data_SMR-016852df6904ea87f33dc0468e443d37_3 _entry.id SMR-016852df6904ea87f33dc0468e443d37_3 _struct.entry_id SMR-016852df6904ea87f33dc0468e443d37_3 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q9QWF0/ CAF1A_MOUSE, Chromatin assembly factor 1 subunit A Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q9QWF0' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 118486.731 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP CAF1A_MOUSE Q9QWF0 1 ;MLEEPEAATRTAAAVDCKDRPGFPVKRLIQARLPFKRLNLVPKEKVEEDTSPKAAVESKVPDLQLSLGTF ESQCHTGSHVGLSTKLVGGQGPIDSFLRATIKPVPSVVIIDLTENCSDIPDSPEGHSELSPDTAGVVTTV EGAAKQQEHSAAELCLLETPSDITCHMEEEPGSPGDPKRTGDCQAGSLQSCPELTPGSRTCPTKELSSWS KAGDLLFIEKVPVVVLEDILATKPSIASLPMMSLDRSVTSESEILESCPEDDSILSHSSTNSSSPTSSPE GPSTPPEHRGGRSSPSTPACRVAKNFVKGSTEKGRSKLHRDREQQREEKEKLREEIRRAKEEARKKKEEE KELKEKERREKREKDEKEKAEKQRLKEEKRKERQEALEAKLEEKRKKEEEKRLREEEKRLREEEKRIKAE KAEITRFFQKPKTPQAPKTLAGSCGKFAPFEIKEHMVLAPRCRAALDQDLCDQLDQLLQQQSVASTFLSD LKSRLPLRSGPTRVCGHDTDIMNRDVVIVESSKVDGVSERKKFGRMKLLQFSENHRPAYWGTWNKKTAII RPRNPWAQDKDLLDYEVDSDDEWEEEEPGESLSHSEGDEDDDVGEDEDEDDGFFVPHGYLSEDEGVTEEC ADPENHKVHQKLKAKEWDELLAKGKRFRVLQPVHVGCVWASEAANCTSSDLKLLQQFTACLLDVASPDEP EPGASRREKRDQHILAQLLPLLHGNVNGSKVIIHEFQEQCRRGLLTLPSPTPHLQMPNLEDAVAVPSKAR LKRLISENSAYEKRPNFRMCWYVHPEVLKSFGQECLPVPCQWTYITTMPSAPREDSGSASTEGPGQSTPM LLKRKPAATMCITQFMKKRRYDGQVGSGDMDGFQADTEEDEEDDTDCMIIDVPDVGSDVSEAPIPAPTLC K ; 'Chromatin assembly factor 1 subunit A' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 911 1 911 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . CAF1A_MOUSE Q9QWF0 . 1 911 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2000-05-01 67B3340010425C95 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no C ;MLEEPEAATRTAAAVDCKDRPGFPVKRLIQARLPFKRLNLVPKEKVEEDTSPKAAVESKVPDLQLSLGTF ESQCHTGSHVGLSTKLVGGQGPIDSFLRATIKPVPSVVIIDLTENCSDIPDSPEGHSELSPDTAGVVTTV EGAAKQQEHSAAELCLLETPSDITCHMEEEPGSPGDPKRTGDCQAGSLQSCPELTPGSRTCPTKELSSWS KAGDLLFIEKVPVVVLEDILATKPSIASLPMMSLDRSVTSESEILESCPEDDSILSHSSTNSSSPTSSPE GPSTPPEHRGGRSSPSTPACRVAKNFVKGSTEKGRSKLHRDREQQREEKEKLREEIRRAKEEARKKKEEE KELKEKERREKREKDEKEKAEKQRLKEEKRKERQEALEAKLEEKRKKEEEKRLREEEKRLREEEKRIKAE KAEITRFFQKPKTPQAPKTLAGSCGKFAPFEIKEHMVLAPRCRAALDQDLCDQLDQLLQQQSVASTFLSD LKSRLPLRSGPTRVCGHDTDIMNRDVVIVESSKVDGVSERKKFGRMKLLQFSENHRPAYWGTWNKKTAII RPRNPWAQDKDLLDYEVDSDDEWEEEEPGESLSHSEGDEDDDVGEDEDEDDGFFVPHGYLSEDEGVTEEC ADPENHKVHQKLKAKEWDELLAKGKRFRVLQPVHVGCVWASEAANCTSSDLKLLQQFTACLLDVASPDEP EPGASRREKRDQHILAQLLPLLHGNVNGSKVIIHEFQEQCRRGLLTLPSPTPHLQMPNLEDAVAVPSKAR LKRLISENSAYEKRPNFRMCWYVHPEVLKSFGQECLPVPCQWTYITTMPSAPREDSGSASTEGPGQSTPM LLKRKPAATMCITQFMKKRRYDGQVGSGDMDGFQADTEEDEEDDTDCMIIDVPDVGSDVSEAPIPAPTLC K ; ;MLEEPEAATRTAAAVDCKDRPGFPVKRLIQARLPFKRLNLVPKEKVEEDTSPKAAVESKVPDLQLSLGTF ESQCHTGSHVGLSTKLVGGQGPIDSFLRATIKPVPSVVIIDLTENCSDIPDSPEGHSELSPDTAGVVTTV EGAAKQQEHSAAELCLLETPSDITCHMEEEPGSPGDPKRTGDCQAGSLQSCPELTPGSRTCPTKELSSWS KAGDLLFIEKVPVVVLEDILATKPSIASLPMMSLDRSVTSESEILESCPEDDSILSHSSTNSSSPTSSPE GPSTPPEHRGGRSSPSTPACRVAKNFVKGSTEKGRSKLHRDREQQREEKEKLREEIRRAKEEARKKKEEE KELKEKERREKREKDEKEKAEKQRLKEEKRKERQEALEAKLEEKRKKEEEKRLREEEKRLREEEKRIKAE KAEITRFFQKPKTPQAPKTLAGSCGKFAPFEIKEHMVLAPRCRAALDQDLCDQLDQLLQQQSVASTFLSD LKSRLPLRSGPTRVCGHDTDIMNRDVVIVESSKVDGVSERKKFGRMKLLQFSENHRPAYWGTWNKKTAII RPRNPWAQDKDLLDYEVDSDDEWEEEEPGESLSHSEGDEDDDVGEDEDEDDGFFVPHGYLSEDEGVTEEC ADPENHKVHQKLKAKEWDELLAKGKRFRVLQPVHVGCVWASEAANCTSSDLKLLQQFTACLLDVASPDEP 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LEU . 1 64 GLN . 1 65 LEU . 1 66 SER . 1 67 LEU . 1 68 GLY . 1 69 THR . 1 70 PHE . 1 71 GLU . 1 72 SER . 1 73 GLN . 1 74 CYS . 1 75 HIS . 1 76 THR . 1 77 GLY . 1 78 SER . 1 79 HIS . 1 80 VAL . 1 81 GLY . 1 82 LEU . 1 83 SER . 1 84 THR . 1 85 LYS . 1 86 LEU . 1 87 VAL . 1 88 GLY . 1 89 GLY . 1 90 GLN . 1 91 GLY . 1 92 PRO . 1 93 ILE . 1 94 ASP . 1 95 SER . 1 96 PHE . 1 97 LEU . 1 98 ARG . 1 99 ALA . 1 100 THR . 1 101 ILE . 1 102 LYS . 1 103 PRO . 1 104 VAL . 1 105 PRO . 1 106 SER . 1 107 VAL . 1 108 VAL . 1 109 ILE . 1 110 ILE . 1 111 ASP . 1 112 LEU . 1 113 THR . 1 114 GLU . 1 115 ASN . 1 116 CYS . 1 117 SER . 1 118 ASP . 1 119 ILE . 1 120 PRO . 1 121 ASP . 1 122 SER . 1 123 PRO . 1 124 GLU . 1 125 GLY . 1 126 HIS . 1 127 SER . 1 128 GLU . 1 129 LEU . 1 130 SER . 1 131 PRO . 1 132 ASP . 1 133 THR . 1 134 ALA . 1 135 GLY . 1 136 VAL . 1 137 VAL . 1 138 THR . 1 139 THR . 1 140 VAL . 1 141 GLU . 1 142 GLY . 1 143 ALA . 1 144 ALA . 1 145 LYS . 1 146 GLN . 1 147 GLN . 1 148 GLU . 1 149 HIS . 1 150 SER . 1 151 ALA . 1 152 ALA . 1 153 GLU . 1 154 LEU . 1 155 CYS . 1 156 LEU . 1 157 LEU . 1 158 GLU . 1 159 THR . 1 160 PRO . 1 161 SER . 1 162 ASP . 1 163 ILE . 1 164 THR . 1 165 CYS . 1 166 HIS . 1 167 MET . 1 168 GLU . 1 169 GLU . 1 170 GLU . 1 171 PRO . 1 172 GLY . 1 173 SER . 1 174 PRO . 1 175 GLY . 1 176 ASP . 1 177 PRO . 1 178 LYS . 1 179 ARG . 1 180 THR . 1 181 GLY . 1 182 ASP . 1 183 CYS . 1 184 GLN . 1 185 ALA . 1 186 GLY . 1 187 SER . 1 188 LEU . 1 189 GLN . 1 190 SER . 1 191 CYS . 1 192 PRO . 1 193 GLU . 1 194 LEU . 1 195 THR . 1 196 PRO . 1 197 GLY . 1 198 SER . 1 199 ARG . 1 200 THR . 1 201 CYS . 1 202 PRO . 1 203 THR . 1 204 LYS . 1 205 GLU . 1 206 LEU . 1 207 SER . 1 208 SER . 1 209 TRP . 1 210 SER . 1 211 LYS . 1 212 ALA . 1 213 GLY . 1 214 ASP . 1 215 LEU . 1 216 LEU . 1 217 PHE . 1 218 ILE . 1 219 GLU . 1 220 LYS . 1 221 VAL . 1 222 PRO . 1 223 VAL . 1 224 VAL . 1 225 VAL . 1 226 LEU . 1 227 GLU . 1 228 ASP . 1 229 ILE . 1 230 LEU . 1 231 ALA . 1 232 THR . 1 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A 1 840 MET 840 ? ? ? C . A 1 841 LEU 841 ? ? ? C . A 1 842 LEU 842 ? ? ? C . A 1 843 LYS 843 ? ? ? C . A 1 844 ARG 844 ? ? ? C . A 1 845 LYS 845 ? ? ? C . A 1 846 PRO 846 ? ? ? C . A 1 847 ALA 847 ? ? ? C . A 1 848 ALA 848 ? ? ? C . A 1 849 THR 849 ? ? ? C . A 1 850 MET 850 ? ? ? C . A 1 851 CYS 851 ? ? ? C . A 1 852 ILE 852 ? ? ? C . A 1 853 THR 853 ? ? ? C . A 1 854 GLN 854 ? ? ? C . A 1 855 PHE 855 ? ? ? C . A 1 856 MET 856 ? ? ? C . A 1 857 LYS 857 ? ? ? C . A 1 858 LYS 858 ? ? ? C . A 1 859 ARG 859 ? ? ? C . A 1 860 ARG 860 ? ? ? C . A 1 861 TYR 861 ? ? ? C . A 1 862 ASP 862 ? ? ? C . A 1 863 GLY 863 ? ? ? C . A 1 864 GLN 864 ? ? ? C . A 1 865 VAL 865 ? ? ? C . A 1 866 GLY 866 ? ? ? C . A 1 867 SER 867 ? ? ? C . A 1 868 GLY 868 ? ? ? C . A 1 869 ASP 869 ? ? ? C . A 1 870 MET 870 ? ? ? C . A 1 871 ASP 871 ? ? ? C . A 1 872 GLY 872 ? ? ? C . A 1 873 PHE 873 ? ? ? C . A 1 874 GLN 874 ? ? ? C . A 1 875 ALA 875 ? ? ? C . A 1 876 ASP 876 ? ? ? C . A 1 877 THR 877 ? ? ? C . A 1 878 GLU 878 ? ? ? C . A 1 879 GLU 879 ? ? ? C . A 1 880 ASP 880 ? ? ? C . A 1 881 GLU 881 ? ? ? C . A 1 882 GLU 882 ? ? ? C . A 1 883 ASP 883 ? ? ? C . A 1 884 ASP 884 ? ? ? C . A 1 885 THR 885 ? ? ? C . A 1 886 ASP 886 ? ? ? C . A 1 887 CYS 887 ? ? ? C . A 1 888 MET 888 ? ? ? C . A 1 889 ILE 889 ? ? ? C . A 1 890 ILE 890 ? ? ? C . A 1 891 ASP 891 ? ? ? C . A 1 892 VAL 892 ? ? ? C . A 1 893 PRO 893 ? ? ? C . A 1 894 ASP 894 ? ? ? C . A 1 895 VAL 895 ? ? ? C . A 1 896 GLY 896 ? ? ? C . A 1 897 SER 897 ? ? ? C . A 1 898 ASP 898 ? ? ? C . A 1 899 VAL 899 ? ? ? C . A 1 900 SER 900 ? ? ? C . A 1 901 GLU 901 ? ? ? C . A 1 902 ALA 902 ? ? ? C . A 1 903 PRO 903 ? ? ? C . A 1 904 ILE 904 ? ? ? C . A 1 905 PRO 905 ? ? ? C . A 1 906 ALA 906 ? ? ? C . A 1 907 PRO 907 ? ? ? C . A 1 908 THR 908 ? ? ? C . A 1 909 LEU 909 ? ? ? C . A 1 910 CYS 910 ? ? ? C . A 1 911 LYS 911 ? ? ? C . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Chromatin assembly factor 1 subunit A {PDB ID=1s4z, label_asym_id=C, auth_asym_id=C, SMTL ID=1s4z.1.C}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 1s4z, label_asym_id=C' 'target-template alignment' . 4 'model 3' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-25 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-20 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A C 2 1 C # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 GSKAGDLLFIEKVPVVVLEDILATKPSIAS GSKAGDLLFIEKVPVVVLEDILATKPSIAS # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 2 29 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 1s4z 2024-05-22 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 911 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 911 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 3.8e-06 100.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MLEEPEAATRTAAAVDCKDRPGFPVKRLIQARLPFKRLNLVPKEKVEEDTSPKAAVESKVPDLQLSLGTFESQCHTGSHVGLSTKLVGGQGPIDSFLRATIKPVPSVVIIDLTENCSDIPDSPEGHSELSPDTAGVVTTVEGAAKQQEHSAAELCLLETPSDITCHMEEEPGSPGDPKRTGDCQAGSLQSCPELTPGSRTCPTKELSSWSKAGDLLFIEKVPVVVLEDILATKPSIASLPMMSLDRSVTSESEILESCPEDDSILSHSSTNSSSPTSSPEGPSTPPEHRGGRSSPSTPACRVAKNFVKGSTEKGRSKLHRDREQQREEKEKLREEIRRAKEEARKKKEEEKELKEKERREKREKDEKEKAEKQRLKEEKRKERQEALEAKLEEKRKKEEEKRLREEEKRLREEEKRIKAEKAEITRFFQKPKTPQAPKTLAGSCGKFAPFEIKEHMVLAPRCRAALDQDLCDQLDQLLQQQSVASTFLSDLKSRLPLRSGPTRVCGHDTDIMNRDVVIVESSKVDGVSERKKFGRMKLLQFSENHRPAYWGTWNKKTAIIRPRNPWAQDKDLLDYEVDSDDEWEEEEPGESLSHSEGDEDDDVGEDEDEDDGFFVPHGYLSEDEGVTEECADPENHKVHQKLKAKEWDELLAKGKRFRVLQPVHVGCVWASEAANCTSSDLKLLQQFTACLLDVASPDEPEPGASRREKRDQHILAQLLPLLHGNVNGSKVIIHEFQEQCRRGLLTLPSPTPHLQMPNLEDAVAVPSKARLKRLISENSAYEKRPNFRMCWYVHPEVLKSFGQECLPVPCQWTYITTMPSAPREDSGSASTEGPGQSTPMLLKRKPAATMCITQFMKKRRYDGQVGSGDMDGFQADTEEDEEDDTDCMIIDVPDVGSDVSEAPIPAPTLCK 2 1 2 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------SKAGDLLFIEKVPVVVLEDILATKPSIA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 1s4z.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 3' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . SER 210 210 ? A 25.773 0.343 -14.700 1 1 C SER 0.720 1 ATOM 2 C CA . SER 210 210 ? A 25.125 -0.997 -15.024 1 1 C SER 0.720 1 ATOM 3 C C . SER 210 210 ? A 23.781 -1.044 -14.322 1 1 C SER 0.720 1 ATOM 4 O O . SER 210 210 ? A 23.099 -0.033 -14.329 1 1 C SER 0.720 1 ATOM 5 C CB . SER 210 210 ? A 26.051 -2.224 -14.666 1 1 C SER 0.720 1 ATOM 6 O OG . SER 210 210 ? A 25.487 -3.478 -15.065 1 1 C SER 0.720 1 ATOM 7 N N . LYS 211 211 ? A 23.411 -2.176 -13.683 1 1 C LYS 0.710 1 ATOM 8 C CA . LYS 211 211 ? A 22.195 -2.386 -12.905 1 1 C LYS 0.710 1 ATOM 9 C C . LYS 211 211 ? A 22.028 -1.452 -11.724 1 1 C LYS 0.710 1 ATOM 10 O O . LYS 211 211 ? A 20.916 -0.945 -11.501 1 1 C LYS 0.710 1 ATOM 11 C CB . LYS 211 211 ? A 22.186 -3.834 -12.349 1 1 C LYS 0.710 1 ATOM 12 C CG . LYS 211 211 ? A 22.257 -4.922 -13.435 1 1 C LYS 0.710 1 ATOM 13 C CD . LYS 211 211 ? A 22.227 -6.348 -12.849 1 1 C LYS 0.710 1 ATOM 14 C CE . LYS 211 211 ? A 20.915 -6.674 -12.117 1 1 C LYS 0.710 1 ATOM 15 N NZ . LYS 211 211 ? A 20.939 -8.058 -11.593 1 1 C LYS 0.710 1 ATOM 16 N N . ALA 212 212 ? A 23.099 -1.163 -10.967 1 1 C ALA 0.530 1 ATOM 17 C CA . ALA 212 212 ? A 23.157 -0.191 -9.893 1 1 C ALA 0.530 1 ATOM 18 C C . ALA 212 212 ? A 23.306 1.213 -10.485 1 1 C ALA 0.530 1 ATOM 19 O O . ALA 212 212 ? A 24.297 1.908 -10.254 1 1 C ALA 0.530 1 ATOM 20 C CB . ALA 212 212 ? A 24.383 -0.513 -9.001 1 1 C ALA 0.530 1 ATOM 21 N N . GLY 213 213 ? A 22.357 1.629 -11.348 1 1 C GLY 0.570 1 ATOM 22 C CA . GLY 213 213 ? A 22.316 2.949 -11.961 1 1 C GLY 0.570 1 ATOM 23 C C . GLY 213 213 ? A 21.773 3.999 -11.036 1 1 C GLY 0.570 1 ATOM 24 O O . GLY 213 213 ? A 22.133 5.169 -11.153 1 1 C GLY 0.570 1 ATOM 25 N N . ASP 214 214 ? A 20.879 3.612 -10.101 1 1 C ASP 0.720 1 ATOM 26 C CA . ASP 214 214 ? A 20.364 4.461 -9.061 1 1 C ASP 0.720 1 ATOM 27 C C . ASP 214 214 ? A 21.457 4.875 -8.077 1 1 C ASP 0.720 1 ATOM 28 O O . ASP 214 214 ? A 22.278 4.087 -7.613 1 1 C ASP 0.720 1 ATOM 29 C CB . ASP 214 214 ? A 19.117 3.822 -8.377 1 1 C ASP 0.720 1 ATOM 30 C CG . ASP 214 214 ? A 19.426 2.487 -7.714 1 1 C ASP 0.720 1 ATOM 31 O OD1 . ASP 214 214 ? A 19.803 1.545 -8.459 1 1 C ASP 0.720 1 ATOM 32 O OD2 . ASP 214 214 ? A 19.244 2.406 -6.474 1 1 C ASP 0.720 1 ATOM 33 N N . LEU 215 215 ? A 21.525 6.178 -7.771 1 1 C LEU 0.480 1 ATOM 34 C CA . LEU 215 215 ? A 22.510 6.641 -6.823 1 1 C LEU 0.480 1 ATOM 35 C C . LEU 215 215 ? A 21.995 7.817 -6.011 1 1 C LEU 0.480 1 ATOM 36 O O . LEU 215 215 ? A 22.357 8.001 -4.860 1 1 C LEU 0.480 1 ATOM 37 C CB . LEU 215 215 ? A 23.784 7.028 -7.628 1 1 C LEU 0.480 1 ATOM 38 C CG . LEU 215 215 ? A 24.969 7.553 -6.790 1 1 C LEU 0.480 1 ATOM 39 C CD1 . LEU 215 215 ? A 25.485 6.454 -5.843 1 1 C LEU 0.480 1 ATOM 40 C CD2 . LEU 215 215 ? A 26.098 8.079 -7.697 1 1 C LEU 0.480 1 ATOM 41 N N . LEU 216 216 ? A 21.075 8.620 -6.581 1 1 C LEU 0.580 1 ATOM 42 C CA . LEU 216 216 ? A 20.560 9.796 -5.930 1 1 C LEU 0.580 1 ATOM 43 C C . LEU 216 216 ? A 19.151 9.991 -6.422 1 1 C LEU 0.580 1 ATOM 44 O O . LEU 216 216 ? A 18.849 9.701 -7.578 1 1 C LEU 0.580 1 ATOM 45 C CB . LEU 216 216 ? A 21.463 11.064 -6.120 1 1 C LEU 0.580 1 ATOM 46 C CG . LEU 216 216 ? A 22.023 11.495 -7.528 1 1 C LEU 0.580 1 ATOM 47 C CD1 . LEU 216 216 ? A 23.044 10.539 -8.173 1 1 C LEU 0.580 1 ATOM 48 C CD2 . LEU 216 216 ? A 20.983 11.871 -8.599 1 1 C LEU 0.580 1 ATOM 49 N N . PHE 217 217 ? A 18.230 10.414 -5.537 1 1 C PHE 0.550 1 ATOM 50 C CA . PHE 217 217 ? A 16.830 10.534 -5.873 1 1 C PHE 0.550 1 ATOM 51 C C . PHE 217 217 ? A 16.171 11.381 -4.791 1 1 C PHE 0.550 1 ATOM 52 O O . PHE 217 217 ? A 16.585 12.503 -4.514 1 1 C PHE 0.550 1 ATOM 53 C CB . PHE 217 217 ? A 16.134 9.140 -6.176 1 1 C PHE 0.550 1 ATOM 54 C CG . PHE 217 217 ? A 16.687 7.982 -5.347 1 1 C PHE 0.550 1 ATOM 55 C CD1 . PHE 217 217 ? A 16.262 7.707 -4.032 1 1 C PHE 0.550 1 ATOM 56 C CD2 . PHE 217 217 ? A 17.720 7.183 -5.883 1 1 C PHE 0.550 1 ATOM 57 C CE1 . PHE 217 217 ? A 16.882 6.706 -3.269 1 1 C PHE 0.550 1 ATOM 58 C CE2 . PHE 217 217 ? A 18.365 6.207 -5.114 1 1 C PHE 0.550 1 ATOM 59 C CZ . PHE 217 217 ? A 17.939 5.963 -3.807 1 1 C PHE 0.550 1 ATOM 60 N N . ILE 218 218 ? A 15.106 10.869 -4.166 1 1 C ILE 0.710 1 ATOM 61 C CA . ILE 218 218 ? A 14.271 11.564 -3.209 1 1 C ILE 0.710 1 ATOM 62 C C . ILE 218 218 ? A 14.371 10.929 -1.826 1 1 C ILE 0.710 1 ATOM 63 O O . ILE 218 218 ? A 14.140 9.742 -1.646 1 1 C ILE 0.710 1 ATOM 64 C CB . ILE 218 218 ? A 12.799 11.505 -3.650 1 1 C ILE 0.710 1 ATOM 65 C CG1 . ILE 218 218 ? A 12.326 10.067 -4.061 1 1 C ILE 0.710 1 ATOM 66 C CG2 . ILE 218 218 ? A 12.615 12.508 -4.810 1 1 C ILE 0.710 1 ATOM 67 C CD1 . ILE 218 218 ? A 10.831 9.941 -4.391 1 1 C ILE 0.710 1 ATOM 68 N N . GLU 219 219 ? A 14.627 11.739 -0.776 1 1 C GLU 0.480 1 ATOM 69 C CA . GLU 219 219 ? A 14.844 11.248 0.579 1 1 C GLU 0.480 1 ATOM 70 C C . GLU 219 219 ? A 14.071 12.131 1.559 1 1 C GLU 0.480 1 ATOM 71 O O . GLU 219 219 ? A 14.610 12.790 2.443 1 1 C GLU 0.480 1 ATOM 72 C CB . GLU 219 219 ? A 16.348 11.217 0.924 1 1 C GLU 0.480 1 ATOM 73 C CG . GLU 219 219 ? A 17.205 10.400 -0.079 1 1 C GLU 0.480 1 ATOM 74 C CD . GLU 219 219 ? A 18.629 10.228 0.436 1 1 C GLU 0.480 1 ATOM 75 O OE1 . GLU 219 219 ? A 18.784 9.580 1.501 1 1 C GLU 0.480 1 ATOM 76 O OE2 . GLU 219 219 ? A 19.559 10.730 -0.245 1 1 C GLU 0.480 1 ATOM 77 N N . LYS 220 220 ? A 12.743 12.204 1.363 1 1 C LYS 0.510 1 ATOM 78 C CA . LYS 220 220 ? A 11.794 13.015 2.095 1 1 C LYS 0.510 1 ATOM 79 C C . LYS 220 220 ? A 10.985 12.122 3.039 1 1 C LYS 0.510 1 ATOM 80 O O . LYS 220 220 ? A 11.483 11.119 3.556 1 1 C LYS 0.510 1 ATOM 81 C CB . LYS 220 220 ? A 10.901 13.757 1.039 1 1 C LYS 0.510 1 ATOM 82 C CG . LYS 220 220 ? A 10.443 12.919 -0.195 1 1 C LYS 0.510 1 ATOM 83 C CD . LYS 220 220 ? A 9.618 11.631 0.088 1 1 C LYS 0.510 1 ATOM 84 C CE . LYS 220 220 ? A 9.745 10.474 -0.906 1 1 C LYS 0.510 1 ATOM 85 N NZ . LYS 220 220 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #