data_SMR-51c13cd7cfdf0e47f3e8d95d215c528e_8 _entry.id SMR-51c13cd7cfdf0e47f3e8d95d215c528e_8 _struct.entry_id SMR-51c13cd7cfdf0e47f3e8d95d215c528e_8 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q99996 (isoform 1)/ AKAP9_HUMAN, A-kinase anchor protein 9 Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q99996 (isoform 1)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 526804.820 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP AKAP9_HUMAN Q99996 1 ;MEDEERQKKLEAGKAKIEELSLAFLVRQLAQFRQRKAQSDGQSPSKKQKKKRKTSSSKHDVSAHHDLNID QSQCNEMYINSSQRVESTVIPESTIMRTLHSGEITSHEQGFSVELESEISTTADDCSSEVNGCSFVMRTG KPTNLLREEEFGVDDSYSEQGAQDSPTHLEMMESELAGKQHEIEELNRELEEMRVTYGTEGLQQLQEFEA AIKQRDGIITQLTANLQQARREKDETMREFLELTEQSQKLQIQFQQLQASETLRNSTHSSTAADLLQAKQ QILTHQQQLEEQDHLLEDYQKKKEDFTMQISFLQEKIKVYEMEQDKKVENSNKEEIQEKETIIEELNTKI IEEEKKTLELKDKLTTADKLLGELQEQIVQKNQEIKNMKLELTNSKQKERQSSEEIKQLMGTVEELQKRN HKDSQFETDIVQRMEQETQRKLEQLRAELDEMYGQQIVQMKQELIRQHMAQMEEMKTRHKGEMENALRSY SNITVNEDQIKLMNVAINELNIKLQDTNSQKEKLKEELGLILEEKCALQRQLEDLVEELSFSREQIQRAR QTIAEQESKLNEAHKSLSTVEDLKAEIVSASESRKELELKHEAEVTNYKIKLEMLEKEKNAVLDRMAESQ EAELERLRTQLLFSHEEELSKLKEDLEIEHRINIEKLKDNLGIHYKQQIDGLQNEMSQKIETMQFEKDNL ITKQNQLILEISKLKDLQQSLVNSKSEEMTLQINELQKEIEILRQEEKEKGTLEQEVQELQLKTELLEKQ MKEKENDLQEKFAQLEAENSILKDEKKTLEDMLKIHTPVSQEERLIFLDSIKSKSKDSVWEKEIEILIEE NEDLKQQCIQLNEEIEKQRNTFSFAEKNFEVNYQELQEEYACLLKVKDDLEDSKNKQELEYKSKLKALNE ELHLQRINPTTVKMKSSVFDEDKTFVAETLEMGEVVEKDTTELMEKLEVTKREKLELSQRLSDLSEQLKQ KHGEISFLNEEVKSLKQEKEQVSLRCRELEIIINHNRAENVQSCDTQVSSLLDGVVTMTSRGAEGSVSKV NKSFGEESKIMVEDKVSFENMTVGEESKQEQLILDHLPSVTKESSLRATQPSENDKLQKELNVLKSEQND LRLQMEAQRICLSLVYSTHVDQVREYMENEKDKALCSLKEELIFAQEEKIKELQKIHQLELQTMKTQETG DEGKPLHLLIGKLQKAVSEECSYFLQTLCSVLGEYYTPALKCEVNAEDKENSGDYISENEDPELQDYRYE VQDFQENMHTLLNKVTEEYNKLLVLQTRLSKIWGQQTDGMKLEFGEENLPKEETEFLSIHSQMTNLEDID VNHKSKLSSLQDLEKTKLEEQVQELESLISSLQQQLKETEQNYEAEIHCLQKRLQAVSESTVPPSLPVDS VVITESDAQRTMYPGSCVKKNIDGTIEFSGEFGVKEETNIVKLLEKQYQEQLEEEVAKVIVSMSIAFAQQ TELSRISGGKENTASSKQAHAVCQQEQHYFNEMKLSQDQIGFQTFETVDVKFKEEFKPLSKELGEHGKEI LLSNSDPHDIPESKDCVLTISEEMFSKDKTFIVRQSIHDEISVSSMDASRQLMLNEEQLEDMRQELVRQY QEHQQATELLRQAHMRQMERQREDQEQLQEEIKRLNRQLAQRSSIDNENLVSERERVLLEELEALKQLSL AGREKLCCELRNSSTQTQNGNENQGEVEEQTFKEKELDRKPEDVPPEILSNERYALQKANNRLLKILLEV VKTTAAVEETIGRHVLGILDRSSKSQSSASLIWRSEAEASVKSCVHEEHTRVTDESIPSYSGSDMPRNDI NMWSKVTEEGTELSQRLVRSGFAGTEIDPENEELMLNISSRLQAAVEKLLEAISETSSQLEHAKVTQTEL MRESFRQKQEATESLKCQEELRERLHEESRAREQLAVELSKAEGVIDGYADEKTLFERQIQEKTDIIDRL EQELLCASNRLQELEAEQQQIQEERELLSRQKEAMKAEAGPVEQQLLQETEKLMKEKLEVQCQAEKVRDD LQKQVKALEIDVEEQVSRFIELEQEKNTELMDLRQQNQALEKQLEKMRKFLDEQAIDREHERDVFQQEIQ KLEQQLKVVPRFQPISEHQTREVEQLANHLKEKTDKCSELLLSKEQLQRDIQERNEEIEKLEFRVRELEQ ALLVEDRKHFGAVEAKPELSLEVQLQAERDAIDRKEKEITNLEEQLEQFREELENKNEEVQQLHMQLEIQ KKESTTRLQELEQENKLFKDDMEKLGLAIKESDAMSTQDQHVLFGKFAQIIQEKEVEIDQLNEQVTKLQQ QLKITTDNKVIEEKNELIRDLETQIECLMSDQECVKRNREEEIEQLNEVIEKLQQELANIGQKTSMNAHS LSEEADSLKHQLDVVIAEKLALEQQVETANEEMTFMKNVLKETNFKMNQLTQELFSLKRERESVEKIQSI PENSVNVAIDHLSKDKPELEVVLTEDALKSLENQTYFKSFEENGKGSIINLETRLLQLESTVSAKDLELT QCYKQIKDMQEQGQFETEMLQKKIVNLQKIVEEKVAAALVSQIQLEAVQEYAKFCQDNQTISSEPERTNI QNLNQLREDELGSDISALTLRISELESQVVEMHTSLILEKEQVEIAEKNVLEKEKKLLELQKLLEGNEKK QREKEKKRSPQDVEVLKTTTELFHSNEESGFFNELEALRAESVATKAELASYKEKAEKLQEELLVKETNM TSLQKDLSQVRDHLAEAKEKLSILEKEDETEVQESKKACMFEPLPIKLSKSIASQTDGTLKISSSNQTPQ ILVKNAGIQINLQSECSSEEVTEIISQFTEKIEKMQELHAAEILDMESRHISETETLKREHYVAVQLLKE ECGTLKAVIQCLRSKEGSSIPELAHSDAYQTREICSSDSGSDWGQGIYLTHSQGFDIASEGRGEESESAT DSFPKKIKGLLRAVHNEGMQVLSLTESPYSDGEDHSIQQVSEPWLEERKAYINTISSLKDLITKMQLQRE AEVYDSSQSHESFSDWRGELLLALQQVFLEERSVLLAAFRTELTALGTTDAVGLLNCLEQRIQEQGVEYQ AAMECLQKADRRSLLSEIQALHAQMNGRKITLKREQESEKPSQELLEYNIQQKQSQMLEMQVELSSMKDR ATELQEQLSSEKMVVAELKSELAQTKLELETTLKAQHKHLKELEAFRLEVKDKTDEVHLLNDTLASEQKK SRELQWALEKEKAKLGRSEERDKEELEDLKFSLESQKQRNLQLNLLLEQQKQLLNESQQKIESQRMLYDA QLSEEQGRNLELQVLLESEKVRIREMSSTLDRERELHAQLQSSDGTGQSRPPLPSEDLLKELQKQLEEKH SRIVELLNETEKYKLDSLQTRQQMEKDRQVHRKTLQTEQEANTEGQKKMHELQSKVEDLQRQLEEKRQQV YKLDLEGQRLQGIMQEFQKQELEREEKRESRRILYQNLNEPTTWSLTSDRTRNWVLQQKIEGETKESNYA KLIEMNGGGTGCNHELEMIRQKLQCVASKLQVLPQKASERLQFETADDEDFIWVQENIDEIILQLQKLTG QQGEEPSLVSPSTSCGSLTERLLRQNAELTGHISQLTEEKNDLRNMVMKLEEQIRWYRQTGAGRDNSSRF SLNGGANIEAIIASEKEVWNREKLTLQKSLKRAEAEVYKLKAELRNDSLLQTLSPDSEHVTLKRIYGKYL RAESFRKALIYQKKYLLLLLGGFQECEDATLALLARMGGQPAFTDLEVITNRPKGFTRFRSAVRVSIAIS RMKFLVRRWHRVTGSVSININRDGFGLNQGAEKTDSFYHSSGGLELYGEPRHTTYRSRSDLDYIRSPLPF QNRYPGTPADFNPGSLACSQLQNYDPDRALTDYITRLEALQRRLGTIQSGALSLTTSWQHHSARPTAPLF FEILSHSLG ; 'A-kinase anchor protein 9' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 3929 1 3929 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . 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A 1 3804 GLY 3804 ? ? ? M . A 1 3805 PHE 3805 ? ? ? M . A 1 3806 GLY 3806 ? ? ? M . A 1 3807 LEU 3807 ? ? ? M . A 1 3808 ASN 3808 ? ? ? M . A 1 3809 GLN 3809 ? ? ? M . A 1 3810 GLY 3810 ? ? ? M . A 1 3811 ALA 3811 ? ? ? M . A 1 3812 GLU 3812 ? ? ? M . A 1 3813 LYS 3813 ? ? ? M . A 1 3814 THR 3814 ? ? ? M . A 1 3815 ASP 3815 ? ? ? M . A 1 3816 SER 3816 ? ? ? M . A 1 3817 PHE 3817 ? ? ? M . A 1 3818 TYR 3818 ? ? ? M . A 1 3819 HIS 3819 ? ? ? M . A 1 3820 SER 3820 ? ? ? M . A 1 3821 SER 3821 ? ? ? M . A 1 3822 GLY 3822 ? ? ? M . A 1 3823 GLY 3823 ? ? ? M . A 1 3824 LEU 3824 ? ? ? M . A 1 3825 GLU 3825 ? ? ? M . A 1 3826 LEU 3826 ? ? ? M . A 1 3827 TYR 3827 ? ? ? M . A 1 3828 GLY 3828 ? ? ? M . A 1 3829 GLU 3829 ? ? ? M . A 1 3830 PRO 3830 ? ? ? M . A 1 3831 ARG 3831 ? ? ? M . A 1 3832 HIS 3832 ? ? ? M . A 1 3833 THR 3833 ? ? ? M . A 1 3834 THR 3834 ? ? ? M . A 1 3835 TYR 3835 ? ? ? M . A 1 3836 ARG 3836 ? ? ? M . A 1 3837 SER 3837 ? ? ? M . A 1 3838 ARG 3838 ? ? ? M . 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M . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Tropomyosin alpha-1 chain {PDB ID=7nep, label_asym_id=M, auth_asym_id=Q, SMTL ID=7nep.1.M}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 7nep, label_asym_id=M' 'target-template alignment' . 4 'model 8' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-04 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-29 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A M 2 1 Q # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;LKLDKENALDRAEQAEADKKAAEDRSKQLEDELVSLQKKLKGTEDELDKYSEALKDAQEKLELAEKKATD AEADVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIESRAQKDEEKMEIQEIQLKE AKHIAEDADRKYEEVARKLVIIESDLERAEERAELSEGKCAELEEELKTVTNNLKSLEAQAEKYSQKEDK YEEEIKVLSDKLKEAETRAEFAERSVTKLEKSIDDLEDELY ; ;LKLDKENALDRAEQAEADKKAAEDRSKQLEDELVSLQKKLKGTEDELDKYSEALKDAQEKLELAEKKATD AEADVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIESRAQKDEEKMEIQEIQLKE AKHIAEDADRKYEEVARKLVIIESDLERAEERAELSEGKCAELEEELKTVTNNLKSLEAQAEKYSQKEDK YEEEIKVLSDKLKEAETRAEFAERSVTKLEKSIDDLEDELY ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 57 178 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 7nep 2024-05-01 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 3929 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 3929 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 3.500 18.033 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MEDEERQKKLEAGKAKIEELSLAFLVRQLAQFRQRKAQSDGQSPSKKQKKKRKTSSSKHDVSAHHDLNIDQSQCNEMYINSSQRVESTVIPESTIMRTLHSGEITSHEQGFSVELESEISTTADDCSSEVNGCSFVMRTGKPTNLLREEEFGVDDSYSEQGAQDSPTHLEMMESELAGKQHEIEELNRELEEMRVTYGTEGLQQLQEFEAAIKQRDGIITQLTANLQQARREKDETMREFLELTEQSQKLQIQFQQLQASETLRNSTHSSTAADLLQAKQQILTHQQQLEEQDHLLEDYQKKKEDFTMQISFLQEKIKVYEMEQDKKVENSNKEEIQEKETIIEELNTKIIEEEKKTLELKDKLTTADKLLGELQEQIVQKNQEIKNMKLELTNSKQKERQSSEEIKQLMGTVEELQKRNHKDSQFETDIVQRMEQETQRKLEQLRAELDEMYGQQIVQMKQELIRQHMAQMEEMKTRHKGEMENALRSYSNITVNEDQIKLMNVAINELNIKLQDTNSQKEKLKEELGLILEEKCALQRQLEDLVEELSFSREQIQRARQTIAEQESKLNEAHKSLSTVEDLKAEIVSASESRKELELKHEAEVTNYKIKLEMLEKEKNAVLDRMAESQEAELERLRTQLLFSHEEELSKLKEDLEIEHRINIEKLKDNLGIHYKQQIDGLQNEMSQKIETMQFEKDNLITKQNQLILEISKLKDLQQSLVNSKSEEMTLQINELQKEIEILRQEEKEKGTLEQEVQELQLKTELLEKQMKEKENDLQEKFAQLEAENSILKDEKKTLEDMLKIHTPVSQEERLIFLDSIKSKSKDSVWEKEIEILIEENEDLKQQCIQLNEEIEKQRNTFSFAEKNFEVNYQELQEEYACLLKVKDDLEDSKNKQELEYKSKLKALNEELHLQRINPTTVKMKSSVFDEDKTFVAETLEMGEVVEKDTTELMEKLEVTKREKLELSQRLSDLSEQLKQKHGEISFLNEEVKSLKQEKEQVSLRCRELEIIINHNRAENVQSCDTQVSSLLDGVVTMTSRGAEGSVSKVNKSFGEESKIMVEDKVSFENMTVGEESKQEQLILDHLPSVTKESSLRATQPSENDKLQKELNVLKSEQNDLRLQMEAQRICLSLVYSTHVDQVREYMENEKDKALCSLKEELIFAQEEKIKELQKIHQLELQTMKTQETGDEGKPLHLLIGKLQKAVSEECSYFLQTLCSVLGEYYTPALKCEVNAEDKENSGDYISENEDPELQDYRYEVQDFQENMHTLLNKVTEEYNKLLVLQTRLSKIWGQQTDGMKLEFGEENLPKEETEFLSIHSQMTNLEDIDVNHKSKLSSLQDLEKTKLEEQVQELESLISSLQQQLKETEQNYEAEIHCLQKRLQAVSESTVPPSLPVDSVVITESDAQRTMYPGSCVKKNIDGTIEFSGEFGVKEETNIVKLLEKQYQEQLEEEVAKVIVSMSIAFAQQTELSRISGGKENTASSKQAHAVCQQEQHYFNEMKLSQDQIGFQTFETVDVKFKEEFKPLSKELGEHGKEILLSNSDPHDIPESKDCVLTISEEMFSKDKTFIVRQSIHDEISVSSMDASRQLMLNEEQLEDMRQELVRQYQEHQQATELLRQAHMRQMERQREDQEQLQEEIKRLNRQLAQRSSIDNENLVSERERVLLEELEALKQLSLAGREKLCCELRNSSTQTQNGNENQGEVEEQTFKEKELDRKPEDVPPEILSNERYALQKANNRLLKILLEVVKTTAAVEETIGRHVLGILDRSSKSQSSASLIWRSEAEASVKSCVHEEHTRVTDESIPSYSGSDMPRNDINMWSKVTEEGTELSQRLVRSGFAGTEIDPENEELMLNISSRLQAAVEKLLEAISETSSQLEHAKVTQTELMRESFRQKQEATESLKCQEELRERLHEESRAREQLAVELSKAEGVIDGYADEKTLFERQIQEKTDIIDRLEQELLCASNRLQELEAEQQQIQEERELLSRQKEAMKAEAGPVEQQLLQETEKLMKEKLEVQCQAEKVRDDLQKQVKALEIDVEEQVSRFIELEQEKNTELMDLRQQNQALEKQLEKMRKFLDEQAIDREHERDVFQQEIQKLEQQLKVVPRFQPISEHQTREVEQLANHLKEKTDKCSELLLSKEQLQRDIQERNEEIEKLEFRVRELEQALLVEDRKHFGAVEAKPELSLEVQLQAERDAIDRKEKEITNLEEQLEQFREELENKNEEVQQLHMQLEIQKKESTTRLQELEQENKLFKDDMEKLGLAIKESDAMSTQDQHVLFGKFAQIIQEKEVEIDQLNEQVTKLQQQLKITTDNKVIEEKNELIRDLETQIECLMSDQECVKRNREEEIEQLNEVIEKLQQELANIGQKTSMNAHSLSEEADSLKHQLDVVIAEKLALEQQVETANEEMTFMKNVLKETNFKMNQLTQELFSLKRERESVEKIQSIPENSVNVAIDHLSKDKPELEVVLTEDALKSLENQTYFKSFEENGKGSIINLETRLLQLESTVSAKDLELTQCYKQIKDMQEQGQFETEMLQKKIVNLQKIVEEKVAAALVSQIQLEAVQEYAKFCQDNQTISSEPERTNIQNLNQLREDELGSDISALTLRISELESQVVEMHTSLILEKEQVEIAEKNVLEKEKKLLELQKLLEGNEKKQREKEKKRSPQDVEVLKTTTELFHSNEESGFFNELEALRAESVATKAELASYKEKAEKLQEELLVKETNMTSLQKDLSQVRDHLAEAKEKLSILEKEDETEVQESKKACMFEPLPIKLSKSIASQTDGTLKISSSNQTPQILVKNAGIQINLQSECSSEEVTEIISQFTEKIEKMQELHAAEILDMESRHISETETLKREHYVAVQLLKEECGTLKAVIQCLRSKEGSSIPELAHSDAYQTREICSSDSGSDWGQGIYLTHSQGFDIASEGRGEESESATDSFPKKIKGLLRAVHNEGMQVLSLTESPYSDGEDHSIQQVSEPWLEERKAYINTISSLKDLITKMQLQREAEVYDSSQSHESFSDWRGELLLALQQVFLEERSVLLAAFRTELTALGTTDAVGLLNCLEQRIQEQGVEYQAAMECLQKADRRSLLSEIQALHAQMNGRKITLKREQESEKPSQELLEYNIQQKQSQMLEMQVELSSMKDRATELQEQLSSEKMVVAELKSELAQTKLELETTLKAQHKHLKELEAFRLEVKDKTDEVHLLNDTLASEQKKSRELQWALEKEKAKLGRSEERDKEELEDLKFSLESQKQRNLQLNLLLEQQKQLLNESQQKIESQRMLYDAQLSEEQGRNLELQVLLESEKVRIREMSSTLDRERELHAQLQSSDGTGQSRPPLPSEDLLKELQKQLEEKHSRIVELLNETEKYKLDSLQTRQQMEKDRQVHRKTLQTEQEANTEGQKKMHELQSKVEDLQRQLEEKRQQVYKLDLEGQRLQGIMQEFQKQELEREEKRESRRILYQNLNEPTTWSLTSDRTRNWVLQQKIEGETKESNYAKLIEMNGGGTGCNHELEMIRQKLQCVASKLQVLPQKASERLQFETADDEDFIWVQENIDEIILQLQKLTGQQGEEPSLVSPSTSCGSLTERLLRQNAELTGHISQLTEEKNDLRNMVMKLEEQIRWYRQTGAGRDNSSRFSLNGGANIEAIIASEKEVWNREKLTLQKSLKRAEAEVYKLKAELRNDSLLQTLSPDSEHVTLKRIYGKYLRAESFRKALIYQKKYLLLLLGGFQECEDATLALLARMGGQPAFTDLEVITNRPKGFTRFRSAVRVSIAISRMKFLVRRWHRVTGSVSININRDGFGLNQGAEKTDSFYHSSGGLELYGEPRHTTYRSRSDLDYIRSPLPFQNRYPGTPADFNPGSLACSQLQNYDPDRALTDYITRLEALQRRLGTIQSGALSLTTSWQHHSARPTAPLFFEILSHSLG 2 1 2 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AQEKLELAEKKATDAEADVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIESRAQKDEEK-MEIQEIQLKEAKHIAEDADRKYEEVARKLVIIESDLERAEERAELSEG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.168}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 7nep.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 8' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . ALA 1932 1932 ? A 159.981 204.589 279.291 1 1 M ALA 0.440 1 ATOM 2 C CA . ALA 1932 1932 ? A 159.381 205.688 278.476 1 1 M ALA 0.440 1 ATOM 3 C C . ALA 1932 1932 ? A 160.368 206.814 278.239 1 1 M ALA 0.440 1 ATOM 4 O O . ALA 1932 1932 ? A 160.660 207.076 277.105 1 1 M ALA 0.440 1 ATOM 5 C CB . ALA 1932 1932 ? A 158.042 206.156 279.071 1 1 M ALA 0.440 1 ATOM 6 N N . GLU 1933 1933 ? A 160.991 207.437 279.266 1 1 M GLU 0.410 1 ATOM 7 C CA . GLU 1933 1933 ? A 162.005 208.458 279.055 1 1 M GLU 0.410 1 ATOM 8 C C . GLU 1933 1933 ? A 163.205 208.036 278.221 1 1 M GLU 0.410 1 ATOM 9 O O . GLU 1933 1933 ? A 163.567 208.716 277.279 1 1 M GLU 0.410 1 ATOM 10 C CB . GLU 1933 1933 ? A 162.479 208.916 280.430 1 1 M GLU 0.410 1 ATOM 11 C CG . GLU 1933 1933 ? A 161.371 209.646 281.221 1 1 M GLU 0.410 1 ATOM 12 C CD . GLU 1933 1933 ? A 161.822 209.938 282.648 1 1 M GLU 0.410 1 ATOM 13 O OE1 . GLU 1933 1933 ? A 162.879 209.397 283.058 1 1 M GLU 0.410 1 ATOM 14 O OE2 . GLU 1933 1933 ? A 161.063 210.655 283.343 1 1 M GLU 0.410 1 ATOM 15 N N . GLY 1934 1934 ? A 163.796 206.843 278.457 1 1 M GLY 0.370 1 ATOM 16 C CA . GLY 1934 1934 ? A 164.879 206.371 277.584 1 1 M GLY 0.370 1 ATOM 17 C C . GLY 1934 1934 ? A 164.484 206.006 276.163 1 1 M GLY 0.370 1 ATOM 18 O O . GLY 1934 1934 ? A 165.236 206.195 275.218 1 1 M GLY 0.370 1 ATOM 19 N N . VAL 1935 1935 ? A 163.241 205.503 275.985 1 1 M VAL 0.350 1 ATOM 20 C CA . VAL 1935 1935 ? A 162.560 205.421 274.697 1 1 M VAL 0.350 1 ATOM 21 C C . VAL 1935 1935 ? A 162.361 206.803 274.103 1 1 M VAL 0.350 1 ATOM 22 O O . VAL 1935 1935 ? A 162.635 206.976 272.940 1 1 M VAL 0.350 1 ATOM 23 C CB . VAL 1935 1935 ? A 161.234 204.651 274.749 1 1 M VAL 0.350 1 ATOM 24 C CG1 . VAL 1935 1935 ? A 160.499 204.660 273.386 1 1 M VAL 0.350 1 ATOM 25 C CG2 . VAL 1935 1935 ? A 161.512 203.187 275.147 1 1 M VAL 0.350 1 ATOM 26 N N . ILE 1936 1936 ? A 161.943 207.839 274.866 1 1 M ILE 0.350 1 ATOM 27 C CA . ILE 1936 1936 ? A 161.863 209.219 274.403 1 1 M ILE 0.350 1 ATOM 28 C C . ILE 1936 1936 ? A 163.206 209.763 273.996 1 1 M ILE 0.350 1 ATOM 29 O O . ILE 1936 1936 ? A 163.289 210.324 272.918 1 1 M ILE 0.350 1 ATOM 30 C CB . ILE 1936 1936 ? A 161.221 210.167 275.418 1 1 M ILE 0.350 1 ATOM 31 C CG1 . ILE 1936 1936 ? A 159.696 209.939 275.490 1 1 M ILE 0.350 1 ATOM 32 C CG2 . ILE 1936 1936 ? A 161.532 211.660 275.118 1 1 M ILE 0.350 1 ATOM 33 C CD1 . ILE 1936 1936 ? A 159.068 210.562 276.742 1 1 M ILE 0.350 1 ATOM 34 N N . ASP 1937 1937 ? A 164.292 209.571 274.773 1 1 M ASP 0.410 1 ATOM 35 C CA . ASP 1937 1937 ? A 165.627 209.965 274.366 1 1 M ASP 0.410 1 ATOM 36 C C . ASP 1937 1937 ? A 166.021 209.255 273.080 1 1 M ASP 0.410 1 ATOM 37 O O . ASP 1937 1937 ? A 166.424 209.883 272.120 1 1 M ASP 0.410 1 ATOM 38 C CB . ASP 1937 1937 ? A 166.668 209.706 275.486 1 1 M ASP 0.410 1 ATOM 39 C CG . ASP 1937 1937 ? A 166.468 210.641 276.669 1 1 M ASP 0.410 1 ATOM 40 O OD1 . ASP 1937 1937 ? A 165.745 211.659 276.523 1 1 M ASP 0.410 1 ATOM 41 O OD2 . ASP 1937 1937 ? A 167.061 210.338 277.737 1 1 M ASP 0.410 1 ATOM 42 N N . GLY 1938 1938 ? A 165.773 207.933 272.979 1 1 M GLY 0.460 1 ATOM 43 C CA . GLY 1938 1938 ? A 165.988 207.176 271.753 1 1 M GLY 0.460 1 ATOM 44 C C . GLY 1938 1938 ? A 165.087 207.487 270.572 1 1 M GLY 0.460 1 ATOM 45 O O . GLY 1938 1938 ? A 165.517 207.364 269.438 1 1 M GLY 0.460 1 ATOM 46 N N . TYR 1939 1939 ? A 163.820 207.885 270.793 1 1 M TYR 0.410 1 ATOM 47 C CA . TYR 1939 1939 ? A 162.833 208.309 269.815 1 1 M TYR 0.410 1 ATOM 48 C C . TYR 1939 1939 ? A 163.107 209.729 269.381 1 1 M TYR 0.410 1 ATOM 49 O O . TYR 1939 1939 ? A 162.946 210.082 268.223 1 1 M TYR 0.410 1 ATOM 50 C CB . TYR 1939 1939 ? A 161.384 208.187 270.375 1 1 M TYR 0.410 1 ATOM 51 C CG . TYR 1939 1939 ? A 160.328 208.469 269.336 1 1 M TYR 0.410 1 ATOM 52 C CD1 . TYR 1939 1939 ? A 159.639 209.693 269.316 1 1 M TYR 0.410 1 ATOM 53 C CD2 . TYR 1939 1939 ? A 160.039 207.522 268.345 1 1 M TYR 0.410 1 ATOM 54 C CE1 . TYR 1939 1939 ? A 158.674 209.953 268.333 1 1 M TYR 0.410 1 ATOM 55 C CE2 . TYR 1939 1939 ? A 159.070 207.780 267.365 1 1 M TYR 0.410 1 ATOM 56 C CZ . TYR 1939 1939 ? A 158.383 208.996 267.361 1 1 M TYR 0.410 1 ATOM 57 O OH . TYR 1939 1939 ? A 157.407 209.269 266.384 1 1 M TYR 0.410 1 ATOM 58 N N . ALA 1940 1940 ? A 163.541 210.596 270.306 1 1 M ALA 0.510 1 ATOM 59 C CA . ALA 1940 1940 ? A 164.088 211.895 270.031 1 1 M ALA 0.510 1 ATOM 60 C C . ALA 1940 1940 ? A 165.406 211.810 269.282 1 1 M ALA 0.510 1 ATOM 61 O O . ALA 1940 1940 ? A 165.570 212.518 268.304 1 1 M ALA 0.510 1 ATOM 62 C CB . ALA 1940 1940 ? A 164.258 212.700 271.329 1 1 M ALA 0.510 1 ATOM 63 N N . ASP 1941 1941 ? A 166.336 210.907 269.656 1 1 M ASP 0.490 1 ATOM 64 C CA . ASP 1941 1941 ? A 167.514 210.551 268.889 1 1 M ASP 0.490 1 ATOM 65 C C . ASP 1941 1941 ? A 167.162 209.959 267.546 1 1 M ASP 0.490 1 ATOM 66 O O . ASP 1941 1941 ? A 167.720 210.372 266.542 1 1 M ASP 0.490 1 ATOM 67 C CB . ASP 1941 1941 ? A 168.431 209.543 269.627 1 1 M ASP 0.490 1 ATOM 68 C CG . ASP 1941 1941 ? A 169.365 210.217 270.620 1 1 M ASP 0.490 1 ATOM 69 O OD1 . ASP 1941 1941 ? A 169.533 211.461 270.539 1 1 M ASP 0.490 1 ATOM 70 O OD2 . ASP 1941 1941 ? A 169.990 209.458 271.404 1 1 M ASP 0.490 1 ATOM 71 N N . GLU 1942 1942 ? A 166.190 209.033 267.448 1 1 M GLU 0.490 1 ATOM 72 C CA . GLU 1942 1942 ? A 165.680 208.542 266.184 1 1 M GLU 0.490 1 ATOM 73 C C . GLU 1942 1942 ? A 165.074 209.654 265.366 1 1 M GLU 0.490 1 ATOM 74 O O . GLU 1942 1942 ? A 165.391 209.779 264.202 1 1 M GLU 0.490 1 ATOM 75 C CB . GLU 1942 1942 ? A 164.673 207.384 266.335 1 1 M GLU 0.490 1 ATOM 76 C CG . GLU 1942 1942 ? A 164.198 206.790 264.983 1 1 M GLU 0.490 1 ATOM 77 C CD . GLU 1942 1942 ? A 163.247 205.603 265.134 1 1 M GLU 0.490 1 ATOM 78 O OE1 . GLU 1942 1942 ? A 162.925 205.219 266.287 1 1 M GLU 0.490 1 ATOM 79 O OE2 . GLU 1942 1942 ? 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A 166.738 212.444 248.920 1 1 M ILE 0.550 1 ATOM 210 N N . ASP 1958 1958 ? A 168.367 217.014 246.580 1 1 M ASP 0.610 1 ATOM 211 C CA . ASP 1958 1958 ? A 168.651 218.257 245.901 1 1 M ASP 0.610 1 ATOM 212 C C . ASP 1958 1958 ? A 169.943 218.156 245.092 1 1 M ASP 0.610 1 ATOM 213 O O . ASP 1958 1958 ? A 170.004 218.562 243.938 1 1 M ASP 0.610 1 ATOM 214 C CB . ASP 1958 1958 ? A 168.765 219.438 246.903 1 1 M ASP 0.610 1 ATOM 215 C CG . ASP 1958 1958 ? A 167.441 219.840 247.548 1 1 M ASP 0.610 1 ATOM 216 O OD1 . ASP 1958 1958 ? A 166.380 219.292 247.175 1 1 M ASP 0.610 1 ATOM 217 O OD2 . ASP 1958 1958 ? A 167.496 220.752 248.416 1 1 M ASP 0.610 1 ATOM 218 N N . ARG 1959 1959 ? A 171.013 217.533 245.630 1 1 M ARG 0.550 1 ATOM 219 C CA . ARG 1959 1959 ? A 172.229 217.269 244.880 1 1 M ARG 0.550 1 ATOM 220 C C . ARG 1959 1959 ? A 172.047 216.385 243.651 1 1 M ARG 0.550 1 ATOM 221 O O . ARG 1959 1959 ? A 172.574 216.706 242.587 1 1 M ARG 0.550 1 ATOM 222 C CB . ARG 1959 1959 ? 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'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.537 2 1 3 0 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 1932 ALA 1 0.440 2 1 A 1933 GLU 1 0.410 3 1 A 1934 GLY 1 0.370 4 1 A 1935 VAL 1 0.350 5 1 A 1936 ILE 1 0.350 6 1 A 1937 ASP 1 0.410 7 1 A 1938 GLY 1 0.460 8 1 A 1939 TYR 1 0.410 9 1 A 1940 ALA 1 0.510 10 1 A 1941 ASP 1 0.490 11 1 A 1942 GLU 1 0.490 12 1 A 1943 LYS 1 0.530 13 1 A 1944 THR 1 0.520 14 1 A 1945 LEU 1 0.500 15 1 A 1946 PHE 1 0.500 16 1 A 1947 GLU 1 0.560 17 1 A 1948 ARG 1 0.530 18 1 A 1949 GLN 1 0.570 19 1 A 1950 ILE 1 0.540 20 1 A 1951 GLN 1 0.600 21 1 A 1952 GLU 1 0.590 22 1 A 1953 LYS 1 0.610 23 1 A 1954 THR 1 0.590 24 1 A 1955 ASP 1 0.630 25 1 A 1956 ILE 1 0.560 26 1 A 1957 ILE 1 0.550 27 1 A 1958 ASP 1 0.610 28 1 A 1959 ARG 1 0.550 29 1 A 1960 LEU 1 0.540 30 1 A 1961 GLU 1 0.560 31 1 A 1962 GLN 1 0.580 32 1 A 1963 GLU 1 0.550 33 1 A 1964 LEU 1 0.500 34 1 A 1965 LEU 1 0.500 35 1 A 1966 CYS 1 0.550 36 1 A 1967 ALA 1 0.590 37 1 A 1968 SER 1 0.540 38 1 A 1969 ASN 1 0.570 39 1 A 1970 ARG 1 0.510 40 1 A 1971 LEU 1 0.520 41 1 A 1972 GLN 1 0.570 42 1 A 1973 GLU 1 0.570 43 1 A 1974 LEU 1 0.540 44 1 A 1975 GLU 1 0.580 45 1 A 1976 ALA 1 0.660 46 1 A 1977 GLU 1 0.580 47 1 A 1978 GLN 1 0.590 48 1 A 1979 GLN 1 0.600 49 1 A 1980 GLN 1 0.590 50 1 A 1981 ILE 1 0.540 51 1 A 1982 GLN 1 0.580 52 1 A 1983 GLU 1 0.560 53 1 A 1984 GLU 1 0.550 54 1 A 1985 ARG 1 0.520 55 1 A 1986 GLU 1 0.550 56 1 A 1987 LEU 1 0.530 57 1 A 1988 LEU 1 0.520 58 1 A 1989 SER 1 0.570 59 1 A 1990 ARG 1 0.500 60 1 A 1991 GLN 1 0.520 61 1 A 1992 LYS 1 0.540 62 1 A 1993 GLU 1 0.500 63 1 A 1994 ALA 1 0.540 64 1 A 1995 MET 1 0.430 65 1 A 1996 LYS 1 0.450 66 1 A 1997 ALA 1 0.470 67 1 A 1998 GLU 1 0.450 68 1 A 1999 ALA 1 0.510 69 1 A 2000 GLY 1 0.500 70 1 A 2001 PRO 1 0.450 71 1 A 2002 VAL 1 0.490 72 1 A 2003 GLU 1 0.500 73 1 A 2004 GLN 1 0.480 74 1 A 2005 GLN 1 0.440 75 1 A 2006 LEU 1 0.440 76 1 A 2007 LEU 1 0.510 77 1 A 2008 GLN 1 0.560 78 1 A 2009 GLU 1 0.560 79 1 A 2010 THR 1 0.530 80 1 A 2011 GLU 1 0.570 81 1 A 2012 LYS 1 0.600 82 1 A 2013 LEU 1 0.540 83 1 A 2014 MET 1 0.540 84 1 A 2015 LYS 1 0.590 85 1 A 2016 GLU 1 0.570 86 1 A 2017 LYS 1 0.590 87 1 A 2018 LEU 1 0.550 88 1 A 2019 GLU 1 0.580 89 1 A 2020 VAL 1 0.600 90 1 A 2021 GLN 1 0.590 91 1 A 2022 CYS 1 0.610 92 1 A 2023 GLN 1 0.580 93 1 A 2024 ALA 1 0.640 94 1 A 2025 GLU 1 0.580 95 1 A 2026 LYS 1 0.620 96 1 A 2027 VAL 1 0.610 97 1 A 2028 ARG 1 0.550 98 1 A 2029 ASP 1 0.610 99 1 A 2030 ASP 1 0.600 100 1 A 2031 LEU 1 0.570 101 1 A 2032 GLN 1 0.600 102 1 A 2033 LYS 1 0.630 103 1 A 2034 GLN 1 0.610 104 1 A 2035 VAL 1 0.620 105 1 A 2036 LYS 1 0.600 106 1 A 2037 ALA 1 0.670 107 1 A 2038 LEU 1 0.550 108 1 A 2039 GLU 1 0.570 109 1 A 2040 ILE 1 0.540 110 1 A 2041 ASP 1 0.570 111 1 A 2042 VAL 1 0.600 112 1 A 2043 GLU 1 0.560 113 1 A 2044 GLU 1 0.570 114 1 A 2045 GLN 1 0.560 115 1 A 2046 VAL 1 0.540 116 1 A 2047 SER 1 0.550 117 1 A 2048 ARG 1 0.470 118 1 A 2049 PHE 1 0.440 119 1 A 2050 ILE 1 0.430 120 1 A 2051 GLU 1 0.450 121 1 A 2052 LEU 1 0.390 122 1 A 2053 GLU 1 0.440 123 1 A 2054 GLN 1 0.430 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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