data_SMR-87a5e0e3be88de7db9b79e66d944d8e4_3 _entry.id SMR-87a5e0e3be88de7db9b79e66d944d8e4_3 _struct.entry_id SMR-87a5e0e3be88de7db9b79e66d944d8e4_3 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q8K4J6/ MRTFA_MOUSE, Myocardin-related transcription factor A Estimated model accuracy of this model is 0.012, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q8K4J6' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 119994.593 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP MRTFA_MOUSE Q8K4J6 1 ;MTLLEPEMLMMAVQSVLQLKLQQRRTREELVSQGIMPPLKSPAAFHEQRRSLERARTEDYLKRKIRSRPE RAELVRMHILEETSAEPSLQAKQLKLKRARLADDLNEKIAQRPGPMELVEKNILPVESSLKEAIIVGQVN YPKVADSSSFDEDSSDALSPEQPASHESQGSVPSPLESRVSDPLPSATSISPTQVLSQLPMAPDPGETLF LAEQPPLPPAPLLPPSLANGSIVPTAKPAPTLIKQSQPKSASEKSQRSKKAKELKPKVKKLKYHQYIPPD QKQDKGAPAMDSSYAKILQQQQLFLQLQILNQQQQQQQQQHYNYQAILPAPPKPSAETPGSSAPTPSRSL STSSSPSSGTPGPSGLARQSSTALAAKPGALPANLDDMKVAELKQELKLRSLPVSGTKTELIERLRAYQD QVSPAPGAPKAPATTSVLSKAGEVVVAFPAALLSTGSALVTAGLAPAEMVVATVTSNGMVKFGSTGSTPP VSPTPSERSLLSTGDENSTPGDAFGEMVTSPLTQLTLQASPLQIVKEEGARAASCCLSPGARAELEGLDK DQMLQEKDKQIEELTRMLQQKQQLVELLRLQLEQQKRAQQPAPASSPVKRESGFSSCQLSCQPQGSAHAF GSGLVVPTTNHGDTQAPAPESPPVVVKQEAGPPEPDLAPSSQLLLGSQGTSFLKRVSPPTLVTDSTGTHL ILTVTNKSADGPGLPAGSPQQPLSQPGSPAPGPPAQMDLEHPPQPPFATPTSLLKKEPPGYEETVTQQPK QQENGSSSQHMDDLFDILIQSGEISADFKEPPSLPGKEKSPPAAAAYGPPLTPQPSPLSELPQAAPPPGS PTLPGRLEDFLESSTGLPLLTSGHEGPEPLSLIDDLHSQMLSSSAILDHPPSPMDTSELHFAPEPSSGMG LDLAVGHLDSMDWLELSSGGPVLSLAPLSTAAPSLFSMDFLDGHDLQLHWDSCL ; 'Myocardin-related transcription factor A' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 964 1 964 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . MRTFA_MOUSE Q8K4J6 . 1 964 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2003-06-27 AFAEA328A1860CE5 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no X ;MTLLEPEMLMMAVQSVLQLKLQQRRTREELVSQGIMPPLKSPAAFHEQRRSLERARTEDYLKRKIRSRPE RAELVRMHILEETSAEPSLQAKQLKLKRARLADDLNEKIAQRPGPMELVEKNILPVESSLKEAIIVGQVN YPKVADSSSFDEDSSDALSPEQPASHESQGSVPSPLESRVSDPLPSATSISPTQVLSQLPMAPDPGETLF LAEQPPLPPAPLLPPSLANGSIVPTAKPAPTLIKQSQPKSASEKSQRSKKAKELKPKVKKLKYHQYIPPD QKQDKGAPAMDSSYAKILQQQQLFLQLQILNQQQQQQQQQHYNYQAILPAPPKPSAETPGSSAPTPSRSL STSSSPSSGTPGPSGLARQSSTALAAKPGALPANLDDMKVAELKQELKLRSLPVSGTKTELIERLRAYQD QVSPAPGAPKAPATTSVLSKAGEVVVAFPAALLSTGSALVTAGLAPAEMVVATVTSNGMVKFGSTGSTPP VSPTPSERSLLSTGDENSTPGDAFGEMVTSPLTQLTLQASPLQIVKEEGARAASCCLSPGARAELEGLDK DQMLQEKDKQIEELTRMLQQKQQLVELLRLQLEQQKRAQQPAPASSPVKRESGFSSCQLSCQPQGSAHAF 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VAL . 1 140 ASN . 1 141 TYR . 1 142 PRO . 1 143 LYS . 1 144 VAL . 1 145 ALA . 1 146 ASP . 1 147 SER . 1 148 SER . 1 149 SER . 1 150 PHE . 1 151 ASP . 1 152 GLU . 1 153 ASP . 1 154 SER . 1 155 SER . 1 156 ASP . 1 157 ALA . 1 158 LEU . 1 159 SER . 1 160 PRO . 1 161 GLU . 1 162 GLN . 1 163 PRO . 1 164 ALA . 1 165 SER . 1 166 HIS . 1 167 GLU . 1 168 SER . 1 169 GLN . 1 170 GLY . 1 171 SER . 1 172 VAL . 1 173 PRO . 1 174 SER . 1 175 PRO . 1 176 LEU . 1 177 GLU . 1 178 SER . 1 179 ARG . 1 180 VAL . 1 181 SER . 1 182 ASP . 1 183 PRO . 1 184 LEU . 1 185 PRO . 1 186 SER . 1 187 ALA . 1 188 THR . 1 189 SER . 1 190 ILE . 1 191 SER . 1 192 PRO . 1 193 THR . 1 194 GLN . 1 195 VAL . 1 196 LEU . 1 197 SER . 1 198 GLN . 1 199 LEU . 1 200 PRO . 1 201 MET . 1 202 ALA . 1 203 PRO . 1 204 ASP . 1 205 PRO . 1 206 GLY . 1 207 GLU . 1 208 THR . 1 209 LEU . 1 210 PHE . 1 211 LEU . 1 212 ALA . 1 213 GLU . 1 214 GLN . 1 215 PRO . 1 216 PRO . 1 217 LEU . 1 218 PRO . 1 219 PRO . 1 220 ALA . 1 221 PRO . 1 222 LEU 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A 1 836 PRO 836 ? ? ? X . A 1 837 PRO 837 ? ? ? X . A 1 838 PRO 838 ? ? ? X . A 1 839 GLY 839 ? ? ? X . A 1 840 SER 840 ? ? ? X . A 1 841 PRO 841 ? ? ? X . A 1 842 THR 842 ? ? ? X . A 1 843 LEU 843 ? ? ? X . A 1 844 PRO 844 ? ? ? X . A 1 845 GLY 845 ? ? ? X . A 1 846 ARG 846 ? ? ? X . A 1 847 LEU 847 ? ? ? X . A 1 848 GLU 848 ? ? ? X . A 1 849 ASP 849 ? ? ? X . A 1 850 PHE 850 ? ? ? X . A 1 851 LEU 851 ? ? ? X . A 1 852 GLU 852 ? ? ? X . A 1 853 SER 853 ? ? ? X . A 1 854 SER 854 ? ? ? X . A 1 855 THR 855 ? ? ? X . A 1 856 GLY 856 ? ? ? X . A 1 857 LEU 857 ? ? ? X . A 1 858 PRO 858 ? ? ? X . A 1 859 LEU 859 ? ? ? X . A 1 860 LEU 860 ? ? ? X . A 1 861 THR 861 ? ? ? X . A 1 862 SER 862 ? ? ? X . A 1 863 GLY 863 ? ? ? X . A 1 864 HIS 864 ? ? ? X . A 1 865 GLU 865 ? ? ? X . A 1 866 GLY 866 ? ? ? X . A 1 867 PRO 867 ? ? ? X . A 1 868 GLU 868 ? ? ? X . A 1 869 PRO 869 ? ? ? X . A 1 870 LEU 870 ? ? ? X . A 1 871 SER 871 ? ? ? X . A 1 872 LEU 872 ? ? ? X . A 1 873 ILE 873 ? ? ? X . A 1 874 ASP 874 ? ? ? X . A 1 875 ASP 875 ? ? ? X . A 1 876 LEU 876 ? ? ? X . A 1 877 HIS 877 ? ? ? X . A 1 878 SER 878 ? ? ? X . A 1 879 GLN 879 ? ? ? X . A 1 880 MET 880 ? ? ? X . A 1 881 LEU 881 ? ? ? X . A 1 882 SER 882 ? ? ? X . A 1 883 SER 883 ? ? ? X . A 1 884 SER 884 ? ? ? X . A 1 885 ALA 885 ? ? ? X . A 1 886 ILE 886 ? ? ? X . A 1 887 LEU 887 ? ? ? X . A 1 888 ASP 888 ? ? ? X . A 1 889 HIS 889 ? ? ? X . A 1 890 PRO 890 ? ? ? X . A 1 891 PRO 891 ? ? ? X . A 1 892 SER 892 ? ? ? X . A 1 893 PRO 893 ? ? ? X . A 1 894 MET 894 ? ? ? X . A 1 895 ASP 895 ? ? ? X . A 1 896 THR 896 ? ? ? X . A 1 897 SER 897 ? ? ? X . A 1 898 GLU 898 ? ? ? X . A 1 899 LEU 899 ? ? ? X . A 1 900 HIS 900 ? ? ? X . A 1 901 PHE 901 ? ? ? X . A 1 902 ALA 902 ? ? ? X . A 1 903 PRO 903 ? ? ? X . A 1 904 GLU 904 ? ? ? X . A 1 905 PRO 905 ? ? ? X . A 1 906 SER 906 ? ? ? X . A 1 907 SER 907 ? ? ? X . A 1 908 GLY 908 ? ? ? X . A 1 909 MET 909 ? ? ? X . A 1 910 GLY 910 ? ? ? X . A 1 911 LEU 911 ? ? ? X . A 1 912 ASP 912 ? ? ? X . A 1 913 LEU 913 ? ? ? X . A 1 914 ALA 914 ? ? ? X . A 1 915 VAL 915 ? ? ? X . A 1 916 GLY 916 ? ? ? X . A 1 917 HIS 917 ? ? ? X . A 1 918 LEU 918 ? ? ? X . A 1 919 ASP 919 ? ? ? X . A 1 920 SER 920 ? ? ? X . A 1 921 MET 921 ? ? ? X . A 1 922 ASP 922 ? ? ? X . A 1 923 TRP 923 ? ? ? X . A 1 924 LEU 924 ? ? ? X . A 1 925 GLU 925 ? ? ? X . A 1 926 LEU 926 ? ? ? X . A 1 927 SER 927 ? ? ? X . A 1 928 SER 928 ? ? ? X . A 1 929 GLY 929 ? ? ? X . A 1 930 GLY 930 ? ? ? X . A 1 931 PRO 931 ? ? ? X . A 1 932 VAL 932 ? ? ? X . A 1 933 LEU 933 ? ? ? X . A 1 934 SER 934 ? ? ? X . A 1 935 LEU 935 ? ? ? X . A 1 936 ALA 936 ? ? ? X . A 1 937 PRO 937 ? ? ? X . A 1 938 LEU 938 ? ? ? X . A 1 939 SER 939 ? ? ? X . A 1 940 THR 940 ? ? ? X . A 1 941 ALA 941 ? ? ? X . A 1 942 ALA 942 ? ? ? X . A 1 943 PRO 943 ? ? ? X . A 1 944 SER 944 ? ? ? X . A 1 945 LEU 945 ? ? ? X . A 1 946 PHE 946 ? ? ? X . A 1 947 SER 947 ? ? ? X . A 1 948 MET 948 ? ? ? X . A 1 949 ASP 949 ? ? ? X . A 1 950 PHE 950 ? ? ? X . A 1 951 LEU 951 ? ? ? X . A 1 952 ASP 952 ? ? ? X . A 1 953 GLY 953 ? ? ? X . A 1 954 HIS 954 ? ? ? X . A 1 955 ASP 955 ? ? ? X . A 1 956 LEU 956 ? ? ? X . A 1 957 GLN 957 ? ? ? X . A 1 958 LEU 958 ? ? ? X . A 1 959 HIS 959 ? ? ? X . A 1 960 TRP 960 ? ? ? X . A 1 961 ASP 961 ? ? ? X . A 1 962 SER 962 ? ? ? X . A 1 963 CYS 963 ? ? ? X . A 1 964 LEU 964 ? ? ? X . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'IL4I1 protein {PDB ID=7wkk, label_asym_id=X, auth_asym_id=l, SMTL ID=7wkk.1.X}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 7wkk, label_asym_id=X' 'target-template alignment' . 4 'model 3' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-25 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-20 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A X 6 1 l # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MSGFNFGAASAGGFSFGNPKSTTTTAPTGFSFGAATAAPSGGFSFGTATPTPASTTGQTSGLFSFSNPAP SLAPTSGFSFGAQVTSTPAPSSGGLAFGANTSKLNSGVGNQPAGGTTQTSQPMGGFSFGAATTQTQPSAT SVGGFSFAGGVGSTSTNVFAQPAASTGITLQSAVSTAAAPTATTSQPTSTFSFGTQPQAAPALNFGLLSS SSVLSTASTPAAAQPVAPTTGLSLNFGKPADTSAAVTSTGSTTTNTPSLSSLLGTSGPSLFSSVATSTVP SVVSTVASGLSLTSTATSTGFGMKTLASSAVPTGTLATSTASLGVKAPLAGTIVQANAVGSAAATGISTA TAMTYAQLENLINKWSLELEDQEKHFLQQATQVNAWDRTLMQNGERITTLHREMEKVKLDQKRLDQELDF ILSQQKELEDLLTPLEESVKEQSGTIYLQHADEEREKTYKLAENIDAQLKRMAQDLKEVIEHLNTSAGPG DASNPLQQICKILNAHMDSLQWIDQNSALLQRKVEQVTKECESRRKEQERGFSIAFD ; ;MSGFNFGAASAGGFSFGNPKSTTTTAPTGFSFGAATAAPSGGFSFGTATPTPASTTGQTSGLFSFSNPAP SLAPTSGFSFGAQVTSTPAPSSGGLAFGANTSKLNSGVGNQPAGGTTQTSQPMGGFSFGAATTQTQPSAT SVGGFSFAGGVGSTSTNVFAQPAASTGITLQSAVSTAAAPTATTSQPTSTFSFGTQPQAAPALNFGLLSS SSVLSTASTPAAAQPVAPTTGLSLNFGKPADTSAAVTSTGSTTTNTPSLSSLLGTSGPSLFSSVATSTVP SVVSTVASGLSLTSTATSTGFGMKTLASSAVPTGTLATSTASLGVKAPLAGTIVQANAVGSAAATGISTA TAMTYAQLENLINKWSLELEDQEKHFLQQATQVNAWDRTLMQNGERITTLHREMEKVKLDQKRLDQELDF ILSQQKELEDLLTPLEESVKEQSGTIYLQHADEEREKTYKLAENIDAQLKRMAQDLKEVIEHLNTSAGPG DASNPLQQICKILNAHMDSLQWIDQNSALLQRKVEQVTKECESRRKEQERGFSIAFD ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 383 426 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 7wkk 2024-06-26 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 964 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 964 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 19.000 18.182 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MTLLEPEMLMMAVQSVLQLKLQQRRTREELVSQGIMPPLKSPAAFHEQRRSLERARTEDYLKRKIRSRPERAELVRMHILEETSAEPSLQAKQLKLKRARLADDLNEKIAQRPGPMELVEKNILPVESSLKEAIIVGQVNYPKVADSSSFDEDSSDALSPEQPASHESQGSVPSPLESRVSDPLPSATSISPTQVLSQLPMAPDPGETLFLAEQPPLPPAPLLPPSLANGSIVPTAKPAPTLIKQSQPKSASEKSQRSKKAKELKPKVKKLKYHQYIPPDQKQDKGAPAMDSSYAKILQQQQLFLQLQILNQQQQQQQQQHYNYQAILPAPPKPSAETPGSSAPTPSRSLSTSSSPSSGTPGPSGLARQSSTALAAKPGALPANLDDMKVAELKQELKLRSLPVSGTKTELIERLRAYQDQVSPAPGAPKAPATTSVLSKAGEVVVAFPAALLSTGSALVTAGLAPAEMVVATVTSNGMVKFGSTGSTPPVSPTPSERSLLSTGDENSTPGDAFGEMVTSPLTQLTLQASPLQIVKEEGARAASCCLSPGARAELEGLDKDQMLQEKDKQIEELTRMLQQKQQLVELLRLQLEQQKRAQQPAPASSPVKRESGFSSCQLSCQPQGSAHAFGSGLVVPTTNHGDTQAPAPESPPVVVKQEAGPPEPDLAPSSQLLLGSQGTSFLKRVSPPTLVTDSTGTHLILTVTNKSADGPGLPAGSPQQPLSQPGSPAPGPPAQMDLEHPPQPPFATPTSLLKKEPPGYEETVTQQPKQQENGSSSQHMDDLFDILIQSGEISADFKEPPSLPGKEKSPPAAAAYGPPLTPQPSPLSELPQAAPPPGSPTLPGRLEDFLESSTGLPLLTSGHEGPEPLSLIDDLHSQMLSSSAILDHPPSPMDTSELHFAPEPSSGMGLDLAVGHLDSMDWLELSSGGPVLSLAPLSTAAPSLFSMDFLDGHDLQLHWDSCL 2 1 2 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------VNAWDRTLMQNGERITTLHREMEKVKLDQKRLDQELDFILSQQK---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 7wkk.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 3' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . GLY 557 557 ? A 468.230 222.449 425.027 1 1 X GLY 0.510 1 ATOM 2 C CA . GLY 557 557 ? A 469.724 222.583 424.826 1 1 X GLY 0.510 1 ATOM 3 C C . GLY 557 557 ? A 470.146 222.910 423.423 1 1 X GLY 0.510 1 ATOM 4 O O . GLY 557 557 ? A 470.970 223.787 423.242 1 1 X GLY 0.510 1 ATOM 5 N N . LEU 558 558 ? A 469.560 222.279 422.384 1 1 X LEU 0.510 1 ATOM 6 C CA . LEU 558 558 ? A 469.888 222.612 421.004 1 1 X LEU 0.510 1 ATOM 7 C C . LEU 558 558 ? A 469.623 224.069 420.623 1 1 X LEU 0.510 1 ATOM 8 O O . LEU 558 558 ? A 470.530 224.755 420.152 1 1 X LEU 0.510 1 ATOM 9 C CB . LEU 558 558 ? A 469.093 221.664 420.082 1 1 X LEU 0.510 1 ATOM 10 C CG . LEU 558 558 ? A 469.502 220.182 420.212 1 1 X LEU 0.510 1 ATOM 11 C CD1 . LEU 558 558 ? A 468.527 219.301 419.420 1 1 X LEU 0.510 1 ATOM 12 C CD2 . LEU 558 558 ? A 470.943 219.955 419.731 1 1 X LEU 0.510 1 ATOM 13 N N . ASP 559 559 ? A 468.433 224.623 420.931 1 1 X ASP 0.580 1 ATOM 14 C CA . ASP 559 559 ? A 468.106 226.026 420.705 1 1 X ASP 0.580 1 ATOM 15 C C . ASP 559 559 ? A 469.062 226.981 421.424 1 1 X ASP 0.580 1 ATOM 16 O O . ASP 559 559 ? A 469.443 228.029 420.919 1 1 X ASP 0.580 1 ATOM 17 C CB . ASP 559 559 ? A 466.645 226.309 421.142 1 1 X ASP 0.580 1 ATOM 18 C CG . ASP 559 559 ? A 465.627 225.496 420.342 1 1 X ASP 0.580 1 ATOM 19 O OD1 . ASP 559 559 ? A 466.035 224.743 419.419 1 1 X ASP 0.580 1 ATOM 20 O OD2 . ASP 559 559 ? A 464.440 225.559 420.737 1 1 X ASP 0.580 1 ATOM 21 N N . LYS 560 560 ? A 469.520 226.596 422.634 1 1 X LYS 0.550 1 ATOM 22 C CA . LYS 560 560 ? A 470.529 227.331 423.378 1 1 X LYS 0.550 1 ATOM 23 C C . LYS 560 560 ? A 471.874 227.439 422.647 1 1 X LYS 0.550 1 ATOM 24 O O . LYS 560 560 ? A 472.431 228.530 422.540 1 1 X LYS 0.550 1 ATOM 25 C CB . LYS 560 560 ? A 470.748 226.682 424.770 1 1 X LYS 0.550 1 ATOM 26 C CG . LYS 560 560 ? A 471.789 227.404 425.637 1 1 X LYS 0.550 1 ATOM 27 C CD . LYS 560 560 ? 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A 479.867 234.591 417.039 1 1 X ASP 0.650 1 ATOM 93 O O . ASP 568 568 ? A 480.932 235.187 416.906 1 1 X ASP 0.650 1 ATOM 94 C CB . ASP 568 568 ? A 479.829 232.624 418.609 1 1 X ASP 0.650 1 ATOM 95 C CG . ASP 568 568 ? A 479.734 232.166 420.062 1 1 X ASP 0.650 1 ATOM 96 O OD1 . ASP 568 568 ? A 479.618 233.032 420.966 1 1 X ASP 0.650 1 ATOM 97 O OD2 . ASP 568 568 ? A 479.821 230.927 420.270 1 1 X ASP 0.650 1 ATOM 98 N N . LYS 569 569 ? A 479.064 234.399 415.974 1 1 X LYS 0.710 1 ATOM 99 C CA . LYS 569 569 ? A 479.393 234.944 414.672 1 1 X LYS 0.710 1 ATOM 100 C C . LYS 569 569 ? A 479.419 236.469 414.613 1 1 X LYS 0.710 1 ATOM 101 O O . LYS 569 569 ? A 480.321 237.086 414.035 1 1 X LYS 0.710 1 ATOM 102 C CB . LYS 569 569 ? A 478.375 234.438 413.639 1 1 X LYS 0.710 1 ATOM 103 C CG . LYS 569 569 ? A 478.730 234.901 412.224 1 1 X LYS 0.710 1 ATOM 104 C CD . LYS 569 569 ? A 477.757 234.353 411.187 1 1 X LYS 0.710 1 ATOM 105 C CE . LYS 569 569 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #