data_SMR-26d1fb369119b5ce09240afd39c79bf2_2 _entry.id SMR-26d1fb369119b5ce09240afd39c79bf2_2 _struct.entry_id SMR-26d1fb369119b5ce09240afd39c79bf2_2 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - P49790/ NU153_HUMAN, Nuclear pore complex protein Nup153 Estimated model accuracy of this model is 0.004, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P49790' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-12.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 2 . 4 2 4 . 5 2 5 . 6 2 6 . 7 3 1 . 8 3 4 . 9 4 1 . 10 4 2 . 11 4 4 . 12 5 3 . 13 6 1 . 14 6 3 . 15 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' ZN non-polymer 'ZINC ION' Zn 65.380 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 184604.616 1 . 2 non-polymer man 'ZINC ION' 65.380 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP NU153_HUMAN P49790 1 ;MASGAGGVGGGGGGKIRTRRCHQGPIKPYQQGRQQHQGILSRVTESVKNIVPGWLQRYFNKNEDVCSCST DTSEVPRWPENKEDHLVYADEESSNITDGRITPEPAVSNTEEPSTTSTASNYPDVLTRPSLHRSHLNFSM LESPALHCQPSTSSAFPIGSSGFSLVKEIKDSTSQHDDDNISTTSGFSSRASDKDITVSKNTSLPPLWSP EAERSHSLSQHTATSSKKPAFNLSAFGTLSPSLGNSSILKTSQLGDSPFYPGKTTYGGAAAAVRQSKLRN TPYQAPVRRQMKAKQLSAQSYGVTSSTARRILQSLEKMSSPLADAKRIPSIVSSPLNSPLDRSGIDITDF QAKREKVDSQYPPVQRLMTPKPVSIATNRSVYFKPSLTPSGEFRKTNQRIDNKCSTGYEKNMTPGQNREQ RESGFSYPNFSLPAANGLSSGVGGGGGKMRRERTRFVASKPLEEERQGLTVLPKLISSSCAQAIIPSWPL KVLRLQEMEVPVLPKISLPITSSSLPTFNFSSPEITTSSPSPINSSQALTNKVQMTSPSSTGSPMFKFSS PIVKSTEANVLPPSSIGFTFSVPVAKTAELSGSSSTLEPIISSSAHHVTTVNSTNCKKTPPEDCEGPFRP AEILKEGSVLDILKSPGFASPKIDSVAAQPTATSPVVYTRPAISSFSSSGIGFGESLKAGSSWQCDTCLL QNKVTDNKCIACQAAKLSPRDTAKQTGIETPNKSGKTTLSASGTGFGDKFKPVIGTWDCDTCLVQNKPEA IKCVACETPKPGTCVKRALTLTVVSESAETMTASSSSCTVTTGTLGFGDKFKRPIGSWECSVCCVSNNAE DNKCVSCMSEKPGSSVPASSSSTVPVSLPSGGSLGLEKFKKPEGSWDCELCLVQNKADSTKCLACESAKP GTKSGFKGFDTSSSSSNSAASSSFKFGVSSSSSGPSQTLTSTGNFKFGDQGGFKIGVSSDSGSINPMSEG FKFSKPIGDFKFGVSSESKPEEVKKDSKNDNFKFGLSSGLSNPVSLTPFQFGVSNLGQEEKKEELPKSSS AGFSFGTGVINSTPAPANTIVTSENKSSFNLGTIETKSASVAPFTCKTSEAKKEEMPATKGGFSFGNVEP ASLPSASVFVLGRTEEKQQEPVTSTSLVFGKKADNEEPKCQPVFSFGNSEQTKDENSSKSTFSFSMTKPS EKESEQPAKATFAFGAQTSTTADQGAAKPVFSFLNNSSSSSSTPATSAGGGIFGSSTSSSNPPVATFVFG QSSNPVSSSAFGNTAESSTSQSLLFSQDSKLATTSSTGTAVTPFVFGPGASSNNTTTSGFGFGATTTSSS AGSSFVFGTGPSAPSASPAFGANQTPTFGQSQGASQPNPPGFGSISSSTALFPTGSQPAPPTFGTVSSSS QPPVFGQQPSQSAFGSGTTPNSSSAFQFGSSTTNFNFTNNSPSGVFTFGANSSTPAASAQPSGSGGFPFN QSPAAFTVGSNGKNVFSSSGTSFSGRKIKTAVRRRK ; 'Nuclear pore complex protein Nup153' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1506 1 1506 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . NU153_HUMAN P49790 P49790-2 1 1506 9606 'Homo sapiens (Human)' 2008-09-23 9D997D081B22CCD3 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MASGAGGVGGGGGGKIRTRRCHQGPIKPYQQGRQQHQGILSRVTESVKNIVPGWLQRYFNKNEDVCSCST DTSEVPRWPENKEDHLVYADEESSNITDGRITPEPAVSNTEEPSTTSTASNYPDVLTRPSLHRSHLNFSM LESPALHCQPSTSSAFPIGSSGFSLVKEIKDSTSQHDDDNISTTSGFSSRASDKDITVSKNTSLPPLWSP EAERSHSLSQHTATSSKKPAFNLSAFGTLSPSLGNSSILKTSQLGDSPFYPGKTTYGGAAAAVRQSKLRN TPYQAPVRRQMKAKQLSAQSYGVTSSTARRILQSLEKMSSPLADAKRIPSIVSSPLNSPLDRSGIDITDF QAKREKVDSQYPPVQRLMTPKPVSIATNRSVYFKPSLTPSGEFRKTNQRIDNKCSTGYEKNMTPGQNREQ RESGFSYPNFSLPAANGLSSGVGGGGGKMRRERTRFVASKPLEEERQGLTVLPKLISSSCAQAIIPSWPL KVLRLQEMEVPVLPKISLPITSSSLPTFNFSSPEITTSSPSPINSSQALTNKVQMTSPSSTGSPMFKFSS PIVKSTEANVLPPSSIGFTFSVPVAKTAELSGSSSTLEPIISSSAHHVTTVNSTNCKKTPPEDCEGPFRP 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DTSEVPRWPENKEDHLVYADEESSNITDGRITPEPAVSNTEEPSTTSTASNYPDVLTRPSLHRSHLNFSM LESPALHCQPSTSSAFPIGSSGFSLVKEIKDSTSQHDDDNISTTSGFSSRASDKDITVSKNTSLPPLWSP EAERSHSLSQHTATSSKKPAFNLSAFGTLSPSLGNSSILKTSQLGDSPFYPGKTTYGGAAAAVRQSKLRN TPYQAPVRRQMKAKQLSAQSYGVTSSTARRILQSLEKMSSPLADAKRIPSIVSSPLNSPLDRSGIDITDF QAKREKVDSQYPPVQRLMTPKPVSIATNRSVYFKPSLTPSGEFRKTNQRIDNKCSTGYEKNMTPGQNREQ RESGFSYPNFSLPAANGLSSGVGGGGGKMRRERTRFVASKPLEEERQGLTVLPKLISSSCAQAIIPSWPL KVLRLQEMEVPVLPKISLPITSSSLPTFNFSSPEITTSSPSPINSSQALTNKVQMTSPSSTGSPMFKFSS PIVKSTEANVLPPSSIGFTFSVPVAKTAELSGSSSTLEPIISSSAHHVTTVNSTNCKKTPPEDCEGPFRP AEILKEGSVLDILKSPGFASPKIDSVAAQPTATSPVVYTRPAISSFSSSGIGFGESLKAGSSWQCDTCLL QNKVTDNKCIACQAAKLSPRDTAKQTGIETPNKSGKTTLSASGTGFGDKFKPVIGTWDCDTCLVQNKPEA IKCVACETPKPGTCVKRALTLTVVSESAETMTASSSSCTVTTGTLGFGDKFKRPIGSWECSVCCVSNNAE DNKCVSCMSEKPGSSVPASSSSTVPVSLPSGGSLGLEKFKKPEGSWDCELCLVQNKADSTKCLACESAKP GTKSGFKGFDTSSSSSNSAASSSFKFGVSSSSSGPSQTLTSTGNFKFGDQGGFKIGVSSDSGSINPMSEG FKFSKPIGDFKFGVSSESKPEEVKKDSKNDNFKFGLSSGLSNPVSLTPFQFGVSNLGQEEKKEELPKSSS 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ILE . 1 27 LYS . 1 28 PRO . 1 29 TYR . 1 30 GLN . 1 31 GLN . 1 32 GLY . 1 33 ARG . 1 34 GLN . 1 35 GLN . 1 36 HIS . 1 37 GLN . 1 38 GLY . 1 39 ILE . 1 40 LEU . 1 41 SER . 1 42 ARG . 1 43 VAL . 1 44 THR . 1 45 GLU . 1 46 SER . 1 47 VAL . 1 48 LYS . 1 49 ASN . 1 50 ILE . 1 51 VAL . 1 52 PRO . 1 53 GLY . 1 54 TRP . 1 55 LEU . 1 56 GLN . 1 57 ARG . 1 58 TYR . 1 59 PHE . 1 60 ASN . 1 61 LYS . 1 62 ASN . 1 63 GLU . 1 64 ASP . 1 65 VAL . 1 66 CYS . 1 67 SER . 1 68 CYS . 1 69 SER . 1 70 THR . 1 71 ASP . 1 72 THR . 1 73 SER . 1 74 GLU . 1 75 VAL . 1 76 PRO . 1 77 ARG . 1 78 TRP . 1 79 PRO . 1 80 GLU . 1 81 ASN . 1 82 LYS . 1 83 GLU . 1 84 ASP . 1 85 HIS . 1 86 LEU . 1 87 VAL . 1 88 TYR . 1 89 ALA . 1 90 ASP . 1 91 GLU . 1 92 GLU . 1 93 SER . 1 94 SER . 1 95 ASN . 1 96 ILE . 1 97 THR . 1 98 ASP . 1 99 GLY . 1 100 ARG . 1 101 ILE . 1 102 THR . 1 103 PRO . 1 104 GLU . 1 105 PRO . 1 106 ALA . 1 107 VAL . 1 108 SER . 1 109 ASN . 1 110 THR . 1 111 GLU . 1 112 GLU . 1 113 PRO . 1 114 SER . 1 115 THR . 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A 1 1503 ARG 1503 ? ? ? A . A 1 1504 ARG 1504 ? ? ? A . A 1 1505 ARG 1505 ? ? ? A . A 1 1506 LYS 1506 ? ? ? A . # # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 ZN 1 1 1 ZN '_' . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Nuclear pore complex protein Nup153 {PDB ID=2k0c, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=2k0c.1.A}' 'template structure' . 2 'ZINC ION {PDB ID=2k0c, label_asym_id=B, auth_asym_id=A, SMTL ID=2k0c.1._.1}' 'template structure' . 3 . target . 4 'ZINC ION' target . 5 'Target-template alignment by HHblits to 2k0c, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 6 'model 2' 'model coordinates' . 7 SMTL 'reference database' . 8 PDB 'reference database' . 9 'AlphaFold DB' 'reference database' . 10 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 3 2 1 7 3 1 8 4 1 9 5 2 10 6 3 3 7 3 4 8 3 1 9 3 2 10 3 5 11 4 1 12 4 2 13 4 5 14 4 4 15 5 6 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 7 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-04 8 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-29 9 'AlphaFold DB' https://alphafold.ebi.ac.uk v4 . # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 3 'reference database' 2 4 . # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . B 2 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A 2 2 'reference database' non-polymer 1 2 B B 2 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 SDKPASTSGTGFGDKFKPAIGTWDCDTCLVQNKPEAVKCVACETPKPGTGVKR SDKPASTSGTGFGDKFKPAIGTWDCDTCLVQNKPEAVKCVACETPKPGTGVKR # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 9 49 # # loop_ _ma_template_non_poly.template_id _ma_template_non_poly.comp_id _ma_template_non_poly.details 2 ZN 'ZINC ION' # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 2k0c 2024-05-29 2 PDB . 2k0c 2024-05-29 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1506 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 5 1 1506 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 6.8e-07 95.122 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MASGAGGVGGGGGGKIRTRRCHQGPIKPYQQGRQQHQGILSRVTESVKNIVPGWLQRYFNKNEDVCSCSTDTSEVPRWPENKEDHLVYADEESSNITDGRITPEPAVSNTEEPSTTSTASNYPDVLTRPSLHRSHLNFSMLESPALHCQPSTSSAFPIGSSGFSLVKEIKDSTSQHDDDNISTTSGFSSRASDKDITVSKNTSLPPLWSPEAERSHSLSQHTATSSKKPAFNLSAFGTLSPSLGNSSILKTSQLGDSPFYPGKTTYGGAAAAVRQSKLRNTPYQAPVRRQMKAKQLSAQSYGVTSSTARRILQSLEKMSSPLADAKRIPSIVSSPLNSPLDRSGIDITDFQAKREKVDSQYPPVQRLMTPKPVSIATNRSVYFKPSLTPSGEFRKTNQRIDNKCSTGYEKNMTPGQNREQRESGFSYPNFSLPAANGLSSGVGGGGGKMRRERTRFVASKPLEEERQGLTVLPKLISSSCAQAIIPSWPLKVLRLQEMEVPVLPKISLPITSSSLPTFNFSSPEITTSSPSPINSSQALTNKVQMTSPSSTGSPMFKFSSPIVKSTEANVLPPSSIGFTFSVPVAKTAELSGSSSTLEPIISSSAHHVTTVNSTNCKKTPPEDCEGPFRPAEILKEGSVLDILKSPGFASPKIDSVAAQPTATSPVVYTRPAISSFSSSGIGFGESLKAGSSWQCDTCLLQNKVTDNKCIACQAAKLSPRDTAKQTGIETPNKSGKTTLSASGTGFGDKFKPVIGTWDCDTCLVQNKPEAIKCVACETPKPGTCVKRALTLTVVSESAETMTASSSSCTVTTGTLGFGDKFKRPIGSWECSVCCVSNNAEDNKCVSCMSEKPGSSVPASSSSTVPVSLPSGGSLGLEKFKKPEGSWDCELCLVQNKADSTKCLACESAKPGTKSGFKGFDTSSSSSNSAASSSFKFGVSSSSSGPSQTLTSTGNFKFGDQGGFKIGVSSDSGSINPMSEGFKFSKPIGDFKFGVSSESKPEEVKKDSKNDNFKFGLSSGLSNPVSLTPFQFGVSNLGQEEKKEELPKSSSAGFSFGTGVINSTPAPANTIVTSENKSSFNLGTIETKSASVAPFTCKTSEAKKEEMPATKGGFSFGNVEPASLPSASVFVLGRTEEKQQEPVTSTSLVFGKKADNEEPKCQPVFSFGNSEQTKDENSSKSTFSFSMTKPSEKESEQPAKATFAFGAQTSTTADQGAAKPVFSFLNNSSSSSSTPATSAGGGIFGSSTSSSNPPVATFVFGQSSNPVSSSAFGNTAESSTSQSLLFSQDSKLATTSSTGTAVTPFVFGPGASSNNTTTSGFGFGATTTSSSAGSSFVFGTGPSAPSASPAFGANQTPTFGQSQGASQPNPPGFGSISSSTALFPTGSQPAPPTFGTVSSSSQPPVFGQQPSQSAFGSGTTPNSSSAFQFGSSTTNFNFTNNSPSGVFTFGANSSTPAASAQPSGSGGFPFNQSPAAFTVGSNGKNVFSSSGTSFSGRKIKTAVRRRK 2 1 2 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GTGFGDKFKPAIGTWDCDTCLVQNKPEAVKCVACETPKPGT--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB & AlphaFold DB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 2k0c.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 2' . 6 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . VAL 753 753 ? A -9.695 -13.806 2.674 1 1 A VAL 0.390 1 ATOM 2 C CA . VAL 753 753 ? A -8.603 -12.785 2.874 1 1 A VAL 0.390 1 ATOM 3 C C . VAL 753 753 ? A -9.266 -11.497 3.295 1 1 A VAL 0.390 1 ATOM 4 O O . VAL 753 753 ? A -10.344 -11.210 2.793 1 1 A VAL 0.390 1 ATOM 5 C CB . VAL 753 753 ? A -7.819 -12.605 1.566 1 1 A VAL 0.390 1 ATOM 6 C CG1 . VAL 753 753 ? A -6.749 -11.491 1.661 1 1 A VAL 0.390 1 ATOM 7 C CG2 . VAL 753 753 ? A -7.116 -13.933 1.216 1 1 A VAL 0.390 1 ATOM 8 N N . ILE 754 754 ? A -8.685 -10.738 4.254 1 1 A ILE 0.460 1 ATOM 9 C CA . ILE 754 754 ? A -9.188 -9.444 4.706 1 1 A ILE 0.460 1 ATOM 10 C C . ILE 754 754 ? A -9.140 -8.381 3.606 1 1 A ILE 0.460 1 ATOM 11 O O . ILE 754 754 ? A -10.086 -7.625 3.402 1 1 A ILE 0.460 1 ATOM 12 C CB . ILE 754 754 ? A -8.369 -8.976 5.915 1 1 A ILE 0.460 1 ATOM 13 C CG1 . ILE 754 754 ? A -8.528 -9.942 7.119 1 1 A ILE 0.460 1 ATOM 14 C CG2 . ILE 754 754 ? A -8.791 -7.550 6.331 1 1 A ILE 0.460 1 ATOM 15 C CD1 . ILE 754 754 ? A -7.488 -9.703 8.225 1 1 A ILE 0.460 1 ATOM 16 N N . GLY 755 755 ? A -8.016 -8.319 2.856 1 1 A GLY 0.620 1 ATOM 17 C CA . GLY 755 755 ? A -7.791 -7.377 1.763 1 1 A GLY 0.620 1 ATOM 18 C C . GLY 755 755 ? A -6.974 -6.182 2.177 1 1 A GLY 0.620 1 ATOM 19 O O . GLY 755 755 ? A -6.625 -5.351 1.348 1 1 A GLY 0.620 1 ATOM 20 N N . THR 756 756 ? A -6.638 -6.079 3.478 1 1 A THR 0.620 1 ATOM 21 C CA . THR 756 756 ? A -5.996 -4.931 4.112 1 1 A THR 0.620 1 ATOM 22 C C . THR 756 756 ? A -4.701 -5.395 4.741 1 1 A THR 0.620 1 ATOM 23 O O . THR 756 756 ? A -4.562 -6.564 5.090 1 1 A THR 0.620 1 ATOM 24 C CB . THR 756 756 ? A -6.853 -4.206 5.169 1 1 A THR 0.620 1 ATOM 25 O OG1 . THR 756 756 ? A -7.121 -4.967 6.332 1 1 A THR 0.620 1 ATOM 26 C CG2 . THR 756 756 ? A -8.232 -3.882 4.588 1 1 A THR 0.620 1 ATOM 27 N N . TRP 757 757 ? A -3.688 -4.509 4.837 1 1 A TRP 0.570 1 ATOM 28 C CA . TRP 757 757 ? A -2.385 -4.902 5.321 1 1 A TRP 0.570 1 ATOM 29 C C . TRP 757 757 ? A -1.615 -3.693 5.811 1 1 A TRP 0.570 1 ATOM 30 O O . TRP 757 757 ? A -1.693 -2.607 5.253 1 1 A TRP 0.570 1 ATOM 31 C CB . TRP 757 757 ? A -1.541 -5.584 4.199 1 1 A TRP 0.570 1 ATOM 32 C CG . TRP 757 757 ? A -1.384 -4.734 2.917 1 1 A TRP 0.570 1 ATOM 33 C CD1 . TRP 757 757 ? A -2.324 -4.443 1.960 1 1 A TRP 0.570 1 ATOM 34 C CD2 . TRP 757 757 ? A -0.224 -3.959 2.618 1 1 A TRP 0.570 1 ATOM 35 N NE1 . TRP 757 757 ? A -1.810 -3.532 1.073 1 1 A TRP 0.570 1 ATOM 36 C CE2 . TRP 757 757 ? A -0.535 -3.212 1.426 1 1 A TRP 0.570 1 ATOM 37 C CE3 . TRP 757 757 ? A 1.003 -3.796 3.251 1 1 A TRP 0.570 1 ATOM 38 C CZ2 . TRP 757 757 ? A 0.392 -2.344 0.903 1 1 A TRP 0.570 1 ATOM 39 C CZ3 . TRP 757 757 ? A 1.955 -2.956 2.670 1 1 A TRP 0.570 1 ATOM 40 C CH2 . TRP 757 757 ? A 1.664 -2.268 1.476 1 1 A TRP 0.570 1 ATOM 41 N N . ASP 758 758 ? A -0.775 -3.890 6.836 1 1 A ASP 0.660 1 ATOM 42 C CA . ASP 758 758 ? A -0.051 -2.807 7.449 1 1 A ASP 0.660 1 ATOM 43 C C . ASP 758 758 ? A 1.428 -3.079 7.235 1 1 A ASP 0.660 1 ATOM 44 O O . ASP 758 758 ? A 1.892 -4.213 7.289 1 1 A ASP 0.660 1 ATOM 45 C CB . ASP 758 758 ? A -0.393 -2.688 8.961 1 1 A ASP 0.660 1 ATOM 46 C CG . ASP 758 758 ? A -1.819 -2.208 9.211 1 1 A ASP 0.660 1 ATOM 47 O OD1 . ASP 758 758 ? A -2.450 -1.658 8.278 1 1 A ASP 0.660 1 ATOM 48 O OD2 . ASP 758 758 ? A -2.245 -2.274 10.394 1 1 A ASP 0.660 1 ATOM 49 N N . CYS 759 759 ? A 2.200 -2.018 6.927 1 1 A CYS 0.650 1 ATOM 50 C CA . CYS 759 759 ? A 3.633 -2.064 6.725 1 1 A CYS 0.650 1 ATOM 51 C C . CYS 759 759 ? A 4.372 -1.819 8.042 1 1 A CYS 0.650 1 ATOM 52 O O . CYS 759 759 ? A 4.376 -0.725 8.603 1 1 A CYS 0.650 1 ATOM 53 C CB . CYS 759 759 ? A 4.074 -0.981 5.693 1 1 A CYS 0.650 1 ATOM 54 S SG . CYS 759 759 ? A 5.777 -1.159 5.137 1 1 A CYS 0.650 1 ATOM 55 N N . ASP 760 760 ? A 5.063 -2.851 8.555 1 1 A ASP 0.590 1 ATOM 56 C CA . ASP 760 760 ? A 5.736 -2.846 9.832 1 1 A ASP 0.590 1 ATOM 57 C C . ASP 760 760 ? A 7.188 -2.396 9.718 1 1 A ASP 0.590 1 ATOM 58 O O . ASP 760 760 ? A 7.815 -2.018 10.706 1 1 A ASP 0.590 1 ATOM 59 C CB . ASP 760 760 ? A 5.640 -4.280 10.429 1 1 A ASP 0.590 1 ATOM 60 C CG . ASP 760 760 ? A 6.091 -5.420 9.515 1 1 A ASP 0.590 1 ATOM 61 O OD1 . ASP 760 760 ? A 6.540 -5.160 8.367 1 1 A ASP 0.590 1 ATOM 62 O OD2 . ASP 760 760 ? A 5.942 -6.580 9.968 1 1 A ASP 0.590 1 ATOM 63 N N . THR 761 761 ? A 7.721 -2.348 8.475 1 1 A THR 0.620 1 ATOM 64 C CA . THR 761 761 ? A 9.102 -1.993 8.127 1 1 A THR 0.620 1 ATOM 65 C C . THR 761 761 ? A 9.426 -0.570 8.485 1 1 A THR 0.620 1 ATOM 66 O O . THR 761 761 ? A 10.562 -0.223 8.800 1 1 A THR 0.620 1 ATOM 67 C CB . THR 761 761 ? A 9.504 -2.223 6.659 1 1 A THR 0.620 1 ATOM 68 O OG1 . THR 761 761 ? A 8.839 -1.394 5.719 1 1 A THR 0.620 1 ATOM 69 C CG2 . THR 761 761 ? A 9.167 -3.665 6.282 1 1 A THR 0.620 1 ATOM 70 N N . CYS 762 762 ? A 8.391 0.283 8.417 1 1 A CYS 0.610 1 ATOM 71 C CA . CYS 762 762 ? A 8.504 1.705 8.574 1 1 A CYS 0.610 1 ATOM 72 C C . CYS 762 762 ? A 7.337 2.317 9.332 1 1 A CYS 0.610 1 ATOM 73 O O . CYS 762 762 ? A 7.229 3.540 9.378 1 1 A CYS 0.610 1 ATOM 74 C CB . CYS 762 762 ? A 8.613 2.362 7.170 1 1 A CYS 0.610 1 ATOM 75 S SG . CYS 762 762 ? A 7.215 2.100 6.053 1 1 A CYS 0.610 1 ATOM 76 N N . LEU 763 763 ? A 6.464 1.492 9.963 1 1 A LEU 0.530 1 ATOM 77 C CA . LEU 763 763 ? A 5.348 1.917 10.806 1 1 A LEU 0.530 1 ATOM 78 C C . LEU 763 763 ? A 4.234 2.642 10.049 1 1 A LEU 0.530 1 ATOM 79 O O . LEU 763 763 ? A 3.680 3.643 10.495 1 1 A LEU 0.530 1 ATOM 80 C CB . LEU 763 763 ? A 5.825 2.697 12.067 1 1 A LEU 0.530 1 ATOM 81 C CG . LEU 763 763 ? A 6.221 1.832 13.285 1 1 A LEU 0.530 1 ATOM 82 C CD1 . LEU 763 763 ? A 7.239 0.720 12.975 1 1 A LEU 0.530 1 ATOM 83 C CD2 . LEU 763 763 ? A 6.773 2.777 14.364 1 1 A LEU 0.530 1 ATOM 84 N N . VAL 764 764 ? A 3.851 2.121 8.869 1 1 A VAL 0.670 1 ATOM 85 C CA . VAL 764 764 ? A 2.944 2.800 7.957 1 1 A VAL 0.670 1 ATOM 86 C C . 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'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.598 2 1 3 0.004 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 753 VAL 1 0.390 2 1 A 754 ILE 1 0.460 3 1 A 755 GLY 1 0.620 4 1 A 756 THR 1 0.620 5 1 A 757 TRP 1 0.570 6 1 A 758 ASP 1 0.660 7 1 A 759 CYS 1 0.650 8 1 A 760 ASP 1 0.590 9 1 A 761 THR 1 0.620 10 1 A 762 CYS 1 0.610 11 1 A 763 LEU 1 0.530 12 1 A 764 VAL 1 0.670 13 1 A 765 GLN 1 0.620 14 1 A 766 ASN 1 0.670 15 1 A 767 LYS 1 0.670 16 1 A 768 PRO 1 0.670 17 1 A 769 GLU 1 0.640 18 1 A 770 ALA 1 0.680 19 1 A 771 ILE 1 0.580 20 1 A 772 LYS 1 0.590 21 1 A 773 CYS 1 0.610 22 1 A 774 VAL 1 0.560 23 1 A 775 ALA 1 0.620 24 1 A 776 CYS 1 0.630 25 1 A 777 GLU 1 0.640 26 1 A 778 THR 1 0.630 27 1 A 779 PRO 1 0.550 28 1 A 780 LYS 1 0.590 29 1 A 781 PRO 1 0.600 30 1 A 782 GLY 1 0.520 31 1 A 783 THR 1 0.470 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #