data_SMR-a73d6b0b980c7598614080c807f5d90a_3 _entry.id SMR-a73d6b0b980c7598614080c807f5d90a_3 _struct.entry_id SMR-a73d6b0b980c7598614080c807f5d90a_3 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q9Y520 (isoform 2)/ PRC2C_HUMAN, Protein PRRC2C Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q9Y520 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 369708.019 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP PRC2C_HUMAN Q9Y520 1 ;MSEKSGQSTKAKDGKKYATLSLFNTYKGKSLETQKTTVAARHGLQSLGKVGISRRMPPPANLPSLKAENK GNDPNVNIVPKDGTGWASKQEQHEEEKTPEVPPAQPKPGVAAPPEVAPAPKSWASNKQGGQGDGIQVNSQ FQQEFPSLQAAGDQEKKEKETNDDNYGPGPSLRPPNVACWRDGGKAAGSPSSSDQDEKLPGQDESTAGTS EQNDILKVVEKRIACGPPQAKLNGQQAALASQYRAMMPPYMFQQYPRMTYPPLHGPMRFPPSLSETNKGL RGRGPPPSWASEPERPSILSASELKELDKFDNLDAEADEGWAGAQMEVDYTEQLNFSDDDEQGSNSPKEN NSEDQGSKASENNENKKETDEVSNTKSSSQIPAQPSVAKVPYGKGPSFNQERGTSSHLPPPPKLLAQQHP PPDRQAVPGRPGPFPSKQQVADEDEIWKQRRRQQSEISAAVERARKRREEEERRMEEQRKAACAEKLKRL DEKLGILEKQPSPEEIREREREKEREREKELEKEQEQEREKEREKDRERQQEKEKELEKEQEKQREMEKE RKQEKEKELERQKEKEKELQKMKEQEKECELEKEREKLEEKIEPREPNLEPMVEKQESENSCNKEEEPVF TRQDSNRSEKEATPVVHETEPESGSQPRPAVLSGYFKQFQKSLPPRFQRQQEQMKQQQWQQQQQQGVLPQ TVPSQPSSSTVPPPPHRPLYQPMQPHPQHLASMGFDPRWLMMQSYMDPRMMSGRPAMDIPPIHPGMIPPK PLMRRDQMEGSPNSSESFEHIARSARDHAISLSEPRMLWGSDPYPHAEPQQATTPKATEEPEDVRSEAAL DQEQITAAYSVEHNQLEAHPKADFIRESSEAQVQKFLSRSVEDVRPHHTDANNQSACFEAPDQKTLSAPQ EERISAVESQPSRKRSVSHGSNHTQKPDEQRSEPSAGIPKVTSRCIDSKEPIERPEEKPKKEGFIRSSEG PKPEKVYKSKSETRWGPRPSSNRREEVNDRPVRRSGPIKKPVLRDMKEEREQRKEKEGEKAEKVTEKVVV KPEKTEKKDLPPPPPPPQPPAPIQPQSVPPPIQPEAEKFPSTETATLAQKPSQDTEKPLEPVSTVQVEPA VKTVNQQTMAAPVVKEEKQPEKVISKDLVIERPRPDSRPAVKKESTLPPRTYWKEARERDWFPDQGYRGR GRGEYYSRGRSYRGSYGGRGRGGRGHTRDYPQYRDNKPRAEHIPSGPLRQREESETRSESSDFEVVPKRR RQRGSETDTDSEIHESASDKDSLSKGKLPKREERPENKKPVKPHSSFKPDNHVRIDNRLLEKPYVRDDDK AKPGFLPKGEPTRRGRGGTFRRGGRDPGGRPSRPSTLRRPAYRDNQWNPRQSEVPKPEDGEPPRRHEQFI PIAADKRPPKFERKFDPARERPRRQRPTRPPRQDKPPRFRRLREREAASKSNEVVAVPTNGTVNNVAQEP VNTLGDISGNKTPDLSNQNSSDQANEEWETASESSDFNERRERDEKKNADLNAQTVVKVGENVLPPKREI AKRSFSSQRPVDRQNRRGNNGPPKSGRNFSGPRNERRSGPPSKSGKRGPFDDQPAGTTGVDLINGSSAHH QEGVPNGTGQKNSKDSTGKKREDPKPGPKKPKEKVDALSQFDLNNYASVVIIDDHPEVTVIEDPQSNLND DGFTEVVSKKQQKRLQDEERRKKEEQVIQVWNKKNANEKGRSQTSKLPPRFAKKQATGIQQAQSSASVPP LASAPLPPSTSASVPASTSAPLPATLTPVPASTSAPVPASTLAPVLASTSAPVPASPLAPVSASASVSAS VPASTSAAAITSSSAPASAPAPTPILASVSTPASVTILASASIPILASALASTSAPTPAPAASSPAAPVI TAPTIPASAPTASVPLAPASASAPAPAPTPVSAPNPAPPAPAQTQAQTHKPVQNPLQTTSQSSKQPPPSI RLPSAQTPNGTDYVASGKSIQTPQSHGTLTAELWDNKVAPPAVLNDISKKLGPISPPQPPSVSAWNKPLT SFGSAPSSEGAKNGQESGLEIGTDTIQFGAPASNGNENEVVPVLSEKSADKIPEPKEQRQKQPRAGPIKA QKLPDLSPVENKEHKPGPIGKERSLKNRKVKDAQQVEPEGQEKPSPATVRSTDPVTTKETKAVSEMSTEI GTMISVSSAEYGTNAKESVTDYTTPSSSLPNTVATNNTKMEDTLVNNVPLPNTLPLPKRETIQQSSSLTS VPPTTFSLTFKMESARKAWENSPNVREKGSPVTSTAPPIATGVSSSASGPSTANYNSFSSASMPQIPVAS VTPTASLSGAGTYTTSSLSTKSTTTSDPPNICKVKPQQLQTSSLPSASHFSQLSCMPSLIAQQQQNPQVY VSQSAAAQIPAFYMDTSHLFNTQHARLAPPSLAQQQGFQPGLSQPTSVQQIPIPIYAPLQGQHQAQLSLG AGPAVSQAQELFSSSLQPYRSQPAFMQSSLSQPSVVLSGTAIHNFPTVQHQELAKAQSGLAFQQTSNTQP IPILYEHQLGQASGLGGSQLIDTHLLQARANLTQASNLYSGQVQQPGQTNFYNTAQSPSALQQVTVPLPA SQLSLPNFGSTGQPLIALPQTLQPPLQHTTPQAQAQSLSRPAQVSQPFRGLIPAGTQHSMIATTGKMSEM ELKAFGSGIDIKPGTPPIAGRSTTPTSSPFRATSTSPNSQSSKMNSIVYQKQFQSAPATVRMTQPFPTQF APQILSQPNLVPPLVRAPHTNTFPAPVQRPPMALASQMPPPLTTGLMSHARLPHVARGPCGSLSGVRGNQ AQAALKAEQDMKAKQRAEVLQSTQRFFSEQQQSKQIGGGKAQKVDSDSSKPPETLTDPPGVCQEKVEEKP PPAPSIATKPVRTGPIKPQAIKTEETKS ; 'Protein PRRC2C' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2898 1 2898 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . PRC2C_HUMAN Q9Y520 Q9Y520-2 1 2898 9606 'Homo sapiens (Human)' 2011-07-27 C2552AD6C203426C # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MSEKSGQSTKAKDGKKYATLSLFNTYKGKSLETQKTTVAARHGLQSLGKVGISRRMPPPANLPSLKAENK GNDPNVNIVPKDGTGWASKQEQHEEEKTPEVPPAQPKPGVAAPPEVAPAPKSWASNKQGGQGDGIQVNSQ FQQEFPSLQAAGDQEKKEKETNDDNYGPGPSLRPPNVACWRDGGKAAGSPSSSDQDEKLPGQDESTAGTS EQNDILKVVEKRIACGPPQAKLNGQQAALASQYRAMMPPYMFQQYPRMTYPPLHGPMRFPPSLSETNKGL RGRGPPPSWASEPERPSILSASELKELDKFDNLDAEADEGWAGAQMEVDYTEQLNFSDDDEQGSNSPKEN NSEDQGSKASENNENKKETDEVSNTKSSSQIPAQPSVAKVPYGKGPSFNQERGTSSHLPPPPKLLAQQHP PPDRQAVPGRPGPFPSKQQVADEDEIWKQRRRQQSEISAAVERARKRREEEERRMEEQRKAACAEKLKRL DEKLGILEKQPSPEEIREREREKEREREKELEKEQEQEREKEREKDRERQQEKEKELEKEQEKQREMEKE RKQEKEKELERQKEKEKELQKMKEQEKECELEKEREKLEEKIEPREPNLEPMVEKQESENSCNKEEEPVF 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A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'STIP1 homology and U-box containing protein 1 {PDB ID=2f42, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=2f42.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 2f42, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 3' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-04 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-29 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GIDPFTQRLNFGDDIPSALRIAKKKRWNSIEEKRISQENELHAYLSKLILAEKERELDDRVKQSDDSQNG GDISKMKSKHDKYLMDMDELFSQVDEKRKKREIPDYLCGKISFELMREPCITPSGITYDRKDIEEHLQRV GHFDPVTRSPLTQDQLIPNLAMKEVIDAFIQENGWVEDY ; ;GIDPFTQRLNFGDDIPSALRIAKKKRWNSIEEKRISQENELHAYLSKLILAEKERELDDRVKQSDDSQNG GDISKMKSKHDKYLMDMDELFSQVDEKRKKREIPDYLCGKISFELMREPCITPSGITYDRKDIEEHLQRV GHFDPVTRSPLTQDQLIPNLAMKEVIDAFIQENGWVEDY ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 7 47 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 2f42 2024-02-14 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2898 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2898 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 45.000 19.512 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MSEKSGQSTKAKDGKKYATLSLFNTYKGKSLETQKTTVAARHGLQSLGKVGISRRMPPPANLPSLKAENKGNDPNVNIVPKDGTGWASKQEQHEEEKTPEVPPAQPKPGVAAPPEVAPAPKSWASNKQGGQGDGIQVNSQFQQEFPSLQAAGDQEKKEKETNDDNYGPGPSLRPPNVACWRDGGKAAGSPSSSDQDEKLPGQDESTAGTSEQNDILKVVEKRIACGPPQAKLNGQQAALASQYRAMMPPYMFQQYPRMTYPPLHGPMRFPPSLSETNKGLRGRGPPPSWASEPERPSILSASELKELDKFDNLDAEADEGWAGAQMEVDYTEQLNFSDDDEQGSNSPKENNSEDQGSKASENNENKKETDEVSNTKSSSQIPAQPSVAKVPYGKGPSFNQERGTSSHLPPPPKLLAQQHPPPDRQAVPGRPGPFPSKQQVADEDEIWKQRRRQQSEISAAVERARKRREEEERRMEEQRKAACAEKLKRLDEKLGILEKQPSPEEIREREREKEREREKELEKEQEQEREKEREKDRERQQEKEKELEKEQEKQREMEKERKQEKEKELERQKEKEKELQKMKEQEKECELEKEREKLEEKIEPREPNLEPMVEKQESENSCNKEEEPVFTRQDSNRSEKEATPVVHETEPESGSQPRPAVLSGYFKQFQKSLPPRFQRQQEQMKQQQWQQQQQQGVLPQTVPSQPSSSTVPPPPHRPLYQPMQPHPQHLASMGFDPRWLMMQSYMDPRMMSGRPAMDIPPIHPGMIPPKPLMRRDQMEGSPNSSESFEHIARSARDHAISLSEPRMLWGSDPYPHAEPQQATTPKATEEPEDVRSEAALDQEQITAAYSVEHNQLEAHPKADFIRESSEAQVQKFLSRSVEDVRPHHTDANNQSACFEAPDQKTLSAPQEERISAVESQPSRKRSVSHGSNHTQKPDEQRSEPSAGIPKVTSRCIDSKEPIERPEEKPKKEGFIRSSEGPKPEKVYKSKSETRWGPRPSSNRREEVNDRPVRRSGPIKKPVLRDMKEEREQRKEKEGEKAEKVTEKVVVKPEKTEKKDLPPPPPPPQPPAPIQPQSVPPPIQPEAEKFPSTETATLAQKPSQDTEKPLEPVSTVQVEPAVKTVNQQTMAAPVVKEEKQPEKVISKDLVIERPRPDSRPAVKKESTLPPRTYWKEARERDWFPDQGYRGRGRGEYYSRGRSYRGSYGGRGRGGRGHTRDYPQYRDNKPRAEHIPSGPLRQREESETRSESSDFEVVPKRRRQRGSETDTDSEIHESASDKDSLSKGKLPKREERPENKKPVKPHSSFKPDNHVRIDNRLLEKPYVRDDDKAKPGFLPKGEPTRRGRGGTFRRGGRDPGGRPSRPSTLRRPAYRDNQWNPRQSEVPKPEDGEPPRRHEQFIPIAADKRPPKFERKFDPARERPRRQRPTRPPRQDKPPRFRRLREREAASKSNEVVAVPTNGTVNNVAQEPVNTLGDISGNKTPDLSNQNSSDQANEEWETASESSDFNERRERDEKKNADLNAQTVVKVGENVLPPKREIAKRSFSSQRPVDRQNRRGNNGPPKSGRNFSGPRNERRSGPPSKSGKRGPFDDQPAGTTGVDLINGSSAHHQEGVPNGTGQKNSKDSTGKKREDPKPGPKKPKEKVDALSQFDLNNYASVVIIDDHPEVTVIEDPQSNLNDDGFTEVVSKKQQKRLQDEERRKKEEQVIQVWNKKNANEKGRSQTSKLPPRFAKKQATGIQQAQSSASVPPLASAPLPPSTSASVPASTSAPLPATLTPVPASTSAPVPASTLAPVLASTSAPVPASPLAPVSASASVSASVPASTSAAAITSSSAPASAPAPTPILASVSTPASVTILASASIPILASALASTSAPTPAPAASSPAAPVITAPTIPASAPTASVPLAPASASAPAPAPTPVSAPNPAPPAPAQTQAQTHKPVQNPLQTTSQSSKQPPPSIRLPSAQTPNGTDYVASGKSIQTPQSHGTLTAELWDNKVAPPAVLNDISKKLGPISPPQPPSVSAWNKPLTSFGSAPSSEGAKNGQESGLEIGTDTIQFGAPASNGNENEVVPVLSEKSADKIPEPKEQRQKQPRAGPIKAQKLPDLSPVENKEHKPGPIGKERSLKNRKVKDAQQVEPEGQEKPSPATVRSTDPVTTKETKAVSEMSTEIGTMISVSSAEYGTNAKESVTDYTTPSSSLPNTVATNNTKMEDTLVNNVPLPNTLPLPKRETIQQSSSLTSVPPTTFSLTFKMESARKAWENSPNVREKGSPVTSTAPPIATGVSSSASGPSTANYNSFSSASMPQIPVASVTPTASLSGAGTYTTSSLSTKSTTTSDPPNICKVKPQQLQTSSLPSASHFSQLSCMPSLIAQQQQNPQVYVSQSAAAQIPAFYMDTSHLFNTQHARLAPPSLAQQQGFQPGLSQPTSVQQIPIPIYAPLQGQHQAQLSLGAGPAVSQAQELFSSSLQPYRSQPAFMQSSLSQPSVVLSGTAIHNFPTVQHQELAKAQSGLAFQQTSNTQPIPILYEHQLGQASGLGGSQLIDTHLLQARANLTQASNLYSGQVQQPGQTNFYNTAQSPSALQQVTVPLPASQLSLPNFGSTGQPLIALPQTLQPPLQHTTPQAQAQSLSRPAQVSQPFRGLIPAGTQHSMIATTGKMSEMELKAFGSGIDIKPGTPPIAGRSTTPTSSPFRATSTSPNSQSSKMNSIVYQKQFQSAPATVRMTQPFPTQFAPQILSQPNLVPPLVRAPHTNTFPAPVQRPPMALASQMPPPLTTGLMSHARLPHVARGPCGSLSGVRGNQAQAALKAEQDMKAKQRAEVLQSTQRFFSEQQQSKQIGGGKAQKVDSDSSKPPETLTDPPGVCQEKVEEKPPPAPSIATKPVRTGPIKPQAIKTEETKS 2 1 2 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------QRLNFGDDIPSALRIAKKKRWNSIEEKRISQENELHAYLSK--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.111}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 2f42.1, oligomeric state (monomer) as predicted' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 3' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . ALA 464 464 ? A -3.138 36.000 52.181 1 1 A ALA 0.290 1 ATOM 2 C CA . ALA 464 464 ? A -3.871 35.056 53.100 1 1 A ALA 0.290 1 ATOM 3 C C . ALA 464 464 ? A -5.234 35.618 53.496 1 1 A ALA 0.290 1 ATOM 4 O O . ALA 464 464 ? A -6.001 35.995 52.613 1 1 A ALA 0.290 1 ATOM 5 C CB . ALA 464 464 ? A -2.988 34.795 54.350 1 1 A ALA 0.290 1 ATOM 6 N N . ARG 465 465 ? A -5.539 35.805 54.804 1 1 A ARG 0.310 1 ATOM 7 C CA . ARG 465 465 ? A -6.767 36.410 55.321 1 1 A ARG 0.310 1 ATOM 8 C C . ARG 465 465 ? A -6.699 37.933 55.311 1 1 A ARG 0.310 1 ATOM 9 O O . ARG 465 465 ? A -7.425 38.652 55.996 1 1 A ARG 0.310 1 ATOM 10 C CB . ARG 465 465 ? A -6.985 35.979 56.789 1 1 A ARG 0.310 1 ATOM 11 C CG . ARG 465 465 ? A -7.145 34.465 57.008 1 1 A ARG 0.310 1 ATOM 12 C CD . ARG 465 465 ? A -7.388 34.166 58.488 1 1 A ARG 0.310 1 ATOM 13 N NE . ARG 465 465 ? A -7.504 32.681 58.634 1 1 A ARG 0.310 1 ATOM 14 C CZ . ARG 465 465 ? A -7.726 32.075 59.807 1 1 A ARG 0.310 1 ATOM 15 N NH1 . ARG 465 465 ? A -7.858 32.780 60.926 1 1 A ARG 0.310 1 ATOM 16 N NH2 . ARG 465 465 ? A -7.824 30.750 59.871 1 1 A ARG 0.310 1 ATOM 17 N N . LYS 466 466 ? A -5.818 38.473 54.465 1 1 A LYS 0.560 1 ATOM 18 C CA . LYS 466 466 ? A -5.640 39.872 54.176 1 1 A LYS 0.560 1 ATOM 19 C C . LYS 466 466 ? A -6.646 40.399 53.166 1 1 A LYS 0.560 1 ATOM 20 O O . LYS 466 466 ? A -6.356 41.324 52.417 1 1 A LYS 0.560 1 ATOM 21 C CB . LYS 466 466 ? A -4.219 40.141 53.630 1 1 A LYS 0.560 1 ATOM 22 C CG . LYS 466 466 ? A -3.054 39.832 54.580 1 1 A LYS 0.560 1 ATOM 23 C CD . LYS 466 466 ? A -1.660 40.159 53.981 1 1 A LYS 0.560 1 ATOM 24 C CE . LYS 466 466 ? A -1.350 41.639 53.606 1 1 A LYS 0.560 1 ATOM 25 N NZ . LYS 466 466 ? A -1.988 42.089 52.353 1 1 A LYS 0.560 1 ATOM 26 N N . ARG 467 467 ? A -7.886 39.883 53.203 1 1 A ARG 0.650 1 ATOM 27 C CA . ARG 467 467 ? A -9.001 40.343 52.400 1 1 A ARG 0.650 1 ATOM 28 C C . ARG 467 467 ? A -9.656 41.541 53.071 1 1 A ARG 0.650 1 ATOM 29 O O . ARG 467 467 ? A -10.613 42.134 52.566 1 1 A ARG 0.650 1 ATOM 30 C CB . ARG 467 467 ? A -10.042 39.204 52.294 1 1 A ARG 0.650 1 ATOM 31 C CG . ARG 467 467 ? A -9.537 37.950 51.542 1 1 A ARG 0.650 1 ATOM 32 C CD . ARG 467 467 ? A -10.667 37.032 51.061 1 1 A ARG 0.650 1 ATOM 33 N NE . ARG 467 467 ? A -11.442 37.822 50.042 1 1 A ARG 0.650 1 ATOM 34 C CZ . ARG 467 467 ? A -12.633 37.475 49.542 1 1 A ARG 0.650 1 ATOM 35 N NH1 . ARG 467 467 ? A -13.221 36.345 49.915 1 1 A ARG 0.650 1 ATOM 36 N NH2 . ARG 467 467 ? A -13.212 38.299 48.674 1 1 A ARG 0.650 1 ATOM 37 N N . ARG 468 468 ? A -9.096 41.991 54.206 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 38 C CA . ARG 468 468 ? A -9.449 43.223 54.880 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 39 C C . ARG 468 468 ? A -9.164 44.435 54.029 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 40 O O . ARG 468 468 ? A -9.874 45.443 54.119 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 41 C CB . ARG 468 468 ? A -8.694 43.359 56.227 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 42 C CG . ARG 468 468 ? A -7.153 43.465 56.135 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 43 C CD . ARG 468 468 ? A -6.506 43.788 57.487 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 44 N NE . ARG 468 468 ? A -5.018 43.597 57.345 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 45 C CZ . ARG 468 468 ? A -4.396 42.407 57.346 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 46 N NH1 . ARG 468 468 ? A -5.084 41.274 57.433 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 47 N NH2 . ARG 468 468 ? A -3.069 42.360 57.282 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 48 N N . GLU 469 469 ? A -8.154 44.381 53.150 1 1 A GLU 0.760 1 ATOM 49 C CA . GLU 469 469 ? A -7.813 45.449 52.253 1 1 A GLU 0.760 1 ATOM 50 C C . GLU 469 469 ? A -8.933 45.779 51.276 1 1 A GLU 0.760 1 ATOM 51 O O . GLU 469 469 ? A -9.209 46.949 50.987 1 1 A GLU 0.760 1 ATOM 52 C CB . GLU 469 469 ? A -6.569 45.033 51.466 1 1 A GLU 0.760 1 ATOM 53 C CG . GLU 469 469 ? A -5.272 44.940 52.291 1 1 A GLU 0.760 1 ATOM 54 C CD . GLU 469 469 ? A -4.117 44.890 51.312 1 1 A GLU 0.760 1 ATOM 55 O OE1 . GLU 469 469 ? A -4.181 45.566 50.252 1 1 A GLU 0.760 1 ATOM 56 O OE2 . GLU 469 469 ? A -3.139 44.168 51.602 1 1 A GLU 0.760 1 ATOM 57 N N . GLU 470 470 ? A -9.636 44.743 50.769 1 1 A GLU 0.760 1 ATOM 58 C CA . GLU 470 470 ? A -10.855 44.862 49.991 1 1 A GLU 0.760 1 ATOM 59 C C . GLU 470 470 ? A -11.947 45.529 50.808 1 1 A GLU 0.760 1 ATOM 60 O O . GLU 470 470 ? A -12.617 46.428 50.297 1 1 A GLU 0.760 1 ATOM 61 C CB . GLU 470 470 ? A -11.339 43.474 49.474 1 1 A GLU 0.760 1 ATOM 62 C CG . GLU 470 470 ? A -10.359 42.803 48.477 1 1 A GLU 0.760 1 ATOM 63 C CD . GLU 470 470 ? A -10.724 41.380 48.015 1 1 A GLU 0.760 1 ATOM 64 O OE1 . GLU 470 470 ? A -11.593 40.673 48.606 1 1 A GLU 0.760 1 ATOM 65 O OE2 . GLU 470 470 ? A -10.044 40.956 47.050 1 1 A GLU 0.760 1 ATOM 66 N N . GLU 471 471 ? A -12.125 45.175 52.100 1 1 A GLU 0.770 1 ATOM 67 C CA . GLU 471 471 ? A -13.103 45.794 52.990 1 1 A GLU 0.770 1 ATOM 68 C C . GLU 471 471 ? A -12.830 47.270 53.299 1 1 A GLU 0.770 1 ATOM 69 O O . GLU 471 471 ? A -13.722 48.110 53.216 1 1 A GLU 0.770 1 ATOM 70 C CB . GLU 471 471 ? A -13.272 44.995 54.316 1 1 A GLU 0.770 1 ATOM 71 C CG . GLU 471 471 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #