data_SMR-99252b158abeafc79ecc62609327249b_3 _entry.id SMR-99252b158abeafc79ecc62609327249b_3 _struct.entry_id SMR-99252b158abeafc79ecc62609327249b_3 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q9Y5B0/ CTDP1_HUMAN, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase Estimated model accuracy of this model is 0.038, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q9Y5B0' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 121833.954 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP CTDP1_HUMAN Q9Y5B0 1 ;MEVPAAGRVPAEGAPTAAVAEVRCPGPAPLRLLEWRVAAGAAVRIGSVLAVFEAAASAQSSGASQSRVAS GGCVRPARPERRLRSERAGVVRELCAQPGQVVAPGAVLVRLEGCSHPVVMKGLCAECGQDLTQLQSKNGK QQVPLSTATVSMVHSVPELMVSSEQAEQLGREDQQRLHRNRKLVLMVDLDQTLIHTTEQHCQQMSNKGIF HFQLGRGEPMLHTRLRPHCKDFLEKIAKLYELHVFTFGSRLYAHTIAGFLDPEKKLFSHRILSRDECIDP FSKTGNLRNLFPCGDSMVCIIDDREDVWKFAPNLITVKKYVYFQGTGDMNAPPGSRESQTRKKVNHSRGT EVSEPSPPVRDPEGVTQAPGVEPSNGLEKPARELNGSEAATPRDSPRPGKPDERDIWPPAQAPTSSQELA GAPEPQGSCAQGGRVAPGQRPAQGATGTDLDFDLSSDSESSSESEGTKSSSSASDGESEGKRGRQKPKAA PEGAGALAQGSSLEPGRPAAPSLPGEAEPGAHAPDKEPELGGQEEGERDGLCGLGNGCADRKEAETESQN SELSGVTAGESLDQSMEEEEEEDTDEDDHLIYLEEILVRVHTDYYAKYDRYLNKEIEEAPDIRKIVPELK SKVLADVAIIFSGLHPTNFPIEKTREHYHATALGAKILTRLVLSPDAPDRATHLIAARAGTEKVLQAQEC GHLHVVNPDWLWSCLERWDKVEEQLFPLRDDHTKAQRENSPAAFPDREGVPPTALFHPMPVLPKAQPGPE VRIYDSNTGKLIRTGARGPPAPSSSLPIRQEPSSFRAVPPPQPQMFGEELPDAQDGEQPGPSRRKRQPSM SETMPLYTLCKEDLESMDKEVDDILGEGSDDSDSEKRRPEEQEEEPQPRKPGTRRERTLGAPASSERSAA GGRGPRGHKRKLNEEDAASESSRESSNEDEGSSSEADEMAKALEAELNDLM ; 'RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 961 1 961 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . CTDP1_HUMAN Q9Y5B0 . 1 961 9606 'Homo sapiens (Human)' 2011-04-05 62B88FFD9CE4B157 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no B ;MEVPAAGRVPAEGAPTAAVAEVRCPGPAPLRLLEWRVAAGAAVRIGSVLAVFEAAASAQSSGASQSRVAS GGCVRPARPERRLRSERAGVVRELCAQPGQVVAPGAVLVRLEGCSHPVVMKGLCAECGQDLTQLQSKNGK QQVPLSTATVSMVHSVPELMVSSEQAEQLGREDQQRLHRNRKLVLMVDLDQTLIHTTEQHCQQMSNKGIF HFQLGRGEPMLHTRLRPHCKDFLEKIAKLYELHVFTFGSRLYAHTIAGFLDPEKKLFSHRILSRDECIDP FSKTGNLRNLFPCGDSMVCIIDDREDVWKFAPNLITVKKYVYFQGTGDMNAPPGSRESQTRKKVNHSRGT EVSEPSPPVRDPEGVTQAPGVEPSNGLEKPARELNGSEAATPRDSPRPGKPDERDIWPPAQAPTSSQELA GAPEPQGSCAQGGRVAPGQRPAQGATGTDLDFDLSSDSESSSESEGTKSSSSASDGESEGKRGRQKPKAA PEGAGALAQGSSLEPGRPAAPSLPGEAEPGAHAPDKEPELGGQEEGERDGLCGLGNGCADRKEAETESQN SELSGVTAGESLDQSMEEEEEEDTDEDDHLIYLEEILVRVHTDYYAKYDRYLNKEIEEAPDIRKIVPELK 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PHE . 1 53 GLU . 1 54 ALA . 1 55 ALA . 1 56 ALA . 1 57 SER . 1 58 ALA . 1 59 GLN . 1 60 SER . 1 61 SER . 1 62 GLY . 1 63 ALA . 1 64 SER . 1 65 GLN . 1 66 SER . 1 67 ARG . 1 68 VAL . 1 69 ALA . 1 70 SER . 1 71 GLY . 1 72 GLY . 1 73 CYS . 1 74 VAL . 1 75 ARG . 1 76 PRO . 1 77 ALA . 1 78 ARG . 1 79 PRO . 1 80 GLU . 1 81 ARG . 1 82 ARG . 1 83 LEU . 1 84 ARG . 1 85 SER . 1 86 GLU . 1 87 ARG . 1 88 ALA . 1 89 GLY . 1 90 VAL . 1 91 VAL . 1 92 ARG . 1 93 GLU . 1 94 LEU . 1 95 CYS . 1 96 ALA . 1 97 GLN . 1 98 PRO . 1 99 GLY . 1 100 GLN . 1 101 VAL . 1 102 VAL . 1 103 ALA . 1 104 PRO . 1 105 GLY . 1 106 ALA . 1 107 VAL . 1 108 LEU . 1 109 VAL . 1 110 ARG . 1 111 LEU . 1 112 GLU . 1 113 GLY . 1 114 CYS . 1 115 SER . 1 116 HIS . 1 117 PRO . 1 118 VAL . 1 119 VAL . 1 120 MET . 1 121 LYS . 1 122 GLY . 1 123 LEU . 1 124 CYS . 1 125 ALA . 1 126 GLU . 1 127 CYS . 1 128 GLY . 1 129 GLN . 1 130 ASP . 1 131 LEU . 1 132 THR . 1 133 GLN . 1 134 LEU . 1 135 GLN . 1 136 SER . 1 137 LYS . 1 138 ASN . 1 139 GLY . 1 140 LYS . 1 141 GLN . 1 142 GLN . 1 143 VAL . 1 144 PRO . 1 145 LEU . 1 146 SER . 1 147 THR . 1 148 ALA . 1 149 THR . 1 150 VAL . 1 151 SER . 1 152 MET . 1 153 VAL . 1 154 HIS . 1 155 SER . 1 156 VAL . 1 157 PRO . 1 158 GLU . 1 159 LEU . 1 160 MET . 1 161 VAL . 1 162 SER . 1 163 SER . 1 164 GLU . 1 165 GLN . 1 166 ALA . 1 167 GLU . 1 168 GLN . 1 169 LEU . 1 170 GLY . 1 171 ARG . 1 172 GLU . 1 173 ASP . 1 174 GLN . 1 175 GLN . 1 176 ARG . 1 177 LEU . 1 178 HIS . 1 179 ARG . 1 180 ASN . 1 181 ARG . 1 182 LYS . 1 183 LEU . 1 184 VAL . 1 185 LEU . 1 186 MET . 1 187 VAL . 1 188 ASP . 1 189 LEU . 1 190 ASP . 1 191 GLN . 1 192 THR . 1 193 LEU . 1 194 ILE . 1 195 HIS . 1 196 THR . 1 197 THR . 1 198 GLU . 1 199 GLN . 1 200 HIS . 1 201 CYS . 1 202 GLN . 1 203 GLN . 1 204 MET . 1 205 SER . 1 206 ASN . 1 207 LYS . 1 208 GLY . 1 209 ILE . 1 210 PHE . 1 211 HIS . 1 212 PHE . 1 213 GLN . 1 214 LEU . 1 215 GLY . 1 216 ARG . 1 217 GLY . 1 218 GLU . 1 219 PRO . 1 220 MET . 1 221 LEU . 1 222 HIS . 1 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A 1 846 LEU 846 ? ? ? B . A 1 847 TYR 847 ? ? ? B . A 1 848 THR 848 ? ? ? B . A 1 849 LEU 849 ? ? ? B . A 1 850 CYS 850 ? ? ? B . A 1 851 LYS 851 ? ? ? B . A 1 852 GLU 852 ? ? ? B . A 1 853 ASP 853 ? ? ? B . A 1 854 LEU 854 ? ? ? B . A 1 855 GLU 855 ? ? ? B . A 1 856 SER 856 ? ? ? B . A 1 857 MET 857 ? ? ? B . A 1 858 ASP 858 ? ? ? B . A 1 859 LYS 859 ? ? ? B . A 1 860 GLU 860 ? ? ? B . A 1 861 VAL 861 ? ? ? B . A 1 862 ASP 862 ? ? ? B . A 1 863 ASP 863 ? ? ? B . A 1 864 ILE 864 ? ? ? B . A 1 865 LEU 865 ? ? ? B . A 1 866 GLY 866 ? ? ? B . A 1 867 GLU 867 ? ? ? B . A 1 868 GLY 868 ? ? ? B . A 1 869 SER 869 ? ? ? B . A 1 870 ASP 870 ? ? ? B . A 1 871 ASP 871 ? ? ? B . A 1 872 SER 872 ? ? ? B . A 1 873 ASP 873 ? ? ? B . A 1 874 SER 874 ? ? ? B . A 1 875 GLU 875 ? ? ? B . A 1 876 LYS 876 ? ? ? B . A 1 877 ARG 877 ? ? ? B . A 1 878 ARG 878 ? ? ? B . A 1 879 PRO 879 ? ? ? B . A 1 880 GLU 880 ? ? ? B . A 1 881 GLU 881 ? ? ? B . A 1 882 GLN 882 ? ? ? B . A 1 883 GLU 883 ? ? ? B . A 1 884 GLU 884 ? ? ? B . A 1 885 GLU 885 ? ? ? B . A 1 886 PRO 886 ? ? ? B . A 1 887 GLN 887 ? ? ? B . A 1 888 PRO 888 ? ? ? B . A 1 889 ARG 889 ? ? ? B . A 1 890 LYS 890 ? ? ? B . A 1 891 PRO 891 ? ? ? B . A 1 892 GLY 892 ? ? ? B . A 1 893 THR 893 ? ? ? B . A 1 894 ARG 894 ? ? ? B . A 1 895 ARG 895 ? ? ? B . A 1 896 GLU 896 ? ? ? B . A 1 897 ARG 897 ? ? ? B . A 1 898 THR 898 ? ? ? B . A 1 899 LEU 899 ? ? ? B . A 1 900 GLY 900 ? ? ? B . A 1 901 ALA 901 ? ? ? B . A 1 902 PRO 902 ? ? ? B . A 1 903 ALA 903 ? ? ? B . A 1 904 SER 904 ? ? ? B . A 1 905 SER 905 ? ? ? B . A 1 906 GLU 906 ? ? ? B . A 1 907 ARG 907 ? ? ? B . A 1 908 SER 908 ? ? ? B . A 1 909 ALA 909 ? ? ? B . A 1 910 ALA 910 ? ? ? B . A 1 911 GLY 911 ? ? ? B . A 1 912 GLY 912 ? ? ? B . A 1 913 ARG 913 ? ? ? B . A 1 914 GLY 914 ? ? ? B . A 1 915 PRO 915 ? ? ? B . A 1 916 ARG 916 ? ? ? B . A 1 917 GLY 917 ? ? ? B . A 1 918 HIS 918 ? ? ? B . A 1 919 LYS 919 ? ? ? B . A 1 920 ARG 920 ? ? ? B . A 1 921 LYS 921 ? ? ? B . A 1 922 LEU 922 ? ? ? B . A 1 923 ASN 923 ? ? ? B . A 1 924 GLU 924 ? ? ? B . A 1 925 GLU 925 ? ? ? B . A 1 926 ASP 926 ? ? ? B . A 1 927 ALA 927 ? ? ? B . A 1 928 ALA 928 ? ? ? B . A 1 929 SER 929 ? ? ? B . A 1 930 GLU 930 ? ? ? B . A 1 931 SER 931 ? ? ? B . A 1 932 SER 932 ? ? ? B . A 1 933 ARG 933 ? ? ? B . A 1 934 GLU 934 ? ? ? B . A 1 935 SER 935 ? ? ? B . A 1 936 SER 936 ? ? ? B . A 1 937 ASN 937 ? ? ? B . A 1 938 GLU 938 ? ? ? B . A 1 939 ASP 939 ? ? ? B . A 1 940 GLU 940 ? ? ? B . A 1 941 GLY 941 941 GLY GLY B . A 1 942 SER 942 942 SER SER B . A 1 943 SER 943 943 SER SER B . A 1 944 SER 944 944 SER SER B . A 1 945 GLU 945 945 GLU GLU B . A 1 946 ALA 946 946 ALA ALA B . A 1 947 ASP 947 947 ASP ASP B . A 1 948 GLU 948 948 GLU GLU B . A 1 949 MET 949 949 MET MET B . A 1 950 ALA 950 950 ALA ALA B . A 1 951 LYS 951 951 LYS LYS B . A 1 952 ALA 952 952 ALA ALA B . A 1 953 LEU 953 953 LEU LEU B . A 1 954 GLU 954 954 GLU GLU B . A 1 955 ALA 955 955 ALA ALA B . A 1 956 GLU 956 956 GLU GLU B . A 1 957 LEU 957 957 LEU LEU B . A 1 958 ASN 958 958 ASN ASN B . A 1 959 ASP 959 959 ASP ASP B . A 1 960 LEU 960 960 LEU LEU B . A 1 961 MET 961 961 MET MET B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'serine phosphatase FCP1a {PDB ID=1onv, label_asym_id=B, auth_asym_id=B, SMTL ID=1onv.1.B}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 1onv, label_asym_id=B' 'target-template alignment' . 4 'model 3' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-25 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-20 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A B 2 1 B # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;PEEQEEEPQPRKPGTRRERTLGAPASSERSAAGGRGPRGHKRKLNEEDAASESSRESSNEDEGSSSEADE MAKALEAELNDLM ; ;PEEQEEEPQPRKPGTRRERTLGAPASSERSAAGGRGPRGHKRKLNEEDAASESSRESSNEDEGSSSEADE MAKALEAELNDLM ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 3 83 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 1onv 2024-05-22 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 961 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 961 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 2.7e-23 100.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MEVPAAGRVPAEGAPTAAVAEVRCPGPAPLRLLEWRVAAGAAVRIGSVLAVFEAAASAQSSGASQSRVASGGCVRPARPERRLRSERAGVVRELCAQPGQVVAPGAVLVRLEGCSHPVVMKGLCAECGQDLTQLQSKNGKQQVPLSTATVSMVHSVPELMVSSEQAEQLGREDQQRLHRNRKLVLMVDLDQTLIHTTEQHCQQMSNKGIFHFQLGRGEPMLHTRLRPHCKDFLEKIAKLYELHVFTFGSRLYAHTIAGFLDPEKKLFSHRILSRDECIDPFSKTGNLRNLFPCGDSMVCIIDDREDVWKFAPNLITVKKYVYFQGTGDMNAPPGSRESQTRKKVNHSRGTEVSEPSPPVRDPEGVTQAPGVEPSNGLEKPARELNGSEAATPRDSPRPGKPDERDIWPPAQAPTSSQELAGAPEPQGSCAQGGRVAPGQRPAQGATGTDLDFDLSSDSESSSESEGTKSSSSASDGESEGKRGRQKPKAAPEGAGALAQGSSLEPGRPAAPSLPGEAEPGAHAPDKEPELGGQEEGERDGLCGLGNGCADRKEAETESQNSELSGVTAGESLDQSMEEEEEEDTDEDDHLIYLEEILVRVHTDYYAKYDRYLNKEIEEAPDIRKIVPELKSKVLADVAIIFSGLHPTNFPIEKTREHYHATALGAKILTRLVLSPDAPDRATHLIAARAGTEKVLQAQECGHLHVVNPDWLWSCLERWDKVEEQLFPLRDDHTKAQRENSPAAFPDREGVPPTALFHPMPVLPKAQPGPEVRIYDSNTGKLIRTGARGPPAPSSSLPIRQEPSSFRAVPPPQPQMFGEELPDAQDGEQPGPSRRKRQPSMSETMPLYTLCKEDLESMDKEVDDILGEGSDDSDSEKRRPEEQEEEPQPRKPGTRRERTLGAPASSERSAAGGRGPRGHKRKLNEEDAASESSRESSNEDEGSSSEADEMAKALEAELNDLM 2 1 2 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------EQEEEPQPRKPGTRRERTLGAPASSERSAAGGRGPRGHKRKLNEEDAASESSRESSNEDEGSSSEADEMAKALEAELNDLM # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 1onv.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 3' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . 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A 10.290 13.806 -2.443 1 1 B SER 0.510 1 ATOM 16 O OG . SER 943 943 ? A 11.052 12.865 -3.198 1 1 B SER 0.510 1 ATOM 17 N N . SER 944 944 ? A 11.457 13.920 0.541 1 1 B SER 0.520 1 ATOM 18 C CA . SER 944 944 ? A 12.124 13.294 1.679 1 1 B SER 0.520 1 ATOM 19 C C . SER 944 944 ? A 11.061 12.827 2.679 1 1 B SER 0.520 1 ATOM 20 O O . SER 944 944 ? A 10.780 11.641 2.787 1 1 B SER 0.520 1 ATOM 21 C CB . SER 944 944 ? A 13.161 14.254 2.351 1 1 B SER 0.520 1 ATOM 22 O OG . SER 944 944 ? A 13.781 13.709 3.515 1 1 B SER 0.520 1 ATOM 23 N N . GLU 945 945 ? A 10.362 13.776 3.365 1 1 B GLU 0.490 1 ATOM 24 C CA . GLU 945 945 ? A 9.330 13.507 4.370 1 1 B GLU 0.490 1 ATOM 25 C C . GLU 945 945 ? A 8.152 12.685 3.828 1 1 B GLU 0.490 1 ATOM 26 O O . GLU 945 945 ? A 7.651 11.738 4.412 1 1 B GLU 0.490 1 ATOM 27 C CB . GLU 945 945 ? A 8.787 14.858 4.929 1 1 B GLU 0.490 1 ATOM 28 C CG . GLU 945 945 ? A 7.789 14.720 6.114 1 1 B GLU 0.490 1 ATOM 29 C CD . GLU 945 945 ? 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'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.502 2 1 3 0.038 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 941 GLY 1 0.290 2 1 A 942 SER 1 0.450 3 1 A 943 SER 1 0.510 4 1 A 944 SER 1 0.520 5 1 A 945 GLU 1 0.490 6 1 A 946 ALA 1 0.530 7 1 A 947 ASP 1 0.530 8 1 A 948 GLU 1 0.520 9 1 A 949 MET 1 0.440 10 1 A 950 ALA 1 0.540 11 1 A 951 LYS 1 0.540 12 1 A 952 ALA 1 0.550 13 1 A 953 LEU 1 0.510 14 1 A 954 GLU 1 0.560 15 1 A 955 ALA 1 0.590 16 1 A 956 GLU 1 0.520 17 1 A 957 LEU 1 0.520 18 1 A 958 ASN 1 0.540 19 1 A 959 ASP 1 0.480 20 1 A 960 LEU 1 0.450 21 1 A 961 MET 1 0.470 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #