data_SMR-7a7fae940a352b1fe6c4827f1df3ea05_2 _entry.id SMR-7a7fae940a352b1fe6c4827f1df3ea05_2 _struct.entry_id SMR-7a7fae940a352b1fe6c4827f1df3ea05_2 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q9JM99 (isoform 2)/ PRG4_MOUSE, Proteoglycan 4 Estimated model accuracy of this model is 0.031, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q9JM99 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 5 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 118858.476 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP PRG4_MOUSE Q9JM99 1 ;MGWKILPVCLSLLLPVVLIQQVSSQELSCKGRCFESFARGRECDCDSQCKQYGKCCADYDSFCEEVKDNK KNTPKKKPNPEPPAVDEAGSGLDNGEFKLTPPPPDPPTTPHSKVATSPKTTAAKPVTPKPSLAPNSETSK EASLASNKETTVETKETTATNKQSSASKKKTTSVKETRSAEKTSDKDVEPTSTTPKNSAPTTTKKPVTTT KESKFLPLPQEPEPTTAKEPPPTTKKPEPTTRKEPEPTTPKEPEPTTPKEPEPTTPKEPEPTTPKEPPPT TKKPEPTTPKEPGPTTPKEPEPTTTKEPEPTTTKEPESTTRKEPEPTTPKEPEPTTPKEPEPTTLKEPEP TTPKEPEPTTPKEPEPTTPKEPEPTTPKEPEPTTPKEPEPTTPKEPEPTTPKEPEPTTPKEPEPTTPKKP EPTTPKEPVPTTPKEPEPTTPKEPEPTTPKEPEPTTRKEPEPTTPKEPEPTTPKEPEPTTPKKPEPTTTS PKTTTLKATTLAPKVTAPAEEIQNKPEETTPASEDSDDSKTTLKPQKPTKAPKPTKKPTKAPKKPTSTKK PKTPKTRKPKTTPSPLKTTSATPELNTTPLEVMLPTTTIPKQTPNPETAEVNPDHEDADGGEGEKPLIPG PPVLFPTAIPGTDLLAGRLNQGININPMLSDETNLCNGKPVDGLTTLRNGTLVAFRGHYFWMLNPFRPPS PPRRITEVWGIPSPIDTVFTRCNCEGKTFFFKDSQYWRFTNDVVDPGYPKQIVKGFGGLTGKIVAALSIA KYKDRPESVYFFKRGGNIQQYTYKQEPMKKCTGRRPAINYSVYGEAAQVRRRRFERAVGPFQTHTFRIHY SVPMRVSYQDKGFLHNEVKVSTMWRGFPNVVTSAITLPNIRKPDGYDYYAFSKDQYYNIDVPTRTARAIT TRSGQTLSKIWYNCP ; 'Proteoglycan 4' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 925 1 925 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . PRG4_MOUSE Q9JM99 Q9JM99-2 1 925 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2005-12-06 1CD5556F5467CD48 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MGWKILPVCLSLLLPVVLIQQVSSQELSCKGRCFESFARGRECDCDSQCKQYGKCCADYDSFCEEVKDNK KNTPKKKPNPEPPAVDEAGSGLDNGEFKLTPPPPDPPTTPHSKVATSPKTTAAKPVTPKPSLAPNSETSK EASLASNKETTVETKETTATNKQSSASKKKTTSVKETRSAEKTSDKDVEPTSTTPKNSAPTTTKKPVTTT KESKFLPLPQEPEPTTAKEPPPTTKKPEPTTRKEPEPTTPKEPEPTTPKEPEPTTPKEPEPTTPKEPPPT TKKPEPTTPKEPGPTTPKEPEPTTTKEPEPTTTKEPESTTRKEPEPTTPKEPEPTTPKEPEPTTLKEPEP TTPKEPEPTTPKEPEPTTPKEPEPTTPKEPEPTTPKEPEPTTPKEPEPTTPKEPEPTTPKEPEPTTPKKP EPTTPKEPVPTTPKEPEPTTPKEPEPTTPKEPEPTTRKEPEPTTPKEPEPTTPKEPEPTTPKKPEPTTTS PKTTTLKATTLAPKVTAPAEEIQNKPEETTPASEDSDDSKTTLKPQKPTKAPKPTKKPTKAPKKPTSTKK PKTPKTRKPKTTPSPLKTTSATPELNTTPLEVMLPTTTIPKQTPNPETAEVNPDHEDADGGEGEKPLIPG PPVLFPTAIPGTDLLAGRLNQGININPMLSDETNLCNGKPVDGLTTLRNGTLVAFRGHYFWMLNPFRPPS PPRRITEVWGIPSPIDTVFTRCNCEGKTFFFKDSQYWRFTNDVVDPGYPKQIVKGFGGLTGKIVAALSIA KYKDRPESVYFFKRGGNIQQYTYKQEPMKKCTGRRPAINYSVYGEAAQVRRRRFERAVGPFQTHTFRIHY SVPMRVSYQDKGFLHNEVKVSTMWRGFPNVVTSAITLPNIRKPDGYDYYAFSKDQYYNIDVPTRTARAIT TRSGQTLSKIWYNCP ; ;MGWKILPVCLSLLLPVVLIQQVSSQELSCKGRCFESFARGRECDCDSQCKQYGKCCADYDSFCEEVKDNK KNTPKKKPNPEPPAVDEAGSGLDNGEFKLTPPPPDPPTTPHSKVATSPKTTAAKPVTPKPSLAPNSETSK EASLASNKETTVETKETTATNKQSSASKKKTTSVKETRSAEKTSDKDVEPTSTTPKNSAPTTTKKPVTTT KESKFLPLPQEPEPTTAKEPPPTTKKPEPTTRKEPEPTTPKEPEPTTPKEPEPTTPKEPEPTTPKEPPPT TKKPEPTTPKEPGPTTPKEPEPTTTKEPEPTTTKEPESTTRKEPEPTTPKEPEPTTPKEPEPTTLKEPEP TTPKEPEPTTPKEPEPTTPKEPEPTTPKEPEPTTPKEPEPTTPKEPEPTTPKEPEPTTPKEPEPTTPKKP EPTTPKEPVPTTPKEPEPTTPKEPEPTTPKEPEPTTRKEPEPTTPKEPEPTTPKEPEPTTPKKPEPTTTS PKTTTLKATTLAPKVTAPAEEIQNKPEETTPASEDSDDSKTTLKPQKPTKAPKPTKKPTKAPKKPTSTKK PKTPKTRKPKTTPSPLKTTSATPELNTTPLEVMLPTTTIPKQTPNPETAEVNPDHEDADGGEGEKPLIPG PPVLFPTAIPGTDLLAGRLNQGININPMLSDETNLCNGKPVDGLTTLRNGTLVAFRGHYFWMLNPFRPPS PPRRITEVWGIPSPIDTVFTRCNCEGKTFFFKDSQYWRFTNDVVDPGYPKQIVKGFGGLTGKIVAALSIA KYKDRPESVYFFKRGGNIQQYTYKQEPMKKCTGRRPAINYSVYGEAAQVRRRRFERAVGPFQTHTFRIHY SVPMRVSYQDKGFLHNEVKVSTMWRGFPNVVTSAITLPNIRKPDGYDYYAFSKDQYYNIDVPTRTARAIT TRSGQTLSKIWYNCP ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 GLY . 1 3 TRP . 1 4 LYS . 1 5 ILE . 1 6 LEU . 1 7 PRO . 1 8 VAL . 1 9 CYS . 1 10 LEU . 1 11 SER . 1 12 LEU . 1 13 LEU . 1 14 LEU . 1 15 PRO . 1 16 VAL . 1 17 VAL . 1 18 LEU . 1 19 ILE . 1 20 GLN . 1 21 GLN . 1 22 VAL . 1 23 SER . 1 24 SER . 1 25 GLN . 1 26 GLU . 1 27 LEU . 1 28 SER . 1 29 CYS . 1 30 LYS . 1 31 GLY . 1 32 ARG . 1 33 CYS . 1 34 PHE . 1 35 GLU . 1 36 SER . 1 37 PHE . 1 38 ALA . 1 39 ARG . 1 40 GLY . 1 41 ARG . 1 42 GLU . 1 43 CYS . 1 44 ASP . 1 45 CYS . 1 46 ASP . 1 47 SER . 1 48 GLN . 1 49 CYS . 1 50 LYS . 1 51 GLN . 1 52 TYR . 1 53 GLY . 1 54 LYS . 1 55 CYS . 1 56 CYS . 1 57 ALA . 1 58 ASP . 1 59 TYR . 1 60 ASP . 1 61 SER . 1 62 PHE . 1 63 CYS . 1 64 GLU . 1 65 GLU . 1 66 VAL . 1 67 LYS . 1 68 ASP . 1 69 ASN . 1 70 LYS . 1 71 LYS . 1 72 ASN . 1 73 THR . 1 74 PRO . 1 75 LYS . 1 76 LYS . 1 77 LYS . 1 78 PRO . 1 79 ASN . 1 80 PRO . 1 81 GLU . 1 82 PRO . 1 83 PRO . 1 84 ALA . 1 85 VAL . 1 86 ASP . 1 87 GLU . 1 88 ALA . 1 89 GLY . 1 90 SER . 1 91 GLY . 1 92 LEU . 1 93 ASP . 1 94 ASN . 1 95 GLY . 1 96 GLU . 1 97 PHE . 1 98 LYS . 1 99 LEU . 1 100 THR . 1 101 PRO . 1 102 PRO . 1 103 PRO . 1 104 PRO . 1 105 ASP . 1 106 PRO . 1 107 PRO . 1 108 THR . 1 109 THR . 1 110 PRO . 1 111 HIS . 1 112 SER . 1 113 LYS . 1 114 VAL . 1 115 ALA . 1 116 THR . 1 117 SER . 1 118 PRO . 1 119 LYS . 1 120 THR . 1 121 THR . 1 122 ALA . 1 123 ALA . 1 124 LYS . 1 125 PRO . 1 126 VAL . 1 127 THR . 1 128 PRO . 1 129 LYS . 1 130 PRO . 1 131 SER . 1 132 LEU . 1 133 ALA . 1 134 PRO . 1 135 ASN . 1 136 SER . 1 137 GLU . 1 138 THR . 1 139 SER . 1 140 LYS . 1 141 GLU . 1 142 ALA . 1 143 SER . 1 144 LEU . 1 145 ALA . 1 146 SER . 1 147 ASN . 1 148 LYS . 1 149 GLU . 1 150 THR . 1 151 THR . 1 152 VAL . 1 153 GLU . 1 154 THR . 1 155 LYS . 1 156 GLU . 1 157 THR . 1 158 THR . 1 159 ALA . 1 160 THR . 1 161 ASN . 1 162 LYS . 1 163 GLN . 1 164 SER . 1 165 SER . 1 166 ALA . 1 167 SER . 1 168 LYS . 1 169 LYS . 1 170 LYS . 1 171 THR . 1 172 THR . 1 173 SER . 1 174 VAL . 1 175 LYS . 1 176 GLU . 1 177 THR . 1 178 ARG . 1 179 SER . 1 180 ALA . 1 181 GLU . 1 182 LYS . 1 183 THR . 1 184 SER . 1 185 ASP . 1 186 LYS . 1 187 ASP . 1 188 VAL . 1 189 GLU . 1 190 PRO . 1 191 THR . 1 192 SER . 1 193 THR . 1 194 THR . 1 195 PRO . 1 196 LYS . 1 197 ASN . 1 198 SER . 1 199 ALA . 1 200 PRO . 1 201 THR . 1 202 THR . 1 203 THR . 1 204 LYS . 1 205 LYS . 1 206 PRO . 1 207 VAL . 1 208 THR . 1 209 THR . 1 210 THR . 1 211 LYS . 1 212 GLU . 1 213 SER . 1 214 LYS . 1 215 PHE . 1 216 LEU . 1 217 PRO . 1 218 LEU . 1 219 PRO . 1 220 GLN . 1 221 GLU . 1 222 PRO . 1 223 GLU . 1 224 PRO . 1 225 THR 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A 1 878 PRO 878 ? ? ? A . A 1 879 ASN 879 ? ? ? A . A 1 880 ILE 880 ? ? ? A . A 1 881 ARG 881 ? ? ? A . A 1 882 LYS 882 ? ? ? A . A 1 883 PRO 883 ? ? ? A . A 1 884 ASP 884 ? ? ? A . A 1 885 GLY 885 ? ? ? A . A 1 886 TYR 886 ? ? ? A . A 1 887 ASP 887 ? ? ? A . A 1 888 TYR 888 ? ? ? A . A 1 889 TYR 889 ? ? ? A . A 1 890 ALA 890 ? ? ? A . A 1 891 PHE 891 ? ? ? A . A 1 892 SER 892 ? ? ? A . A 1 893 LYS 893 ? ? ? A . A 1 894 ASP 894 ? ? ? A . A 1 895 GLN 895 ? ? ? A . A 1 896 TYR 896 ? ? ? A . A 1 897 TYR 897 ? ? ? A . A 1 898 ASN 898 ? ? ? A . A 1 899 ILE 899 ? ? ? A . A 1 900 ASP 900 ? ? ? A . A 1 901 VAL 901 ? ? ? A . A 1 902 PRO 902 ? ? ? A . A 1 903 THR 903 ? ? ? A . A 1 904 ARG 904 ? ? ? A . A 1 905 THR 905 ? ? ? A . A 1 906 ALA 906 ? ? ? A . A 1 907 ARG 907 ? ? ? A . A 1 908 ALA 908 ? ? ? A . A 1 909 ILE 909 ? ? ? A . A 1 910 THR 910 ? ? ? A . A 1 911 THR 911 ? ? ? A . A 1 912 ARG 912 ? ? ? A . A 1 913 SER 913 ? ? ? A . A 1 914 GLY 914 ? ? ? A . A 1 915 GLN 915 ? ? ? A . A 1 916 THR 916 ? ? ? A . A 1 917 LEU 917 ? ? ? A . A 1 918 SER 918 ? ? ? A . A 1 919 LYS 919 ? ? ? A . A 1 920 ILE 920 ? ? ? A . A 1 921 TRP 921 ? ? ? A . A 1 922 TYR 922 ? ? ? A . A 1 923 ASN 923 ? ? ? A . A 1 924 CYS 924 ? ? ? A . A 1 925 PRO 925 ? ? ? A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 2 {PDB ID=5inh, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=5inh.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by BLAST to 5inh, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 2' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-25 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-20 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MLLVNQSHQGFNKEHTSKMVSAIVLYVLLAAAAHSAFAADPGGSAEWDEGPPTVLSDSPWTNTSGSCKGR CFELQEVGPPDCRCDNLCKSYSSCCHDFDELCLKTARGWECTKDRCGEVRNEENACHCSEDCLSRGDCCT NYQVVCKGESHWVDDDCEEIRVPECPAGFVRPPLIIFSVDGFRASYMKKGSKVMPNIEKLRSCGTHAPYM RPVYPTKTFPNLYTLATGLYPESHGIVGNSMYDPVFDATFHLRGREKFNHRWWGGQPLWITATKQGVRAG TFFWSVSIPHERRILTILQWLSLPDNERPSVYAFYSEQPDFSGHKYGPFGPEMTNPLREIDKTVGQLMDG LKQLKLHRCVNVIFVGDHGMEDVTCDRTEFLSNYLTNVDDITLVPGTLGRIRPKIPNNLKYDPKAIIANL TCKKPDQHFKPYMKQHLPKRLHYANNRRIEDLHLLVERRWHVARKPLDVYKKPSGKCFFQGDHGFDNKVN SMQTVFVGYGPTFKYRTKVPPFENIELYNVMCDLLGLKPAPNNGTHGSLNHLLRTNTFRPTLPEEVSRPN YPGIMYLQSDFDLGCTCDDKVEPKNKLEELNKRLHTKGSTEERHLLYGRPAVLYRTSYDILYHTDFESGY SEIFLMPLWTSYTISKQAEVSSIPEHLTNCVRPDVRVSPGFSQNCLAYKNDKQMSYGFLFPPYLSSSPEA KYDAFLVTNMVPMYPAFKRVWTYFQRVLVKKYASERNGVNVISGPIFDYNYNGLRDIEDEIKQYVEGSSI PVPTHYYSIITSCLDFTQPADKCDGPLSVSSFILPHRPDNDESCNSSEDESKWVEELMKMHTARVRDIEH LTGLDFYRKTSRSYSEILTLKTYLHTYESEISAENLYFQ ; ;MLLVNQSHQGFNKEHTSKMVSAIVLYVLLAAAAHSAFAADPGGSAEWDEGPPTVLSDSPWTNTSGSCKGR CFELQEVGPPDCRCDNLCKSYSSCCHDFDELCLKTARGWECTKDRCGEVRNEENACHCSEDCLSRGDCCT NYQVVCKGESHWVDDDCEEIRVPECPAGFVRPPLIIFSVDGFRASYMKKGSKVMPNIEKLRSCGTHAPYM RPVYPTKTFPNLYTLATGLYPESHGIVGNSMYDPVFDATFHLRGREKFNHRWWGGQPLWITATKQGVRAG TFFWSVSIPHERRILTILQWLSLPDNERPSVYAFYSEQPDFSGHKYGPFGPEMTNPLREIDKTVGQLMDG LKQLKLHRCVNVIFVGDHGMEDVTCDRTEFLSNYLTNVDDITLVPGTLGRIRPKIPNNLKYDPKAIIANL TCKKPDQHFKPYMKQHLPKRLHYANNRRIEDLHLLVERRWHVARKPLDVYKKPSGKCFFQGDHGFDNKVN SMQTVFVGYGPTFKYRTKVPPFENIELYNVMCDLLGLKPAPNNGTHGSLNHLLRTNTFRPTLPEEVSRPN YPGIMYLQSDFDLGCTCDDKVEPKNKLEELNKRLHTKGSTEERHLLYGRPAVLYRTSYDILYHTDFESGY SEIFLMPLWTSYTISKQAEVSSIPEHLTNCVRPDVRVSPGFSQNCLAYKNDKQMSYGFLFPPYLSSSPEA KYDAFLVTNMVPMYPAFKRVWTYFQRVLVKKYASERNGVNVISGPIFDYNYNGLRDIEDEIKQYVEGSSI PVPTHYYSIITSCLDFTQPADKCDGPLSVSSFILPHRPDNDESCNSSEDESKWVEELMKMHTARVRDIEH LTGLDFYRKTSRSYSEILTLKTYLHTYESEISAENLYFQ ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 66 102 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 5inh 2024-11-06 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 925 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 926 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'BLAST e-value' . 8.85e-05 55.556 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MGWKILPVCLSLLLPVVLIQQVSSQELSCKGRCFESFARGR-ECDCDSQCKQYGKCCADYDSFCEEVKDNKKNTPKKKPNPEPPAVDEAGSGLDNGEFKLTPPPPDPPTTPHSKVATSPKTTAAKPVTPKPSLAPNSETSKEASLASNKETTVETKETTATNKQSSASKKKTTSVKETRSAEKTSDKDVEPTSTTPKNSAPTTTKKPVTTTKESKFLPLPQEPEPTTAKEPPPTTKKPEPTTRKEPEPTTPKEPEPTTPKEPEPTTPKEPEPTTPKEPPPTTKKPEPTTPKEPGPTTPKEPEPTTTKEPEPTTTKEPESTTRKEPEPTTPKEPEPTTPKEPEPTTLKEPEPTTPKEPEPTTPKEPEPTTPKEPEPTTPKEPEPTTPKEPEPTTPKEPEPTTPKEPEPTTPKEPEPTTPKKPEPTTPKEPVPTTPKEPEPTTPKEPEPTTPKEPEPTTRKEPEPTTPKEPEPTTPKEPEPTTPKKPEPTTTSPKTTTLKATTLAPKVTAPAEEIQNKPEETTPASEDSDDSKTTLKPQKPTKAPKPTKKPTKAPKKPTSTKKPKTPKTRKPKTTPSPLKTTSATPELNTTPLEVMLPTTTIPKQTPNPETAEVNPDHEDADGGEGEKPLIPGPPVLFPTAIPGTDLLAGRLNQGININPMLSDETNLCNGKPVDGLTTLRNGTLVAFRGHYFWMLNPFRPPSPPRRITEVWGIPSPIDTVFTRCNCEGKTFFFKDSQYWRFTNDVVDPGYPKQIVKGFGGLTGKIVAALSIAKYKDRPESVYFFKRGGNIQQYTYKQEPMKKCTGRRPAINYSVYGEAAQVRRRRFERAVGPFQTHTFRIHYSVPMRVSYQDKGFLHNEVKVSTMWRGFPNVVTSAITLPNIRKPDGYDYYAFSKDQYYNIDVPTRTARAITTRSGQTLSKIWYNCP 2 1 2 ---------------------------SCKGRCFELQEVGPPDCRCDNLCKSYSSCCHDFDELC---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 5inh.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 2' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . SER 28 28 ? A 16.698 -0.153 61.123 1 1 A SER 0.600 1 ATOM 2 C CA . SER 28 28 ? A 16.980 1.261 61.585 1 1 A SER 0.600 1 ATOM 3 C C . SER 28 28 ? A 17.662 2.047 60.486 1 1 A SER 0.600 1 ATOM 4 O O . SER 28 28 ? A 18.361 1.437 59.673 1 1 A SER 0.600 1 ATOM 5 C CB . SER 28 28 ? A 17.857 1.234 62.885 1 1 A SER 0.600 1 ATOM 6 O OG . SER 28 28 ? A 18.394 2.502 63.269 1 1 A SER 0.600 1 ATOM 7 N N . CYS 29 29 ? A 17.443 3.378 60.415 1 1 A CYS 0.570 1 ATOM 8 C CA . CYS 29 29 ? A 18.096 4.288 59.475 1 1 A CYS 0.570 1 ATOM 9 C C . CYS 29 29 ? A 19.337 4.934 60.057 1 1 A CYS 0.570 1 ATOM 10 O O . CYS 29 29 ? A 19.938 5.810 59.438 1 1 A CYS 0.570 1 ATOM 11 C CB . CYS 29 29 ? A 17.176 5.453 58.996 1 1 A CYS 0.570 1 ATOM 12 S SG . CYS 29 29 ? A 15.864 4.924 57.871 1 1 A CYS 0.570 1 ATOM 13 N N . LYS 30 30 ? A 19.805 4.495 61.241 1 1 A LYS 0.650 1 ATOM 14 C CA . LYS 30 30 ? A 21.079 4.934 61.784 1 1 A LYS 0.650 1 ATOM 15 C C . LYS 30 30 ? A 22.271 4.679 60.854 1 1 A LYS 0.650 1 ATOM 16 O O . LYS 30 30 ? A 22.615 3.542 60.539 1 1 A LYS 0.650 1 ATOM 17 C CB . LYS 30 30 ? A 21.342 4.268 63.153 1 1 A LYS 0.650 1 ATOM 18 C CG . LYS 30 30 ? A 22.640 4.732 63.833 1 1 A LYS 0.650 1 ATOM 19 C CD . LYS 30 30 ? A 22.856 4.063 65.198 1 1 A LYS 0.650 1 ATOM 20 C CE . LYS 30 30 ? A 24.238 4.375 65.778 1 1 A LYS 0.650 1 ATOM 21 N NZ . LYS 30 30 ? A 24.441 3.639 67.044 1 1 A LYS 0.650 1 ATOM 22 N N . GLY 31 31 ? A 22.921 5.765 60.376 1 1 A GLY 0.630 1 ATOM 23 C CA . GLY 31 31 ? A 24.009 5.697 59.401 1 1 A GLY 0.630 1 ATOM 24 C C . GLY 31 31 ? A 23.569 5.547 57.962 1 1 A GLY 0.630 1 ATOM 25 O O . GLY 31 31 ? A 24.407 5.434 57.075 1 1 A GLY 0.630 1 ATOM 26 N N . ARG 32 32 ? A 22.249 5.544 57.689 1 1 A ARG 0.550 1 ATOM 27 C CA . ARG 32 32 ? A 21.711 5.250 56.369 1 1 A ARG 0.550 1 ATOM 28 C C . ARG 32 32 ? A 20.786 6.317 55.802 1 1 A ARG 0.550 1 ATOM 29 O O . ARG 32 32 ? A 20.140 6.096 54.781 1 1 A ARG 0.550 1 ATOM 30 C CB . ARG 32 32 ? A 20.913 3.924 56.403 1 1 A ARG 0.550 1 ATOM 31 C CG . ARG 32 32 ? A 21.804 2.675 56.519 1 1 A ARG 0.550 1 ATOM 32 C CD . ARG 32 32 ? A 21.177 1.449 55.847 1 1 A ARG 0.550 1 ATOM 33 N NE . ARG 32 32 ? A 20.081 0.938 56.735 1 1 A ARG 0.550 1 ATOM 34 C CZ . ARG 32 32 ? A 18.822 0.766 56.331 1 1 A ARG 0.550 1 ATOM 35 N NH1 . ARG 32 32 ? A 18.339 1.251 55.201 1 1 A ARG 0.550 1 ATOM 36 N NH2 . ARG 32 32 ? A 17.965 0.071 57.074 1 1 A ARG 0.550 1 ATOM 37 N N . CYS 33 33 ? A 20.674 7.512 56.411 1 1 A CYS 0.630 1 ATOM 38 C CA . CYS 33 33 ? A 19.795 8.553 55.888 1 1 A CYS 0.630 1 ATOM 39 C C . CYS 33 33 ? A 20.153 9.041 54.494 1 1 A CYS 0.630 1 ATOM 40 O O . CYS 33 33 ? A 21.231 9.584 54.267 1 1 A CYS 0.630 1 ATOM 41 C CB . CYS 33 33 ? A 19.722 9.785 56.813 1 1 A CYS 0.630 1 ATOM 42 S SG . CYS 33 33 ? A 18.897 9.399 58.376 1 1 A CYS 0.630 1 ATOM 43 N N . PHE 34 34 ? A 19.224 8.834 53.538 1 1 A PHE 0.490 1 ATOM 44 C CA . PHE 34 34 ? A 19.362 9.158 52.130 1 1 A PHE 0.490 1 ATOM 45 C C . PHE 34 34 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #