Y520 (isoform 2)/ PRC2C_HUMAN, Protein PRRC2C Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q9Y520 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 364379.201 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP PRC2C_HUMAN Q9Y520 1 ;MSEKSGQSTKAKDGKKYATLSLFNTYKGKSLETQKTTARHGLQSLGKVGISRRMPPPANLPSLKAENKGN DPNVNIVPKDGTGWASKQEQHEEEKTPEVPPAQPKPGVAAPPEVAPAPKSWASNKQGGQGDGIQVNSQFQ QEFPSLQAAGDQEKKEKETNDDNYGPGPSLRPPNVACWRDGGKAAGSPSSSDQDEKLPGQDESTAGTSEQ NDILKVVEKRIACGPPQAKLNGQQAALASQYRAMMPPYMFQQYPRMTYPPLHGPMRFPPSLSETNKGLRG RGPPPSWASEPERPSILSASELKELDKFDNLDAEADEGWAGAQMEVDYTEQLNFSDDDEQGSNSPKENNS EDQGSKASENNENKKETDEVSNTKSSSQIPAQPSVAKVPYGKGPSFNQERGTSSHLPPPPKLLAQQHPPP DRQAVPGRPGPFPSKQQVADEDEIWKQRRRQQSEISAAVERARKRREEEERRMEEQRKAACAEKLKRLDE KLGILEKQPSPEEIREREREKEREREKELEKEQEQEREKEREKDRERQQEKEKELEKEQEKQREMEKERK QEKEKELERQKEKEKELQKMKEQEKECELEKEREKLEEKIEPREPNLEPMVEKQESENSCNKEEEPVFTR QDSNRSEKEATPVVHETEPESGSQPRPAVLSGYFKQFQKSLPPRFQRQQEQMKQQQWQQQQQQGVLPQTV PSQPSSSTVPPPPHRPLYQPMQPHPQHLASMGFDPRWLMMQSYMDPRMMSGRPAMDIPPIHPGMIPPKPL MRRDQMEGSPNSSESFEHIARSARDHAISLSEPRMLWGSDPYPHAEPQQATTPKATEEPEDVRSEAALDQ EQITAAYSVEHNQLEAHPKADFIRESSEAQVQKFLSRSVEDVRPHHTDANNQSACFEAPDQKTLSAPQEE RISAVESQPSRKRSVSHGSNHTQKPDEQRSEPSAGIPKVTSRCIDSKEPIERPEEKPKKEGFIRSSEGPK PEKVYKSKSETRWGPRPSSNRREEVNDRPVRRSGPIKKPVLRDMKEEREQRKEKEGEKAEKVTEKVVVKP EKTEKKDLPPPPPPPQPPAPIQPQSVPPPIQPEAEKFPSTETATLAQKPSQDTEKPLEPVSTVQVEPAVK TVNQQTMAAPVVKEEKQPEKVISKDLVIERPRPDSRPAVKKESTLPPRTYWKEARERDWFPDQGYRGRGR GEYYSRGRSYRGSYGGRGRGGRGHTRDYPQYRDNKPRAEHIPSGPLRQREESETRSESSDFEVVPKRRRQ RGSETDTDSEIHESASDKDSLSKGKLPKREERPENKKPVKPHSSFKPDNHVRIDNRLLEKPYVRDDDKAK PGFLPKGEPTRRGRGGTFRRGGRDPGGRPSRPSTLRRPAYRDNQWNPRQSEVPKPEDGEPPRRHEQFIPI AADKRPPKFERKFDPARERPRRQRPTRPPRQDKPPRFRRLREREAASKSNEVVAVPTNGTVNNVAQEPVN TLGDISGNKTPDLSNQNSSDQANEEWETASESSDFNERRERDEKKNADLNAQTVVKVGENVLPPKREIAK RSFSSQRPVDRQNRRGNNGPPKSGRNFSGPRNERRSGPPSKSGKRGPFDDQPAGTTGVDLINGSSAHHQE GVPNGTGQKNSKDSTGKKREDPKPGPKKPKEKVDALSQFDLNNYASVVIIDDHPEVTVIEDPQSNLNDDG FTEVVSKKQQKRLQDEERRKKEEQVIQVWNKKNANEKGRSQTSKLPPRFAKKQATGIQQAQSSASVPPLA SAPLPPSTLAPVSASASVSASVPASTSAAAITSSSAPASAPAPTPILASVSTPASVTILASASIPILASA LASTSAPTPAPAASSPAAPVITAPTIPASAPTASVPLAPASASAPAPAPTPVSAPNPAPPAPAQTQAQTH KPVQNPLQTTSQSSKQPPPSIRLPSAQTPNGTDYVASGKSIQTPQSHGTLTAELWDNKVAPPAVLNDISK KLGPISPPQPPSVSAWNKPLTSFGSAPSSEGAKNGQESGLEIGTDTIQFGAPASNGNENEVVPVLSEKSA DKIPEPKEQRQKQPRAGPIKAQKLPDLSPVENKEHKPGPIGKERSLKNRKVKDAQQVEPEGQEKPSPATV RSTDPVTTKETKAVSEMSTEIGTMISVSSAEYGTNAKESVTDYTTPSSSLPNTVATNNTKMEDTLVNNVP LPNTLPLPKRETIQQSSSLTSVPPTTFSLTFKMESARKAWENSPNVREKGSPVTSTAPPIATGVSSSASG PSTANYNSFSSASMPQIPVASVTPTASLSGAGTYTTSSLSTKSTTTSDPPNICKVKPQQLQTSSLPSASH FSQLSCMPSLIAQQQQNPQVYVSQSAAAQIPAFYMDTSHLFNTQHARLAPPSLAQQQGFQPGLSQPTSVQ QIPIPIYAPLQGQHQAQLSLGAGPAVSQAQELFSSSLQPYRSQPAFMQSSLSQPSVVLSGTAIHNFPTVQ HQELAKAQSGLAFQQTSNTQPIPILYEHQLGQASGLGGSQLIDTHLLQARANLTQASNLYSGQVQQPGQT NFYNTAQSPSALQQVTVPLPASQLSLPNFGSTGQPLIALPQTLQPPLQHTTPQAQAQSLSRPAQVSQPFR GLIPAGTQHSMIATTGKMSEMELKAFGSGIDIKPGTPPIAGRSTTPTSSPFRATSTSPNSQSSKMNSIVY QKQFQSAPATVRMTQPFPTQFAPQILSQPNLVPPLVRAPHTNTFPAPVQRPPMALASQMPPPLTTGLMSH ARLPHVARGPCGSLSGVRGNQAQAALKAEQDMKAKQRAEVLQSTQRFFSEQQQSKQIGGGKAQKVDSDSS KPPETLTDPPGVCQEKVEEKPPPAPSIATKPVRTGPIKPQAIKTEETKS ; 'Protein PRRC2C' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2849 1 2849 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . 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A 1 2844 THR 2844 ? ? ? B . A 1 2845 GLU 2845 ? ? ? B . A 1 2846 GLU 2846 ? ? ? B . A 1 2847 THR 2847 ? ? ? B . A 1 2848 LYS 2848 ? ? ? B . A 1 2849 SER 2849 ? ? ? B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Ribosomal RNA-processing protein 17 {PDB ID=7naf, label_asym_id=B, auth_asym_id=5, SMTL ID=7naf.1.B}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 7naf, label_asym_id=B' 'target-template alignment' . 4 'model 7' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-04 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-29 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A B 2 1 5 # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;NRQILTRGKQSKKFGTDEVTFDKDSRLDYLTGFHKRKLQRQKKAQEFIKEQERLRKIEERQKIRQERKEV MEEQLKTFKESLNLKFRYLTKNERRINQRKANDNK ; ;NRQILTRGKQSKKFGTDEVTFDKDSRLDYLTGFHKRKLQRQKKAQEFIKEQERLRKIEERQKIRQERKEV MEEQLKTFKESLNLKFRYLTKNERRINQRKANDNK ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 48 91 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 7naf 2024-06-05 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2849 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2849 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 58.000 27.273 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MSEKSGQSTKAKDGKKYATLSLFNTYKGKSLETQKTTARHGLQSLGKVGISRRMPPPANLPSLKAENKGNDPNVNIVPKDGTGWASKQEQHEEEKTPEVPPAQPKPGVAAPPEVAPAPKSWASNKQGGQGDGIQVNSQFQQEFPSLQAAGDQEKKEKETNDDNYGPGPSLRPPNVACWRDGGKAAGSPSSSDQDEKLPGQDESTAGTSEQNDILKVVEKRIACGPPQAKLNGQQAALASQYRAMMPPYMFQQYPRMTYPPLHGPMRFPPSLSETNKGLRGRGPPPSWASEPERPSILSASELKELDKFDNLDAEADEGWAGAQMEVDYTEQLNFSDDDEQGSNSPKENNSEDQGSKASENNENKKETDEVSNTKSSSQIPAQPSVAKVPYGKGPSFNQERGTSSHLPPPPKLLAQQHPPPDRQAVPGRPGPFPSKQQVADEDEIWKQRRRQQSEISAAVERARKRREEEERRMEEQRKAACAEKLKRLDEKLGILEKQPSPEEIREREREKEREREKELEKEQEQEREKEREKDRERQQEKEKELEKEQEKQREMEKERKQEKEKELERQKEKEKELQKMKEQEKECELEKEREKLEEKIEPREPNLEPMVEKQESENSCNKEEEPVFTRQDSNRSEKEATPVVHETEPESGSQPRPAVLSGYFKQFQKSLPPRFQRQQEQMKQQQWQQQQQQGVLPQTVPSQPSSSTVPPPPHRPLYQPMQPHPQHLASMGFDPRWLMMQSYMDPRMMSGRPAMDIPPIHPGMIPPKPLMRRDQMEGSPNSSESFEHIARSARDHAISLSEPRMLWGSDPYPHAEPQQATTPKATEEPEDVRSEAALDQEQITAAYSVEHNQLEAHPKADFIRESSEAQVQKFLSRSVEDVRPHHTDANNQSACFEAPDQKTLSAPQEERISAVESQPSRKRSVSHGSNHTQKPDEQRSEPSAGIPKVTSRCIDSKEPIERPEEKPKKEGFIRSSEGPKPEKVYKSKSETRWGPRPSSNRREEVNDRPVRRSGPIKKPVLRDMKEEREQRKEKEGEKAEKVTEKVVVKPEKTEKKDLPPPPPPPQPPAPIQPQSVPPPIQPEAEKFPSTETATLAQKPSQDTEKPLEPVSTVQVEPAVKTVNQQTMAAPVVKEEKQPEKVISKDLVIERPRPDSRPAVKKESTLPPRTYWKEARERDWFPDQGYRGRGRGEYYSRGRSYRGSYGGRGRGGRGHTRDYPQYRDNKPRAEHIPSGPLRQREESETRSESSDFEVVPKRRRQRGSETDTDSEIHESASDKDSLSKGKLPKREERPENKKPVKPHSSFKPDNHVRIDNRLLEKPYVRDDDKAKPGFLPKGEPTRRGRGGTFRRGGRDPGGRPSRPSTLRRPAYRDNQWNPRQSEVPKPEDGEPPRRHEQFIPIAADKRPPKFERKFDPARERPRRQRPTRPPRQDKPPRFRRLREREAASKSNEVVAVPTNGTVNNVAQEPVNTLGDISGNKTPDLSNQNSSDQANEEWETASESSDFNERRERDEKKNADLNAQTVVKVGENVLPPKREIAKRSFSSQRPVDRQNRRGNNGPPKSGRNFSGPRNERRSGPPSKSGKRGPFDDQPAGTTGVDLINGSSAHHQEGVPNGTGQKNSKDSTGKKREDPKPGPKKPKEKVDALSQFDLNNYASVVIIDDHPEVTVIEDPQSNLNDDGFTEVVSKKQQKRLQDEERRKKEEQVIQVWNKKNANEKGRSQTSKLPPRFAKKQATGIQQAQSSASVPPLASAPLPPSTLAPVSASASVSASVPASTSAAAITSSSAPASAPAPTPILASVSTPASVTILASASIPILASALASTSAPTPAPAASSPAAPVITAPTIPASAPTASVPLAPASASAPAPAPTPVSAPNPAPPAPAQTQAQTHKPVQNPLQTTSQSSKQPPPSIRLPSAQTPNGTDYVASGKSIQTPQSHGTLTAELWDNKVAPPAVLNDISKKLGPISPPQPPSVSAWNKPLTSFGSAPSSEGAKNGQESGLEIGTDTIQFGAPASNGNENEVVPVLSEKSADKIPEPKEQRQKQPRAGPIKAQKLPDLSPVENKEHKPGPIGKERSLKNRKVKDAQQVEPEGQEKPSPATVRSTDPVTTKETKAVSEMSTEIGTMISVSSAEYGTNAKESVTDYTTPSSSLPNTVATNNTKMEDTLVNNVPLPNTLPLPKRETIQQSSSLTSVPPTTFSLTFKMESARKAWENSPNVREKGSPVTSTAPPIATGVSSSASGPSTANYNSFSSASMPQIPVASVTPTASLSGAGTYTTSSLSTKSTTTSDPPNICKVKPQQLQTSSLPSASHFSQLSCMPSLIAQQQQNPQVYVSQSAAAQIPAFYMDTSHLFNTQHARLAPPSLAQQQGFQPGLSQPTSVQQIPIPIYAPLQGQHQAQLSLGAGPAVSQAQELFSSSLQPYRSQPAFMQSSLSQPSVVLSGTAIHNFPTVQHQELAKAQSGLAFQQTSNTQPIPILYEHQLGQASGLGGSQLIDTHLLQARANLTQASNLYSGQVQQPGQTNFYNTAQSPSALQQVTVPLPASQLSLPNFGSTGQPLIALPQTLQPPLQHTTPQAQAQSLSRPAQVSQPFRGLIPAGTQHSMIATTGKMSEMELKAFGSGIDIKPGTPPIAGRSTTPTSSPFRATSTSPNSQSSKMNSIVYQKQFQSAPATVRMTQPFPTQFAPQILSQPNLVPPLVRAPHTNTFPAPVQRPPMALASQMPPPLTTGLMSHARLPHVARGPCGSLSGVRGNQAQAALKAEQDMKAKQRAEVLQSTQRFFSEQQQSKQIGGGKAQKVDSDSSKPPETLTDPPGVCQEKVEEKPPPAPSIATKPVRTGPIKPQAIKTEETKS 2 1 2 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------IKEQERLRKIEERQKIRQERKEVMEEQLKTFKESLNLKFRYLTK-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 7naf.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 7' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . ALA 458 458 ? A 150.709 243.381 199.767 1 1 B ALA 0.560 1 ATOM 2 C CA . ALA 458 458 ? A 150.989 241.923 199.588 1 1 B ALA 0.560 1 ATOM 3 C C . ALA 458 458 ? A 152.469 241.591 199.560 1 1 B ALA 0.560 1 ATOM 4 O O . ALA 458 458 ? A 152.910 240.795 200.378 1 1 B ALA 0.560 1 ATOM 5 C CB . ALA 458 458 ? A 150.225 241.425 198.346 1 1 B ALA 0.560 1 ATOM 6 N N . VAL 459 459 ? A 153.270 242.251 198.690 1 1 B VAL 0.620 1 ATOM 7 C CA . VAL 459 459 ? A 154.711 242.054 198.557 1 1 B VAL 0.620 1 ATOM 8 C C . VAL 459 459 ? A 155.488 242.132 199.872 1 1 B VAL 0.620 1 ATOM 9 O O . VAL 459 459 ? A 156.204 241.209 200.218 1 1 B VAL 0.620 1 ATOM 10 C CB . VAL 459 459 ? A 155.258 243.060 197.549 1 1 B VAL 0.620 1 ATOM 11 C CG1 . VAL 459 459 ? A 156.791 242.973 197.420 1 1 B VAL 0.620 1 ATOM 12 C CG2 . VAL 459 459 ? A 154.609 242.805 196.173 1 1 B VAL 0.620 1 ATOM 13 N N . GLU 460 460 ? A 155.277 243.188 200.693 1 1 B GLU 0.470 1 ATOM 14 C CA . GLU 460 460 ? A 155.887 243.258 202.015 1 1 B GLU 0.470 1 ATOM 15 C C . GLU 460 460 ? A 155.513 242.143 202.974 1 1 B GLU 0.470 1 ATOM 16 O O . GLU 460 460 ? A 156.354 241.627 203.707 1 1 B GLU 0.470 1 ATOM 17 C CB . GLU 460 460 ? A 155.577 244.610 202.702 1 1 B GLU 0.470 1 ATOM 18 C CG . GLU 460 460 ? A 156.431 245.775 202.153 1 1 B GLU 0.470 1 ATOM 19 C CD . GLU 460 460 ? A 157.926 245.430 202.150 1 1 B GLU 0.470 1 ATOM 20 O OE1 . GLU 460 460 ? A 158.502 245.114 203.233 1 1 B GLU 0.470 1 ATOM 21 O OE2 . GLU 460 460 ? A 158.494 245.388 201.033 1 1 B GLU 0.470 1 ATOM 22 N N . ARG 461 461 ? A 154.245 241.699 203.010 1 1 B ARG 0.460 1 ATOM 23 C CA . ARG 461 461 ? A 153.867 240.554 203.824 1 1 B ARG 0.460 1 ATOM 24 C C . ARG 461 461 ? A 154.520 239.259 203.364 1 1 B ARG 0.460 1 ATOM 25 O O . ARG 461 461 ? A 154.974 238.451 204.176 1 1 B ARG 0.460 1 ATOM 26 C CB . ARG 461 461 ? A 152.334 240.357 203.872 1 1 B ARG 0.460 1 ATOM 27 C CG . ARG 461 461 ? A 151.586 241.496 204.595 1 1 B ARG 0.460 1 ATOM 28 C CD . ARG 461 461 ? A 150.110 241.189 204.889 1 1 B ARG 0.460 1 ATOM 29 N NE . ARG 461 461 ? A 149.379 241.049 203.578 1 1 B ARG 0.460 1 ATOM 30 C CZ . ARG 461 461 ? A 148.662 242.014 202.990 1 1 B ARG 0.460 1 ATOM 31 N NH1 . ARG 461 461 ? A 148.691 243.267 203.431 1 1 B ARG 0.460 1 ATOM 32 N NH2 . ARG 461 461 ? A 147.929 241.731 201.914 1 1 B ARG 0.460 1 ATOM 33 N N . ALA 462 462 ? A 154.605 239.043 202.038 1 1 B ALA 0.580 1 ATOM 34 C CA . ALA 462 462 ? A 155.316 237.927 201.465 1 1 B ALA 0.580 1 ATOM 35 C C . ALA 462 462 ? A 156.815 237.967 201.742 1 1 B ALA 0.580 1 ATOM 36 O O . ALA 462 462 ? A 157.418 236.942 202.058 1 1 B ALA 0.580 1 ATOM 37 C CB . ALA 462 462 ? A 155.002 237.816 199.966 1 1 B ALA 0.580 1 ATOM 38 N N . ARG 463 463 ? A 157.444 239.156 201.679 1 1 B ARG 0.540 1 ATOM 39 C CA . ARG 463 463 ? A 158.831 239.349 202.057 1 1 B ARG 0.540 1 ATOM 40 C C . ARG 463 463 ? A 159.099 239.033 203.523 1 1 B ARG 0.540 1 ATOM 41 O O . ARG 463 463 ? A 160.030 238.302 203.849 1 1 B ARG 0.540 1 ATOM 42 C CB . ARG 463 463 ? A 159.273 240.802 201.756 1 1 B ARG 0.540 1 ATOM 43 C CG . ARG 463 463 ? A 160.788 241.053 201.881 1 1 B ARG 0.540 1 ATOM 44 C CD . ARG 463 463 ? A 161.189 242.532 201.746 1 1 B ARG 0.540 1 ATOM 45 N NE . ARG 463 463 ? A 160.710 243.278 202.949 1 1 B ARG 0.540 1 ATOM 46 C CZ . ARG 463 463 ? A 161.351 243.273 204.118 1 1 B ARG 0.540 1 ATOM 47 N NH1 . ARG 463 463 ? A 162.487 242.604 204.319 1 1 B ARG 0.540 1 ATOM 48 N NH2 . ARG 463 463 ? A 160.878 244.024 205.105 1 1 B ARG 0.540 1 ATOM 49 N N . LYS 464 464 ? A 158.242 239.525 204.440 1 1 B LYS 0.630 1 ATOM 50 C CA . LYS 464 464 ? A 158.373 239.263 205.862 1 1 B LYS 0.630 1 ATOM 51 C C . LYS 464 464 ? A 158.212 237.801 206.239 1 1 B LYS 0.630 1 ATOM 52 O O . LYS 464 464 ? A 158.999 237.260 207.013 1 1 B LYS 0.630 1 ATOM 53 C CB . LYS 464 464 ? A 157.349 240.096 206.668 1 1 B LYS 0.630 1 ATOM 54 C CG . LYS 464 464 ? A 157.658 241.600 206.682 1 1 B LYS 0.630 1 ATOM 55 C CD . LYS 464 464 ? A 156.542 242.409 207.360 1 1 B LYS 0.630 1 ATOM 56 C CE . LYS 464 464 ? A 156.800 243.917 207.304 1 1 B LYS 0.630 1 ATOM 57 N NZ . LYS 464 464 ? A 155.730 244.653 208.017 1 1 B LYS 0.630 1 ATOM 58 N N . ARG 465 465 ? A 157.207 237.092 205.681 1 1 B ARG 0.610 1 ATOM 59 C CA . ARG 465 465 ? A 157.053 235.671 205.945 1 1 B ARG 0.610 1 ATOM 60 C C . ARG 465 465 ? A 158.193 234.840 205.391 1 1 B ARG 0.610 1 ATOM 61 O O . ARG 465 465 ? A 158.581 233.842 205.998 1 1 B ARG 0.610 1 ATOM 62 C CB . ARG 465 465 ? A 155.683 235.101 205.507 1 1 B ARG 0.610 1 ATOM 63 C CG . ARG 465 465 ? A 155.458 235.020 203.989 1 1 B ARG 0.610 1 ATOM 64 C CD . ARG 465 465 ? A 154.053 234.538 203.635 1 1 B ARG 0.610 1 ATOM 65 N NE . ARG 465 465 ? A 153.948 234.524 202.144 1 1 B ARG 0.610 1 ATOM 66 C CZ . ARG 465 465 ? 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A 163.107 238.502 201.162 1 1 B ARG 0.610 1 ATOM 80 N N . GLU 467 467 ? A 161.447 235.954 205.204 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 81 C CA . GLU 467 467 ? A 162.525 236.138 206.166 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 82 C C . GLU 467 467 ? A 162.285 235.369 207.463 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 83 O O . GLU 467 467 ? A 163.194 234.783 208.053 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 84 C CB . GLU 467 467 ? A 162.810 237.646 206.353 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 85 C CG . GLU 467 467 ? A 163.392 238.220 205.032 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 86 C CD . GLU 467 467 ? A 163.373 239.733 204.859 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 87 O OE1 . GLU 467 467 ? A 163.169 240.506 205.834 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 88 O OE2 . GLU 467 467 ? A 163.508 240.157 203.667 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 89 N N . GLU 468 468 ? A 161.020 235.272 207.910 1 1 B GLU 0.710 1 ATOM 90 C CA . GLU 468 468 ? A 160.631 234.383 208.988 1 1 B GLU 0.710 1 ATOM 91 C C . GLU 468 468 ? A 160.873 232.895 208.729 1 1 B GLU 0.710 1 ATOM 92 O O . GLU 468 468 ? 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A 179.461 217.141 220.167 1 1 B LEU 0.610 1 ATOM 236 C CB . LEU 485 485 ? A 178.726 219.865 218.349 1 1 B LEU 0.610 1 ATOM 237 C CG . LEU 485 485 ? A 180.008 220.371 219.041 1 1 B LEU 0.610 1 ATOM 238 C CD1 . LEU 485 485 ? A 181.278 219.942 218.294 1 1 B LEU 0.610 1 ATOM 239 C CD2 . LEU 485 485 ? A 179.969 221.901 219.159 1 1 B LEU 0.610 1 ATOM 240 N N . LYS 486 486 ? A 177.366 217.866 220.408 1 1 B LYS 0.650 1 ATOM 241 C CA . LYS 486 486 ? A 177.189 217.257 221.716 1 1 B LYS 0.650 1 ATOM 242 C C . LYS 486 486 ? A 177.244 215.734 221.702 1 1 B LYS 0.650 1 ATOM 243 O O . LYS 486 486 ? A 177.831 215.120 222.592 1 1 B LYS 0.650 1 ATOM 244 C CB . LYS 486 486 ? A 175.895 217.750 222.405 1 1 B LYS 0.650 1 ATOM 245 C CG . LYS 486 486 ? A 175.798 219.267 222.690 1 1 B LYS 0.650 1 ATOM 246 C CD . LYS 486 486 ? A 176.852 219.836 223.662 1 1 B LYS 0.650 1 ATOM 247 C CE . LYS 486 486 ? A 178.113 220.347 222.952 1 1 B LYS 0.650 1 ATOM 248 N NZ . LYS 486 486 ? 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'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.600 2 1 3 0 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 458 ALA 1 0.560 2 1 A 459 VAL 1 0.620 3 1 A 460 GLU 1 0.470 4 1 A 461 ARG 1 0.460 5 1 A 462 ALA 1 0.580 6 1 A 463 ARG 1 0.540 7 1 A 464 LYS 1 0.630 8 1 A 465 ARG 1 0.610 9 1 A 466 ARG 1 0.610 10 1 A 467 GLU 1 0.690 11 1 A 468 GLU 1 0.710 12 1 A 469 GLU 1 0.700 13 1 A 470 GLU 1 0.700 14 1 A 471 ARG 1 0.680 15 1 A 472 ARG 1 0.660 16 1 A 473 MET 1 0.630 17 1 A 474 GLU 1 0.630 18 1 A 475 GLU 1 0.600 19 1 A 476 GLN 1 0.630 20 1 A 477 ARG 1 0.590 21 1 A 478 LYS 1 0.620 22 1 A 479 ALA 1 0.660 23 1 A 480 ALA 1 0.660 24 1 A 481 CYS 1 0.550 25 1 A 482 ALA 1 0.610 26 1 A 483 GLU 1 0.580 27 1 A 484 LYS 1 0.610 28 1 A 485 LEU 1 0.610 29 1 A 486 LYS 1 0.650 30 1 A 487 ARG 1 0.620 31 1 A 488 LEU 1 0.640 32 1 A 489 ASP 1 0.660 33 1 A 490 GLU 1 0.610 34 1 A 491 LYS 1 0.640 35 1 A 492 LEU 1 0.600 36 1 A 493 GLY 1 0.650 37 1 A 494 ILE 1 0.610 38 1 A 495 LEU 1 0.550 39 1 A 496 GLU 1 0.540 40 1 A 497 LYS 1 0.570 41 1 A 498 GLN 1 0.510 42 1 A 499 PRO 1 0.310 43 1 A 500 SER 1 0.550 44 1 A 501 PRO 1 0.470 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #