data_SMR-27020bf5a3b214f66aacbcc4baa05398_8 _entry.id SMR-27020bf5a3b214f66aacbcc4baa05398_8 _struct.entry_id SMR-27020bf5a3b214f66aacbcc4baa05398_8 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - P49792/ RBP2_HUMAN, E3 SUMO-protein ligase RanBP2 Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P49792' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' ZN non-polymer 'ZINC ION' Zn 65.380 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 416720.981 1 . 2 non-polymer man 'ZINC ION' 65.380 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP RBP2_HUMAN P49792 1 ;MRRSKADVERYIASVQGSTPSPRQKSMKGFYFAKLYYEAKEYDLAKKYICTYINVQERDPKAHRFLGLLY ELEENTDKAVECYRRSVELNPTQKDLVLKIAELLCKNDVTDGRAKYWLERAAKLFPGSPAIYKLKEQLLD CEGEDGWNKLFDLIQSELYVRPDDVHVNIRLVEVYRSTKRLKDAVAHCHEAERNIALRSSLEWNSCVVQT LKEYLESLQCLESDKSDWRATNTDLLLAYANLMLLTLSTRDVQESRELLQSFDSALQSVKSLGGNDELSA TFLEMKGHFYMHAGSLLLKMGQHSSNVQWRALSELAALCYLIAFQVPRPKIKLIKGEAGQNLLEMMACDR LSQSGHMLLNLSRGKQDFLKEIVETFANKSGQSALYDALFSSQSPKDTSFLGSDDIGNIDVREPELEDLT RYDVGAIRAHNGSLQHLTWLGLQWNSLPALPGIRKWLKQLFHHLPHETSRLETNAPESICILDLEVFLLG VVYTSHLQLKEKCNSHHSSYQPLCLPLPVCKQLCTERQKSWWDAVCTLIHRKAVPGNVAKLRLLVQHEIN TLRAQEKHGLQPALLVHWAECLQKTGSGLNSFYDQREYIGRSVHYWKKVLPLLKIIKKKNSIPEPIDPLF KHFHSVDIQASEIVEYEEDAHITFAILDAVNGNIEDAVTAFESIKSVVSYWNLALIFHRKAEDIENDALS PEEQEECKNYLRKTRDYLIKIIDDSDSNLSVVKKLPVPLESVKEMLNSVMQELEDYSEGGPLYKNGSLRN ADSEIKHSTPSPTRYSLSPSKSYKYSPKTPPRWAEDQNSLLKMICQQVEAIKKEMQELKLNSSNSASPHR WPTENYGPDSVPDGYQGSQTFHGAPLTVATTGPSVYYSQSPAYNSQYLLRPAANVTPTKGPVYGMNRLPP QQHIYAYPQQMHTPPVQSSSACMFSQEMYGPPALRFESPATGILSPRGDDYFNYNVQQTSTNPPLPEPGY FTKPPIAAHASRSAESKTIEFGKTNFVQPMPGEGLRPSLPTQAHTTQPTPFKFNSNFKSNDGDFTFSSPQ VVTQPPPAAYSNSESLLGLLTSDKPLQGDGYSGAKPIPGGQTIGPRNTFNFGSKNVSGISFTENMGSSQQ KNSGFRRSDDMFTFHGPGKSVFGTPTLETANKNHETDGGSAHGDDDDDGPHFEPVVPLPDKIEVKTGEED EEEFFCNRAKLFRFDVESKEWKERGIGNVKILRHKTSGKIRLLMRREQVLKICANHYISPDMKLTPNAGS DRSFVWHALDYADELPKPEQLAIRFKTPEEAALFKCKFEEAQSILKAPGTNVAMASNQAVRIVKEPTSHD NKDICKSDAGNLNFEFQVAKKEGSWWHCNSCSLKNASTAKKCVSCQNLNPSNKELVGPPLAETVFTPKTS PENVQDRFALVTPKKEGHWDCSICLVRNEPTVSRCIACQNTKSANKSGSSFVHQASFKFGQGDLPKPINS DFRSVFSTKEGQWDCSACLVQNEGSSTKCAACQNPRKQSLPATSIPTPASFKFGTSETSKTLKSGFEDMF AKKEGQWDCSSCLVRNEANATRCVACQNPDKPSPSTSVPAPASFKFGTSETSKAPKSGFEGMFTKKEGQW DCSVCLVRNEASATKCIACQNPGKQNQTTSAVSTPASSETSKAPKSGFEGMFTKKEGQWDCSVCLVRNEA SATKCIACQNPGKQNQTTSAVSTPASSETSKAPKSGFEGMFTKKEGQWDCSVCLVRNEASATKCIACQCP SKQNQTTAISTPASSEISKAPKSGFEGMFIRKGQWDCSVCCVQNESSSLKCVACDASKPTHKPIAEAPSA FTLGSEMKLHDSSGSQVGTGFKSNFSEKASKFGNTEQGFKFGHVDQENSPSFMFQGSSNTEFKSTKEGFS IPVSADGFKFGISEPGNQEKKSEKPLENGTGFQAQDISGQKNGRGVIFGQTSSTFTFADLAKSTSGEGFQ FGKKDPNFKGFSGAGEKLFSSQYGKMANKANTSGDFEKDDDAYKTEDSDDIHFEPVVQMPEKVELVTGEE DEKVLYSQRVKLFRFDAEVSQWKERGLGNLKILKNEVNGKLRMLMRREQVLKVCANHWITTTMNLKPLSG SDRAWMWLASDFSDGDAKLEQLAAKFKTPELAEEFKQKFEECQRLLLDIPLQTPHKLVDTGRAAKLIQRA EEMKSGLKDFKTFLTNDQTKVTEEENKGSGTGAAGASDTTIKPNPENTGPTLEWDNYDLREDALDDSVSS SSVHASPLASSPVRKNLFRFGESTTGFNFSFKSALSPSKSPAKLNQSGTSVGTDEESDVTQEEERDGQYF EPVVPLPDLVEVSSGEENEQVVFSHRAKLYRYDKDVGQWKERGIGDIKILQNYDNKQVRIVMRRDQVLKL CANHRITPDMTLQNMKGTERVWLWTACDFADGERKVEHLAVRFKLQDVADSFKKIFDEAKTAQEKDSLIT PHVSRSSTPRESPCGKIAVAVLEETTRERTDVIQGDDVADATSEVEVSSTSETTPKAVVSPPKFVFGSES VKSIFSSEKSKPFAFGNSSATGSLFGFSFNAPLKSNNSETSSVAQSGSESKVEPKKCELSKNSDIEQSSD SKVKNLFASFPTEESSINYTFKTPEKAKEKKKPEDSPSDDDVLIVYELTPTAEQKALATKLKLPPTFFCY KNRPDYVSEEEEDDEDFETAVKKLNGKLYLDGSEKCRPLEENTADNEKECIIVWEKKPTVEEKAKADTLK LPPTFFCGVCSDTDEDNGNGEDFQSELQKVQEAQKSQTEEITSTTDSVYTGGTEVMVPSFCKSEEPDSIT KSISSPSVSSETMDKPVDLSTRKEIDTDSTSQGESKIVSFGFGSSTGLSFADLASSNSGDFAFGSKDKNF QWANTGAAVFGTQSVGTQSAGKVGEDEDGSDEEVVHNEDIHFEPIVSLPEVEVKSGEEDEEILFKERAKL YRWDRDVSQWKERGVGDIKILWHTMKNYYRILMRRDQVFKVCANHVITKTMELKPLNVSNNALVWTASDY ADGEAKVEQLAVRFKTKEVADCFKKTFEECQQNLMKLQKGHVSLAAELSKETNPVVFFDVCADGEPLGRI TMELFSNIVPRTAENFRALCTGEKGFGFKNSIFHRVIPDFVCQGGDITKHDGTGGQSIYGDKFEDENFDV KHTGPGLLSMANQGQNTNNSQFVITLKKAEHLDFKHVVFGFVKDGMDTVKKIESFGSPKGSVCRRITITE CGQI ; 'E3 SUMO-protein ligase RanBP2' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 3224 1 3224 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . 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B . # # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 ZN 1 3 3 ZN '_' . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'E3 SUMO-protein ligase RanBP2 {PDB ID=7mnu, label_asym_id=B, auth_asym_id=B, SMTL ID=7mnu.1.B}' 'template structure' . 2 'ZINC ION {PDB ID=7mnu, label_asym_id=E, auth_asym_id=B, SMTL ID=7mnu.1._.3}' 'template structure' . 3 . target . 4 'ZINC ION' target . 5 'Target-template alignment by HHblits to 7mnu, label_asym_id=B' 'target-template alignment' . 6 'model 8' 'model coordinates' . 7 SMTL 'reference database' . 8 PDB 'reference database' . 9 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 3 2 1 7 3 1 8 4 2 9 5 3 3 6 3 4 7 3 1 8 3 2 9 3 5 10 4 1 11 4 2 12 4 5 13 4 4 14 5 6 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 7 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-04 8 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-29 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 3 'reference database' 2 4 . # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . B 2 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A B 2 1 B 2 2 'reference database' non-polymer 1 2 B E 5 1 B # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 GPLGSMGFEGMFTKKEGQWDCSVCLVRNEASATKCIACQCPSK GPLGSMGFEGMFTKKEGQWDCSVCLVRNEASATKCIACQCPSK # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 7 43 # # loop_ _ma_template_non_poly.template_id _ma_template_non_poly.comp_id _ma_template_non_poly.details 2 ZN 'ZINC ION' # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 7mnu 2024-05-22 2 PDB . 7mnu 2024-05-22 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 3224 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 5 1 3224 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 3.1e-05 94.595 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MRRSKADVERYIASVQGSTPSPRQKSMKGFYFAKLYYEAKEYDLAKKYICTYINVQERDPKAHRFLGLLYELEENTDKAVECYRRSVELNPTQKDLVLKIAELLCKNDVTDGRAKYWLERAAKLFPGSPAIYKLKEQLLDCEGEDGWNKLFDLIQSELYVRPDDVHVNIRLVEVYRSTKRLKDAVAHCHEAERNIALRSSLEWNSCVVQTLKEYLESLQCLESDKSDWRATNTDLLLAYANLMLLTLSTRDVQESRELLQSFDSALQSVKSLGGNDELSATFLEMKGHFYMHAGSLLLKMGQHSSNVQWRALSELAALCYLIAFQVPRPKIKLIKGEAGQNLLEMMACDRLSQSGHMLLNLSRGKQDFLKEIVETFANKSGQSALYDALFSSQSPKDTSFLGSDDIGNIDVREPELEDLTRYDVGAIRAHNGSLQHLTWLGLQWNSLPALPGIRKWLKQLFHHLPHETSRLETNAPESICILDLEVFLLGVVYTSHLQLKEKCNSHHSSYQPLCLPLPVCKQLCTERQKSWWDAVCTLIHRKAVPGNVAKLRLLVQHEINTLRAQEKHGLQPALLVHWAECLQKTGSGLNSFYDQREYIGRSVHYWKKVLPLLKIIKKKNSIPEPIDPLFKHFHSVDIQASEIVEYEEDAHITFAILDAVNGNIEDAVTAFESIKSVVSYWNLALIFHRKAEDIENDALSPEEQEECKNYLRKTRDYLIKIIDDSDSNLSVVKKLPVPLESVKEMLNSVMQELEDYSEGGPLYKNGSLRNADSEIKHSTPSPTRYSLSPSKSYKYSPKTPPRWAEDQNSLLKMICQQVEAIKKEMQELKLNSSNSASPHRWPTENYGPDSVPDGYQGSQTFHGAPLTVATTGPSVYYSQSPAYNSQYLLRPAANVTPTKGPVYGMNRLPPQQHIYAYPQQMHTPPVQSSSACMFSQEMYGPPALRFESPATGILSPRGDDYFNYNVQQTSTNPPLPEPGYFTKPPIAAHASRSAESKTIEFGKTNFVQPMPGEGLRPSLPTQAHTTQPTPFKFNSNFKSNDGDFTFSSPQVVTQPPPAAYSNSESLLGLLTSDKPLQGDGYSGAKPIPGGQTIGPRNTFNFGSKNVSGISFTENMGSSQQKNSGFRRSDDMFTFHGPGKSVFGTPTLETANKNHETDGGSAHGDDDDDGPHFEPVVPLPDKIEVKTGEEDEEEFFCNRAKLFRFDVESKEWKERGIGNVKILRHKTSGKIRLLMRREQVLKICANHYISPDMKLTPNAGSDRSFVWHALDYADELPKPEQLAIRFKTPEEAALFKCKFEEAQSILKAPGTNVAMASNQAVRIVKEPTSHDNKDICKSDAGNLNFEFQVAKKEGSWWHCNSCSLKNASTAKKCVSCQNLNPSNKELVGPPLAETVFTPKTSPENVQDRFALVTPKKEGHWDCSICLVRNEPTVSRCIACQNTKSANKSGSSFVHQASFKFGQGDLPKPINSDFRSVFSTKEGQWDCSACLVQNEGSSTKCAACQNPRKQSLPATSIPTPASFKFGTSETSKTLKSGFEDMFAKKEGQWDCSSCLVRNEANATRCVACQNPDKPSPSTSVPAPASFKFGTSETSKAPKSGFEGMFTKKEGQWDCSVCLVRNEASATKCIACQNPGKQNQTTSAVSTPASSETSKAPKSGFEGMFTKKEGQWDCSVCLVRNEASATKCIACQNPGKQNQTTSAVSTPASSETSKAPKSGFEGMFTKKEGQWDCSVCLVRNEASATKCIACQCPSKQNQTTAISTPASSEISKAPKSGFEGMFIRKGQWDCSVCCVQNESSSLKCVACDASKPTHKPIAEAPSAFTLGSEMKLHDSSGSQVGTGFKSNFSEKASKFGNTEQGFKFGHVDQENSPSFMFQGSSNTEFKSTKEGFSIPVSADGFKFGISEPGNQEKKSEKPLENGTGFQAQDISGQKNGRGVIFGQTSSTFTFADLAKSTSGEGFQFGKKDPNFKGFSGAGEKLFSSQYGKMANKANTSGDFEKDDDAYKTEDSDDIHFEPVVQMPEKVELVTGEEDEKVLYSQRVKLFRFDAEVSQWKERGLGNLKILKNEVNGKLRMLMRREQVLKVCANHWITTTMNLKPLSGSDRAWMWLASDFSDGDAKLEQLAAKFKTPELAEEFKQKFEECQRLLLDIPLQTPHKLVDTGRAAKLIQRAEEMKSGLKDFKTFLTNDQTKVTEEENKGSGTGAAGASDTTIKPNPENTGPTLEWDNYDLREDALDDSVSSSSVHASPLASSPVRKNLFRFGESTTGFNFSFKSALSPSKSPAKLNQSGTSVGTDEESDVTQEEERDGQYFEPVVPLPDLVEVSSGEENEQVVFSHRAKLYRYDKDVGQWKERGIGDIKILQNYDNKQVRIVMRRDQVLKLCANHRITPDMTLQNMKGTERVWLWTACDFADGERKVEHLAVRFKLQDVADSFKKIFDEAKTAQEKDSLITPHVSRSSTPRESPCGKIAVAVLEETTRERTDVIQGDDVADATSEVEVSSTSETTPKAVVSPPKFVFGSESVKSIFSSEKSKPFAFGNSSATGSLFGFSFNAPLKSNNSETSSVAQSGSESKVEPKKCELSKNSDIEQSSDSKVKNLFASFPTEESSINYTFKTPEKAKEKKKPEDSPSDDDVLIVYELTPTAEQKALATKLKLPPTFFCYKNRPDYVSEEEEDDEDFETAVKKLNGKLYLDGSEKCRPLEENTADNEKECIIVWEKKPTVEEKAKADTLKLPPTFFCGVCSDTDEDNGNGEDFQSELQKVQEAQKSQTEEITSTTDSVYTGGTEVMVPSFCKSEEPDSITKSISSPSVSSETMDKPVDLSTRKEIDTDSTSQGESKIVSFGFGSSTGLSFADLASSNSGDFAFGSKDKNFQWANTGAAVFGTQSVGTQSAGKVGEDEDGSDEEVVHNEDIHFEPIVSLPEVEVKSGEEDEEILFKERAKLYRWDRDVSQWKERGVGDIKILWHTMKNYYRILMRRDQVFKVCANHVITKTMELKPLNVSNNALVWTASDYADGEAKVEQLAVRFKTKEVADCFKKTFEECQQNLMKLQKGHVSLAAELSKETNPVVFFDVCADGEPLGRITMELFSNIVPRTAENFRALCTGEKGFGFKNSIFHRVIPDFVCQGGDITKHDGTGGQSIYGDKFEDENFDVKHTGPGLLSMANQGQNTNNSQFVITLKKAEHLDFKHVVFGFVKDGMDTVKKIESFGSPKGSVCRRITITECGQI 2 1 2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GFEGMFTKKEGQWDCSVCLVRNEASATKCIACQCPSK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 7mnu.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 8' . 6 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . GLY 1657 1657 ? A 7.999 28.342 125.110 1 1 B GLY 0.360 1 ATOM 2 C CA . GLY 1657 1657 ? A 8.939 28.778 123.992 1 1 B GLY 0.360 1 ATOM 3 C C . GLY 1657 1657 ? A 8.852 27.816 122.831 1 1 B GLY 0.360 1 ATOM 4 O O . GLY 1657 1657 ? A 7.825 27.177 122.698 1 1 B GLY 0.360 1 ATOM 5 N N . PHE 1658 1658 ? A 9.906 27.640 121.994 1 1 B PHE 0.310 1 ATOM 6 C CA . PHE 1658 1658 ? A 9.872 26.697 120.877 1 1 B PHE 0.310 1 ATOM 7 C C . PHE 1658 1658 ? A 10.401 25.307 121.239 1 1 B PHE 0.310 1 ATOM 8 O O . PHE 1658 1658 ? A 10.593 24.458 120.384 1 1 B PHE 0.310 1 ATOM 9 C CB . PHE 1658 1658 ? A 10.761 27.215 119.716 1 1 B PHE 0.310 1 ATOM 10 C CG . PHE 1658 1658 ? A 10.271 28.540 119.220 1 1 B PHE 0.310 1 ATOM 11 C CD1 . PHE 1658 1658 ? A 9.004 28.638 118.628 1 1 B PHE 0.310 1 ATOM 12 C CD2 . PHE 1658 1658 ? A 11.068 29.691 119.314 1 1 B PHE 0.310 1 ATOM 13 C CE1 . PHE 1658 1658 ? A 8.538 29.863 118.139 1 1 B PHE 0.310 1 ATOM 14 C CE2 . PHE 1658 1658 ? A 10.603 30.919 118.827 1 1 B PHE 0.310 1 ATOM 15 C CZ . PHE 1658 1658 ? A 9.338 31.005 118.238 1 1 B PHE 0.310 1 ATOM 16 N N . GLU 1659 1659 ? A 10.694 25.095 122.543 1 1 B GLU 0.440 1 ATOM 17 C CA . GLU 1659 1659 ? A 10.955 23.814 123.191 1 1 B GLU 0.440 1 ATOM 18 C C . GLU 1659 1659 ? A 12.123 23.010 122.653 1 1 B GLU 0.440 1 ATOM 19 O O . GLU 1659 1659 ? A 12.218 21.799 122.771 1 1 B GLU 0.440 1 ATOM 20 C CB . GLU 1659 1659 ? A 9.684 22.952 123.269 1 1 B GLU 0.440 1 ATOM 21 C CG . GLU 1659 1659 ? A 8.475 23.728 123.844 1 1 B GLU 0.440 1 ATOM 22 C CD . GLU 1659 1659 ? A 7.306 22.829 124.239 1 1 B GLU 0.440 1 ATOM 23 O OE1 . GLU 1659 1659 ? A 7.525 21.623 124.504 1 1 B GLU 0.440 1 ATOM 24 O OE2 . GLU 1659 1659 ? A 6.187 23.396 124.330 1 1 B GLU 0.440 1 ATOM 25 N N . GLY 1660 1660 ? A 13.086 23.728 122.049 1 1 B GLY 0.460 1 ATOM 26 C CA . GLY 1660 1660 ? A 14.187 23.136 121.319 1 1 B GLY 0.460 1 ATOM 27 C C . GLY 1660 1660 ? A 13.811 22.290 120.123 1 1 B GLY 0.460 1 ATOM 28 O O . GLY 1660 1660 ? A 14.548 21.393 119.750 1 1 B GLY 0.460 1 ATOM 29 N N . MET 1661 1661 ? A 12.668 22.563 119.459 1 1 B MET 0.400 1 ATOM 30 C CA . MET 1661 1661 ? A 12.195 21.762 118.337 1 1 B MET 0.400 1 ATOM 31 C C . MET 1661 1661 ? A 13.126 21.727 117.114 1 1 B MET 0.400 1 ATOM 32 O O . MET 1661 1661 ? A 13.292 20.717 116.441 1 1 B MET 0.400 1 ATOM 33 C CB . MET 1661 1661 ? A 10.774 22.233 117.934 1 1 B MET 0.400 1 ATOM 34 C CG . MET 1661 1661 ? A 9.965 21.192 117.136 1 1 B MET 0.400 1 ATOM 35 S SD . MET 1661 1661 ? A 9.670 19.630 118.036 1 1 B MET 0.400 1 ATOM 36 C CE . MET 1661 1661 ? A 8.693 20.274 119.430 1 1 B MET 0.400 1 ATOM 37 N N . PHE 1662 1662 ? A 13.777 22.881 116.850 1 1 B PHE 0.480 1 ATOM 38 C CA . PHE 1662 1662 ? A 14.650 23.145 115.716 1 1 B PHE 0.480 1 ATOM 39 C C . PHE 1662 1662 ? A 16.067 23.465 116.186 1 1 B PHE 0.480 1 ATOM 40 O O . PHE 1662 1662 ? A 16.845 24.132 115.493 1 1 B PHE 0.480 1 ATOM 41 C CB . PHE 1662 1662 ? A 14.120 24.323 114.855 1 1 B PHE 0.480 1 ATOM 42 C CG . PHE 1662 1662 ? A 12.742 24.021 114.343 1 1 B PHE 0.480 1 ATOM 43 C CD1 . PHE 1662 1662 ? A 12.573 23.259 113.178 1 1 B PHE 0.480 1 ATOM 44 C CD2 . PHE 1662 1662 ? A 11.601 24.479 115.021 1 1 B PHE 0.480 1 ATOM 45 C CE1 . PHE 1662 1662 ? A 11.293 22.977 112.687 1 1 B PHE 0.480 1 ATOM 46 C CE2 . PHE 1662 1662 ? A 10.318 24.183 114.543 1 1 B PHE 0.480 1 ATOM 47 C CZ . PHE 1662 1662 ? A 10.164 23.442 113.368 1 1 B PHE 0.480 1 ATOM 48 N N . THR 1663 1663 ? A 16.457 23.013 117.401 1 1 B THR 0.520 1 ATOM 49 C CA . THR 1663 1663 ? A 17.822 23.151 117.906 1 1 B THR 0.520 1 ATOM 50 C C . THR 1663 1663 ? A 18.830 22.472 117.033 1 1 B THR 0.520 1 ATOM 51 O O . THR 1663 1663 ? A 18.566 21.496 116.333 1 1 B THR 0.520 1 ATOM 52 C CB . THR 1663 1663 ? A 18.063 22.689 119.337 1 1 B THR 0.520 1 ATOM 53 O OG1 . THR 1663 1663 ? A 17.397 21.467 119.599 1 1 B THR 0.520 1 ATOM 54 C CG2 . THR 1663 1663 ? A 17.482 23.780 120.236 1 1 B THR 0.520 1 ATOM 55 N N . LYS 1664 1664 ? A 20.042 23.038 117.022 1 1 B LYS 0.550 1 ATOM 56 C CA . LYS 1664 1664 ? A 21.161 22.460 116.335 1 1 B LYS 0.550 1 ATOM 57 C C . LYS 1664 1664 ? A 21.536 21.107 116.921 1 1 B LYS 0.550 1 ATOM 58 O O . LYS 1664 1664 ? A 21.647 20.974 118.138 1 1 B LYS 0.550 1 ATOM 59 C CB . LYS 1664 1664 ? A 22.326 23.457 116.433 1 1 B LYS 0.550 1 ATOM 60 C CG . LYS 1664 1664 ? A 23.437 23.177 115.428 1 1 B LYS 0.550 1 ATOM 61 C CD . LYS 1664 1664 ? A 24.228 24.437 115.080 1 1 B LYS 0.550 1 ATOM 62 C CE . LYS 1664 1664 ? A 24.970 25.003 116.281 1 1 B LYS 0.550 1 ATOM 63 N NZ . LYS 1664 1664 ? A 25.508 26.315 115.898 1 1 B LYS 0.550 1 ATOM 64 N N . LYS 1665 1665 ? A 21.708 20.075 116.074 1 1 B LYS 0.560 1 ATOM 65 C CA . LYS 1665 1665 ? A 22.063 18.740 116.513 1 1 B LYS 0.560 1 ATOM 66 C C . LYS 1665 1665 ? A 23.543 18.673 116.813 1 1 B LYS 0.560 1 ATOM 67 O O . LYS 1665 1665 ? A 24.320 19.565 116.450 1 1 B LYS 0.560 1 ATOM 68 C CB . 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'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.570 2 1 3 0 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 1657 GLY 1 0.360 2 1 A 1658 PHE 1 0.310 3 1 A 1659 GLU 1 0.440 4 1 A 1660 GLY 1 0.460 5 1 A 1661 MET 1 0.400 6 1 A 1662 PHE 1 0.480 7 1 A 1663 THR 1 0.520 8 1 A 1664 LYS 1 0.550 9 1 A 1665 LYS 1 0.560 10 1 A 1666 GLU 1 0.540 11 1 A 1667 GLY 1 0.630 12 1 A 1668 GLN 1 0.630 13 1 A 1669 TRP 1 0.560 14 1 A 1670 ASP 1 0.630 15 1 A 1671 CYS 1 0.640 16 1 A 1672 SER 1 0.610 17 1 A 1673 VAL 1 0.620 18 1 A 1674 CYS 1 0.650 19 1 A 1675 LEU 1 0.620 20 1 A 1676 VAL 1 0.630 21 1 A 1677 ARG 1 0.610 22 1 A 1678 ASN 1 0.620 23 1 A 1679 GLU 1 0.600 24 1 A 1680 ALA 1 0.630 25 1 A 1681 SER 1 0.630 26 1 A 1682 ALA 1 0.610 27 1 A 1683 THR 1 0.610 28 1 A 1684 LYS 1 0.620 29 1 A 1685 CYS 1 0.640 30 1 A 1686 ILE 1 0.600 31 1 A 1687 ALA 1 0.600 32 1 A 1688 CYS 1 0.650 33 1 A 1689 GLN 1 0.620 34 1 A 1690 ASN 1 0.610 35 1 A 1691 PRO 1 0.600 36 1 A 1692 GLY 1 0.520 37 1 A 1693 LYS 1 0.470 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #