data_SMR-22901c638eb8c8a911a8cbb1eb9c3956_10 _entry.id SMR-22901c638eb8c8a911a8cbb1eb9c3956_10 _struct.entry_id SMR-22901c638eb8c8a911a8cbb1eb9c3956_10 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q8VIP2/ MLXPL_RAT, Carbohydrate-responsive element-binding protein Estimated model accuracy of this model is 0.042, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q8VIP2' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 110590.299 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP MLXPL_RAT Q8VIP2 1 ;MARALADLSVNLQVPRVVPSPDSDSDTDLEDPSPRRSAGGLHRSQVIHSGHFMVSSPHSDSLTRRRDQEG PVGLADFGPRSIDPTLTRLFECLSLAYSGKLVSPKWKNFKGLKLLCRDKIRLNNAIWRAWYIQYVQRRKS PVCGFVTPLQGSEADEHRKPEAVVLEGNYWKRRIEVVMREYHKWRIYYKKRLRKSSREGDFLAPKQVEGG WPPPERWCEQLFSSVVPVLLGGSEEEPGGRQLLDLDCFLSDISDTLFTMTQPSPSSLQLPSEDAYVGNAD MIQPDLTPLQPSLDDFMEISDFFTNYRPPQTPTSSNFPEPPSFGPMADSLFSGGILGPEMPSPASASSSS GMTPLSGNTRLQARNSCSGPLDPSTFPSSEFLLPEDPKTKMPPAPVPTPLLPYPGPVKVHGLEPCTPSPF PTMAPPPALLSEEPLFSARFPFTTVPPAPGVSTLPAPTTFVPTPQPGPGPGPVPFPVDHLPHGYLEPVFG PHFTVPQGVQPRCKPCSPPPGGRKASPPTLTSATASPTATATARDNNPCLTQLLRAAKPEQVLEPSTVPS TLLRPPESPDAVPEIPRVRAFYPPIPAPTPPRPPPGPATLAPPRSLVVPKAERLSPPASSGSERRPSGDL NSIQPPGALSVHLSPPQTVLSRGRVDNNKMENRRITHISAEQKRRFNIKLGFDTLHGLVSTLSAQPSLKV SKATTLQKTAEYILMLQQERAAMQEEAQQLRDEIEELNAAINLCQQQLPATGVPITHQRFDQMRDMFDDY VRTRTLHNWKFWVFSILIRPLFESFNGMVSTASLHSLRQTSLAWLDQYCSLPALRPTVLNSLRQLSTSTS ILTDPSLVPEQATRAVTEGPLGRPL ; 'Carbohydrate-responsive element-binding protein' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 865 1 865 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . MLXPL_RAT Q8VIP2 . 1 865 10116 'Rattus norvegicus (Rat)' 2002-03-01 5B818B081B83C641 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no B ;MARALADLSVNLQVPRVVPSPDSDSDTDLEDPSPRRSAGGLHRSQVIHSGHFMVSSPHSDSLTRRRDQEG PVGLADFGPRSIDPTLTRLFECLSLAYSGKLVSPKWKNFKGLKLLCRDKIRLNNAIWRAWYIQYVQRRKS PVCGFVTPLQGSEADEHRKPEAVVLEGNYWKRRIEVVMREYHKWRIYYKKRLRKSSREGDFLAPKQVEGG WPPPERWCEQLFSSVVPVLLGGSEEEPGGRQLLDLDCFLSDISDTLFTMTQPSPSSLQLPSEDAYVGNAD MIQPDLTPLQPSLDDFMEISDFFTNYRPPQTPTSSNFPEPPSFGPMADSLFSGGILGPEMPSPASASSSS GMTPLSGNTRLQARNSCSGPLDPSTFPSSEFLLPEDPKTKMPPAPVPTPLLPYPGPVKVHGLEPCTPSPF PTMAPPPALLSEEPLFSARFPFTTVPPAPGVSTLPAPTTFVPTPQPGPGPGPVPFPVDHLPHGYLEPVFG PHFTVPQGVQPRCKPCSPPPGGRKASPPTLTSATASPTATATARDNNPCLTQLLRAAKPEQVLEPSTVPS TLLRPPESPDAVPEIPRVRAFYPPIPAPTPPRPPPGPATLAPPRSLVVPKAERLSPPASSGSERRPSGDL NSIQPPGALSVHLSPPQTVLSRGRVDNNKMENRRITHISAEQKRRFNIKLGFDTLHGLVSTLSAQPSLKV SKATTLQKTAEYILMLQQERAAMQEEAQQLRDEIEELNAAINLCQQQLPATGVPITHQRFDQMRDMFDDY VRTRTLHNWKFWVFSILIRPLFESFNGMVSTASLHSLRQTSLAWLDQYCSLPALRPTVLNSLRQLSTSTS ILTDPSLVPEQATRAVTEGPLGRPL ; ;MARALADLSVNLQVPRVVPSPDSDSDTDLEDPSPRRSAGGLHRSQVIHSGHFMVSSPHSDSLTRRRDQEG PVGLADFGPRSIDPTLTRLFECLSLAYSGKLVSPKWKNFKGLKLLCRDKIRLNNAIWRAWYIQYVQRRKS PVCGFVTPLQGSEADEHRKPEAVVLEGNYWKRRIEVVMREYHKWRIYYKKRLRKSSREGDFLAPKQVEGG WPPPERWCEQLFSSVVPVLLGGSEEEPGGRQLLDLDCFLSDISDTLFTMTQPSPSSLQLPSEDAYVGNAD MIQPDLTPLQPSLDDFMEISDFFTNYRPPQTPTSSNFPEPPSFGPMADSLFSGGILGPEMPSPASASSSS GMTPLSGNTRLQARNSCSGPLDPSTFPSSEFLLPEDPKTKMPPAPVPTPLLPYPGPVKVHGLEPCTPSPF PTMAPPPALLSEEPLFSARFPFTTVPPAPGVSTLPAPTTFVPTPQPGPGPGPVPFPVDHLPHGYLEPVFG PHFTVPQGVQPRCKPCSPPPGGRKASPPTLTSATASPTATATARDNNPCLTQLLRAAKPEQVLEPSTVPS TLLRPPESPDAVPEIPRVRAFYPPIPAPTPPRPPPGPATLAPPRSLVVPKAERLSPPASSGSERRPSGDL NSIQPPGALSVHLSPPQTVLSRGRVDNNKMENRRITHISAEQKRRFNIKLGFDTLHGLVSTLSAQPSLKV SKATTLQKTAEYILMLQQERAAMQEEAQQLRDEIEELNAAINLCQQQLPATGVPITHQRFDQMRDMFDDY VRTRTLHNWKFWVFSILIRPLFESFNGMVSTASLHSLRQTSLAWLDQYCSLPALRPTVLNSLRQLSTSTS ILTDPSLVPEQATRAVTEGPLGRPL ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 ALA . 1 3 ARG . 1 4 ALA . 1 5 LEU . 1 6 ALA . 1 7 ASP . 1 8 LEU . 1 9 SER . 1 10 VAL . 1 11 ASN . 1 12 LEU . 1 13 GLN . 1 14 VAL . 1 15 PRO . 1 16 ARG . 1 17 VAL . 1 18 VAL . 1 19 PRO . 1 20 SER . 1 21 PRO . 1 22 ASP . 1 23 SER . 1 24 ASP . 1 25 SER . 1 26 ASP . 1 27 THR . 1 28 ASP . 1 29 LEU . 1 30 GLU . 1 31 ASP . 1 32 PRO . 1 33 SER . 1 34 PRO . 1 35 ARG . 1 36 ARG . 1 37 SER . 1 38 ALA . 1 39 GLY . 1 40 GLY . 1 41 LEU . 1 42 HIS . 1 43 ARG . 1 44 SER . 1 45 GLN . 1 46 VAL . 1 47 ILE . 1 48 HIS . 1 49 SER . 1 50 GLY . 1 51 HIS . 1 52 PHE . 1 53 MET . 1 54 VAL . 1 55 SER . 1 56 SER . 1 57 PRO . 1 58 HIS . 1 59 SER . 1 60 ASP . 1 61 SER . 1 62 LEU . 1 63 THR . 1 64 ARG . 1 65 ARG . 1 66 ARG . 1 67 ASP . 1 68 GLN . 1 69 GLU . 1 70 GLY . 1 71 PRO . 1 72 VAL . 1 73 GLY . 1 74 LEU . 1 75 ALA . 1 76 ASP . 1 77 PHE . 1 78 GLY . 1 79 PRO . 1 80 ARG . 1 81 SER . 1 82 ILE . 1 83 ASP . 1 84 PRO . 1 85 THR . 1 86 LEU . 1 87 THR . 1 88 ARG . 1 89 LEU . 1 90 PHE . 1 91 GLU . 1 92 CYS . 1 93 LEU . 1 94 SER . 1 95 LEU . 1 96 ALA . 1 97 TYR . 1 98 SER . 1 99 GLY . 1 100 LYS . 1 101 LEU . 1 102 VAL . 1 103 SER . 1 104 PRO . 1 105 LYS . 1 106 TRP . 1 107 LYS . 1 108 ASN . 1 109 PHE . 1 110 LYS . 1 111 GLY . 1 112 LEU . 1 113 LYS . 1 114 LEU . 1 115 LEU . 1 116 CYS . 1 117 ARG . 1 118 ASP . 1 119 LYS . 1 120 ILE . 1 121 ARG . 1 122 LEU . 1 123 ASN . 1 124 ASN . 1 125 ALA . 1 126 ILE . 1 127 TRP . 1 128 ARG . 1 129 ALA . 1 130 TRP . 1 131 TYR . 1 132 ILE . 1 133 GLN . 1 134 TYR . 1 135 VAL . 1 136 GLN . 1 137 ARG . 1 138 ARG . 1 139 LYS . 1 140 SER . 1 141 PRO . 1 142 VAL . 1 143 CYS . 1 144 GLY . 1 145 PHE . 1 146 VAL . 1 147 THR . 1 148 PRO . 1 149 LEU . 1 150 GLN . 1 151 GLY . 1 152 SER . 1 153 GLU . 1 154 ALA . 1 155 ASP . 1 156 GLU . 1 157 HIS . 1 158 ARG . 1 159 LYS . 1 160 PRO . 1 161 GLU . 1 162 ALA . 1 163 VAL . 1 164 VAL . 1 165 LEU . 1 166 GLU . 1 167 GLY . 1 168 ASN . 1 169 TYR . 1 170 TRP . 1 171 LYS . 1 172 ARG . 1 173 ARG . 1 174 ILE . 1 175 GLU . 1 176 VAL . 1 177 VAL . 1 178 MET . 1 179 ARG . 1 180 GLU . 1 181 TYR . 1 182 HIS . 1 183 LYS . 1 184 TRP . 1 185 ARG . 1 186 ILE . 1 187 TYR . 1 188 TYR . 1 189 LYS . 1 190 LYS . 1 191 ARG . 1 192 LEU . 1 193 ARG . 1 194 LYS . 1 195 SER . 1 196 SER . 1 197 ARG . 1 198 GLU . 1 199 GLY . 1 200 ASP . 1 201 PHE . 1 202 LEU . 1 203 ALA . 1 204 PRO . 1 205 LYS . 1 206 GLN . 1 207 VAL . 1 208 GLU . 1 209 GLY . 1 210 GLY . 1 211 TRP . 1 212 PRO . 1 213 PRO . 1 214 PRO . 1 215 GLU . 1 216 ARG . 1 217 TRP . 1 218 CYS . 1 219 GLU . 1 220 GLN . 1 221 LEU . 1 222 PHE . 1 223 SER . 1 224 SER . 1 225 VAL . 1 226 VAL . 1 227 PRO . 1 228 VAL . 1 229 LEU . 1 230 LEU . 1 231 GLY . 1 232 GLY . 1 233 SER . 1 234 GLU . 1 235 GLU . 1 236 GLU 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B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Carbohydrate-responsive element-binding protein {PDB ID=5f74, label_asym_id=B, auth_asym_id=B, SMTL ID=5f74.1.B}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 5f74, label_asym_id=B' 'target-template alignment' . 4 'model 10' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-25 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-20 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A B 2 1 B # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MARALADLSVNLQVPRVVPSPDSDSDTDLEDPSPRRSAGGLHRSQVIHSGHFMVSSPHSDSLTRRRDQEG PVGLADFGPRSIDPTLTRLFECLSLAYSGKLVSPKWKNFKGLKLLCRDKIRLNNAIWRAWYIQYVQRRKS PVCGFVTPLQGSEADEHRKPEAVVLEGNYWKRRIEVVMREYHKWRIYYKKRLRKSS ; ;MARALADLSVNLQVPRVVPSPDSDSDTDLEDPSPRRSAGGLHRSQVIHSGHFMVSSPHSDSLTRRRDQEG PVGLADFGPRSIDPTLTRLFECLSLAYSGKLVSPKWKNFKGLKLLCRDKIRLNNAIWRAWYIQYVQRRKS PVCGFVTPLQGSEADEHRKPEAVVLEGNYWKRRIEVVMREYHKWRIYYKKRLRKSS ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 1 195 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 5f74 2023-09-27 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 865 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 865 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 6.7e-79 100.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MARALADLSVNLQVPRVVPSPDSDSDTDLEDPSPRRSAGGLHRSQVIHSGHFMVSSPHSDSLTRRRDQEGPVGLADFGPRSIDPTLTRLFECLSLAYSGKLVSPKWKNFKGLKLLCRDKIRLNNAIWRAWYIQYVQRRKSPVCGFVTPLQGSEADEHRKPEAVVLEGNYWKRRIEVVMREYHKWRIYYKKRLRKSSREGDFLAPKQVEGGWPPPERWCEQLFSSVVPVLLGGSEEEPGGRQLLDLDCFLSDISDTLFTMTQPSPSSLQLPSEDAYVGNADMIQPDLTPLQPSLDDFMEISDFFTNYRPPQTPTSSNFPEPPSFGPMADSLFSGGILGPEMPSPASASSSSGMTPLSGNTRLQARNSCSGPLDPSTFPSSEFLLPEDPKTKMPPAPVPTPLLPYPGPVKVHGLEPCTPSPFPTMAPPPALLSEEPLFSARFPFTTVPPAPGVSTLPAPTTFVPTPQPGPGPGPVPFPVDHLPHGYLEPVFGPHFTVPQGVQPRCKPCSPPPGGRKASPPTLTSATASPTATATARDNNPCLTQLLRAAKPEQVLEPSTVPSTLLRPPESPDAVPEIPRVRAFYPPIPAPTPPRPPPGPATLAPPRSLVVPKAERLSPPASSGSERRPSGDLNSIQPPGALSVHLSPPQTVLSRGRVDNNKMENRRITHISAEQKRRFNIKLGFDTLHGLVSTLSAQPSLKVSKATTLQKTAEYILMLQQERAAMQEEAQQLRDEIEELNAAINLCQQQLPATGVPITHQRFDQMRDMFDDYVRTRTLHNWKFWVFSILIRPLFESFNGMVSTASLHSLRQTSLAWLDQYCSLPALRPTVLNSLRQLSTSTSILTDPSLVPEQATRAVTEGPLGRPL 2 1 2 MARALADLSVNLQVPRVVPSPDSDSDTDLEDPSPRRSAGGLHRSQVIHSGHFMVSSPHSDSLTRRRDQEGPVGLADFGPRSIDPTLTRLFECLSLAYSGKLVSPKWKNFKGLKLLCRDKIRLNNAIWRAWYIQYVQRRKSPVCGFVTPLQGSEADEHRKPEAVVLEGNYWKRRIEVVMREYHKWRIYYKKRLRKS---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 5f74.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 10' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . ARG 117 117 ? A 12.471 54.278 -1.393 1 1 B ARG 0.270 1 ATOM 2 C CA . ARG 117 117 ? A 13.489 54.152 -0.336 1 1 B ARG 0.270 1 ATOM 3 C C . ARG 117 117 ? A 12.957 54.423 1.072 1 1 B ARG 0.270 1 ATOM 4 O O . ARG 117 117 ? A 13.192 53.611 1.957 1 1 B ARG 0.270 1 ATOM 5 C CB . ARG 117 117 ? A 14.656 54.990 -0.860 1 1 B ARG 0.270 1 ATOM 6 C CG . ARG 117 117 ? A 15.902 54.879 0.003 1 1 B ARG 0.270 1 ATOM 7 C CD . ARG 117 117 ? A 17.038 55.709 -0.582 1 1 B ARG 0.270 1 ATOM 8 N NE . ARG 117 117 ? A 17.921 56.014 0.573 1 1 B ARG 0.270 1 ATOM 9 C CZ . ARG 117 117 ? A 19.197 55.639 0.717 1 1 B ARG 0.270 1 ATOM 10 N NH1 . ARG 117 117 ? A 19.822 54.887 -0.183 1 1 B ARG 0.270 1 ATOM 11 N NH2 . ARG 117 117 ? A 19.865 56.048 1.793 1 1 B ARG 0.270 1 ATOM 12 N N . ASP 118 118 ? A 12.117 55.454 1.310 1 1 B ASP 0.340 1 ATOM 13 C CA . ASP 118 118 ? A 11.406 55.609 2.578 1 1 B ASP 0.340 1 ATOM 14 C C . ASP 118 118 ? A 10.442 54.470 2.876 1 1 B ASP 0.340 1 ATOM 15 O O . ASP 118 118 ? A 10.174 54.143 4.027 1 1 B ASP 0.340 1 ATOM 16 C CB . ASP 118 118 ? A 10.743 56.996 2.585 1 1 B ASP 0.340 1 ATOM 17 C CG . ASP 118 118 ? A 11.877 58.010 2.465 1 1 B ASP 0.340 1 ATOM 18 O OD1 . ASP 118 118 ? A 12.964 57.764 3.063 1 1 B ASP 0.340 1 ATOM 19 O OD2 . ASP 118 118 ? A 11.711 58.949 1.653 1 1 B ASP 0.340 1 ATOM 20 N N . LYS 119 119 ? A 10.000 53.761 1.818 1 1 B LYS 0.540 1 ATOM 21 C CA . LYS 119 119 ? A 9.208 52.543 1.867 1 1 B LYS 0.540 1 ATOM 22 C C . LYS 119 119 ? A 9.881 51.431 2.690 1 1 B LYS 0.540 1 ATOM 23 O O . LYS 119 119 ? A 9.253 50.814 3.547 1 1 B LYS 0.540 1 ATOM 24 C CB . LYS 119 119 ? A 8.846 52.044 0.418 1 1 B LYS 0.540 1 ATOM 25 C CG . LYS 119 119 ? A 9.081 53.066 -0.730 1 1 B LYS 0.540 1 ATOM 26 C CD . LYS 119 119 ? A 8.427 52.704 -2.091 1 1 B LYS 0.540 1 ATOM 27 C CE . LYS 119 119 ? A 8.405 53.801 -3.188 1 1 B LYS 0.540 1 ATOM 28 N NZ . LYS 119 119 ? A 9.720 53.986 -3.856 1 1 B LYS 0.540 1 ATOM 29 N N . ILE 120 120 ? A 11.200 51.194 2.492 1 1 B ILE 0.520 1 ATOM 30 C CA . ILE 120 120 ? A 12.006 50.262 3.280 1 1 B ILE 0.520 1 ATOM 31 C C . ILE 120 120 ? A 12.131 50.732 4.721 1 1 B ILE 0.520 1 ATOM 32 O O . ILE 120 120 ? A 11.939 49.966 5.668 1 1 B ILE 0.520 1 ATOM 33 C CB . ILE 120 120 ? A 13.415 50.092 2.691 1 1 B ILE 0.520 1 ATOM 34 C CG1 . ILE 120 120 ? A 13.416 49.557 1.236 1 1 B ILE 0.520 1 ATOM 35 C CG2 . ILE 120 120 ? A 14.310 49.213 3.595 1 1 B ILE 0.520 1 ATOM 36 C CD1 . ILE 120 120 ? A 12.886 48.131 1.077 1 1 B ILE 0.520 1 ATOM 37 N N . ARG 121 121 ? A 12.425 52.036 4.918 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 38 C CA . ARG 121 121 ? A 12.578 52.629 6.234 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 39 C C . ARG 121 121 ? A 11.316 52.562 7.082 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 40 O O . ARG 121 121 ? A 11.349 52.153 8.240 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 41 C CB . ARG 121 121 ? A 12.969 54.124 6.121 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 42 C CG . ARG 121 121 ? A 14.366 54.389 5.527 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 43 C CD . ARG 121 121 ? A 14.741 55.876 5.438 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 44 N NE . ARG 121 121 ? A 14.716 56.391 6.843 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 45 C CZ . ARG 121 121 ? A 14.786 57.686 7.172 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 46 N NH1 . ARG 121 121 ? A 14.917 58.624 6.245 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 47 N NH2 . ARG 121 121 ? A 14.654 58.058 8.444 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 48 N N . LEU 122 122 ? A 10.166 52.942 6.502 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 49 C CA . LEU 122 122 ? A 8.878 52.920 7.160 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 50 C C . LEU 122 122 ? A 8.425 51.509 7.548 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 51 O O . LEU 122 122 ? A 7.980 51.263 8.671 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 52 C CB . LEU 122 122 ? A 7.832 53.649 6.288 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 53 C CG . LEU 122 122 ? A 6.677 54.255 7.100 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 54 C CD1 . LEU 122 122 ? A 7.134 55.524 7.838 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 55 C CD2 . LEU 122 122 ? A 5.476 54.554 6.194 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 56 N N . ASN 123 123 ? A 8.610 50.530 6.635 1 1 B ASN 0.630 1 ATOM 57 C CA . ASN 123 123 ? 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'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.528 2 1 3 0.042 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 117 ARG 1 0.270 2 1 A 118 ASP 1 0.340 3 1 A 119 LYS 1 0.540 4 1 A 120 ILE 1 0.520 5 1 A 121 ARG 1 0.520 6 1 A 122 LEU 1 0.590 7 1 A 123 ASN 1 0.630 8 1 A 124 ASN 1 0.650 9 1 A 125 ALA 1 0.690 10 1 A 126 ILE 1 0.630 11 1 A 127 TRP 1 0.530 12 1 A 128 ARG 1 0.570 13 1 A 129 ALA 1 0.670 14 1 A 130 TRP 1 0.490 15 1 A 131 TYR 1 0.560 16 1 A 132 ILE 1 0.560 17 1 A 133 GLN 1 0.570 18 1 A 134 TYR 1 0.530 19 1 A 135 VAL 1 0.350 20 1 A 136 GLN 1 0.360 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #