data_SMR-3c5e96958b4067d06294566fd6936be6_1 _entry.id SMR-3c5e96958b4067d06294566fd6936be6_1 _struct.entry_id SMR-3c5e96958b4067d06294566fd6936be6_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q03164 (isoform 2)/ KMT2A_HUMAN, Histone-lysine N-methyltransferase 2A Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q03164 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' ZN non-polymer 'ZINC ION' Zn 65.380 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 504214.214 1 . 2 non-polymer man 'ZINC ION' 65.380 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP KMT2A_HUMAN Q03164 1 ;MAHSCRWRFPARPGTTGGGGGGGRRGLGGAPRQRVPALLLPPGPPVGGGGPGAPPSPPAVAAAAAAAGSS GAGVPGGAAAASAASSSSASSSSSSSSSASSGPALLRVGPGFDAALQVSAAIGTNLRRFRAVFGESGGGG GSGEDEQFLGFGSDEEVRVRSPTRSPSVKTSPRKPRGRPRSGSDRNSAILSDPSVFSPLNKSETKSGDKI KKKDSKSIEKKRGRPPTFPGVKIKITHGKDISELPKGNKEDSLKKIKRTPSATFQQATKIKKLRAGKLSP LKSKFKTGKLQIGRKGVQIVRRRGRPPSTERIKTPSGLLINSELEKPQKVRKDKEGTPPLTKEDKTVVRQ SPRRIKPVRIIPSSKRTDATIAKQLLQRAKKGAQKKIEKEAAQLQGRKVKTQVKNIRQFIMPVVSAISSR IIKTPRRFIEDEDYDPPIKIARLESTPNSRFSAPSCGSSEKSSAASQHSSQMSSDSSRSSSPSVDTSTDS QASEEIQVLPEERSDTPEVHPPLPISQSPENESNDRRSRRYSVSERSFGSRTTKKLSTLQSAPQQQTSSS PPPPLLTPPPPLQPASSISDHTPWLMPPTIPLASPFLPASTAPMQGKRKSILREPTFRWTSLKHSRSEPQ YFSSAKYAKEGLIRKPIFDNFRPPPLTPEDVGFASGFSASGTAASARLFSPLHSGTRFDMHKRSPLLRAP RFTPSEAHSRIFESVTLPSNRTSAGTSSSGVSNRKRKRKVFSPIRSEPRSPSHSMRTRSGRLSSSELSPL TPPSSVSSSLSISVSPLATSALNPTFTFPSHSLTQSGESAEKNQRPRKQTSAPAEPFSSSSPTPLFPWFT PGSQTERGRNKDKAPEELSKDRDADKSVEKDKSRERDREREKENKRESRKEKRKKGSEIQSSSALYPVGR VSKEKVVGEDVATSSSAKKATGRKKSSSHDSGTDITSVTLGDTTAVKTKILIKKGRGNLEKTNLDLGPTA PSLEKEKTLCLSTPSSSTVKHSTSSIGSMLAQADKLPMTDKRVASLLKKAKAQLCKIEKSKSLKQTDQPK AQGQESDSSETSVRGPRIKHVCRRAAVALGRKRAVFPDDMPTLSALPWEEREKILSSMGNDDKSSIAGSE DAEPLAPPIKPIKPVTRNKAPQEPPVKKGRRSRRCGQCPGCQVPEDCGVCTNCLDKPKFGGRNIKKQCCK MRKCQNLQWMPSKAYLQKQAKAVKKKEKKSKTSEKKDSKESSVVKNVVDSSQKPTPSAREDPAPKKSSSE PPPRKPVEEKSEEGNVSAPGPESKQATTPASRKSSKQVSQPALVIPPQPPTTGPPRKEVPKTTPSEPKKK QPPPPESGPEQSKQKKVAPRPSIPVKQKPKEKEKPPPVNKQENAGTLNILSTLSNGNSSKQKIPADGVHR IRVDFKEDCEAENVWEMGGLGILTSVPITPRVVCFLCASSGHVEFVYCQVCCEPFHKFCLEENERPLEDQ LENWCCRRCKFCHVCGRQHQATKQLLECNKCRNSYHPECLGPNYPTKPTKKKKVWICTKCVRCKSCGSTT PGKGWDAQWSHDFSLCHDCAKLFAKGNFCPLCDKCYDDDDYESKMMQCGKCDRWVHSKCENLSGTEDEMY EILSNLPESVAYTCVNCTERHPAEWRLALEKELQISLKQVLTALLNSRTTSHLLRYRQAAKPPDLNPETE ESIPSRSSPEGPDPPVLTEVSKQDDQQPLDLEGVKRKMDQGNYTSVLEFSDDIVKIIQAAINSDGGQPEI KKANSMVKSFFIRQMERVFPWFSVKKSRFWEPNKVSSNSGMLPNAVLPPSLDHNYAQWQEREENSHTEQP PLMKKIIPAPKPKGPGEPDSPTPLHPPTPPILSTDRSREDSPELNPPPGIEDNRQCALCLTYGDDSANDA GRLLYIGQNEWTHVNCALWSAEVFEDDDGSLKNVHMAVIRGKQLRCEFCQKPGATVGCCLTSCTSNYHFM CSRAKNCVFLDDKKVYCQRHRDLIKGEVVPENGFEVFRRVFVDFEGISLRRKFLNGLEPENIHMMIGSMT IDCLGILNDLSDCEDKLFPIGYQCSRVYWSTTDARKRCVYTCKIVECRPPVVEPDINSTVEHDENRTIAH SPTSFTESSSKESQNTAEIISPPSPDRPPHSQTSGSCYYHVISKVPRIRTPSYSPTQRSPGCRPLPSAGS PTPTTHEIVTVGDPLLSSGLRSIGSRRHSTSSLSPQRSKLRIMSPMRTGNTYSRNNVSSVSTTGTATDLE SSAKVVDHVLGPLNSSTSLGQNTSTSSNLQRTVVTVGNKNSHLDGSSSSEMKQSSASDLVSKSSSLKGEK TKVLSSKSSEGSAHNVAYPGIPKLAPQVHNTTSRELNVSKIGSFAEPSSVSFSSKEALSFPHLHLRGQRN DRDQHTDSTQSANSSPDEDTEVKTLKLSGMSNRSSIINEHMGSSSRDRRQKGKKSCKETFKEKHSSKSFL EPGQVTTGEEGNLKPEFMDEVLTPEYMGQRPCNNVSSDKIGDKGLSMPGVPKAPPMQVEGSAKELQAPRK RTVKVTLTPLKMENESQSKNALKESSPASPLQIESTSPTEPISASENPGDGPVAQPSPNNTSCQDSQSNN YQNLPVQDRNLMLPDGPKPQEDGSFKRRYPRRSARARSNMFFGLTPLYGVRSYGEEDIPFYSSSTGKKRG KRSAEGQVDGADDLSTSDEDDLYYYNFTRTVISSGGEERLASHNLFREEEQCDLPKISQLDGVDDGTESD TSVTATTRKSSQIPKRNGKENGTENLKIDRPEDAGEKEHVTKSSVGHKNEPKMDNCHSVSRVKTQGQDSL EAQLSSLESSRRVHTSTPSDKNLLDTYNTELLKSDSDNNNSDDCGNILPSDIMDFVLKNTPSMQALGESP ESSSSELLNLGEGLGLDSNREKDMGLFEVFSQQLPTTEPVDSSVSSSISAEEQFELPLELPSDLSVLTTR SPTVPSQNPSRLAVISDSGEKRVTITEKSVASSESDPALLSPGVDPTPEGHMTPDHFIQGHMDADHISSP PCGSVEQGHGNNQDLTRNSSTPGLQVPVSPTVPIQNQKYVPNSTDSPGPSQISNAAVQTTPPHLKPATEK LIVVNQNMQPLYVLQTLPNGVTQKIQLTSSVSSTPSVMETNTSVLGPMGGGLTLTTGLNPSLPTSQSLFP SASKGLLPMSHHQHLHSFPAATQSSFPPNISNPPSGLLIGVQPPPDPQLLVSESSQRTDLSTTVATPSSG LKKRPISRLQTRKNKKLAPSSTPSNIAPSDVVSNMTLINFTPSQLPNHPSLLDLGSLNTSSHRTVPNIIK RSKSSIMYFEPAPLLPQSVGGTAATAAGTSTISQDTSHLTSGSVSGLASSSSVLNVVSMQTTTTPTSSAS VPGHVTLTNPRLLGTPDIGSISNLLIKASQQSLGIQDQPVALPPSSGMFPQLGTSQTPSTAAITAASSIC VLPSTQTTGITAASPSGEADEHYQLQHVNQLLASKTGIHSSQRDLDSASGPQVSNFTQTVDAPNSMGLEQ NKALSSAVQASPTSPGGSPSSPSSGQRSASPSVPGPTKPKPKTKRFQLPLDKGNGKKHKVSHLRTSSSEA HIPDQETTSLTSGTGTPGAEAEQQDTASVEQSSQKECGQPAGQVAVLPEVQVTQNPANEQESAEPKTVEE EESNFSSPLMLWLQQEQKRKESITEKKPKKGLVFEISSDDGFQICAESIEDAWKSLTDKVQEARSNARLK QLSFAGVNGLRMLGILHDAVVFLIEQLSGAKHCRNYKFRFHKPEEANEPPLNPHGSARAEVHLRKSAFDM FNFLASKHRQPPEYNPNDEEEEEVQLKSARRATSMDLPMPMRFRHLKKTSKEAVGVYRSPIHGRGLFCKR NIDAGEMVIEYAGNVIRSIQTDKREKYYDSKGIGCYMFRIDDSEVVDATMHGNAARFINHSCEPNCYSRV INIDGQKHIVIFAMRKIYRGEELTYDYKFPIEDASNKLPCNCGAKKCRKFLN ; 'Histone-lysine N-methyltransferase 2A' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 3972 1 3972 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . 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A 1 3905 ALA 3905 3905 ALA ALA A . A 1 3906 ARG 3906 3906 ARG ARG A . A 1 3907 PHE 3907 3907 PHE PHE A . A 1 3908 ILE 3908 3908 ILE ILE A . A 1 3909 ASN 3909 3909 ASN ASN A . A 1 3910 HIS 3910 3910 HIS HIS A . A 1 3911 SER 3911 3911 SER SER A . A 1 3912 CYS 3912 3912 CYS CYS A . A 1 3913 GLU 3913 3913 GLU GLU A . A 1 3914 PRO 3914 3914 PRO PRO A . A 1 3915 ASN 3915 3915 ASN ASN A . A 1 3916 CYS 3916 3916 CYS CYS A . A 1 3917 TYR 3917 3917 TYR TYR A . A 1 3918 SER 3918 3918 SER SER A . A 1 3919 ARG 3919 3919 ARG ARG A . A 1 3920 VAL 3920 3920 VAL VAL A . A 1 3921 ILE 3921 3921 ILE ILE A . A 1 3922 ASN 3922 3922 ASN ASN A . A 1 3923 ILE 3923 3923 ILE ILE A . A 1 3924 ASP 3924 3924 ASP ASP A . A 1 3925 GLY 3925 3925 GLY GLY A . A 1 3926 GLN 3926 3926 GLN GLN A . A 1 3927 LYS 3927 3927 LYS LYS A . A 1 3928 HIS 3928 3928 HIS HIS A . A 1 3929 ILE 3929 3929 ILE ILE A . A 1 3930 VAL 3930 3930 VAL VAL A . A 1 3931 ILE 3931 3931 ILE ILE A . A 1 3932 PHE 3932 3932 PHE PHE A . A 1 3933 ALA 3933 3933 ALA ALA A . A 1 3934 MET 3934 3934 MET MET A . A 1 3935 ARG 3935 3935 ARG ARG A . A 1 3936 LYS 3936 3936 LYS LYS A . A 1 3937 ILE 3937 3937 ILE ILE A . A 1 3938 TYR 3938 3938 TYR TYR A . A 1 3939 ARG 3939 3939 ARG ARG A . A 1 3940 GLY 3940 3940 GLY GLY A . A 1 3941 GLU 3941 3941 GLU GLU A . A 1 3942 GLU 3942 3942 GLU GLU A . A 1 3943 LEU 3943 3943 LEU LEU A . A 1 3944 THR 3944 3944 THR THR A . A 1 3945 TYR 3945 3945 TYR TYR A . A 1 3946 ASP 3946 3946 ASP ASP A . A 1 3947 TYR 3947 3947 TYR TYR A . A 1 3948 LYS 3948 3948 LYS LYS A . A 1 3949 PHE 3949 3949 PHE PHE A . A 1 3950 PRO 3950 3950 PRO PRO A . A 1 3951 ILE 3951 3951 ILE ILE A . A 1 3952 GLU 3952 3952 GLU GLU A . A 1 3953 ASP 3953 3953 ASP ASP A . A 1 3954 ALA 3954 3954 ALA ALA A . A 1 3955 SER 3955 3955 SER SER A . A 1 3956 ASN 3956 3956 ASN ASN A . A 1 3957 LYS 3957 3957 LYS LYS A . A 1 3958 LEU 3958 3958 LEU LEU A . A 1 3959 PRO 3959 3959 PRO PRO A . A 1 3960 CYS 3960 3960 CYS CYS A . A 1 3961 ASN 3961 3961 ASN ASN A . A 1 3962 CYS 3962 3962 CYS CYS A . A 1 3963 GLY 3963 3963 GLY GLY A . A 1 3964 ALA 3964 3964 ALA ALA A . A 1 3965 LYS 3965 3965 LYS LYS A . A 1 3966 LYS 3966 3966 LYS LYS A . A 1 3967 CYS 3967 3967 CYS CYS A . A 1 3968 ARG 3968 3968 ARG ARG A . A 1 3969 LYS 3969 3969 LYS LYS A . A 1 3970 PHE 3970 3970 PHE PHE A . A 1 3971 LEU 3971 3971 LEU LEU A . A 1 3972 ASN 3972 ? ? ? A . # # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 ZN 1 3 3 ZN '_' . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Histone-lysine N-methyltransferase SETD2 {PDB ID=5jle, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=5jle.1.A}' 'template structure' . 2 'ZINC ION {PDB ID=5jle, label_asym_id=D, auth_asym_id=A, SMTL ID=5jle.1._.3}' 'template structure' . 3 . target . 4 'ZINC ION' target . 5 'Target-template alignment by HHblits to 5jle, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 6 'model 1' 'model coordinates' . 7 SMTL 'reference database' . 8 PDB 'reference database' . 9 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 3 2 1 7 3 1 8 4 2 9 5 3 3 6 3 4 7 3 1 8 3 2 9 3 5 10 4 1 11 4 2 12 4 5 13 4 4 14 5 6 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 7 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-04 8 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-29 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 3 'reference database' 2 4 . # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . B 2 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A 2 2 'reference database' non-polymer 1 2 B D 2 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;SGETSVPPGSALVGPSCVMDDFRDPQRWKECAKQGKMPCYFDLIEENVYLTERKKNKSHRDIKRMQCECT PLSKDERAQGEIACGEDCLNRLLMIECSSRCPNGDYCSNRRFQRKQHADVEVILTEKKGWGLRAAKDLPS NTFVLEYCGEVLDHKEFKARVKEYARNKNIHYYFMALKNDEIIDATQKGNCSRFMNHSCEPNCETQKWTV NGQLRVGFFTTKLVPSGSELTFDYQFQRYGKEAQKCFCGSANCRGYLGGENRVSIRAAGGKMKKERSRK ; ;SGETSVPPGSALVGPSCVMDDFRDPQRWKECAKQGKMPCYFDLIEENVYLTERKKNKSHRDIKRMQCECT PLSKDERAQGEIACGEDCLNRLLMIECSSRCPNGDYCSNRRFQRKQHADVEVILTEKKGWGLRAAKDLPS NTFVLEYCGEVLDHKEFKARVKEYARNKNIHYYFMALKNDEIIDATQKGNCSRFMNHSCEPNCETQKWTV NGQLRVGFFTTKLVPSGSELTFDYQFQRYGKEAQKCFCGSANCRGYLGGENRVSIRAAGGKMKKERSRK ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 105 258 # # loop_ _ma_template_non_poly.template_id _ma_template_non_poly.comp_id _ma_template_non_poly.details 2 ZN 'ZINC ION' # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 5jle 2023-11-08 2 PDB . 5jle 2023-11-08 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 3972 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 5 1 3973 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 6.3e-26 32.026 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MAHSCRWRFPARPGTTGGGGGGGRRGLGGAPRQRVPALLLPPGPPVGGGGPGAPPSPPAVAAAAAAAGSSGAGVPGGAAAASAASSSSASSSSSSSSSASSGPALLRVGPGFDAALQVSAAIGTNLRRFRAVFGESGGGGGSGEDEQFLGFGSDEEVRVRSPTRSPSVKTSPRKPRGRPRSGSDRNSAILSDPSVFSPLNKSETKSGDKIKKKDSKSIEKKRGRPPTFPGVKIKITHGKDISELPKGNKEDSLKKIKRTPSATFQQATKIKKLRAGKLSPLKSKFKTGKLQIGRKGVQIVRRRGRPPSTERIKTPSGLLINSELEKPQKVRKDKEGTPPLTKEDKTVVRQSPRRIKPVRIIPSSKRTDATIAKQLLQRAKKGAQKKIEKEAAQLQGRKVKTQVKNIRQFIMPVVSAISSRIIKTPRRFIEDEDYDPPIKIARLESTPNSRFSAPSCGSSEKSSAASQHSSQMSSDSSRSSSPSVDTSTDSQASEEIQVLPEERSDTPEVHPPLPISQSPENESNDRRSRRYSVSERSFGSRTTKKLSTLQSAPQQQTSSSPPPPLLTPPPPLQPASSISDHTPWLMPPTIPLASPFLPASTAPMQGKRKSILREPTFRWTSLKHSRSEPQYFSSAKYAKEGLIRKPIFDNFRPPPLTPEDVGFASGFSASGTAASARLFSPLHSGTRFDMHKRSPLLRAPRFTPSEAHSRIFESVTLPSNRTSAGTSSSGVSNRKRKRKVFSPIRSEPRSPSHSMRTRSGRLSSSELSPLTPPSSVSSSLSISVSPLATSALNPTFTFPSHSLTQSGESAEKNQRPRKQTSAPAEPFSSSSPTPLFPWFTPGSQTERGRNKDKAPEELSKDRDADKSVEKDKSRERDREREKENKRESRKEKRKKGSEIQSSSALYPVGRVSKEKVVGEDVATSSSAKKATGRKKSSSHDSGTDITSVTLGDTTAVKTKILIKKGRGNLEKTNLDLGPTAPSLEKEKTLCLSTPSSSTVKHSTSSIGSMLAQADKLPMTDKRVASLLKKAKAQLCKIEKSKSLKQTDQPKAQGQESDSSETSVRGPRIKHVCRRAAVALGRKRAVFPDDMPTLSALPWEEREKILSSMGNDDKSSIAGSEDAEPLAPPIKPIKPVTRNKAPQEPPVKKGRRSRRCGQCPGCQVPEDCGVCTNCLDKPKFGGRNIKKQCCKMRKCQNLQWMPSKAYLQKQAKAVKKKEKKSKTSEKKDSKESSVVKNVVDSSQKPTPSAREDPAPKKSSSEPPPRKPVEEKSEEGNVSAPGPESKQATTPASRKSSKQVSQPALVIPPQPPTTGPPRKEVPKTTPSEPKKKQPPPPESGPEQSKQKKVAPRPSIPVKQKPKEKEKPPPVNKQENAGTLNILSTLSNGNSSKQKIPADGVHRIRVDFKEDCEAENVWEMGGLGILTSVPITPRVVCFLCASSGHVEFVYCQVCCEPFHKFCLEENERPLEDQLENWCCRRCKFCHVCGRQHQATKQLLECNKCRNSYHPECLGPNYPTKPTKKKKVWICTKCVRCKSCGSTTPGKGWDAQWSHDFSLCHDCAKLFAKGNFCPLCDKCYDDDDYESKMMQCGKCDRWVHSKCENLSGTEDEMYEILSNLPESVAYTCVNCTERHPAEWRLALEKELQISLKQVLTALLNSRTTSHLLRYRQAAKPPDLNPETEESIPSRSSPEGPDPPVLTEVSKQDDQQPLDLEGVKRKMDQGNYTSVLEFSDDIVKIIQAAINSDGGQPEIKKANSMVKSFFIRQMERVFPWFSVKKSRFWEPNKVSSNSGMLPNAVLPPSLDHNYAQWQEREENSHTEQPPLMKKIIPAPKPKGPGEPDSPTPLHPPTPPILSTDRSREDSPELNPPPGIEDNRQCALCLTYGDDSANDAGRLLYIGQNEWTHVNCALWSAEVFEDDDGSLKNVHMAVIRGKQLRCEFCQKPGATVGCCLTSCTSNYHFMCSRAKNCVFLDDKKVYCQRHRDLIKGEVVPENGFEVFRRVFVDFEGISLRRKFLNGLEPENIHMMIGSMTIDCLGILNDLSDCEDKLFPIGYQCSRVYWSTTDARKRCVYTCKIVECRPPVVEPDINSTVEHDENRTIAHSPTSFTESSSKESQNTAEIISPPSPDRPPHSQTSGSCYYHVISKVPRIRTPSYSPTQRSPGCRPLPSAGSPTPTTHEIVTVGDPLLSSGLRSIGSRRHSTSSLSPQRSKLRIMSPMRTGNTYSRNNVSSVSTTGTATDLESSAKVVDHVLGPLNSSTSLGQNTSTSSNLQRTVVTVGNKNSHLDGSSSSEMKQSSASDLVSKSSSLKGEKTKVLSSKSSEGSAHNVAYPGIPKLAPQVHNTTSRELNVSKIGSFAEPSSVSFSSKEALSFPHLHLRGQRNDRDQHTDSTQSANSSPDEDTEVKTLKLSGMSNRSSIINEHMGSSSRDRRQKGKKSCKETFKEKHSSKSFLEPGQVTTGEEGNLKPEFMDEVLTPEYMGQRPCNNVSSDKIGDKGLSMPGVPKAPPMQVEGSAKELQAPRKRTVKVTLTPLKMENESQSKNALKESSPASPLQIESTSPTEPISASENPGDGPVAQPSPNNTSCQDSQSNNYQNLPVQDRNLMLPDGPKPQEDGSFKRRYPRRSARARSNMFFGLTPLYGVRSYGEEDIPFYSSSTGKKRGKRSAEGQVDGADDLSTSDEDDLYYYNFTRTVISSGGEERLASHNLFREEEQCDLPKISQLDGVDDGTESDTSVTATTRKSSQIPKRNGKENGTENLKIDRPEDAGEKEHVTKSSVGHKNEPKMDNCHSVSRVKTQGQDSLEAQLSSLESSRRVHTSTPSDKNLLDTYNTELLKSDSDNNNSDDCGNILPSDIMDFVLKNTPSMQALGESPESSSSELLNLGEGLGLDSNREKDMGLFEVFSQQLPTTEPVDSSVSSSISAEEQFELPLELPSDLSVLTTRSPTVPSQNPSRLAVISDSGEKRVTITEKSVASSESDPALLSPGVDPTPEGHMTPDHFIQGHMDADHISSPPCGSVEQGHGNNQDLTRNSSTPGLQVPVSPTVPIQNQKYVPNSTDSPGPSQISNAAVQTTPPHLKPATEKLIVVNQNMQPLYVLQTLPNGVTQKIQLTSSVSSTPSVMETNTSVLGPMGGGLTLTTGLNPSLPTSQSLFPSASKGLLPMSHHQHLHSFPAATQSSFPPNISNPPSGLLIGVQPPPDPQLLVSESSQRTDLSTTVATPSSGLKKRPISRLQTRKNKKLAPSSTPSNIAPSDVVSNMTLINFTPSQLPNHPSLLDLGSLNTSSHRTVPNIIKRSKSSIMYFEPAPLLPQSVGGTAATAAGTSTISQDTSHLTSGSVSGLASSSSVLNVVSMQTTTTPTSSASVPGHVTLTNPRLLGTPDIGSISNLLIKASQQSLGIQDQPVALPPSSGMFPQLGTSQTPSTAAITAASSICVLPSTQTTGITAASPSGEADEHYQLQHVNQLLASKTGIHSSQRDLDSASGPQVSNFTQTVDAPNSMGLEQNKALSSAVQASPTSPGGSPSSPSSGQRSASPSVPGPTKPKPKTKRFQLPLDKGNGKKHKVSHLRTSSSEAHIPDQETTSLTSGTGTPGAEAEQQDTASVEQSSQKECGQPAGQVAVLPEVQVTQNPANEQESAEPKTVEEEESNFSSPLMLWLQQEQKRKESITEKKPKKGLVFEISSDDGFQICAESIEDAWKSLTDKVQEARSNARLKQLSFAGVNGLRMLGILHDAVVFLIEQLSGAKHCRNYKFRFHKPEEANEPPLNPHGSARAEVHLRKSAFDMFNFLASKHRQPPEYNPNDEEEEEVQLKSARRATSMDLPMPMRFRHLKKTSKEAVGVYRSPIHGRGLFCKRNIDAGEMVIEYAGNVIRSIQTDKREKYYDS-KGIGCYMFRIDDSEVVDATMHGNAARFINHSCEPNCYSRVINIDGQKHIVIFAMRKIYRGEELTYDYKFPIEDASNKLPCNCGAKKCRKFLN 2 1 2 --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DYCSNRRFQRKQHADVEVILTEKKGWGLRAAKDLPSNTFVLEYCGEVLDHKEFKARVKEYARNKNIHYYFMALKNDEIIDATQKGNCSRFMNHSCEPNCETQKWTVNGQLRVGFFTTKLVPSGSELTFDYQFQRYG-KEAQKCFCGSANCRGYLG # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 5jle.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 1' . 6 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . 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PRO 3820 3820 ? A 13.787 -6.973 15.428 1 1 A PRO 0.260 1 ATOM 16 N N . MET 3821 3821 ? A 13.293 -3.561 14.780 1 1 A MET 0.330 1 ATOM 17 C CA . MET 3821 3821 ? A 13.242 -2.401 13.930 1 1 A MET 0.330 1 ATOM 18 C C . MET 3821 3821 ? A 12.745 -1.133 14.616 1 1 A MET 0.330 1 ATOM 19 O O . MET 3821 3821 ? A 11.575 -1.008 14.999 1 1 A MET 0.330 1 ATOM 20 C CB . MET 3821 3821 ? A 12.377 -2.704 12.687 1 1 A MET 0.330 1 ATOM 21 C CG . MET 3821 3821 ? A 12.495 -1.650 11.571 1 1 A MET 0.330 1 ATOM 22 S SD . MET 3821 3821 ? A 14.171 -1.438 10.914 1 1 A MET 0.330 1 ATOM 23 C CE . MET 3821 3821 ? A 14.140 -2.893 9.836 1 1 A MET 0.330 1 ATOM 24 N N . ARG 3822 3822 ? A 13.678 -0.171 14.764 1 1 A ARG 0.270 1 ATOM 25 C CA . ARG 3822 3822 ? A 13.427 1.158 15.272 1 1 A ARG 0.270 1 ATOM 26 C C . ARG 3822 3822 ? A 12.776 2.047 14.215 1 1 A ARG 0.270 1 ATOM 27 O O . ARG 3822 3822 ? A 12.078 3.001 14.535 1 1 A ARG 0.270 1 ATOM 28 C CB . ARG 3822 3822 ? A 14.753 1.791 15.787 1 1 A ARG 0.270 1 ATOM 29 C CG . 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PHE 3823 3823 ? A 16.031 4.848 10.705 1 1 A PHE 0.260 1 ATOM 44 C CE2 . PHE 3823 3823 ? A 16.931 2.610 10.943 1 1 A PHE 0.260 1 ATOM 45 C CZ . PHE 3823 3823 ? A 17.128 3.994 10.874 1 1 A PHE 0.260 1 ATOM 46 N N . ARG 3824 3824 ? A 10.021 2.034 12.587 1 1 A ARG 0.450 1 ATOM 47 C CA . ARG 3824 3824 ? A 8.593 1.812 12.410 1 1 A ARG 0.450 1 ATOM 48 C C . ARG 3824 3824 ? A 7.794 2.698 13.344 1 1 A ARG 0.450 1 ATOM 49 O O . ARG 3824 3824 ? A 6.684 2.355 13.746 1 1 A ARG 0.450 1 ATOM 50 C CB . ARG 3824 3824 ? A 8.186 0.325 12.592 1 1 A ARG 0.450 1 ATOM 51 C CG . ARG 3824 3824 ? A 8.925 -0.615 11.617 1 1 A ARG 0.450 1 ATOM 52 C CD . ARG 3824 3824 ? A 8.374 -2.042 11.517 1 1 A ARG 0.450 1 ATOM 53 N NE . ARG 3824 3824 ? A 7.027 -1.968 10.868 1 1 A ARG 0.450 1 ATOM 54 C CZ . ARG 3824 3824 ? A 6.023 -2.834 11.063 1 1 A ARG 0.450 1 ATOM 55 N NH1 . ARG 3824 3824 ? A 6.133 -3.878 11.877 1 1 A ARG 0.450 1 ATOM 56 N NH2 . ARG 3824 3824 ? A 4.876 -2.641 10.418 1 1 A ARG 0.450 1 ATOM 57 N N . 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #