data_SMR-69c2ce4671e721b72833bb1b6e86c4cf_8 _entry.id SMR-69c2ce4671e721b72833bb1b6e86c4cf_8 _struct.entry_id SMR-69c2ce4671e721b72833bb1b6e86c4cf_8 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - P15924/ DESP_HUMAN, Desmoplakin Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P15924' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-12.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 2 . 4 2 4 . 5 2 5 . 6 2 6 . 7 3 1 . 8 3 4 . 9 4 1 . 10 4 2 . 11 4 4 . 12 5 3 . 13 6 1 . 14 6 3 . 15 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 383977.728 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP DESP_HUMAN P15924 1 ;MSCNGGSHPRINTLGRMIRAESGPDLRYEVTSGGGGTSRMYYSRRGVITDQNSDGYCQTGTMSRHQNQNT IQELLQNCSDCLMRAELIVQPELKYGDGIQLTRSRELDECFAQANDQMEILDSLIREMRQMGQPCDAYQK RLLQLQEQMRALYKAISVPRVRRASSKGGGGYTCQSGSGWDEFTKHVTSECLGWMRQQRAEMDMVAWGVD LASVEQHINSHRGIHNSIGDYRWQLDKIKADLREKSAIYQLEEEYENLLKASFERMDHLRQLQNIIQATS REIMWINDCEEEELLYDWSDKNTNIAQKQEAFSIRMSQLEVKEKELNKLKQESDQLVLNQHPASDKIEAY MDTLQTQWSWILQITKCIDVHLKENAAYFQFFEEAQSTEAYLKGLQDSIRKKYPCDKNMPLQHLLEQIKE LEKEREKILEYKRQVQNLVNKSKKIVQLKPRNPDYRSNKPIILRALCDYKQDQKIVHKGDECILKDNNER SKWYVTGPGGVDMLVPSVGLIIPPPNPLAVDLSCKIEQYYEAILALWNQLYINMKSLVSWHYCMIDIEKI RAMTIAKLKTMRQEDYMKTIADLELHYQEFIRNSQGSEMFGDDDKRKIQSQFTDAQKHYQTLVIQLPGYP QHQTVTTTEITHHGTCQDVNHNKVIETNRENDKQETWMLMELQKIRRQIEHCEGRMTLKNLPLADQGSSH HITVKINELKSVQNDSQAIAEVLNQLKDMLANFRGSEKYCYLQNEVFGLFQKLENINGVTDGYLNSLCTV RALLQAILQTEDMLKVYEARLTEEETVCLDLDKVEAYRCGLKKIKNDLNLKKSLLATMKTELQKAQQIHS QTSQQYPLYDLDLGKFGEKVTQLTDRWQRIDKQIDFRLWDLEKQIKQLRNYRDNYQAFCKWLYDAKRRQD SLESMKFGDSNTVMRFLNEQKNLHSEISGKRDKSEEVQKIAELCANSIKDYELQLASYTSGLETLLNIPI KRTMIQSPSGVILQEAADVHARYIELLTRSGDYYRFLSEMLKSLEDLKLKNTKIEVLEEELRLARDANSE NCNKNKFLDQNLQKYQAECSQFKAKLASLEELKRQAELDGKSAKQNLDKCYGQIKELNEKITRLTYEIED EKRRRKSVEDRFDQQKNDYDQLQKARQCEKENLGWQKLESEKAIKEKEYEIERLRVLLQEEGTRKREYEN ELAKVRNHYNEEMSNLRNKYETEINITKTTIKEISMQKEDDSKNLRNQLDRLSRENRDLKDEIVRLNDSI LQATEQRRRAEENALQQKACGSEIMQKKQHLEIELKQVMQQRSEDNARHKQSLEEAAKTIQDKNKEIERL KAEFQEEAKRRWEYENELSKVRNNYDEEIISLKNQFETEINITKTTIHQLTMQKEEDTSGYRAQIDNLTR ENRSLSEEIKRLKNTLTQTTENLRRVEEDIQQQKATGSEVSQRKQQLEVELRQVTQMRTEESVRYKQSLD DAAKTIQDKNKEIERLKQLIDKETNDRKCLEDENARLQRVQYDLQKANSSATETINKLKVQEQELTRLRI DYERVSQERTVKDQDITRFQNSLKELQLQKQKVEEELNRLKRTASEDSCKRKKLEEELEGMRRSLKEQAI KITNLTQQLEQASIVKKRSEDDLRQQRDVLDGHLREKQRTQEELRRLSSEVEALRRQLLQEQESVKQAHL RNEHFQKAIEDKSRSLNESKIEIERLQSLTENLTKEHLMLEEELRNLRLEYDDLRRGRSEADSDKNATIL ELRSQLQISNNRTLELQGLINDLQRERENLRQEIEKFQKQALEASNRIQESKNQCTQVVQERESLLVKIK VLEQDKARLQRLEDELNRAKSTLEAETRVKQRLECEKQQIQNDLNQWKTQYSRKEEAIRKIESEREKSER EKNSLRSEIERLQAEIKRIEERCRRKLEDSTRETQSQLETERSRYQREIDKLRQRPYGSHRETQTECEWT VDTSKLVFDGLRKKVTAMQLYECQLIDKTTLDKLLKGKKSVEEVASEIQPFLRGAGSIAGASASPKEKYS LVEAKRKKLISPESTVMLLEAQAATGGIIDPHRNEKLTVDSAIARDLIDFDDRQQIYAAEKAITGFDDPF SGKTVSVSEAIKKNLIDRETGMRLLEAQIASGGVVDPVNSVFLPKDVALARGLIDRDLYRSLNDPRDSQK NFVDPVTKKKVSYVQLKERCRIEPHTGLLLLSVQKRSMSFQGIRQPVTVTELVDSGILRPSTVNELESGQ ISYDEVGERIKDFLQGSSCIAGIYNETTKQKLGIYEAMKIGLVRPGTALELLEAQAATGFIVDPVSNLRL PVEEAYKRGLVGIEFKEKLLSAERAVTGYNDPETGNIISLFQAMNKELIEKGHGIRLLEAQIATGGIIDP KESHRLPVDIAYKRGYFNEELSEILSDPSDDTKGFFDPNTEENLTYLQLKERCIKDEETGLCLLPLKEKK KQVQTSQKNTLRKRRVVIVDPETNKEMSVQEAYKKGLIDYETFKELCEQECEWEEITITGSDGSTRVVLV DRKTGSQYDIQDAIDKGLVDRKFFDQYRSGSLSLTQFADMISLKNGVGTSSSMGSGVSDDVFSSSRHESV SKISTISSVRNLTIRSSSFSDTLEESSPIAAIFDTENLEKISITEGIERGIVDSITGQRLLEAQACTGGI IHPTTGQKLSLQDAVSQGVIDQDMATRLKPAQKAFIGFEGVKGKKKMSAAEAVKEKWLPYEAGQRFLEFQ YLTGGLVDPEVHGRISTEEAIRKGFIDGRAAQRLQDTSSYAKILTCPKTKLKISYKDAINRSMVEDITGL RLLEAASVSSKGLPSPYNMSSAPGSRSGSRSGSRSGSRSGSRSGSRRGSFDATGNSSYSYSYSFSSSSIG H ; Desmoplakin # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2871 1 2871 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . 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A 1 2871 HIS 2871 ? ? ? 2 . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Spectrin beta chain {PDB ID=8iah, label_asym_id=CA, auth_asym_id=S, SMTL ID=8iah.1.2}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 8iah, label_asym_id=CA' 'target-template alignment' . 4 'model 8' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'AlphaFold DB' 'reference database' . 8 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 1 7 5 2 8 6 3 2 7 3 1 8 3 3 9 4 1 10 4 3 11 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-25 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-20 7 'AlphaFold DB' https://alphafold.ebi.ac.uk v4 . # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A CA 6 1 S # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MTSATEFENVGNQPPYSRINARWDAPDDELDNDNSSARLFERSRIKALADEREVVQKKTFTKWVNSHLAR VSCRITDLYKDLRDGRMLIKLLEVLSGEMLPKPTKGKMRIHCLENVDKALQFLKEQRVHLENMGSHDIVD GNHRLVLGLIWTIILRFQIQDIVVQTQEGRETRSAKDALLLWCQMKTAGYPNVNVTNFTSSWKDGLAFNA LIHKHRPDLIDFDKLKDSNARHNLEHAFDVAERQLGIIQLLDPEDVFTENPDEKSIITYVVAFYHYFSKM KVLAVEGKRVGKVIDHAIETEKMIEKYSGLASDLLTWIEQTITVLNSRKFANSLAGVQQQLQAFSTYRTV EKPPKFQEKGNLEVLLFTIQSRMRANNQKVYTPHDGKLVSDINRAWESLEEAEYRRELALRSELIRQEKL EQLARRFDRKAAMRETWLNENQRLVAQDNFGYDLAAVEAAKKKHEAIETDTAAYEERVRALEDLARELEL ENYHDQKRITARKDNILRLWNYLQELLQSRRQRLETTLALQQLFQDMLHSIDWMDEIKAHLLSAEFGKHL LEAEDLLQKHKLMEADIAIQGDKVKAITAATLQFTEETGYQPCDPQVIRDRVSHLEQCFAELSNTAAGRK AQLEQSKRLWKLFWEMDEAKSWIKEKEQIYSSLGYGKDLTSVLILQRKHKAFEDELRRLDPHLDQIFQEA EDMVALKQFGYPKNEAWVKEVSAQWDQLKEVPAQWNQLKELAASRKKNLQDTENFFQFQGDVDDLKAWLQ DAHKLLSGEDVGQDEGATRALGKKHKDFLEELEESRGVMEHLEQQAQDFPERFRDSPDVTNRLQVLRDLY QQVVAQADLRRQRLQDALDLYTVFGETDACELWMGEKEKWLAQMDIPDTLEDLEVVQHRFDILDQEMKTL IAQIDGVNVAANSLVESNHPRSTEVKQYQDHLNTRWREFQTMVLARREAVDSALRVHNYCVDCEETSKWI IDKTKVVESTKDLGQDLAGVMAIQRKLSGLERDVAAIQVRVGALEQESHRLMESHREQEKDIGERQAYVE ELWQGLQQALKGQEALLGKSSQLQAFLQDLDAFEAWLSTAQKEVASKDMPESLPEAEQLLQQHAALKDDI DRHQENYQHVKASGEKVIHGQTDPEYLLLGQRLEGLDKGWDALCRMWESRGHTLAQCLGFQEFQKDAKQA EAILSNQEYTLAHLEPPDSLEAAEAGIRKFQDFFTTMENNRDKVLSPVDSGNKLVAEGNLYSDKIKEKVQ QIEDRHKRNNEKAQEASVLLQDNLALQNFLQNCQELTLWINDKLLTSQDVSYDDARNLHNKWLKHTAFEA ELASQQGWLENIDAEGKQLMEEKPQFEALVSQRLEALHRLWDELQATTKEIGQRLSAARSSDLRSQTHAD LNKWIRAMEDQLRSDDLGKDLTSVNRMLAKLKRVEDQVNVRKEELGELFAHMPSPGEEAEDEDLSIEKRF LDLLEPLGRRKKQLESSKAKLQISRDLEDETLWVEERLPLAQSTDYGANLQTVQLFMKKNQTLQNEILGH APRVEDVLYRGHQLVEAAEIDCQDIEERLGHLQNSWDTLQEAAAGRLQRLWDASEAQQYYLDAGEAEAWI SEQELYVISDEMPQDEEGAIVMLKRHLRQQRMVEEYERNIKQLAGRAQSLLAAGHPEGEQIIRLQGQVDK HYAGLKDMAEDRKRKLENKYRQFQMEREADDLEQWILEKDLVASSPEMGQDFDHVTLLRDKFRDFARETG AIGQERVDNMNALIEHLIDAGHEEAASIAERKDGLNEMWADVLELIDTRMQLLAASYDRHRYFYTGNEIL GLIDEKHRELPEDVGLDASTAESFHRVHTAFERELHQLGVQVQQFQDVATRLQAAYAGEEADSIQNKEQE VSAAWQALLDACAGRRTQLVDTADKFRFFSMVRDLLSWMETIIRQIETQERPRDVSSVELLMKYHQGIWA EMDTRSKNFSACLELGESLLQRQHQASDEIREKLQQVVSKKKEIDEKWKARSDRLSMLLEVCQFSRDASV AEAWLIAQEPYLSSRDFGHTVDSVEKLIKRHEAFEKSTASWEPRFAALEKPTTLELKERQTPERPKEDAG PQEEEGETAGEAPRGPHRAATERTSPVSSLSHLSSSWESLLPEPAHPY ; ;MTSATEFENVGNQPPYSRINARWDAPDDELDNDNSSARLFERSRIKALADEREVVQKKTFTKWVNSHLAR VSCRITDLYKDLRDGRMLIKLLEVLSGEMLPKPTKGKMRIHCLENVDKALQFLKEQRVHLENMGSHDIVD GNHRLVLGLIWTIILRFQIQDIVVQTQEGRETRSAKDALLLWCQMKTAGYPNVNVTNFTSSWKDGLAFNA LIHKHRPDLIDFDKLKDSNARHNLEHAFDVAERQLGIIQLLDPEDVFTENPDEKSIITYVVAFYHYFSKM KVLAVEGKRVGKVIDHAIETEKMIEKYSGLASDLLTWIEQTITVLNSRKFANSLAGVQQQLQAFSTYRTV EKPPKFQEKGNLEVLLFTIQSRMRANNQKVYTPHDGKLVSDINRAWESLEEAEYRRELALRSELIRQEKL EQLARRFDRKAAMRETWLNENQRLVAQDNFGYDLAAVEAAKKKHEAIETDTAAYEERVRALEDLARELEL ENYHDQKRITARKDNILRLWNYLQELLQSRRQRLETTLALQQLFQDMLHSIDWMDEIKAHLLSAEFGKHL LEAEDLLQKHKLMEADIAIQGDKVKAITAATLQFTEETGYQPCDPQVIRDRVSHLEQCFAELSNTAAGRK AQLEQSKRLWKLFWEMDEAKSWIKEKEQIYSSLGYGKDLTSVLILQRKHKAFEDELRRLDPHLDQIFQEA EDMVALKQFGYPKNEAWVKEVSAQWDQLKEVPAQWNQLKELAASRKKNLQDTENFFQFQGDVDDLKAWLQ DAHKLLSGEDVGQDEGATRALGKKHKDFLEELEESRGVMEHLEQQAQDFPERFRDSPDVTNRLQVLRDLY QQVVAQADLRRQRLQDALDLYTVFGETDACELWMGEKEKWLAQMDIPDTLEDLEVVQHRFDILDQEMKTL IAQIDGVNVAANSLVESNHPRSTEVKQYQDHLNTRWREFQTMVLARREAVDSALRVHNYCVDCEETSKWI IDKTKVVESTKDLGQDLAGVMAIQRKLSGLERDVAAIQVRVGALEQESHRLMESHREQEKDIGERQAYVE ELWQGLQQALKGQEALLGKSSQLQAFLQDLDAFEAWLSTAQKEVASKDMPESLPEAEQLLQQHAALKDDI DRHQENYQHVKASGEKVIHGQTDPEYLLLGQRLEGLDKGWDALCRMWESRGHTLAQCLGFQEFQKDAKQA EAILSNQEYTLAHLEPPDSLEAAEAGIRKFQDFFTTMENNRDKVLSPVDSGNKLVAEGNLYSDKIKEKVQ QIEDRHKRNNEKAQEASVLLQDNLALQNFLQNCQELTLWINDKLLTSQDVSYDDARNLHNKWLKHTAFEA ELASQQGWLENIDAEGKQLMEEKPQFEALVSQRLEALHRLWDELQATTKEIGQRLSAARSSDLRSQTHAD LNKWIRAMEDQLRSDDLGKDLTSVNRMLAKLKRVEDQVNVRKEELGELFAHMPSPGEEAEDEDLSIEKRF LDLLEPLGRRKKQLESSKAKLQISRDLEDETLWVEERLPLAQSTDYGANLQTVQLFMKKNQTLQNEILGH APRVEDVLYRGHQLVEAAEIDCQDIEERLGHLQNSWDTLQEAAAGRLQRLWDASEAQQYYLDAGEAEAWI SEQELYVISDEMPQDEEGAIVMLKRHLRQQRMVEEYERNIKQLAGRAQSLLAAGHPEGEQIIRLQGQVDK HYAGLKDMAEDRKRKLENKYRQFQMEREADDLEQWILEKDLVASSPEMGQDFDHVTLLRDKFRDFARETG AIGQERVDNMNALIEHLIDAGHEEAASIAERKDGLNEMWADVLELIDTRMQLLAASYDRHRYFYTGNEIL GLIDEKHRELPEDVGLDASTAESFHRVHTAFERELHQLGVQVQQFQDVATRLQAAYAGEEADSIQNKEQE VSAAWQALLDACAGRRTQLVDTADKFRFFSMVRDLLSWMETIIRQIETQERPRDVSSVELLMKYHQGIWA EMDTRSKNFSACLELGESLLQRQHQASDEIREKLQQVVSKKKEIDEKWKARSDRLSMLLEVCQFSRDASV AEAWLIAQEPYLSSRDFGHTVDSVEKLIKRHEAFEKSTASWEPRFAALEKPTTLELKERQTPERPKEDAG PQEEEGETAGEAPRGPHRAATERTSPVSSLSHLSSSWESLLPEPAHPY ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 303 1034 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8iah 2024-07-03 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2871 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2932 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 7e-20 10.879 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MSCNGGSHPRINTLGRMIRAESGPDLRYEVTSGGGGTSRMYYSRRGVITDQNSDGYCQTGTMSRHQNQNTIQELLQNCSDCLMRAELIVQPELKYGDGIQLTRSRELDECFAQANDQMEILDSLIREMRQMGQPCDAYQKRLLQLQEQMRALYKAISVPRVRRASSKGGGGYTCQSGSGWDEFTKHVTSECLGWMRQQRAEMDMVAWGVDLASVEQHINSHRGIHNSIG---------------DYRWQLDKIKADL---REKSAIYQLEEEYENLLKASFERMDHLRQ-----------LQNIIQATSREIMWINDCEEEELLYDWSDKNTNIAQKQEAFSIRMSQLEVKEKELNKLKQESDQLVLNQHPASDKIEAYMDTLQTQWSWILQITKCIDVHLKENAAYFQFFEEAQSTEAYLKGLQDSIRKKYPCDKNMPLQHLLEQIKELEKEREKILEYKRQVQNLVNKSKKIVQLKPRNPDYRSNKPIILRALCDYKQDQKIVHKGDECILKDNNERSKWYVTGPGGVDMLVPSVGLIIPPPNPLAVDLSCKIEQYYEAILALWNQLYINMKSL-VSWHYCMIDIEKIRAMTIAKLKTMRQE-------DYMKTIAD-------L---ELHYQEFIRNSQGS---EMFGDDD-------KRKIQSQFTDAQKHYQTLVIQLPGYPQHQTVTTTEITHHGTCQDVNHNKVIETNRENDKQETWMLMELQKIRRQIEHCEGRMTLKNLPLADQGSSHHITVKINELKSVQNDSQAIAEVLNQLKDMLANFR-GSEKYCYLQNEVFGLFQKLENINGVTDGYLNSLCTVRALLQAI---LQTEDMLKVYEARLTEEETVCLDLDKVEAYRCGLKKIKNDLNLKKSLLATMKTELQKAQQIHSQTSQQYPLYDLDLGKFGEKVTQLTDRWQRIDKQIDFRLWDLEKQIKQLRNYRDNYQAFCKWLYDAKRRQDSLESMKFGDSNTVMRFLNEQKNLHSEISGKRDKSEEVQKIAELCANSIKDYELQLASYTSGLETLLNIPIKRTMIQSPSGVILQEAADVHARYIELLTRSGDYYRFLSEMLKSLEDLKLKNTKIEVLEEELRLARDANSENCNKNKFLDQNLQKYQAECSQFKAKLASLEELKRQAELDGKSAKQNLDKCYGQIKELNEKITRLTYEIEDEKRRRKSVEDRFDQQKNDYDQLQKARQCEKENLGWQKLESEKAIKEKEYEIERLRVLLQEEGTRKREYENELAKVRNHYNEEMSNLRNKYETEINITKTTIKEISMQKEDDSKNLRNQLDRLSRENRDLKDEIVRLNDSILQATEQRRRAEENALQQKACGSEIMQKKQHLEIELKQVMQQRSEDNARHKQSLEEAAKTIQDKNKEIERLKAEFQEEAKRRWEYENELSKVRNNYDEEIISLKNQFETEINITKTTIHQLTMQKEEDTSGYRAQIDNLTRENRSLSEEIKRLKNTLTQTTENLRRVEEDIQQQKATGSEVSQRKQQLEVELRQVTQMRTEESVRYKQSLDDAAKTIQDKNKEIERLKQLIDKETNDRKCLEDENARLQRVQYDLQKANSSATETINKLKVQEQELTRLRIDYERVSQERTVKDQDITRFQNSLKELQLQKQKVEEELNRLKRTASEDSCKRKKLEEELEGMRRSLKEQAIKITNLTQQLEQASIVKKRSEDDLRQQRDVLDGHLREKQRTQEELRRLSSEVEALRRQLLQEQESVKQAHLRNEHFQKAIEDKSRSLNESKIEIERLQSLTENLTKEHLMLEEELRNLRLEYDDLRRGRSEADSDKNATILELRSQLQISNNRTLELQGLINDLQRERENLRQEIEKFQKQALEASNRIQESKNQCTQVVQERESLLVKIKVLEQDKARLQRLEDELNRAKSTLEAETRVKQRLECEKQQIQNDLNQWKTQYSRKEEAIRKIESEREKSEREKNSLRSEIERLQAEIKRIEERCRRKLEDSTRETQSQLETERSRYQREIDKLRQRPYGSHRETQTECEWTVDTSKLVFDGLRKKVTAMQLYECQLIDKTTLDKLLKGKKSVEEVASEIQPFLRGAGSIAGASASPKEKYSLVEAKRKKLISPESTVMLLEAQAATGGIIDPHRNEKLTVDSAIARDLIDFDDRQQIYAAEKAITGFDDPFSGKTVSVSEAIKKNLIDRETGMRLLEAQIASGGVVDPVNSVFLPKDVALARGLIDRDLYRSLNDPRDSQKNFVDPVTKKKVSYVQLKERCRIEPHTGLLLLSVQKRSMSFQGIRQPVTVTELVDSGILRPSTVNELESGQISYDEVGERIKDFLQGSSCIAGIYNETTKQKLGIYEAMKIGLVRPGTALELLEAQAATGFIVDPVSNLRLPVEEAYKRGLVGIEFKEKLLSAERAVTGYNDPETGNIISLFQAMNKELIEKGHGIRLLEAQIATGGIIDPKESHRLPVDIAYKRGYFNEELSEILSDPSDDTKGFFDPNTEENLTYLQLKERCIKDEETGLCLLPLKEKKKQVQTSQKNTLRKRRVVIVDPETNKEMSVQEAYKKGLIDYETFKELCEQECEWEEITITGSDGSTRVVLVDRKTGSQYDIQDAIDKGLVDRKFFDQYRSGSLSLTQFADMISLKNGVGTSSSMGSGVSDDVFSSSRHESVSKISTISSVRNLTIRSSSFSDTLEESSPIAAIFDTENLEKISITEGIERGIVDSITGQRLLEAQACTGGIIHPTTGQKLSLQDAVSQGVIDQDMATRLKPAQKAFIGFEGVKGKKKMSAAEAVKEKWLPYEAGQRFLEFQYLTGGLVDPEVHGRISTEEAIRKGFIDGRAAQRLQDTSSYAKILTCPKTKLKISYKDAINRSMVEDITGLRLLEAASVSSKGLPSPYNMSSAPGSRSGSRSGSRSGSRSGSRSGSRRGSFDATGNSSYSYSYSFSSSSIGH 2 1 2 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------MIEKY-SGLASDLLTWIEQTITVLNSRKFANSLAGVQQQLQAFSTYRTVEKPPKFQEKGNLEVLLFTIQSRMRANNQKVYTPHDGKLVSDINRAWESLEEAEYRRELALRSELIRQEKLEQLARRFDRKAAMRETWLNENQRLVAQDNFGYDLAAVEAAKKKHEAIETDTAAYEERVRALEDLARELELENYHDQKRITARKDNILRLWNYLQELLQSRRQRLETTLALQQLFQDMLHSIDWMDEIKAHLLSAE---FGKHLLEAEDLLQKHKLMEADIAIQGDKVKAITAATLQFTEETG------------------------------------------------------------YQPCDPQVIRDRVSHLEQCFAELSNTAAGRKAQLEQSKRLWKL-FWEMDEAKSWIKEKEQIYSSLGYGKDLTSVLILQRKHKAFEDELRRLDPHLDQIFQEAEDMVALKQFGYPKNEAWVKEVSAQWDQLKEVPAQWNQLKELAASRKK---------------------NL-Q---DT-ENFFQFQGDVDDLKAWLQDAHKLLSGED-VGQDE---GATRALGKKHKDFLEELEESRGVMEHLEQQAQDFPERFRDSPDVTNRLQVLRDLYQQVVAQADLRRQRLQDALDLYTVFGETDACELWMGEKEKWLAQM-DIPDTLEDLEVVQHRFDILDQEMKTLIAQIDGVNVAANSLVE----------SNHPRSTEVKQYQDHLNTRWREFQTMVLARREAVDSAL-RVHNYCVDCEETSKWIIDKTKVVESTKD-LGQDLAGVMAIQRKLSGLERDVAAIQVRVGALEQESHRLMES------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB & AlphaFold DB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL, target not predicted to be a monomer {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8iah.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 8' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . GLY 179 179 ? A 298.244 372.779 232.251 1 1 2 GLY 0.550 1 ATOM 2 C CA . GLY 179 179 ? A 297.656 373.141 230.895 1 1 2 GLY 0.550 1 ATOM 3 C C . GLY 179 179 ? A 297.707 374.575 230.412 1 1 2 GLY 0.550 1 ATOM 4 O O . GLY 179 179 ? A 297.752 374.803 229.209 1 1 2 GLY 0.550 1 ATOM 5 N N . TRP 180 180 ? A 297.739 375.603 231.293 1 1 2 TRP 0.510 1 ATOM 6 C CA . TRP 180 180 ? A 298.050 376.967 230.871 1 1 2 TRP 0.510 1 ATOM 7 C C . TRP 180 180 ? A 299.419 377.065 230.183 1 1 2 TRP 0.510 1 ATOM 8 O O . TRP 180 180 ? A 299.499 377.407 229.005 1 1 2 TRP 0.510 1 ATOM 9 C CB . TRP 180 180 ? A 297.961 377.904 232.104 1 1 2 TRP 0.510 1 ATOM 10 C CG . TRP 180 180 ? A 298.181 379.385 231.839 1 1 2 TRP 0.510 1 ATOM 11 C CD1 . TRP 180 180 ? A 297.692 380.147 230.821 1 1 2 TRP 0.510 1 ATOM 12 C CD2 . TRP 180 180 ? A 299.111 380.220 232.545 1 1 2 TRP 0.510 1 ATOM 13 N NE1 . TRP 180 180 ? A 298.169 381.429 230.907 1 1 2 TRP 0.510 1 ATOM 14 C CE2 . TRP 180 180 ? 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A 306.395 376.063 207.213 1 1 2 GLN 0.630 1 ATOM 171 N N . ARG 199 199 ? A 304.013 381.980 206.046 1 1 2 ARG 0.590 1 ATOM 172 C CA . ARG 199 199 ? A 303.587 383.092 205.208 1 1 2 ARG 0.590 1 ATOM 173 C C . ARG 199 199 ? A 304.728 383.647 204.381 1 1 2 ARG 0.590 1 ATOM 174 O O . ARG 199 199 ? A 304.545 383.932 203.208 1 1 2 ARG 0.590 1 ATOM 175 C CB . ARG 199 199 ? A 302.877 384.230 205.974 1 1 2 ARG 0.590 1 ATOM 176 C CG . ARG 199 199 ? A 301.483 383.829 206.497 1 1 2 ARG 0.590 1 ATOM 177 C CD . ARG 199 199 ? A 300.587 384.984 206.955 1 1 2 ARG 0.590 1 ATOM 178 N NE . ARG 199 199 ? A 301.386 385.888 207.819 1 1 2 ARG 0.590 1 ATOM 179 C CZ . ARG 199 199 ? A 301.507 385.786 209.146 1 1 2 ARG 0.590 1 ATOM 180 N NH1 . ARG 199 199 ? A 301.036 384.772 209.857 1 1 2 ARG 0.590 1 ATOM 181 N NH2 . ARG 199 199 ? A 302.137 386.745 209.814 1 1 2 ARG 0.590 1 ATOM 182 N N . ALA 200 200 ? A 305.945 383.709 204.956 1 1 2 ALA 0.660 1 ATOM 183 C CA . ALA 200 200 ? 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A 305.101 381.552 201.420 1 1 2 MET 0.480 1 ATOM 197 C CA . MET 202 202 ? A 303.960 381.789 200.553 1 1 2 MET 0.480 1 ATOM 198 C C . MET 202 202 ? A 303.876 383.201 199.978 1 1 2 MET 0.480 1 ATOM 199 O O . MET 202 202 ? A 303.014 383.460 199.129 1 1 2 MET 0.480 1 ATOM 200 C CB . MET 202 202 ? A 302.624 381.459 201.267 1 1 2 MET 0.480 1 ATOM 201 C CG . MET 202 202 ? A 302.435 379.974 201.638 1 1 2 MET 0.480 1 ATOM 202 S SD . MET 202 202 ? A 302.554 378.801 200.248 1 1 2 MET 0.480 1 ATOM 203 C CE . MET 202 202 ? A 301.052 379.325 199.375 1 1 2 MET 0.480 1 ATOM 204 N N . ASP 203 203 ? A 304.801 384.109 200.329 1 1 2 ASP 0.480 1 ATOM 205 C CA . ASP 203 203 ? A 305.023 385.391 199.685 1 1 2 ASP 0.480 1 ATOM 206 C C . ASP 203 203 ? A 305.820 385.253 198.385 1 1 2 ASP 0.480 1 ATOM 207 O O . ASP 203 203 ? A 305.877 386.173 197.566 1 1 2 ASP 0.480 1 ATOM 208 C CB . ASP 203 203 ? A 305.814 386.368 200.595 1 1 2 ASP 0.480 1 ATOM 209 C CG . ASP 203 203 ? 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A 306.380 385.037 192.296 1 1 2 VAL 0.320 1 ATOM 223 O O . VAL 205 205 ? A 305.936 385.571 191.282 1 1 2 VAL 0.320 1 ATOM 224 C CB . VAL 205 205 ? A 304.791 386.353 193.728 1 1 2 VAL 0.320 1 ATOM 225 C CG1 . VAL 205 205 ? A 303.732 386.181 194.835 1 1 2 VAL 0.320 1 ATOM 226 C CG2 . VAL 205 205 ? A 305.677 387.587 193.971 1 1 2 VAL 0.320 1 ATOM 227 N N . ALA 206 206 ? A 307.541 384.364 192.268 1 1 2 ALA 0.480 1 ATOM 228 C CA . ALA 206 206 ? A 308.390 384.320 191.107 1 1 2 ALA 0.480 1 ATOM 229 C C . ALA 206 206 ? A 308.746 382.880 190.801 1 1 2 ALA 0.480 1 ATOM 230 O O . ALA 206 206 ? A 309.221 382.148 191.669 1 1 2 ALA 0.480 1 ATOM 231 C CB . ALA 206 206 ? A 309.656 385.156 191.375 1 1 2 ALA 0.480 1 ATOM 232 N N . TRP 207 207 ? A 308.498 382.431 189.557 1 1 2 TRP 0.450 1 ATOM 233 C CA . TRP 207 207 ? A 308.820 381.091 189.134 1 1 2 TRP 0.450 1 ATOM 234 C C . TRP 207 207 ? A 308.956 381.095 187.624 1 1 2 TRP 0.450 1 ATOM 235 O O . TRP 207 207 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #