data_SMR-59eaa743e905ae1f5992039fa13c5c2f_1 _entry.id SMR-59eaa743e905ae1f5992039fa13c5c2f_1 _struct.entry_id SMR-59eaa743e905ae1f5992039fa13c5c2f_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled homo-tetramer covers following UniProtKB entries: - A0A2J8K4G1/ A0A2J8K4G1_PANTR, ZFC3H1 isoform 4 - O60293 (isoform 2)/ ZC3H1_HUMAN, Zinc finger C3H1 domain-containing protein Estimated model accuracy of this model is 0.002, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries A0A2J8K4G1, O60293 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' UNK 'L-peptide linking' UNKNOWN . . 'CCD local' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 44119.349 4 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP A0A2J8K4G1_PANTR A0A2J8K4G1 1 ;MATADTPAPASSGLSPKEEGELEDGEISDDDNNSQIRSRSSSSSSGGGLLPYPRRRPPHSARGGGSGGGG GSSSSSSSSQQQLRNFSRSRHASERGHLRGPSSYRPKEPFRSHPPSVRMPSSSLSESSPRPSFWERSHLA LDRFRFRGRPYRGGSRWSRGRGVGERGGKPGCRPPLGGGAGSGFSSSQSWREPSPPRKSSKSFGRSPSRK QNYSSKNENCVEETFEDLLLKYKQIQLELECINKDEKLALSSKEENVQEDPKTLNFEDQTSTDNVSITKD SSKEVAPEEKTQVKTFQAFELKPLRQKLTLPGDKNRLKKVKDGAKPLSLKSDTTDSSQGNGIKYFS ; 'ZFC3H1 isoform 4' 2 1 UNP ZC3H1_HUMAN O60293 1 ;MATADTPAPASSGLSPKEEGELEDGEISDDDNNSQIRSRSSSSSSGGGLLPYPRRRPPHSARGGGSGGGG GSSSSSSSSQQQLRNFSRSRHASERGHLRGPSSYRPKEPFRSHPPSVRMPSSSLSESSPRPSFWERSHLA LDRFRFRGRPYRGGSRWSRGRGVGERGGKPGCRPPLGGGAGSGFSSSQSWREPSPPRKSSKSFGRSPSRK QNYSSKNENCVEETFEDLLLKYKQIQLELECINKDEKLALSSKEENVQEDPKTLNFEDQTSTDNVSITKD SSKEVAPEEKTQVKTFQAFELKPLRQKLTLPGDKNRLKKVKDGAKPLSLKSDTTDSSQGNGIKYFS ; 'Zinc finger C3H1 domain-containing protein' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 346 1 346 2 2 1 346 1 346 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . A0A2J8K4G1_PANTR A0A2J8K4G1 . 1 346 9598 'Pan troglodytes (Chimpanzee)' 2018-03-28 1451AF85D85AB236 1 UNP . ZC3H1_HUMAN O60293 O60293-2 1 346 9606 'Homo sapiens (Human)' 2007-05-01 1451AF85D85AB236 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A,B,C,D ;MATADTPAPASSGLSPKEEGELEDGEISDDDNNSQIRSRSSSSSSGGGLLPYPRRRPPHSARGGGSGGGG GSSSSSSSSQQQLRNFSRSRHASERGHLRGPSSYRPKEPFRSHPPSVRMPSSSLSESSPRPSFWERSHLA LDRFRFRGRPYRGGSRWSRGRGVGERGGKPGCRPPLGGGAGSGFSSSQSWREPSPPRKSSKSFGRSPSRK QNYSSKNENCVEETFEDLLLKYKQIQLELECINKDEKLALSSKEENVQEDPKTLNFEDQTSTDNVSITKD SSKEVAPEEKTQVKTFQAFELKPLRQKLTLPGDKNRLKKVKDGAKPLSLKSDTTDSSQGNGIKYFS ; ;MATADTPAPASSGLSPKEEGELEDGEISDDDNNSQIRSRSSSSSSGGGLLPYPRRRPPHSARGGGSGGGG GSSSSSSSSQQQLRNFSRSRHASERGHLRGPSSYRPKEPFRSHPPSVRMPSSSLSESSPRPSFWERSHLA LDRFRFRGRPYRGGSRWSRGRGVGERGGKPGCRPPLGGGAGSGFSSSQSWREPSPPRKSSKSFGRSPSRK QNYSSKNENCVEETFEDLLLKYKQIQLELECINKDEKLALSSKEENVQEDPKTLNFEDQTSTDNVSITKD SSKEVAPEEKTQVKTFQAFELKPLRQKLTLPGDKNRLKKVKDGAKPLSLKSDTTDSSQGNGIKYFS ; 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D 1 70 GLY 70 ? ? ? D . D 1 71 GLY 71 ? ? ? D . D 1 72 SER 72 ? ? ? D . D 1 73 SER 73 ? ? ? D . D 1 74 SER 74 ? ? ? D . D 1 75 SER 75 ? ? ? D . D 1 76 SER 76 ? ? ? D . D 1 77 SER 77 ? ? ? D . D 1 78 SER 78 ? ? ? D . D 1 79 SER 79 ? ? ? D . D 1 80 GLN 80 ? ? ? D . D 1 81 GLN 81 ? ? ? D . D 1 82 GLN 82 ? ? ? D . D 1 83 LEU 83 ? ? ? D . D 1 84 ARG 84 ? ? ? D . D 1 85 ASN 85 ? ? ? D . D 1 86 PHE 86 ? ? ? D . D 1 87 SER 87 ? ? ? D . D 1 88 ARG 88 ? ? ? D . D 1 89 SER 89 ? ? ? D . D 1 90 ARG 90 ? ? ? D . D 1 91 HIS 91 ? ? ? D . D 1 92 ALA 92 ? ? ? D . D 1 93 SER 93 ? ? ? D . D 1 94 GLU 94 ? ? ? D . D 1 95 ARG 95 ? ? ? D . D 1 96 GLY 96 ? ? ? D . D 1 97 HIS 97 ? ? ? D . D 1 98 LEU 98 ? ? ? D . D 1 99 ARG 99 ? ? ? D . D 1 100 GLY 100 ? ? ? D . D 1 101 PRO 101 ? ? ? D . D 1 102 SER 102 ? ? ? D . D 1 103 SER 103 ? ? ? D . D 1 104 TYR 104 ? ? ? D . D 1 105 ARG 105 ? ? ? D . D 1 106 PRO 106 ? ? ? D . D 1 107 LYS 107 ? ? ? D . D 1 108 GLU 108 ? ? ? D . D 1 109 PRO 109 ? ? ? D . 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B 1 . C 1 . D 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A 2 2 'reference database' polymer 1 2 B B 1 1 B 3 3 'reference database' polymer 1 3 C A 1 1 A 4 4 'reference database' polymer 1 4 D B 1 1 B # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 RMKQIED(UNK)EEILSKLYHIENELARIKKLLGER RMKQIEDXEEILSKLYHIENELARIKKLLGER 2 RMKQIED(UNK)EEILSKLYHIENELARIKKLLGER RMKQIEDXEEILSKLYHIENELARIKKLLGER 3 RMKQIED(UNK)EEILSKLYHIENELARIKKLLGER RMKQIEDXEEILSKLYHIENELARIKKLLGER 4 RMKQIED(UNK)EEILSKLYHIENELARIKKLLGER RMKQIEDXEEILSKLYHIENELARIKKLLGER # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 5 27 2 2 5 27 3 3 5 27 4 4 5 27 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 1u9g 2011-07-13 2 PDB . 1u9g 2011-07-13 3 PDB . 1u9g 2011-07-13 4 PDB . 1u9g 2011-07-13 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 346 2 2 B 1 346 3 3 C 1 346 4 4 D 1 346 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 6 1 346 'target-template pairwise alignment' local 2 7 1 346 'target-template pairwise alignment' local 3 8 1 346 'target-template pairwise alignment' local 4 9 1 346 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 25.000 39.130 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . 2 2 2 B 'HHblits e-value' . 25.000 39.130 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . 3 3 3 C 'HHblits e-value' . 25.000 39.130 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . 4 4 4 D 'HHblits e-value' . 25.000 39.130 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MATADTPAPASSGLSPKEEGELEDGEISDDDNNSQIRSRSSSSSSGGGLLPYPRRRPPHSARGGGSGGGGGSSSSSSSSQQQLRNFSRSRHASERGHLRGPSSYRPKEPFRSHPPSVRMPSSSLSESSPRPSFWERSHLALDRFRFRGRPYRGGSRWSRGRGVGERGGKPGCRPPLGGGAGSGFSSSQSWREPSPPRKSSKSFGRSPSRKQNYSSKNENCVEETFEDLLLKYKQIQLELECINKDEKLALSSKEENVQEDPKTLNFEDQTSTDNVSITKDSSKEVAPEEKTQVKTFQAFELKPLRQKLTLPGDKNRLKKVKDGAKPLSLKSDTTDSSQGNGIKYFS 2 1 2 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------IED-XEEILSKLYHIENELARIKK------------------------------------------------------------------------------------------------------ 3 2 1 MATADTPAPASSGLSPKEEGELEDGEISDDDNNSQIRSRSSSSSSGGGLLPYPRRRPPHSARGGGSGGGGGSSSSSSSSQQQLRNFSRSRHASERGHLRGPSSYRPKEPFRSHPPSVRMPSSSLSESSPRPSFWERSHLALDRFRFRGRPYRGGSRWSRGRGVGERGGKPGCRPPLGGGAGSGFSSSQSWREPSPPRKSSKSFGRSPSRKQNYSSKNENCVEETFEDLLLKYKQIQLELECINKDEKLALSSKEENVQEDPKTLNFEDQTSTDNVSITKDSSKEVAPEEKTQVKTFQAFELKPLRQKLTLPGDKNRLKKVKDGAKPLSLKSDTTDSSQGNGIKYFS 4 2 2 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------IED-XEEILSKLYHIENELARIKK------------------------------------------------------------------------------------------------------ 5 3 1 MATADTPAPASSGLSPKEEGELEDGEISDDDNNSQIRSRSSSSSSGGGLLPYPRRRPPHSARGGGSGGGGGSSSSSSSSQQQLRNFSRSRHASERGHLRGPSSYRPKEPFRSHPPSVRMPSSSLSESSPRPSFWERSHLALDRFRFRGRPYRGGSRWSRGRGVGERGGKPGCRPPLGGGAGSGFSSSQSWREPSPPRKSSKSFGRSPSRKQNYSSKNENCVEETFEDLLLKYKQIQLELECINKDEKLALSSKEENVQEDPKTLNFEDQTSTDNVSITKDSSKEVAPEEKTQVKTFQAFELKPLRQKLTLPGDKNRLKKVKDGAKPLSLKSDTTDSSQGNGIKYFS 6 3 2 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------IED-XEEILSKLYHIENELARIKK------------------------------------------------------------------------------------------------------ 7 4 1 MATADTPAPASSGLSPKEEGELEDGEISDDDNNSQIRSRSSSSSSGGGLLPYPRRRPPHSARGGGSGGGGGSSSSSSSSQQQLRNFSRSRHASERGHLRGPSSYRPKEPFRSHPPSVRMPSSSLSESSPRPSFWERSHLALDRFRFRGRPYRGGSRWSRGRGVGERGGKPGCRPPLGGGAGSGFSSSQSWREPSPPRKSSKSFGRSPSRKQNYSSKNENCVEETFEDLLLKYKQIQLELECINKDEKLALSSKEENVQEDPKTLNFEDQTSTDNVSITKDSSKEVAPEEKTQVKTFQAFELKPLRQKLTLPGDKNRLKKVKDGAKPLSLKSDTTDSSQGNGIKYFS 8 4 2 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------IED-XEEILSKLYHIENELARIKK------------------------------------------------------------------------------------------------------ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.298}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 1u9g.1, oligomeric state (homo-tetramer) as predicted' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 1' . 10 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . PHE 225 225 ? A 22.715 3.740 6.430 1 1 A PHE 0.500 1 ATOM 2 C CA . PHE 225 225 ? A 22.144 4.830 7.271 1 1 A PHE 0.500 1 ATOM 3 C C . PHE 225 225 ? A 20.658 4.690 7.103 1 1 A PHE 0.500 1 ATOM 4 O O . PHE 225 225 ? A 20.144 4.795 6.010 1 1 A PHE 0.500 1 ATOM 5 C CB . PHE 225 225 ? A 22.534 6.266 6.834 1 1 A PHE 0.500 1 ATOM 6 C CG . PHE 225 225 ? A 23.981 6.648 6.991 1 1 A PHE 0.500 1 ATOM 7 C CD1 . PHE 225 225 ? A 24.660 6.455 8.207 1 1 A PHE 0.500 1 ATOM 8 C CD2 . PHE 225 225 ? A 24.610 7.396 5.978 1 1 A PHE 0.500 1 ATOM 9 C CE1 . PHE 225 225 ? A 25.918 7.036 8.420 1 1 A PHE 0.500 1 ATOM 10 C CE2 . PHE 225 225 ? A 25.863 7.983 6.192 1 1 A PHE 0.500 1 ATOM 11 C CZ . PHE 225 225 ? A 26.516 7.804 7.416 1 1 A PHE 0.500 1 ATOM 12 N N . GLU 226 226 ? A 19.995 4.305 8.193 1 1 A GLU 0.530 1 ATOM 13 C CA . GLU 226 226 ? A 18.734 3.621 8.134 1 1 A GLU 0.530 1 ATOM 14 C C . GLU 226 226 ? A 17.537 4.439 7.736 1 1 A GLU 0.530 1 ATOM 15 O O . GLU 226 226 ? A 16.812 4.026 6.831 1 1 A GLU 0.530 1 ATOM 16 C CB . GLU 226 226 ? A 18.589 2.834 9.446 1 1 A GLU 0.530 1 ATOM 17 C CG . GLU 226 226 ? A 19.882 2.018 9.781 1 1 A GLU 0.530 1 ATOM 18 C CD . GLU 226 226 ? A 20.645 1.472 8.556 1 1 A GLU 0.530 1 ATOM 19 O OE1 . GLU 226 226 ? A 21.666 2.098 8.151 1 1 A GLU 0.530 1 ATOM 20 O OE2 . GLU 226 226 ? A 20.190 0.479 7.960 1 1 A GLU 0.530 1 ATOM 21 N N . ASP 227 227 ? A 17.330 5.657 8.272 1 1 A ASP 0.640 1 ATOM 22 C CA . ASP 227 227 ? A 16.249 6.522 7.823 1 1 A ASP 0.640 1 ATOM 23 C C . ASP 227 227 ? A 16.350 6.860 6.343 1 1 A ASP 0.640 1 ATOM 24 O O . ASP 227 227 ? A 15.378 6.831 5.594 1 1 A ASP 0.640 1 ATOM 25 C CB . ASP 227 227 ? A 16.295 7.867 8.578 1 1 A ASP 0.640 1 ATOM 26 C CG . ASP 227 227 ? A 15.987 7.670 10.046 1 1 A ASP 0.640 1 ATOM 27 O OD1 . ASP 227 227 ? A 15.211 6.741 10.370 1 1 A ASP 0.640 1 ATOM 28 O OD2 . ASP 227 227 ? A 16.540 8.473 10.836 1 1 A ASP 0.640 1 ATOM 29 N N . LEU 228 228 ? A 17.587 7.153 5.896 1 1 A LEU 0.690 1 ATOM 30 C CA . LEU 228 228 ? A 17.917 7.526 4.536 1 1 A LEU 0.690 1 ATOM 31 C C . LEU 228 228 ? A 17.603 6.407 3.552 1 1 A LEU 0.690 1 ATOM 32 O O . LEU 228 228 ? A 16.967 6.615 2.520 1 1 A LEU 0.690 1 ATOM 33 C CB . LEU 228 228 ? A 19.427 7.911 4.433 1 1 A LEU 0.690 1 ATOM 34 C CG . LEU 228 228 ? A 19.950 8.935 5.475 1 1 A LEU 0.690 1 ATOM 35 C CD1 . LEU 228 228 ? A 21.340 9.458 5.075 1 1 A LEU 0.690 1 ATOM 36 C CD2 . LEU 228 228 ? A 19.012 10.132 5.571 1 1 A LEU 0.690 1 ATOM 37 N N . LEU 229 229 ? A 17.996 5.172 3.911 1 1 A LEU 0.700 1 ATOM 38 C CA . LEU 229 229 ? A 17.708 3.945 3.199 1 1 A LEU 0.700 1 ATOM 39 C C . LEU 229 229 ? A 16.229 3.566 3.212 1 1 A LEU 0.700 1 ATOM 40 O O . LEU 229 229 ? A 15.667 3.132 2.206 1 1 A LEU 0.700 1 ATOM 41 C CB . LEU 229 229 ? A 18.582 2.819 3.799 1 1 A LEU 0.700 1 ATOM 42 C CG . LEU 229 229 ? A 18.578 1.477 3.040 1 1 A LEU 0.700 1 ATOM 43 C CD1 . LEU 229 229 ? A 18.950 1.625 1.555 1 1 A LEU 0.700 1 ATOM 44 C CD2 . LEU 229 229 ? A 19.538 0.497 3.728 1 1 A LEU 0.700 1 ATOM 45 N N . LEU 230 230 ? A 15.540 3.752 4.356 1 1 A LEU 0.660 1 ATOM 46 C CA . LEU 230 230 ? A 14.113 3.523 4.500 1 1 A LEU 0.660 1 ATOM 47 C C . LEU 230 230 ? A 13.243 4.395 3.604 1 1 A LEU 0.660 1 ATOM 48 O O . LEU 230 230 ? A 12.356 3.885 2.922 1 1 A LEU 0.660 1 ATOM 49 C CB . LEU 230 230 ? A 13.683 3.739 5.970 1 1 A LEU 0.660 1 ATOM 50 C CG . LEU 230 230 ? A 12.198 3.451 6.281 1 1 A LEU 0.660 1 ATOM 51 C CD1 . LEU 230 230 ? A 11.826 1.984 6.013 1 1 A LEU 0.660 1 ATOM 52 C CD2 . LEU 230 230 ? A 11.895 3.826 7.738 1 1 A LEU 0.660 1 ATOM 53 N N . LYS 231 231 ? A 13.512 5.723 3.516 1 1 A LYS 0.690 1 ATOM 54 C CA . LYS 231 231 ? A 12.799 6.627 2.611 1 1 A LYS 0.690 1 ATOM 55 C C . LYS 231 231 ? A 12.974 6.214 1.167 1 1 A LYS 0.690 1 ATOM 56 O O . LYS 231 231 ? A 12.098 6.354 0.323 1 1 A LYS 0.690 1 ATOM 57 C CB . LYS 231 231 ? A 13.260 8.112 2.746 1 1 A LYS 0.690 1 ATOM 58 C CG . LYS 231 231 ? A 13.072 8.738 4.140 1 1 A LYS 0.690 1 ATOM 59 C CD . LYS 231 231 ? A 11.660 8.568 4.716 1 1 A LYS 0.690 1 ATOM 60 C CE . LYS 231 231 ? A 11.605 8.824 6.219 1 1 A LYS 0.690 1 ATOM 61 N NZ . LYS 231 231 ? A 10.301 8.353 6.726 1 1 A LYS 0.690 1 ATOM 62 N N . TYR 232 232 ? A 14.156 5.681 0.874 1 1 A TYR 0.710 1 ATOM 63 C CA . TYR 232 232 ? A 14.600 5.208 -0.408 1 1 A TYR 0.710 1 ATOM 64 C C . TYR 232 232 ? A 13.993 3.925 -0.883 1 1 A TYR 0.710 1 ATOM 65 O O . TYR 232 232 ? A 13.686 3.774 -2.061 1 1 A TYR 0.710 1 ATOM 66 C CB . TYR 232 232 ? A 16.138 5.167 -0.374 1 1 A TYR 0.710 1 ATOM 67 C CG . TYR 232 232 ? A 16.594 6.425 -1.031 1 1 A TYR 0.710 1 ATOM 68 C CD1 . TYR 232 232 ? A 15.955 7.669 -0.853 1 1 A TYR 0.710 1 ATOM 69 C CD2 . TYR 232 232 ? A 17.532 6.307 -2.042 1 1 A TYR 0.710 1 ATOM 70 C CE1 . TYR 232 232 ? A 16.109 8.689 -1.793 1 1 A TYR 0.710 1 ATOM 71 C CE2 . TYR 232 232 ? A 17.700 7.334 -2.961 1 1 A TYR 0.710 1 ATOM 72 C CZ . TYR 232 232 ? A 17.009 8.541 -2.833 1 1 A TYR 0.710 1 ATOM 73 O OH . TYR 232 232 ? A 17.240 9.643 -3.673 1 1 A TYR 0.710 1 ATOM 74 N N . LYS 233 233 ? A 13.733 2.977 0.022 1 1 A LYS 0.680 1 ATOM 75 C CA . LYS 233 233 ? A 12.866 1.870 -0.285 1 1 A LYS 0.680 1 ATOM 76 C C . LYS 233 233 ? A 11.454 2.351 -0.626 1 1 A LYS 0.680 1 ATOM 77 O O . LYS 233 233 ? A 10.851 1.887 -1.585 1 1 A LYS 0.680 1 ATOM 78 C CB . LYS 233 233 ? A 12.876 0.901 0.910 1 1 A LYS 0.680 1 ATOM 79 C CG . LYS 233 233 ? A 12.042 -0.354 0.650 1 1 A LYS 0.680 1 ATOM 80 C CD . LYS 233 233 ? A 12.050 -1.321 1.837 1 1 A LYS 0.680 1 ATOM 81 C CE . LYS 233 233 ? A 11.070 -2.476 1.631 1 1 A LYS 0.680 1 ATOM 82 N NZ . LYS 233 233 ? A 11.082 -3.366 2.810 1 1 A LYS 0.680 1 ATOM 83 N N . GLN 234 234 ? A 10.920 3.345 0.112 1 1 A GLN 0.670 1 ATOM 84 C CA . GLN 234 234 ? A 9.634 3.963 -0.189 1 1 A GLN 0.670 1 ATOM 85 C C . GLN 234 234 ? A 9.586 4.670 -1.553 1 1 A GLN 0.670 1 ATOM 86 O O . GLN 234 234 ? A 8.711 4.374 -2.360 1 1 A GLN 0.670 1 ATOM 87 C CB . GLN 234 234 ? A 9.205 4.914 0.971 1 1 A GLN 0.670 1 ATOM 88 C CG . GLN 234 234 ? A 9.076 4.164 2.325 1 1 A GLN 0.670 1 ATOM 89 C CD . GLN 234 234 ? A 8.787 5.051 3.547 1 1 A GLN 0.670 1 ATOM 90 O OE1 . GLN 234 234 ? A 9.411 6.067 3.855 1 1 A GLN 0.670 1 ATOM 91 N NE2 . GLN 234 234 ? A 7.802 4.589 4.358 1 1 A GLN 0.670 1 ATOM 92 N N . ILE 235 235 ? A 10.576 5.532 -1.878 1 1 A ILE 0.740 1 ATOM 93 C CA . ILE 235 235 ? A 10.708 6.226 -3.161 1 1 A ILE 0.740 1 ATOM 94 C C . ILE 235 235 ? A 10.883 5.278 -4.346 1 1 A ILE 0.740 1 ATOM 95 O O . ILE 235 235 ? A 10.231 5.434 -5.378 1 1 A ILE 0.740 1 ATOM 96 C CB . ILE 235 235 ? A 11.846 7.260 -3.088 1 1 A ILE 0.740 1 ATOM 97 C CG1 . ILE 235 235 ? A 11.368 8.469 -2.241 1 1 A ILE 0.740 1 ATOM 98 C CG2 . ILE 235 235 ? A 12.330 7.713 -4.490 1 1 A ILE 0.740 1 ATOM 99 C CD1 . ILE 235 235 ? 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B 20.999 7.625 -13.794 1 1 B GLN 0.700 1 ATOM 282 N NE2 . GLN 236 236 ? B 19.348 8.677 -14.943 1 1 B GLN 0.700 1 ATOM 283 N N . LEU 237 237 ? B 17.825 5.563 -12.756 1 1 B LEU 0.700 1 ATOM 284 C CA . LEU 237 237 ? B 17.486 4.657 -13.847 1 1 B LEU 0.700 1 ATOM 285 C C . LEU 237 237 ? B 15.983 4.411 -14.009 1 1 B LEU 0.700 1 ATOM 286 O O . LEU 237 237 ? B 15.464 4.380 -15.125 1 1 B LEU 0.700 1 ATOM 287 C CB . LEU 237 237 ? B 18.231 3.307 -13.705 1 1 B LEU 0.700 1 ATOM 288 C CG . LEU 237 237 ? B 19.764 3.409 -13.863 1 1 B LEU 0.700 1 ATOM 289 C CD1 . LEU 237 237 ? B 20.420 2.088 -13.432 1 1 B LEU 0.700 1 ATOM 290 C CD2 . LEU 237 237 ? B 20.186 3.797 -15.290 1 1 B LEU 0.700 1 ATOM 291 N N . GLU 238 238 ? B 15.221 4.269 -12.902 1 1 B GLU 0.710 1 ATOM 292 C CA . GLU 238 238 ? B 13.765 4.215 -12.926 1 1 B GLU 0.710 1 ATOM 293 C C . GLU 238 238 ? B 13.150 5.489 -13.497 1 1 B GLU 0.710 1 ATOM 294 O O . GLU 238 238 ? B 12.258 5.433 -14.345 1 1 B GLU 0.710 1 ATOM 295 C CB . GLU 238 238 ? 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B 15.240 7.574 -17.003 1 1 B GLU 0.660 1 ATOM 310 C C . GLU 240 240 ? B 14.298 6.714 -17.837 1 1 B GLU 0.660 1 ATOM 311 O O . GLU 240 240 ? B 13.886 7.098 -18.930 1 1 B GLU 0.660 1 ATOM 312 C CB . GLU 240 240 ? B 16.684 7.061 -17.222 1 1 B GLU 0.660 1 ATOM 313 C CG . GLU 240 240 ? B 17.168 7.245 -18.684 1 1 B GLU 0.660 1 ATOM 314 C CD . GLU 240 240 ? B 18.466 6.507 -18.983 1 1 B GLU 0.660 1 ATOM 315 O OE1 . GLU 240 240 ? B 18.447 5.713 -19.970 1 1 B GLU 0.660 1 ATOM 316 O OE2 . GLU 240 240 ? B 19.464 6.735 -18.267 1 1 B GLU 0.660 1 ATOM 317 N N . CYS 241 241 ? B 13.890 5.536 -17.330 1 1 B CYS 0.600 1 ATOM 318 C CA . CYS 241 241 ? B 12.859 4.710 -17.942 1 1 B CYS 0.600 1 ATOM 319 C C . CYS 241 241 ? B 11.474 5.358 -17.981 1 1 B CYS 0.600 1 ATOM 320 O O . CYS 241 241 ? B 10.753 5.192 -18.953 1 1 B CYS 0.600 1 ATOM 321 C CB . CYS 241 241 ? B 12.788 3.312 -17.280 1 1 B CYS 0.600 1 ATOM 322 S SG . CYS 241 241 ? B 14.294 2.331 -17.606 1 1 B CYS 0.600 1 ATOM 323 N N . ILE 242 242 ? B 11.071 6.112 -16.935 1 1 B ILE 0.610 1 ATOM 324 C CA . ILE 242 242 ? B 9.859 6.942 -16.916 1 1 B ILE 0.610 1 ATOM 325 C C . ILE 242 242 ? B 9.920 8.149 -17.866 1 1 B ILE 0.610 1 ATOM 326 O O . ILE 242 242 ? B 8.903 8.579 -18.402 1 1 B ILE 0.610 1 ATOM 327 C CB . ILE 242 242 ? B 9.511 7.354 -15.477 1 1 B ILE 0.610 1 ATOM 328 C CG1 . ILE 242 242 ? B 9.077 6.103 -14.672 1 1 B ILE 0.610 1 ATOM 329 C CG2 . ILE 242 242 ? B 8.397 8.427 -15.428 1 1 B ILE 0.610 1 ATOM 330 C CD1 . ILE 242 242 ? B 9.136 6.302 -13.154 1 1 B ILE 0.610 1 ATOM 331 N N . ASN 243 243 ? B 11.114 8.729 -18.113 1 1 B ASN 0.510 1 ATOM 332 C CA . ASN 243 243 ? B 11.311 9.828 -19.053 1 1 B ASN 0.510 1 ATOM 333 C C . ASN 243 243 ? B 11.194 9.432 -20.531 1 1 B ASN 0.510 1 ATOM 334 O O . ASN 243 243 ? B 11.135 10.308 -21.390 1 1 B ASN 0.510 1 ATOM 335 C CB . ASN 243 243 ? B 12.746 10.429 -18.926 1 1 B ASN 0.510 1 ATOM 336 C CG . ASN 243 243 ? B 12.955 11.216 -17.637 1 1 B ASN 0.510 1 ATOM 337 O OD1 . ASN 243 243 ? B 12.052 11.859 -17.111 1 1 B ASN 0.510 1 ATOM 338 N ND2 . ASN 243 243 ? B 14.220 11.234 -17.147 1 1 B ASN 0.510 1 ATOM 339 N N . LYS 244 244 ? B 11.242 8.125 -20.849 1 1 B LYS 0.440 1 ATOM 340 C CA . LYS 244 244 ? B 11.210 7.611 -22.208 1 1 B LYS 0.440 1 ATOM 341 C C . LYS 244 244 ? B 9.810 7.161 -22.704 1 1 B LYS 0.440 1 ATOM 342 O O . LYS 244 244 ? B 8.838 7.110 -21.909 1 1 B LYS 0.440 1 ATOM 343 C CB . LYS 244 244 ? B 12.147 6.383 -22.321 1 1 B LYS 0.440 1 ATOM 344 C CG . LYS 244 244 ? B 13.634 6.749 -22.269 1 1 B LYS 0.440 1 ATOM 345 C CD . LYS 244 244 ? B 14.535 5.506 -22.240 1 1 B LYS 0.440 1 ATOM 346 C CE . LYS 244 244 ? B 16.018 5.880 -22.190 1 1 B LYS 0.440 1 ATOM 347 N NZ . LYS 244 244 ? B 16.836 4.724 -21.780 1 1 B LYS 0.440 1 ATOM 348 O OXT . LYS 244 244 ? B 9.729 6.830 -23.923 1 1 B LYS 0.440 1 ATOM 349 N N . PHE 225 225 ? C 26.054 15.877 3.188 1 1 C PHE 0.480 1 ATOM 350 C CA . PHE 225 225 ? C 26.891 14.791 2.604 1 1 C PHE 0.480 1 ATOM 351 C C . PHE 225 225 ? C 26.707 14.970 1.124 1 1 C PHE 0.480 1 ATOM 352 O O . PHE 225 225 ? C 25.596 15.005 0.652 1 1 C PHE 0.480 1 ATOM 353 C CB . PHE 225 225 ? C 26.434 13.357 2.970 1 1 C PHE 0.480 1 ATOM 354 C CG . PHE 225 225 ? C 26.582 12.942 4.414 1 1 C PHE 0.480 1 ATOM 355 C CD1 . PHE 225 225 ? C 27.792 13.130 5.105 1 1 C PHE 0.480 1 ATOM 356 C CD2 . PHE 225 225 ? C 25.569 12.180 5.030 1 1 C PHE 0.480 1 ATOM 357 C CE1 . PHE 225 225 ? C 27.996 12.541 6.360 1 1 C PHE 0.480 1 ATOM 358 C CE2 . PHE 225 225 ? C 25.775 11.585 6.280 1 1 C PHE 0.480 1 ATOM 359 C CZ . PHE 225 225 ? C 26.991 11.764 6.945 1 1 C PHE 0.480 1 ATOM 360 N N . GLU 226 226 ? C 27.804 15.246 0.420 1 1 C GLU 0.510 1 ATOM 361 C CA . GLU 226 226 ? C 27.751 15.956 -0.832 1 1 C GLU 0.510 1 ATOM 362 C C . GLU 226 226 ? C 27.405 15.143 -2.051 1 1 C GLU 0.510 1 ATOM 363 O O . GLU 226 226 ? C 26.487 15.534 -2.779 1 1 C GLU 0.510 1 ATOM 364 C CB . GLU 226 226 ? C 29.051 16.767 -0.950 1 1 C GLU 0.510 1 ATOM 365 C CG . GLU 226 226 ? 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C 23.402 13.214 -2.034 1 1 C LEU 0.670 1 ATOM 380 O O . LEU 228 228 ? C 22.487 13.032 -2.834 1 1 C LEU 0.670 1 ATOM 381 C CB . LEU 228 228 ? C 24.340 11.812 -0.136 1 1 C LEU 0.670 1 ATOM 382 C CG . LEU 228 228 ? C 25.245 10.658 0.370 1 1 C LEU 0.670 1 ATOM 383 C CD1 . LEU 228 228 ? C 24.845 10.232 1.792 1 1 C LEU 0.670 1 ATOM 384 C CD2 . LEU 228 228 ? C 25.150 9.423 -0.514 1 1 C LEU 0.670 1 ATOM 385 N N . LEU 229 229 ? C 23.659 14.447 -1.556 1 1 C LEU 0.680 1 ATOM 386 C CA . LEU 229 229 ? C 22.854 15.629 -1.819 1 1 C LEU 0.680 1 ATOM 387 C C . LEU 229 229 ? C 22.772 16.008 -3.291 1 1 C LEU 0.680 1 ATOM 388 O O . LEU 229 229 ? C 21.716 16.386 -3.805 1 1 C LEU 0.680 1 ATOM 389 C CB . LEU 229 229 ? C 23.430 16.817 -1.013 1 1 C LEU 0.680 1 ATOM 390 C CG . LEU 229 229 ? C 22.601 18.118 -1.002 1 1 C LEU 0.680 1 ATOM 391 C CD1 . LEU 229 229 ? C 21.129 17.901 -0.611 1 1 C LEU 0.680 1 ATOM 392 C CD2 . LEU 229 229 ? C 23.260 19.118 -0.040 1 1 C LEU 0.680 1 ATOM 393 N N . LEU 230 230 ? 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C 21.050 10.732 0.127 1 1 C TYR 0.720 1 ATOM 422 N N . LYS 233 233 ? C 19.360 16.418 -5.736 1 1 C LYS 0.690 1 ATOM 423 C CA . LYS 233 233 ? C 19.137 17.553 -6.597 1 1 C LYS 0.690 1 ATOM 424 C C . LYS 233 233 ? C 18.857 17.113 -8.030 1 1 C LYS 0.690 1 ATOM 425 O O . LYS 233 233 ? C 17.923 17.597 -8.655 1 1 C LYS 0.690 1 ATOM 426 C CB . LYS 233 233 ? C 20.347 18.517 -6.549 1 1 C LYS 0.690 1 ATOM 427 C CG . LYS 233 233 ? C 20.132 19.774 -7.407 1 1 C LYS 0.690 1 ATOM 428 C CD . LYS 233 233 ? C 21.333 20.731 -7.413 1 1 C LYS 0.690 1 ATOM 429 C CE . LYS 233 233 ? C 21.132 21.881 -8.406 1 1 C LYS 0.690 1 ATOM 430 N NZ . LYS 233 233 ? C 22.308 22.778 -8.405 1 1 C LYS 0.690 1 ATOM 431 N N . GLN 234 234 ? C 19.616 16.133 -8.564 1 1 C GLN 0.670 1 ATOM 432 C CA . GLN 234 234 ? C 19.343 15.546 -9.869 1 1 C GLN 0.670 1 ATOM 433 C C . GLN 234 234 ? C 17.979 14.846 -9.947 1 1 C GLN 0.670 1 ATOM 434 O O . GLN 234 234 ? C 17.190 15.140 -10.840 1 1 C GLN 0.670 1 ATOM 435 C CB . GLN 234 234 ? 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C 18.373 20.205 -10.909 1 1 C LEU 0.700 1 ATOM 464 C CD2 . LEU 237 237 ? C 16.055 21.159 -10.607 1 1 C LEU 0.700 1 ATOM 465 N N . GLU 238 238 ? C 14.723 15.988 -12.090 1 1 C GLU 0.700 1 ATOM 466 C CA . GLU 238 238 ? C 14.050 15.015 -12.943 1 1 C GLU 0.700 1 ATOM 467 C C . GLU 238 238 ? C 12.556 14.921 -12.633 1 1 C GLU 0.700 1 ATOM 468 O O . GLU 238 238 ? C 11.719 14.988 -13.531 1 1 C GLU 0.700 1 ATOM 469 C CB . GLU 238 238 ? C 14.682 13.597 -12.804 1 1 C GLU 0.700 1 ATOM 470 C CG . GLU 238 238 ? C 16.054 13.422 -13.507 1 1 C GLU 0.700 1 ATOM 471 C CD . GLU 238 238 ? C 16.645 12.021 -13.322 1 1 C GLU 0.700 1 ATOM 472 O OE1 . GLU 238 238 ? C 16.782 11.306 -14.351 1 1 C GLU 0.700 1 ATOM 473 O OE2 . GLU 238 238 ? C 16.981 11.659 -12.165 1 1 C GLU 0.700 1 ATOM 474 N N . LEU 239 239 ? C 12.166 14.836 -11.346 1 1 C LEU 0.730 1 ATOM 475 C CA . LEU 239 239 ? C 10.770 14.833 -10.937 1 1 C LEU 0.730 1 ATOM 476 C C . LEU 239 239 ? C 9.990 16.099 -11.244 1 1 C LEU 0.730 1 ATOM 477 O O . LEU 239 239 ? C 8.876 16.020 -11.758 1 1 C LEU 0.730 1 ATOM 478 C CB . LEU 239 239 ? C 10.616 14.492 -9.443 1 1 C LEU 0.730 1 ATOM 479 C CG . LEU 239 239 ? C 10.908 13.014 -9.140 1 1 C LEU 0.730 1 ATOM 480 C CD1 . LEU 239 239 ? C 10.988 12.810 -7.631 1 1 C LEU 0.730 1 ATOM 481 C CD2 . LEU 239 239 ? C 9.847 12.075 -9.732 1 1 C LEU 0.730 1 ATOM 482 N N . GLU 240 240 ? C 10.545 17.299 -10.997 1 1 C GLU 0.660 1 ATOM 483 C CA . GLU 240 240 ? C 9.911 18.553 -11.371 1 1 C GLU 0.660 1 ATOM 484 C C . GLU 240 240 ? C 9.710 18.695 -12.881 1 1 C GLU 0.660 1 ATOM 485 O O . GLU 240 240 ? C 8.669 19.165 -13.349 1 1 C GLU 0.660 1 ATOM 486 C CB . GLU 240 240 ? C 10.698 19.754 -10.800 1 1 C GLU 0.660 1 ATOM 487 C CG . GLU 240 240 ? C 9.966 21.107 -10.977 1 1 C GLU 0.660 1 ATOM 488 C CD . GLU 240 240 ? C 10.801 22.304 -10.540 1 1 C GLU 0.660 1 ATOM 489 O OE1 . GLU 240 240 ? C 10.629 23.360 -11.216 1 1 C GLU 0.660 1 ATOM 490 O OE2 . GLU 240 240 ? C 11.588 22.201 -9.573 1 1 C GLU 0.660 1 ATOM 491 N N . 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D 20.064 19.678 4.007 1 1 D ASP 0.570 1 ATOM 548 C CG . ASP 227 227 ? D 20.133 20.988 4.759 1 1 D ASP 0.570 1 ATOM 549 O OD1 . ASP 227 227 ? D 19.069 21.647 4.860 1 1 D ASP 0.570 1 ATOM 550 O OD2 . ASP 227 227 ? D 21.244 21.317 5.232 1 1 D ASP 0.570 1 ATOM 551 N N . LEU 228 228 ? D 19.313 16.639 3.703 1 1 D LEU 0.670 1 ATOM 552 C CA . LEU 228 228 ? D 19.063 15.411 2.983 1 1 D LEU 0.670 1 ATOM 553 C C . LEU 228 228 ? D 17.647 14.867 3.235 1 1 D LEU 0.670 1 ATOM 554 O O . LEU 228 228 ? D 16.927 14.543 2.294 1 1 D LEU 0.670 1 ATOM 555 C CB . LEU 228 228 ? D 20.101 14.329 3.400 1 1 D LEU 0.670 1 ATOM 556 C CG . LEU 228 228 ? D 21.584 14.675 3.119 1 1 D LEU 0.670 1 ATOM 557 C CD1 . LEU 228 228 ? D 22.532 13.629 3.711 1 1 D LEU 0.670 1 ATOM 558 C CD2 . LEU 228 228 ? D 21.952 14.759 1.636 1 1 D LEU 0.670 1 ATOM 559 N N . LEU 229 229 ? D 17.198 14.813 4.515 1 1 D LEU 0.640 1 ATOM 560 C CA . LEU 229 229 ? D 15.869 14.382 4.941 1 1 D LEU 0.640 1 ATOM 561 C C . LEU 229 229 ? 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'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 4 QSQE 'Global Quaternary Structure Quality Estimate predicts the expected accuracy of the modelled interfaces.' 'normalized score' global . 3 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.635 2 1 3 0.002 3 1 4 0.298 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 225 PHE 1 0.500 2 1 A 226 GLU 1 0.530 3 1 A 227 ASP 1 0.640 4 1 A 228 LEU 1 0.690 5 1 A 229 LEU 1 0.700 6 1 A 230 LEU 1 0.660 7 1 A 231 LYS 1 0.690 8 1 A 232 TYR 1 0.710 9 1 A 233 LYS 1 0.680 10 1 A 234 GLN 1 0.670 11 1 A 235 ILE 1 0.740 12 1 A 236 GLN 1 0.720 13 1 A 237 LEU 1 0.700 14 1 A 238 GLU 1 0.700 15 1 A 239 LEU 1 0.730 16 1 A 240 GLU 1 0.670 17 1 A 241 CYS 1 0.580 18 1 A 242 ILE 1 0.580 19 1 A 243 ASN 1 0.520 20 1 A 244 LYS 1 0.430 21 1 B 225 PHE 1 0.480 22 1 B 226 GLU 1 0.490 23 1 B 227 ASP 1 0.580 24 1 B 228 LEU 1 0.670 25 1 B 229 LEU 1 0.640 26 1 B 230 LEU 1 0.630 27 1 B 231 LYS 1 0.710 28 1 B 232 TYR 1 0.710 29 1 B 233 LYS 1 0.690 30 1 B 234 GLN 1 0.680 31 1 B 235 ILE 1 0.740 32 1 B 236 GLN 1 0.700 33 1 B 237 LEU 1 0.700 34 1 B 238 GLU 1 0.710 35 1 B 239 LEU 1 0.720 36 1 B 240 GLU 1 0.660 37 1 B 241 CYS 1 0.600 38 1 B 242 ILE 1 0.610 39 1 B 243 ASN 1 0.510 40 1 B 244 LYS 1 0.440 41 1 C 225 PHE 1 0.480 42 1 C 226 GLU 1 0.510 43 1 C 227 ASP 1 0.620 44 1 C 228 LEU 1 0.670 45 1 C 229 LEU 1 0.680 46 1 C 230 LEU 1 0.650 47 1 C 231 LYS 1 0.700 48 1 C 232 TYR 1 0.720 49 1 C 233 LYS 1 0.690 50 1 C 234 GLN 1 0.670 51 1 C 235 ILE 1 0.730 52 1 C 236 GLN 1 0.720 53 1 C 237 LEU 1 0.700 54 1 C 238 GLU 1 0.700 55 1 C 239 LEU 1 0.730 56 1 C 240 GLU 1 0.660 57 1 C 241 CYS 1 0.570 58 1 C 242 ILE 1 0.580 59 1 C 243 ASN 1 0.510 60 1 C 244 LYS 1 0.430 61 1 D 225 PHE 1 0.480 62 1 D 226 GLU 1 0.500 63 1 D 227 ASP 1 0.570 64 1 D 228 LEU 1 0.670 65 1 D 229 LEU 1 0.640 66 1 D 230 LEU 1 0.610 67 1 D 231 LYS 1 0.700 68 1 D 232 TYR 1 0.720 69 1 D 233 LYS 1 0.680 70 1 D 234 GLN 1 0.680 71 1 D 235 ILE 1 0.740 72 1 D 236 GLN 1 0.690 73 1 D 237 LEU 1 0.690 74 1 D 238 GLU 1 0.710 75 1 D 239 LEU 1 0.720 76 1 D 240 GLU 1 0.650 77 1 D 241 CYS 1 0.590 78 1 D 242 ILE 1 0.590 79 1 D 243 ASN 1 0.510 80 1 D 244 LYS 1 0.440 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #