data_SMR-f6d7956d42634a6baf157df8bdfdf8dd_1 _entry.id SMR-f6d7956d42634a6baf157df8bdfdf8dd_1 _struct.entry_id SMR-f6d7956d42634a6baf157df8bdfdf8dd_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q5VT06/ CE350_HUMAN, Centrosome-associated protein 350 Estimated model accuracy of this model is 0.008, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q5VT06' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 407614.021 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP CE350_HUMAN Q5VT06 1 ;MRSSKSKEVPLPNPRNSQSKDTVQADITTSWDALSQTKAALRHIENKLEVAPTSTAVCDSVMDTKKSSTS ATRKISRKDGRYLDDSWVNAPISKSTKSRKEKSRSPLRATTLESNVKKNNRVEFREPLVSYREIHGAPSN FSSSHLESKHVYCVDVNEEKTESGNWMIGSREERNIRSCDFESSQSSVINDTVVRFLNDRPAIDALQNSE CLIRMGASMRTEEEMPNRTKGSENNLKLSVNNMAHDTDPKALRLTDSSPSSTSTSNSQRLDILKRRQHDV KLEKLKERIRKQWEHSEETNGRGQKLGHIDHPVMVVNVDNSVTAKVRKVATAPPAPAYKGFNPSETKIRT PDGKVWQEAEFQNMSRELYRDLALHFADDISIKEKPAEKSKEKKVVKPVRKVQKVAQLSSTECRTGSSHL ISTSSWRDGQKLVKKILGPAPRMEPKEQRTASSDRGGRERTAKSGGHIGRAESDPRLDVLHRHLQRNSER SRSKSRSENNIKKLASSLPDNKQEENTALNKDFLPIEIRGILDDLQLDSTAHTAKQDTVELQNQKSSAPV HAPRSHSPVKRKPDKITANEDPPVISKRRHYDTDEVRQYIVRQQEERKRKQNEEKKAQKEATEQKNKRLQ ELYRKQKEAFTKVKNVPPSEPSATRRLQETYSKLLLEKTLLEEPSHQHVTQETQAKPGYQPSGESDKENK VQERPPSASSSSDMSLSEPPQPLARKDLMESTWMQPERLSPQVHHSQPQPFAGTAGSLLSHLLSLEHVGI LHKDFESILPTRKNHNMASRPLTFTPQPYVTSPAAYTDALLKPSASQYKSKLDRIEALKATAASLSSRIE SEAKKLAGASINYGSAWNTEYDVQQAPQEDGPWTKAVTPPVKDDNEDVFSARIQKMLGSCVSHATFDDDL PGVGNLSEFKKLPEMIRPQSAISSFRVRSPGPKPEGLLAQLCKRQTDSSSSDMQACSQDKAKISLGSSID SVSEGPLLSEGSLSEEEGDQDGQPLLKVAEILKEKEFCPGERNSYEPIKEFQKEAEKFLPLFGHIGGTQS KGPWEELAKGSPHSVINIFTKSYQLYGKGFEDKLDRGTSTSRPLNATATPLSGVSYEDDFVSSPGTGTST EKKSTLEPHSTLSPQEDHSNRKSAYDPSSVDVTSQHSSGAQSAASSRSSTSSKGKKGKKEKTEWLDSFTG NVQNSLLDEEKAERGSHQGKKSGTSSKLSVKDFEQTLDTDSTLEDLSGHSVSVSSDKGRSQKTPTSPLSP SSQKSLQFDVAGTSSERSKSSVMPPTITGFKPNAPLTDLNPAASRTTTENMAPIPGSKRFSPAGLHHRMA AELSYLNAIEESVRQLSDVERVRGISLAQQESVSLAQIIKAQQQRHERDLALLKLKAEQEALESQRQLEE TRNKAAQVHAESLQQVVQSQREVTEVLQEATCKIAAQQSETARLTTDAARQICEMAELTRTHISDAVVAS GAPLAILYDHQRQHLPDFVKQLRTRTETDRKSPSVSLSQSKEGTLDSKHQKYSASYDSYSESSGYKNHDR RSSSGSSRQESPSVPSCKENEKKLNGEKIESSIDEQVQTAADDSLRSDSVPSLPDEKDSTSIATEYSLKF DESMTEDEIEEQSFRSLLPSESHRRFNMEKRRGHHDDSDEEASPEKTTLSTAKELNMPFSGGQDSFSKFT MEMVRQYMKEEEMRAAHQSSLLRLREKALKEKTKAELAWLEHQKKHLRDKGEDDKMPPLRKKQRGLLLRL QQEKAEIKRLQEANKAARKERQLILKQQEEIEKIRQTTIKLQEKLKSAGESKLDSHSDDDTKDNKATSPG PTDLETRSPSPISISSSETSSIMQKLKKMRSRMDEKFLTKREQKLMQRRQHAEELLEWKRRLDAEEAEIR QMEKQALAAWDKELIKPKTPKKELEDQRTEQKEIASEEESPVPLYSHLNSESSIPEELGSPAVEYVPSES IGQEQPGSPDHSILTEEMICSQELESSTSPSKHSLPKSCTSVSKQESSKGSHRTGGQCHLPIKSHQHCYS WSDESLSMTQSETTSDQSDIEGRIRALKDELRKRKSVVNQLKKEQKKRQKERLKAQEASLIKQLESYDEF IKKTEAELSQDLETSPTAKPQIKTLSSASEKPKIKPLTPLHRSETAKNWKSLTESERSRGSLESIAEHVD ASLSGSERSVSERSLSAYAKRVNEWDSRTEDFQTPSPVLRSSRKIREESGDSLENVPALHLLKELNATSR ILDMSDGKVGESSKKSEIKEIEYTKLKKSKIEDAFSKEGKSDVLLKLVLEQGDSSEILSKKDLPLDSENV QKDLVGLAIENLHKSEEMLKERQSDQDMNHSPNIQSGKDIHEQKNTKEKDLSWSEHLFAPKEIPYSEDFE VSSFKKEISAELYKDDFEVSSLLSLRKDSQSCRDKPQPMRSSTSGATSFGSNEEISECLSEKSLSIHSNV HSDRLLELKSPTELMKSKERSDVEHEQQVTESPSLASVPTADELFDFHIGDRVLIGNVQPGILRFKGETS FAKGFWAGVELDKPEGNNNGTYDGIAYFECKEKHGIFAPPQKISHIPENFDDYVDINEDEDCYSDERYQC YNQEQNDTEGPKDREKDVSEYFYEKSLPSVNDIEASVNRSRSLKIETDNVQDISGVLEAHVHQQSSVDSQ ISSKENKDLISDATEKVSIAAEDDTLDNTFSEELEKQQQFTEEEDNLYAEASEKLCTPLLDLLTREKNQL EAQLKSSLNEEKKSKQQLEKISLLTDSLLKVFVKDTVNQLQQIKKTRDEKIQLSNQELLGDDQKKVTPQD LSQNVEEQSPSISGCFLSSELEDEKEEISSPDMCPRPESPVFGASGQEELAKRLAELELSREFLSALGDD QDWFDEDFGLSSSHKIQKNKAEETIVPLMAEPKRVTQQPCETLLAVPHTAEEVEILVHNAAEELWKWKEL GHDLHSISIPTKLLGCASKGLDIESTSKRVYKQAVFDLTKEIFEEIFAEDPNLNQPVWMKPCRINSSYFR RVKNPNNLDEIKSFIASEVLKLFSLKKEPNHKTDWQKMMKFGRKKRDRVDHILVQELHEEEAQWVNYDED ELCVKMQLADGIFETLIKDTIDVLNQISEKQGRMLLV ; 'Centrosome-associated protein 350' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 3117 1 3117 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . CE350_HUMAN Q5VT06 . 1 3117 9606 'Homo sapiens (Human)' 2004-12-07 DD0E03EA96DA319E # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MRSSKSKEVPLPNPRNSQSKDTVQADITTSWDALSQTKAALRHIENKLEVAPTSTAVCDSVMDTKKSSTS ATRKISRKDGRYLDDSWVNAPISKSTKSRKEKSRSPLRATTLESNVKKNNRVEFREPLVSYREIHGAPSN FSSSHLESKHVYCVDVNEEKTESGNWMIGSREERNIRSCDFESSQSSVINDTVVRFLNDRPAIDALQNSE CLIRMGASMRTEEEMPNRTKGSENNLKLSVNNMAHDTDPKALRLTDSSPSSTSTSNSQRLDILKRRQHDV KLEKLKERIRKQWEHSEETNGRGQKLGHIDHPVMVVNVDNSVTAKVRKVATAPPAPAYKGFNPSETKIRT PDGKVWQEAEFQNMSRELYRDLALHFADDISIKEKPAEKSKEKKVVKPVRKVQKVAQLSSTECRTGSSHL ISTSSWRDGQKLVKKILGPAPRMEPKEQRTASSDRGGRERTAKSGGHIGRAESDPRLDVLHRHLQRNSER SRSKSRSENNIKKLASSLPDNKQEENTALNKDFLPIEIRGILDDLQLDSTAHTAKQDTVELQNQKSSAPV HAPRSHSPVKRKPDKITANEDPPVISKRRHYDTDEVRQYIVRQQEERKRKQNEEKKAQKEATEQKNKRLQ 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A 1 2971 TYR 2971 ? ? ? A . A 1 2972 LYS 2972 ? ? ? A . A 1 2973 GLN 2973 ? ? ? A . A 1 2974 ALA 2974 ? ? ? A . A 1 2975 VAL 2975 ? ? ? A . A 1 2976 PHE 2976 ? ? ? A . A 1 2977 ASP 2977 ? ? ? A . A 1 2978 LEU 2978 ? ? ? A . A 1 2979 THR 2979 ? ? ? A . A 1 2980 LYS 2980 ? ? ? A . A 1 2981 GLU 2981 ? ? ? A . A 1 2982 ILE 2982 ? ? ? A . A 1 2983 PHE 2983 ? ? ? A . A 1 2984 GLU 2984 ? ? ? A . A 1 2985 GLU 2985 ? ? ? A . A 1 2986 ILE 2986 ? ? ? A . A 1 2987 PHE 2987 ? ? ? A . A 1 2988 ALA 2988 ? ? ? A . A 1 2989 GLU 2989 ? ? ? A . A 1 2990 ASP 2990 ? ? ? A . A 1 2991 PRO 2991 ? ? ? A . A 1 2992 ASN 2992 ? ? ? A . A 1 2993 LEU 2993 ? ? ? A . A 1 2994 ASN 2994 ? ? ? A . A 1 2995 GLN 2995 ? ? ? A . A 1 2996 PRO 2996 ? ? ? A . A 1 2997 VAL 2997 ? ? ? A . A 1 2998 TRP 2998 ? ? ? A . A 1 2999 MET 2999 ? ? ? A . A 1 3000 LYS 3000 ? ? ? A . A 1 3001 PRO 3001 ? ? ? A . A 1 3002 CYS 3002 ? ? ? A . A 1 3003 ARG 3003 ? ? ? A . A 1 3004 ILE 3004 ? ? ? A . A 1 3005 ASN 3005 ? ? ? A . A 1 3006 SER 3006 ? ? ? A . A 1 3007 SER 3007 ? ? ? A . A 1 3008 TYR 3008 ? ? ? A . A 1 3009 PHE 3009 ? ? ? A . A 1 3010 ARG 3010 ? ? ? A . A 1 3011 ARG 3011 ? ? ? A . A 1 3012 VAL 3012 ? ? ? A . A 1 3013 LYS 3013 ? ? ? A . A 1 3014 ASN 3014 ? ? ? A . A 1 3015 PRO 3015 ? ? ? A . A 1 3016 ASN 3016 ? ? ? A . A 1 3017 ASN 3017 ? ? ? A . A 1 3018 LEU 3018 ? ? ? A . A 1 3019 ASP 3019 ? ? ? A . A 1 3020 GLU 3020 ? ? ? A . A 1 3021 ILE 3021 ? ? ? A . A 1 3022 LYS 3022 ? ? ? A . A 1 3023 SER 3023 ? ? ? A . A 1 3024 PHE 3024 ? ? ? A . A 1 3025 ILE 3025 ? ? ? A . A 1 3026 ALA 3026 ? ? ? A . A 1 3027 SER 3027 ? ? ? A . A 1 3028 GLU 3028 ? ? ? A . A 1 3029 VAL 3029 ? ? ? A . A 1 3030 LEU 3030 ? ? ? A . A 1 3031 LYS 3031 ? ? ? A . A 1 3032 LEU 3032 ? ? ? A . A 1 3033 PHE 3033 ? ? ? A . A 1 3034 SER 3034 ? ? ? A . A 1 3035 LEU 3035 ? ? ? A . A 1 3036 LYS 3036 ? ? ? A . A 1 3037 LYS 3037 ? ? ? A . A 1 3038 GLU 3038 ? ? ? A . A 1 3039 PRO 3039 ? ? ? A . A 1 3040 ASN 3040 ? ? ? A . A 1 3041 HIS 3041 ? ? ? A . A 1 3042 LYS 3042 ? ? ? A . A 1 3043 THR 3043 ? ? ? A . A 1 3044 ASP 3044 ? ? ? A . A 1 3045 TRP 3045 ? ? ? A . A 1 3046 GLN 3046 ? ? ? A . A 1 3047 LYS 3047 ? ? ? A . A 1 3048 MET 3048 ? ? ? A . A 1 3049 MET 3049 ? ? ? A . A 1 3050 LYS 3050 ? ? ? A . A 1 3051 PHE 3051 ? ? ? A . A 1 3052 GLY 3052 ? ? ? A . A 1 3053 ARG 3053 ? ? ? A . A 1 3054 LYS 3054 ? ? ? A . A 1 3055 LYS 3055 ? ? ? A . A 1 3056 ARG 3056 ? ? ? A . A 1 3057 ASP 3057 ? ? ? A . A 1 3058 ARG 3058 ? ? ? A . A 1 3059 VAL 3059 ? ? ? A . A 1 3060 ASP 3060 ? ? ? A . A 1 3061 HIS 3061 ? ? ? A . A 1 3062 ILE 3062 ? ? ? A . A 1 3063 LEU 3063 ? ? ? A . A 1 3064 VAL 3064 ? ? ? A . A 1 3065 GLN 3065 ? ? ? A . A 1 3066 GLU 3066 ? ? ? A . A 1 3067 LEU 3067 ? ? ? A . A 1 3068 HIS 3068 ? ? ? A . A 1 3069 GLU 3069 ? ? ? A . A 1 3070 GLU 3070 ? ? ? A . A 1 3071 GLU 3071 ? ? ? A . A 1 3072 ALA 3072 ? ? ? A . A 1 3073 GLN 3073 ? ? ? A . A 1 3074 TRP 3074 ? ? ? A . A 1 3075 VAL 3075 ? ? ? A . A 1 3076 ASN 3076 ? ? ? A . A 1 3077 TYR 3077 ? ? ? A . A 1 3078 ASP 3078 ? ? ? A . A 1 3079 GLU 3079 ? ? ? A . A 1 3080 ASP 3080 ? ? ? A . A 1 3081 GLU 3081 ? ? ? A . A 1 3082 LEU 3082 ? ? ? A . A 1 3083 CYS 3083 ? ? ? A . A 1 3084 VAL 3084 ? ? ? A . A 1 3085 LYS 3085 ? ? ? A . A 1 3086 MET 3086 ? ? ? A . A 1 3087 GLN 3087 ? ? ? A . A 1 3088 LEU 3088 ? ? ? A . A 1 3089 ALA 3089 ? ? ? A . A 1 3090 ASP 3090 ? ? ? A . A 1 3091 GLY 3091 ? ? ? A . A 1 3092 ILE 3092 ? ? ? A . A 1 3093 PHE 3093 ? ? ? A . A 1 3094 GLU 3094 ? ? ? A . A 1 3095 THR 3095 ? ? ? A . A 1 3096 LEU 3096 ? ? ? A . A 1 3097 ILE 3097 ? ? ? A . A 1 3098 LYS 3098 ? ? ? A . A 1 3099 ASP 3099 ? ? ? A . A 1 3100 THR 3100 ? ? ? A . A 1 3101 ILE 3101 ? ? ? A . A 1 3102 ASP 3102 ? ? ? A . A 1 3103 VAL 3103 ? ? ? A . A 1 3104 LEU 3104 ? ? ? A . A 1 3105 ASN 3105 ? ? ? A . A 1 3106 GLN 3106 ? ? ? A . A 1 3107 ILE 3107 ? ? ? A . A 1 3108 SER 3108 ? ? ? A . A 1 3109 GLU 3109 ? ? ? A . A 1 3110 LYS 3110 ? ? ? A . A 1 3111 GLN 3111 ? ? ? A . A 1 3112 GLY 3112 ? ? ? A . A 1 3113 ARG 3113 ? ? ? A . A 1 3114 MET 3114 ? ? ? A . A 1 3115 LEU 3115 ? ? ? A . A 1 3116 LEU 3116 ? ? ? A . A 1 3117 VAL 3117 ? ? ? A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'centrosome-associated protein 350 {PDB ID=2coz, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=2coz.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 2coz, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 1' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-04 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-29 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GSSGSSGVEHEQQVTESPSLASVPTADELFDFHIGDRVLIGNVQPGILRFKGETSFAKGFWAGVELDKPE GNNNGTYDGIAYFECKEKHGIFAPPQKISHIPENFDDYVDINEDEDSGPSSG ; ;GSSGSSGVEHEQQVTESPSLASVPTADELFDFHIGDRVLIGNVQPGILRFKGETSFAKGFWAGVELDKPE GNNNGTYDGIAYFECKEKHGIFAPPQKISHIPENFDDYVDINEDEDSGPSSG ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 23 116 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 2coz 2024-05-29 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 3117 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 3117 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 2.1e-17 100.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MRSSKSKEVPLPNPRNSQSKDTVQADITTSWDALSQTKAALRHIENKLEVAPTSTAVCDSVMDTKKSSTSATRKISRKDGRYLDDSWVNAPISKSTKSRKEKSRSPLRATTLESNVKKNNRVEFREPLVSYREIHGAPSNFSSSHLESKHVYCVDVNEEKTESGNWMIGSREERNIRSCDFESSQSSVINDTVVRFLNDRPAIDALQNSECLIRMGASMRTEEEMPNRTKGSENNLKLSVNNMAHDTDPKALRLTDSSPSSTSTSNSQRLDILKRRQHDVKLEKLKERIRKQWEHSEETNGRGQKLGHIDHPVMVVNVDNSVTAKVRKVATAPPAPAYKGFNPSETKIRTPDGKVWQEAEFQNMSRELYRDLALHFADDISIKEKPAEKSKEKKVVKPVRKVQKVAQLSSTECRTGSSHLISTSSWRDGQKLVKKILGPAPRMEPKEQRTASSDRGGRERTAKSGGHIGRAESDPRLDVLHRHLQRNSERSRSKSRSENNIKKLASSLPDNKQEENTALNKDFLPIEIRGILDDLQLDSTAHTAKQDTVELQNQKSSAPVHAPRSHSPVKRKPDKITANEDPPVISKRRHYDTDEVRQYIVRQQEERKRKQNEEKKAQKEATEQKNKRLQELYRKQKEAFTKVKNVPPSEPSATRRLQETYSKLLLEKTLLEEPSHQHVTQETQAKPGYQPSGESDKENKVQERPPSASSSSDMSLSEPPQPLARKDLMESTWMQPERLSPQVHHSQPQPFAGTAGSLLSHLLSLEHVGILHKDFESILPTRKNHNMASRPLTFTPQPYVTSPAAYTDALLKPSASQYKSKLDRIEALKATAASLSSRIESEAKKLAGASINYGSAWNTEYDVQQAPQEDGPWTKAVTPPVKDDNEDVFSARIQKMLGSCVSHATFDDDLPGVGNLSEFKKLPEMIRPQSAISSFRVRSPGPKPEGLLAQLCKRQTDSSSSDMQACSQDKAKISLGSSIDSVSEGPLLSEGSLSEEEGDQDGQPLLKVAEILKEKEFCPGERNSYEPIKEFQKEAEKFLPLFGHIGGTQSKGPWEELAKGSPHSVINIFTKSYQLYGKGFEDKLDRGTSTSRPLNATATPLSGVSYEDDFVSSPGTGTSTEKKSTLEPHSTLSPQEDHSNRKSAYDPSSVDVTSQHSSGAQSAASSRSSTSSKGKKGKKEKTEWLDSFTGNVQNSLLDEEKAERGSHQGKKSGTSSKLSVKDFEQTLDTDSTLEDLSGHSVSVSSDKGRSQKTPTSPLSPSSQKSLQFDVAGTSSERSKSSVMPPTITGFKPNAPLTDLNPAASRTTTENMAPIPGSKRFSPAGLHHRMAAELSYLNAIEESVRQLSDVERVRGISLAQQESVSLAQIIKAQQQRHERDLALLKLKAEQEALESQRQLEETRNKAAQVHAESLQQVVQSQREVTEVLQEATCKIAAQQSETARLTTDAARQICEMAELTRTHISDAVVASGAPLAILYDHQRQHLPDFVKQLRTRTETDRKSPSVSLSQSKEGTLDSKHQKYSASYDSYSESSGYKNHDRRSSSGSSRQESPSVPSCKENEKKLNGEKIESSIDEQVQTAADDSLRSDSVPSLPDEKDSTSIATEYSLKFDESMTEDEIEEQSFRSLLPSESHRRFNMEKRRGHHDDSDEEASPEKTTLSTAKELNMPFSGGQDSFSKFTMEMVRQYMKEEEMRAAHQSSLLRLREKALKEKTKAELAWLEHQKKHLRDKGEDDKMPPLRKKQRGLLLRLQQEKAEIKRLQEANKAARKERQLILKQQEEIEKIRQTTIKLQEKLKSAGESKLDSHSDDDTKDNKATSPGPTDLETRSPSPISISSSETSSIMQKLKKMRSRMDEKFLTKREQKLMQRRQHAEELLEWKRRLDAEEAEIRQMEKQALAAWDKELIKPKTPKKELEDQRTEQKEIASEEESPVPLYSHLNSESSIPEELGSPAVEYVPSESIGQEQPGSPDHSILTEEMICSQELESSTSPSKHSLPKSCTSVSKQESSKGSHRTGGQCHLPIKSHQHCYSWSDESLSMTQSETTSDQSDIEGRIRALKDELRKRKSVVNQLKKEQKKRQKERLKAQEASLIKQLESYDEFIKKTEAELSQDLETSPTAKPQIKTLSSASEKPKIKPLTPLHRSETAKNWKSLTESERSRGSLESIAEHVDASLSGSERSVSERSLSAYAKRVNEWDSRTEDFQTPSPVLRSSRKIREESGDSLENVPALHLLKELNATSRILDMSDGKVGESSKKSEIKEIEYTKLKKSKIEDAFSKEGKSDVLLKLVLEQGDSSEILSKKDLPLDSENVQKDLVGLAIENLHKSEEMLKERQSDQDMNHSPNIQSGKDIHEQKNTKEKDLSWSEHLFAPKEIPYSEDFEVSSFKKEISAELYKDDFEVSSLLSLRKDSQSCRDKPQPMRSSTSGATSFGSNEEISECLSEKSLSIHSNVHSDRLLELKSPTELMKSKERSDVEHEQQVTESPSLASVPTADELFDFHIGDRVLIGNVQPGILRFKGETSFAKGFWAGVELDKPEGNNNGTYDGIAYFECKEKHGIFAPPQKISHIPENFDDYVDINEDEDCYSDERYQCYNQEQNDTEGPKDREKDVSEYFYEKSLPSVNDIEASVNRSRSLKIETDNVQDISGVLEAHVHQQSSVDSQISSKENKDLISDATEKVSIAAEDDTLDNTFSEELEKQQQFTEEEDNLYAEASEKLCTPLLDLLTREKNQLEAQLKSSLNEEKKSKQQLEKISLLTDSLLKVFVKDTVNQLQQIKKTRDEKIQLSNQELLGDDQKKVTPQDLSQNVEEQSPSISGCFLSSELEDEKEEISSPDMCPRPESPVFGASGQEELAKRLAELELSREFLSALGDDQDWFDEDFGLSSSHKIQKNKAEETIVPLMAEPKRVTQQPCETLLAVPHTAEEVEILVHNAAEELWKWKELGHDLHSISIPTKLLGCASKGLDIESTSKRVYKQAVFDLTKEIFEEIFAEDPNLNQPVWMKPCRINSSYFRRVKNPNNLDEIKSFIASEVLKLFSLKKEPNHKTDWQKMMKFGRKKRDRVDHILVQELHEEEAQWVNYDEDELCVKMQLADGIFETLIKDTIDVLNQISEKQGRMLLV 2 1 2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------VPTADELFDFHIGDRVLIGNVQPGILRFKGETSFAKGFWAGVELDKPEGNNNGTYDGIAYFECKEKHGIFAPPQKISHIPENFDDYVDINEDED-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 2coz.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 1' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id 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PHE 2525 2525 ? A 4.078 -10.299 5.636 1 1 A PHE 0.700 1 ATOM 293 C CD1 . PHE 2525 2525 ? A 4.350 -9.538 6.780 1 1 A PHE 0.700 1 ATOM 294 C CD2 . PHE 2525 2525 ? A 4.449 -11.652 5.617 1 1 A PHE 0.700 1 ATOM 295 C CE1 . PHE 2525 2525 ? A 5.011 -10.105 7.876 1 1 A PHE 0.700 1 ATOM 296 C CE2 . PHE 2525 2525 ? A 5.090 -12.229 6.722 1 1 A PHE 0.700 1 ATOM 297 C CZ . PHE 2525 2525 ? A 5.382 -11.452 7.847 1 1 A PHE 0.700 1 ATOM 298 N N . TRP 2526 2526 ? A 0.797 -7.521 4.866 1 1 A TRP 0.680 1 ATOM 299 C CA . TRP 2526 2526 ? A 0.362 -6.192 4.543 1 1 A TRP 0.680 1 ATOM 300 C C . TRP 2526 2526 ? A 1.004 -5.235 5.522 1 1 A TRP 0.680 1 ATOM 301 O O . TRP 2526 2526 ? A 0.856 -5.369 6.731 1 1 A TRP 0.680 1 ATOM 302 C CB . TRP 2526 2526 ? A -1.168 -6.147 4.684 1 1 A TRP 0.680 1 ATOM 303 C CG . TRP 2526 2526 ? A -1.867 -6.871 3.551 1 1 A TRP 0.680 1 ATOM 304 C CD1 . TRP 2526 2526 ? A -2.365 -8.141 3.482 1 1 A TRP 0.680 1 ATOM 305 C CD2 . TRP 2526 2526 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #