data_SMR-83a07c455cc668226f878b8e95bb56c5_1 _entry.id SMR-83a07c455cc668226f878b8e95bb56c5_1 _struct.entry_id SMR-83a07c455cc668226f878b8e95bb56c5_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q8C0C4/ CCSE1_MOUSE, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1 Estimated model accuracy of this model is 0.007, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q8C0C4' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 114469.264 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP CCSE1_MOUSE Q8C0C4 1 ;MGDSGSRRCTLVSRLPIFRKSINRRHDSLPSSPSSSNTAGVHSSSPSSTNSSSGSTGKRRSIFRAPSISF HHKKGSEPKPEPTEQNLSISNGAQPSHSNMQKLSLEEHVKTRGRHSVGFSSSRSKKITRSLTEDFEREKE PSTNKNVFINCLSSGRSEGDDSGFTEEQSRRSIKQSTKKLLPKSFSSHYKFCKSVPQSQSTSLIQQPEFS LAIAQYQEQEAALGRPSPSCSVDVTERAGSSLQSPLLSADLTTAQTPSEFLALTEDSLSEADAFPKSGST ASHCDNFGHNDATSQPTSSLTAVSKTKMEFVGTAPCVMSPGRYRLEGRCSTELHSSPETPAGNRREVSLQ STELSVGNGSDPETHLPAHHQRGESPLAHAGEPALRTGSPRTLGSYDQHKALAERFKGVHPVSDSRVIPS SGDHVFNKTSYGYEASAAKVLASSLSPYREGRYIERRLRSSSEGTAGSSRMVLKPKDGHVEASSLRKHRT GSSSSKMNSLDVLNHLGSCELDEDDLMLDLEFLEEQNLQPPVCREDSCHSVMSCTAVLLSPVDPGKEVNM LEEPKCPEPSKQNLSLRITKDTDQEARCSHVSCMPNSPSADWPQQGVEENGGIDSLPFRLMLQECTAVKT LLLKMKRVLQESDVSPSSSTTSLPISPLTEEPLPFKDITRDECSMLRLQLKDRDELISQLQAELEKVQHL QKAFASRVDKSTQTELLGCDGLSLKRLEAVQGGRETTHRNRTMSQSHSTRDRKAIHTPTEDRFRYSTADQ TSPYKNICQLPGLCLSNFLKDKELGGVMKHTRGNHEAVTSEMTQNSRTTMGQSFLKAAAKPEGLPMFSEK PKDPAALSRQHSTFTGRFGQPPRGPISLHTYSRKNVFLHHNLHTTEFQTLGQQDG ; 'Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 895 1 895 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . CCSE1_MOUSE Q8C0C4 . 1 895 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2008-09-02 F630C3EB4233E4A9 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no C ;MGDSGSRRCTLVSRLPIFRKSINRRHDSLPSSPSSSNTAGVHSSSPSSTNSSSGSTGKRRSIFRAPSISF HHKKGSEPKPEPTEQNLSISNGAQPSHSNMQKLSLEEHVKTRGRHSVGFSSSRSKKITRSLTEDFEREKE PSTNKNVFINCLSSGRSEGDDSGFTEEQSRRSIKQSTKKLLPKSFSSHYKFCKSVPQSQSTSLIQQPEFS LAIAQYQEQEAALGRPSPSCSVDVTERAGSSLQSPLLSADLTTAQTPSEFLALTEDSLSEADAFPKSGST ASHCDNFGHNDATSQPTSSLTAVSKTKMEFVGTAPCVMSPGRYRLEGRCSTELHSSPETPAGNRREVSLQ STELSVGNGSDPETHLPAHHQRGESPLAHAGEPALRTGSPRTLGSYDQHKALAERFKGVHPVSDSRVIPS SGDHVFNKTSYGYEASAAKVLASSLSPYREGRYIERRLRSSSEGTAGSSRMVLKPKDGHVEASSLRKHRT GSSSSKMNSLDVLNHLGSCELDEDDLMLDLEFLEEQNLQPPVCREDSCHSVMSCTAVLLSPVDPGKEVNM LEEPKCPEPSKQNLSLRITKDTDQEARCSHVSCMPNSPSADWPQQGVEENGGIDSLPFRLMLQECTAVKT LLLKMKRVLQESDVSPSSSTTSLPISPLTEEPLPFKDITRDECSMLRLQLKDRDELISQLQAELEKVQHL QKAFASRVDKSTQTELLGCDGLSLKRLEAVQGGRETTHRNRTMSQSHSTRDRKAIHTPTEDRFRYSTADQ TSPYKNICQLPGLCLSNFLKDKELGGVMKHTRGNHEAVTSEMTQNSRTTMGQSFLKAAAKPEGLPMFSEK PKDPAALSRQHSTFTGRFGQPPRGPISLHTYSRKNVFLHHNLHTTEFQTLGQQDG ; ;MGDSGSRRCTLVSRLPIFRKSINRRHDSLPSSPSSSNTAGVHSSSPSSTNSSSGSTGKRRSIFRAPSISF HHKKGSEPKPEPTEQNLSISNGAQPSHSNMQKLSLEEHVKTRGRHSVGFSSSRSKKITRSLTEDFEREKE PSTNKNVFINCLSSGRSEGDDSGFTEEQSRRSIKQSTKKLLPKSFSSHYKFCKSVPQSQSTSLIQQPEFS LAIAQYQEQEAALGRPSPSCSVDVTERAGSSLQSPLLSADLTTAQTPSEFLALTEDSLSEADAFPKSGST ASHCDNFGHNDATSQPTSSLTAVSKTKMEFVGTAPCVMSPGRYRLEGRCSTELHSSPETPAGNRREVSLQ STELSVGNGSDPETHLPAHHQRGESPLAHAGEPALRTGSPRTLGSYDQHKALAERFKGVHPVSDSRVIPS SGDHVFNKTSYGYEASAAKVLASSLSPYREGRYIERRLRSSSEGTAGSSRMVLKPKDGHVEASSLRKHRT GSSSSKMNSLDVLNHLGSCELDEDDLMLDLEFLEEQNLQPPVCREDSCHSVMSCTAVLLSPVDPGKEVNM LEEPKCPEPSKQNLSLRITKDTDQEARCSHVSCMPNSPSADWPQQGVEENGGIDSLPFRLMLQECTAVKT LLLKMKRVLQESDVSPSSSTTSLPISPLTEEPLPFKDITRDECSMLRLQLKDRDELISQLQAELEKVQHL QKAFASRVDKSTQTELLGCDGLSLKRLEAVQGGRETTHRNRTMSQSHSTRDRKAIHTPTEDRFRYSTADQ TSPYKNICQLPGLCLSNFLKDKELGGVMKHTRGNHEAVTSEMTQNSRTTMGQSFLKAAAKPEGLPMFSEK PKDPAALSRQHSTFTGRFGQPPRGPISLHTYSRKNVFLHHNLHTTEFQTLGQQDG ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 GLY . 1 3 ASP . 1 4 SER . 1 5 GLY . 1 6 SER . 1 7 ARG . 1 8 ARG . 1 9 CYS . 1 10 THR . 1 11 LEU . 1 12 VAL . 1 13 SER . 1 14 ARG . 1 15 LEU . 1 16 PRO . 1 17 ILE . 1 18 PHE . 1 19 ARG . 1 20 LYS . 1 21 SER . 1 22 ILE . 1 23 ASN . 1 24 ARG . 1 25 ARG . 1 26 HIS . 1 27 ASP . 1 28 SER . 1 29 LEU . 1 30 PRO . 1 31 SER . 1 32 SER . 1 33 PRO . 1 34 SER . 1 35 SER . 1 36 SER . 1 37 ASN . 1 38 THR . 1 39 ALA . 1 40 GLY . 1 41 VAL . 1 42 HIS . 1 43 SER . 1 44 SER . 1 45 SER . 1 46 PRO . 1 47 SER . 1 48 SER . 1 49 THR . 1 50 ASN . 1 51 SER . 1 52 SER . 1 53 SER . 1 54 GLY . 1 55 SER . 1 56 THR . 1 57 GLY . 1 58 LYS . 1 59 ARG . 1 60 ARG . 1 61 SER . 1 62 ILE . 1 63 PHE . 1 64 ARG . 1 65 ALA . 1 66 PRO . 1 67 SER . 1 68 ILE . 1 69 SER . 1 70 PHE . 1 71 HIS . 1 72 HIS . 1 73 LYS . 1 74 LYS . 1 75 GLY . 1 76 SER . 1 77 GLU . 1 78 PRO . 1 79 LYS . 1 80 PRO . 1 81 GLU . 1 82 PRO . 1 83 THR . 1 84 GLU . 1 85 GLN . 1 86 ASN . 1 87 LEU . 1 88 SER . 1 89 ILE . 1 90 SER . 1 91 ASN . 1 92 GLY . 1 93 ALA . 1 94 GLN . 1 95 PRO . 1 96 SER . 1 97 HIS . 1 98 SER . 1 99 ASN . 1 100 MET . 1 101 GLN . 1 102 LYS . 1 103 LEU . 1 104 SER . 1 105 LEU . 1 106 GLU . 1 107 GLU . 1 108 HIS . 1 109 VAL . 1 110 LYS . 1 111 THR . 1 112 ARG . 1 113 GLY . 1 114 ARG . 1 115 HIS . 1 116 SER . 1 117 VAL . 1 118 GLY . 1 119 PHE . 1 120 SER . 1 121 SER . 1 122 SER . 1 123 ARG . 1 124 SER . 1 125 LYS . 1 126 LYS . 1 127 ILE . 1 128 THR . 1 129 ARG . 1 130 SER . 1 131 LEU . 1 132 THR . 1 133 GLU . 1 134 ASP . 1 135 PHE . 1 136 GLU . 1 137 ARG . 1 138 GLU . 1 139 LYS . 1 140 GLU . 1 141 PRO . 1 142 SER . 1 143 THR . 1 144 ASN . 1 145 LYS . 1 146 ASN . 1 147 VAL . 1 148 PHE . 1 149 ILE . 1 150 ASN . 1 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A 1 839 GLU 839 ? ? ? C . A 1 840 LYS 840 ? ? ? C . A 1 841 PRO 841 ? ? ? C . A 1 842 LYS 842 ? ? ? C . A 1 843 ASP 843 ? ? ? C . A 1 844 PRO 844 ? ? ? C . A 1 845 ALA 845 ? ? ? C . A 1 846 ALA 846 ? ? ? C . A 1 847 LEU 847 ? ? ? C . A 1 848 SER 848 ? ? ? C . A 1 849 ARG 849 ? ? ? C . A 1 850 GLN 850 ? ? ? C . A 1 851 HIS 851 ? ? ? C . A 1 852 SER 852 ? ? ? C . A 1 853 THR 853 ? ? ? C . A 1 854 PHE 854 ? ? ? C . A 1 855 THR 855 ? ? ? C . A 1 856 GLY 856 ? ? ? C . A 1 857 ARG 857 ? ? ? C . A 1 858 PHE 858 ? ? ? C . A 1 859 GLY 859 ? ? ? C . A 1 860 GLN 860 ? ? ? C . A 1 861 PRO 861 ? ? ? C . A 1 862 PRO 862 ? ? ? C . A 1 863 ARG 863 ? ? ? C . A 1 864 GLY 864 ? ? ? C . A 1 865 PRO 865 ? ? ? C . A 1 866 ILE 866 ? ? ? C . A 1 867 SER 867 ? ? ? C . A 1 868 LEU 868 ? ? ? C . A 1 869 HIS 869 ? ? ? C . A 1 870 THR 870 ? ? ? C . A 1 871 TYR 871 ? ? ? C . A 1 872 SER 872 ? ? ? C . A 1 873 ARG 873 ? ? ? C . A 1 874 LYS 874 ? ? ? C . A 1 875 ASN 875 ? ? ? C . A 1 876 VAL 876 ? ? ? C . A 1 877 PHE 877 ? ? ? C . A 1 878 LEU 878 ? ? ? C . A 1 879 HIS 879 ? ? ? C . A 1 880 HIS 880 ? ? ? C . A 1 881 ASN 881 ? ? ? C . A 1 882 LEU 882 ? ? ? C . A 1 883 HIS 883 ? ? ? C . A 1 884 THR 884 ? ? ? C . A 1 885 THR 885 ? ? ? C . A 1 886 GLU 886 ? ? ? C . A 1 887 PHE 887 ? ? ? C . A 1 888 GLN 888 ? ? ? C . A 1 889 THR 889 ? ? ? C . A 1 890 LEU 890 ? ? ? C . A 1 891 GLY 891 ? ? ? C . A 1 892 GLN 892 ? ? ? C . A 1 893 GLN 893 ? ? ? C . A 1 894 ASP 894 ? ? ? C . A 1 895 GLY 895 ? ? ? C . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4 {PDB ID=8t1l, label_asym_id=C, auth_asym_id=B, SMTL ID=8t1l.1.C}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 8t1l, label_asym_id=C' 'target-template alignment' . 4 'model 1' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-25 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-20 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A C 3 1 B # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MAASSSGEKEKERMGGVSGMAGLGSTRERLLSALEDLEVLSRELIEMLAISRNQKLLQLEEENQVLELLI HRDGDFQELMKLALNQGKVHHEMQALEKEVEKRDSDIQQLQKQLKEAEQILATAVYQAKEKLKSIEKARK GAISSEEIIKYAHRISASNAVCAPLTWVPGDPRRPYPTDLEMRSGLLGQMNNPSTSGVNGHLPGDALAAG RLPDVLAPQYPWQSNDMSVNMLPPNHSSDFLLEPPGHNKENEDDVEVMSTDSSSSSSDSD ; ;MAASSSGEKEKERMGGVSGMAGLGSTRERLLSALEDLEVLSRELIEMLAISRNQKLLQLEEENQVLELLI HRDGDFQELMKLALNQGKVHHEMQALEKEVEKRDSDIQQLQKQLKEAEQILATAVYQAKEKLKSIEKARK GAISSEEIIKYAHRISASNAVCAPLTWVPGDPRRPYPTDLEMRSGLLGQMNNPSTSGVNGHLPGDALAAG RLPDVLAPQYPWQSNDMSVNMLPPNHSSDFLLEPPGHNKENEDDVEVMSTDSSSSSSDSD ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 88 118 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8t1l 2024-10-16 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 895 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 895 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 12.000 29.032 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MGDSGSRRCTLVSRLPIFRKSINRRHDSLPSSPSSSNTAGVHSSSPSSTNSSSGSTGKRRSIFRAPSISFHHKKGSEPKPEPTEQNLSISNGAQPSHSNMQKLSLEEHVKTRGRHSVGFSSSRSKKITRSLTEDFEREKEPSTNKNVFINCLSSGRSEGDDSGFTEEQSRRSIKQSTKKLLPKSFSSHYKFCKSVPQSQSTSLIQQPEFSLAIAQYQEQEAALGRPSPSCSVDVTERAGSSLQSPLLSADLTTAQTPSEFLALTEDSLSEADAFPKSGSTASHCDNFGHNDATSQPTSSLTAVSKTKMEFVGTAPCVMSPGRYRLEGRCSTELHSSPETPAGNRREVSLQSTELSVGNGSDPETHLPAHHQRGESPLAHAGEPALRTGSPRTLGSYDQHKALAERFKGVHPVSDSRVIPSSGDHVFNKTSYGYEASAAKVLASSLSPYREGRYIERRLRSSSEGTAGSSRMVLKPKDGHVEASSLRKHRTGSSSSKMNSLDVLNHLGSCELDEDDLMLDLEFLEEQNLQPPVCREDSCHSVMSCTAVLLSPVDPGKEVNMLEEPKCPEPSKQNLSLRITKDTDQEARCSHVSCMPNSPSADWPQQGVEENGGIDSLPFRLMLQECTAVKTLLLKMKRVLQESDVSPSSSTTSLPISPLTEEPLPFKDITRDECSMLRLQLKDRDELISQLQAELEKVQHLQKAFASRVDKSTQTELLGCDGLSLKRLEAVQGGRETTHRNRTMSQSHSTRDRKAIHTPTEDRFRYSTADQTSPYKNICQLPGLCLSNFLKDKELGGVMKHTRGNHEAVTSEMTQNSRTTMGQSFLKAAAKPEGLPMFSEKPKDPAALSRQHSTFTGRFGQPPRGPISLHTYSRKNVFLHHNLHTTEFQTLGQQDG 2 1 2 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------KVHHEMQALEKEVEKRDSDIQQLQKQLKEAE----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8t1l.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 1' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . ILE 668 668 ? A 305.087 381.148 384.018 1 1 C ILE 0.630 1 ATOM 2 C CA . ILE 668 668 ? A 304.002 380.209 384.481 1 1 C ILE 0.630 1 ATOM 3 C C . ILE 668 668 ? A 304.360 379.577 385.804 1 1 C ILE 0.630 1 ATOM 4 O O . ILE 668 668 ? A 303.631 379.759 386.754 1 1 C ILE 0.630 1 ATOM 5 C CB . ILE 668 668 ? A 303.661 379.201 383.384 1 1 C ILE 0.630 1 ATOM 6 C CG1 . ILE 668 668 ? A 303.109 379.978 382.154 1 1 C ILE 0.630 1 ATOM 7 C CG2 . ILE 668 668 ? A 302.630 378.147 383.877 1 1 C ILE 0.630 1 ATOM 8 C CD1 . ILE 668 668 ? A 302.978 379.116 380.894 1 1 C ILE 0.630 1 ATOM 9 N N . THR 669 669 ? A 305.555 378.938 385.956 1 1 C THR 0.620 1 ATOM 10 C CA . THR 669 669 ? A 305.957 378.283 387.200 1 1 C THR 0.620 1 ATOM 11 C C . THR 669 669 ? A 305.922 379.189 388.413 1 1 C THR 0.620 1 ATOM 12 O O . THR 669 669 ? A 305.402 378.838 389.454 1 1 C THR 0.620 1 ATOM 13 C CB . THR 669 669 ? A 307.366 377.715 387.080 1 1 C THR 0.620 1 ATOM 14 O OG1 . THR 669 669 ? A 307.433 376.926 385.906 1 1 C THR 0.620 1 ATOM 15 C CG2 . THR 669 669 ? A 307.736 376.843 388.294 1 1 C THR 0.620 1 ATOM 16 N N . ARG 670 670 ? A 306.409 380.447 388.286 1 1 C ARG 0.600 1 ATOM 17 C CA . ARG 670 670 ? A 306.278 381.434 389.342 1 1 C ARG 0.600 1 ATOM 18 C C . ARG 670 670 ? A 304.829 381.753 389.748 1 1 C ARG 0.600 1 ATOM 19 O O . ARG 670 670 ? A 304.526 381.817 390.928 1 1 C ARG 0.600 1 ATOM 20 C CB . ARG 670 670 ? A 306.962 382.753 388.910 1 1 C ARG 0.600 1 ATOM 21 C CG . ARG 670 670 ? A 306.956 383.851 390.002 1 1 C ARG 0.600 1 ATOM 22 C CD . ARG 670 670 ? A 307.169 385.267 389.467 1 1 C ARG 0.600 1 ATOM 23 N NE . ARG 670 670 ? A 305.961 385.597 388.622 1 1 C ARG 0.600 1 ATOM 24 C CZ . ARG 670 670 ? A 305.896 386.611 387.754 1 1 C ARG 0.600 1 ATOM 25 N NH1 . ARG 670 670 ? A 306.943 387.410 387.572 1 1 C ARG 0.600 1 ATOM 26 N NH2 . ARG 670 670 ? A 304.764 386.808 387.086 1 1 C ARG 0.600 1 ATOM 27 N N . ASP 671 671 ? A 303.916 381.940 388.759 1 1 C ASP 0.720 1 ATOM 28 C CA . ASP 671 671 ? A 302.503 382.193 388.954 1 1 C ASP 0.720 1 ATOM 29 C C . ASP 671 671 ? A 301.818 381.005 389.629 1 1 C ASP 0.720 1 ATOM 30 O O . ASP 671 671 ? A 301.156 381.180 390.646 1 1 C ASP 0.720 1 ATOM 31 C CB . ASP 671 671 ? A 301.863 382.535 387.580 1 1 C ASP 0.720 1 ATOM 32 C CG . ASP 671 671 ? A 302.508 383.766 386.942 1 1 C ASP 0.720 1 ATOM 33 O OD1 . ASP 671 671 ? A 303.282 384.522 387.602 1 1 C ASP 0.720 1 ATOM 34 O OD2 . ASP 671 671 ? A 302.327 383.902 385.707 1 1 C ASP 0.720 1 ATOM 35 N N . GLU 672 672 ? A 302.070 379.756 389.153 1 1 C GLU 0.660 1 ATOM 36 C CA . GLU 672 672 ? A 301.605 378.531 389.779 1 1 C GLU 0.660 1 ATOM 37 C C . GLU 672 672 ? A 302.119 378.398 391.195 1 1 C GLU 0.660 1 ATOM 38 O O . GLU 672 672 ? A 301.342 378.190 392.113 1 1 C GLU 0.660 1 ATOM 39 C CB . GLU 672 672 ? A 301.995 377.280 388.958 1 1 C GLU 0.660 1 ATOM 40 C CG . GLU 672 672 ? A 301.228 377.214 387.615 1 1 C GLU 0.660 1 ATOM 41 C CD . GLU 672 672 ? A 301.643 376.034 386.742 1 1 C GLU 0.660 1 ATOM 42 O OE1 . GLU 672 672 ? A 302.606 375.318 387.112 1 1 C GLU 0.660 1 ATOM 43 O OE2 . GLU 672 672 ? A 301.012 375.882 385.665 1 1 C GLU 0.660 1 ATOM 44 N N . CYS 673 673 ? A 303.426 378.639 391.445 1 1 C CYS 0.760 1 ATOM 45 C CA . CYS 673 673 ? A 303.982 378.625 392.786 1 1 C CYS 0.760 1 ATOM 46 C C . CYS 673 673 ? A 303.324 379.652 393.709 1 1 C CYS 0.760 1 ATOM 47 O O . CYS 673 673 ? A 302.993 379.331 394.843 1 1 C CYS 0.760 1 ATOM 48 C CB . CYS 673 673 ? A 305.527 378.811 392.787 1 1 C CYS 0.760 1 ATOM 49 S SG . CYS 673 673 ? A 306.432 377.376 392.127 1 1 C CYS 0.760 1 ATOM 50 N N . SER 674 674 ? A 303.059 380.901 393.247 1 1 C SER 0.640 1 ATOM 51 C CA . SER 674 674 ? A 302.280 381.888 394.003 1 1 C SER 0.640 1 ATOM 52 C C . SER 674 674 ? A 300.867 381.443 394.310 1 1 C SER 0.640 1 ATOM 53 O O . SER 674 674 ? 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'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.656 2 1 3 0.007 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 668 ILE 1 0.630 2 1 A 669 THR 1 0.620 3 1 A 670 ARG 1 0.600 4 1 A 671 ASP 1 0.720 5 1 A 672 GLU 1 0.660 6 1 A 673 CYS 1 0.760 7 1 A 674 SER 1 0.640 8 1 A 675 MET 1 0.670 9 1 A 676 LEU 1 0.710 10 1 A 677 ARG 1 0.610 11 1 A 678 LEU 1 0.650 12 1 A 679 GLN 1 0.620 13 1 A 680 LEU 1 0.700 14 1 A 681 LYS 1 0.630 15 1 A 682 ASP 1 0.630 16 1 A 683 ARG 1 0.590 17 1 A 684 ASP 1 0.640 18 1 A 685 GLU 1 0.670 19 1 A 686 LEU 1 0.670 20 1 A 687 ILE 1 0.660 21 1 A 688 SER 1 0.710 22 1 A 689 GLN 1 0.710 23 1 A 690 LEU 1 0.690 24 1 A 691 GLN 1 0.700 25 1 A 692 ALA 1 0.770 26 1 A 693 GLU 1 0.670 27 1 A 694 LEU 1 0.630 28 1 A 695 GLU 1 0.630 29 1 A 696 LYS 1 0.600 30 1 A 697 VAL 1 0.580 31 1 A 698 GLN 1 0.580 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #