data_SMR-5a6cd82d59c9d52b656731831cee2667_1 _entry.id SMR-5a6cd82d59c9d52b656731831cee2667_1 _struct.entry_id SMR-5a6cd82d59c9d52b656731831cee2667_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q9Y6V0 (isoform 3)/ PCLO_HUMAN, Protein piccolo Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q9Y6V0 (isoform 3)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 627450.667 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP PCLO_HUMAN Q9Y6V0 1 ;MGNEASLEGEGLPEGLAAAAAAGGGASGAGSPSHTAIPAGMEADLSQLSEEERRQIAAVMSRAQGLPKGS VPPAAAESPSMHRKQELDSSHPPKQSGRPPDPGRPAQPGLSKSRTTDTFRSEQKLPGRSPSTISLKESKS RTDLKEEHKSSMMPGFLSEVNALSAVSSVVNKFNPFDLISDSEASQEETTKKQKVVQKEQGKPEGIIKPP LQQQPPKPIPKQQGPGRDPLQQDGTPKSISSQQPEKIKSQPPGTGKPIQGPTQTPQTDHAKLPLQRDASR 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A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'PROTEIN KINASE C (BETA) {PDB ID=1a25, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=1a25.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 1a25, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 1' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-04 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-29 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GSPGISGGGGGILDSMERRGRIYIQAHIDREVLIVVVRDAKNLVPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPKSESKQ KTKTIKCSLNPEWNETFRFQLKESDKDRRLSVEIWDWDLTSRNDFMGSLSFGISELQKAGVDGWFKLLSQ EEGEYFNVP ; ;GSPGISGGGGGILDSMERRGRIYIQAHIDREVLIVVVRDAKNLVPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPKSESKQ KTKTIKCSLNPEWNETFRFQLKESDKDRRLSVEIWDWDLTSRNDFMGSLSFGISELQKAGVDGWFKLLSQ EEGEYFNVP ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 15 140 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 1a25 2024-05-22 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 4935 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 4935 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 1.6e-12 38.889 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MGNEASLEGEGLPEGLAAAAAAGGGASGAGSPSHTAIPAGMEADLSQLSEEERRQIAAVMSRAQGLPKGSVPPAAAESPSMHRKQELDSSHPPKQSGRPPDPGRPAQPGLSKSRTTDTFRSEQKLPGRSPSTISLKESKSRTDLKEEHKSSMMPGFLSEVNALSAVSSVVNKFNPFDLISDSEASQEETTKKQKVVQKEQGKPEGIIKPPLQQQPPKPIPKQQGPGRDPLQQDGTPKSISSQQPEKIKSQPPGTGKPIQGPTQTPQTDHAKLPLQRDASRPQTKQADIVRGESVKPSLPSPSKPPIQQPTPGKPPAQQPGHEKSQPGPAKPPAQPSGLTKPLAQQPGTVKPPVQPPGTTKPPAQPLGPAKPPAQQTGSEKPSSEQPGPKALAQPPGVGKTPAQQPGPAKPPTQQVGTPKPLAQQPGLQSPAKAPGPTKTPVQQPGPGKIPAQQAGPGKTSAQQTGPTKPPSQLPGPAKPPPQQPGPAKPPPQQPGSAKPPSQQPGSTKPPPQQPGPAKPSPQQPGSTKPPSQQPGSAKPSAQQPSPAKPSAQQSTKPVSQTGSGKPLQPPTVSPSAKQPPSQGLPKTICPLCNTTELLLHVPEKANFNTCTECQTTVCSLCGFNPNPHLTEVKEWLCLNCQMKRALGGDLAPVPSSPQPKLKTAPVTTTSAVSKSSPQPQQTSPKKDAAPKQDLSKAPEPKKPPPLVKQPTLHGSPSAKAKQPPEADSLSKPAPPKEPSVPSEQDKAPVADDKPKQPKMVKPTTDLVSSSSATTKPDIPSSKVQSQAEEKTTPPLKTDSAKPSQSFPPTGEKVSPFDSKAIPRPASDSKIISHPGPSSESKGQKQVDPVQKKEEPKKAQTKMSPKPDAKPMPKGSPTPPGPRPTAGQTVPTPQQSPKPQEQSRRFSLNLGSITDAPKSQPTTPQETVTGKLFGFGASIFSQASNLISTAGQPGPHSQSGPGAPMKQAPAPSQPPTSQGPPKSTGQAPPAPAKSIPVKKETKAPAAEKLEPKAEQAPTVKRTETEKKPPPIKDSKSLTAEPQKAVLPTKLEKSPKPESTCPLCKTELNIGSKDPPNFNTCTECKNQVCNLCGFNPTPHLTEIQEWLCLNCQTQRAISGQLGDIRKMPPAPSGPKASPMPVPTESSSQKTAVPPQVKLVKKQEQEVKTEAEKVILEKVKETLSMEKIPPMVTTDQKQEESKLEKDKASALQEKKPLPEEKKLIPEEEKIRSEEKKPLLEEKKPTPEDKKLLPEAKTSAPEEQKHDLLKSQVQIAEEKLEGRVAPKTVQEGKQPQTKMEGLPSGTPQSLPKEDDKTTKTIKEQPQPPCTAKPDQVEPGKEKTEKEDDKSDTSSSQQPKSPQGLSDTGYSSDGISSSLGEIPSLIPTDEKDILKGLKKDSFSQESSPSSPSDLAKLESTVLSILEAQASTLADEKSEKKTQPHEVSPEQPKDQEKTQSLSETLEITISEEEIKESQEERKDTFKKDSQQDIPSSKDHKEKSEFVDDITTRREPYDSVEESSESENSPVPQRKRRTSVGSSSSDEYKQEDSQGSGEEEDFIRKQIIEMSADEDASGSEDDEFIRNQLKEISSSTESQKKEETKGKGKITAGKHRRLTRKSSTSIDEDAGRRHSWHDEDDEAFDESPELKYRETKSQESEELVVTGGGGLRRFKTIELNSTIADKYSAESSQKKTSLYFDEEPELEMESLTDSPEDRSRGEGSSSLHASSFTPGTSPTSVSSLDEDSDSSPSHKKGESKQQRKARHRPHGPLLPTIEDSSEEEELREEEELLKEQEKQREIEQQQRKSSSKKSKKDKDELRAQRRRERPKTPPSNLSPIEDASPTEELRQAAEMEELHRSSCSEYSPSIESDPEGFEISPEKIIEVQKVYKLPTAVSLYSPTDEQSIMQKEGSQKALKSAEEMYEEMMHKTHKYKAFPAANERDEVFEKEPLYGGMLIEDYIYESLVEDTYNGSVDGSLLTRQEEENGFMQQKGREQKIRLSEQIYEDPMQKITDLQKEFYELESLHSVVPQEDIVSSSFIIPESHEIVDLGTMVTSTEEERKLLDADAAYEELMKRQQMQLTPGSSPTQAPIGEDMTESTMDFDRMPDASLTSSVLSGASLTDSTSSATLSIPDVKITQHFSTEEIEDEYVTDYTREIQEIIAHESLILTYSEPSESATSVPPSDTPSLTSSVSSVCTTDSSSPITTLDSITTVYTEPVDMITKFEDSEEISSSTYFPGSIIDYPEEISVSLDRTAPPDGRASADHIVISLSDMASSIIESVVPKPEGPVADTVSTDLLISEKDPVKKAKKETGNGIILEVLEAYRDKKELEAERTKSSLSETVFDHPPSSVIALPMKEQLSTTYFTSGETFGQEKPASQLPSGSPSVSSLPAKPRPFFRSSSLDISAQPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPLPPPTSPKPTILPKKKLTVASPVTTATPLFDAVTTLETTAVLRSNGLPVTRICTTAPPPVPPKPSSIPSGLVFTHRPEPSKPPIAPKPVIPQLPTTTQKPTDIHPKPTGLSLTSSMTLNLVTSADYKLPSPTSPLSPHSNKSSPRFSKSLTETYVVITLPSEPGTPTDSSASQAITSWPLGSPSKDLVSVEPVFSVVPPVTAVEIPISSEQTFYISGALQTFSATPVTAPSSFQAAPTSVTQFLTTEVSKTEVSATRSTAPSVGLSSISITIPPEPLALDNIHLEKPQYKEDGKLQLVGDVIDLRTVPKVEVKTTDKCIDLSASTMDVKRQITANEVYGKQISAVQPSIINLSVTSSIVTPVSLATETVTFVTCTASASYTTGTESLVGAEHAMTTPLQLTTSKHAEPPYRIPSDQVFPIAREEAPINLSLGTPAHAVTLAITKPVTVPPVGVTNGWTDSTVSQGITDGEVVDLSTTKSHRTVVTMDESTSSVMTKIIEDEKPVDLTAGRRAVCCDVVYKLPFGRSCTAQQPATTLPEDRFGYRDDHYQYDRSGPYGYRGIGGMKPSMSDTNLAEAGHFFYKSKNAFDYSEGTDTAVDLTSGRVTTGEVMDYSSKTTGPYPETRQVISGAGISTPQYSTARMTPPPGPQYCVGSVLRSSNGVVYSSVATPTPSTFAITTQPGSIFSTTVRDLSGIHTADAVTSLPAMHHSQPMPRSYFITTGASETDIAVTGIDISASLQTITMESLTAETIDSVPTLTTASEVFPEVVGDESALLIVPEEDKQQQQLDLERELLELEKIKQQRFAEELEWERQEIQRFREQEKIMVQKKLEELQSMKQHLLFQQEEERQAQFMMRQETLAQQQLQLEQIQQLQQQLHQQLEEQKIRQIYQYNYDPSGTASPQTTTEQAILEGQYAALEGSQFWATEDATTTASAVVAIEIPQSQGWYTVQSDGVTQYIAPPGILSTVSEIPLTDVVVKEEKQPKKRSSGAKVRGQYDDMGENMTDDPRSFKKIVDSGVQTDDEDATDRSYVSRRRRTKKSVDTSVQTDDEDQDEWDMPTRSRRKARVGKYGDSMTEADKTKPLSKVSSIAVQTVAEISVQTEPVGTIRTPSIRARVDAKVEIIKHISAPEKTYKGGSLGCQTEADSDTQSPQYLSATSPPKDKKRPTPLEIGYSSHLRADSTVQLAPSPPKSPKVLYSPISPLSPGKALESAFVPYEKPLPDDISPQKVLHPDMAKVPPASPKTAKMMQRSMSDPKPLSPTADESSRAPFQYTEGYTTKGSQTMTSSGAQKKVKRTLPNPPPEEISTGTQSTFSTMGTVSRRRICRTNTMARAKILQDIDRELDLVERESAKLRKKQAELDEEEKEIDAKLRYLEMGINRRKEALLKEREKRERAYLQGVAEDRDYMSDSEVSSTRPTRIESQHGIERPRTAPQTEFSQFIPPQTQTESQLVPPTSPYTQYQYSSPALPTQAPTSYTQQSHFEQQTLYHQQVSPYQTQPTFQAVATMSFTPQVQPTPTPQPSYQLPSQMMVIQQKPRQTTLYLEPKITSNYEVIRNQPLMIAPVSTDNTFAVSHLGSKYNSLDLRIGLEERSSMASSPISSISADSFYADIDHHTPRNYVLIDDIGEITKGTAALSTAFSLHEKDLSKTDRLLRTTETRRSQEVTDFLAPLQSSSRLHSYVKAEEDPMEDPYELKLLKHQIKQEFRRGTESLDHLAGLSHYYHADTSYRHFPKSEKYSISRLTLEKQAAKQLPAAILYQKQSKHKKSLIDPKMSKFSPIQESRDLEPDYSSYMTSSTSSIGGISSRARLLQDDITFGLRKNITDQQKFMGSSLGTGLGTLGNTIRSALQDEADKPYSSGSRSRPSSRPSSVYGLDLSIKRDSSSSSLRLKAQEAEALDVSFSHASSSARTKPTSLPISQSRGRIPIVAQNSEEESPLSPVGQPMGMARAAAGPLPPISADTRDQFGSSHSLPEVQQHMREESRTRGYDRDIAFIMDDFQHAMSDSEAYHLRREETDWFDKPRESRLENGHGLDRKLPERLVHSRPLSQHQEQIIQMNGKTMHYIFPHARIKITRDSKDHTVSGNGLGIRIVGGKEIPGHSGEIGAYIAKILPGGSAEQTGKLMEGMQVLEWNGIPLTSKTYEEVQSIISQQSGEAEICVRLDLNMLSDSENSQHLELHEPPKAVDKAKSPGVDPKQLAAELQKVSLQQSPLVLSSVVEKGSHVHSGPTSAGSSSVPSPGQPGSPSVSKKKHGSSKPTDGTKVVSHPITGEIQLQINYDLGNLIIHILQARNLVPRDNNGYSDPFVKVYLLPGRGQVMVVQNASAEYKRRTKHVQKSLNPEWNQTVIYKSISMEQLKKKTLEVTVWDYDRFSSNDFLGEVLIDLSSTSHLDNTPRWYPLKEQTESIDHGKSHSSQSSQQSPKPSVIKSRSHGIFPDPSKDMQVPTIEKSHSSPGSSKSSSEGHLRSHGPSRSQSKTSVTQTHLEDAGAAIAAAEAAVQQLRIQPSKRRK 2 1 2 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------SMERRGRIYIQAHIDREVLIVVVRDAKNLVPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPK---------SESKQKTKTIKCSLNPEWNETFRFQ-LKESD-KDRRLSVEIWDWDLTSRNDFMGSLSFGISELQKA-GVDGWFKLLSQ----------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.215}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 1a25.1, oligomeric state (monomer) as predicted' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 1' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . PRO 4693 4693 ? A 7.335 56.046 14.558 1 1 A PRO 0.370 1 ATOM 2 C CA . PRO 4693 4693 ? A 8.011 55.031 15.426 1 1 A PRO 0.370 1 ATOM 3 C C . PRO 4693 4693 ? A 7.035 54.677 16.524 1 1 A PRO 0.370 1 ATOM 4 O O . PRO 4693 4693 ? A 7.220 55.101 17.655 1 1 A PRO 0.370 1 ATOM 5 C CB . PRO 4693 4693 ? A 9.253 55.795 15.897 1 1 A PRO 0.370 1 ATOM 6 C CG . PRO 4693 4693 ? A 8.796 57.257 16.048 1 1 A PRO 0.370 1 ATOM 7 C CD . PRO 4693 4693 ? A 7.611 57.431 15.089 1 1 A PRO 0.370 1 ATOM 8 N N . ILE 4694 4694 ? A 5.958 53.931 16.202 1 1 A ILE 0.410 1 ATOM 9 C CA . ILE 4694 4694 ? A 4.881 53.612 17.137 1 1 A ILE 0.410 1 ATOM 10 C C . ILE 4694 4694 ? A 5.297 52.671 18.250 1 1 A ILE 0.410 1 ATOM 11 O O . ILE 4694 4694 ? A 4.885 52.812 19.395 1 1 A ILE 0.410 1 ATOM 12 C CB . ILE 4694 4694 ? A 3.630 53.107 16.409 1 1 A ILE 0.410 1 ATOM 13 C CG1 . ILE 4694 4694 ? A 2.400 52.937 17.340 1 1 A ILE 0.410 1 ATOM 14 C CG2 . ILE 4694 4694 ? A 3.891 51.803 15.617 1 1 A ILE 0.410 1 ATOM 15 C CD1 . ILE 4694 4694 ? A 1.844 54.241 17.928 1 1 A ILE 0.410 1 ATOM 16 N N . THR 4695 4695 ? A 6.152 51.685 17.944 1 1 A THR 0.710 1 ATOM 17 C CA . THR 4695 4695 ? A 6.566 50.672 18.899 1 1 A THR 0.710 1 ATOM 18 C C . THR 4695 4695 ? A 7.921 50.916 19.527 1 1 A THR 0.710 1 ATOM 19 O O . THR 4695 4695 ? A 8.447 50.051 20.226 1 1 A THR 0.710 1 ATOM 20 C CB . THR 4695 4695 ? A 6.597 49.295 18.269 1 1 A THR 0.710 1 ATOM 21 O OG1 . THR 4695 4695 ? A 7.138 49.385 16.962 1 1 A THR 0.710 1 ATOM 22 C CG2 . THR 4695 4695 ? A 5.159 48.790 18.128 1 1 A THR 0.710 1 ATOM 23 N N . GLY 4696 4696 ? A 8.519 52.104 19.324 1 1 A GLY 0.790 1 ATOM 24 C CA . GLY 4696 4696 ? A 9.892 52.360 19.744 1 1 A GLY 0.790 1 ATOM 25 C C . GLY 4696 4696 ? A 10.946 51.934 18.748 1 1 A GLY 0.790 1 ATOM 26 O O . GLY 4696 4696 ? A 10.690 51.729 17.560 1 1 A GLY 0.790 1 ATOM 27 N N . GLU 4697 4697 ? A 12.198 51.836 19.222 1 1 A GLU 0.750 1 ATOM 28 C CA . GLU 4697 4697 ? A 13.350 51.578 18.379 1 1 A GLU 0.750 1 ATOM 29 C C . GLU 4697 4697 ? A 14.356 50.674 19.072 1 1 A GLU 0.750 1 ATOM 30 O O . GLU 4697 4697 ? A 14.435 50.614 20.299 1 1 A GLU 0.750 1 ATOM 31 C CB . GLU 4697 4697 ? A 14.048 52.900 17.974 1 1 A GLU 0.750 1 ATOM 32 C CG . GLU 4697 4697 ? A 14.544 53.737 19.179 1 1 A GLU 0.750 1 ATOM 33 C CD . GLU 4697 4697 ? A 15.163 55.078 18.794 1 1 A GLU 0.750 1 ATOM 34 O OE1 . GLU 4697 4697 ? A 15.581 55.788 19.748 1 1 A GLU 0.750 1 ATOM 35 O OE2 . GLU 4697 4697 ? A 15.208 55.405 17.585 1 1 A GLU 0.750 1 ATOM 36 N N . ILE 4698 4698 ? A 15.150 49.916 18.292 1 1 A ILE 0.790 1 ATOM 37 C CA . ILE 4698 4698 ? A 16.159 49.009 18.818 1 1 A ILE 0.790 1 ATOM 38 C C . ILE 4698 4698 ? A 17.500 49.280 18.159 1 1 A ILE 0.790 1 ATOM 39 O O . ILE 4698 4698 ? A 17.594 49.502 16.955 1 1 A ILE 0.790 1 ATOM 40 C CB . ILE 4698 4698 ? A 15.755 47.541 18.687 1 1 A ILE 0.790 1 ATOM 41 C CG1 . ILE 4698 4698 ? A 16.749 46.600 19.412 1 1 A ILE 0.790 1 ATOM 42 C CG2 . ILE 4698 4698 ? A 15.574 47.167 17.200 1 1 A ILE 0.790 1 ATOM 43 C CD1 . ILE 4698 4698 ? A 16.236 45.163 19.537 1 1 A ILE 0.790 1 ATOM 44 N N . GLN 4699 4699 ? A 18.596 49.294 18.940 1 1 A GLN 0.740 1 ATOM 45 C CA . GLN 4699 4699 ? A 19.929 49.477 18.404 1 1 A GLN 0.740 1 ATOM 46 C C . GLN 4699 4699 ? A 20.531 48.120 18.111 1 1 A GLN 0.740 1 ATOM 47 O O . GLN 4699 4699 ? A 20.820 47.325 19.010 1 1 A GLN 0.740 1 ATOM 48 C CB . GLN 4699 4699 ? A 20.822 50.270 19.387 1 1 A GLN 0.740 1 ATOM 49 C CG . GLN 4699 4699 ? A 22.348 50.252 19.120 1 1 A GLN 0.740 1 ATOM 50 C CD . GLN 4699 4699 ? A 22.792 50.856 17.788 1 1 A GLN 0.740 1 ATOM 51 O OE1 . GLN 4699 4699 ? A 22.667 52.048 17.514 1 1 A GLN 0.740 1 ATOM 52 N NE2 . GLN 4699 4699 ? A 23.383 50.000 16.923 1 1 A GLN 0.740 1 ATOM 53 N N . LEU 4700 4700 ? A 20.742 47.836 16.816 1 1 A LEU 0.740 1 ATOM 54 C CA . LEU 4700 4700 ? A 21.242 46.559 16.360 1 1 A LEU 0.740 1 ATOM 55 C C . LEU 4700 4700 ? A 22.552 46.765 15.643 1 1 A LEU 0.740 1 ATOM 56 O O . LEU 4700 4700 ? 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A 5.501 39.681 11.204 1 1 A GLN 0.520 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O S # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.589 2 1 3 0 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 4693 PRO 1 0.370 2 1 A 4694 ILE 1 0.410 3 1 A 4695 THR 1 0.710 4 1 A 4696 GLY 1 0.790 5 1 A 4697 GLU 1 0.750 6 1 A 4698 ILE 1 0.790 7 1 A 4699 GLN 1 0.740 8 1 A 4700 LEU 1 0.740 9 1 A 4701 GLN 1 0.710 10 1 A 4702 ILE 1 0.720 11 1 A 4703 ASN 1 0.650 12 1 A 4704 TYR 1 0.490 13 1 A 4705 ASP 1 0.570 14 1 A 4706 LEU 1 0.430 15 1 A 4707 GLY 1 0.580 16 1 A 4708 ASN 1 0.640 17 1 A 4709 LEU 1 0.670 18 1 A 4710 ILE 1 0.730 19 1 A 4711 ILE 1 0.780 20 1 A 4712 HIS 1 0.770 21 1 A 4713 ILE 1 0.790 22 1 A 4714 LEU 1 0.740 23 1 A 4715 GLN 1 0.690 24 1 A 4716 ALA 1 0.760 25 1 A 4717 ARG 1 0.720 26 1 A 4718 ASN 1 0.730 27 1 A 4719 LEU 1 0.740 28 1 A 4720 VAL 1 0.740 29 1 A 4721 PRO 1 0.520 30 1 A 4722 ARG 1 0.390 31 1 A 4723 ASP 1 0.400 32 1 A 4724 ASN 1 0.480 33 1 A 4725 ASN 1 0.480 34 1 A 4726 GLY 1 0.470 35 1 A 4727 TYR 1 0.510 36 1 A 4728 SER 1 0.510 37 1 A 4729 ASP 1 0.530 38 1 A 4730 PRO 1 0.690 39 1 A 4731 PHE 1 0.750 40 1 A 4732 VAL 1 0.820 41 1 A 4733 LYS 1 0.780 42 1 A 4734 VAL 1 0.810 43 1 A 4735 TYR 1 0.750 44 1 A 4736 LEU 1 0.720 45 1 A 4737 LEU 1 0.670 46 1 A 4738 PRO 1 0.620 47 1 A 4739 GLY 1 0.580 48 1 A 4740 ARG 1 0.410 49 1 A 4741 GLY 1 0.340 50 1 A 4742 GLN 1 0.330 51 1 A 4743 VAL 1 0.200 52 1 A 4744 MET 1 0.140 53 1 A 4745 VAL 1 0.170 54 1 A 4746 VAL 1 0.130 55 1 A 4747 GLN 1 0.220 56 1 A 4748 ASN 1 0.190 57 1 A 4749 ALA 1 0.170 58 1 A 4750 SER 1 0.230 59 1 A 4751 ALA 1 0.450 60 1 A 4752 GLU 1 0.440 61 1 A 4753 TYR 1 0.490 62 1 A 4754 LYS 1 0.610 63 1 A 4755 ARG 1 0.600 64 1 A 4756 ARG 1 0.620 65 1 A 4757 THR 1 0.660 66 1 A 4758 LYS 1 0.520 67 1 A 4759 HIS 1 0.550 68 1 A 4760 VAL 1 0.560 69 1 A 4761 GLN 1 0.410 70 1 A 4762 LYS 1 0.490 71 1 A 4763 SER 1 0.590 72 1 A 4764 LEU 1 0.610 73 1 A 4765 ASN 1 0.670 74 1 A 4766 PRO 1 0.710 75 1 A 4767 GLU 1 0.610 76 1 A 4768 TRP 1 0.600 77 1 A 4769 ASN 1 0.720 78 1 A 4770 GLN 1 0.760 79 1 A 4771 THR 1 0.790 80 1 A 4772 VAL 1 0.800 81 1 A 4773 ILE 1 0.700 82 1 A 4774 TYR 1 0.670 83 1 A 4775 LYS 1 0.620 84 1 A 4776 SER 1 0.530 85 1 A 4777 ILE 1 0.360 86 1 A 4778 SER 1 0.390 87 1 A 4779 MET 1 0.360 88 1 A 4780 GLU 1 0.410 89 1 A 4781 GLN 1 0.490 90 1 A 4782 LEU 1 0.550 91 1 A 4783 LYS 1 0.560 92 1 A 4784 LYS 1 0.610 93 1 A 4785 LYS 1 0.670 94 1 A 4786 THR 1 0.730 95 1 A 4787 LEU 1 0.730 96 1 A 4788 GLU 1 0.740 97 1 A 4789 VAL 1 0.810 98 1 A 4790 THR 1 0.810 99 1 A 4791 VAL 1 0.810 100 1 A 4792 TRP 1 0.710 101 1 A 4793 ASP 1 0.710 102 1 A 4794 TYR 1 0.570 103 1 A 4795 ASP 1 0.570 104 1 A 4796 ARG 1 0.480 105 1 A 4797 PHE 1 0.340 106 1 A 4798 SER 1 0.420 107 1 A 4799 SER 1 0.530 108 1 A 4800 ASN 1 0.680 109 1 A 4801 ASP 1 0.700 110 1 A 4802 PHE 1 0.720 111 1 A 4803 LEU 1 0.730 112 1 A 4804 GLY 1 0.800 113 1 A 4805 GLU 1 0.780 114 1 A 4806 VAL 1 0.780 115 1 A 4807 LEU 1 0.760 116 1 A 4808 ILE 1 0.690 117 1 A 4809 ASP 1 0.720 118 1 A 4810 LEU 1 0.660 119 1 A 4811 SER 1 0.570 120 1 A 4812 SER 1 0.580 121 1 A 4813 THR 1 0.570 122 1 A 4814 SER 1 0.460 123 1 A 4815 HIS 1 0.360 124 1 A 4816 LEU 1 0.300 125 1 A 4817 ASP 1 0.340 126 1 A 4818 ASN 1 0.430 127 1 A 4819 THR 1 0.530 128 1 A 4820 PRO 1 0.580 129 1 A 4821 ARG 1 0.600 130 1 A 4822 TRP 1 0.690 131 1 A 4823 TYR 1 0.640 132 1 A 4824 PRO 1 0.710 133 1 A 4825 LEU 1 0.740 134 1 A 4826 LYS 1 0.740 135 1 A 4827 GLU 1 0.620 136 1 A 4828 GLN 1 0.520 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #