data_SMR-b1614cae7bd64bf3f2d61458a13f2603_2 _entry.id SMR-b1614cae7bd64bf3f2d61458a13f2603_2 _struct.entry_id SMR-b1614cae7bd64bf3f2d61458a13f2603_2 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q9D415 (isoform 2)/ DLGP1_MOUSE, Disks large-associated protein 1 Estimated model accuracy of this model is 0.017, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q9D415 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 121013.288 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP DLGP1_MOUSE Q9D415 1 ;MKGLSGSRSHHHGITCEAACDSLSHHSDHKPYLLSPVDHHPADHPYYTQRNSFQAECVGPFSDPLASSTF PRRHYTSQQELKDESALVPRTLATKANRLPTNLLDQFERQLPLSRDGYHTLQYKRTAVEHRSDSPGRIRH LVHSVQKLFTKSHSLEGPSKGSVNGGKASPDESQTLRYGKRSKSKERRSESKARSNASNASPTSPSWWSS DDNLDGDMCLYHTPSGVMTMGRCPDRSASQYFMEAYNTISEQAVKASRSNNDIKCSTCANLPVTLDAPLL KKSAWSSTLTVSRAREVYQKASVNMDQAMVKSEACQQERSCQYLQVPQDEWSGYTPRGKDDEIPCRRMRS GSYIKAMGDEDSGDSDTSPKPSPKVAARRESYLKATQPSLTELTTLKISNEHSPKLQIRSHSYLRAVSEV SINRSLDSLDPAGLLTSPKFRSRNESYMRAMSTISQVSEMEVNGQFESVCESVFSELESQAVEALDLPLP GCFRMRSHSYVRAIEKGCSQDDECVSLRSSSPPRTTTTVRTIQSSTVSSCITTYKKTPPPVPPRTTTKPF ISITAQSSTESAQDAYMDGQGQRGDMISQSGLSNSTESLDSMKALTAAIEAANAQIHGPASQHMGSNAAA VTTTTTIATVTTEDRKKDFKKNRCLSIGIQVDDAEEPEKMAESKTSNKFQSVGVQVEEEKCFRRFTRSNS VTTAVQADLDFHDNLENSLESIEDNSCPGPMARQFSRDASTSTVSIQGSGNHYHACAADDDFDTDFDPSI LPPPDPWIDSITEDPLEAVQRSVCHRDGHWFLKLLQAERDRMEGWCKLMEREERENNLPEDILGKIRTAV GSAQLLMAQKFYQFRELCEENLNPNAHPRPTSQDLAGFWDMLQLSIENISMKFDELHQLKANNWKQMDPL DKKVEQCRFCMVHLKPCTNAGQSK ; 'Disks large-associated protein 1' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 934 1 934 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . DLGP1_MOUSE Q9D415 Q9D415-2 1 934 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2005-07-19 224A365837BCE785 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no G ;MKGLSGSRSHHHGITCEAACDSLSHHSDHKPYLLSPVDHHPADHPYYTQRNSFQAECVGPFSDPLASSTF PRRHYTSQQELKDESALVPRTLATKANRLPTNLLDQFERQLPLSRDGYHTLQYKRTAVEHRSDSPGRIRH LVHSVQKLFTKSHSLEGPSKGSVNGGKASPDESQTLRYGKRSKSKERRSESKARSNASNASPTSPSWWSS DDNLDGDMCLYHTPSGVMTMGRCPDRSASQYFMEAYNTISEQAVKASRSNNDIKCSTCANLPVTLDAPLL KKSAWSSTLTVSRAREVYQKASVNMDQAMVKSEACQQERSCQYLQVPQDEWSGYTPRGKDDEIPCRRMRS GSYIKAMGDEDSGDSDTSPKPSPKVAARRESYLKATQPSLTELTTLKISNEHSPKLQIRSHSYLRAVSEV SINRSLDSLDPAGLLTSPKFRSRNESYMRAMSTISQVSEMEVNGQFESVCESVFSELESQAVEALDLPLP GCFRMRSHSYVRAIEKGCSQDDECVSLRSSSPPRTTTTVRTIQSSTVSSCITTYKKTPPPVPPRTTTKPF ISITAQSSTESAQDAYMDGQGQRGDMISQSGLSNSTESLDSMKALTAAIEAANAQIHGPASQHMGSNAAA 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VTTTTTIATVTTEDRKKDFKKNRCLSIGIQVDDAEEPEKMAESKTSNKFQSVGVQVEEEKCFRRFTRSNS VTTAVQADLDFHDNLENSLESIEDNSCPGPMARQFSRDASTSTVSIQGSGNHYHACAADDDFDTDFDPSI LPPPDPWIDSITEDPLEAVQRSVCHRDGHWFLKLLQAERDRMEGWCKLMEREERENNLPEDILGKIRTAV GSAQLLMAQKFYQFRELCEENLNPNAHPRPTSQDLAGFWDMLQLSIENISMKFDELHQLKANNWKQMDPL DKKVEQCRFCMVHLKPCTNAGQSK ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 LYS . 1 3 GLY . 1 4 LEU . 1 5 SER . 1 6 GLY . 1 7 SER . 1 8 ARG . 1 9 SER . 1 10 HIS . 1 11 HIS . 1 12 HIS . 1 13 GLY . 1 14 ILE . 1 15 THR . 1 16 CYS . 1 17 GLU . 1 18 ALA . 1 19 ALA . 1 20 CYS . 1 21 ASP . 1 22 SER . 1 23 LEU . 1 24 SER . 1 25 HIS . 1 26 HIS . 1 27 SER . 1 28 ASP . 1 29 HIS . 1 30 LYS . 1 31 PRO . 1 32 TYR . 1 33 LEU . 1 34 LEU . 1 35 SER . 1 36 PRO . 1 37 VAL . 1 38 ASP . 1 39 HIS . 1 40 HIS . 1 41 PRO . 1 42 ALA . 1 43 ASP . 1 44 HIS . 1 45 PRO . 1 46 TYR . 1 47 TYR . 1 48 THR . 1 49 GLN . 1 50 ARG . 1 51 ASN . 1 52 SER . 1 53 PHE . 1 54 GLN 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1 142 VAL . 1 143 HIS . 1 144 SER . 1 145 VAL . 1 146 GLN . 1 147 LYS . 1 148 LEU . 1 149 PHE . 1 150 THR . 1 151 LYS . 1 152 SER . 1 153 HIS . 1 154 SER . 1 155 LEU . 1 156 GLU . 1 157 GLY . 1 158 PRO . 1 159 SER . 1 160 LYS . 1 161 GLY . 1 162 SER . 1 163 VAL . 1 164 ASN . 1 165 GLY . 1 166 GLY . 1 167 LYS . 1 168 ALA . 1 169 SER . 1 170 PRO . 1 171 ASP . 1 172 GLU . 1 173 SER . 1 174 GLN . 1 175 THR . 1 176 LEU . 1 177 ARG . 1 178 TYR . 1 179 GLY . 1 180 LYS . 1 181 ARG . 1 182 SER . 1 183 LYS . 1 184 SER . 1 185 LYS . 1 186 GLU . 1 187 ARG . 1 188 ARG . 1 189 SER . 1 190 GLU . 1 191 SER . 1 192 LYS . 1 193 ALA . 1 194 ARG . 1 195 SER . 1 196 ASN . 1 197 ALA . 1 198 SER . 1 199 ASN . 1 200 ALA . 1 201 SER . 1 202 PRO . 1 203 THR . 1 204 SER . 1 205 PRO . 1 206 SER . 1 207 TRP . 1 208 TRP . 1 209 SER . 1 210 SER . 1 211 ASP . 1 212 ASP . 1 213 ASN . 1 214 LEU . 1 215 ASP . 1 216 GLY . 1 217 ASP . 1 218 MET . 1 219 CYS . 1 220 LEU . 1 221 TYR . 1 222 HIS . 1 223 THR . 1 224 PRO . 1 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A 1 869 ARG 869 ? ? ? G . A 1 870 PRO 870 ? ? ? G . A 1 871 THR 871 ? ? ? G . A 1 872 SER 872 ? ? ? G . A 1 873 GLN 873 ? ? ? G . A 1 874 ASP 874 ? ? ? G . A 1 875 LEU 875 ? ? ? G . A 1 876 ALA 876 ? ? ? G . A 1 877 GLY 877 ? ? ? G . A 1 878 PHE 878 ? ? ? G . A 1 879 TRP 879 ? ? ? G . A 1 880 ASP 880 ? ? ? G . A 1 881 MET 881 ? ? ? G . A 1 882 LEU 882 ? ? ? G . A 1 883 GLN 883 ? ? ? G . A 1 884 LEU 884 ? ? ? G . A 1 885 SER 885 ? ? ? G . A 1 886 ILE 886 ? ? ? G . A 1 887 GLU 887 ? ? ? G . A 1 888 ASN 888 ? ? ? G . A 1 889 ILE 889 ? ? ? G . A 1 890 SER 890 ? ? ? G . A 1 891 MET 891 ? ? ? G . A 1 892 LYS 892 ? ? ? G . A 1 893 PHE 893 ? ? ? G . A 1 894 ASP 894 ? ? ? G . A 1 895 GLU 895 ? ? ? G . A 1 896 LEU 896 ? ? ? G . A 1 897 HIS 897 ? ? ? G . A 1 898 GLN 898 ? ? ? G . A 1 899 LEU 899 ? ? ? G . A 1 900 LYS 900 ? ? ? G . A 1 901 ALA 901 ? ? ? G . A 1 902 ASN 902 ? ? ? G . A 1 903 ASN 903 ? ? ? G . A 1 904 TRP 904 ? ? ? G . A 1 905 LYS 905 ? ? ? G . A 1 906 GLN 906 ? ? ? G . A 1 907 MET 907 ? ? ? G . A 1 908 ASP 908 ? ? ? G . A 1 909 PRO 909 ? ? ? G . A 1 910 LEU 910 ? ? ? G . A 1 911 ASP 911 ? ? ? G . A 1 912 LYS 912 ? ? ? G . A 1 913 LYS 913 ? ? ? G . A 1 914 VAL 914 ? ? ? G . A 1 915 GLU 915 ? ? ? G . A 1 916 GLN 916 ? ? ? G . A 1 917 CYS 917 ? ? ? G . A 1 918 ARG 918 ? ? ? G . A 1 919 PHE 919 ? ? ? G . A 1 920 CYS 920 ? ? ? G . A 1 921 MET 921 ? ? ? G . A 1 922 VAL 922 ? ? ? G . A 1 923 HIS 923 ? ? ? G . A 1 924 LEU 924 ? ? ? G . A 1 925 LYS 925 ? ? ? G . A 1 926 PRO 926 ? ? ? G . A 1 927 CYS 927 ? ? ? G . A 1 928 THR 928 ? ? ? G . A 1 929 ASN 929 ? ? ? G . A 1 930 ALA 930 ? ? ? G . A 1 931 GLY 931 ? ? ? G . A 1 932 GLN 932 ? ? ? G . A 1 933 SER 933 ? ? ? G . A 1 934 LYS 934 ? ? ? G . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Nucleoporin NUP49/NSP49 {PDB ID=7n85, label_asym_id=G, auth_asym_id=C, SMTL ID=7n85.1.G}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 7n85, label_asym_id=G' 'target-template alignment' . 4 'model 2' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-25 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-20 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A G 6 1 C # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MFGLNKASSTPAGGLFGQASGASTGNANTGFSFGGTQTGQNTGPSTGGLFGAKPAGSTGGLGASFGQQQQ QSQTNAFGGSATTGGGLFGNKPNNTANTGGGLFGANSNSNSGSLFGSNNAQTSRGLFGNNNTNNINNSSS GMNNASAGLFGSKPAGGTSLFGNTSTSSAPAQNQGMFGAKPAGTSLFGNNAGNTTTGGGLFGSKPTGATS LFGSSNNNNNNNNSNNIMSASGGLFGNQQQQLQQQPQMQCALQNLSQLPITPMTRISELPPQIRQEIEQL DQYIQKQVQISHHLKADTIDHDELIDSIPRDVAYLLKSESATSQYLKQDLKKISSFKSLIDEDLLDTQTF SVLLQQLLTPGSKISSNDLDKFFQKKIHLYEKKLEDYCRILSDIETAVNGIDTDLFGAPNNPNSTAITAD LGSSEAENLLQLKTGLAAIVSTVIEEFTLFMDIAERIAVLHQKTKTLASLSI ; ;MFGLNKASSTPAGGLFGQASGASTGNANTGFSFGGTQTGQNTGPSTGGLFGAKPAGSTGGLGASFGQQQQ QSQTNAFGGSATTGGGLFGNKPNNTANTGGGLFGANSNSNSGSLFGSNNAQTSRGLFGNNNTNNINNSSS GMNNASAGLFGSKPAGGTSLFGNTSTSSAPAQNQGMFGAKPAGTSLFGNNAGNTTTGGGLFGSKPTGATS LFGSSNNNNNNNNSNNIMSASGGLFGNQQQQLQQQPQMQCALQNLSQLPITPMTRISELPPQIRQEIEQL DQYIQKQVQISHHLKADTIDHDELIDSIPRDVAYLLKSESATSQYLKQDLKKISSFKSLIDEDLLDTQTF SVLLQQLLTPGSKISSNDLDKFFQKKIHLYEKKLEDYCRILSDIETAVNGIDTDLFGAPNNPNSTAITAD LGSSEAENLLQLKTGLAAIVSTVIEEFTLFMDIAERIAVLHQKTKTLASLSI ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 272 343 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 7n85 2024-06-05 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 934 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 941 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 17.000 13.846 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MKGLSGSRSHHHGITCEAACDSLSHHSDHKPYLLSPVDHHPADHPYYTQRNSFQAECVGPFSDPLASSTFPRRHYTSQQELKDESALVPRTLATKANRLPTNLLDQFERQLPLSRDGYHTLQYKRTAVEHRSDSPGRIRHLVHSVQKLFTKSHSLEGPSKGSVNGGKASPDESQTLRYGKRSKSKERRSESKARSNASNASPTSPSWWSSDDNLDGDMCLYHTPSGVMTMGRCPDRSASQYFMEAYNTISEQAVKASRSNNDIKCSTCANLPVTLDAPLLKKSAWSSTLTVSRAREVYQKASVNMDQAMVKSEACQQERSCQYLQVPQDEWSGYTPRGKDDEIPCRRMRSGSYIKAMGDEDSGDSDTSPKPSPKVAARRESYLKATQPSLTELTTLKISNEHSPKLQIRSHSYLRAVSEVSINRSLDSLDPAGLLTSPKFRSRNESYMRAMSTISQVSEMEVNGQFESVCESVFSELESQAVEALDLPLPGCFRMRSHSYVRAIEKGCSQDDECVSLRSSSPPRTTTTVRTIQSSTVSSCITTYKKTPPPVPPRTTTKPFISITAQSSTESAQDAYMDGQGQRGDMISQSGLSNSTESLDSMKALTAAIEAANAQIHGPASQHMGSNAAAVTTTTTIATVTTEDRKKDFKKNRCLSIGIQVDDAEEPEKMAESKTSNKFQSVGVQVEEEKCFRRFTRSNSVTTAVQADLDFHDNLENSLESIEDNSCPGPMARQFSRDASTSTVSIQGSGNHYHACAADDDFDTDFDPSILPPPDPWIDSITEDPLEAVQRSVCHRDGHWFLKLLQAERDRMEGWCKLMEREERE-----NNLPEDILGKIRTAVGSAQLL--MAQKFYQFRELCEENLNPNAHPRPTSQDLAGFWDMLQLSIENISMKFDELHQLKANNWKQMDPLDKKVEQCRFCMVHLKPCTNAGQSK 2 1 2 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------QIRQEIEQLDQYIQKQVQISHHLKADTIDHDELIDSIPRDVAYLLKSESATSQYLKQDLKKISSFKSLIDED------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 7n85.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 2' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . ASP 797 797 ? A 847.100 738.659 673.596 1 1 G ASP 0.490 1 ATOM 2 C CA . ASP 797 797 ? A 848.368 737.908 673.342 1 1 G ASP 0.490 1 ATOM 3 C C . ASP 797 797 ? A 848.836 737.026 674.456 1 1 G ASP 0.490 1 ATOM 4 O O . ASP 797 797 ? A 848.941 735.818 674.269 1 1 G ASP 0.490 1 ATOM 5 C CB . ASP 797 797 ? A 849.408 738.927 672.830 1 1 G ASP 0.490 1 ATOM 6 C CG . ASP 797 797 ? A 848.839 739.637 671.587 1 1 G ASP 0.490 1 ATOM 7 O OD1 . ASP 797 797 ? A 847.664 739.326 671.218 1 1 G ASP 0.490 1 ATOM 8 O OD2 . ASP 797 797 ? A 849.518 740.541 671.075 1 1 G ASP 0.490 1 ATOM 9 N N . GLY 798 798 ? A 849.077 737.577 675.663 1 1 G GLY 0.370 1 ATOM 10 C CA . GLY 798 798 ? A 849.569 736.793 676.796 1 1 G GLY 0.370 1 ATOM 11 C C . GLY 798 798 ? A 848.744 735.579 677.154 1 1 G GLY 0.370 1 ATOM 12 O O . GLY 798 798 ? A 849.283 734.506 677.393 1 1 G GLY 0.370 1 ATOM 13 N N . HIS 799 799 ? A 847.400 735.703 677.119 1 1 G HIS 0.690 1 ATOM 14 C CA . HIS 799 799 ? A 846.497 734.585 677.340 1 1 G HIS 0.690 1 ATOM 15 C C . HIS 799 799 ? A 846.659 733.440 676.355 1 1 G HIS 0.690 1 ATOM 16 O O . HIS 799 799 ? A 846.697 732.278 676.745 1 1 G HIS 0.690 1 ATOM 17 C CB . HIS 799 799 ? A 845.017 735.039 677.300 1 1 G HIS 0.690 1 ATOM 18 C CG . HIS 799 799 ? A 844.668 735.980 678.406 1 1 G HIS 0.690 1 ATOM 19 N ND1 . HIS 799 799 ? A 844.661 735.455 679.674 1 1 G HIS 0.690 1 ATOM 20 C CD2 . HIS 799 799 ? A 844.297 737.290 678.432 1 1 G HIS 0.690 1 ATOM 21 C CE1 . HIS 799 799 ? A 844.287 736.442 680.460 1 1 G HIS 0.690 1 ATOM 22 N NE2 . HIS 799 799 ? A 844.052 737.578 679.759 1 1 G HIS 0.690 1 ATOM 23 N N . TRP 800 800 ? A 846.770 733.728 675.043 1 1 G TRP 0.580 1 ATOM 24 C CA . TRP 800 800 ? A 846.973 732.701 674.043 1 1 G TRP 0.580 1 ATOM 25 C C . TRP 800 800 ? A 848.341 732.064 674.150 1 1 G TRP 0.580 1 ATOM 26 O O . TRP 800 800 ? A 848.445 730.845 674.076 1 1 G TRP 0.580 1 ATOM 27 C CB . TRP 800 800 ? A 846.657 733.193 672.614 1 1 G TRP 0.580 1 ATOM 28 C CG . TRP 800 800 ? A 845.183 733.543 672.419 1 1 G TRP 0.580 1 ATOM 29 C CD1 . TRP 800 800 ? A 844.587 734.769 672.314 1 1 G TRP 0.580 1 ATOM 30 C CD2 . TRP 800 800 ? A 844.127 732.575 672.255 1 1 G TRP 0.580 1 ATOM 31 N NE1 . TRP 800 800 ? A 843.228 734.633 672.128 1 1 G TRP 0.580 1 ATOM 32 C CE2 . TRP 800 800 ? A 842.927 733.296 672.077 1 1 G TRP 0.580 1 ATOM 33 C CE3 . TRP 800 800 ? A 844.141 731.183 672.212 1 1 G TRP 0.580 1 ATOM 34 C CZ2 . TRP 800 800 ? A 841.722 732.641 671.847 1 1 G TRP 0.580 1 ATOM 35 C CZ3 . TRP 800 800 ? A 842.926 730.525 671.980 1 1 G TRP 0.580 1 ATOM 36 C CH2 . TRP 800 800 ? A 841.736 731.240 671.798 1 1 G TRP 0.580 1 ATOM 37 N N . PHE 801 801 ? A 849.414 732.850 674.397 1 1 G PHE 0.640 1 ATOM 38 C CA . PHE 801 801 ? A 850.752 732.322 674.600 1 1 G PHE 0.640 1 ATOM 39 C C . PHE 801 801 ? A 850.795 731.322 675.745 1 1 G PHE 0.640 1 ATOM 40 O O . PHE 801 801 ? 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'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.573 2 1 3 0.017 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 797 ASP 1 0.490 2 1 A 798 GLY 1 0.370 3 1 A 799 HIS 1 0.690 4 1 A 800 TRP 1 0.580 5 1 A 801 PHE 1 0.640 6 1 A 802 LEU 1 0.660 7 1 A 803 LYS 1 0.720 8 1 A 804 LEU 1 0.710 9 1 A 805 LEU 1 0.710 10 1 A 806 GLN 1 0.730 11 1 A 807 ALA 1 0.690 12 1 A 808 GLU 1 0.700 13 1 A 809 ARG 1 0.700 14 1 A 810 ASP 1 0.730 15 1 A 811 ARG 1 0.710 16 1 A 812 MET 1 0.710 17 1 A 813 GLU 1 0.690 18 1 A 814 GLY 1 0.620 19 1 A 815 TRP 1 0.670 20 1 A 816 CYS 1 0.580 21 1 A 817 LYS 1 0.630 22 1 A 818 LEU 1 0.660 23 1 A 819 MET 1 0.650 24 1 A 820 GLU 1 0.570 25 1 A 821 ARG 1 0.500 26 1 A 822 GLU 1 0.480 27 1 A 823 GLU 1 0.220 28 1 A 824 ARG 1 0.280 29 1 A 825 GLU 1 0.330 30 1 A 826 ASN 1 0.270 31 1 A 827 ASN 1 0.300 32 1 A 828 LEU 1 0.400 33 1 A 829 PRO 1 0.600 34 1 A 830 GLU 1 0.490 35 1 A 831 ASP 1 0.570 36 1 A 832 ILE 1 0.650 37 1 A 833 LEU 1 0.620 38 1 A 834 GLY 1 0.730 39 1 A 835 LYS 1 0.720 40 1 A 836 ILE 1 0.650 41 1 A 837 ARG 1 0.620 42 1 A 838 THR 1 0.710 43 1 A 839 ALA 1 0.710 44 1 A 840 VAL 1 0.650 45 1 A 841 GLY 1 0.550 46 1 A 842 SER 1 0.550 47 1 A 843 ALA 1 0.590 48 1 A 844 GLN 1 0.450 49 1 A 845 LEU 1 0.310 50 1 A 846 LEU 1 0.260 51 1 A 847 MET 1 0.310 52 1 A 848 ALA 1 0.490 53 1 A 849 GLN 1 0.620 54 1 A 850 LYS 1 0.620 55 1 A 851 PHE 1 0.540 56 1 A 852 TYR 1 0.570 57 1 A 853 GLN 1 0.630 58 1 A 854 PHE 1 0.610 59 1 A 855 ARG 1 0.630 60 1 A 856 GLU 1 0.680 61 1 A 857 LEU 1 0.680 62 1 A 858 CYS 1 0.700 63 1 A 859 GLU 1 0.680 64 1 A 860 GLU 1 0.350 65 1 A 861 ASN 1 0.330 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #