data_SMR-0ec977697f85f1aba3016f8e2b52840f_3 _entry.id SMR-0ec977697f85f1aba3016f8e2b52840f_3 _struct.entry_id SMR-0ec977697f85f1aba3016f8e2b52840f_3 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q6P3W6/ NBPFA_HUMAN, NBPF family member NBPF10 Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q6P3W6' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 504538.332 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP NBPFA_HUMAN Q6P3W6 1 ;MVVSAGPWSSEKAEMNILEINETLRPQLAEKKQQFRSLKEKCFLTQLAGFLANRQKKYKYEECKDLIKFM LRNERQFKEEKLAEQLKQAEELRQYKVLVHSQERELTQLREKLREGRDASRSLYEHLQALLTPDEPDKSQ GQDLQEQLAEGCRLAQHLVQKLSPENDEDEDEDVQVEEAEKVLESSAPREVQKAEESKVPEDSLEECAIT CSNSHGPCDSNQPHKNIKITFEEDEVNSTLVVDRESSHDECQDALNILPVPGPTSSATNVSMVVSAGPLS SEKAEMNILEINEKLRPQLAEKKQQFRNLKEKCFLTQLSGFLANQQKKYKYEECKDLIKFMLRNERQFKE EKLAEQLKQAEELRQYKVLVHAQERELTQLKEKLREGRDASRSLNEHLQALLTPYEPDKSQGQDLQEQLA EGCRLAQHLVQKLSPENDNDDDEDVQVEVAEKVQKSSAPREMQKAEEKEVPEDSLEECAITYSNSHGSYD SNQPHRKTKITFEEDKVDSTLIGSSSHVEWEDAVHIIPENESDDEEEEEKGPVSPRNLQESEEEEVPQES WDEGYSTLSIPPEMLASYQSYSSTFHSLEEQQVCMAVDIGRHRWDQVKKEDQEATGPRLSRELLDEKGPE VLQDSQDRCYSTPSGCLELTDSCQPYRSAFYILEQQRVGLAIDMDEIEKYQEVEEDQDPSCPRLSRELLD EKEPEVLQDSLDRCYSTPSGYLELPDLGQPYSSAVYSLEEQYLGLALDVDRIKKDQEEEEDQGPPCPRLS RELLEVVEPEVLQDSLDRCYSTPSSCLEQPDSCQPYGSSFYALEEKHVGFSLDVGEIEKKGKGKKRRGRR SKKERRRGRKEGEEDQNPPCPRLSRELLDEKGPEVLQDSLDRCYSTPSGCLELTDSCQPYRSAFYVLEQQ RVGFAFDMDEIEKYQEVEEDQDPSCPRLSRELLDEKEPEVLQDSLDRCYSTPSGYLELPDLGQPYSSAVY SLEEQYLGLALDVDRIKKDEEEEEDQDPPCPRLSRELLEVVEPEVLQDSLDRCYSTPSSCLEQPDSCQPY GSSFYALEENHVGFSLDVGEIEKKGKGKKRRGRRSKKERRRGRKEGEEDQNPPCPRLSRELLEEKGPEVL QDSLDRCYSTPSGCLELTDSCQPYRSAFYVLEQQRVGFAVDMDEIEKYQEVEEDQDPSCPRLSRELLDEK EPEVLQDSLDRCYSTPSGYLELPDLGQPYSSAVYSLEEQYLGLALDVDRIKKDEEEEEDQDPPCPRLSRE LLEVVEPEVLQDSLDRCYSTPSSCLEQPDSCQPYGSSFYALEEKHVGFSLDVGEIEKKGKGKKRRGRRSK KERRRGRKEGEEDQNPPCPRLSRELLEEKGPEVLQDSLDRCYSTPSGCLELTDSCQPYRSAFYVLEQQRV GFAVDMDEIEKYQEVEEDQDPSCPRLSRELLDEKEPEVLQDSLDRCYSTPSGYLELPDLGQPYSSAVYSL EEQYLGLALDVDRIKKDEEEEEDQDPPCPRLSRELLEVVEPEVLQDSLDRCYSTPSSCLEQPDSCQPYGS SFYALEEKHVGFSLDVGEIEKKGKGKKRRGRRSKKERRRGRKEGEEDQNPPCPRLSRELLDEKGPEVLQD SLDRCYSTPSGCLELTDSCQPYRSAFYVLEQQHVGLAVDMDEIEKYQEVEEDQDPSCPRLSRELLDEKEP EVLQDSLDRCYSTPSGYLELPDLGQPYSSAVYSLEEQYLGLALDVDRIKKDQEEEEDQGPPCPRLSRELL EVVEPEVLQDSLDRCYSTPSSCLEQPDSCQPYGSSFYALEEKHVGFSLDVGEIEKKGKGKKRRGRRSKKE RRRGRKEGEEDQNPPCPRLSRELLDEKGPEVLQDSLDRCYSTPSGCLELTDSCQPYRSAFYVLEQQHVGL AVDMDEIEKYQEVEEDQDPSCPRLSRELLDEKEPEVLQDSLDRCYSTPSGYLELPDLGQPYSSAVYSLEE QYLGLALDVDRIKKDQEEEEDQGPPCPRLSRELLEVVEPEVLQDSLDRCYSTPSSCLEQPDSCQPYGSSF YALEEKHVGFSLDVGEIEKKGKGKKRRGRRSKKERRRGRKEGEEDQNPPCPRLSRELLDEKGPEVLQDSL DRCYSTPSGCLELTDSCQPYRSAFYVLEQQHVGLAVDMDEIEKYQEVEEDQDPSCPRLSRELLDEKEPEV LQDSLDRCYSTPSGYLELPDLGQPYSSAVYSLEEQYLGLALDVDRIKKDQEEEEDQGPPCPRLSRELLEV VEPEVLQDSLDRCYSTPSSCLEQPDSCQPYGSSFYALEEKHVGFSLDVGEIEKKGKGKKRRGRRSKKERR RGRKEGEEDQNPPCPRLSRELLDEKGPEVLQDSLDRCYSTPSGCLELTDSCQPYRSAFYVLEQQHVGLAV DMDEIEKYQEVEEDQDPSCPRLSRELLDEKEPEVLQDSLDRCYSTPSGYLELPDLGQPYSSAVYSLEEQY LGLALDVDRIKKDQEEEEDQDPPCPRLSRELLEVVEPEVLQDSLDRCYSTPSSCLEQPDSCQPYGSSFYA LEEKHVGFSLDVGEIEKKGKGKKRRGRRSKKERRRGRKEGEEDQNPPCPRLSRELLDEKGPEVLQDSLDR CYSTPSGCLELTDSCQPYRSAFYVLEQQHVGLAVDMDEIEKYQEVEEDQDPSCPRLSRELLDEKEPEVLQ DSLDRCYSTPSGYLELPDLGQPYSSAVYSLEEQYLGLALDVDRIKKDQEEEEDQGPPCPRLSRELLEVVE PEVLQDSLDRCYSTPSSCLEQPDSCQPYGSSFYALEEKHVGFSLDVGEIEKKGKGKKRRGRRSKKERRRG RKEGEEDQNPPCPRLSRELLDEKGPEVLQDSLDRCYSTPSGCLELTDSCQPYRSAFYVLEQQHVGLAVDM DEIEKYQEVEEDQDPSCPRLSRELLDEKEPEVLQDSLDRCYSTPSGYLELPDLGQPYSSAVYSLEEQYLG LALDVDRIKKDQEEEEDQGPPCPRLSRELLEVVEPEVLQDSLDRCYSTPSSCLEQPDSCQPYGSSFYALE EKHVGFSLDVGEIEKKGKGKKRRGRRSKKERRRGRKEGEEDQNPPCPRLSRELLDEKGPEVLQDSLDRCY STPSGCLELTDSCQPYRSAFYVLEQQHVGLAVDMDEIEKYQEVEEDQDPSCPRLSRELLDEKEPEVLQDS LDRCYSTPSGYLELPDLGQPYSSAVYSLEEQYLGLALDVDRIKKDEEEEEDQDPPCPRLSRELLEVVEPE VLQDSLDRCYSTPSSCLEQPDSCQPYGSSFYALEEKHVGFSLDVGEIEKKGKGKKRRGRRSKKERRRGRK EGEEDQNPPCPRLSRELLDEKGPEVLQDSLDRCYSTPSGYLELTDSCQPYRSAFYVLEQQHVGLAVDMDE IEKYQEVEEDQDPSCPRLSRELLDEKEPEVLQDSLDRCYSTPSGYLELPDLGQPYSSAVYSLEEQYLGLA LDVDRIKKDQEEEEDQGPPCPRLSRELLEVVEPEVLQDSLDRCYSTPSSCLEQPDSCQPYGSSFYALEEK HVGFSLDVGEIEKKGKGKKRRGRRSKKERRRGRKEGEEDQNPPCPRLSRELLDEKGPEVLQDSLDRCYST PSGCLELCDSCQPYRSAFYVLEQQRVGLAVDMDEIEKYQEVEEDQDPSCPRLSRELLDEKEPEVLQDSLD RCYSTPSGYLELPDLGQPYSSAVYSLEEQYLGLALDVDKIEKKGKGKKRRGRRSKKERRRGRKEGEEDQN PPCPRLNGVLMEVEEREVLQDSLDRCYSTPSMYFELPDSFQHYRSVFYSFEEQHISFALYVDNRFFTLTV TSLHLVFQMGVIFPQ ; 'NBPF family member NBPF10' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 3795 1 3795 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . 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A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'NF-kB ESSENTIAL MODULATOR,NF-kappa-B essential modulator,NF-kB ESSENTIAL MODULATOR {PDB ID=6mi3, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=6mi3.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 6mi3, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 3' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-04 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-29 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GSWSVKELEDKNEELLSEIAHLKNEVARLKKLLQRCLAANQELRDAIRQSNQILRERAEELLHFQASQRE EKEFLMSKFQEARKLVERLGLEKLELEDKNEELLSEIAHLKNEVARLKKLVGER ; ;GSWSVKELEDKNEELLSEIAHLKNEVARLKKLLQRCLAANQELRDAIRQSNQILRERAEELLHFQASQRE EKEFLMSKFQEARKLVERLGLEKLELEDKNEELLSEIAHLKNEVARLKKLVGER ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 35 93 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 6mi3 2023-10-11 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 3795 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 3795 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 340.000 20.339 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MVVSAGPWSSEKAEMNILEINETLRPQLAEKKQQFRSLKEKCFLTQLAGFLANRQKKYKYEECKDLIKFMLRNERQFKEEKLAEQLKQAEELRQYKVLVHSQERELTQLREKLREGRDASRSLYEHLQALLTPDEPDKSQGQDLQEQLAEGCRLAQHLVQKLSPENDEDEDEDVQVEEAEKVLESSAPREVQKAEESKVPEDSLEECAITCSNSHGPCDSNQPHKNIKITFEEDEVNSTLVVDRESSHDECQDALNILPVPGPTSSATNVSMVVSAGPLSSEKAEMNILEINEKLRPQLAEKKQQFRNLKEKCFLTQLSGFLANQQKKYKYEECKDLIKFMLRNERQFKEEKLAEQLKQAEELRQYKVLVHAQERELTQLKEKLREGRDASRSLNEHLQALLTPYEPDKSQGQDLQEQLAEGCRLAQHLVQKLSPENDNDDDEDVQVEVAEKVQKSSAPREMQKAEEKEVPEDSLEECAITYSNSHGSYDSNQPHRKTKITFEEDKVDSTLIGSSSHVEWEDAVHIIPENESDDEEEEEKGPVSPRNLQESEEEEVPQESWDEGYSTLSIPPEMLASYQSYSSTFHSLEEQQVCMAVDIGRHRWDQVKKEDQEATGPRLSRELLDEKGPEVLQDSQDRCYSTPSGCLELTDSCQPYRSAFYILEQQRVGLAIDMDEIEKYQEVEEDQDPSCPRLSRELLDEKEPEVLQDSLDRCYSTPSGYLELPDLGQPYSSAVYSLEEQYLGLALDVDRIKKDQEEEEDQGPPCPRLSRELLEVVEPEVLQDSLDRCYSTPSSCLEQPDSCQPYGSSFYALEEKHVGFSLDVGEIEKKGKGKKRRGRRSKKERRRGRKEGEEDQNPPCPRLSRELLDEKGPEVLQDSLDRCYSTPSGCLELTDSCQPYRSAFYVLEQQRVGFAFDMDEIEKYQEVEEDQDPSCPRLSRELLDEKEPEVLQDSLDRCYSTPSGYLELPDLGQPYSSAVYSLEEQYLGLALDVDRIKKDEEEEEDQDPPCPRLSRELLEVVEPEVLQDSLDRCYSTPSSCLEQPDSCQPYGSSFYALEENHVGFSLDVGEIEKKGKGKKRRGRRSKKERRRGRKEGEEDQNPPCPRLSRELLEEKGPEVLQDSLDRCYSTPSGCLELTDSCQPYRSAFYVLEQQRVGFAVDMDEIEKYQEVEEDQDPSCPRLSRELLDEKEPEVLQDSLDRCYSTPSGYLELPDLGQPYSSAVYSLEEQYLGLALDVDRIKKDEEEEEDQDPPCPRLSRELLEVVEPEVLQDSLDRCYSTPSSCLEQPDSCQPYGSSFYALEEKHVGFSLDVGEIEKKGKGKKRRGRRSKKERRRGRKEGEEDQNPPCPRLSRELLEEKGPEVLQDSLDRCYSTPSGCLELTDSCQPYRSAFYVLEQQRVGFAVDMDEIEKYQEVEEDQDPSCPRLSRELLDEKEPEVLQDSLDRCYSTPSGYLELPDLGQPYSSAVYSLEEQYLGLALDVDRIKKDEEEEEDQDPPCPRLSRELLEVVEPEVLQDSLDRCYSTPSSCLEQPDSCQPYGSSFYALEEKHVGFSLDVGEIEKKGKGKKRRGRRSKKERRRGRKEGEEDQNPPCPRLSRELLDEKGPEVLQDSLDRCYSTPSGCLELTDSCQPYRSAFYVLEQQHVGLAVDMDEIEKYQEVEEDQDPSCPRLSRELLDEKEPEVLQDSLDRCYSTPSGYLELPDLGQPYSSAVYSLEEQYLGLALDVDRIKKDQEEEEDQGPPCPRLSRELLEVVEPEVLQDSLDRCYSTPSSCLEQPDSCQPYGSSFYALEEKHVGFSLDVGEIEKKGKGKKRRGRRSKKERRRGRKEGEEDQNPPCPRLSRELLDEKGPEVLQDSLDRCYSTPSGCLELTDSCQPYRSAFYVLEQQHVGLAVDMDEIEKYQEVEEDQDPSCPRLSRELLDEKEPEVLQDSLDRCYSTPSGYLELPDLGQPYSSAVYSLEEQYLGLALDVDRIKKDQEEEEDQGPPCPRLSRELLEVVEPEVLQDSLDRCYSTPSSCLEQPDSCQPYGSSFYALEEKHVGFSLDVGEIEKKGKGKKRRGRRSKKERRRGRKEGEEDQNPPCPRLSRELLDEKGPEVLQDSLDRCYSTPSGCLELTDSCQPYRSAFYVLEQQHVGLAVDMDEIEKYQEVEEDQDPSCPRLSRELLDEKEPEVLQDSLDRCYSTPSGYLELPDLGQPYSSAVYSLEEQYLGLALDVDRIKKDQEEEEDQGPPCPRLSRELLEVVEPEVLQDSLDRCYSTPSSCLEQPDSCQPYGSSFYALEEKHVGFSLDVGEIEKKGKGKKRRGRRSKKERRRGRKEGEEDQNPPCPRLSRELLDEKGPEVLQDSLDRCYSTPSGCLELTDSCQPYRSAFYVLEQQHVGLAVDMDEIEKYQEVEEDQDPSCPRLSRELLDEKEPEVLQDSLDRCYSTPSGYLELPDLGQPYSSAVYSLEEQYLGLALDVDRIKKDQEEEEDQDPPCPRLSRELLEVVEPEVLQDSLDRCYSTPSSCLEQPDSCQPYGSSFYALEEKHVGFSLDVGEIEKKGKGKKRRGRRSKKERRRGRKEGEEDQNPPCPRLSRELLDEKGPEVLQDSLDRCYSTPSGCLELTDSCQPYRSAFYVLEQQHVGLAVDMDEIEKYQEVEEDQDPSCPRLSRELLDEKEPEVLQDSLDRCYSTPSGYLELPDLGQPYSSAVYSLEEQYLGLALDVDRIKKDQEEEEDQGPPCPRLSRELLEVVEPEVLQDSLDRCYSTPSSCLEQPDSCQPYGSSFYALEEKHVGFSLDVGEIEKKGKGKKRRGRRSKKERRRGRKEGEEDQNPPCPRLSRELLDEKGPEVLQDSLDRCYSTPSGCLELTDSCQPYRSAFYVLEQQHVGLAVDMDEIEKYQEVEEDQDPSCPRLSRELLDEKEPEVLQDSLDRCYSTPSGYLELPDLGQPYSSAVYSLEEQYLGLALDVDRIKKDQEEEEDQGPPCPRLSRELLEVVEPEVLQDSLDRCYSTPSSCLEQPDSCQPYGSSFYALEEKHVGFSLDVGEIEKKGKGKKRRGRRSKKERRRGRKEGEEDQNPPCPRLSRELLDEKGPEVLQDSLDRCYSTPSGCLELTDSCQPYRSAFYVLEQQHVGLAVDMDEIEKYQEVEEDQDPSCPRLSRELLDEKEPEVLQDSLDRCYSTPSGYLELPDLGQPYSSAVYSLEEQYLGLALDVDRIKKDEEEEEDQDPPCPRLSRELLEVVEPEVLQDSLDRCYSTPSSCLEQPDSCQPYGSSFYALEEKHVGFSLDVGEIEKKGKGKKRRGRRSKKERRRGRKEGEEDQNPPCPRLSRELLDEKGPEVLQDSLDRCYSTPSGYLELTDSCQPYRSAFYVLEQQHVGLAVDMDEIEKYQEVEEDQDPSCPRLSRELLDEKEPEVLQDSLDRCYSTPSGYLELPDLGQPYSSAVYSLEEQYLGLALDVDRIKKDQEEEEDQGPPCPRLSRELLEVVEPEVLQDSLDRCYSTPSSCLEQPDSCQPYGSSFYALEEKHVGFSLDVGEIEKKGKGKKRRGRRSKKERRRGRKEGEEDQNPPCPRLSRELLDEKGPEVLQDSLDRCYSTPSGCLELCDSCQPYRSAFYVLEQQRVGLAVDMDEIEKYQEVEEDQDPSCPRLSRELLDEKEPEVLQDSLDRCYSTPSGYLELPDLGQPYSSAVYSLEEQYLGLALDVDKIEKKGKGKKRRGRRSKKERRRGRKEGEEDQNPPCPRLNGVLMEVEEREVLQDSLDRCYSTPSMYFELPDSFQHYRSVFYSFEEQHISFALYVDNRFFTLTVTSLHLVFQMGVIFPQ 2 1 2 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------RCLAANQELRDAIRQSNQILRERAEELLHFQASQREEKEFLMSKFQEARKLVERLGLEK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.195}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 6mi3.1, oligomeric state (monomer) as predicted' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 3' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . ASN 287 287 ? A -12.987 23.465 49.203 1 1 A ASN 0.360 1 ATOM 2 C CA . ASN 287 287 ? A -12.201 23.200 50.477 1 1 A ASN 0.360 1 ATOM 3 C C . ASN 287 287 ? A -10.969 22.335 50.287 1 1 A ASN 0.360 1 ATOM 4 O O . ASN 287 287 ? A -9.849 22.768 50.525 1 1 A ASN 0.360 1 ATOM 5 C CB . ASN 287 287 ? A -13.079 22.582 51.614 1 1 A ASN 0.360 1 ATOM 6 C CG . ASN 287 287 ? A -14.250 23.520 51.889 1 1 A ASN 0.360 1 ATOM 7 O OD1 . ASN 287 287 ? A -14.250 24.617 51.331 1 1 A ASN 0.360 1 ATOM 8 N ND2 . ASN 287 287 ? A -15.278 23.091 52.648 1 1 A ASN 0.360 1 ATOM 9 N N . ILE 288 288 ? A -11.147 21.079 49.828 1 1 A ILE 0.430 1 ATOM 10 C CA . ILE 288 288 ? A -10.086 20.088 49.664 1 1 A ILE 0.430 1 ATOM 11 C C . ILE 288 288 ? A -9.000 20.523 48.689 1 1 A ILE 0.430 1 ATOM 12 O O . ILE 288 288 ? A -7.814 20.372 48.965 1 1 A ILE 0.430 1 ATOM 13 C CB . ILE 288 288 ? A -10.715 18.752 49.291 1 1 A ILE 0.430 1 ATOM 14 C CG1 . ILE 288 288 ? A -11.662 18.305 50.435 1 1 A ILE 0.430 1 ATOM 15 C CG2 . ILE 288 288 ? A -9.627 17.690 49.019 1 1 A ILE 0.430 1 ATOM 16 C CD1 . ILE 288 288 ? A -12.555 17.113 50.078 1 1 A ILE 0.430 1 ATOM 17 N N . LEU 289 289 ? A -9.377 21.148 47.548 1 1 A LEU 0.700 1 ATOM 18 C CA . LEU 289 289 ? A -8.423 21.729 46.615 1 1 A LEU 0.700 1 ATOM 19 C C . LEU 289 289 ? A -7.499 22.750 47.282 1 1 A LEU 0.700 1 ATOM 20 O O . LEU 289 289 ? A -6.280 22.614 47.222 1 1 A LEU 0.700 1 ATOM 21 C CB . LEU 289 289 ? A -9.163 22.357 45.403 1 1 A LEU 0.700 1 ATOM 22 C CG . LEU 289 289 ? A -9.783 21.327 44.435 1 1 A LEU 0.700 1 ATOM 23 C CD1 . LEU 289 289 ? A -10.735 22.018 43.447 1 1 A LEU 0.700 1 ATOM 24 C CD2 . LEU 289 289 ? A -8.689 20.573 43.663 1 1 A LEU 0.700 1 ATOM 25 N N . GLU 290 290 ? A -8.074 23.707 48.034 1 1 A GLU 0.730 1 ATOM 26 C CA . GLU 290 290 ? A -7.358 24.720 48.783 1 1 A GLU 0.730 1 ATOM 27 C C . GLU 290 290 ? A -6.468 24.167 49.885 1 1 A GLU 0.730 1 ATOM 28 O O . GLU 290 290 ? A -5.353 24.633 50.088 1 1 A GLU 0.730 1 ATOM 29 C CB . GLU 290 290 ? A -8.353 25.712 49.400 1 1 A GLU 0.730 1 ATOM 30 C CG . GLU 290 290 ? A -9.158 26.519 48.360 1 1 A GLU 0.730 1 ATOM 31 C CD . GLU 290 290 ? A -10.191 27.413 49.046 1 1 A GLU 0.730 1 ATOM 32 O OE1 . GLU 290 290 ? A -10.347 27.292 50.291 1 1 A GLU 0.730 1 ATOM 33 O OE2 . GLU 290 290 ? A -10.877 28.167 48.316 1 1 A GLU 0.730 1 ATOM 34 N N . ILE 291 291 ? A -6.919 23.134 50.633 1 1 A ILE 0.750 1 ATOM 35 C CA . ILE 291 291 ? A -6.081 22.410 51.593 1 1 A ILE 0.750 1 ATOM 36 C C . ILE 291 291 ? A -4.878 21.771 50.905 1 1 A ILE 0.750 1 ATOM 37 O O . ILE 291 291 ? A -3.735 21.971 51.317 1 1 A ILE 0.750 1 ATOM 38 C CB . ILE 291 291 ? A -6.884 21.361 52.373 1 1 A ILE 0.750 1 ATOM 39 C CG1 . ILE 291 291 ? A -7.911 22.053 53.300 1 1 A ILE 0.750 1 ATOM 40 C CG2 . ILE 291 291 ? A -5.961 20.430 53.197 1 1 A ILE 0.750 1 ATOM 41 C CD1 . ILE 291 291 ? A -8.965 21.097 53.873 1 1 A ILE 0.750 1 ATOM 42 N N . ASN 292 292 ? A -5.092 21.071 49.770 1 1 A ASN 0.810 1 ATOM 43 C CA . ASN 292 292 ? A -4.026 20.484 48.967 1 1 A ASN 0.810 1 ATOM 44 C C . ASN 292 292 ? A -3.034 21.529 48.446 1 1 A ASN 0.810 1 ATOM 45 O O . ASN 292 292 ? A -1.827 21.291 48.347 1 1 A ASN 0.810 1 ATOM 46 C CB . ASN 292 292 ? A -4.579 19.695 47.756 1 1 A ASN 0.810 1 ATOM 47 C CG . ASN 292 292 ? A -5.380 18.468 48.183 1 1 A ASN 0.810 1 ATOM 48 O OD1 . ASN 292 292 ? A -5.251 17.941 49.285 1 1 A ASN 0.810 1 ATOM 49 N ND2 . ASN 292 292 ? A -6.205 17.943 47.242 1 1 A ASN 0.810 1 ATOM 50 N N . GLU 293 293 ? A -3.540 22.725 48.098 1 1 A GLU 0.790 1 ATOM 51 C CA . GLU 293 293 ? A -2.760 23.869 47.649 1 1 A GLU 0.790 1 ATOM 52 C C . GLU 293 293 ? A -2.233 24.720 48.802 1 1 A GLU 0.790 1 ATOM 53 O O . GLU 293 293 ? A -1.576 25.739 48.597 1 1 A GLU 0.790 1 ATOM 54 C CB . GLU 293 293 ? A -3.574 24.846 46.791 1 1 A GLU 0.790 1 ATOM 55 C CG . GLU 293 293 ? A -4.080 24.333 45.432 1 1 A GLU 0.790 1 ATOM 56 C CD . GLU 293 293 ? A -4.885 25.435 44.733 1 1 A GLU 0.790 1 ATOM 57 O OE1 . GLU 293 293 ? 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'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.749 2 1 3 0 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 287 ASN 1 0.360 2 1 A 288 ILE 1 0.430 3 1 A 289 LEU 1 0.700 4 1 A 290 GLU 1 0.730 5 1 A 291 ILE 1 0.750 6 1 A 292 ASN 1 0.810 7 1 A 293 GLU 1 0.790 8 1 A 294 LYS 1 0.820 9 1 A 295 LEU 1 0.820 10 1 A 296 ARG 1 0.760 11 1 A 297 PRO 1 0.820 12 1 A 298 GLN 1 0.840 13 1 A 299 LEU 1 0.810 14 1 A 300 ALA 1 0.860 15 1 A 301 GLU 1 0.800 16 1 A 302 LYS 1 0.820 17 1 A 303 LYS 1 0.810 18 1 A 304 GLN 1 0.820 19 1 A 305 GLN 1 0.820 20 1 A 306 PHE 1 0.750 21 1 A 307 ARG 1 0.750 22 1 A 308 ASN 1 0.820 23 1 A 309 LEU 1 0.800 24 1 A 310 LYS 1 0.810 25 1 A 311 GLU 1 0.790 26 1 A 312 LYS 1 0.800 27 1 A 313 CYS 1 0.810 28 1 A 314 PHE 1 0.730 29 1 A 315 LEU 1 0.750 30 1 A 316 THR 1 0.750 31 1 A 317 GLN 1 0.750 32 1 A 318 LEU 1 0.730 33 1 A 319 SER 1 0.750 34 1 A 320 GLY 1 0.770 35 1 A 321 PHE 1 0.700 36 1 A 322 LEU 1 0.750 37 1 A 323 ALA 1 0.800 38 1 A 324 ASN 1 0.770 39 1 A 325 GLN 1 0.780 40 1 A 326 GLN 1 0.780 41 1 A 327 LYS 1 0.760 42 1 A 328 LYS 1 0.760 43 1 A 329 TYR 1 0.720 44 1 A 330 LYS 1 0.750 45 1 A 331 TYR 1 0.720 46 1 A 332 GLU 1 0.740 47 1 A 333 GLU 1 0.740 48 1 A 334 CYS 1 0.790 49 1 A 335 LYS 1 0.790 50 1 A 336 ASP 1 0.800 51 1 A 337 LEU 1 0.780 52 1 A 338 ILE 1 0.790 53 1 A 339 LYS 1 0.800 54 1 A 340 PHE 1 0.730 55 1 A 341 MET 1 0.740 56 1 A 342 LEU 1 0.740 57 1 A 343 ARG 1 0.670 58 1 A 344 ASN 1 0.460 59 1 A 345 GLU 1 0.420 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #