data_SMR-c3a39745a17f5f85c0d33d7d44f42ff2_2 _entry.id SMR-c3a39745a17f5f85c0d33d7d44f42ff2_2 _struct.entry_id SMR-c3a39745a17f5f85c0d33d7d44f42ff2_2 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q62504 (isoform 2)/ MINT_MOUSE, Msx2-interacting protein Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q62504 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SEP 'L-peptide linking' PHOSPHOSERINE 'C3 H8 N O6 P' 185.072 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 462023.353 1 . 2 polymer man 'peptide from Silencing mediator of retinoic acid and thyroid hormone receptor' 1228.993 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP MINT_MOUSE Q62504 1 ;MVRETRHLWVGNLPENVREEKIIEHFKRYGRVESVKILPKRGSEGGVAAFVDFVDIKSAQKAHNSVNKMG DRDLRTDYNEPGTIPSAARGLDETVSIASRSREVSGFRGSAGGPAYGPPPSLHAREGRYERRLDGASDNR ERAYEHSAYGHHERGTGAFDRTRHYDQDYYRDPRERTLQHGLYYTSRSRSPNRFDAHDPRYEPRAREQFT LPSVVHRDIYRDDITREVRGRRPERSYQHSRSRSPHSSQSRNQSPQRLASQASRPTRSPSGSGSRSRSSS SDSISSSSSSSNTDSSDSSSTASDDSPARSVQSAAVPAPTSQLLSSLEKDEPRKSFGIKVQNLPVRSIDT SLKDGLFHEFKKFGKVTSVQIHGASEERYGLVFFRQQEDQEKALTASKGKLFFGMQIEVTAWVGPETESE NEFRPLDERIDEFHPKATRTLFIGNLEKTTTYHDLRNIFQRFGEIVDIDIKKVNGVPQYAFLQYCDIASV CKAIKKMDGEYLGNNRLKLGFGKSMPTNCVWLDGLSSNVSDQYLTRHFCRYGPVVKVVFDRLKGMALVLY SEIEDAQAAVKETKGRKIGGNKIKVDFANRESQLAFYHCMEKSGQDMRDFYEMLTERREERRGSYEYSQE RTYYENVRTPGTYPEDSRRDYPARGREFYSEWETYQGEYYDSRYYDEPREYREYRSDPYEQDIREYSYRQ RERERERERFESDRDHERRPIERSQSPVHLRRPQSPGVSPAHSERLPSDSERRLYRRSSERSGSCSSVSP PRYDKLEKARLERYTKNEKADKERTFDPERVERERRIVRKEKGEKDKAERQKRKGKAHSPSSQPSETEQE NDREQSPEKPRGSTKLSRDRADKEGPAKNRLELVPCVVLTRVKEKEGKVIEHPPPEKLKARLGRDTTKAS ALDQKPQAAQGEPAKSDPARGKALREKVLPSHAEVGEKEGRTKLRKHLKAEQTPELSALDLEKLEARKRR FADSGLKIEKQKPEIKKTSPETEDTRILLKKQPDTSRDGVLLREGESERKPVRKEILKRESKKTKLERLN SALSPKDCQDPAAVSAGSGSRPSSDVHAGLGELTHGSVETQETQPKKAIPSKPQPKQLQLLENQGPEKEE VRKNYCRPREEPAEHRAGQEKPHGGNAEEKLGIDIDHTQSYRKQMEQSRRKQRMEMEIAKAEKFGSPKKD VDDYERRSLVHEVGKPPQDVTDDSPPSKKRRTDHVDFDICTKRERNYRSSRQISEDSERTSCSPSVRHGS FHDDDDPRGSPRLVSVKGSPKGDEKGLPYPNAAVRDDPLKCNPYDSGKREQTADTAKIKLSVLNSEGEPS RWDPPMKQDPSRFDVSFPNSVIKRDSLRKRSVRDLEPGEVPSDSDEDAEHRSQSPRASSFYDSPRLSFLL RDRDQKLRERDERLASSLERNKFYSFALDKTITPDTKALLERAKSLSSSREENWSFLDWDSRFANFRNNK DKEKVDSAPRPIPSWYMKKKKIRTDSEGKLDDKKDERREEEQERQELFASRFLHSSIFEQDSKRLQHLER KSEESDFPPGRLYGRQASEGANSTSDSVQEPVVLFHSRFMELTRMQQKEKEKDQKPKEAEKQEEPETHPK TPEPAAETKEPEPKAPVSAGLPAVTITVVTPEPASSAPEKAEEAAEAPSPAGEKPAEPAPVSEETKLVSE PVSVPVEQPRQSDVPPGEDSRDSQDSAALAPSAPQESAATDAVPCVNAEPLTPGTTVSQVESSVDPKPSS PQPLSKLTQRSEEAEEGKVEKPDTTPSTEPDATQNAGVASEAQPPASEDVEANPPVAAKDRKTNKSKRSK TSVQAAAASVVEKPVTRKSERIDREKLKRSSSPRGEAQKLLELKMEAEKITRTASKSSGGDTEHPEPSLP LSRSRRRNVRSVYATMTDHESRSPAKEPVEQPRVTRKRLERELQEAVVPPTTPRRGRPPKTRRRAEEDGE HERKEPAETPRPAEGWRSPRSQKSAAAAGPQGKRGRNEQKVEAAAEAGAQASTREGNPKSRGEREAASEP KRDRRDPSTDKSGPDTFPVEVLERKPPEKTYKSKRGRARSTRSGMDRAAHQRSLEMAARAAGQAADKEAG PAAASPQESESPQKGSGSSPQLANNPADPDREAEEESASASTAPPEGTQLARQIELEQAVQNIAKLPEPS AAAASKGTATATATAASEEPAPEHGHKPAHQASETELAAAIGSIISDASGEPENFSAPPSVPPGSQTHPR EGMEPGLHEAESGILETGTATESSAPQVSALDPPEGSADTKETRGNSGDSVQEAKGSKAEVTPPRKDKGR QKTTRRRKRNANKKVVAITETRASEAEQTQSESPAAEEATAATPEAPQEEKPSEKPPSPPAECTFDPSKT PPAESLSQENSAAEKTPCKAPVLPALPPLSQPALMDDGPQARFKVHSIIESDPVTPPSDSGIPPPTIPLV TIAKLPPPVIPGGVPHQSPPPKVTEWITRQEEPRAQSTPSPALPPDTKASDMDTSSSTLRKILMDPKYVS ATGVTSTSVTTAIAEPVSAPCLQEAPAPPCDPKHPPLEGVSAAAVPNADTQASEVPVAADKEKVAPVIAP KITSVISRMPVSIDLENSQKITLAKPAPQTLTGLVSALTGLVNVSLVPVNALKGPVKGSVATLKGLVSTP AGPVNLLKGPVNVLTGPVNVLTTPVSATVGTVNAAPGPVTAACGVTATTGTAAVTGAVTAPAAKGKQRAS SNENSRFHPGSMSVIDDRPADTGSGAGLRVNTSEGVVLLSYSGQKTEGPQRISAKISQIPPASAMDIEFQ QSVSKSQVKADSITPTQSAPKGPQTPSAFANVAAHSTLVLTAQTYNASPVISSVKTDRPSLEKPEPIHLS VSTPVTQGGTVKVLTQGINTPPVLVHNQLVLTPSIVTTNKKLADPVTLKIETKVLQPANLGPTLTPHHPP ALPSKLPAEVNHVPSGPSTPADRTIAHLATPKPDTHSPRPTGPTPGLFPRPCHPSSTTSTALSTNATVML AAGIPVPQFISSIHPEQSVIMPPHSITQTVSLGHLSQGEVRMSTPTLPSITYSIRPETLHSPRAPLQPQQ IEARAPQRVGTPQPATTGVPALATQHPPEEEVHYHLPVARAAAPVQSEVLVMQSEYRLHPYTVPRDVRIM VHPHVTAVSEQPRATEGVVKVPPANKAPQQLVKEAVKTSDAKAVPAPAPVPVPVPVPTPAPPPHGEARIL TVTPSSQLQGLPLTPPVVVTHGVQIVHSSGELFQEYRYGDVRTYHAPAQQLTHTQFPVASSISLASRTKT SAQVPPEGEPLQSTQSAQPAPSTQATQPIPPAPPCQPSQLSQPAQPPSGKIPQVSQEAKGTQTGGVEQTR LPAIPTNRPSEPHAQLQRAPVETAQPAHPSPVSVSMKPDLPSPLSSQAAPKQPLFVPANSGPSTPPGLAL PHAEVQPAPKQESSPHGTPQRPVDMVQLLKKYPIVWQGLLALKNDTAAVQLHFVSGNNVLAHRSLPLSEG GPPLRIAQRMRLEASQLEGVARRMTVETDYCLLLALPCGRDQEDVVSQTESLKAAFITYLQAKQAAGIIN VPNPGSNQPAYVLQIFPPCEFSESHLSRLAPDLLASISNISPHLMIVIASV ; 'Msx2-interacting protein' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 3621 1 3621 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . 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A 1 3495 LEU 3495 3495 LEU LEU A . A 1 3496 PRO 3496 3496 PRO PRO A . A 1 3497 LEU 3497 3497 LEU LEU A . A 1 3498 SER 3498 3498 SER SER A . A 1 3499 GLU 3499 3499 GLU GLU A . A 1 3500 GLY 3500 3500 GLY GLY A . A 1 3501 GLY 3501 3501 GLY GLY A . A 1 3502 PRO 3502 3502 PRO PRO A . A 1 3503 PRO 3503 3503 PRO PRO A . A 1 3504 LEU 3504 3504 LEU LEU A . A 1 3505 ARG 3505 3505 ARG ARG A . A 1 3506 ILE 3506 3506 ILE ILE A . A 1 3507 ALA 3507 3507 ALA ALA A . A 1 3508 GLN 3508 3508 GLN GLN A . A 1 3509 ARG 3509 3509 ARG ARG A . A 1 3510 MET 3510 3510 MET MET A . A 1 3511 ARG 3511 3511 ARG ARG A . A 1 3512 LEU 3512 3512 LEU LEU A . A 1 3513 GLU 3513 3513 GLU GLU A . A 1 3514 ALA 3514 3514 ALA ALA A . A 1 3515 SER 3515 3515 SER SER A . A 1 3516 GLN 3516 3516 GLN GLN A . A 1 3517 LEU 3517 3517 LEU LEU A . A 1 3518 GLU 3518 3518 GLU GLU A . A 1 3519 GLY 3519 3519 GLY GLY A . A 1 3520 VAL 3520 3520 VAL VAL A . A 1 3521 ALA 3521 3521 ALA ALA A . A 1 3522 ARG 3522 3522 ARG ARG A . A 1 3523 ARG 3523 3523 ARG ARG A . A 1 3524 MET 3524 3524 MET MET A . A 1 3525 THR 3525 3525 THR THR A . A 1 3526 VAL 3526 3526 VAL VAL A . A 1 3527 GLU 3527 3527 GLU GLU A . A 1 3528 THR 3528 3528 THR THR A . A 1 3529 ASP 3529 3529 ASP ASP A . A 1 3530 TYR 3530 3530 TYR TYR A . A 1 3531 CYS 3531 3531 CYS CYS A . A 1 3532 LEU 3532 3532 LEU LEU A . A 1 3533 LEU 3533 3533 LEU LEU A . A 1 3534 LEU 3534 3534 LEU LEU A . A 1 3535 ALA 3535 3535 ALA ALA A . A 1 3536 LEU 3536 3536 LEU LEU A . A 1 3537 PRO 3537 3537 PRO PRO A . A 1 3538 CYS 3538 3538 CYS CYS A . A 1 3539 GLY 3539 3539 GLY GLY A . A 1 3540 ARG 3540 3540 ARG ARG A . A 1 3541 ASP 3541 3541 ASP ASP A . A 1 3542 GLN 3542 3542 GLN GLN A . A 1 3543 GLU 3543 3543 GLU GLU A . A 1 3544 ASP 3544 3544 ASP ASP A . A 1 3545 VAL 3545 3545 VAL VAL A . A 1 3546 VAL 3546 3546 VAL VAL A . A 1 3547 SER 3547 3547 SER SER A . A 1 3548 GLN 3548 3548 GLN GLN A . A 1 3549 THR 3549 3549 THR THR A . A 1 3550 GLU 3550 3550 GLU GLU A . A 1 3551 SER 3551 3551 SER SER A . A 1 3552 LEU 3552 3552 LEU LEU A . A 1 3553 LYS 3553 3553 LYS LYS A . A 1 3554 ALA 3554 3554 ALA ALA A . A 1 3555 ALA 3555 3555 ALA ALA A . A 1 3556 PHE 3556 3556 PHE PHE A . A 1 3557 ILE 3557 3557 ILE ILE A . A 1 3558 THR 3558 3558 THR THR A . A 1 3559 TYR 3559 3559 TYR TYR A . A 1 3560 LEU 3560 3560 LEU LEU A . A 1 3561 GLN 3561 3561 GLN GLN A . A 1 3562 ALA 3562 3562 ALA ALA A . A 1 3563 LYS 3563 3563 LYS LYS A . A 1 3564 GLN 3564 3564 GLN GLN A . A 1 3565 ALA 3565 3565 ALA ALA A . A 1 3566 ALA 3566 3566 ALA ALA A . A 1 3567 GLY 3567 3567 GLY GLY A . A 1 3568 ILE 3568 3568 ILE ILE A . A 1 3569 ILE 3569 3569 ILE ILE A . A 1 3570 ASN 3570 3570 ASN ASN A . A 1 3571 VAL 3571 3571 VAL VAL A . A 1 3572 PRO 3572 3572 PRO PRO A . A 1 3573 ASN 3573 3573 ASN ASN A . A 1 3574 PRO 3574 3574 PRO PRO A . A 1 3575 GLY 3575 3575 GLY GLY A . A 1 3576 SER 3576 3576 SER SER A . A 1 3577 ASN 3577 3577 ASN ASN A . A 1 3578 GLN 3578 3578 GLN GLN A . A 1 3579 PRO 3579 3579 PRO PRO A . A 1 3580 ALA 3580 3580 ALA ALA A . A 1 3581 TYR 3581 3581 TYR TYR A . A 1 3582 VAL 3582 3582 VAL VAL A . A 1 3583 LEU 3583 3583 LEU LEU A . A 1 3584 GLN 3584 3584 GLN GLN A . A 1 3585 ILE 3585 3585 ILE ILE A . A 1 3586 PHE 3586 3586 PHE PHE A . A 1 3587 PRO 3587 3587 PRO PRO A . A 1 3588 PRO 3588 3588 PRO PRO A . A 1 3589 CYS 3589 3589 CYS CYS A . A 1 3590 GLU 3590 3590 GLU GLU A . A 1 3591 PHE 3591 3591 PHE PHE A . A 1 3592 SER 3592 3592 SER SER A . A 1 3593 GLU 3593 3593 GLU GLU A . A 1 3594 SER 3594 3594 SER SER A . A 1 3595 HIS 3595 3595 HIS HIS A . A 1 3596 LEU 3596 3596 LEU LEU A . A 1 3597 SER 3597 3597 SER SER A . A 1 3598 ARG 3598 3598 ARG ARG A . A 1 3599 LEU 3599 3599 LEU LEU A . A 1 3600 ALA 3600 3600 ALA ALA A . A 1 3601 PRO 3601 3601 PRO PRO A . A 1 3602 ASP 3602 3602 ASP ASP A . A 1 3603 LEU 3603 3603 LEU LEU A . A 1 3604 LEU 3604 3604 LEU LEU A . A 1 3605 ALA 3605 3605 ALA ALA A . A 1 3606 SER 3606 3606 SER SER A . A 1 3607 ILE 3607 3607 ILE ILE A . A 1 3608 SER 3608 3608 SER SER A . A 1 3609 ASN 3609 3609 ASN ASN A . A 1 3610 ILE 3610 3610 ILE ILE A . A 1 3611 SER 3611 3611 SER SER A . A 1 3612 PRO 3612 3612 PRO PRO A . A 1 3613 HIS 3613 3613 HIS HIS A . A 1 3614 LEU 3614 3614 LEU LEU A . A 1 3615 MET 3615 3615 MET MET A . A 1 3616 ILE 3616 3616 ILE ILE A . A 1 3617 VAL 3617 3617 VAL VAL A . A 1 3618 ILE 3618 3618 ILE ILE A . A 1 3619 ALA 3619 3619 ALA ALA A . A 1 3620 SER 3620 3620 SER SER A . A 1 3621 VAL 3621 3621 VAL VAL A . B 2 1 TYR 1 1 TYR TYR '_' A B 2 2 GLU 1 1 GLU GLU '_' B B 2 3 THR 1 1 THR THR '_' C B 2 4 LEU 1 1 LEU LEU '_' D B 2 5 SEP 1 1 SEP SEP '_' E B 2 6 ASP 1 1 ASP ASP '_' F B 2 7 SEP 1 1 SEP SEP '_' G B 2 8 GLU 1 1 GLU GLU '_' H # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Msx2-interacting protein {PDB ID=2rt5, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=2rt5.1.A}' 'template structure' . 2 'peptide from Silencing mediator of retinoic acid and thyroid hormone receptor {PDB ID=2rt5, label_asym_id=B, auth_asym_id=B, SMTL ID=2rt5.1._.1}' 'template structure' . 3 . target . 4 'peptide from Silencing mediator of retinoic acid and thyroid hormone receptor' target . 5 'Target-template alignment by HHblits to 2rt5, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 6 'model 2' 'model coordinates' . 7 SMTL 'reference database' . 8 PDB 'reference database' . 9 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 3 2 1 7 3 1 8 4 2 9 5 3 3 6 3 4 7 3 1 8 3 2 9 3 5 10 4 1 11 4 2 12 4 5 13 4 4 14 5 6 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 7 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-04 8 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-29 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 3 'reference database' 2 4 . # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . B 2 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A 2 2 'reference database' polymer 1 2 . B 2 1 B # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;VDMVQLLKKYPIVWQGLLALKNDTAAVQLHFVSGNNVLAHRSLPLSEGGPPLRIAQRMRLEATQLEGVAR RMTVETDYCLLLALPCGRDQEDVVSQTESLKAAFITYLQAKQAAGIINVPNPGSNQPAYVLQIFPPCEFS ESHLSRLAPDLLASISNISPHLMIVIASV ; ;VDMVQLLKKYPIVWQGLLALKNDTAAVQLHFVSGNNVLAHRSLPLSEGGPPLRIAQRMRLEATQLEGVAR RMTVETDYCLLLALPCGRDQEDVVSQTESLKAAFITYLQAKQAAGIINVPNPGSNQPAYVLQIFPPCEFS ESHLSRLAPDLLASISNISPHLMIVIASV ; 2 YETL(SEP)D(SEP)E YETLSDSE # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 1 169 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 2rt5 2024-11-20 2 PDB . 2rt5 2024-11-20 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 3621 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 5 1 3621 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 1.2e-42 99.408 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 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2 1 2 --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------VDMVQLLKKYPIVWQGLLALKNDTAAVQLHFVSGNNVLAHRSLPLSEGGPPLRIAQRMRLEATQLEGVARRMTVETDYCLLLALPCGRDQEDVVSQTESLKAAFITYLQAKQAAGIINVPNPGSNQPAYVLQIFPPCEFSESHLSRLAPDLLASISNISPHLMIVIASV # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 2rt5.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 2' . 6 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . 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A 262.110 -4.533 16.372 1 1 A ASP 0.610 1 ATOM 15 O OD2 . ASP 3454 3454 ? A 262.494 -2.371 16.150 1 1 A ASP 0.610 1 ATOM 16 N N . MET 3455 3455 ? A 263.931 -3.934 12.964 1 1 A MET 0.600 1 ATOM 17 C CA . MET 3455 3455 ? A 263.639 -3.060 11.857 1 1 A MET 0.600 1 ATOM 18 C C . MET 3455 3455 ? A 262.419 -2.218 12.149 1 1 A MET 0.600 1 ATOM 19 O O . MET 3455 3455 ? A 262.190 -1.217 11.479 1 1 A MET 0.600 1 ATOM 20 C CB . MET 3455 3455 ? A 263.412 -3.849 10.548 1 1 A MET 0.600 1 ATOM 21 C CG . MET 3455 3455 ? A 264.640 -4.665 10.094 1 1 A MET 0.600 1 ATOM 22 S SD . MET 3455 3455 ? A 264.414 -5.561 8.525 1 1 A MET 0.600 1 ATOM 23 C CE . MET 3455 3455 ? A 263.066 -6.659 9.047 1 1 A MET 0.600 1 ATOM 24 N N . VAL 3456 3456 ? A 261.624 -2.590 13.172 1 1 A VAL 0.630 1 ATOM 25 C CA . VAL 3456 3456 ? A 260.329 -2.012 13.475 1 1 A VAL 0.630 1 ATOM 26 C C . VAL 3456 3456 ? A 260.429 -0.570 13.936 1 1 A VAL 0.630 1 ATOM 27 O O . VAL 3456 3456 ? A 259.617 0.274 13.555 1 1 A VAL 0.630 1 ATOM 28 C CB . VAL 3456 3456 ? A 259.540 -2.871 14.455 1 1 A VAL 0.630 1 ATOM 29 C CG1 . VAL 3456 3456 ? A 258.089 -2.369 14.580 1 1 A VAL 0.630 1 ATOM 30 C CG2 . VAL 3456 3456 ? A 259.530 -4.330 13.959 1 1 A VAL 0.630 1 ATOM 31 N N . GLN 3457 3457 ? A 261.456 -0.236 14.738 1 1 A GLN 0.560 1 ATOM 32 C CA . GLN 3457 3457 ? A 261.817 1.141 15.023 1 1 A GLN 0.560 1 ATOM 33 C C . GLN 3457 3457 ? A 262.320 1.912 13.808 1 1 A GLN 0.560 1 ATOM 34 O O . GLN 3457 3457 ? A 261.791 2.961 13.443 1 1 A GLN 0.560 1 ATOM 35 C CB . GLN 3457 3457 ? A 262.943 1.181 16.087 1 1 A GLN 0.560 1 ATOM 36 C CG . GLN 3457 3457 ? A 262.507 0.628 17.460 1 1 A GLN 0.560 1 ATOM 37 C CD . GLN 3457 3457 ? A 263.664 0.632 18.458 1 1 A GLN 0.560 1 ATOM 38 O OE1 . GLN 3457 3457 ? A 264.546 1.487 18.464 1 1 A GLN 0.560 1 ATOM 39 N NE2 . GLN 3457 3457 ? A 263.643 -0.361 19.377 1 1 A GLN 0.560 1 ATOM 40 N N . LEU 3458 3458 ? A 263.348 1.384 13.113 1 1 A LEU 0.520 1 ATOM 41 C CA . LEU 3458 3458 ? A 264.042 2.113 12.071 1 1 A LEU 0.520 1 ATOM 42 C C . LEU 3458 3458 ? A 263.201 2.413 10.840 1 1 A LEU 0.520 1 ATOM 43 O O . LEU 3458 3458 ? A 263.272 3.508 10.285 1 1 A LEU 0.520 1 ATOM 44 C CB . LEU 3458 3458 ? A 265.413 1.472 11.756 1 1 A LEU 0.520 1 ATOM 45 C CG . LEU 3458 3458 ? A 265.426 0.191 10.912 1 1 A LEU 0.520 1 ATOM 46 C CD1 . LEU 3458 3458 ? A 265.622 0.518 9.432 1 1 A LEU 0.520 1 ATOM 47 C CD2 . LEU 3458 3458 ? A 266.559 -0.750 11.336 1 1 A LEU 0.520 1 ATOM 48 N N . LEU 3459 3459 ? A 262.325 1.477 10.403 1 1 A LEU 0.600 1 ATOM 49 C CA . LEU 3459 3459 ? A 261.579 1.612 9.158 1 1 A LEU 0.600 1 ATOM 50 C C . LEU 3459 3459 ? A 260.526 2.703 9.194 1 1 A LEU 0.600 1 ATOM 51 O O . LEU 3459 3459 ? A 260.033 3.167 8.169 1 1 A LEU 0.600 1 ATOM 52 C CB . LEU 3459 3459 ? A 261.055 0.239 8.636 1 1 A LEU 0.600 1 ATOM 53 C CG . LEU 3459 3459 ? A 259.635 -0.273 9.005 1 1 A LEU 0.600 1 ATOM 54 C CD1 . LEU 3459 3459 ? A 259.259 -0.095 10.471 1 1 A LEU 0.600 1 ATOM 55 C CD2 . 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A 270.467 -2.362 -10.710 1 1 A PRO 0.680 1 ATOM 345 C CD . PRO 3496 3496 ? A 270.252 -1.434 -9.521 1 1 A PRO 0.680 1 ATOM 346 N N . LEU 3497 3497 ? A 266.356 -3.286 -11.088 1 1 A LEU 0.670 1 ATOM 347 C CA . LEU 3497 3497 ? A 265.512 -4.410 -10.735 1 1 A LEU 0.670 1 ATOM 348 C C . LEU 3497 3497 ? A 264.882 -5.025 -11.968 1 1 A LEU 0.670 1 ATOM 349 O O . LEU 3497 3497 ? A 264.707 -4.359 -12.984 1 1 A LEU 0.670 1 ATOM 350 C CB . LEU 3497 3497 ? A 264.446 -4.079 -9.659 1 1 A LEU 0.670 1 ATOM 351 C CG . LEU 3497 3497 ? A 263.416 -2.991 -10.021 1 1 A LEU 0.670 1 ATOM 352 C CD1 . LEU 3497 3497 ? A 262.129 -3.190 -9.208 1 1 A LEU 0.670 1 ATOM 353 C CD2 . LEU 3497 3497 ? A 263.963 -1.576 -9.781 1 1 A LEU 0.670 1 ATOM 354 N N . SER 3498 3498 ? A 264.543 -6.326 -11.893 1 1 A SER 0.570 1 ATOM 355 C CA . SER 3498 3498 ? A 263.908 -7.053 -12.986 1 1 A SER 0.570 1 ATOM 356 C C . SER 3498 3498 ? A 263.038 -8.109 -12.361 1 1 A SER 0.570 1 ATOM 357 O O . SER 3498 3498 ? 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A 274.806 -3.878 4.673 1 1 A ALA 0.900 1 ATOM 646 C CB . ALA 3535 3535 ? A 274.187 -2.883 1.925 1 1 A ALA 0.900 1 ATOM 647 N N . LEU 3536 3536 ? A 272.642 -4.514 4.609 1 1 A LEU 0.820 1 ATOM 648 C CA . LEU 3536 3536 ? A 272.778 -5.577 5.573 1 1 A LEU 0.820 1 ATOM 649 C C . LEU 3536 3536 ? A 272.601 -6.886 4.883 1 1 A LEU 0.820 1 ATOM 650 O O . LEU 3536 3536 ? A 271.766 -6.954 3.987 1 1 A LEU 0.820 1 ATOM 651 C CB . LEU 3536 3536 ? A 271.706 -5.527 6.686 1 1 A LEU 0.820 1 ATOM 652 C CG . LEU 3536 3536 ? A 271.899 -4.358 7.652 1 1 A LEU 0.820 1 ATOM 653 C CD1 . LEU 3536 3536 ? A 270.812 -4.353 8.726 1 1 A LEU 0.820 1 ATOM 654 C CD2 . LEU 3536 3536 ? A 273.280 -4.424 8.301 1 1 A LEU 0.820 1 ATOM 655 N N . PRO 3537 3537 ? A 273.331 -7.940 5.221 1 1 A PRO 0.790 1 ATOM 656 C CA . PRO 3537 3537 ? A 273.125 -9.259 4.660 1 1 A PRO 0.790 1 ATOM 657 C C . PRO 3537 3537 ? A 271.706 -9.735 4.826 1 1 A PRO 0.790 1 ATOM 658 O O . PRO 3537 3537 ? A 271.196 -9.810 5.943 1 1 A PRO 0.790 1 ATOM 659 C CB . PRO 3537 3537 ? A 274.157 -10.160 5.346 1 1 A PRO 0.790 1 ATOM 660 C CG . PRO 3537 3537 ? A 274.523 -9.416 6.629 1 1 A PRO 0.790 1 ATOM 661 C CD . PRO 3537 3537 ? A 274.366 -7.952 6.252 1 1 A PRO 0.790 1 ATOM 662 N N . CYS 3538 3538 ? A 271.037 -10.038 3.711 1 1 A CYS 0.740 1 ATOM 663 C CA . CYS 3538 3538 ? A 269.691 -10.540 3.757 1 1 A CYS 0.740 1 ATOM 664 C C . CYS 3538 3538 ? A 269.739 -12.015 3.500 1 1 A CYS 0.740 1 ATOM 665 O O . CYS 3538 3538 ? A 270.106 -12.495 2.433 1 1 A CYS 0.740 1 ATOM 666 C CB . CYS 3538 3538 ? A 268.704 -9.843 2.791 1 1 A CYS 0.740 1 ATOM 667 S SG . CYS 3538 3538 ? A 269.228 -9.839 1.050 1 1 A CYS 0.740 1 ATOM 668 N N . GLY 3539 3539 ? A 269.383 -12.773 4.534 1 1 A GLY 0.720 1 ATOM 669 C CA . GLY 3539 3539 ? A 269.204 -14.198 4.414 1 1 A GLY 0.720 1 ATOM 670 C C . GLY 3539 3539 ? A 267.756 -14.546 4.515 1 1 A GLY 0.720 1 ATOM 671 O O . GLY 3539 3539 ? 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A 266.425 -17.671 7.456 1 1 A ASP 0.720 1 ATOM 685 C C . ASP 3541 3541 ? A 267.697 -17.385 8.234 1 1 A ASP 0.720 1 ATOM 686 O O . ASP 3541 3541 ? A 268.641 -16.818 7.702 1 1 A ASP 0.720 1 ATOM 687 C CB . ASP 3541 3541 ? A 266.053 -19.171 7.432 1 1 A ASP 0.720 1 ATOM 688 C CG . ASP 3541 3541 ? A 267.144 -20.026 6.825 1 1 A ASP 0.720 1 ATOM 689 O OD1 . ASP 3541 3541 ? A 268.170 -20.238 7.513 1 1 A ASP 0.720 1 ATOM 690 O OD2 . ASP 3541 3541 ? A 266.967 -20.463 5.663 1 1 A ASP 0.720 1 ATOM 691 N N . GLN 3542 3542 ? A 267.781 -17.756 9.522 1 1 A GLN 0.740 1 ATOM 692 C CA . GLN 3542 3542 ? A 268.954 -17.498 10.339 1 1 A GLN 0.740 1 ATOM 693 C C . GLN 3542 3542 ? A 270.255 -18.106 9.811 1 1 A GLN 0.740 1 ATOM 694 O O . GLN 3542 3542 ? A 271.300 -17.461 9.867 1 1 A GLN 0.740 1 ATOM 695 C CB . GLN 3542 3542 ? A 268.685 -17.973 11.788 1 1 A GLN 0.740 1 ATOM 696 C CG . GLN 3542 3542 ? A 269.794 -17.630 12.813 1 1 A GLN 0.740 1 ATOM 697 C CD . GLN 3542 3542 ? 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A 270.351 -1.098 15.759 1 1 A SER 0.680 1 ATOM 1180 C CA . SER 3606 3606 ? A 270.295 -2.411 15.146 1 1 A SER 0.680 1 ATOM 1181 C C . SER 3606 3606 ? A 271.584 -2.898 14.514 1 1 A SER 0.680 1 ATOM 1182 O O . SER 3606 3606 ? A 271.924 -4.077 14.615 1 1 A SER 0.680 1 ATOM 1183 C CB . SER 3606 3606 ? A 269.169 -2.442 14.102 1 1 A SER 0.680 1 ATOM 1184 O OG . SER 3606 3606 ? A 267.939 -2.552 14.809 1 1 A SER 0.680 1 ATOM 1185 N N . ILE 3607 3607 ? A 272.351 -2.021 13.843 1 1 A ILE 0.690 1 ATOM 1186 C CA . ILE 3607 3607 ? A 273.547 -2.405 13.100 1 1 A ILE 0.690 1 ATOM 1187 C C . ILE 3607 3607 ? A 274.790 -2.419 13.949 1 1 A ILE 0.690 1 ATOM 1188 O O . ILE 3607 3607 ? A 275.838 -2.870 13.513 1 1 A ILE 0.690 1 ATOM 1189 C CB . ILE 3607 3607 ? A 273.783 -1.557 11.860 1 1 A ILE 0.690 1 ATOM 1190 C CG1 . ILE 3607 3607 ? A 273.876 -0.063 12.195 1 1 A ILE 0.690 1 ATOM 1191 C CG2 . ILE 3607 3607 ? A 272.632 -1.846 10.890 1 1 A ILE 0.690 1 ATOM 1192 C CD1 . ILE 3607 3607 ? 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A 279.768 -4.013 10.302 1 1 A SER 0.730 1 ATOM 1219 C CB . SER 3611 3611 ? A 279.663 -4.309 13.419 1 1 A SER 0.730 1 ATOM 1220 O OG . SER 3611 3611 ? A 279.068 -4.285 14.712 1 1 A SER 0.730 1 ATOM 1221 N N . PRO 3612 3612 ? A 279.484 -6.167 10.691 1 1 A PRO 0.740 1 ATOM 1222 C CA . PRO 3612 3612 ? A 279.832 -6.562 9.326 1 1 A PRO 0.740 1 ATOM 1223 C C . PRO 3612 3612 ? A 278.754 -6.189 8.304 1 1 A PRO 0.740 1 ATOM 1224 O O . PRO 3612 3612 ? A 277.934 -7.021 7.916 1 1 A PRO 0.740 1 ATOM 1225 C CB . PRO 3612 3612 ? A 279.992 -8.093 9.444 1 1 A PRO 0.740 1 ATOM 1226 C CG . PRO 3612 3612 ? A 279.185 -8.488 10.681 1 1 A PRO 0.740 1 ATOM 1227 C CD . PRO 3612 3612 ? A 279.466 -7.317 11.603 1 1 A PRO 0.740 1 ATOM 1228 N N . HIS 3613 3613 ? A 278.788 -4.933 7.827 1 1 A HIS 0.840 1 ATOM 1229 C CA . HIS 3613 3613 ? A 277.823 -4.367 6.909 1 1 A HIS 0.840 1 ATOM 1230 C C . HIS 3613 3613 ? A 278.470 -3.298 6.061 1 1 A HIS 0.840 1 ATOM 1231 O O . HIS 3613 3613 ? A 279.636 -2.959 6.250 1 1 A HIS 0.840 1 ATOM 1232 C CB . HIS 3613 3613 ? A 276.591 -3.761 7.617 1 1 A HIS 0.840 1 ATOM 1233 C CG . HIS 3613 3613 ? A 276.810 -2.524 8.437 1 1 A HIS 0.840 1 ATOM 1234 N ND1 . HIS 3613 3613 ? A 276.910 -1.286 7.828 1 1 A HIS 0.840 1 ATOM 1235 C CD2 . HIS 3613 3613 ? A 276.924 -2.391 9.777 1 1 A HIS 0.840 1 ATOM 1236 C CE1 . HIS 3613 3613 ? A 277.094 -0.433 8.812 1 1 A HIS 0.840 1 ATOM 1237 N NE2 . HIS 3613 3613 ? A 277.108 -1.049 10.016 1 1 A HIS 0.840 1 ATOM 1238 N N . LEU 3614 3614 ? A 277.740 -2.753 5.070 1 1 A LEU 0.880 1 ATOM 1239 C CA . LEU 3614 3614 ? A 278.286 -1.738 4.197 1 1 A LEU 0.880 1 ATOM 1240 C C . LEU 3614 3614 ? A 277.444 -0.480 4.204 1 1 A LEU 0.880 1 ATOM 1241 O O . LEU 3614 3614 ? A 276.218 -0.516 4.082 1 1 A LEU 0.880 1 ATOM 1242 C CB . LEU 3614 3614 ? A 278.372 -2.249 2.750 1 1 A LEU 0.880 1 ATOM 1243 C CG . LEU 3614 3614 ? A 279.295 -3.465 2.570 1 1 A LEU 0.880 1 ATOM 1244 C CD1 . LEU 3614 3614 ? A 278.956 -4.151 1.247 1 1 A LEU 0.880 1 ATOM 1245 C CD2 . LEU 3614 3614 ? A 280.777 -3.078 2.668 1 1 A LEU 0.880 1 ATOM 1246 N N . MET 3615 3615 ? A 278.099 0.692 4.292 1 1 A MET 0.890 1 ATOM 1247 C CA . MET 3615 3615 ? A 277.417 1.965 4.175 1 1 A MET 0.890 1 ATOM 1248 C C . MET 3615 3615 ? A 277.521 2.453 2.749 1 1 A MET 0.890 1 ATOM 1249 O O . MET 3615 3615 ? A 278.606 2.707 2.234 1 1 A MET 0.890 1 ATOM 1250 C CB . MET 3615 3615 ? A 278.032 3.019 5.115 1 1 A MET 0.890 1 ATOM 1251 C CG . MET 3615 3615 ? A 277.290 4.368 5.113 1 1 A MET 0.890 1 ATOM 1252 S SD . MET 3615 3615 ? A 278.031 5.607 6.214 1 1 A MET 0.890 1 ATOM 1253 C CE . MET 3615 3615 ? A 279.473 5.972 5.174 1 1 A MET 0.890 1 ATOM 1254 N N . ILE 3616 3616 ? A 276.384 2.587 2.052 1 1 A ILE 0.910 1 ATOM 1255 C CA . ILE 3616 3616 ? A 276.386 2.788 0.619 1 1 A ILE 0.910 1 ATOM 1256 C C . ILE 3616 3616 ? A 275.894 4.178 0.306 1 1 A ILE 0.910 1 ATOM 1257 O O . ILE 3616 3616 ? 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GLU 2 1 B B 292.503 1.733 -6.752 1 2 '_' GLU . 1 ATOM 1327 O OE2 . GLU 2 1 B B 291.290 3.196 -5.662 1 2 '_' GLU . 1 ATOM 1328 H H . GLU 2 1 B B 289.888 5.943 -9.771 1 2 '_' GLU . 1 ATOM 1329 H HA . GLU 2 1 B B 291.018 4.129 -10.605 1 2 '_' GLU . 1 ATOM 1330 H HB2 . GLU 2 1 B B 289.581 2.860 -8.275 1 2 '_' GLU . 1 ATOM 1331 H HB3 . GLU 2 1 B B 290.781 2.006 -9.226 1 2 '_' GLU . 1 ATOM 1332 H HG2 . GLU 2 1 B B 292.473 3.541 -8.550 1 2 '_' GLU . 1 ATOM 1333 H HG3 . GLU 2 1 B B 291.293 4.546 -7.730 1 2 '_' GLU . 1 ATOM 1334 N N . THR 3 1 C B 289.534 1.750 -11.096 1 2 '_' THR . 1 ATOM 1335 C CA . THR 3 1 C B 288.663 0.764 -11.697 1 2 '_' THR . 1 ATOM 1336 C C . THR 3 1 C B 288.804 -0.522 -10.902 1 2 '_' THR . 1 ATOM 1337 O O . THR 3 1 C B 289.886 -1.108 -10.875 1 2 '_' THR . 1 ATOM 1338 C CB . THR 3 1 C B 289.022 0.496 -13.172 1 2 '_' THR . 1 ATOM 1339 O OG1 . THR 3 1 C B 289.056 1.729 -13.901 1 2 '_' THR . 1 ATOM 1340 C CG2 . 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LEU 4 1 D B 286.816 -2.330 -5.803 1 2 '_' LEU . 1 ATOM 1355 C CD2 . LEU 4 1 D B 286.134 -4.344 -7.102 1 2 '_' LEU . 1 ATOM 1356 H H . LEU 4 1 D B 286.886 -0.471 -10.317 1 2 '_' LEU . 1 ATOM 1357 H HA . LEU 4 1 D B 288.775 -2.085 -8.875 1 2 '_' LEU . 1 ATOM 1358 H HB2 . LEU 4 1 D B 286.514 -1.186 -7.974 1 2 '_' LEU . 1 ATOM 1359 H HB3 . LEU 4 1 D B 285.806 -2.558 -8.807 1 2 '_' LEU . 1 ATOM 1360 H HG . LEU 4 1 D B 288.036 -3.406 -7.158 1 2 '_' LEU . 1 ATOM 1361 H HD11 . LEU 4 1 D B 287.680 -1.716 -5.614 1 2 '_' LEU . 1 ATOM 1362 H HD12 . LEU 4 1 D B 285.938 -1.708 -5.870 1 2 '_' LEU . 1 ATOM 1363 H HD13 . LEU 4 1 D B 286.693 -3.036 -4.993 1 2 '_' LEU . 1 ATOM 1364 H HD21 . LEU 4 1 D B 285.092 -4.065 -7.106 1 2 '_' LEU . 1 ATOM 1365 H HD22 . LEU 4 1 D B 286.350 -4.937 -7.977 1 2 '_' LEU . 1 ATOM 1366 H HD23 . LEU 4 1 D B 286.344 -4.924 -6.214 1 2 '_' LEU . 1 ATOM 1367 N N . SEP 5 1 E B 286.948 -4.310 -9.990 1 2 '_' SEP . 1 ATOM 1368 C CA . 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GLU 8 1 H B 284.860 -5.341 -17.954 1 2 '_' GLU . 1 # # loop_ _atom_type.symbol C H N O P S # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.719 2 1 3 0 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 3453 VAL 1 0.630 2 1 A 3454 ASP 1 0.610 3 1 A 3455 MET 1 0.600 4 1 A 3456 VAL 1 0.630 5 1 A 3457 GLN 1 0.560 6 1 A 3458 LEU 1 0.520 7 1 A 3459 LEU 1 0.600 8 1 A 3460 LYS 1 0.600 9 1 A 3461 LYS 1 0.630 10 1 A 3462 TYR 1 0.640 11 1 A 3463 PRO 1 0.640 12 1 A 3464 ILE 1 0.700 13 1 A 3465 VAL 1 0.730 14 1 A 3466 TRP 1 0.740 15 1 A 3467 GLN 1 0.730 16 1 A 3468 GLY 1 0.760 17 1 A 3469 LEU 1 0.720 18 1 A 3470 LEU 1 0.750 19 1 A 3471 ALA 1 0.740 20 1 A 3472 LEU 1 0.650 21 1 A 3473 LYS 1 0.610 22 1 A 3474 ASN 1 0.630 23 1 A 3475 ASP 1 0.650 24 1 A 3476 THR 1 0.680 25 1 A 3477 ALA 1 0.770 26 1 A 3478 ALA 1 0.780 27 1 A 3479 VAL 1 0.830 28 1 A 3480 GLN 1 0.820 29 1 A 3481 LEU 1 0.850 30 1 A 3482 HIS 1 0.800 31 1 A 3483 PHE 1 0.770 32 1 A 3484 VAL 1 0.810 33 1 A 3485 SER 1 0.780 34 1 A 3486 GLY 1 0.750 35 1 A 3487 ASN 1 0.710 36 1 A 3488 ASN 1 0.700 37 1 A 3489 VAL 1 0.690 38 1 A 3490 LEU 1 0.710 39 1 A 3491 ALA 1 0.810 40 1 A 3492 HIS 1 0.690 41 1 A 3493 ARG 1 0.640 42 1 A 3494 SER 1 0.730 43 1 A 3495 LEU 1 0.730 44 1 A 3496 PRO 1 0.680 45 1 A 3497 LEU 1 0.670 46 1 A 3498 SER 1 0.570 47 1 A 3499 GLU 1 0.600 48 1 A 3500 GLY 1 0.700 49 1 A 3501 GLY 1 0.690 50 1 A 3502 PRO 1 0.660 51 1 A 3503 PRO 1 0.710 52 1 A 3504 LEU 1 0.740 53 1 A 3505 ARG 1 0.690 54 1 A 3506 ILE 1 0.720 55 1 A 3507 ALA 1 0.680 56 1 A 3508 GLN 1 0.650 57 1 A 3509 ARG 1 0.650 58 1 A 3510 MET 1 0.660 59 1 A 3511 ARG 1 0.620 60 1 A 3512 LEU 1 0.670 61 1 A 3513 GLU 1 0.660 62 1 A 3514 ALA 1 0.660 63 1 A 3515 SER 1 0.680 64 1 A 3516 GLN 1 0.640 65 1 A 3517 LEU 1 0.670 66 1 A 3518 GLU 1 0.650 67 1 A 3519 GLY 1 0.710 68 1 A 3520 VAL 1 0.730 69 1 A 3521 ALA 1 0.750 70 1 A 3522 ARG 1 0.640 71 1 A 3523 ARG 1 0.620 72 1 A 3524 MET 1 0.690 73 1 A 3525 THR 1 0.640 74 1 A 3526 VAL 1 0.650 75 1 A 3527 GLU 1 0.660 76 1 A 3528 THR 1 0.680 77 1 A 3529 ASP 1 0.690 78 1 A 3530 TYR 1 0.760 79 1 A 3531 CYS 1 0.830 80 1 A 3532 LEU 1 0.870 81 1 A 3533 LEU 1 0.890 82 1 A 3534 LEU 1 0.880 83 1 A 3535 ALA 1 0.900 84 1 A 3536 LEU 1 0.820 85 1 A 3537 PRO 1 0.790 86 1 A 3538 CYS 1 0.740 87 1 A 3539 GLY 1 0.720 88 1 A 3540 ARG 1 0.670 89 1 A 3541 ASP 1 0.720 90 1 A 3542 GLN 1 0.740 91 1 A 3543 GLU 1 0.750 92 1 A 3544 ASP 1 0.730 93 1 A 3545 VAL 1 0.720 94 1 A 3546 VAL 1 0.720 95 1 A 3547 SER 1 0.750 96 1 A 3548 GLN 1 0.730 97 1 A 3549 THR 1 0.720 98 1 A 3550 GLU 1 0.710 99 1 A 3551 SER 1 0.720 100 1 A 3552 LEU 1 0.740 101 1 A 3553 LYS 1 0.760 102 1 A 3554 ALA 1 0.770 103 1 A 3555 ALA 1 0.780 104 1 A 3556 PHE 1 0.800 105 1 A 3557 ILE 1 0.810 106 1 A 3558 THR 1 0.750 107 1 A 3559 TYR 1 0.750 108 1 A 3560 LEU 1 0.760 109 1 A 3561 GLN 1 0.710 110 1 A 3562 ALA 1 0.750 111 1 A 3563 LYS 1 0.710 112 1 A 3564 GLN 1 0.690 113 1 A 3565 ALA 1 0.750 114 1 A 3566 ALA 1 0.800 115 1 A 3567 GLY 1 0.780 116 1 A 3568 ILE 1 0.760 117 1 A 3569 ILE 1 0.780 118 1 A 3570 ASN 1 0.720 119 1 A 3571 VAL 1 0.740 120 1 A 3572 PRO 1 0.630 121 1 A 3573 ASN 1 0.640 122 1 A 3574 PRO 1 0.650 123 1 A 3575 GLY 1 0.630 124 1 A 3576 SER 1 0.680 125 1 A 3577 ASN 1 0.660 126 1 A 3578 GLN 1 0.620 127 1 A 3579 PRO 1 0.620 128 1 A 3580 ALA 1 0.620 129 1 A 3581 TYR 1 0.660 130 1 A 3582 VAL 1 0.770 131 1 A 3583 LEU 1 0.860 132 1 A 3584 GLN 1 0.850 133 1 A 3585 ILE 1 0.870 134 1 A 3586 PHE 1 0.850 135 1 A 3587 PRO 1 0.810 136 1 A 3588 PRO 1 0.760 137 1 A 3589 CYS 1 0.720 138 1 A 3590 GLU 1 0.670 139 1 A 3591 PHE 1 0.700 140 1 A 3592 SER 1 0.800 141 1 A 3593 GLU 1 0.700 142 1 A 3594 SER 1 0.730 143 1 A 3595 HIS 1 0.760 144 1 A 3596 LEU 1 0.770 145 1 A 3597 SER 1 0.730 146 1 A 3598 ARG 1 0.700 147 1 A 3599 LEU 1 0.740 148 1 A 3600 ALA 1 0.800 149 1 A 3601 PRO 1 0.720 150 1 A 3602 ASP 1 0.670 151 1 A 3603 LEU 1 0.670 152 1 A 3604 LEU 1 0.690 153 1 A 3605 ALA 1 0.710 154 1 A 3606 SER 1 0.680 155 1 A 3607 ILE 1 0.690 156 1 A 3608 SER 1 0.680 157 1 A 3609 ASN 1 0.650 158 1 A 3610 ILE 1 0.680 159 1 A 3611 SER 1 0.730 160 1 A 3612 PRO 1 0.740 161 1 A 3613 HIS 1 0.840 162 1 A 3614 LEU 1 0.880 163 1 A 3615 MET 1 0.890 164 1 A 3616 ILE 1 0.910 165 1 A 3617 VAL 1 0.890 166 1 A 3618 ILE 1 0.840 167 1 A 3619 ALA 1 0.790 168 1 A 3620 SER 1 0.650 169 1 A 3621 VAL 1 0.620 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. 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