data_SMR-7662b3b380f09d3a4c136bc3e169f2c7_2 _entry.id SMR-7662b3b380f09d3a4c136bc3e169f2c7_2 _struct.entry_id SMR-7662b3b380f09d3a4c136bc3e169f2c7_2 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - A2AEY4 (isoform 2)/ MA7D3_MOUSE, MAP7 domain-containing protein 3 Estimated model accuracy of this model is 0.034, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries A2AEY4 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 110261.467 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP MA7D3_MOUSE A2AEY4 1 ;MADPTFAATSSSTSFRGLHERLVAMTQELAEERRHKRGINSSAGANKRSSSTPDGSVLKNDVKQQLAKER REQQKRQQEANKEKQLLEKEQKAKLQYEKQLEEKHRKLKEQKEKDQRRQASAEEKRKQKQAEDTEKFKAV VSRTLERCNRIDQRQKRWSWEGGVMNADKSGKLENKRSSSLSRKDNRLHPRGDMQHVDNTPAKTPVAAKL EKITTKKLDASLRGHVEGLSMMNIEIPPKITIEVPSPPKLEESSEADAEVRLQTMDDISKVKEDASQKVD IKVPTDENIARHPKPNVEELSPVSVDTSSSVELSSIVSVNSSPSLSTGSFSFGSVEISPVVSIDASLETN IDTSPELSMDSGNTKVASEIKTEAPLQARGESRLEASVEGQPEANVEGSPKNPEIDKRNINLTTKKQPLC HIPCYRWPSSSALGCRPPSPLKALQTRKIRPPSPIPVSSKLSTKTSLSYKITPVQNVLYVPNSLGVIATK KETIQKYPIKKEFGNRSMPSAEAIKKAFIQIRHAAYEQSKNEKERLQKEETKQRIARKPEIMAEKLDKVP AEGSLPCQDEQQDKNPTKTFLESPEVQKAELQKGDSAMMKSRDSAEQRKKEQENILQHWQERLERRKASE ISFSSEDEADDEGESEDSLEIFPSGGKMLSMKLKKFHKYAKTKPQKLVFLQSGTDEVDTNKNVYFNGDMK AVKQKDPKYSMIQGKGSKLSAKKPPTRPIRSRKTKEGSTAIRPTQSASSNPNHKWVCDKVIDFNQTPFLK TTLTKSNKESPADSKIACQGPQAHLDHRKRTKSVSVPLTNVLSHLHITGRASNLEHPFASVYSRLAFGKE AEESDV ; 'MAP7 domain-containing protein 3' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 846 1 846 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . MA7D3_MOUSE A2AEY4 A2AEY4-2 1 846 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2007-02-20 6A79ED46ED930531 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no 0 ;MADPTFAATSSSTSFRGLHERLVAMTQELAEERRHKRGINSSAGANKRSSSTPDGSVLKNDVKQQLAKER REQQKRQQEANKEKQLLEKEQKAKLQYEKQLEEKHRKLKEQKEKDQRRQASAEEKRKQKQAEDTEKFKAV VSRTLERCNRIDQRQKRWSWEGGVMNADKSGKLENKRSSSLSRKDNRLHPRGDMQHVDNTPAKTPVAAKL EKITTKKLDASLRGHVEGLSMMNIEIPPKITIEVPSPPKLEESSEADAEVRLQTMDDISKVKEDASQKVD IKVPTDENIARHPKPNVEELSPVSVDTSSSVELSSIVSVNSSPSLSTGSFSFGSVEISPVVSIDASLETN IDTSPELSMDSGNTKVASEIKTEAPLQARGESRLEASVEGQPEANVEGSPKNPEIDKRNINLTTKKQPLC HIPCYRWPSSSALGCRPPSPLKALQTRKIRPPSPIPVSSKLSTKTSLSYKITPVQNVLYVPNSLGVIATK KETIQKYPIKKEFGNRSMPSAEAIKKAFIQIRHAAYEQSKNEKERLQKEETKQRIARKPEIMAEKLDKVP AEGSLPCQDEQQDKNPTKTFLESPEVQKAELQKGDSAMMKSRDSAEQRKKEQENILQHWQERLERRKASE ISFSSEDEADDEGESEDSLEIFPSGGKMLSMKLKKFHKYAKTKPQKLVFLQSGTDEVDTNKNVYFNGDMK AVKQKDPKYSMIQGKGSKLSAKKPPTRPIRSRKTKEGSTAIRPTQSASSNPNHKWVCDKVIDFNQTPFLK TTLTKSNKESPADSKIACQGPQAHLDHRKRTKSVSVPLTNVLSHLHITGRASNLEHPFASVYSRLAFGKE AEESDV ; ;MADPTFAATSSSTSFRGLHERLVAMTQELAEERRHKRGINSSAGANKRSSSTPDGSVLKNDVKQQLAKER REQQKRQQEANKEKQLLEKEQKAKLQYEKQLEEKHRKLKEQKEKDQRRQASAEEKRKQKQAEDTEKFKAV VSRTLERCNRIDQRQKRWSWEGGVMNADKSGKLENKRSSSLSRKDNRLHPRGDMQHVDNTPAKTPVAAKL EKITTKKLDASLRGHVEGLSMMNIEIPPKITIEVPSPPKLEESSEADAEVRLQTMDDISKVKEDASQKVD IKVPTDENIARHPKPNVEELSPVSVDTSSSVELSSIVSVNSSPSLSTGSFSFGSVEISPVVSIDASLETN IDTSPELSMDSGNTKVASEIKTEAPLQARGESRLEASVEGQPEANVEGSPKNPEIDKRNINLTTKKQPLC HIPCYRWPSSSALGCRPPSPLKALQTRKIRPPSPIPVSSKLSTKTSLSYKITPVQNVLYVPNSLGVIATK KETIQKYPIKKEFGNRSMPSAEAIKKAFIQIRHAAYEQSKNEKERLQKEETKQRIARKPEIMAEKLDKVP AEGSLPCQDEQQDKNPTKTFLESPEVQKAELQKGDSAMMKSRDSAEQRKKEQENILQHWQERLERRKASE ISFSSEDEADDEGESEDSLEIFPSGGKMLSMKLKKFHKYAKTKPQKLVFLQSGTDEVDTNKNVYFNGDMK AVKQKDPKYSMIQGKGSKLSAKKPPTRPIRSRKTKEGSTAIRPTQSASSNPNHKWVCDKVIDFNQTPFLK TTLTKSNKESPADSKIACQGPQAHLDHRKRTKSVSVPLTNVLSHLHITGRASNLEHPFASVYSRLAFGKE AEESDV ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 ALA . 1 3 ASP . 1 4 PRO . 1 5 THR . 1 6 PHE . 1 7 ALA . 1 8 ALA . 1 9 THR . 1 10 SER . 1 11 SER . 1 12 SER . 1 13 THR . 1 14 SER . 1 15 PHE . 1 16 ARG . 1 17 GLY . 1 18 LEU . 1 19 HIS . 1 20 GLU . 1 21 ARG . 1 22 LEU . 1 23 VAL . 1 24 ALA . 1 25 MET . 1 26 THR . 1 27 GLN . 1 28 GLU . 1 29 LEU . 1 30 ALA . 1 31 GLU . 1 32 GLU . 1 33 ARG . 1 34 ARG . 1 35 HIS . 1 36 LYS . 1 37 ARG . 1 38 GLY . 1 39 ILE . 1 40 ASN . 1 41 SER . 1 42 SER . 1 43 ALA . 1 44 GLY . 1 45 ALA . 1 46 ASN . 1 47 LYS . 1 48 ARG . 1 49 SER . 1 50 SER . 1 51 SER . 1 52 THR . 1 53 PRO . 1 54 ASP . 1 55 GLY . 1 56 SER . 1 57 VAL . 1 58 LEU . 1 59 LYS . 1 60 ASN . 1 61 ASP . 1 62 VAL . 1 63 LYS . 1 64 GLN . 1 65 GLN . 1 66 LEU . 1 67 ALA . 1 68 LYS . 1 69 GLU . 1 70 ARG . 1 71 ARG . 1 72 GLU . 1 73 GLN . 1 74 GLN . 1 75 LYS . 1 76 ARG . 1 77 GLN . 1 78 GLN . 1 79 GLU . 1 80 ALA . 1 81 ASN . 1 82 LYS . 1 83 GLU . 1 84 LYS . 1 85 GLN . 1 86 LEU . 1 87 LEU . 1 88 GLU . 1 89 LYS . 1 90 GLU . 1 91 GLN . 1 92 LYS . 1 93 ALA . 1 94 LYS . 1 95 LEU . 1 96 GLN . 1 97 TYR . 1 98 GLU . 1 99 LYS . 1 100 GLN . 1 101 LEU . 1 102 GLU . 1 103 GLU . 1 104 LYS . 1 105 HIS . 1 106 ARG . 1 107 LYS . 1 108 LEU . 1 109 LYS . 1 110 GLU . 1 111 GLN . 1 112 LYS . 1 113 GLU . 1 114 LYS . 1 115 ASP . 1 116 GLN . 1 117 ARG . 1 118 ARG . 1 119 GLN . 1 120 ALA . 1 121 SER . 1 122 ALA . 1 123 GLU . 1 124 GLU . 1 125 LYS . 1 126 ARG . 1 127 LYS . 1 128 GLN . 1 129 LYS . 1 130 GLN . 1 131 ALA . 1 132 GLU . 1 133 ASP . 1 134 THR . 1 135 GLU . 1 136 LYS . 1 137 PHE . 1 138 LYS . 1 139 ALA . 1 140 VAL . 1 141 VAL . 1 142 SER . 1 143 ARG . 1 144 THR . 1 145 LEU . 1 146 GLU . 1 147 ARG . 1 148 CYS . 1 149 ASN . 1 150 ARG . 1 151 ILE . 1 152 ASP . 1 153 GLN . 1 154 ARG . 1 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A 1 846 VAL 846 ? ? ? 0 . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'rRNA-processing protein {PDB ID=8i9w, label_asym_id=AA, auth_asym_id=Cz, SMTL ID=8i9w.1.0}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 8i9w, label_asym_id=AA' 'target-template alignment' . 4 'model 2' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-25 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-20 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A AA 27 1 Cz # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MNMSETQVNITAAPAPATTKKNLGMRKNGQVWLPAKKAFRPTKGLTSWELRVKKRQEQAAMKAKEREMKE EKEAERQKRIQAIKERRKKKEEKERYEQLAAKMHKKRLERLKRKEKRNKLLNS ; ;MNMSETQVNITAAPAPATTKKNLGMRKNGQVWLPAKKAFRPTKGLTSWELRVKKRQEQAAMKAKEREMKE EKEAERQKRIQAIKERRKKKEEKERYEQLAAKMHKKRLERLKRKEKRNKLLNS ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 78 103 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8i9w 2024-10-16 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 846 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 846 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 130.000 23.077 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MADPTFAATSSSTSFRGLHERLVAMTQELAEERRHKRGINSSAGANKRSSSTPDGSVLKNDVKQQLAKERREQQKRQQEANKEKQLLEKEQKAKLQYEKQLEEKHRKLKEQKEKDQRRQASAEEKRKQKQAEDTEKFKAVVSRTLERCNRIDQRQKRWSWEGGVMNADKSGKLENKRSSSLSRKDNRLHPRGDMQHVDNTPAKTPVAAKLEKITTKKLDASLRGHVEGLSMMNIEIPPKITIEVPSPPKLEESSEADAEVRLQTMDDISKVKEDASQKVDIKVPTDENIARHPKPNVEELSPVSVDTSSSVELSSIVSVNSSPSLSTGSFSFGSVEISPVVSIDASLETNIDTSPELSMDSGNTKVASEIKTEAPLQARGESRLEASVEGQPEANVEGSPKNPEIDKRNINLTTKKQPLCHIPCYRWPSSSALGCRPPSPLKALQTRKIRPPSPIPVSSKLSTKTSLSYKITPVQNVLYVPNSLGVIATKKETIQKYPIKKEFGNRSMPSAEAIKKAFIQIRHAAYEQSKNEKERLQKEETKQRIARKPEIMAEKLDKVPAEGSLPCQDEQQDKNPTKTFLESPEVQKAELQKGDSAMMKSRDSAEQRKKEQENILQHWQERLERRKASEISFSSEDEADDEGESEDSLEIFPSGGKMLSMKLKKFHKYAKTKPQKLVFLQSGTDEVDTNKNVYFNGDMKAVKQKDPKYSMIQGKGSKLSAKKPPTRPIRSRKTKEGSTAIRPTQSASSNPNHKWVCDKVIDFNQTPFLKTTLTKSNKESPADSKIACQGPQAHLDHRKRTKSVSVPLTNVLSHLHITGRASNLEHPFASVYSRLAFGKEAEESDV 2 1 2 --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------KRIQAIKERRKKKE--EKERYEQLAAKM------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8i9w.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 2' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . ARG 117 117 ? A 180.250 254.495 296.467 1 1 0 ARG 0.640 1 ATOM 2 C CA . ARG 117 117 ? A 179.785 255.932 296.434 1 1 0 ARG 0.640 1 ATOM 3 C C . ARG 117 117 ? A 180.244 256.744 295.235 1 1 0 ARG 0.640 1 ATOM 4 O O . ARG 117 117 ? A 179.406 257.275 294.529 1 1 0 ARG 0.640 1 ATOM 5 C CB . ARG 117 117 ? A 180.101 256.680 297.756 1 1 0 ARG 0.640 1 ATOM 6 C CG . ARG 117 117 ? A 179.351 256.135 298.994 1 1 0 ARG 0.640 1 ATOM 7 C CD . ARG 117 117 ? A 179.436 257.039 300.240 1 1 0 ARG 0.640 1 ATOM 8 N NE . ARG 117 117 ? A 180.873 257.115 300.674 1 1 0 ARG 0.640 1 ATOM 9 C CZ . ARG 117 117 ? A 181.491 256.241 301.485 1 1 0 ARG 0.640 1 ATOM 10 N NH1 . ARG 117 117 ? A 180.868 255.186 301.993 1 1 0 ARG 0.640 1 ATOM 11 N NH2 . ARG 117 117 ? A 182.763 256.441 301.820 1 1 0 ARG 0.640 1 ATOM 12 N N . ARG 118 118 ? A 181.559 256.825 294.923 1 1 0 ARG 0.610 1 ATOM 13 C CA . ARG 118 118 ? A 182.056 257.519 293.739 1 1 0 ARG 0.610 1 ATOM 14 C C . ARG 118 118 ? A 181.462 257.026 292.423 1 1 0 ARG 0.610 1 ATOM 15 O O . ARG 118 118 ? A 181.093 257.831 291.578 1 1 0 ARG 0.610 1 ATOM 16 C CB . ARG 118 118 ? A 183.589 257.367 293.652 1 1 0 ARG 0.610 1 ATOM 17 C CG . ARG 118 118 ? A 184.374 258.232 294.654 1 1 0 ARG 0.610 1 ATOM 18 C CD . ARG 118 118 ? A 185.881 258.119 294.410 1 1 0 ARG 0.610 1 ATOM 19 N NE . ARG 118 118 ? A 186.578 259.005 295.397 1 1 0 ARG 0.610 1 ATOM 20 C CZ . ARG 118 118 ? A 187.913 259.065 295.504 1 1 0 ARG 0.610 1 ATOM 21 N NH1 . ARG 118 118 ? A 188.694 258.315 294.733 1 1 0 ARG 0.610 1 ATOM 22 N NH2 . ARG 118 118 ? A 188.484 259.890 296.379 1 1 0 ARG 0.610 1 ATOM 23 N N . GLN 119 119 ? A 181.314 255.691 292.251 1 1 0 GLN 0.620 1 ATOM 24 C CA . GLN 119 119 ? A 180.637 255.111 291.099 1 1 0 GLN 0.620 1 ATOM 25 C C . GLN 119 119 ? A 179.183 255.575 290.941 1 1 0 GLN 0.620 1 ATOM 26 O O . GLN 119 119 ? A 178.799 256.043 289.881 1 1 0 GLN 0.620 1 ATOM 27 C CB . GLN 119 119 ? A 180.700 253.559 291.164 1 1 0 GLN 0.620 1 ATOM 28 C CG . GLN 119 119 ? A 180.135 252.833 289.918 1 1 0 GLN 0.620 1 ATOM 29 C CD . GLN 119 119 ? A 180.910 253.214 288.659 1 1 0 GLN 0.620 1 ATOM 30 O OE1 . GLN 119 119 ? A 182.080 253.587 288.702 1 1 0 GLN 0.620 1 ATOM 31 N NE2 . GLN 119 119 ? A 180.237 253.107 287.490 1 1 0 GLN 0.620 1 ATOM 32 N N . ALA 120 120 ? A 178.378 255.544 292.035 1 1 0 ALA 0.690 1 ATOM 33 C CA . ALA 120 120 ? A 176.998 256.012 292.073 1 1 0 ALA 0.690 1 ATOM 34 C C . ALA 120 120 ? A 176.903 257.497 291.726 1 1 0 ALA 0.690 1 ATOM 35 O O . ALA 120 120 ? A 176.105 257.915 290.896 1 1 0 ALA 0.690 1 ATOM 36 C CB . ALA 120 120 ? A 176.393 255.754 293.479 1 1 0 ALA 0.690 1 ATOM 37 N N . SER 121 121 ? A 177.797 258.332 292.302 1 1 0 SER 0.650 1 ATOM 38 C CA . SER 121 121 ? A 177.921 259.743 291.955 1 1 0 SER 0.650 1 ATOM 39 C C . SER 121 121 ? A 178.264 259.991 290.494 1 1 0 SER 0.650 1 ATOM 40 O O . SER 121 121 ? A 177.727 260.898 289.871 1 1 0 SER 0.650 1 ATOM 41 C CB . SER 121 121 ? A 178.987 260.492 292.801 1 1 0 SER 0.650 1 ATOM 42 O OG . SER 121 121 ? A 178.688 260.438 294.197 1 1 0 SER 0.650 1 ATOM 43 N N . ALA 122 122 ? A 179.177 259.199 289.896 1 1 0 ALA 0.690 1 ATOM 44 C CA . ALA 122 122 ? A 179.475 259.220 288.476 1 1 0 ALA 0.690 1 ATOM 45 C C . ALA 122 122 ? A 178.304 258.801 287.578 1 1 0 ALA 0.690 1 ATOM 46 O O . ALA 122 122 ? A 178.069 259.423 286.543 1 1 0 ALA 0.690 1 ATOM 47 C CB . ALA 122 122 ? A 180.703 258.336 288.177 1 1 0 ALA 0.690 1 ATOM 48 N N . GLU 123 123 ? A 177.539 257.753 287.953 1 1 0 GLU 0.590 1 ATOM 49 C CA . GLU 123 123 ? A 176.307 257.323 287.302 1 1 0 GLU 0.590 1 ATOM 50 C C . GLU 123 123 ? A 175.202 258.372 287.336 1 1 0 GLU 0.590 1 ATOM 51 O O . GLU 123 123 ? A 174.639 258.701 286.293 1 1 0 GLU 0.590 1 ATOM 52 C CB . GLU 123 123 ? A 175.805 255.991 287.912 1 1 0 GLU 0.590 1 ATOM 53 C CG . GLU 123 123 ? A 176.750 254.812 287.569 1 1 0 GLU 0.590 1 ATOM 54 C CD . GLU 123 123 ? A 176.452 253.477 288.254 1 1 0 GLU 0.590 1 ATOM 55 O OE1 . GLU 123 123 ? A 175.489 253.370 289.045 1 1 0 GLU 0.590 1 ATOM 56 O OE2 . GLU 123 123 ? A 177.266 252.549 287.980 1 1 0 GLU 0.590 1 ATOM 57 N N . GLU 124 124 ? A 174.930 258.995 288.501 1 1 0 GLU 0.550 1 ATOM 58 C CA . GLU 124 124 ? A 174.007 260.116 288.654 1 1 0 GLU 0.550 1 ATOM 59 C C . GLU 124 124 ? A 174.406 261.328 287.827 1 1 0 GLU 0.550 1 ATOM 60 O O . GLU 124 124 ? A 173.593 261.925 287.123 1 1 0 GLU 0.550 1 ATOM 61 C CB . GLU 124 124 ? A 173.877 260.532 290.144 1 1 0 GLU 0.550 1 ATOM 62 C CG . GLU 124 124 ? A 173.073 259.512 290.987 1 1 0 GLU 0.550 1 ATOM 63 C CD . GLU 124 124 ? A 171.632 259.379 290.494 1 1 0 GLU 0.550 1 ATOM 64 O OE1 . GLU 124 124 ? A 171.074 260.376 289.959 1 1 0 GLU 0.550 1 ATOM 65 O OE2 . GLU 124 124 ? A 171.075 258.261 290.621 1 1 0 GLU 0.550 1 ATOM 66 N N . LYS 125 125 ? A 175.706 261.689 287.827 1 1 0 LYS 0.600 1 ATOM 67 C CA . LYS 125 125 ? A 176.238 262.732 286.965 1 1 0 LYS 0.600 1 ATOM 68 C C . LYS 125 125 ? A 176.111 262.446 285.493 1 1 0 LYS 0.600 1 ATOM 69 O O . LYS 125 125 ? A 175.863 263.359 284.728 1 1 0 LYS 0.600 1 ATOM 70 C CB . LYS 125 125 ? A 177.729 263.032 287.193 1 1 0 LYS 0.600 1 ATOM 71 C CG . LYS 125 125 ? A 177.986 263.748 288.514 1 1 0 LYS 0.600 1 ATOM 72 C CD . LYS 125 125 ? A 179.484 263.943 288.749 1 1 0 LYS 0.600 1 ATOM 73 C CE . LYS 125 125 ? A 179.767 264.565 290.110 1 1 0 LYS 0.600 1 ATOM 74 N NZ . LYS 125 125 ? A 181.223 264.732 290.283 1 1 0 LYS 0.600 1 ATOM 75 N N . ARG 126 126 ? A 176.317 261.189 285.054 1 1 0 ARG 0.540 1 ATOM 76 C CA . ARG 126 126 ? A 176.014 260.759 283.703 1 1 0 ARG 0.540 1 ATOM 77 C C . ARG 126 126 ? A 174.546 260.772 283.369 1 1 0 ARG 0.540 1 ATOM 78 O O . ARG 126 126 ? A 174.185 261.150 282.268 1 1 0 ARG 0.540 1 ATOM 79 C CB . ARG 126 126 ? 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A 175.049 269.782 278.072 1 1 0 GLN 0.460 1 ATOM 119 C CD . GLN 130 130 ? A 173.980 270.747 278.575 1 1 0 GLN 0.460 1 ATOM 120 O OE1 . GLN 130 130 ? A 174.147 271.363 279.620 1 1 0 GLN 0.460 1 ATOM 121 N NE2 . GLN 130 130 ? A 172.851 270.885 277.842 1 1 0 GLN 0.460 1 ATOM 122 N N . ALA 131 131 ? A 174.317 265.926 277.987 1 1 0 ALA 0.510 1 ATOM 123 C CA . ALA 131 131 ? A 174.009 265.052 276.882 1 1 0 ALA 0.510 1 ATOM 124 C C . ALA 131 131 ? A 172.914 264.005 277.198 1 1 0 ALA 0.510 1 ATOM 125 O O . ALA 131 131 ? A 172.650 263.182 276.328 1 1 0 ALA 0.510 1 ATOM 126 C CB . ALA 131 131 ? A 175.301 264.293 276.468 1 1 0 ALA 0.510 1 ATOM 127 N N . GLU 132 132 ? A 172.268 263.993 278.400 1 1 0 GLU 0.380 1 ATOM 128 C CA . GLU 132 132 ? A 171.234 263.008 278.762 1 1 0 GLU 0.380 1 ATOM 129 C C . GLU 132 132 ? A 169.942 263.704 279.247 1 1 0 GLU 0.380 1 ATOM 130 O O . GLU 132 132 ? A 169.181 264.178 278.402 1 1 0 GLU 0.380 1 ATOM 131 C CB . GLU 132 132 ? A 171.710 261.910 279.765 1 1 0 GLU 0.380 1 ATOM 132 C CG . GLU 132 132 ? A 172.846 260.991 279.231 1 1 0 GLU 0.380 1 ATOM 133 C CD . GLU 132 132 ? A 172.531 259.954 278.150 1 1 0 GLU 0.380 1 ATOM 134 O OE1 . GLU 132 132 ? A 171.351 259.598 277.928 1 1 0 GLU 0.380 1 ATOM 135 O OE2 . GLU 132 132 ? A 173.548 259.467 277.578 1 1 0 GLU 0.380 1 ATOM 136 N N . ASP 133 133 ? A 169.667 263.772 280.580 1 1 0 ASP 0.360 1 ATOM 137 C CA . ASP 133 133 ? A 168.534 264.461 281.218 1 1 0 ASP 0.360 1 ATOM 138 C C . ASP 133 133 ? A 168.690 266.035 281.275 1 1 0 ASP 0.360 1 ATOM 139 O O . ASP 133 133 ? A 169.782 266.577 280.960 1 1 0 ASP 0.360 1 ATOM 140 C CB . ASP 133 133 ? A 168.284 263.906 282.691 1 1 0 ASP 0.360 1 ATOM 141 C CG . ASP 133 133 ? A 167.593 262.557 282.954 1 1 0 ASP 0.360 1 ATOM 142 O OD1 . ASP 133 133 ? A 167.007 261.907 282.062 1 1 0 ASP 0.360 1 ATOM 143 O OD2 . ASP 133 133 ? A 167.607 262.135 284.159 1 1 0 ASP 0.360 1 ATOM 144 O OXT . ASP 133 133 ? A 167.681 266.716 281.621 1 1 0 ASP 0.360 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.564 2 1 3 0.034 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 117 ARG 1 0.640 2 1 A 118 ARG 1 0.610 3 1 A 119 GLN 1 0.620 4 1 A 120 ALA 1 0.690 5 1 A 121 SER 1 0.650 6 1 A 122 ALA 1 0.690 7 1 A 123 GLU 1 0.590 8 1 A 124 GLU 1 0.550 9 1 A 125 LYS 1 0.600 10 1 A 126 ARG 1 0.540 11 1 A 127 LYS 1 0.560 12 1 A 128 GLN 1 0.560 13 1 A 129 LYS 1 0.580 14 1 A 130 GLN 1 0.460 15 1 A 131 ALA 1 0.510 16 1 A 132 GLU 1 0.380 17 1 A 133 ASP 1 0.360 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #