data_SMR-c19427401e3b19aeb179220b997641c6_2 _entry.id SMR-c19427401e3b19aeb179220b997641c6_2 _struct.entry_id SMR-c19427401e3b19aeb179220b997641c6_2 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q12830 (isoform 2)/ BPTF_HUMAN, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF Estimated model accuracy of this model is 0.011, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q12830 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' ZN non-polymer 'ZINC ION' Zn 65.380 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 378152.802 1 . 2 non-polymer man 'ZINC ION' 65.380 2 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP BPTF_HUMAN Q12830 1 ;MRGRRGRPPKQPAAPAAERCAPAPPPPPPPPTSGPIGGLRSRHRGSSRGRWAAAQAEVAPKTRLSSPRGG SSSRRKPPPPPPAPPSTSAPGRGGRGGGGGRTGGGGGGGHLARTTAARRAVNKVVYDDHESEEEEEEEDM VSEEEEEEDGDAEETQDSEDDEEDEMEEDDDDSDYPEEMEDDDDDASYCTESSFRSHSTYSSTPGRRKPR VHRPRSPILEEKDIPPLEFPKSSEDLMVPNEHIMNVIAIYEVLRNFGTVLRLSPFRFEDFCAALVSQEQC TLMAEMHVVLLKAVLREEDTSNTTFGPADLKDSVNSTLYFIDGMTWPEVLRVYCESDKEYHHVLPYQEAE DYPYGPVENKIKVLQFLVDQFLTTNIAREELMSEGVIQYDDHCRVCHKLGDLLCCETCSAVYHLECVKPP LEEVPEDEWQCEVCVAHKVPGVTDCVAEIQKNKPYIRHEPIGYDRSRRKYWFLNRRLIIEEDTENENEKK IWYYSTKVQLAELIDCLDKDYWEAELCKILEEMREEIHRHMDITEDLTNKARGSNKSFLAAANEEILESI RAKKGDIDNVKSPEETEKDKNETENDSKDAEKNREEFEDQSLEKDSDDKTPDDDPEQGKSEVGDFKSEKS NGELSESPGAGKGASGSTRIITRLRNPDSKLSQLKSQQVAAAAHEANKLFKEGKEVLVVNSQGEISRLST KKEVIMKGNINNYFKLGQEGKYRVYHNQYSTNSFALNKHQHREDHDKRRHLAHKFCLTPAGEFKWNGSVH GSKVLTISTLRLTITQLENNIPSSFLHPNWASHRANWIKAVQMCSKPREFALALAILECAVKPVVMLPIW RESLGHTRLHRMTSIEREEKEKVKKKEKKQEEEETMQQATWVKYTFPVKHQVWKQKGEEYRVTGYGGWSW ISKTHVYRFVPKLPGNTNVNYRKSLEGTKNNMDENMDESDKRKCSRSPKKIKIEPDSEKDEVKGSDAAKG ADQNEMDISKITEKKDQDVKELLDSDSDKPCKEEPMEVDDDMKTESHVNCQESSQVDVVNVSEGFHLRTS YKKKTKSSKLDGLLERRIKQFTLEEKQRLEKIKLEGGIKGIGKTSTNSSKNLSESPVITKAKEGCQSDSM RQEQSPNANNDQPEDLIQGCSESDSSVLRMSDPSHTTNKLYPKDRVLDDVSIRSPETKCPKQNSIENDIE EKVSDLASRGQEPSKSKTKGNDFFIDDSKLASADDIGTLICKNKKPLIQEESDTIVSSSKSALHSSVPKS TNDRDATPLSRAMDFEGKLGCDSESNSTLENSSDTVSIQDSSEEDMIVQNSNESISEQFRTREQDVEVLE PLKCELVSGESTGNCEDRLPVKGTEANGKKPSQQKKLEERPVNKCSDQIKLKNTTDKKNNENRESEKKGQ RTSTFQINGKDNKPKIYLKGECLKEISESRVVSGNVEPKVNNINKIIPENDIKSLTVKESAIRPFINGDV IMEDFNERNSSETKSHLLSSSDAEGNYRDSLETLPSTKESDSTQTTTPSASCPESNSVNQVEDMEIETSE VKKVTSSPITSEEESNLSNDFIDENGLPINKNENVNGESKRKTVITEVTTMTSTVATESKTVIKVEKGDK QTVVSSTENCAKSTVTTTTTTVTKLSTPSTGGSVDIISVKEQSKTVVTTTVTDSLTTTGGTLVTSMTVSK EYSTRDKVKLMKFSRPKKTRSGTALPSYRKFVTKSSKKSIFVLPNDDLKKLARKGGIREVPYFNYNAKPA LDIWPYPSPRPTFGITWRYRLQTVKSLAGVSLMLRLLWASLRWDDMAAKAPPGGGTTRTETSETEITTTE IIKRRDVGPYGIRSEYCIRKIICPIGVPETPKETPTPQRKGLRSSALRPKRPETPKQTGPVIIETWVAEE ELELWEIRAFAERVEKEKAQAVEQQAKKRLEQQKPTVIATSTTSPTSSTTSTISPAQKVMVAPISGSVTT GTKMVLTTKVGSPATVTFQQNKNFHQTFATWVKQGQSNSGVVQVQQKVLGIIPSSTGTSQQTFTSFQPRT ATVTIRPNTSGSGGTTSNSQVITGPQIRPGMTVIRTPLQQSTLGKAIIRTPVMVQPGAPQQVMTQIIRGQ PVSTAVSAPNTVSSTPGQKSLTSATSTSNIQSSASQPPRPQQGQVKLTMAQLTQLTQGHGGNQGLTVVIQ GQGQTTGQLQLIPQGVTVLPGPGQQLMQAAMPNGTVQRFLFTPLATTATTASTTTTTVSTTAAGTGEQRQ SKLSPQMQVHQDKTLPPAQSSSVGPAEAQPQTAQPSAQPQPQTQPQSPAQPEVQTQPEVQTQTTVSSHVP SEAQPTHAQSSKPQVAAQSQPQSNVQGQSPVRVQSPSQTRIRPSTPSQLSPGQQSQVQTTTSQPIPIQPH TSLQIPSQGQPQSQPQVQSSTQTLSSGQTLNQVTVSSPSRPQLQIQQPQPQVIAVPQLQQQVQVLSQIQS QVVAQIQAQQSGVPQQIKLQLPIQIQQSSAVQTHQIQNVVTVQAASVQEQLQRVQQLRDQQQKKKQQQIE IKREHTLQASNQSEIIQKQVVMKHNAVIEHLKQKKSMTPAEREENQRMIVCNQVMKYILDKIDKEEKQAA KKRKREESVEQKRSKQNATKLSALLFKHKEQLRAEILKKRALLDKDLQIEVQEELKRDLKIKKEKDLMQL AQATAVAAPCPPVTPAPPAPPAPPPSPPPPPAVQHTGLLSTPTLPAASQKRKREEEKDSSSKSKKKKMIS TTSKETKKDTKLYCICKTPYDESKFYIGCDRCQNWYHGRCVGILQSEAELIDEYVCPQCQSTEDAMTVLT PLTEKDYEGLKRVLRSLQAHKMAWPFLEPVDPNDAPDYYGVIKEPMDLATMEERVQRRYYEKLTEFVADM TKIFDNCRYYNPSDSPFYQCAEVLESFFVQKLKGFKASRSHNNKLQSTAS ; 'Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2920 1 2920 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . BPTF_HUMAN Q12830 Q12830-2 1 2920 9606 'Homo sapiens (Human)' 2008-11-25 B4C61BE795C1C555 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MRGRRGRPPKQPAAPAAERCAPAPPPPPPPPTSGPIGGLRSRHRGSSRGRWAAAQAEVAPKTRLSSPRGG SSSRRKPPPPPPAPPSTSAPGRGGRGGGGGRTGGGGGGGHLARTTAARRAVNKVVYDDHESEEEEEEEDM VSEEEEEEDGDAEETQDSEDDEEDEMEEDDDDSDYPEEMEDDDDDASYCTESSFRSHSTYSSTPGRRKPR VHRPRSPILEEKDIPPLEFPKSSEDLMVPNEHIMNVIAIYEVLRNFGTVLRLSPFRFEDFCAALVSQEQC TLMAEMHVVLLKAVLREEDTSNTTFGPADLKDSVNSTLYFIDGMTWPEVLRVYCESDKEYHHVLPYQEAE DYPYGPVENKIKVLQFLVDQFLTTNIAREELMSEGVIQYDDHCRVCHKLGDLLCCETCSAVYHLECVKPP LEEVPEDEWQCEVCVAHKVPGVTDCVAEIQKNKPYIRHEPIGYDRSRRKYWFLNRRLIIEEDTENENEKK IWYYSTKVQLAELIDCLDKDYWEAELCKILEEMREEIHRHMDITEDLTNKARGSNKSFLAAANEEILESI RAKKGDIDNVKSPEETEKDKNETENDSKDAEKNREEFEDQSLEKDSDDKTPDDDPEQGKSEVGDFKSEKS 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A 1 2877 CYS 2877 2877 CYS CYS A . A 1 2878 ARG 2878 2878 ARG ARG A . A 1 2879 TYR 2879 2879 TYR TYR A . A 1 2880 TYR 2880 2880 TYR TYR A . A 1 2881 ASN 2881 2881 ASN ASN A . A 1 2882 PRO 2882 2882 PRO PRO A . A 1 2883 SER 2883 2883 SER SER A . A 1 2884 ASP 2884 2884 ASP ASP A . A 1 2885 SER 2885 2885 SER SER A . A 1 2886 PRO 2886 2886 PRO PRO A . A 1 2887 PHE 2887 2887 PHE PHE A . A 1 2888 TYR 2888 2888 TYR TYR A . A 1 2889 GLN 2889 2889 GLN GLN A . A 1 2890 CYS 2890 2890 CYS CYS A . A 1 2891 ALA 2891 2891 ALA ALA A . A 1 2892 GLU 2892 2892 GLU GLU A . A 1 2893 VAL 2893 2893 VAL VAL A . A 1 2894 LEU 2894 2894 LEU LEU A . A 1 2895 GLU 2895 2895 GLU GLU A . A 1 2896 SER 2896 2896 SER SER A . A 1 2897 PHE 2897 2897 PHE PHE A . A 1 2898 PHE 2898 2898 PHE PHE A . A 1 2899 VAL 2899 2899 VAL VAL A . A 1 2900 GLN 2900 2900 GLN GLN A . A 1 2901 LYS 2901 2901 LYS LYS A . A 1 2902 LEU 2902 2902 LEU LEU A . A 1 2903 LYS 2903 2903 LYS LYS A . A 1 2904 GLY 2904 2904 GLY GLY A . A 1 2905 PHE 2905 2905 PHE PHE A . A 1 2906 LYS 2906 2906 LYS LYS A . A 1 2907 ALA 2907 ? ? ? A . A 1 2908 SER 2908 ? ? ? A . A 1 2909 ARG 2909 ? ? ? A . A 1 2910 SER 2910 ? ? ? A . A 1 2911 HIS 2911 ? ? ? A . A 1 2912 ASN 2912 ? ? ? A . A 1 2913 ASN 2913 ? ? ? A . A 1 2914 LYS 2914 ? ? ? A . A 1 2915 LEU 2915 ? ? ? A . A 1 2916 GLN 2916 ? ? ? A . A 1 2917 SER 2917 ? ? ? A . A 1 2918 THR 2918 ? ? ? A . A 1 2919 ALA 2919 ? ? ? A . A 1 2920 SER 2920 ? ? ? A . # # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 ZN 1 1 1 ZN '_' . C 2 ZN 1 2 2 ZN '_' . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'bromodomain PHD finger transcription factor {PDB ID=2f6j, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=2f6j.1.A}' 'template structure' . 2 'ZINC ION {PDB ID=2f6j, label_asym_id=E, auth_asym_id=A, SMTL ID=2f6j.1._.1}' 'template structure' . 3 'ZINC ION {PDB ID=2f6j, label_asym_id=F, auth_asym_id=A, SMTL ID=2f6j.1._.2}' 'template structure' . 4 . target . 5 'ZINC ION' target . 6 'Target-template alignment by HHblits to 2f6j, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 7 'model 2' 'model coordinates' . 8 SMTL 'reference database' . 9 PDB 'reference database' . 10 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 4 2 1 8 3 1 9 4 2 10 5 3 4 6 3 5 7 3 1 8 3 2 9 3 3 10 3 6 11 4 1 12 4 2 13 4 3 14 4 6 15 4 5 16 5 7 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 8 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-04 9 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-29 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 4 'reference database' 2 5 . # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . B 2 . C 2 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A 2 2 'reference database' non-polymer 1 2 B E 3 1 A 3 3 'reference database' non-polymer 1 3 C F 3 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GPLGSDTKLYCICKTPYDESKFYIGCDRCQNWYHGRCVGILQSEAELIDEYVCPQCQSTEDAMTVLTPLT EKDYEGLKRVLRSLQAHKMAWPFLEPVDPNDAPDYYGVIKEPMDLATMEERVQRRYYEKLTEFVADMTKI FDNCRYYNPSDSPFYQCAEVLESFFVQKLKGFKA ; ;GPLGSDTKLYCICKTPYDESKFYIGCDRCQNWYHGRCVGILQSEAELIDEYVCPQCQSTEDAMTVLTPLT EKDYEGLKRVLRSLQAHKMAWPFLEPVDPNDAPDYYGVIKEPMDLATMEERVQRRYYEKLTEFVADMTKI FDNCRYYNPSDSPFYQCAEVLESFFVQKLKGFKA ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 6 173 # # loop_ _ma_template_non_poly.template_id _ma_template_non_poly.comp_id _ma_template_non_poly.details 2 ZN 'ZINC ION' 3 ZN 'ZINC ION' # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 2f6j 2011-07-13 2 PDB . 2f6j 2011-07-13 3 PDB . 2f6j 2011-07-13 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2920 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 6 1 2920 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 5.6e-31 100.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 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2 1 2 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# # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 2f6j.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 2' . 7 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id 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'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.751 2 1 3 0.011 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 2739 ASP 1 0.510 2 1 A 2740 THR 1 0.530 3 1 A 2741 LYS 1 0.600 4 1 A 2742 LEU 1 0.610 5 1 A 2743 TYR 1 0.660 6 1 A 2744 CYS 1 0.730 7 1 A 2745 ILE 1 0.710 8 1 A 2746 CYS 1 0.690 9 1 A 2747 LYS 1 0.650 10 1 A 2748 THR 1 0.650 11 1 A 2749 PRO 1 0.630 12 1 A 2750 TYR 1 0.600 13 1 A 2751 ASP 1 0.640 14 1 A 2752 GLU 1 0.600 15 1 A 2753 SER 1 0.670 16 1 A 2754 LYS 1 0.660 17 1 A 2755 PHE 1 0.670 18 1 A 2756 TYR 1 0.710 19 1 A 2757 ILE 1 0.740 20 1 A 2758 GLY 1 0.790 21 1 A 2759 CYS 1 0.780 22 1 A 2760 ASP 1 0.760 23 1 A 2761 ARG 1 0.690 24 1 A 2762 CYS 1 0.760 25 1 A 2763 GLN 1 0.730 26 1 A 2764 ASN 1 0.750 27 1 A 2765 TRP 1 0.730 28 1 A 2766 TYR 1 0.750 29 1 A 2767 HIS 1 0.720 30 1 A 2768 GLY 1 0.750 31 1 A 2769 ARG 1 0.670 32 1 A 2770 CYS 1 0.730 33 1 A 2771 VAL 1 0.780 34 1 A 2772 GLY 1 0.780 35 1 A 2773 ILE 1 0.730 36 1 A 2774 LEU 1 0.630 37 1 A 2775 GLN 1 0.620 38 1 A 2776 SER 1 0.610 39 1 A 2777 GLU 1 0.600 40 1 A 2778 ALA 1 0.710 41 1 A 2779 GLU 1 0.590 42 1 A 2780 LEU 1 0.580 43 1 A 2781 ILE 1 0.620 44 1 A 2782 ASP 1 0.640 45 1 A 2783 GLU 1 0.690 46 1 A 2784 TYR 1 0.750 47 1 A 2785 VAL 1 0.810 48 1 A 2786 CYS 1 0.800 49 1 A 2787 PRO 1 0.780 50 1 A 2788 GLN 1 0.720 51 1 A 2789 CYS 1 0.780 52 1 A 2790 GLN 1 0.730 53 1 A 2791 SER 1 0.680 54 1 A 2792 THR 1 0.640 55 1 A 2793 GLU 1 0.590 56 1 A 2794 ASP 1 0.580 57 1 A 2795 ALA 1 0.610 58 1 A 2796 MET 1 0.580 59 1 A 2797 THR 1 0.660 60 1 A 2798 VAL 1 0.680 61 1 A 2799 LEU 1 0.600 62 1 A 2800 THR 1 0.680 63 1 A 2801 PRO 1 0.730 64 1 A 2802 LEU 1 0.770 65 1 A 2803 THR 1 0.800 66 1 A 2804 GLU 1 0.750 67 1 A 2805 LYS 1 0.760 68 1 A 2806 ASP 1 0.830 69 1 A 2807 TYR 1 0.810 70 1 A 2808 GLU 1 0.800 71 1 A 2809 GLY 1 0.880 72 1 A 2810 LEU 1 0.870 73 1 A 2811 LYS 1 0.850 74 1 A 2812 ARG 1 0.780 75 1 A 2813 VAL 1 0.870 76 1 A 2814 LEU 1 0.870 77 1 A 2815 ARG 1 0.770 78 1 A 2816 SER 1 0.860 79 1 A 2817 LEU 1 0.850 80 1 A 2818 GLN 1 0.810 81 1 A 2819 ALA 1 0.800 82 1 A 2820 HIS 1 0.760 83 1 A 2821 LYS 1 0.720 84 1 A 2822 MET 1 0.760 85 1 A 2823 ALA 1 0.840 86 1 A 2824 TRP 1 0.720 87 1 A 2825 PRO 1 0.800 88 1 A 2826 PHE 1 0.820 89 1 A 2827 LEU 1 0.820 90 1 A 2828 GLU 1 0.790 91 1 A 2829 PRO 1 0.820 92 1 A 2830 VAL 1 0.810 93 1 A 2831 ASP 1 0.750 94 1 A 2832 PRO 1 0.710 95 1 A 2833 ASN 1 0.640 96 1 A 2834 ASP 1 0.660 97 1 A 2835 ALA 1 0.730 98 1 A 2836 PRO 1 0.630 99 1 A 2837 ASP 1 0.710 100 1 A 2838 TYR 1 0.730 101 1 A 2839 TYR 1 0.700 102 1 A 2840 GLY 1 0.730 103 1 A 2841 VAL 1 0.720 104 1 A 2842 ILE 1 0.760 105 1 A 2843 LYS 1 0.730 106 1 A 2844 GLU 1 0.770 107 1 A 2845 PRO 1 0.850 108 1 A 2846 MET 1 0.850 109 1 A 2847 ASP 1 0.870 110 1 A 2848 LEU 1 0.860 111 1 A 2849 ALA 1 0.870 112 1 A 2850 THR 1 0.870 113 1 A 2851 MET 1 0.860 114 1 A 2852 GLU 1 0.840 115 1 A 2853 GLU 1 0.790 116 1 A 2854 ARG 1 0.780 117 1 A 2855 VAL 1 0.870 118 1 A 2856 GLN 1 0.790 119 1 A 2857 ARG 1 0.680 120 1 A 2858 ARG 1 0.740 121 1 A 2859 TYR 1 0.800 122 1 A 2860 TYR 1 0.810 123 1 A 2861 GLU 1 0.770 124 1 A 2862 LYS 1 0.760 125 1 A 2863 LEU 1 0.800 126 1 A 2864 THR 1 0.800 127 1 A 2865 GLU 1 0.810 128 1 A 2866 PHE 1 0.860 129 1 A 2867 VAL 1 0.850 130 1 A 2868 ALA 1 0.870 131 1 A 2869 ASP 1 0.870 132 1 A 2870 MET 1 0.870 133 1 A 2871 THR 1 0.870 134 1 A 2872 LYS 1 0.850 135 1 A 2873 ILE 1 0.860 136 1 A 2874 PHE 1 0.860 137 1 A 2875 ASP 1 0.850 138 1 A 2876 ASN 1 0.830 139 1 A 2877 CYS 1 0.830 140 1 A 2878 ARG 1 0.760 141 1 A 2879 TYR 1 0.760 142 1 A 2880 TYR 1 0.770 143 1 A 2881 ASN 1 0.770 144 1 A 2882 PRO 1 0.770 145 1 A 2883 SER 1 0.770 146 1 A 2884 ASP 1 0.760 147 1 A 2885 SER 1 0.790 148 1 A 2886 PRO 1 0.780 149 1 A 2887 PHE 1 0.800 150 1 A 2888 TYR 1 0.800 151 1 A 2889 GLN 1 0.790 152 1 A 2890 CYS 1 0.820 153 1 A 2891 ALA 1 0.860 154 1 A 2892 GLU 1 0.800 155 1 A 2893 VAL 1 0.830 156 1 A 2894 LEU 1 0.840 157 1 A 2895 GLU 1 0.820 158 1 A 2896 SER 1 0.830 159 1 A 2897 PHE 1 0.800 160 1 A 2898 PHE 1 0.830 161 1 A 2899 VAL 1 0.800 162 1 A 2900 GLN 1 0.720 163 1 A 2901 LYS 1 0.790 164 1 A 2902 LEU 1 0.770 165 1 A 2903 LYS 1 0.700 166 1 A 2904 GLY 1 0.710 167 1 A 2905 PHE 1 0.740 168 1 A 2906 LYS 1 0.700 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #