data_SMR-75c9e258f8c479ec9b7d65eefe71fb23_3 _entry.id SMR-75c9e258f8c479ec9b7d65eefe71fb23_3 _struct.entry_id SMR-75c9e258f8c479ec9b7d65eefe71fb23_3 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q2LD37 (isoform 2)/ BLTP1_HUMAN, Bridge-like lipid transfer protein family member 1 Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q2LD37 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 476148.620 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP BLTP1_HUMAN Q2LD37 1 ;MDQRKNESIVPSITQLEDFLTEHNSNVVWLLVATILSCGWIIYLTYYNSRNVGLILTLVLNRLYKHGYIH IGSFSFSVLSGKVMVREIYYITEDMSIRIQDGFIIFRWWKMYNPKQKQHDPKAETRLYITVNDFEFHVYN RSDLYGRLQELFGLEPTIIPPKKDDDKTREIGRTRTQSKIERVKVKTESQDPTSSWRSLIPVIKVNVSTG RLAFGNHYQPQTLCINFDDAFLTYTTKPPSSHLDQFMHIVKGKLENVRVMLVPSPRYVGLQNDEPPRLMG EGFVVMQSNDVDIYYYMDEPGLVPEETEENIEGEMSSEDCKLQDLPPCWGLDIVCGKGTDFNYGPWADRQ RDCLWKFFFPPDYQVLKVSEIAQPGRPRQILAFELRMNIIADATIDLLFTKNRETNAVHVNVGAGSYLEI NIPMTVEENGYTPAIKGQLLHVDATTSMQYRTLLEAEMLAFHINASYPRIWNMPQTWQCELEVYKATYHF IFAQKNFFTDLIQDWSSDSPPDIFSFVPYTWNFKIMFHQFEMIWAANQHNWIDCSTKQQENVYLAACGET LNIDFSLPFTDFVPATCNTKFSLRGEDVDLHLFLPDCHPSKYSLFMLVKNCHPNKMIHDTGIPAECQSGQ KTVKPKWRNVTQEKSGWVECWTVPSVMLTIDYTWHPIYPQKADEQLKQSLSEMEETMLSVLRPSQKTSDR VVSSPSTSSRPPIDPSELPPDKLHVEMELSPDSQITLYGPLLNAFLCIKENYFGEDDMYMDFEEVISSPV LSLSTSSSSGWTAVGMENDKKENEGSAKSIHPLALRPWDITVLVNLYKVHGRLPVHGTTDGPECPTAFLE RLCFEMKKGFRETMLQLILSPLNVFVSDNYQQRPPVDEVLREGHINLSGLQLRAHAMFSAEGLPLGSDSL EYAWLIDVQAGSLTAKVTAPQLACLLEWGQTFVFHVVCREYELERPKSVIICQHGIDRRFCESKLSCIPG PCPTSDDLKYTMIRLAVDGADIYIVEHGCATNIKMGAIRVANCNLHNQSVGEGISAAIQDFQVRQYIEQL NNCRIGLQPAVLRRAYWLEAGSANLGLITVDIALAADHHSKHEAQRHFLETHDARTKRLWFLWPDDILKN KRCRNKCGCLGGCRFFGGTVTGLDFFKLEELTPSSSSAFSSTSAESDMYYGQSLLQPGEWIITKEIPKII DGNVNGMKRKEWENKSVGIEVERKTQHLSLQVPLRSHSSSSSSEENSSSSAAQPLLAGEKESPSSVADDH LVQKEFLHGTKRDDGQASIPTEISGNSPVSPNTQDKSVGQSPLRSPLKRQASVCSTRLGSTKSLTAAFYG DKQPVTVGVQFSSDVSRSDENVLDSPKQRRSFGSFPYTPSADSNSFHQYRSMDSSMSMADSEAYFSAAEE FEPISSDEGPGTYPGRKKKKKQTQQIDYSRGSIYHSVEGPLTGHGESIQDSRTLPFKTHPSQASFVSALG GEDDVIEHLYIVEGEKTVESEQITPQQPVMNCYQTYLTQFQVINWSVKHPTNKRTSKSSLHRPLDLDTPT SEESSSSFEQLSVPTFKVIKQGLTANSLLDRGMQLSGSTSNTPYTPLEKKLADNTDDETLTEEWTLDQPV SQTRTTAIVEVKGTVDIVLTPLVAEALDRYIEAMVHCASTRHPAAIVDDLHAKVLREAVQNSKTTFSENL SSKQDIRGTKTEQSTIGTTNQGQAQTNLTMKQDNVTIKGLQTNVSIPKVNLCLLQASVEESPTTAPSRSV THVSLVALCFDRIATQVRMNRGVVEETSNNAEPGRTSNFDRYVHATKMQPQSSGSLRSNAGAEKGKEIAA KLNIHRVHGQLRGLDTTDIGTCAITAIPFEKSKVLFTLEELDEFTFVDETDQQAVPDVTRIGPSQEKWGW IMFECGLENLTIKGGRQSGAVLYNSFGIMGKASDTERGGVLTSNNSSDSPTGSGYNTDVSDDNLPCDRTS PSSDLNGNSVSDEQDEGVESDDLKKDLPLMPPPPDSCSMKLTIKEIWFSFAAPTNVRSHTHAFSRQLNLL STATPAVGAWLVPIDQLKSSLNKLETEGTLRICAVMGCIMTEALENKSVHFPLRSKYNRLTKVARFLQEN PSCLLCNILHHYLHQANYSIIDDATMSDGLPALVTLKKGLVALARQWMKFIVVTPAFKGVSLHRPAQPLK PQIAMDHEHEDGLGLDNGGGLQSDTSADGAEFEFDAATVSEHTMLLEGTANRPPPGSSGPVTGAEIMRKL SKTHTHSDSALKIKGIHPYHSLSYTSGDTATDSPVHVGRAGMPVKDSPRKESLLSYLTGSFPSLHNLLEG TPQRSSAAVKSSSLTRTGNTVATDMLSEHPLLSEPSSVSFYNWMSNAVGNRGSVLQESPVTKSGHNSLPT GVAPNLPTIPSASDFNTVLSSDQNTLDGTHSQHSTSQDDVAGVEEANQGFPAVQLADAQVVFKPLLSHTG IQSQDTMPFCYRMYFGEHLSFSGTLDCLRADIVDSDTAKERKGKRARRQGHVNLPPLEFKPALMLGTFSI SAVVMEKSVCTPQNSTSALSFHDLSKRYYNTFHCNFTISCQSISQHVDMALVRLIHQFSTMIDDIKATQT DIKLSRYTAGSASPTPTFKTRKHRDFRSSDFSRSSRGSLNGGNRVNNAKNKRTNNENNKKESRNKNSLGR SERRTSKVSRKGSKDVVDHMTIHMDDSDSITVSEQSEPSAECWQNMYKLLNFYSLISDPTGILEKSSETF GPAGVRSPTEPTCKVVFENEQDNSSLTKTQRKRSLVTSEPQHVTLIVFGIGMVNRTHLEADIGGLTMESE LKRIHGSFTLKEKMKDVLHQKMTETCATAHIGGVNIVLLEGITPNIQLEDFPTSPTSTAKQEFLTVVKCS IAKSQALYSAQRGLKTNNAAVFKVGAISINIPQHPATLHSMMVRSSHQLSKQISDLIRQPSTAPQPVKED IATPLPSEKTPTSVNQTPVETNEFPQLPEGLEKKPIVLKFSAMLDGIAIGAALLPSLKAEYKMGRMRSHG MTGAQTRFTFELPNHRLRFTSKVSATDMSTIPPSASLNLPPVTMSGKYIMEEHDSYSDQVWSIDELPSKQ GYYLQGNYLRCVAEVGSFEHNLTTDLLNHLVFVQKVFMKEVNEVIQKVSGGEQPIPLWNEHDGTADGDKP KILLYSLNLQFKGIQVTATTPSMRAVRFETGLIELELSNRLQTKASPGSSSYLKLFGKCQVDLNLALGQI VKHQVYEEAGSDFHQVAYFKTRIGLRNALREEISGSSDREAVLITLNRPIVYAQPVAFDRAVLFWLNYKA AYDNWNEQRMALHKDIHMATKEVVDMLPGIQQTSAQAFGTLFLQLTVNDLGICLPITNTAQSNHTGDLDT GSALVLTIESTLITACSSESLVSKGHFKNFCIRFADGFETSWDDWKPEIHGDLVMNACVVPDGTYEVCSR TTGQAAAESSSAGTWTLNVLWKMCGIDVHMDPNIGKRLNALGNTLTTLTGEEDIDDIADLNSVNIADLSD EDEVDTMSPTIHTEATDYRRQAASASQPGELRGRKIMKRIVDIRELNEQAKVIDDLKKLGASEGTINQEI QRYQQLESVAVNDIRRDVRKKLRRSSMRAASLKDKWGLSYKPSYSRSKSISASGRPPLKRMERASSRVGE TEELPEIRVDAASPGPRVTFNIQDTIAEIRRKKISFKVVF ; 'Bridge-like lipid transfer protein family member 1' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 3680 1 3680 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . 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A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Polymerase I and transcript release factor {PDB ID=4qkv, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=4qkv.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 4qkv, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 3' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-04 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-29 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;LIKSDQVNGVLVLSLLDKIIGAVDQIQLTQAQLEERQAEMEGAVQSIQGELSKLGKAHATTSNTVSKLLE KVRKVSVNVKTVRGSLERQAGQIKKLEVNEAELLRRRNFKV ; ;LIKSDQVNGVLVLSLLDKIIGAVDQIQLTQAQLEERQAEMEGAVQSIQGELSKLGKAHATTSNTVSKLLE KVRKVSVNVKTVRGSLERQAGQIKKLEVNEAELLRRRNFKV ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 7 38 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 4qkv 2024-03-20 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 3680 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 3680 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 360.000 15.625 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MDQRKNESIVPSITQLEDFLTEHNSNVVWLLVATILSCGWIIYLTYYNSRNVGLILTLVLNRLYKHGYIHIGSFSFSVLSGKVMVREIYYITEDMSIRIQDGFIIFRWWKMYNPKQKQHDPKAETRLYITVNDFEFHVYNRSDLYGRLQELFGLEPTIIPPKKDDDKTREIGRTRTQSKIERVKVKTESQDPTSSWRSLIPVIKVNVSTGRLAFGNHYQPQTLCINFDDAFLTYTTKPPSSHLDQFMHIVKGKLENVRVMLVPSPRYVGLQNDEPPRLMGEGFVVMQSNDVDIYYYMDEPGLVPEETEENIEGEMSSEDCKLQDLPPCWGLDIVCGKGTDFNYGPWADRQRDCLWKFFFPPDYQVLKVSEIAQPGRPRQILAFELRMNIIADATIDLLFTKNRETNAVHVNVGAGSYLEINIPMTVEENGYTPAIKGQLLHVDATTSMQYRTLLEAEMLAFHINASYPRIWNMPQTWQCELEVYKATYHFIFAQKNFFTDLIQDWSSDSPPDIFSFVPYTWNFKIMFHQFEMIWAANQHNWIDCSTKQQENVYLAACGETLNIDFSLPFTDFVPATCNTKFSLRGEDVDLHLFLPDCHPSKYSLFMLVKNCHPNKMIHDTGIPAECQSGQKTVKPKWRNVTQEKSGWVECWTVPSVMLTIDYTWHPIYPQKADEQLKQSLSEMEETMLSVLRPSQKTSDRVVSSPSTSSRPPIDPSELPPDKLHVEMELSPDSQITLYGPLLNAFLCIKENYFGEDDMYMDFEEVISSPVLSLSTSSSSGWTAVGMENDKKENEGSAKSIHPLALRPWDITVLVNLYKVHGRLPVHGTTDGPECPTAFLERLCFEMKKGFRETMLQLILSPLNVFVSDNYQQRPPVDEVLREGHINLSGLQLRAHAMFSAEGLPLGSDSLEYAWLIDVQAGSLTAKVTAPQLACLLEWGQTFVFHVVCREYELERPKSVIICQHGIDRRFCESKLSCIPGPCPTSDDLKYTMIRLAVDGADIYIVEHGCATNIKMGAIRVANCNLHNQSVGEGISAAIQDFQVRQYIEQLNNCRIGLQPAVLRRAYWLEAGSANLGLITVDIALAADHHSKHEAQRHFLETHDARTKRLWFLWPDDILKNKRCRNKCGCLGGCRFFGGTVTGLDFFKLEELTPSSSSAFSSTSAESDMYYGQSLLQPGEWIITKEIPKIIDGNVNGMKRKEWENKSVGIEVERKTQHLSLQVPLRSHSSSSSSEENSSSSAAQPLLAGEKESPSSVADDHLVQKEFLHGTKRDDGQASIPTEISGNSPVSPNTQDKSVGQSPLRSPLKRQASVCSTRLGSTKSLTAAFYGDKQPVTVGVQFSSDVSRSDENVLDSPKQRRSFGSFPYTPSADSNSFHQYRSMDSSMSMADSEAYFSAAEEFEPISSDEGPGTYPGRKKKKKQTQQIDYSRGSIYHSVEGPLTGHGESIQDSRTLPFKTHPSQASFVSALGGEDDVIEHLYIVEGEKTVESEQITPQQPVMNCYQTYLTQFQVINWSVKHPTNKRTSKSSLHRPLDLDTPTSEESSSSFEQLSVPTFKVIKQGLTANSLLDRGMQLSGSTSNTPYTPLEKKLADNTDDETLTEEWTLDQPVSQTRTTAIVEVKGTVDIVLTPLVAEALDRYIEAMVHCASTRHPAAIVDDLHAKVLREAVQNSKTTFSENLSSKQDIRGTKTEQSTIGTTNQGQAQTNLTMKQDNVTIKGLQTNVSIPKVNLCLLQASVEESPTTAPSRSVTHVSLVALCFDRIATQVRMNRGVVEETSNNAEPGRTSNFDRYVHATKMQPQSSGSLRSNAGAEKGKEIAAKLNIHRVHGQLRGLDTTDIGTCAITAIPFEKSKVLFTLEELDEFTFVDETDQQAVPDVTRIGPSQEKWGWIMFECGLENLTIKGGRQSGAVLYNSFGIMGKASDTERGGVLTSNNSSDSPTGSGYNTDVSDDNLPCDRTSPSSDLNGNSVSDEQDEGVESDDLKKDLPLMPPPPDSCSMKLTIKEIWFSFAAPTNVRSHTHAFSRQLNLLSTATPAVGAWLVPIDQLKSSLNKLETEGTLRICAVMGCIMTEALENKSVHFPLRSKYNRLTKVARFLQENPSCLLCNILHHYLHQANYSIIDDATMSDGLPALVTLKKGLVALARQWMKFIVVTPAFKGVSLHRPAQPLKPQIAMDHEHEDGLGLDNGGGLQSDTSADGAEFEFDAATVSEHTMLLEGTANRPPPGSSGPVTGAEIMRKLSKTHTHSDSALKIKGIHPYHSLSYTSGDTATDSPVHVGRAGMPVKDSPRKESLLSYLTGSFPSLHNLLEGTPQRSSAAVKSSSLTRTGNTVATDMLSEHPLLSEPSSVSFYNWMSNAVGNRGSVLQESPVTKSGHNSLPTGVAPNLPTIPSASDFNTVLSSDQNTLDGTHSQHSTSQDDVAGVEEANQGFPAVQLADAQVVFKPLLSHTGIQSQDTMPFCYRMYFGEHLSFSGTLDCLRADIVDSDTAKERKGKRARRQGHVNLPPLEFKPALMLGTFSISAVVMEKSVCTPQNSTSALSFHDLSKRYYNTFHCNFTISCQSISQHVDMALVRLIHQFSTMIDDIKATQTDIKLSRYTAGSASPTPTFKTRKHRDFRSSDFSRSSRGSLNGGNRVNNAKNKRTNNENNKKESRNKNSLGRSERRTSKVSRKGSKDVVDHMTIHMDDSDSITVSEQSEPSAECWQNMYKLLNFYSLISDPTGILEKSSETFGPAGVRSPTEPTCKVVFENEQDNSSLTKTQRKRSLVTSEPQHVTLIVFGIGMVNRTHLEADIGGLTMESELKRIHGSFTLKEKMKDVLHQKMTETCATAHIGGVNIVLLEGITPNIQLEDFPTSPTSTAKQEFLTVVKCSIAKSQALYSAQRGLKTNNAAVFKVGAISINIPQHPATLHSMMVRSSHQLSKQISDLIRQPSTAPQPVKEDIATPLPSEKTPTSVNQTPVETNEFPQLPEGLEKKPIVLKFSAMLDGIAIGAALLPSLKAEYKMGRMRSHGMTGAQTRFTFELPNHRLRFTSKVSATDMSTIPPSASLNLPPVTMSGKYIMEEHDSYSDQVWSIDELPSKQGYYLQGNYLRCVAEVGSFEHNLTTDLLNHLVFVQKVFMKEVNEVIQKVSGGEQPIPLWNEHDGTADGDKPKILLYSLNLQFKGIQVTATTPSMRAVRFETGLIELELSNRLQTKASPGSSSYLKLFGKCQVDLNLALGQIVKHQVYEEAGSDFHQVAYFKTRIGLRNALREEISGSSDREAVLITLNRPIVYAQPVAFDRAVLFWLNYKAAYDNWNEQRMALHKDIHMATKEVVDMLPGIQQTSAQAFGTLFLQLTVNDLGICLPITNTAQSNHTGDLDTGSALVLTIESTLITACSSESLVSKGHFKNFCIRFADGFETSWDDWKPEIHGDLVMNACVVPDGTYEVCSRTTGQAAAESSSAGTWTLNVLWKMCGIDVHMDPNIGKRLNALGNTLTTLTGEEDIDDIADLNSVNIADLSDEDEVDTMSPTIHTEATDYRRQAASASQPGELRGRKIMKRIVDIRELNEQAKVIDDLKKLGASEGTINQEIQRYQQLESVAVNDIRRDVRKKLRRSSMRAASLKDKWGLSYKPSYSRSKSISASGRPPLKRMERASSRVGETEELPEIRVDAASPGPRVTFNIQDTIAEIRRKKISFKVVF 2 1 2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------VNGVLVLSLLDKIIGAVDQIQLTQAQLEERQA--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.032}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 4qkv.1, oligomeric state (monomer) as predicted' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 3' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . HIS 2566 2566 ? A 13.192 22.130 110.130 1 1 A HIS 0.450 1 ATOM 2 C CA . HIS 2566 2566 ? A 13.599 21.840 108.692 1 1 A HIS 0.450 1 ATOM 3 C C . HIS 2566 2566 ? A 12.509 22.056 107.642 1 1 A HIS 0.450 1 ATOM 4 O O . HIS 2566 2566 ? A 12.748 22.724 106.648 1 1 A HIS 0.450 1 ATOM 5 C CB . HIS 2566 2566 ? A 14.171 20.413 108.529 1 1 A HIS 0.450 1 ATOM 6 C CG . HIS 2566 2566 ? A 14.646 20.156 107.137 1 1 A HIS 0.450 1 ATOM 7 N ND1 . HIS 2566 2566 ? A 15.814 20.772 106.743 1 1 A HIS 0.450 1 ATOM 8 C CD2 . HIS 2566 2566 ? A 14.148 19.393 106.137 1 1 A HIS 0.450 1 ATOM 9 C CE1 . HIS 2566 2566 ? A 16.016 20.351 105.515 1 1 A HIS 0.450 1 ATOM 10 N NE2 . HIS 2566 2566 ? A 15.033 19.514 105.086 1 1 A HIS 0.450 1 ATOM 11 N N . VAL 2567 2567 ? A 11.269 21.535 107.835 1 1 A VAL 0.570 1 ATOM 12 C CA . VAL 2567 2567 ? A 10.127 21.812 106.961 1 1 A VAL 0.570 1 ATOM 13 C C . VAL 2567 2567 ? A 9.803 23.302 106.861 1 1 A VAL 0.570 1 ATOM 14 O O . VAL 2567 2567 ? A 9.583 23.809 105.770 1 1 A VAL 0.570 1 ATOM 15 C CB . VAL 2567 2567 ? A 8.907 21.009 107.392 1 1 A VAL 0.570 1 ATOM 16 C CG1 . VAL 2567 2567 ? A 7.666 21.379 106.546 1 1 A VAL 0.570 1 ATOM 17 C CG2 . VAL 2567 2567 ? A 9.233 19.509 107.217 1 1 A VAL 0.570 1 ATOM 18 N N . ASP 2568 2568 ? A 9.882 24.059 107.982 1 1 A ASP 0.610 1 ATOM 19 C CA . ASP 2568 2568 ? A 9.798 25.512 108.000 1 1 A ASP 0.610 1 ATOM 20 C C . ASP 2568 2568 ? A 10.771 26.182 107.034 1 1 A ASP 0.610 1 ATOM 21 O O . ASP 2568 2568 ? A 10.418 27.041 106.245 1 1 A ASP 0.610 1 ATOM 22 C CB . ASP 2568 2568 ? A 10.124 26.008 109.437 1 1 A ASP 0.610 1 ATOM 23 C CG . ASP 2568 2568 ? A 9.097 25.506 110.439 1 1 A ASP 0.610 1 ATOM 24 O OD1 . ASP 2568 2568 ? A 8.020 25.035 110.007 1 1 A ASP 0.610 1 ATOM 25 O OD2 . ASP 2568 2568 ? A 9.459 25.492 111.639 1 1 A ASP 0.610 1 ATOM 26 N N . MET 2569 2569 ? A 12.036 25.711 107.029 1 1 A MET 0.570 1 ATOM 27 C CA . MET 2569 2569 ? A 13.069 26.155 106.119 1 1 A MET 0.570 1 ATOM 28 C C . MET 2569 2569 ? A 12.773 25.826 104.656 1 1 A MET 0.570 1 ATOM 29 O O . MET 2569 2569 ? A 13.035 26.637 103.775 1 1 A MET 0.570 1 ATOM 30 C CB . MET 2569 2569 ? A 14.444 25.556 106.502 1 1 A MET 0.570 1 ATOM 31 C CG . MET 2569 2569 ? A 14.983 25.987 107.880 1 1 A MET 0.570 1 ATOM 32 S SD . MET 2569 2569 ? A 16.526 25.147 108.378 1 1 A MET 0.570 1 ATOM 33 C CE . MET 2569 2569 ? A 17.642 25.910 107.162 1 1 A MET 0.570 1 ATOM 34 N N . ALA 2570 2570 ? A 12.223 24.614 104.371 1 1 A ALA 0.670 1 ATOM 35 C CA . ALA 2570 2570 ? A 11.753 24.222 103.053 1 1 A ALA 0.670 1 ATOM 36 C C . ALA 2570 2570 ? A 10.636 25.124 102.554 1 1 A ALA 0.670 1 ATOM 37 O O . ALA 2570 2570 ? A 10.750 25.707 101.483 1 1 A ALA 0.670 1 ATOM 38 C CB . ALA 2570 2570 ? A 11.210 22.770 103.076 1 1 A ALA 0.670 1 ATOM 39 N N . LEU 2571 2571 ? A 9.580 25.338 103.372 1 1 A LEU 0.630 1 ATOM 40 C CA . LEU 2571 2571 ? A 8.472 26.220 103.052 1 1 A LEU 0.630 1 ATOM 41 C C . LEU 2571 2571 ? A 8.925 27.650 102.823 1 1 A LEU 0.630 1 ATOM 42 O O . LEU 2571 2571 ? A 8.601 28.238 101.804 1 1 A LEU 0.630 1 ATOM 43 C CB . LEU 2571 2571 ? A 7.402 26.225 104.176 1 1 A LEU 0.630 1 ATOM 44 C CG . LEU 2571 2571 ? A 6.516 24.963 104.269 1 1 A LEU 0.630 1 ATOM 45 C CD1 . LEU 2571 2571 ? A 5.650 25.030 105.541 1 1 A LEU 0.630 1 ATOM 46 C CD2 . LEU 2571 2571 ? A 5.617 24.796 103.028 1 1 A LEU 0.630 1 ATOM 47 N N . VAL 2572 2572 ? A 9.766 28.214 103.721 1 1 A VAL 0.680 1 ATOM 48 C CA . VAL 2572 2572 ? A 10.304 29.563 103.590 1 1 A VAL 0.680 1 ATOM 49 C C . VAL 2572 2572 ? A 11.060 29.780 102.292 1 1 A VAL 0.680 1 ATOM 50 O O . VAL 2572 2572 ? A 10.802 30.737 101.562 1 1 A VAL 0.680 1 ATOM 51 C CB . VAL 2572 2572 ? A 11.235 29.879 104.765 1 1 A VAL 0.680 1 ATOM 52 C CG1 . VAL 2572 2572 ? A 12.164 31.095 104.521 1 1 A VAL 0.680 1 ATOM 53 C CG2 . VAL 2572 2572 ? A 10.367 30.150 106.010 1 1 A VAL 0.680 1 ATOM 54 N N . ARG 2573 2573 ? A 11.992 28.867 101.934 1 1 A ARG 0.630 1 ATOM 55 C CA . 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A 8.830 29.333 97.009 1 1 A LEU 0.670 1 ATOM 69 C CB . LEU 2574 2574 ? A 9.104 26.490 98.552 1 1 A LEU 0.670 1 ATOM 70 C CG . LEU 2574 2574 ? A 9.793 25.115 98.494 1 1 A LEU 0.670 1 ATOM 71 C CD1 . LEU 2574 2574 ? A 8.714 24.033 98.664 1 1 A LEU 0.670 1 ATOM 72 C CD2 . LEU 2574 2574 ? A 10.604 24.904 97.207 1 1 A LEU 0.670 1 ATOM 73 N N . ILE 2575 2575 ? A 8.487 29.438 99.240 1 1 A ILE 0.660 1 ATOM 74 C CA . ILE 2575 2575 ? A 7.579 30.586 99.269 1 1 A ILE 0.660 1 ATOM 75 C C . ILE 2575 2575 ? A 8.264 31.827 98.718 1 1 A ILE 0.660 1 ATOM 76 O O . ILE 2575 2575 ? A 7.718 32.529 97.871 1 1 A ILE 0.660 1 ATOM 77 C CB . ILE 2575 2575 ? A 7.063 30.870 100.697 1 1 A ILE 0.660 1 ATOM 78 C CG1 . ILE 2575 2575 ? A 6.039 29.800 101.168 1 1 A ILE 0.660 1 ATOM 79 C CG2 . ILE 2575 2575 ? A 6.432 32.283 100.832 1 1 A ILE 0.660 1 ATOM 80 C CD1 . ILE 2575 2575 ? A 5.770 29.842 102.685 1 1 A ILE 0.660 1 ATOM 81 N N . HIS 2576 2576 ? A 9.516 32.081 99.161 1 1 A HIS 0.620 1 ATOM 82 C CA . HIS 2576 2576 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #