data_SMR-af43db5a9fa9447fd7984f889f1a38da_3 _entry.id SMR-af43db5a9fa9447fd7984f889f1a38da_3 _struct.entry_id SMR-af43db5a9fa9447fd7984f889f1a38da_3 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q62504 (isoform 2)/ MINT_MOUSE, Msx2-interacting protein Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q62504 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 453750.198 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP MINT_MOUSE Q62504 1 ;MVRETRHLWVGNLPENVREEKIIEHFKRYGRVESVKILPKRGSEGGVAAFVDFVDIKSAQKAHNSVNKMG DRDLRTDYNEPGTIPSAARGLDETVSIASRSREVSGFRGSAGGPAYGPPPSLHAREGRYERRLDGASDNR ERAYEHSAYGHHERGTGAFDRTRHYDQDYYRDPRERTLQHGLYYTSRSRSPNRFDAHDPRYEPRAREQFT LPSVVHRDIYRDDITREVRGRRPERSYQHSRSRSPHSSQSRNQSPQRLASQASRPTRSPSGSGSRSRSSS SDSISSSSSSSNTDSSDSSSTASDDSPARSVQSAAVPAPTSQLLSSLEKDEPRKSFGIKVQNLPVRSIDT SLKDGLFHEFKKFGKVTSVQIHGASEERYGLVFFRQQEDQEKALTASKGKLFFGMQIEVTAWVGPETESE NEFRPLDERIDEFHPKATRTLFIGNLEKTTTYHDLRNIFQRFGEIVDIDIKKVNGVPQYAFLQYCDIASV CKAIKKMDGEYLGNNRLKLGFGKSMPTNCVWLDGLSSNVSDQYLTRHFCRYGPVVKVVFDRLKGMALVLY SEIEDAQAAVKETKGRKIGGNKIKVDFANRESQLAFYHCMEKSGQDMRDFYEMLTERRAGQMAQSKHEDW SADAQSPHKCREERRGSYEYSQERTYYENVRTPGTYPEDSRRDYPARGREFYSEWETYQGEYYDSRYYDE PREYREYRSDPYEQDIREYSYRQRERERERERFESDRDHERRPIERSQSPVHLRRPQSPGVSPAHSERLP SDSERRLYRRSSERSGSCSSVSPPRYDKLEKARLERYTKNEKADKERTFDPERVERERRIVRKEKGEKDK AERQKRKGKAHSPSSQPSETEQENDREQSPEKPRGSTKLSRDRADKEGPAKNRLELVPCVVLTRVKEKEG KVIEHPPPEKLKARLGRDTTKASALDQKPQAAQGEPAKSDPARGKALREKVLPSHAEVGEKEGRTKLRKH LKAEQTPELSALDLEKLEARKRRFADSGLKIEKQKPEIKKTSPETEDTRILLKKQPDTSRDGVLLREGES ERKPVRKEILKRESKKTKLERLNSALSPKDCQDPAAVSAGSGSRPSSDVHAGLGELTHGSVETQETQPKK AIPSKPQPKQLQLLENQGPEKEEVRKNYCRPREEPAEHRAGQEKPHGGNAEEKLGIDIDHTQSYRKQMEQ SRRKQRMEMEIAKAEKFGSPKKDVDDYERRSLVHEVGKPPQDVTDDSPPSKKRRTDHVDFDICTKRERNY RSSRQISEDSERTSCSPSVRHGSFHDDDDPRGSPRLVSVKGSPKGDEKGLPYPNAAVRDDPLKCNPYDSG KREQTADTAKIKLSVLNSEGEPSRWDPPMKQDPSRFDVSFPNSVIKRDSLRKRSVRDLEPGEVPSDSDED AEHRSQSPRASSFYDSPRLSFLLRDRDQKLRERDERLASSLERNKFYSFALDKTITPDTKALLERAKSLS SSREENWSFLDWDSRFANFRNNKDKEKVDSAPRPIPSWYMKKKKIRTDSEGKLDDKKDERREEEQERQEL FASRFLHSSIFEQDSKRLQHLERKSEESDFPPGRLYGRQASEGANSTSDSVQEPVVLFHSRFMELTRMQQ KEKEKDQKPKEAEKQEEPETHPKTPEPAAETKEPEPKAPVSAGLPAVTITVVTPEPASSAPEKAEEAAEA PSPAGEKPAEPAPVSEETKLVSEPVSVPVEQPRQSDVPPGEDSRDSQDSAALAPSAPQESAATDAVPCVN AEPLTPGTTVSQVESSVDPKPSSPQPLSKLTQRSEEAEEGKVEKPDTTPSTEPDATQNAGVASEAQPPAS EDVEANPPVAAKDRKTNKSKRSKTSVQAAAASVVEKPVTRKSERIDREKLKRSSSPRGEAQKLLELKMEA EKITRTASKSSGGDTEHPEPSLPLSRSRRRNVRSVYATMTDHESRSPAKEPVEQPRVTRKRLERELQEAV VPPTTPRRGRPPKTRRRAEEDGEHERKEPAETPRPAEGWRSPRSQKSAAAAGPQGKRGRNEQKVEAAAEA GAQASTREGNPKSRGEREAASEPKRDRRDPSTDKSGPDTFPVEVLERKPPEKTYKSKRGRARSTRSGMDR AAHQRSLEMAARAAGQAADKEAGPAAASPQESESPQKGSGSSPQLANNPADPDREAEEESASASTAPPEG TQLARQIELEQAVQNIAKLPEPSAAAASKGTATATATAASEEPAPEHGHKPAHQASETELAAAIGSIISD ASGEPENFSAPPSVPPGSQTHPREGMEPGLHEAESGILETGTATESSAPQVSALDPPEGSADTKETRGNS GDSVQEAKGSKAEVTPPRKDKGRQKTTRRRKRNANKKVVAITETRASEAEQTQSESPAAEEATAATPEAP QEEKPSEKPPSPPAECTFDPSKTPPAESLSQENSAAEKTPCKAPVLPALPPLSQPALMDDGPQARFKVHS IIESDPVTPPSDSGIPPPTIPLVTIAKLPPPVIPGGVPHQSPPPKVTEWITRQEEPRAQSTPSPALPPDT KASDMDTSSSTLRKILMDPKYVSATGVTSTSVTTAIAEPVSAPCLQEAPAPPCDPKHPPLEGVSAAAVPN ADTQASEVPVAADKEKVAPVIAPKITSVISRMPVSIDLENSQKITLAKPAPQTLTGLVSALTGLVNVSLV PVNALKGPVKGSVATLKGLVSTPAGPVNLLKGPVNVLTGPVNVLTTPVSATVGTVNAAPGPVTAACGVTA TTGTAAVTGAVTAPAAKGKQRASSNENSRFHPGSMSVIDDRPADTGSGAGLRVNTSEGVVLLSYSGQKTE GPQRISAKISQIPPASAMDIEFQQSVSKSQVKADSITPTQSAPKGPQTPSAFANVAAHSTLVLTAQTYNA SPVISSVKTDRPSLEKPEPIHLSVSTPVTQGGTVKVLTQGINTPPVLVHNQLVLTPSIVTTNKKLADPVT LKIETKVLQPANLGPTLTPHHPPALPSKLPAEVNHVPSGPSTPADRTIAHLATPKPDTHSPRPTGPTPGL FPRPCHPSSTTSTALSTNATVMLAAGIPVPQFISSIHPEQSVIMPPHSITQTVSLGHLSQGEVRMSTPTL PSITYSIRPETLHSPRAPLQPQQIEARAPQRVGTPQPATTGVPALATQHPPEEEVHYHLPVARAAAPVQS EVLVMQSEYRLHPYTVPRDVRIMVHPHVTAVSEQPRATEGVVKVPPANKAPQQLVKEAVKTSDAKAVPAP APVPVPVPVPTPAPPPHGEARILTVTPSSQLQGLPLTPPVVVTHGVQIVHSSGELFQEYRYGDVRTYHAP AQQLTHTQFPVASSISLASRTKTSAQVRKPAFFPLQSTQSAQPAPSTQATQPIPPAPPCQPSQLSQPAQP PSGKIPQVSQEAKGTQTGGVEQTRLPAIPTNRPSEPHAQLQRAPVETAQPAHPSPVSVSMKPDLPSPLSS QAAPKQPLFVPANSGPSTPPGLALPHAEVQPAPKQESSPHGTPQRPVDMVQLLKKYPIVWQGLLALKNDT AAVQLHFVSGNNVLAHRSLPLSEGGPPLRIAQRMRLEASQLEGVARRMTVRLE ; 'Msx2-interacting protein' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 3553 1 3553 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . 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A 1 3471 GLY 3471 ? ? ? F . A 1 3472 THR 3472 ? ? ? F . A 1 3473 PRO 3473 ? ? ? F . A 1 3474 GLN 3474 ? ? ? F . A 1 3475 ARG 3475 ? ? ? F . A 1 3476 PRO 3476 ? ? ? F . A 1 3477 VAL 3477 ? ? ? F . A 1 3478 ASP 3478 ? ? ? F . A 1 3479 MET 3479 ? ? ? F . A 1 3480 VAL 3480 ? ? ? F . A 1 3481 GLN 3481 ? ? ? F . A 1 3482 LEU 3482 ? ? ? F . A 1 3483 LEU 3483 ? ? ? F . A 1 3484 LYS 3484 ? ? ? F . A 1 3485 LYS 3485 ? ? ? F . A 1 3486 TYR 3486 ? ? ? F . A 1 3487 PRO 3487 ? ? ? F . A 1 3488 ILE 3488 ? ? ? F . A 1 3489 VAL 3489 ? ? ? F . A 1 3490 TRP 3490 ? ? ? F . A 1 3491 GLN 3491 ? ? ? F . A 1 3492 GLY 3492 ? ? ? F . A 1 3493 LEU 3493 ? ? ? F . A 1 3494 LEU 3494 ? ? ? F . A 1 3495 ALA 3495 ? ? ? F . A 1 3496 LEU 3496 ? ? ? F . A 1 3497 LYS 3497 ? ? ? F . A 1 3498 ASN 3498 ? ? ? F . A 1 3499 ASP 3499 ? ? ? F . A 1 3500 THR 3500 ? ? ? F . A 1 3501 ALA 3501 ? ? ? F . A 1 3502 ALA 3502 ? ? ? F . A 1 3503 VAL 3503 ? ? ? F . A 1 3504 GLN 3504 ? ? ? F . A 1 3505 LEU 3505 ? ? ? F . A 1 3506 HIS 3506 ? ? ? F . A 1 3507 PHE 3507 ? ? ? F . A 1 3508 VAL 3508 ? ? ? F . A 1 3509 SER 3509 ? ? ? F . A 1 3510 GLY 3510 ? ? ? F . A 1 3511 ASN 3511 ? ? ? F . A 1 3512 ASN 3512 ? ? ? F . A 1 3513 VAL 3513 ? ? ? F . A 1 3514 LEU 3514 ? ? ? F . A 1 3515 ALA 3515 ? ? ? F . A 1 3516 HIS 3516 ? ? ? F . A 1 3517 ARG 3517 ? ? ? F . A 1 3518 SER 3518 ? ? ? F . A 1 3519 LEU 3519 ? ? ? F . A 1 3520 PRO 3520 ? ? ? F . A 1 3521 LEU 3521 ? ? ? F . A 1 3522 SER 3522 ? ? ? F . A 1 3523 GLU 3523 ? ? ? F . A 1 3524 GLY 3524 ? ? ? F . A 1 3525 GLY 3525 ? ? ? F . A 1 3526 PRO 3526 ? ? ? F . A 1 3527 PRO 3527 ? ? ? F . A 1 3528 LEU 3528 ? ? ? F . A 1 3529 ARG 3529 ? ? ? F . A 1 3530 ILE 3530 ? ? ? F . A 1 3531 ALA 3531 ? ? ? F . A 1 3532 GLN 3532 ? ? ? F . A 1 3533 ARG 3533 ? ? ? F . A 1 3534 MET 3534 ? ? ? F . A 1 3535 ARG 3535 ? ? ? F . A 1 3536 LEU 3536 ? ? ? F . A 1 3537 GLU 3537 ? ? ? F . A 1 3538 ALA 3538 ? ? ? F . A 1 3539 SER 3539 ? ? ? F . A 1 3540 GLN 3540 ? ? ? F . A 1 3541 LEU 3541 ? ? ? F . A 1 3542 GLU 3542 ? ? ? F . A 1 3543 GLY 3543 ? ? ? F . A 1 3544 VAL 3544 ? ? ? F . A 1 3545 ALA 3545 ? ? ? F . A 1 3546 ARG 3546 ? ? ? F . A 1 3547 ARG 3547 ? ? ? F . A 1 3548 MET 3548 ? ? ? F . A 1 3549 THR 3549 ? ? ? F . A 1 3550 VAL 3550 ? ? ? F . A 1 3551 ARG 3551 ? ? ? F . A 1 3552 LEU 3552 ? ? ? F . A 1 3553 GLU 3553 ? ? ? F . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Protein NAM8 {PDB ID=6n7p, label_asym_id=F, auth_asym_id=F, SMTL ID=6n7p.1.F}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 6n7p, label_asym_id=F' 'target-template alignment' . 4 'model 3' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-04 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-29 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A F 6 1 F # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MSYKQTTYYPSRGNLVRNDSSPYTNTISSETNNSSTSVLSLQGASNVSLGTTGNQLYMGDLDPTWDKNTV RQIWASLGEANINVRMMWNNTLNNGSRSSMGPKNNQGYCFVDFPSSTHAANALLKNGMLIPNFPNKKLKL NWATSSYSNSNNSLNNVKSGNNCSIFVGDLAPNVTESQLFELFINRYASTSHAKIVHDQVTGMSKGYGFV KFTNSDEQQLALSEMQGVFLNGRAIKVGPTSGQQQHVSGNNDYNRSSSSLNNENVDSRFLSKGQSFLSNG NNNMGFKRNHMSQFIYPVQQQPSLNHFTDPNNTTVFIGGLSSLVTEDELRAYFQPFGTIVYVKIPVGKCC GFVQYVDRLSAEAAIAGMQGFPIANSRVRLSWGRSAKQTALLQQAMLSNSLQVQQQQPGLQQPNYGYIPS STCEAPVLPDNNVSSTMLPGCQILNYSNPYANANGLGSNNFSFYSNNNATNTQATSLLADTSSMDLSGTG GQQVIMQGSEAVVNSTNAMLNRLEQGSNGFMFA ; ;MSYKQTTYYPSRGNLVRNDSSPYTNTISSETNNSSTSVLSLQGASNVSLGTTGNQLYMGDLDPTWDKNTV RQIWASLGEANINVRMMWNNTLNNGSRSSMGPKNNQGYCFVDFPSSTHAANALLKNGMLIPNFPNKKLKL NWATSSYSNSNNSLNNVKSGNNCSIFVGDLAPNVTESQLFELFINRYASTSHAKIVHDQVTGMSKGYGFV KFTNSDEQQLALSEMQGVFLNGRAIKVGPTSGQQQHVSGNNDYNRSSSSLNNENVDSRFLSKGQSFLSNG NNNMGFKRNHMSQFIYPVQQQPSLNHFTDPNNTTVFIGGLSSLVTEDELRAYFQPFGTIVYVKIPVGKCC GFVQYVDRLSAEAAIAGMQGFPIANSRVRLSWGRSAKQTALLQQAMLSNSLQVQQQQPGLQQPNYGYIPS STCEAPVLPDNNVSSTMLPGCQILNYSNPYANANGLGSNNFSFYSNNNATNTQATSLLADTSSMDLSGTG GQQVIMQGSEAVVNSTNAMLNRLEQGSNGFMFA ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 163 457 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 6n7p 2024-03-20 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 3553 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 3621 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 1.1e-26 25.110 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MVRETRHLWVGNLPENVREEKIIEHFKRYGRVESVKILPKRGSEGGVAAFVDFVDIKSAQKAHNSVNKMGDRDLRTDYNEPGTIPSAARGLDETVSIASRSREVSGFRGSAGGPAYGPPPSLHAREGRYERRLDGASDNRERAYEHSAYGHHERGTGAFDRTRHYDQDYYRDPRERTLQHGLYYTSRSRSPNRFDAHDPRYEPRAREQFTLPSVVHRDIYRDDITREVRGRRPERSYQHSRSRSPHSSQSRNQSPQRLASQASRPTRSPSGSGSRSRSSSSDSISSSSSSSNTDSSDSSSTASDDSPARSVQSAAVPAPTSQLLSSLEKDEPRKSFGIKVQNLPVRSIDTSLKDGLFHEF-KKFGKVTSVQIHGA----SEERYGLVFFRQQEDQEKALTASKGKLFFGMQIEVTAWVGPETESENEF------R-------------------PL---------------------DERIDEFHPKATRTLFIGNLEKTTTYHDLRNIFQRFGEIVDIDIKKVNGVPQYAFLQYCDIASVCKAIKKMDGEYLGNNRLKLGFGKSMPTNCVWLDGLSS-----NVSDQYLTRHFCRYGPVVK-----VVFD----RLK---GMALVLYSEIEDAQAAVKETKGRKIGGNKIKVDFANRESQLAFYHCMEKSGQDMRDFYEMLTERRAGQMAQSKHEDWSADAQSPHKCREERRGSYEYSQERTYYENVRTPGTYPEDSRRDYPARGREFYSEWETYQGEYYDSRYYDEPREYREYRSDPYEQDIREYSYRQRERERERERFESDRDHERRPIERSQSPVHLRRPQSPGVSPAHSERLPSDSERRLYRRSSERSGSCSSVSPPRYDKLEKARLERYTKNEKADKERTFDPERVERERRIVRKEKGEKDKAERQKRKGKAHSPSSQPSETEQENDREQSPEKPRGSTKLSRDRADKEGPAKNRLELVPCVVLTRVKEKEGKVIEHPPPEKLKARLGRDTTKASALDQKPQAAQGEPAKSDPARGKALREKVLPSHAEVGEKEGRTKLRKHLKAEQTPELSALDLEKLEARKRRFADSGLKIEKQKPEIKKTSPETEDTRILLKKQPDTSRDGVLLREGESERKPVRKEILKRESKKTKLERLNSALSPKDCQDPAAVSAGSGSRPSSDVHAGLGELTHGSVETQETQPKKAIPSKPQPKQLQLLENQGPEKEEVRKNYCRPREEPAEHRAGQEKPHGGNAEEKLGIDIDHTQSYRKQMEQSRRKQRMEMEIAKAEKFGSPKKDVDDYERRSLVHEVGKPPQDVTDDSPPSKKRRTDHVDFDICTKRERNYRSSRQISEDSERTSCSPSVRHGSFHDDDDPRGSPRLVSVKGSPKGDEKGLPYPNAAVRDDPLKCNPYDSGKREQTADTAKIKLSVLNSEGEPSRWDPPMKQDPSRFDVSFPNSVIKRDSLRKRSVRDLEPGEVPSDSDEDAEHRSQSPRASSFYDSPRLSFLLRDRDQKLRERDERLASSLERNKFYSFALDKTITPDTKALLERAKSLSSSREENWSFLDWDSRFANFRNNKDKEKVDSAPRPIPSWYMKKKKIRTDSEGKLDDKKDERREEEQERQELFASRFLHSSIFEQDSKRLQHLERKSEESDFPPGRLYGRQASEGANSTSDSVQEPVVLFHSRFMELTRMQQKEKEKDQKPKEAEKQEEPETHPKTPEPAAETKEPEPKAPVSAGLPAVTITVVTPEPASSAPEKAEEAAEAPSPAGEKPAEPAPVSEETKLVSEPVSVPVEQPRQSDVPPGEDSRDSQDSAALAPSAPQESAATDAVPCVNAEPLTPGTTVSQVESSVDPKPSSPQPLSKLTQRSEEAEEGKVEKPDTTPSTEPDATQNAGVASEAQPPASEDVEANPPVAAKDRKTNKSKRSKTSVQAAAASVVEKPVTRKSERIDREKLKRSSSPRGEAQKLLELKMEAEKITRTASKSSGGDTEHPEPSLPLSRSRRRNVRSVYATMTDHESRSPAKEPVEQPRVTRKRLERELQEAVVPPTTPRRGRPPKTRRRAEEDGEHERKEPAETPRPAEGWRSPRSQKSAAAAGPQGKRGRNEQKVEAAAEAGAQASTREGNPKSRGEREAASEPKRDRRDPSTDKSGPDTFPVEVLERKPPEKTYKSKRGRARSTRSGMDRAAHQRSLEMAARAAGQAADKEAGPAAASPQESESPQKGSGSSPQLANNPADPDREAEEESASASTAPPEGTQLARQIELEQAVQNIAKLPEPSAAAASKGTATATATAASEEPAPEHGHKPAHQASETELAAAIGSIISDASGEPENFSAPPSVPPGSQTHPREGMEPGLHEAESGILETGTATESSAPQVSALDPPEGSADTKETRGNSGDSVQEAKGSKAEVTPPRKDKGRQKTTRRRKRNANKKVVAITETRASEAEQTQSESPAAEEATAATPEAPQEEKPSEKPPSPPAECTFDPSKTPPAESLSQENSAAEKTPCKAPVLPALPPLSQPALMDDGPQARFKVHSIIESDPVTPPSDSGIPPPTIPLVTIAKLPPPVIPGGVPHQSPPPKVTEWITRQEEPRAQSTPSPALPPDTKASDMDTSSSTLRKILMDPKYVSATGVTSTSVTTAIAEPVSAPCLQEAPAPPCDPKHPPLEGVSAAAVPNADTQASEVPVAADKEKVAPVIAPKITSVISRMPVSIDLENSQKITLAKPAPQTLTGLVSALTGLVNVSLVPVNALKGPVKGSVATLKGLVSTPAGPVNLLKGPVNVLTGPVNVLTTPVSATVGTVNAAPGPVTAACGVTATTGTAAVTGAVTAPAAKGKQRASSNENSRFHPGSMSVIDDRPADTGSGAGLRVNTSEGVVLLSYSGQKTEGPQRISAKISQIPPASAMDIEFQQSVSKSQVKADSITPTQSAPKGPQTPSAFANVAAHSTLVLTAQTYNASPVISSVKTDRPSLEKPEPIHLSVSTPVTQGGTVKVLTQGINTPPVLVHNQLVLTPSIVTTNKKLADPVTLKIETKVLQPANLGPTLTPHHPPALPSKLPAEVNHVPSGPSTPADRTIAHLATPKPDTHSPRPTGPTPGLFPRPCHPSSTTSTALSTNATVMLAAGIPVPQFISSIHPEQSVIMPPHSITQTVSLGHLSQGEVRMSTPTLPSITYSIRPETLHSPRAPLQPQQIEARAPQRVGTPQPATTGVPALATQHPPEEEVHYHLPVARAAAPVQSEVLVMQSEYRLHPYTVPRDVRIMVHPHVTAVSEQPRATEGVVKVPPANKAPQQLVKEAVKTSDAKAVPAPAPVPVPVPVPTPAPPPHGEARILTVTPSSQLQGLPLTPPVVVTHGVQIVHSSGELFQEYRYGDVRTYHAPAQQLTHTQFPVASSISLASRTKTSAQVRKPAFFPLQSTQSAQPAPSTQATQPIPPAPPCQPSQLSQPAQPPSGKIPQVSQEAKGTQTGGVEQTRLPAIPTNRPSEPHAQLQRAPVETAQPAHPSPVSVSMKPDLPSPLSSQAAPKQPLFVPANSGPSTPPGLALPHAEVQPAPKQESSPHGTPQRPVDMVQLLKKYPIVWQGLLALKNDTAAVQLHFVSGNNVLAHRSLPLSEGGPPLRIAQRMRLEASQLEGVARRMTVRLE 2 1 2 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CSIFVGDLAPNVTE----SQLFELFINRYASTSHAKIVHDQVTGMSKGYGFVKFTNSDEQQLALSEMQGVFLNGRAIKVGPTSGQQQHVSGNNDYNRSSSSLNNENVDSRFLSKGQSFLSNGNNNMGFKRNHMSQFIYPVQQQPSLNHFTDPNNTTVFIGGLSSLVTEDELRAYFQPFGTIVYVKIPVG---KCCGFVQYVDRLSAEAAIAGMQGFPIANSRVRLSWGRSAKQTALLQQAMLSNSLQVQQQQPGLQQ--PNYGYIPSSTCEAPVLPDNNVSSTMLPGCQILNYSNPYANANGLG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 6n7p.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 3' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #