data_SMR-13d9d40b1d2e1867c2de241a45dac826_7 _entry.id SMR-13d9d40b1d2e1867c2de241a45dac826_7 _struct.entry_id SMR-13d9d40b1d2e1867c2de241a45dac826_7 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q14789 (isoform 2)/ GOGB1_HUMAN, Golgin subfamily B member 1 Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q14789 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 430871.435 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP GOGB1_HUMAN Q14789 1 ;MEFNNTTQEDVQERLAYAEQLVVELKDIIRQKDVQLQQKDEALQEERKAADNKIKKLKLHAKAKLTSLNK YIEEMKAQGGTVLPTEPQSEEQLSKHDKSSTEEEMEIEKIKHKLQEKEELISTLQAQLTQAQAEQPAQSS TEMEEFVMMKQQLQEKEEFISTLQAQLSQTQAEQAAQLSSMQQVVREKDARFETQVRLHEDELLQLVTQA DVETEMQQKLRVLQRKLEEHEESLVGRAQVVDLLQQELTAAEQRNQILSQQLQQMEAEHNTLRNTVETER EESKILLEKMELEVAERKLSFHNLQEEMHHLLEQFEQAGQAQAELESRYSALEQKHKAEMEEKTSHILSL QKTGQELQSACDALKDQNSKLLQDKNEQAVQSAQTIQQLEDQLQQKSKEISQFLNRLPLQQHETASQTSF PDVYNEGTQAVTEENIASLQKRVVELENEKGALLLSSIELEELKAENEKLSSQITLLEAQNRTGEADREV SEISIVDIANKRSSSAEESGQDVLENTFSQKHKELSVLLLEMKEAQEEIAFLKLQLQGKRAEEADHEVLD QKEMKQMEGEGIAPIKMKVFLEDTGQDFPLMPNEESSLPAVEKEQASTEHQSRTSEEISLNDAGVELKST KQDGDKSLSAVPDIGQCHQDELERLKSQILELELNFHKAQEIYEKNLDEKAKEISNLNQLIEEFKKNADN NSSAFTALSEERDQLLSQVKELSMVTELRAQVKQLEMNLAEAERQRRLDYESQTAHDNLLTEQIHSLSIE AKSKDVKIEVLQNELDDVQLQFSEQSTLIRSLQSQLQNKESEVLEGAERVRHISSKVEELSQALSQKELE ITKMDQLLLEKKRDVETLQQTIEEKDQQVTEISFSMTEKMVQLNEEKFSLGVEIKTLKEQLNLLSRAEEA KKEQVEEDNEVSSGLKQNYDEMSPAGQISKEELQHEFDLLKKENEQRKRKLQAALINRKELLQRVSRLEE ELANLKDESKKEIPLSETERGEVEEDKENKEYSEKCVTSKCQEIEIYLKQTISEKEVELQHIRKDLEEKL AAEEQFQALVKQMNQTLQDKTNQIDLLQAEISENQAIIQKLITSNTDASDGDSVALVKETVVISPPCTGS SEHWKPELEEKILALEKEKEQLQKKLQEALTSRKAILKKAQEKERHLREELKQQKDDYNRLQEQFDEQSK ENENIGDQLRQLQIQVRESIDGKLPSTDQQESCSSTPGLEEPLFKATEQHHTQPVLESNLCPDWPSHSED ASALQGGTSVAQIKAQLKEIEAEKVELELKVSSTTSELTKKSEEVFQLQEQINKQGLEIESLKTVSHEAE VHAESLQQKLESSQLQIAGLEHLRELQPKLDELQKLISKKEEDVSYLSGQLSEKEAALTKIQTEIIEQED LIKALHTQLEMQAKEHDERIKQLQVELCEMKQKPEEIGEESRAKQQIQRKLQAALISRKEALKENKSLQE ELSLARGTIERLTKSLADVESQVSAQNKEKDTVLGRLALLQEERDKLITEMDRSLLENQSLSSSCESLKL ALEGLTEDKEKLVKEIESLKSSKIAESTEWQEKHKELQKEYEILLQSYENVSNEAERIQHVVEAVRQEKQ ELYGKLRSTEANKKETEKQLQEAEQEMEEMKEKMRKFAKSKQQKILELEEENDRLRAEVHPAGDTAKECM ETLLSSNASMKEELERVKMEYETLSKKFQSLMSEKDSLSEEVQDLKHQIEGNVSKQANLEATEKHDNQTN VTEEGTQSIPGETEEQDSLSMSTRPTCSESVPSAKSANPAVSKDFSSHDEINNYLQQIDQLKERIAGLEE EKQKNKEFSQTLENEKNTLLSQISTKDGELKMLQEEVTKMNLLNQQIQEELSRVTKLKETAEEEKDDLEE RLMNQLAELNGSIGNYCQDVTDAQIKNELLESEMKNLKKCVSELEEEKQQLVKEKTKVESEIRKEYLEKI QGAQKEPGNKSHAKELQELLKEKQQEVKQLQKDCIRYQEKISALERTVKALEFVQTESQKDLEITKENLA QAVEHRKKAQAELASFKVLLDDTQSEAARVLADNLKLKKELQSNKESVKSQMKQKDEDLERRLEQAEEKH LKEKKNMQEKLDALRREKVHLEETIGEIQVTLNKKDKEVQQLQENLDSTVTQLAAFTKSMSSLQDDRDRV IDEAKKWERKFSDAIQSKEEEIRLKEDNCSVLKDQLRQMSIHMEELKINISRLEHDKQIWESKAQTEVQL QQKVCDTLQGENKELLSQLEETRHLYHSSQNELAKLESELKSLKDQLTDLSNSLEKCKEQKGNLEGIIRQ QEADIQNSKFSYEQLETDLQASRELTSRLHEEINMKEQKIISLLSGKEEAIQVAIAELRQQHDKEIKELE NLLSQEEEENIVLEEENKKAVDKTNQLMETLKTIKKENIQQKAQLDSFVKSMSSLQNDRDRIVGDYQQLE ERHLSIILEKDQLIQEAAAENNKLKEEIRGLRSHMDDLNSENAKLDAELIQYREDLNQVITIKDSQQKQL LEVQLQQNKELENKYAKLEEKLKESEEANEDLRRSFNALQEEKQDLSKEIESLKVSISQLTRQVTALQEE GTLGLYHAQLKVKEEEVHRLSALFSSSQKRIAELEEELVCVQKEAAKKVGEIEDKLKKELKHLHHDAGIM RNETETAEERVAELARDLVEMEQKLLMVTKENKGLTAQIQSFGRSMSSLQNSRDHANEELDELKRKYDAS LKELAQLKEQGLLNRERDALLSETAFSMNSTEENSLSHLEKLNQQLLSKDEQLLHLSSQLEDSYNQVQSF SKAMASLQNERDHLWNELEKFRKSEEGKQRSAAQPSTSPAEVQSLKKAMSSLQNDRDRLLKELKNLQQQY LQINQEITELHPLKAQLQEYQDKTKAFQIMQEELRQENLSWQHELHQLRMEKSSWEIHERRMKEQYLMAI SDKDQQLSHLQNLIRELRSSSSQTQPLKVQYQRQASPETSASPDGSQNLVYETELLRTQLNDSLKEIHQK ELRIQQLNSNFSQLLEEKNTLSIQLCDTSQSLRENQQHYGDLLNHCAVLEKQVQELQAGPLNIDVAPGAP QEKNGVHRKSDPEELREPQQSFSEAQQQLCNTRQEVNELRKLLEEERDQRVAAENALSVAEEQIRRLEHS EWDSSRTPIIGSCGTQEQALLIDLTSNSCRRTRSGVGWKRVLRSLCHSRTRVPLLAAIYFLMIHVLLILC FTGHL ; 'Golgin subfamily B member 1' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 3225 1 3225 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . 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A 1 3120 ARG 3120 ? ? ? A . A 1 3121 LYS 3121 ? ? ? A . A 1 3122 LEU 3122 ? ? ? A . A 1 3123 LEU 3123 ? ? ? A . A 1 3124 GLU 3124 ? ? ? A . A 1 3125 GLU 3125 ? ? ? A . A 1 3126 GLU 3126 ? ? ? A . A 1 3127 ARG 3127 ? ? ? A . A 1 3128 ASP 3128 ? ? ? A . A 1 3129 GLN 3129 ? ? ? A . A 1 3130 ARG 3130 ? ? ? A . A 1 3131 VAL 3131 ? ? ? A . A 1 3132 ALA 3132 ? ? ? A . A 1 3133 ALA 3133 ? ? ? A . A 1 3134 GLU 3134 ? ? ? A . A 1 3135 ASN 3135 ? ? ? A . A 1 3136 ALA 3136 ? ? ? A . A 1 3137 LEU 3137 ? ? ? A . A 1 3138 SER 3138 ? ? ? A . A 1 3139 VAL 3139 ? ? ? A . A 1 3140 ALA 3140 ? ? ? A . A 1 3141 GLU 3141 ? ? ? A . A 1 3142 GLU 3142 ? ? ? A . A 1 3143 GLN 3143 ? ? ? A . A 1 3144 ILE 3144 ? ? ? A . A 1 3145 ARG 3145 ? ? ? A . A 1 3146 ARG 3146 ? ? ? A . A 1 3147 LEU 3147 ? ? ? A . A 1 3148 GLU 3148 ? ? ? A . A 1 3149 HIS 3149 ? ? ? A . A 1 3150 SER 3150 ? ? ? A . A 1 3151 GLU 3151 ? ? ? A . A 1 3152 TRP 3152 ? ? ? A . A 1 3153 ASP 3153 ? ? ? A . A 1 3154 SER 3154 ? ? ? A . A 1 3155 SER 3155 ? ? ? A . A 1 3156 ARG 3156 ? ? ? A . A 1 3157 THR 3157 ? ? ? A . A 1 3158 PRO 3158 ? ? ? A . A 1 3159 ILE 3159 ? ? ? A . A 1 3160 ILE 3160 ? ? ? A . A 1 3161 GLY 3161 ? ? ? A . A 1 3162 SER 3162 ? ? ? A . A 1 3163 CYS 3163 ? ? ? A . A 1 3164 GLY 3164 ? ? ? A . A 1 3165 THR 3165 ? ? ? A . A 1 3166 GLN 3166 ? ? ? A . A 1 3167 GLU 3167 ? ? ? A . A 1 3168 GLN 3168 ? ? ? A . A 1 3169 ALA 3169 ? ? ? A . A 1 3170 LEU 3170 ? ? ? A . A 1 3171 LEU 3171 ? ? ? A . A 1 3172 ILE 3172 ? ? ? A . A 1 3173 ASP 3173 ? ? ? A . A 1 3174 LEU 3174 ? ? ? A . A 1 3175 THR 3175 ? ? ? A . A 1 3176 SER 3176 ? ? ? A . A 1 3177 ASN 3177 ? ? ? A . A 1 3178 SER 3178 ? ? ? A . A 1 3179 CYS 3179 ? ? ? A . A 1 3180 ARG 3180 ? ? ? A . A 1 3181 ARG 3181 ? ? ? A . A 1 3182 THR 3182 ? ? ? A . A 1 3183 ARG 3183 ? ? ? A . A 1 3184 SER 3184 ? ? ? A . A 1 3185 GLY 3185 ? ? ? A . A 1 3186 VAL 3186 ? ? ? A . A 1 3187 GLY 3187 ? ? ? A . A 1 3188 TRP 3188 ? ? ? A . A 1 3189 LYS 3189 ? ? ? A . A 1 3190 ARG 3190 ? ? ? A . A 1 3191 VAL 3191 ? ? ? A . A 1 3192 LEU 3192 ? ? ? A . A 1 3193 ARG 3193 ? ? ? A . A 1 3194 SER 3194 ? ? ? A . A 1 3195 LEU 3195 ? ? ? A . A 1 3196 CYS 3196 ? ? ? A . A 1 3197 HIS 3197 ? ? ? A . A 1 3198 SER 3198 ? ? ? A . A 1 3199 ARG 3199 ? ? ? A . A 1 3200 THR 3200 ? ? ? A . A 1 3201 ARG 3201 ? ? ? A . A 1 3202 VAL 3202 ? ? ? A . A 1 3203 PRO 3203 ? ? ? A . A 1 3204 LEU 3204 ? ? ? A . A 1 3205 LEU 3205 ? ? ? A . A 1 3206 ALA 3206 ? ? ? A . A 1 3207 ALA 3207 ? ? ? A . A 1 3208 ILE 3208 ? ? ? A . A 1 3209 TYR 3209 ? ? ? A . A 1 3210 PHE 3210 ? ? ? A . A 1 3211 LEU 3211 ? ? ? A . A 1 3212 MET 3212 ? ? ? A . A 1 3213 ILE 3213 ? ? ? A . A 1 3214 HIS 3214 ? ? ? A . A 1 3215 VAL 3215 ? ? ? A . A 1 3216 LEU 3216 ? ? ? A . A 1 3217 LEU 3217 ? ? ? A . A 1 3218 ILE 3218 ? ? ? A . A 1 3219 LEU 3219 ? ? ? A . A 1 3220 CYS 3220 ? ? ? A . A 1 3221 PHE 3221 ? ? ? A . A 1 3222 THR 3222 ? ? ? A . A 1 3223 GLY 3223 ? ? ? A . A 1 3224 HIS 3224 ? ? ? A . A 1 3225 LEU 3225 ? ? ? A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Chromosome partition protein MukB,Chromosome partition protein MukB {PDB ID=6h2x, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=6h2x.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 6h2x, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 7' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-04 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-29 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;ASDHLNLVQTALRQQEKIERYEADLDELQIRLEEQNEVVAEAIERQQENEARAEAAELEVDELKSQLADY QQALDVQQTRAIQYNQAIAALNRAKELCHLPDLTADCAAEWLETFQAKELEATEKMLSLEQKMSMAQTAH SQFEQAYQLVVAINGPLARNEAWDVARELLREGVDQRHLAEQVQPLRMRLSELESGGSDRVDEIRERLDE AQEAARFVQQFGNQLAKLEPIVSVLQSDPEQFEQLKEDYAYSQQMQRDARQQAFALTEVVQRRAHFSYSD SAEMLSGNSDLNEKLRERLEQAEAERTRAREALRGHAAQLSQYNQVLASLKSSYDTKKELLNDLQRELQD IGVRADSGAGSHHHHHH ; ;ASDHLNLVQTALRQQEKIERYEADLDELQIRLEEQNEVVAEAIERQQENEARAEAAELEVDELKSQLADY QQALDVQQTRAIQYNQAIAALNRAKELCHLPDLTADCAAEWLETFQAKELEATEKMLSLEQKMSMAQTAH SQFEQAYQLVVAINGPLARNEAWDVARELLREGVDQRHLAEQVQPLRMRLSELESGGSDRVDEIRERLDE AQEAARFVQQFGNQLAKLEPIVSVLQSDPEQFEQLKEDYAYSQQMQRDARQQAFALTEVVQRRAHFSYSD SAEMLSGNSDLNEKLRERLEQAEAERTRAREALRGHAAQLSQYNQVLASLKSSYDTKKELLNDLQRELQD IGVRADSGAGSHHHHHH ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 290 348 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 6h2x 2024-10-23 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 3225 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 3225 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 11.000 18.644 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MEFNNTTQEDVQERLAYAEQLVVELKDIIRQKDVQLQQKDEALQEERKAADNKIKKLKLHAKAKLTSLNKYIEEMKAQGGTVLPTEPQSEEQLSKHDKSSTEEEMEIEKIKHKLQEKEELISTLQAQLTQAQAEQPAQSSTEMEEFVMMKQQLQEKEEFISTLQAQLSQTQAEQAAQLSSMQQVVREKDARFETQVRLHEDELLQLVTQADVETEMQQKLRVLQRKLEEHEESLVGRAQVVDLLQQELTAAEQRNQILSQQLQQMEAEHNTLRNTVETEREESKILLEKMELEVAERKLSFHNLQEEMHHLLEQFEQAGQAQAELESRYSALEQKHKAEMEEKTSHILSLQKTGQELQSACDALKDQNSKLLQDKNEQAVQSAQTIQQLEDQLQQKSKEISQFLNRLPLQQHETASQTSFPDVYNEGTQAVTEENIASLQKRVVELENEKGALLLSSIELEELKAENEKLSSQITLLEAQNRTGEADREVSEISIVDIANKRSSSAEESGQDVLENTFSQKHKELSVLLLEMKEAQEEIAFLKLQLQGKRAEEADHEVLDQKEMKQMEGEGIAPIKMKVFLEDTGQDFPLMPNEESSLPAVEKEQASTEHQSRTSEEISLNDAGVELKSTKQDGDKSLSAVPDIGQCHQDELERLKSQILELELNFHKAQEIYEKNLDEKAKEISNLNQLIEEFKKNADNNSSAFTALSEERDQLLSQVKELSMVTELRAQVKQLEMNLAEAERQRRLDYESQTAHDNLLTEQIHSLSIEAKSKDVKIEVLQNELDDVQLQFSEQSTLIRSLQSQLQNKESEVLEGAERVRHISSKVEELSQALSQKELEITKMDQLLLEKKRDVETLQQTIEEKDQQVTEISFSMTEKMVQLNEEKFSLGVEIKTLKEQLNLLSRAEEAKKEQVEEDNEVSSGLKQNYDEMSPAGQISKEELQHEFDLLKKENEQRKRKLQAALINRKELLQRVSRLEEELANLKDESKKEIPLSETERGEVEEDKENKEYSEKCVTSKCQEIEIYLKQTISEKEVELQHIRKDLEEKLAAEEQFQALVKQMNQTLQDKTNQIDLLQAEISENQAIIQKLITSNTDASDGDSVALVKETVVISPPCTGSSEHWKPELEEKILALEKEKEQLQKKLQEALTSRKAILKKAQEKERHLREELKQQKDDYNRLQEQFDEQSKENENIGDQLRQLQIQVRESIDGKLPSTDQQESCSSTPGLEEPLFKATEQHHTQPVLESNLCPDWPSHSEDASALQGGTSVAQIKAQLKEIEAEKVELELKVSSTTSELTKKSEEVFQLQEQINKQGLEIESLKTVSHEAEVHAESLQQKLESSQLQIAGLEHLRELQPKLDELQKLISKKEEDVSYLSGQLSEKEAALTKIQTEIIEQEDLIKALHTQLEMQAKEHDERIKQLQVELCEMKQKPEEIGEESRAKQQIQRKLQAALISRKEALKENKSLQEELSLARGTIERLTKSLADVESQVSAQNKEKDTVLGRLALLQEERDKLITEMDRSLLENQSLSSSCESLKLALEGLTEDKEKLVKEIESLKSSKIAESTEWQEKHKELQKEYEILLQSYENVSNEAERIQHVVEAVRQEKQELYGKLRSTEANKKETEKQLQEAEQEMEEMKEKMRKFAKSKQQKILELEEENDRLRAEVHPAGDTAKECMETLLSSNASMKEELERVKMEYETLSKKFQSLMSEKDSLSEEVQDLKHQIEGNVSKQANLEATEKHDNQTNVTEEGTQSIPGETEEQDSLSMSTRPTCSESVPSAKSANPAVSKDFSSHDEINNYLQQIDQLKERIAGLEEEKQKNKEFSQTLENEKNTLLSQISTKDGELKMLQEEVTKMNLLNQQIQEELSRVTKLKETAEEEKDDLEERLMNQLAELNGSIGNYCQDVTDAQIKNELLESEMKNLKKCVSELEEEKQQLVKEKTKVESEIRKEYLEKIQGAQKEPGNKSHAKELQELLKEKQQEVKQLQKDCIRYQEKISALERTVKALEFVQTESQKDLEITKENLAQAVEHRKKAQAELASFKVLLDDTQSEAARVLADNLKLKKELQSNKESVKSQMKQKDEDLERRLEQAEEKHLKEKKNMQEKLDALRREKVHLEETIGEIQVTLNKKDKEVQQLQENLDSTVTQLAAFTKSMSSLQDDRDRVIDEAKKWERKFSDAIQSKEEEIRLKEDNCSVLKDQLRQMSIHMEELKINISRLEHDKQIWESKAQTEVQLQQKVCDTLQGENKELLSQLEETRHLYHSSQNELAKLESELKSLKDQLTDLSNSLEKCKEQKGNLEGIIRQQEADIQNSKFSYEQLETDLQASRELTSRLHEEINMKEQKIISLLSGKEEAIQVAIAELRQQHDKEIKELENLLSQEEEENIVLEEENKKAVDKTNQLMETLKTIKKENIQQKAQLDSFVKSMSSLQNDRDRIVGDYQQLEERHLSIILEKDQLIQEAAAENNKLKEEIRGLRSHMDDLNSENAKLDAELIQYREDLNQVITIKDSQQKQLLEVQLQQNKELENKYAKLEEKLKESEEANEDLRRSFNALQEEKQDLSKEIESLKVSISQLTRQVTALQEEGTLGLYHAQLKVKEEEVHRLSALFSSSQKRIAELEEELVCVQKEAAKKVGEIEDKLKKELKHLHHDAGIMRNETETAEERVAELARDLVEMEQKLLMVTKENKGLTAQIQSFGRSMSSLQNSRDHANEELDELKRKYDASLKELAQLKEQGLLNRERDALLSETAFSMNSTEENSLSHLEKLNQQLLSKDEQLLHLSSQLEDSYNQVQSFSKAMASLQNERDHLWNELEKFRKSEEGKQRSAAQPSTSPAEVQSLKKAMSSLQNDRDRLLKELKNLQQQYLQINQEITELHPLKAQLQEYQDKTKAFQIMQEELRQENLSWQHELHQLRMEKSSWEIHERRMKEQYLMAISDKDQQLSHLQNLIRELRSSSSQTQPLKVQYQRQASPETSASPDGSQNLVYETELLRTQLNDSLKEIHQKELRIQQLNSNFSQLLEEKNTLSIQLCDTSQSLRENQQHYGDLLNHCAVLEKQVQELQAGPLNIDVAPGAPQEKNGVHRKSDPEELREPQQSFSEAQQQLCNTRQEVNELRKLLEEERDQRVAAENALSVAEEQIRRLEHSEWDSSRTPIIGSCGTQEQALLIDLTSNSCRRTRSGVGWKRVLRSLCHSRTRVPLLAAIYFLMIHVLLILCFTGHL 2 1 2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DLNEKLRERLEQAEAERTRAREALRGHAAQLSQYNQVLASLKSSYDTKKELLNDLQREL---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 6h2x.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 7' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . 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'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.609 2 1 3 0 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 2767 SER 1 0.250 2 1 A 2768 HIS 1 0.230 3 1 A 2769 LEU 1 0.520 4 1 A 2770 GLU 1 0.540 5 1 A 2771 LYS 1 0.590 6 1 A 2772 LEU 1 0.620 7 1 A 2773 ASN 1 0.670 8 1 A 2774 GLN 1 0.680 9 1 A 2775 GLN 1 0.700 10 1 A 2776 LEU 1 0.680 11 1 A 2777 LEU 1 0.670 12 1 A 2778 SER 1 0.700 13 1 A 2779 LYS 1 0.690 14 1 A 2780 ASP 1 0.700 15 1 A 2781 GLU 1 0.670 16 1 A 2782 GLN 1 0.710 17 1 A 2783 LEU 1 0.680 18 1 A 2784 LEU 1 0.670 19 1 A 2785 HIS 1 0.610 20 1 A 2786 LEU 1 0.680 21 1 A 2787 SER 1 0.690 22 1 A 2788 SER 1 0.680 23 1 A 2789 GLN 1 0.670 24 1 A 2790 LEU 1 0.630 25 1 A 2791 GLU 1 0.640 26 1 A 2792 ASP 1 0.640 27 1 A 2793 SER 1 0.640 28 1 A 2794 TYR 1 0.600 29 1 A 2795 ASN 1 0.630 30 1 A 2796 GLN 1 0.620 31 1 A 2797 VAL 1 0.650 32 1 A 2798 GLN 1 0.630 33 1 A 2799 SER 1 0.610 34 1 A 2800 PHE 1 0.550 35 1 A 2801 SER 1 0.620 36 1 A 2802 LYS 1 0.610 37 1 A 2803 ALA 1 0.670 38 1 A 2804 MET 1 0.600 39 1 A 2805 ALA 1 0.690 40 1 A 2806 SER 1 0.660 41 1 A 2807 LEU 1 0.640 42 1 A 2808 GLN 1 0.670 43 1 A 2809 ASN 1 0.670 44 1 A 2810 GLU 1 0.650 45 1 A 2811 ARG 1 0.610 46 1 A 2812 ASP 1 0.670 47 1 A 2813 HIS 1 0.580 48 1 A 2814 LEU 1 0.650 49 1 A 2815 TRP 1 0.550 50 1 A 2816 ASN 1 0.660 51 1 A 2817 GLU 1 0.620 52 1 A 2818 LEU 1 0.610 53 1 A 2819 GLU 1 0.600 54 1 A 2820 LYS 1 0.580 55 1 A 2821 PHE 1 0.490 56 1 A 2822 ARG 1 0.480 57 1 A 2823 LYS 1 0.510 58 1 A 2824 SER 1 0.340 59 1 A 2825 GLU 1 0.370 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #