data_SMR-c19427401e3b19aeb179220b997641c6_1 _entry.id SMR-c19427401e3b19aeb179220b997641c6_1 _struct.entry_id SMR-c19427401e3b19aeb179220b997641c6_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled homo-dimer covers following UniProtKB entries: - Q12830 (isoform 2)/ BPTF_HUMAN, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q12830 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 378152.802 2 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP BPTF_HUMAN Q12830 1 ;MRGRRGRPPKQPAAPAAERCAPAPPPPPPPPTSGPIGGLRSRHRGSSRGRWAAAQAEVAPKTRLSSPRGG SSSRRKPPPPPPAPPSTSAPGRGGRGGGGGRTGGGGGGGHLARTTAARRAVNKVVYDDHESEEEEEEEDM VSEEEEEEDGDAEETQDSEDDEEDEMEEDDDDSDYPEEMEDDDDDASYCTESSFRSHSTYSSTPGRRKPR VHRPRSPILEEKDIPPLEFPKSSEDLMVPNEHIMNVIAIYEVLRNFGTVLRLSPFRFEDFCAALVSQEQC TLMAEMHVVLLKAVLREEDTSNTTFGPADLKDSVNSTLYFIDGMTWPEVLRVYCESDKEYHHVLPYQEAE DYPYGPVENKIKVLQFLVDQFLTTNIAREELMSEGVIQYDDHCRVCHKLGDLLCCETCSAVYHLECVKPP LEEVPEDEWQCEVCVAHKVPGVTDCVAEIQKNKPYIRHEPIGYDRSRRKYWFLNRRLIIEEDTENENEKK IWYYSTKVQLAELIDCLDKDYWEAELCKILEEMREEIHRHMDITEDLTNKARGSNKSFLAAANEEILESI RAKKGDIDNVKSPEETEKDKNETENDSKDAEKNREEFEDQSLEKDSDDKTPDDDPEQGKSEVGDFKSEKS NGELSESPGAGKGASGSTRIITRLRNPDSKLSQLKSQQVAAAAHEANKLFKEGKEVLVVNSQGEISRLST KKEVIMKGNINNYFKLGQEGKYRVYHNQYSTNSFALNKHQHREDHDKRRHLAHKFCLTPAGEFKWNGSVH GSKVLTISTLRLTITQLENNIPSSFLHPNWASHRANWIKAVQMCSKPREFALALAILECAVKPVVMLPIW RESLGHTRLHRMTSIEREEKEKVKKKEKKQEEEETMQQATWVKYTFPVKHQVWKQKGEEYRVTGYGGWSW ISKTHVYRFVPKLPGNTNVNYRKSLEGTKNNMDENMDESDKRKCSRSPKKIKIEPDSEKDEVKGSDAAKG ADQNEMDISKITEKKDQDVKELLDSDSDKPCKEEPMEVDDDMKTESHVNCQESSQVDVVNVSEGFHLRTS YKKKTKSSKLDGLLERRIKQFTLEEKQRLEKIKLEGGIKGIGKTSTNSSKNLSESPVITKAKEGCQSDSM RQEQSPNANNDQPEDLIQGCSESDSSVLRMSDPSHTTNKLYPKDRVLDDVSIRSPETKCPKQNSIENDIE EKVSDLASRGQEPSKSKTKGNDFFIDDSKLASADDIGTLICKNKKPLIQEESDTIVSSSKSALHSSVPKS TNDRDATPLSRAMDFEGKLGCDSESNSTLENSSDTVSIQDSSEEDMIVQNSNESISEQFRTREQDVEVLE PLKCELVSGESTGNCEDRLPVKGTEANGKKPSQQKKLEERPVNKCSDQIKLKNTTDKKNNENRESEKKGQ RTSTFQINGKDNKPKIYLKGECLKEISESRVVSGNVEPKVNNINKIIPENDIKSLTVKESAIRPFINGDV IMEDFNERNSSETKSHLLSSSDAEGNYRDSLETLPSTKESDSTQTTTPSASCPESNSVNQVEDMEIETSE VKKVTSSPITSEEESNLSNDFIDENGLPINKNENVNGESKRKTVITEVTTMTSTVATESKTVIKVEKGDK QTVVSSTENCAKSTVTTTTTTVTKLSTPSTGGSVDIISVKEQSKTVVTTTVTDSLTTTGGTLVTSMTVSK EYSTRDKVKLMKFSRPKKTRSGTALPSYRKFVTKSSKKSIFVLPNDDLKKLARKGGIREVPYFNYNAKPA LDIWPYPSPRPTFGITWRYRLQTVKSLAGVSLMLRLLWASLRWDDMAAKAPPGGGTTRTETSETEITTTE IIKRRDVGPYGIRSEYCIRKIICPIGVPETPKETPTPQRKGLRSSALRPKRPETPKQTGPVIIETWVAEE ELELWEIRAFAERVEKEKAQAVEQQAKKRLEQQKPTVIATSTTSPTSSTTSTISPAQKVMVAPISGSVTT GTKMVLTTKVGSPATVTFQQNKNFHQTFATWVKQGQSNSGVVQVQQKVLGIIPSSTGTSQQTFTSFQPRT ATVTIRPNTSGSGGTTSNSQVITGPQIRPGMTVIRTPLQQSTLGKAIIRTPVMVQPGAPQQVMTQIIRGQ PVSTAVSAPNTVSSTPGQKSLTSATSTSNIQSSASQPPRPQQGQVKLTMAQLTQLTQGHGGNQGLTVVIQ GQGQTTGQLQLIPQGVTVLPGPGQQLMQAAMPNGTVQRFLFTPLATTATTASTTTTTVSTTAAGTGEQRQ SKLSPQMQVHQDKTLPPAQSSSVGPAEAQPQTAQPSAQPQPQTQPQSPAQPEVQTQPEVQTQTTVSSHVP SEAQPTHAQSSKPQVAAQSQPQSNVQGQSPVRVQSPSQTRIRPSTPSQLSPGQQSQVQTTTSQPIPIQPH TSLQIPSQGQPQSQPQVQSSTQTLSSGQTLNQVTVSSPSRPQLQIQQPQPQVIAVPQLQQQVQVLSQIQS QVVAQIQAQQSGVPQQIKLQLPIQIQQSSAVQTHQIQNVVTVQAASVQEQLQRVQQLRDQQQKKKQQQIE IKREHTLQASNQSEIIQKQVVMKHNAVIEHLKQKKSMTPAEREENQRMIVCNQVMKYILDKIDKEEKQAA KKRKREESVEQKRSKQNATKLSALLFKHKEQLRAEILKKRALLDKDLQIEVQEELKRDLKIKKEKDLMQL AQATAVAAPCPPVTPAPPAPPAPPPSPPPPPAVQHTGLLSTPTLPAASQKRKREEEKDSSSKSKKKKMIS TTSKETKKDTKLYCICKTPYDESKFYIGCDRCQNWYHGRCVGILQSEAELIDEYVCPQCQSTEDAMTVLT PLTEKDYEGLKRVLRSLQAHKMAWPFLEPVDPNDAPDYYGVIKEPMDLATMEERVQRRYYEKLTEFVADM TKIFDNCRYYNPSDSPFYQCAEVLESFFVQKLKGFKASRSHNNKLQSTAS ; 'Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2920 1 2920 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . BPTF_HUMAN Q12830 Q12830-2 1 2920 9606 'Homo sapiens (Human)' 2008-11-25 B4C61BE795C1C555 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A,B ;MRGRRGRPPKQPAAPAAERCAPAPPPPPPPPTSGPIGGLRSRHRGSSRGRWAAAQAEVAPKTRLSSPRGG SSSRRKPPPPPPAPPSTSAPGRGGRGGGGGRTGGGGGGGHLARTTAARRAVNKVVYDDHESEEEEEEEDM VSEEEEEEDGDAEETQDSEDDEEDEMEEDDDDSDYPEEMEDDDDDASYCTESSFRSHSTYSSTPGRRKPR VHRPRSPILEEKDIPPLEFPKSSEDLMVPNEHIMNVIAIYEVLRNFGTVLRLSPFRFEDFCAALVSQEQC TLMAEMHVVLLKAVLREEDTSNTTFGPADLKDSVNSTLYFIDGMTWPEVLRVYCESDKEYHHVLPYQEAE DYPYGPVENKIKVLQFLVDQFLTTNIAREELMSEGVIQYDDHCRVCHKLGDLLCCETCSAVYHLECVKPP LEEVPEDEWQCEVCVAHKVPGVTDCVAEIQKNKPYIRHEPIGYDRSRRKYWFLNRRLIIEEDTENENEKK IWYYSTKVQLAELIDCLDKDYWEAELCKILEEMREEIHRHMDITEDLTNKARGSNKSFLAAANEEILESI RAKKGDIDNVKSPEETEKDKNETENDSKDAEKNREEFEDQSLEKDSDDKTPDDDPEQGKSEVGDFKSEKS 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B 1 2747 LYS 2747 ? ? ? B . B 1 2748 THR 2748 ? ? ? B . B 1 2749 PRO 2749 ? ? ? B . B 1 2750 TYR 2750 ? ? ? B . B 1 2751 ASP 2751 ? ? ? B . B 1 2752 GLU 2752 ? ? ? B . B 1 2753 SER 2753 ? ? ? B . B 1 2754 LYS 2754 ? ? ? B . B 1 2755 PHE 2755 ? ? ? B . B 1 2756 TYR 2756 ? ? ? B . B 1 2757 ILE 2757 ? ? ? B . B 1 2758 GLY 2758 ? ? ? B . B 1 2759 CYS 2759 ? ? ? B . B 1 2760 ASP 2760 ? ? ? B . B 1 2761 ARG 2761 ? ? ? B . B 1 2762 CYS 2762 ? ? ? B . B 1 2763 GLN 2763 ? ? ? B . B 1 2764 ASN 2764 ? ? ? B . B 1 2765 TRP 2765 ? ? ? B . B 1 2766 TYR 2766 ? ? ? B . B 1 2767 HIS 2767 ? ? ? B . B 1 2768 GLY 2768 ? ? ? B . B 1 2769 ARG 2769 ? ? ? B . B 1 2770 CYS 2770 ? ? ? B . B 1 2771 VAL 2771 ? ? ? B . B 1 2772 GLY 2772 ? ? ? B . B 1 2773 ILE 2773 ? ? ? B . B 1 2774 LEU 2774 ? ? ? B . B 1 2775 GLN 2775 ? ? ? B . B 1 2776 SER 2776 ? ? ? B . B 1 2777 GLU 2777 ? ? ? B . B 1 2778 ALA 2778 ? ? ? B . B 1 2779 GLU 2779 ? ? ? B . B 1 2780 LEU 2780 ? ? ? B . B 1 2781 ILE 2781 ? ? ? B . B 1 2782 ASP 2782 ? ? ? B . B 1 2783 GLU 2783 ? ? ? B . B 1 2784 TYR 2784 ? ? ? B . B 1 2785 VAL 2785 ? ? ? B . B 1 2786 CYS 2786 ? ? ? B . B 1 2787 PRO 2787 ? ? ? B . B 1 2788 GLN 2788 ? ? ? B . B 1 2789 CYS 2789 ? ? ? B . B 1 2790 GLN 2790 ? ? ? B . B 1 2791 SER 2791 ? ? ? B . B 1 2792 THR 2792 ? ? ? B . B 1 2793 GLU 2793 ? ? ? B . B 1 2794 ASP 2794 ? ? ? B . B 1 2795 ALA 2795 ? ? ? B . B 1 2796 MET 2796 ? ? ? B . B 1 2797 THR 2797 ? ? ? B . B 1 2798 VAL 2798 ? ? ? B . B 1 2799 LEU 2799 ? ? ? B . B 1 2800 THR 2800 ? ? ? B . B 1 2801 PRO 2801 ? ? ? B . B 1 2802 LEU 2802 ? ? ? B . B 1 2803 THR 2803 2803 THR THR B . B 1 2804 GLU 2804 2804 GLU GLU B . B 1 2805 LYS 2805 2805 LYS LYS B . B 1 2806 ASP 2806 2806 ASP ASP B . B 1 2807 TYR 2807 2807 TYR TYR B . B 1 2808 GLU 2808 2808 GLU GLU B . B 1 2809 GLY 2809 2809 GLY GLY B . B 1 2810 LEU 2810 2810 LEU LEU B . B 1 2811 LYS 2811 2811 LYS LYS B . B 1 2812 ARG 2812 2812 ARG ARG B . B 1 2813 VAL 2813 2813 VAL VAL B . B 1 2814 LEU 2814 2814 LEU LEU B . B 1 2815 ARG 2815 2815 ARG ARG B . B 1 2816 SER 2816 2816 SER SER B . B 1 2817 LEU 2817 2817 LEU LEU B . B 1 2818 GLN 2818 2818 GLN GLN B . B 1 2819 ALA 2819 2819 ALA ALA B . B 1 2820 HIS 2820 2820 HIS HIS B . B 1 2821 LYS 2821 2821 LYS LYS B . B 1 2822 MET 2822 2822 MET MET B . B 1 2823 ALA 2823 2823 ALA ALA B . B 1 2824 TRP 2824 2824 TRP TRP B . B 1 2825 PRO 2825 2825 PRO PRO B . B 1 2826 PHE 2826 2826 PHE PHE B . B 1 2827 LEU 2827 2827 LEU LEU B . B 1 2828 GLU 2828 2828 GLU GLU B . B 1 2829 PRO 2829 2829 PRO PRO B . B 1 2830 VAL 2830 2830 VAL VAL B . B 1 2831 ASP 2831 2831 ASP ASP B . B 1 2832 PRO 2832 2832 PRO PRO B . B 1 2833 ASN 2833 2833 ASN ASN B . B 1 2834 ASP 2834 2834 ASP ASP B . B 1 2835 ALA 2835 2835 ALA ALA B . B 1 2836 PRO 2836 2836 PRO PRO B . B 1 2837 ASP 2837 2837 ASP ASP B . B 1 2838 TYR 2838 2838 TYR TYR B . B 1 2839 TYR 2839 2839 TYR TYR B . B 1 2840 GLY 2840 2840 GLY GLY B . B 1 2841 VAL 2841 2841 VAL VAL B . B 1 2842 ILE 2842 2842 ILE ILE B . B 1 2843 LYS 2843 2843 LYS LYS B . B 1 2844 GLU 2844 2844 GLU GLU B . B 1 2845 PRO 2845 2845 PRO PRO B . B 1 2846 MET 2846 2846 MET MET B . B 1 2847 ASP 2847 2847 ASP ASP B . B 1 2848 LEU 2848 2848 LEU LEU B . B 1 2849 ALA 2849 2849 ALA ALA B . B 1 2850 THR 2850 2850 THR THR B . B 1 2851 MET 2851 2851 MET MET B . B 1 2852 GLU 2852 2852 GLU GLU B . B 1 2853 GLU 2853 2853 GLU GLU B . B 1 2854 ARG 2854 2854 ARG ARG B . B 1 2855 VAL 2855 2855 VAL VAL B . B 1 2856 GLN 2856 2856 GLN GLN B . B 1 2857 ARG 2857 2857 ARG ARG B . B 1 2858 ARG 2858 2858 ARG ARG B . B 1 2859 TYR 2859 2859 TYR TYR B . B 1 2860 TYR 2860 2860 TYR TYR B . B 1 2861 GLU 2861 2861 GLU GLU B . B 1 2862 LYS 2862 2862 LYS LYS B . B 1 2863 LEU 2863 2863 LEU LEU B . B 1 2864 THR 2864 2864 THR THR B . B 1 2865 GLU 2865 2865 GLU GLU B . B 1 2866 PHE 2866 2866 PHE PHE B . B 1 2867 VAL 2867 2867 VAL VAL B . B 1 2868 ALA 2868 2868 ALA ALA B . B 1 2869 ASP 2869 2869 ASP ASP B . B 1 2870 MET 2870 2870 MET MET B . B 1 2871 THR 2871 2871 THR THR B . B 1 2872 LYS 2872 2872 LYS LYS B . B 1 2873 ILE 2873 2873 ILE ILE B . B 1 2874 PHE 2874 2874 PHE PHE B . B 1 2875 ASP 2875 2875 ASP ASP B . B 1 2876 ASN 2876 2876 ASN ASN B . B 1 2877 CYS 2877 2877 CYS CYS B . B 1 2878 ARG 2878 2878 ARG ARG B . B 1 2879 TYR 2879 2879 TYR TYR B . B 1 2880 TYR 2880 2880 TYR TYR B . B 1 2881 ASN 2881 2881 ASN ASN B . B 1 2882 PRO 2882 2882 PRO PRO B . B 1 2883 SER 2883 2883 SER SER B . B 1 2884 ASP 2884 2884 ASP ASP B . B 1 2885 SER 2885 2885 SER SER B . B 1 2886 PRO 2886 2886 PRO PRO B . B 1 2887 PHE 2887 2887 PHE PHE B . B 1 2888 TYR 2888 2888 TYR TYR B . B 1 2889 GLN 2889 2889 GLN GLN B . B 1 2890 CYS 2890 2890 CYS CYS B . B 1 2891 ALA 2891 2891 ALA ALA B . B 1 2892 GLU 2892 2892 GLU GLU B . B 1 2893 VAL 2893 2893 VAL VAL B . B 1 2894 LEU 2894 2894 LEU LEU B . B 1 2895 GLU 2895 2895 GLU GLU B . B 1 2896 SER 2896 2896 SER SER B . B 1 2897 PHE 2897 2897 PHE PHE B . B 1 2898 PHE 2898 2898 PHE PHE B . B 1 2899 VAL 2899 2899 VAL VAL B . B 1 2900 GLN 2900 2900 GLN GLN B . B 1 2901 LYS 2901 2901 LYS LYS B . B 1 2902 LEU 2902 2902 LEU LEU B . B 1 2903 LYS 2903 2903 LYS LYS B . B 1 2904 GLY 2904 2904 GLY GLY B . B 1 2905 PHE 2905 2905 PHE PHE B . B 1 2906 LYS 2906 2906 LYS LYS B . B 1 2907 ALA 2907 2907 ALA ALA B . B 1 2908 SER 2908 ? ? ? B . B 1 2909 ARG 2909 ? ? ? B . B 1 2910 SER 2910 ? ? ? B . B 1 2911 HIS 2911 ? ? ? B . B 1 2912 ASN 2912 ? ? ? B . B 1 2913 ASN 2913 ? ? ? B . B 1 2914 LYS 2914 ? ? ? B . B 1 2915 LEU 2915 ? ? ? B . B 1 2916 GLN 2916 ? ? ? B . B 1 2917 SER 2917 ? ? ? B . B 1 2918 THR 2918 ? ? ? B . B 1 2919 ALA 2919 ? ? ? B . B 1 2920 SER 2920 ? ? ? B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Bromodomain-containing protein 2 {PDB ID=7vro, label_asym_id=C, auth_asym_id=C, SMTL ID=7vro.2.B}' 'template structure' . 2 'Bromodomain-containing protein 2 {PDB ID=7vro, label_asym_id=C, auth_asym_id=C, SMTL ID=7vro.2.B}' 'template structure' . 3 . target . 4 'Target-template alignment by HHblits to 7vro, label_asym_id=C' 'target-template alignment' . 5 'Target-template alignment by HHblits to 7vro, label_asym_id=C' 'target-template alignment' . 6 'model 1' 'model coordinates' . 7 SMTL 'reference database' . 8 PDB 'reference database' . 9 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 3 2 1 7 3 1 8 4 2 9 5 3 3 6 3 1 7 3 2 8 3 4 9 3 5 10 4 1 11 4 2 12 4 4 13 4 5 14 5 6 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 7 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-04 8 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-29 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 3 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . B 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A C 1 1 C 2 2 'reference database' polymer 1 2 B C 1 1 C # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GSHMGRVTNQLQYLHKVVMKALWKHQFAWPFRQPVDAVKLGLPDYHKIIKQPMDMGTIKRRLENNYYWAA SECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQEEQELVVTIPKN ; ;GSHMGRVTNQLQYLHKVVMKALWKHQFAWPFRQPVDAVKLGLPDYHKIIKQPMDMGTIKRRLENNYYWAA SECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQEEQELVVTIPKN ; 2 ;GSHMGRVTNQLQYLHKVVMKALWKHQFAWPFRQPVDAVKLGLPDYHKIIKQPMDMGTIKRRLENNYYWAA SECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQEEQELVVTIPKN ; ;GSHMGRVTNQLQYLHKVVMKALWKHQFAWPFRQPVDAVKLGLPDYHKIIKQPMDMGTIKRRLENNYYWAA SECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQEEQELVVTIPKN ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 5 116 2 2 5 116 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 7vro 2023-11-29 2 PDB . 7vro 2023-11-29 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2920 2 2 B 1 2920 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 4 1 2922 'target-template pairwise alignment' local 2 5 1 2922 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 3e-18 33.636 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . 2 2 2 B 'HHblits e-value' . 3e-18 33.636 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MRGRRGRPPKQPAAPAAERCAPAPPPPPPPPTSGPIGGLRSRHRGSSRGRWAAAQAEVAPKTRLSSPRGGSSSRRKPPPPPPAPPSTSAPGRGGRGGGGGRTGGGGGGGHLARTTAARRAVNKVVYDDHESEEEEEEEDMVSEEEEEEDGDAEETQDSEDDEEDEMEEDDDDSDYPEEMEDDDDDASYCTESSFRSHSTYSSTPGRRKPRVHRPRSPILEEKDIPPLEFPKSSEDLMVPNEHIMNVIAIYEVLRNFGTVLRLSPFRFEDFCAALVSQEQCTLMAEMHVVLLKAVLREEDTSNTTFGPADLKDSVNSTLYFIDGMTWPEVLRVYCESDKEYHHVLPYQEAEDYPYGPVENKIKVLQFLVDQFLTTNIAREELMSEGVIQYDDHCRVCHKLGDLLCCETCSAVYHLECVKPPLEEVPEDEWQCEVCVAHKVPGVTDCVAEIQKNKPYIRHEPIGYDRSRRKYWFLNRRLIIEEDTENENEKKIWYYSTKVQLAELIDCLDKDYWEAELCKILEEMREEIHRHMDITEDLTNKARGSNKSFLAAANEEILESIRAKKGDIDNVKSPEETEKDKNETENDSKDAEKNREEFEDQSLEKDSDDKTPDDDPEQGKSEVGDFKSEKSNGELSESPGAGKGASGSTRIITRLRNPDSKLSQLKSQQVAAAAHEANKLFKEGKEVLVVNSQGEISRLSTKKEVIMKGNINNYFKLGQEGKYRVYHNQYSTNSFALNKHQHREDHDKRRHLAHKFCLTPAGEFKWNGSVHGSKVLTISTLRLTITQLENNIPSSFLHPNWASHRANWIKAVQMCSKPREFALALAILECAVKPVVMLPIWRESLGHTRLHRMTSIEREEKEKVKKKEKKQEEEETMQQATWVKYTFPVKHQVWKQKGEEYRVTGYGGWSWISKTHVYRFVPKLPGNTNVNYRKSLEGTKNNMDENMDESDKRKCSRSPKKIKIEPDSEKDEVKGSDAAKGADQNEMDISKITEKKDQDVKELLDSDSDKPCKEEPMEVDDDMKTESHVNCQESSQVDVVNVSEGFHLRTSYKKKTKSSKLDGLLERRIKQFTLEEKQRLEKIKLEGGIKGIGKTSTNSSKNLSESPVITKAKEGCQSDSMRQEQSPNANNDQPEDLIQGCSESDSSVLRMSDPSHTTNKLYPKDRVLDDVSIRSPETKCPKQNSIENDIEEKVSDLASRGQEPSKSKTKGNDFFIDDSKLASADDIGTLICKNKKPLIQEESDTIVSSSKSALHSSVPKSTNDRDATPLSRAMDFEGKLGCDSESNSTLENSSDTVSIQDSSEEDMIVQNSNESISEQFRTREQDVEVLEPLKCELVSGESTGNCEDRLPVKGTEANGKKPSQQKKLEERPVNKCSDQIKLKNTTDKKNNENRESEKKGQRTSTFQINGKDNKPKIYLKGECLKEISESRVVSGNVEPKVNNINKIIPENDIKSLTVKESAIRPFINGDVIMEDFNERNSSETKSHLLSSSDAEGNYRDSLETLPSTKESDSTQTTTPSASCPESNSVNQVEDMEIETSEVKKVTSSPITSEEESNLSNDFIDENGLPINKNENVNGESKRKTVITEVTTMTSTVATESKTVIKVEKGDKQTVVSSTENCAKSTVTTTTTTVTKLSTPSTGGSVDIISVKEQSKTVVTTTVTDSLTTTGGTLVTSMTVSKEYSTRDKVKLMKFSRPKKTRSGTALPSYRKFVTKSSKKSIFVLPNDDLKKLARKGGIREVPYFNYNAKPALDIWPYPSPRPTFGITWRYRLQTVKSLAGVSLMLRLLWASLRWDDMAAKAPPGGGTTRTETSETEITTTEIIKRRDVGPYGIRSEYCIRKIICPIGVPETPKETPTPQRKGLRSSALRPKRPETPKQTGPVIIETWVAEEELELWEIRAFAERVEKEKAQAVEQQAKKRLEQQKPTVIATSTTSPTSSTTSTISPAQKVMVAPISGSVTTGTKMVLTTKVGSPATVTFQQNKNFHQTFATWVKQGQSNSGVVQVQQKVLGIIPSSTGTSQQTFTSFQPRTATVTIRPNTSGSGGTTSNSQVITGPQIRPGMTVIRTPLQQSTLGKAIIRTPVMVQPGAPQQVMTQIIRGQPVSTAVSAPNTVSSTPGQKSLTSATSTSNIQSSASQPPRPQQGQVKLTMAQLTQLTQGHGGNQGLTVVIQGQGQTTGQLQLIPQGVTVLPGPGQQLMQAAMPNGTVQRFLFTPLATTATTASTTTTTVSTTAAGTGEQRQSKLSPQMQVHQDKTLPPAQSSSVGPAEAQPQTAQPSAQPQPQTQPQSPAQPEVQTQPEVQTQTTVSSHVPSEAQPTHAQSSKPQVAAQSQPQSNVQGQSPVRVQSPSQTRIRPSTPSQLSPGQQSQVQTTTSQPIPIQPHTSLQIPSQGQPQSQPQVQSSTQTLSSGQTLNQVTVSSPSRPQLQIQQPQPQVIAVPQLQQQVQVLSQIQSQVVAQIQAQQSGVPQQIKLQLPIQIQQSSAVQTHQIQNVVTVQAASVQEQLQRVQQLRDQQQKKKQQQIEIKREHTLQASNQSEIIQKQVVMKHNAVIEHLKQKKSMTPAEREENQRMIVCNQVMKYILDKIDKEEKQAAKKRKREESVEQKRSKQNATKLSALLFKHKEQLRAEILKKRALLDKDLQIEVQEELKRDLKIKKEKDLMQLAQATAVAAPCPPVTPAPPAPPAPPPSPPPPPAVQHTGLLSTPTLPAASQKRKREEEKDSSSKSKKKKMISTTSKETKKDTKLYCICKTPYDESKFYIGCDRCQNWYHGRCVGILQSEAELIDEYVCPQCQSTEDAMTVLTPLTEKDYEGLKRVLRSLQAHKMAWPFLEPVDPND--APDYYGVIKEPMDLATMEERVQRRYYEKLTEFVADMTKIFDNCRYYNPSDSPFYQCAEVLESFFVQKLKGFKASRSHNNKLQSTAS 2 1 2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GRVTNQLQYLHKVVMKALWKHQFAWPFRQPVDAVKLGLPDYHKIIKQPMDMGTIKRRLENNYYWAASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQEE----------- 3 2 1 MRGRRGRPPKQPAAPAAERCAPAPPPPPPPPTSGPIGGLRSRHRGSSRGRWAAAQAEVAPKTRLSSPRGGSSSRRKPPPPPPAPPSTSAPGRGGRGGGGGRTGGGGGGGHLARTTAARRAVNKVVYDDHESEEEEEEEDMVSEEEEEEDGDAEETQDSEDDEEDEMEEDDDDSDYPEEMEDDDDDASYCTESSFRSHSTYSSTPGRRKPRVHRPRSPILEEKDIPPLEFPKSSEDLMVPNEHIMNVIAIYEVLRNFGTVLRLSPFRFEDFCAALVSQEQCTLMAEMHVVLLKAVLREEDTSNTTFGPADLKDSVNSTLYFIDGMTWPEVLRVYCESDKEYHHVLPYQEAEDYPYGPVENKIKVLQFLVDQFLTTNIAREELMSEGVIQYDDHCRVCHKLGDLLCCETCSAVYHLECVKPPLEEVPEDEWQCEVCVAHKVPGVTDCVAEIQKNKPYIRHEPIGYDRSRRKYWFLNRRLIIEEDTENENEKKIWYYSTKVQLAELIDCLDKDYWEAELCKILEEMREEIHRHMDITEDLTNKARGSNKSFLAAANEEILESIRAKKGDIDNVKSPEETEKDKNETENDSKDAEKNREEFEDQSLEKDSDDKTPDDDPEQGKSEVGDFKSEKSNGELSESPGAGKGASGSTRIITRLRNPDSKLSQLKSQQVAAAAHEANKLFKEGKEVLVVNSQGEISRLSTKKEVIMKGNINNYFKLGQEGKYRVYHNQYSTNSFALNKHQHREDHDKRRHLAHKFCLTPAGEFKWNGSVHGSKVLTISTLRLTITQLENNIPSSFLHPNWASHRANWIKAVQMCSKPREFALALAILECAVKPVVMLPIWRESLGHTRLHRMTSIEREEKEKVKKKEKKQEEEETMQQATWVKYTFPVKHQVWKQKGEEYRVTGYGGWSWISKTHVYRFVPKLPGNTNVNYRKSLEGTKNNMDENMDESDKRKCSRSPKKIKIEPDSEKDEVKGSDAAKGADQNEMDISKITEKKDQDVKELLDSDSDKPCKEEPMEVDDDMKTESHVNCQESSQVDVVNVSEGFHLRTSYKKKTKSSKLDGLLERRIKQFTLEEKQRLEKIKLEGGIKGIGKTSTNSSKNLSESPVITKAKEGCQSDSMRQEQSPNANNDQPEDLIQGCSESDSSVLRMSDPSHTTNKLYPKDRVLDDVSIRSPETKCPKQNSIENDIEEKVSDLASRGQEPSKSKTKGNDFFIDDSKLASADDIGTLICKNKKPLIQEESDTIVSSSKSALHSSVPKSTNDRDATPLSRAMDFEGKLGCDSESNSTLENSSDTVSIQDSSEEDMIVQNSNESISEQFRTREQDVEVLEPLKCELVSGESTGNCEDRLPVKGTEANGKKPSQQKKLEERPVNKCSDQIKLKNTTDKKNNENRESEKKGQRTSTFQINGKDNKPKIYLKGECLKEISESRVVSGNVEPKVNNINKIIPENDIKSLTVKESAIRPFINGDVIMEDFNERNSSETKSHLLSSSDAEGNYRDSLETLPSTKESDSTQTTTPSASCPESNSVNQVEDMEIETSEVKKVTSSPITSEEESNLSNDFIDENGLPINKNENVNGESKRKTVITEVTTMTSTVATESKTVIKVEKGDKQTVVSSTENCAKSTVTTTTTTVTKLSTPSTGGSVDIISVKEQSKTVVTTTVTDSLTTTGGTLVTSMTVSKEYSTRDKVKLMKFSRPKKTRSGTALPSYRKFVTKSSKKSIFVLPNDDLKKLARKGGIREVPYFNYNAKPALDIWPYPSPRPTFGITWRYRLQTVKSLAGVSLMLRLLWASLRWDDMAAKAPPGGGTTRTETSETEITTTEIIKRRDVGPYGIRSEYCIRKIICPIGVPETPKETPTPQRKGLRSSALRPKRPETPKQTGPVIIETWVAEEELELWEIRAFAERVEKEKAQAVEQQAKKRLEQQKPTVIATSTTSPTSSTTSTISPAQKVMVAPISGSVTTGTKMVLTTKVGSPATVTFQQNKNFHQTFATWVKQGQSNSGVVQVQQKVLGIIPSSTGTSQQTFTSFQPRTATVTIRPNTSGSGGTTSNSQVITGPQIRPGMTVIRTPLQQSTLGKAIIRTPVMVQPGAPQQVMTQIIRGQPVSTAVSAPNTVSSTPGQKSLTSATSTSNIQSSASQPPRPQQGQVKLTMAQLTQLTQGHGGNQGLTVVIQGQGQTTGQLQLIPQGVTVLPGPGQQLMQAAMPNGTVQRFLFTPLATTATTASTTTTTVSTTAAGTGEQRQSKLSPQMQVHQDKTLPPAQSSSVGPAEAQPQTAQPSAQPQPQTQPQSPAQPEVQTQPEVQTQTTVSSHVPSEAQPTHAQSSKPQVAAQSQPQSNVQGQSPVRVQSPSQTRIRPSTPSQLSPGQQSQVQTTTSQPIPIQPHTSLQIPSQGQPQSQPQVQSSTQTLSSGQTLNQVTVSSPSRPQLQIQQPQPQVIAVPQLQQQVQVLSQIQSQVVAQIQAQQSGVPQQIKLQLPIQIQQSSAVQTHQIQNVVTVQAASVQEQLQRVQQLRDQQQKKKQQQIEIKREHTLQASNQSEIIQKQVVMKHNAVIEHLKQKKSMTPAEREENQRMIVCNQVMKYILDKIDKEEKQAAKKRKREESVEQKRSKQNATKLSALLFKHKEQLRAEILKKRALLDKDLQIEVQEELKRDLKIKKEKDLMQLAQATAVAAPCPPVTPAPPAPPAPPPSPPPPPAVQHTGLLSTPTLPAASQKRKREEEKDSSSKSKKKKMISTTSKETKKDTKLYCICKTPYDESKFYIGCDRCQNWYHGRCVGILQSEAELIDEYVCPQCQSTEDAMTVLTPLTEKDYEGLKRVLRSLQAHKMAWPFLEPVDPND--APDYYGVIKEPMDLATMEERVQRRYYEKLTEFVADMTKIFDNCRYYNPSDSPFYQCAEVLESFFVQKLKGFKASRSHNNKLQSTAS 4 2 2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GRVTNQLQYLHKVVMKALWKHQFAWPFRQPVDAVKLGLPDYHKIIKQPMDMGTIKRRLENNYYWAASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQEE----------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.095}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 7vro.2, oligomeric state (homo-dimer) as predicted' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 1' . 6 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . THR 2803 2803 ? A -13.245 37.692 91.222 1 1 A THR 0.640 1 ATOM 2 C CA . THR 2803 2803 ? A -12.482 38.362 90.112 1 1 A THR 0.640 1 ATOM 3 C C . THR 2803 2803 ? A -10.977 38.242 90.220 1 1 A THR 0.640 1 ATOM 4 O O . THR 2803 2803 ? A -10.399 37.395 89.549 1 1 A THR 0.640 1 ATOM 5 C CB . THR 2803 2803 ? A -12.930 39.808 89.890 1 1 A THR 0.640 1 ATOM 6 O OG1 . THR 2803 2803 ? A -14.350 39.879 89.906 1 1 A THR 0.640 1 ATOM 7 C CG2 . THR 2803 2803 ? A -12.492 40.268 88.495 1 1 A THR 0.640 1 ATOM 8 N N . GLU 2804 2804 ? A -10.271 39.041 91.065 1 1 A GLU 0.550 1 ATOM 9 C CA . GLU 2804 2804 ? A -8.822 38.891 91.216 1 1 A GLU 0.550 1 ATOM 10 C C . GLU 2804 2804 ? A -8.375 37.526 91.727 1 1 A GLU 0.550 1 ATOM 11 O O . GLU 2804 2804 ? A -7.440 36.941 91.196 1 1 A GLU 0.550 1 ATOM 12 C CB . GLU 2804 2804 ? A -8.198 39.948 92.159 1 1 A GLU 0.550 1 ATOM 13 C CG . GLU 2804 2804 ? A -7.966 41.335 91.515 1 1 A GLU 0.550 1 ATOM 14 C CD . GLU 2804 2804 ? A -6.555 41.815 91.827 1 1 A GLU 0.550 1 ATOM 15 O OE1 . GLU 2804 2804 ? A -5.593 41.191 91.303 1 1 A GLU 0.550 1 ATOM 16 O OE2 . GLU 2804 2804 ? A -6.356 42.741 92.654 1 1 A GLU 0.550 1 ATOM 17 N N . LYS 2805 2805 ? A -9.067 36.966 92.739 1 1 A LYS 0.500 1 ATOM 18 C CA . LYS 2805 2805 ? A -8.763 35.667 93.318 1 1 A LYS 0.500 1 ATOM 19 C C . LYS 2805 2805 ? A -8.757 34.519 92.315 1 1 A LYS 0.500 1 ATOM 20 O O . LYS 2805 2805 ? A -7.860 33.681 92.283 1 1 A LYS 0.500 1 ATOM 21 C CB . LYS 2805 2805 ? A -9.839 35.363 94.402 1 1 A LYS 0.500 1 ATOM 22 C CG . LYS 2805 2805 ? A -9.528 36.069 95.727 1 1 A LYS 0.500 1 ATOM 23 C CD . LYS 2805 2805 ? A -10.324 35.601 96.966 1 1 A LYS 0.500 1 ATOM 24 C CE . LYS 2805 2805 ? A -9.429 35.768 98.206 1 1 A LYS 0.500 1 ATOM 25 N NZ . LYS 2805 2805 ? A -10.126 35.945 99.499 1 1 A LYS 0.500 1 ATOM 26 N N . ASP 2806 2806 ? A -9.775 34.478 91.455 1 1 A ASP 0.490 1 ATOM 27 C CA . ASP 2806 2806 ? A -10.008 33.502 90.418 1 1 A ASP 0.490 1 ATOM 28 C C . 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A -9.038 38.171 86.660 1 1 A TYR 0.640 1 ATOM 42 C CE1 . TYR 2807 2807 ? A -9.704 36.453 84.556 1 1 A TYR 0.640 1 ATOM 43 C CE2 . TYR 2807 2807 ? A -9.987 38.565 85.705 1 1 A TYR 0.640 1 ATOM 44 C CZ . TYR 2807 2807 ? A -10.318 37.705 84.652 1 1 A TYR 0.640 1 ATOM 45 O OH . TYR 2807 2807 ? A -11.258 38.118 83.684 1 1 A TYR 0.640 1 ATOM 46 N N . GLU 2808 2808 ? A -5.877 35.005 90.012 1 1 A GLU 0.540 1 ATOM 47 C CA . GLU 2808 2808 ? A -4.701 34.577 90.748 1 1 A GLU 0.540 1 ATOM 48 C C . GLU 2808 2808 ? A -4.574 33.055 90.822 1 1 A GLU 0.540 1 ATOM 49 O O . GLU 2808 2808 ? A -3.516 32.482 90.556 1 1 A GLU 0.540 1 ATOM 50 C CB . GLU 2808 2808 ? A -4.681 35.217 92.155 1 1 A GLU 0.540 1 ATOM 51 C CG . GLU 2808 2808 ? A -3.313 35.051 92.847 1 1 A GLU 0.540 1 ATOM 52 C CD . GLU 2808 2808 ? A -3.118 35.873 94.116 1 1 A GLU 0.540 1 ATOM 53 O OE1 . GLU 2808 2808 ? A -4.064 36.472 94.682 1 1 A GLU 0.540 1 ATOM 54 O OE2 . GLU 2808 2808 ? A -1.934 35.871 94.550 1 1 A GLU 0.540 1 ATOM 55 N N . 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B -19.902 15.325 110.730 1 1 B MET 0.690 1 ATOM 1046 S SD . MET 2822 2822 ? B -19.988 15.524 108.933 1 1 B MET 0.690 1 ATOM 1047 C CE . MET 2822 2822 ? B -21.599 14.717 108.744 1 1 B MET 0.690 1 ATOM 1048 N N . ALA 2823 2823 ? B -16.774 16.718 114.206 1 1 B ALA 0.770 1 ATOM 1049 C CA . ALA 2823 2823 ? B -15.443 17.042 114.673 1 1 B ALA 0.770 1 ATOM 1050 C C . ALA 2823 2823 ? B -14.805 15.996 115.569 1 1 B ALA 0.770 1 ATOM 1051 O O . ALA 2823 2823 ? B -13.583 15.884 115.627 1 1 B ALA 0.770 1 ATOM 1052 C CB . ALA 2823 2823 ? B -15.491 18.371 115.440 1 1 B ALA 0.770 1 ATOM 1053 N N . TRP 2824 2824 ? B -15.617 15.188 116.282 1 1 B TRP 0.680 1 ATOM 1054 C CA . TRP 2824 2824 ? B -15.165 14.317 117.357 1 1 B TRP 0.680 1 ATOM 1055 C C . TRP 2824 2824 ? B -14.034 13.325 117.052 1 1 B TRP 0.680 1 ATOM 1056 O O . TRP 2824 2824 ? B -13.183 13.211 117.933 1 1 B TRP 0.680 1 ATOM 1057 C CB . TRP 2824 2824 ? B -16.353 13.642 118.104 1 1 B TRP 0.680 1 ATOM 1058 C CG . TRP 2824 2824 ? 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'normalized score' global . 3 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.712 2 1 3 0 3 1 4 0.095 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 2803 THR 1 0.640 2 1 A 2804 GLU 1 0.550 3 1 A 2805 LYS 1 0.500 4 1 A 2806 ASP 1 0.490 5 1 A 2807 TYR 1 0.640 6 1 A 2808 GLU 1 0.540 7 1 A 2809 GLY 1 0.570 8 1 A 2810 LEU 1 0.610 9 1 A 2811 LYS 1 0.630 10 1 A 2812 ARG 1 0.630 11 1 A 2813 VAL 1 0.770 12 1 A 2814 LEU 1 0.780 13 1 A 2815 ARG 1 0.700 14 1 A 2816 SER 1 0.780 15 1 A 2817 LEU 1 0.790 16 1 A 2818 GLN 1 0.750 17 1 A 2819 ALA 1 0.750 18 1 A 2820 HIS 1 0.710 19 1 A 2821 LYS 1 0.660 20 1 A 2822 MET 1 0.690 21 1 A 2823 ALA 1 0.780 22 1 A 2824 TRP 1 0.680 23 1 A 2825 PRO 1 0.760 24 1 A 2826 PHE 1 0.800 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #