data_SMR-1566df200ba7574c09f406d760f1cc36_2 _entry.id SMR-1566df200ba7574c09f406d760f1cc36_2 _struct.entry_id SMR-1566df200ba7574c09f406d760f1cc36_2 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q8WUM4 (isoform 2)/ PDC6I_HUMAN, Programmed cell death 6-interacting protein Estimated model accuracy of this model is 0.014, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q8WUM4 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 112590.174 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP PDC6I_HUMAN Q8WUM4 1 ;MATFISVQLKKTSEVDLAKPLVKFIQQTYPSGGEEQAQYCRAAEELSKLRRAAVGRPLDKHEGALETLLR YYDQICSIEPKFPFSENQICLTFTWKDAFDKGSLFGGSVKLALASLGYEKSCVLFNCAALASQIAAEQNL DNDEGLKIAAKHYQFASGAFLHIKETVLSALSREPTVDISPDTVGTLSLIMLAQAQEVFFLKATRDKMKD AIIAKLANQAADYFGDAFKQCQYKDTLPKYFYFQEVFPVLAAKHCIMQANAEYHQSILAKQQKKFGEEIA RLQHAAELIKTVASRYDEYVNVKDFSDKINRALAAAKKDNDFIYHDRVPDLKDLDPIGKATLVKSTPVNV PISQKFTDLFEKMVPVSVQQSLAAYNQRKADLVNRSIAQMREATTLANGVLASLNLPAAIEDVSGDTVPQ SILTKSRSVIEQGGIQTVDQLIKELPELLQRNREILDESLRLLDEEEATDNDLRAKFKERWQRTPSNELY KPLRAEGTNFRTVLDKAVQADGQVKECYQSHRDTIVLLCKPEPELNAAIPSANPAKTMQGSEVVNVLKSL LSNLDEVKKEREGLENDLKSVNFDMTSKFLTALAQDGVINEEALSVTELDRVYGGLTTKVQESLKKQEGL LKNIQVSHQEFSKMKQSNNEANLREEVLKNLATAYDNFVELVANLKEGTKFYNELTEILVRFQNKCSDIV FARKTERDELLKDLQQSIAREPSAPSIPTPAYQSSPAGGHAPTPPTPAPRTMPPTKPQPPARPPPPVLPA NRAPSATAPSPVGAGTAAPAPSQTPGSAPPPQAQGPPYPTYPGYPGYCQMPMPMGYNPYAYGQYNMPYPP VYHQSPGQAPYPGPQQPSYPFPQPPQQSYYPQQ ; 'Programmed cell death 6-interacting protein' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 873 1 873 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . PDC6I_HUMAN Q8WUM4 Q8WUM4-2 1 873 9606 'Homo sapiens (Human)' 2002-03-01 FAC77FBE20C69D70 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no C ;MATFISVQLKKTSEVDLAKPLVKFIQQTYPSGGEEQAQYCRAAEELSKLRRAAVGRPLDKHEGALETLLR YYDQICSIEPKFPFSENQICLTFTWKDAFDKGSLFGGSVKLALASLGYEKSCVLFNCAALASQIAAEQNL DNDEGLKIAAKHYQFASGAFLHIKETVLSALSREPTVDISPDTVGTLSLIMLAQAQEVFFLKATRDKMKD AIIAKLANQAADYFGDAFKQCQYKDTLPKYFYFQEVFPVLAAKHCIMQANAEYHQSILAKQQKKFGEEIA RLQHAAELIKTVASRYDEYVNVKDFSDKINRALAAAKKDNDFIYHDRVPDLKDLDPIGKATLVKSTPVNV PISQKFTDLFEKMVPVSVQQSLAAYNQRKADLVNRSIAQMREATTLANGVLASLNLPAAIEDVSGDTVPQ SILTKSRSVIEQGGIQTVDQLIKELPELLQRNREILDESLRLLDEEEATDNDLRAKFKERWQRTPSNELY KPLRAEGTNFRTVLDKAVQADGQVKECYQSHRDTIVLLCKPEPELNAAIPSANPAKTMQGSEVVNVLKSL LSNLDEVKKEREGLENDLKSVNFDMTSKFLTALAQDGVINEEALSVTELDRVYGGLTTKVQESLKKQEGL 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FARKTERDELLKDLQQSIAREPSAPSIPTPAYQSSPAGGHAPTPPTPAPRTMPPTKPQPPARPPPPVLPA NRAPSATAPSPVGAGTAAPAPSQTPGSAPPPQAQGPPYPTYPGYPGYCQMPMPMGYNPYAYGQYNMPYPP VYHQSPGQAPYPGPQQPSYPFPQPPQQSYYPQQ ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 ALA . 1 3 THR . 1 4 PHE . 1 5 ILE . 1 6 SER . 1 7 VAL . 1 8 GLN . 1 9 LEU . 1 10 LYS . 1 11 LYS . 1 12 THR . 1 13 SER . 1 14 GLU . 1 15 VAL . 1 16 ASP . 1 17 LEU . 1 18 ALA . 1 19 LYS . 1 20 PRO . 1 21 LEU . 1 22 VAL . 1 23 LYS . 1 24 PHE . 1 25 ILE . 1 26 GLN . 1 27 GLN . 1 28 THR . 1 29 TYR . 1 30 PRO . 1 31 SER . 1 32 GLY . 1 33 GLY . 1 34 GLU . 1 35 GLU . 1 36 GLN . 1 37 ALA . 1 38 GLN . 1 39 TYR . 1 40 CYS . 1 41 ARG . 1 42 ALA . 1 43 ALA . 1 44 GLU . 1 45 GLU . 1 46 LEU . 1 47 SER . 1 48 LYS . 1 49 LEU . 1 50 ARG . 1 51 ARG . 1 52 ALA . 1 53 ALA . 1 54 VAL . 1 55 GLY . 1 56 ARG . 1 57 PRO . 1 58 LEU . 1 59 ASP . 1 60 LYS . 1 61 HIS . 1 62 GLU . 1 63 GLY . 1 64 ALA . 1 65 LEU . 1 66 GLU . 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A 1 873 GLN 873 ? ? ? C . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 '14-3-3 protein sigma {PDB ID=7bdp, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=7bdp.1.C}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 7bdp, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 2' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-25 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-20 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;AMGSMERASLIQKAKLAEQAERYEDMAAFMKGAVEKGEELSCEERNLLSVAYKNVVGGQRAAWRVLSSIE QKSNEEGSEEKGPEVREYREKVETELQGVCDTVLGLLDSHLIKEAGDAESRVFYLKMKGDYYRYLAEVAT GDDKKRIIDSARSAYQEAMDISKKEMPPTNPIRLGLALNFSVFHYEIANSPEEAISLAKTTFDEAMADLH TLSEDSYKDSTLIMQLLRDNLTLWTADNAGEEGGEAPQEPQS ; ;AMGSMERASLIQKAKLAEQAERYEDMAAFMKGAVEKGEELSCEERNLLSVAYKNVVGGQRAAWRVLSSIE QKSNEEGSEEKGPEVREYREKVETELQGVCDTVLGLLDSHLIKEAGDAESRVFYLKMKGDYYRYLAEVAT GDDKKRIIDSARSAYQEAMDISKKEMPPTNPIRLGLALNFSVFHYEIANSPEEAISLAKTTFDEAMADLH TLSEDSYKDSTLIMQLLRDNLTLWTADNAGEEGGEAPQEPQS ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 190 244 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 7bdp 2024-10-16 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 873 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 873 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 130.000 18.182 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MATFISVQLKKTSEVDLAKPLVKFIQQTYPSGGEEQAQYCRAAEELSKLRRAAVGRPLDKHEGALETLLRYYDQICSIEPKFPFSENQICLTFTWKDAFDKGSLFGGSVKLALASLGYEKSCVLFNCAALASQIAAEQNLDNDEGLKIAAKHYQFASGAFLHIKETVLSALSREPTVDISPDTVGTLSLIMLAQAQEVFFLKATRDKMKDAIIAKLANQAADYFGDAFKQCQYKDTLPKYFYFQEVFPVLAAKHCIMQANAEYHQSILAKQQKKFGEEIARLQHAAELIKTVASRYDEYVNVKDFSDKINRALAAAKKDNDFIYHDRVPDLKDLDPIGKATLVKSTPVNVPISQKFTDLFEKMVPVSVQQSLAAYNQRKADLVNRSIAQMREATTLANGVLASLNLPAAIEDVSGDTVPQSILTKSRSVIEQGGIQTVDQLIKELPELLQRNREILDESLRLLDEEEATDNDLRAKFKERWQRTPSNELYKPLRAEGTNFRTVLDKAVQADGQVKECYQSHRDTIVLLCKPEPELNAAIPSANPAKTMQGSEVVNVLKSLLSNLDEVKKEREGLENDLKSVNFDMTSKFLTALAQDGVINEEALSVTELDRVYGGLTTKVQESLKKQEGLLKNIQVSHQEFSKMKQSNNEANLREEVLKNLATAYDNFVELVANLKEGTKFYNELTEILVRFQNKCSDIVFARKTERDELLKDLQQSIAREPSAPSIPTPAYQSSPAGGHAPTPPTPAPRTMPPTKPQPPARPPPPVLPANRAPSATAPSPVGAGTAAPAPSQTPGSAPPPQAQGPPYPTYPGYPGYCQMPMPMGYNPYAYGQYNMPYPPVYHQSPGQAPYPGPQQPSYPFPQPPQQSYYPQQ 2 1 2 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------SPEEAISLAKTTFDEAMADLHTLSED--SYKDSTLIMQLLRDNLTLWTADNAGEEGG-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 7bdp.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 2' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . LEU 653 653 ? A -23.299 19.153 25.129 1 1 C LEU 0.280 1 ATOM 2 C CA . LEU 653 653 ? A -24.141 20.392 25.301 1 1 C LEU 0.280 1 ATOM 3 C C . LEU 653 653 ? A -25.433 20.372 24.511 1 1 C LEU 0.280 1 ATOM 4 O O . LEU 653 653 ? A -25.586 21.098 23.539 1 1 C LEU 0.280 1 ATOM 5 C CB . LEU 653 653 ? A -23.301 21.613 24.852 1 1 C LEU 0.280 1 ATOM 6 C CG . LEU 653 653 ? A -22.010 21.849 25.656 1 1 C LEU 0.280 1 ATOM 7 C CD1 . LEU 653 653 ? A -21.259 23.041 25.043 1 1 C LEU 0.280 1 ATOM 8 C CD2 . LEU 653 653 ? A -22.306 22.114 27.143 1 1 C LEU 0.280 1 ATOM 9 N N . ARG 654 654 ? A -26.407 19.523 24.902 1 1 C ARG 0.300 1 ATOM 10 C CA . ARG 654 654 ? A -27.626 19.290 24.147 1 1 C ARG 0.300 1 ATOM 11 C C . ARG 654 654 ? A -28.507 20.522 23.971 1 1 C ARG 0.300 1 ATOM 12 O O . ARG 654 654 ? A -29.084 20.729 22.914 1 1 C ARG 0.300 1 ATOM 13 C CB . ARG 654 654 ? A -28.438 18.165 24.813 1 1 C ARG 0.300 1 ATOM 14 C CG . ARG 654 654 ? A -27.770 16.783 24.683 1 1 C ARG 0.300 1 ATOM 15 C CD . ARG 654 654 ? A -28.548 15.730 25.470 1 1 C ARG 0.300 1 ATOM 16 N NE . ARG 654 654 ? A -27.835 14.422 25.306 1 1 C ARG 0.300 1 ATOM 17 C CZ . ARG 654 654 ? A -28.179 13.320 25.987 1 1 C ARG 0.300 1 ATOM 18 N NH1 . ARG 654 654 ? A -29.152 13.350 26.892 1 1 C ARG 0.300 1 ATOM 19 N NH2 . ARG 654 654 ? A -27.562 12.165 25.753 1 1 C ARG 0.300 1 ATOM 20 N N . GLU 655 655 ? A -28.600 21.384 25.005 1 1 C GLU 0.550 1 ATOM 21 C CA . GLU 655 655 ? A -29.308 22.643 24.925 1 1 C GLU 0.550 1 ATOM 22 C C . GLU 655 655 ? A -28.728 23.619 23.912 1 1 C GLU 0.550 1 ATOM 23 O O . GLU 655 655 ? A -29.468 24.195 23.128 1 1 C GLU 0.550 1 ATOM 24 C CB . GLU 655 655 ? A -29.390 23.274 26.320 1 1 C GLU 0.550 1 ATOM 25 C CG . GLU 655 655 ? A -30.172 22.371 27.300 1 1 C GLU 0.550 1 ATOM 26 C CD . GLU 655 655 ? A -30.353 23.077 28.636 1 1 C GLU 0.550 1 ATOM 27 O OE1 . GLU 655 655 ? A -29.459 23.888 28.991 1 1 C GLU 0.550 1 ATOM 28 O OE2 . GLU 655 655 ? A -31.399 22.829 29.280 1 1 C GLU 0.550 1 ATOM 29 N N . GLU 656 656 ? A -27.382 23.762 23.852 1 1 C GLU 0.610 1 ATOM 30 C CA . GLU 656 656 ? A -26.686 24.533 22.833 1 1 C GLU 0.610 1 ATOM 31 C C . GLU 656 656 ? A -26.942 23.998 21.425 1 1 C GLU 0.610 1 ATOM 32 O O . GLU 656 656 ? A -27.255 24.735 20.499 1 1 C GLU 0.610 1 ATOM 33 C CB . GLU 656 656 ? A -25.156 24.544 23.112 1 1 C GLU 0.610 1 ATOM 34 C CG . GLU 656 656 ? A -24.377 25.525 22.204 1 1 C GLU 0.610 1 ATOM 35 C CD . GLU 656 656 ? A -24.746 26.985 22.474 1 1 C GLU 0.610 1 ATOM 36 O OE1 . GLU 656 656 ? A -24.289 27.825 21.663 1 1 C GLU 0.610 1 ATOM 37 O OE2 . GLU 656 656 ? A -25.467 27.267 23.470 1 1 C GLU 0.610 1 ATOM 38 N N . VAL 657 657 ? A -26.898 22.649 21.259 1 1 C VAL 0.640 1 ATOM 39 C CA . VAL 657 657 ? A -27.226 21.971 20.004 1 1 C VAL 0.640 1 ATOM 40 C C . VAL 657 657 ? A -28.638 22.296 19.545 1 1 C VAL 0.640 1 ATOM 41 O O . VAL 657 657 ? A -28.851 22.723 18.414 1 1 C VAL 0.640 1 ATOM 42 C CB . VAL 657 657 ? A -27.085 20.443 20.126 1 1 C VAL 0.640 1 ATOM 43 C CG1 . VAL 657 657 ? A -27.597 19.694 18.870 1 1 C VAL 0.640 1 ATOM 44 C CG2 . VAL 657 657 ? A -25.603 20.088 20.356 1 1 C VAL 0.640 1 ATOM 45 N N . LEU 658 658 ? A -29.635 22.164 20.444 1 1 C LEU 0.630 1 ATOM 46 C CA . LEU 658 658 ? A -31.016 22.476 20.144 1 1 C LEU 0.630 1 ATOM 47 C C . LEU 658 658 ? A -31.260 23.948 19.817 1 1 C LEU 0.630 1 ATOM 48 O O . LEU 658 658 ? A -31.934 24.273 18.840 1 1 C LEU 0.630 1 ATOM 49 C CB . LEU 658 658 ? A -31.904 22.048 21.334 1 1 C LEU 0.630 1 ATOM 50 C CG . LEU 658 658 ? A -33.398 22.410 21.194 1 1 C LEU 0.630 1 ATOM 51 C CD1 . LEU 658 658 ? A -34.024 21.805 19.921 1 1 C LEU 0.630 1 ATOM 52 C CD2 . LEU 658 658 ? A -34.144 21.979 22.466 1 1 C LEU 0.630 1 ATOM 53 N N . LYS 659 659 ? A -30.681 24.882 20.605 1 1 C LYS 0.670 1 ATOM 54 C CA . LYS 659 659 ? A -30.779 26.313 20.365 1 1 C LYS 0.670 1 ATOM 55 C C . LYS 659 659 ? A -30.184 26.737 19.032 1 1 C LYS 0.670 1 ATOM 56 O O . LYS 659 659 ? A -30.808 27.486 18.283 1 1 C LYS 0.670 1 ATOM 57 C CB . LYS 659 659 ? A -30.079 27.113 21.489 1 1 C LYS 0.670 1 ATOM 58 C CG . LYS 659 659 ? A -30.845 27.065 22.817 1 1 C LYS 0.670 1 ATOM 59 C CD . LYS 659 659 ? A -30.090 27.805 23.928 1 1 C LYS 0.670 1 ATOM 60 C CE . LYS 659 659 ? A -30.800 27.706 25.279 1 1 C LYS 0.670 1 ATOM 61 N NZ . LYS 659 659 ? A -30.005 28.397 26.313 1 1 C LYS 0.670 1 ATOM 62 N N . ASN 660 660 ? A -28.985 26.219 18.683 1 1 C ASN 0.650 1 ATOM 63 C CA . ASN 660 660 ? A -28.347 26.472 17.401 1 1 C ASN 0.650 1 ATOM 64 C C . ASN 660 660 ? A -29.147 25.964 16.216 1 1 C ASN 0.650 1 ATOM 65 O O . ASN 660 660 ? A -29.318 26.678 15.232 1 1 C ASN 0.650 1 ATOM 66 C CB . ASN 660 660 ? A -26.937 25.821 17.325 1 1 C ASN 0.650 1 ATOM 67 C CG . ASN 660 660 ? A -25.989 26.658 18.179 1 1 C ASN 0.650 1 ATOM 68 O OD1 . ASN 660 660 ? A -26.252 27.817 18.441 1 1 C ASN 0.650 1 ATOM 69 N ND2 . ASN 660 660 ? A -24.836 26.065 18.573 1 1 C ASN 0.650 1 ATOM 70 N N . LEU 661 661 ? A -29.682 24.726 16.290 1 1 C LEU 0.660 1 ATOM 71 C CA . LEU 661 661 ? A -30.523 24.168 15.245 1 1 C LEU 0.660 1 ATOM 72 C C . LEU 661 661 ? A -31.835 24.908 15.039 1 1 C LEU 0.660 1 ATOM 73 O O . LEU 661 661 ? A -32.213 25.181 13.906 1 1 C LEU 0.660 1 ATOM 74 C CB . LEU 661 661 ? A -30.859 22.683 15.512 1 1 C LEU 0.660 1 ATOM 75 C CG . LEU 661 661 ? A -29.670 21.707 15.424 1 1 C LEU 0.660 1 ATOM 76 C CD1 . LEU 661 661 ? A -30.131 20.321 15.906 1 1 C LEU 0.660 1 ATOM 77 C CD2 . LEU 661 661 ? A -29.085 21.632 14.002 1 1 C LEU 0.660 1 ATOM 78 N N . ALA 662 662 ? A -32.548 25.271 16.132 1 1 C ALA 0.680 1 ATOM 79 C CA . ALA 662 662 ? A -33.786 26.021 16.054 1 1 C ALA 0.680 1 ATOM 80 C C . ALA 662 662 ? A -33.597 27.424 15.479 1 1 C ALA 0.680 1 ATOM 81 O O . ALA 662 662 ? A -34.243 27.795 14.505 1 1 C ALA 0.680 1 ATOM 82 C CB . ALA 662 662 ? A -34.401 26.104 17.469 1 1 C ALA 0.680 1 ATOM 83 N N . THR 663 663 ? A -32.613 28.197 15.998 1 1 C THR 0.690 1 ATOM 84 C CA . THR 663 663 ? A -32.280 29.542 15.509 1 1 C THR 0.690 1 ATOM 85 C C . THR 663 663 ? 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PHE 668 668 ? A -32.772 29.043 6.992 1 1 C PHE 0.620 1 ATOM 128 C CG . PHE 668 668 ? A -31.260 29.011 7.114 1 1 C PHE 0.620 1 ATOM 129 C CD1 . PHE 668 668 ? A -30.452 30.162 7.013 1 1 C PHE 0.620 1 ATOM 130 C CD2 . PHE 668 668 ? A -30.612 27.771 7.290 1 1 C PHE 0.620 1 ATOM 131 C CE1 . PHE 668 668 ? A -29.059 30.079 7.131 1 1 C PHE 0.620 1 ATOM 132 C CE2 . PHE 668 668 ? A -29.221 27.684 7.401 1 1 C PHE 0.620 1 ATOM 133 C CZ . PHE 668 668 ? A -28.444 28.841 7.336 1 1 C PHE 0.620 1 ATOM 134 N N . VAL 669 669 ? A -35.851 29.962 7.414 1 1 C VAL 0.600 1 ATOM 135 C CA . VAL 669 669 ? A -37.279 30.016 7.086 1 1 C VAL 0.600 1 ATOM 136 C C . VAL 669 669 ? A -37.725 31.430 6.739 1 1 C VAL 0.600 1 ATOM 137 O O . VAL 669 669 ? A -38.465 31.646 5.805 1 1 C VAL 0.600 1 ATOM 138 C CB . VAL 669 669 ? A -38.194 29.495 8.205 1 1 C VAL 0.600 1 ATOM 139 C CG1 . VAL 669 669 ? A -39.696 29.764 7.926 1 1 C VAL 0.600 1 ATOM 140 C CG2 . VAL 669 669 ? A -38.021 27.976 8.384 1 1 C VAL 0.600 1 ATOM 141 N N . 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'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.571 2 1 3 0.014 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 653 LEU 1 0.280 2 1 A 654 ARG 1 0.300 3 1 A 655 GLU 1 0.550 4 1 A 656 GLU 1 0.610 5 1 A 657 VAL 1 0.640 6 1 A 658 LEU 1 0.630 7 1 A 659 LYS 1 0.670 8 1 A 660 ASN 1 0.650 9 1 A 661 LEU 1 0.660 10 1 A 662 ALA 1 0.680 11 1 A 663 THR 1 0.690 12 1 A 664 ALA 1 0.680 13 1 A 665 TYR 1 0.630 14 1 A 666 ASP 1 0.640 15 1 A 667 ASN 1 0.610 16 1 A 668 PHE 1 0.620 17 1 A 669 VAL 1 0.600 18 1 A 670 GLU 1 0.540 19 1 A 671 LEU 1 0.560 20 1 A 672 VAL 1 0.550 21 1 A 673 ALA 1 0.400 22 1 A 674 ASN 1 0.400 23 1 A 675 LEU 1 0.410 24 1 A 676 LYS 1 0.380 25 1 A 677 GLU 1 0.400 26 1 A 678 GLY 1 0.370 27 1 A 679 THR 1 0.390 28 1 A 680 LYS 1 0.630 29 1 A 681 PHE 1 0.490 30 1 A 682 TYR 1 0.460 31 1 A 683 ASN 1 0.560 32 1 A 684 GLU 1 0.590 33 1 A 685 LEU 1 0.590 34 1 A 686 THR 1 0.610 35 1 A 687 GLU 1 0.620 36 1 A 688 ILE 1 0.670 37 1 A 689 LEU 1 0.680 38 1 A 690 VAL 1 0.740 39 1 A 691 ARG 1 0.640 40 1 A 692 PHE 1 0.640 41 1 A 693 GLN 1 0.640 42 1 A 694 ASN 1 0.680 43 1 A 695 LYS 1 0.640 44 1 A 696 CYS 1 0.680 45 1 A 697 SER 1 0.670 46 1 A 698 ASP 1 0.640 47 1 A 699 ILE 1 0.500 48 1 A 700 VAL 1 0.480 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #