data_SMR-8f892e9022d2204c31b34517a99b6592_1 _entry.id SMR-8f892e9022d2204c31b34517a99b6592_1 _struct.entry_id SMR-8f892e9022d2204c31b34517a99b6592_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q5FW52/ MLIP_MOUSE, Muscular LMNA-interacting protein Estimated model accuracy of this model is 0.003, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q5FW52' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 120975.944 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP MLIP_MOUSE Q5FW52 1 ;MTSCILAGSLETTPKVSPGDPEAKPLIFTFVPTLRRLPTHIQLADTSKFLVKIPEEPTDKSPETVNRFEY SDHMTFSSESKQERVQRILDYPSEVSGRNSQQKEFNTKEPQGMQKGDLFKAEYVFIVDSDGEDEATCRQG EQGPPGGPGNIATRPKSLAISSSLASDVVRPKVRGADLKTSSHPEIPHGIAPQQKHGLLISPTTSEQLAH KPPAFSFVSPTNQKTPPVPANVSGATVLREFHTRRLDVTGASEEETTTYFHSTAHDSPLSAWKGASTLVV SPSAQLSGSSLCGSNVTDHTRGLASEAQKKMSTSNVLNPKEDVRTCPAPASGASLTSPSASYIPVRIVMH SLSPSPKPLTSSSHGSLSTVCSQMSSSGSLSKSGLKSPVPSRLSLLTAILKSNPSHQRPLSPASCPTFSL NSLASSTLALDQKVKQTPPTSKKSLSSGSLTTGSTEQEHQASAASYQPCHLPFFSKTTPLSQAQPLSPLA LASNSCASMDIEKIPGSTLRSNTTSPQPQTDTFSLADVPSVTPVLSPLSSSKGRKDGDSRTPEKNRNICI QPSTLASTPPVDESLALSSSGKGFHPSPALSDLIDRSKRACSQQHPGQRPSPSALPTPPVSRAASASHPH LGCSILPLQSSLTQTLQPSPSALRPSCGSATCPSRTQMPENTASNHSSRVSTPSLPVSLTRTKELFSPCA LSMSAGPENKKPKQYKTMSSYKAFAAIPTNTLLLEQKALDEPARTESNSKASVLDLPVEFCFPAQLRQQT EELCATIDKVLQDSLSMHSSDSPSRPPQTMLGSETIKTPTTHPRAAGRETKYANLSSSSSTASESQLTKP GVIRPVPVKSKLLLRKDEEVYEPNPFSKYLEDNSGLFSEQDMAIPHKPVSLHPLYQSKLYPPAKSLLHPQ TLSHADCLTPGSFSHLSSFSVRDEQEKSPTLLSQDTYNKLGHPMVTIPEHDTLDSKE ; 'Muscular LMNA-interacting protein' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 967 1 967 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . MLIP_MOUSE Q5FW52 . 1 967 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2023-05-03 15FA8D7525E1F44A # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no U ;MTSCILAGSLETTPKVSPGDPEAKPLIFTFVPTLRRLPTHIQLADTSKFLVKIPEEPTDKSPETVNRFEY SDHMTFSSESKQERVQRILDYPSEVSGRNSQQKEFNTKEPQGMQKGDLFKAEYVFIVDSDGEDEATCRQG EQGPPGGPGNIATRPKSLAISSSLASDVVRPKVRGADLKTSSHPEIPHGIAPQQKHGLLISPTTSEQLAH KPPAFSFVSPTNQKTPPVPANVSGATVLREFHTRRLDVTGASEEETTTYFHSTAHDSPLSAWKGASTLVV SPSAQLSGSSLCGSNVTDHTRGLASEAQKKMSTSNVLNPKEDVRTCPAPASGASLTSPSASYIPVRIVMH SLSPSPKPLTSSSHGSLSTVCSQMSSSGSLSKSGLKSPVPSRLSLLTAILKSNPSHQRPLSPASCPTFSL NSLASSTLALDQKVKQTPPTSKKSLSSGSLTTGSTEQEHQASAASYQPCHLPFFSKTTPLSQAQPLSPLA LASNSCASMDIEKIPGSTLRSNTTSPQPQTDTFSLADVPSVTPVLSPLSSSKGRKDGDSRTPEKNRNICI QPSTLASTPPVDESLALSSSGKGFHPSPALSDLIDRSKRACSQQHPGQRPSPSALPTPPVSRAASASHPH LGCSILPLQSSLTQTLQPSPSALRPSCGSATCPSRTQMPENTASNHSSRVSTPSLPVSLTRTKELFSPCA LSMSAGPENKKPKQYKTMSSYKAFAAIPTNTLLLEQKALDEPARTESNSKASVLDLPVEFCFPAQLRQQT EELCATIDKVLQDSLSMHSSDSPSRPPQTMLGSETIKTPTTHPRAAGRETKYANLSSSSSTASESQLTKP GVIRPVPVKSKLLLRKDEEVYEPNPFSKYLEDNSGLFSEQDMAIPHKPVSLHPLYQSKLYPPAKSLLHPQ TLSHADCLTPGSFSHLSSFSVRDEQEKSPTLLSQDTYNKLGHPMVTIPEHDTLDSKE ; ;MTSCILAGSLETTPKVSPGDPEAKPLIFTFVPTLRRLPTHIQLADTSKFLVKIPEEPTDKSPETVNRFEY SDHMTFSSESKQERVQRILDYPSEVSGRNSQQKEFNTKEPQGMQKGDLFKAEYVFIVDSDGEDEATCRQG EQGPPGGPGNIATRPKSLAISSSLASDVVRPKVRGADLKTSSHPEIPHGIAPQQKHGLLISPTTSEQLAH KPPAFSFVSPTNQKTPPVPANVSGATVLREFHTRRLDVTGASEEETTTYFHSTAHDSPLSAWKGASTLVV SPSAQLSGSSLCGSNVTDHTRGLASEAQKKMSTSNVLNPKEDVRTCPAPASGASLTSPSASYIPVRIVMH SLSPSPKPLTSSSHGSLSTVCSQMSSSGSLSKSGLKSPVPSRLSLLTAILKSNPSHQRPLSPASCPTFSL NSLASSTLALDQKVKQTPPTSKKSLSSGSLTTGSTEQEHQASAASYQPCHLPFFSKTTPLSQAQPLSPLA LASNSCASMDIEKIPGSTLRSNTTSPQPQTDTFSLADVPSVTPVLSPLSSSKGRKDGDSRTPEKNRNICI QPSTLASTPPVDESLALSSSGKGFHPSPALSDLIDRSKRACSQQHPGQRPSPSALPTPPVSRAASASHPH LGCSILPLQSSLTQTLQPSPSALRPSCGSATCPSRTQMPENTASNHSSRVSTPSLPVSLTRTKELFSPCA LSMSAGPENKKPKQYKTMSSYKAFAAIPTNTLLLEQKALDEPARTESNSKASVLDLPVEFCFPAQLRQQT EELCATIDKVLQDSLSMHSSDSPSRPPQTMLGSETIKTPTTHPRAAGRETKYANLSSSSSTASESQLTKP GVIRPVPVKSKLLLRKDEEVYEPNPFSKYLEDNSGLFSEQDMAIPHKPVSLHPLYQSKLYPPAKSLLHPQ TLSHADCLTPGSFSHLSSFSVRDEQEKSPTLLSQDTYNKLGHPMVTIPEHDTLDSKE ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 THR . 1 3 SER . 1 4 CYS . 1 5 ILE . 1 6 LEU . 1 7 ALA . 1 8 GLY . 1 9 SER . 1 10 LEU . 1 11 GLU . 1 12 THR . 1 13 THR . 1 14 PRO . 1 15 LYS . 1 16 VAL . 1 17 SER . 1 18 PRO . 1 19 GLY . 1 20 ASP . 1 21 PRO . 1 22 GLU . 1 23 ALA . 1 24 LYS . 1 25 PRO . 1 26 LEU . 1 27 ILE . 1 28 PHE . 1 29 THR . 1 30 PHE . 1 31 VAL . 1 32 PRO . 1 33 THR . 1 34 LEU . 1 35 ARG . 1 36 ARG . 1 37 LEU . 1 38 PRO . 1 39 THR . 1 40 HIS . 1 41 ILE . 1 42 GLN . 1 43 LEU . 1 44 ALA . 1 45 ASP . 1 46 THR . 1 47 SER . 1 48 LYS . 1 49 PHE . 1 50 LEU . 1 51 VAL . 1 52 LYS . 1 53 ILE . 1 54 PRO . 1 55 GLU . 1 56 GLU . 1 57 PRO . 1 58 THR . 1 59 ASP . 1 60 LYS . 1 61 SER . 1 62 PRO . 1 63 GLU . 1 64 THR . 1 65 VAL . 1 66 ASN . 1 67 ARG . 1 68 PHE . 1 69 GLU . 1 70 TYR . 1 71 SER . 1 72 ASP . 1 73 HIS . 1 74 MET . 1 75 THR . 1 76 PHE . 1 77 SER . 1 78 SER . 1 79 GLU . 1 80 SER . 1 81 LYS . 1 82 GLN . 1 83 GLU . 1 84 ARG . 1 85 VAL . 1 86 GLN . 1 87 ARG . 1 88 ILE . 1 89 LEU . 1 90 ASP . 1 91 TYR . 1 92 PRO . 1 93 SER . 1 94 GLU . 1 95 VAL . 1 96 SER . 1 97 GLY . 1 98 ARG . 1 99 ASN . 1 100 SER . 1 101 GLN . 1 102 GLN . 1 103 LYS . 1 104 GLU . 1 105 PHE . 1 106 ASN . 1 107 THR . 1 108 LYS . 1 109 GLU . 1 110 PRO . 1 111 GLN . 1 112 GLY . 1 113 MET . 1 114 GLN . 1 115 LYS . 1 116 GLY . 1 117 ASP . 1 118 LEU . 1 119 PHE . 1 120 LYS . 1 121 ALA . 1 122 GLU . 1 123 TYR . 1 124 VAL . 1 125 PHE . 1 126 ILE . 1 127 VAL . 1 128 ASP . 1 129 SER . 1 130 ASP . 1 131 GLY . 1 132 GLU . 1 133 ASP . 1 134 GLU . 1 135 ALA . 1 136 THR . 1 137 CYS . 1 138 ARG . 1 139 GLN . 1 140 GLY . 1 141 GLU . 1 142 GLN . 1 143 GLY . 1 144 PRO . 1 145 PRO . 1 146 GLY . 1 147 GLY . 1 148 PRO . 1 149 GLY . 1 150 ASN . 1 151 ILE . 1 152 ALA . 1 153 THR . 1 154 ARG . 1 155 PRO . 1 156 LYS . 1 157 SER . 1 158 LEU . 1 159 ALA . 1 160 ILE . 1 161 SER . 1 162 SER . 1 163 SER . 1 164 LEU . 1 165 ALA . 1 166 SER . 1 167 ASP . 1 168 VAL . 1 169 VAL . 1 170 ARG . 1 171 PRO . 1 172 LYS . 1 173 VAL . 1 174 ARG . 1 175 GLY . 1 176 ALA . 1 177 ASP . 1 178 LEU . 1 179 LYS . 1 180 THR . 1 181 SER . 1 182 SER . 1 183 HIS . 1 184 PRO . 1 185 GLU . 1 186 ILE . 1 187 PRO . 1 188 HIS . 1 189 GLY . 1 190 ILE . 1 191 ALA . 1 192 PRO . 1 193 GLN . 1 194 GLN . 1 195 LYS . 1 196 HIS . 1 197 GLY . 1 198 LEU . 1 199 LEU . 1 200 ILE . 1 201 SER . 1 202 PRO . 1 203 THR . 1 204 THR . 1 205 SER . 1 206 GLU . 1 207 GLN . 1 208 LEU . 1 209 ALA . 1 210 HIS . 1 211 LYS . 1 212 PRO . 1 213 PRO . 1 214 ALA . 1 215 PHE . 1 216 SER . 1 217 PHE . 1 218 VAL . 1 219 SER . 1 220 PRO . 1 221 THR . 1 222 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A 1 840 PRO 840 ? ? ? U . A 1 841 GLY 841 ? ? ? U . A 1 842 VAL 842 ? ? ? U . A 1 843 ILE 843 ? ? ? U . A 1 844 ARG 844 ? ? ? U . A 1 845 PRO 845 ? ? ? U . A 1 846 VAL 846 ? ? ? U . A 1 847 PRO 847 ? ? ? U . A 1 848 VAL 848 ? ? ? U . A 1 849 LYS 849 ? ? ? U . A 1 850 SER 850 ? ? ? U . A 1 851 LYS 851 ? ? ? U . A 1 852 LEU 852 ? ? ? U . A 1 853 LEU 853 ? ? ? U . A 1 854 LEU 854 ? ? ? U . A 1 855 ARG 855 ? ? ? U . A 1 856 LYS 856 ? ? ? U . A 1 857 ASP 857 ? ? ? U . A 1 858 GLU 858 ? ? ? U . A 1 859 GLU 859 ? ? ? U . A 1 860 VAL 860 ? ? ? U . A 1 861 TYR 861 ? ? ? U . A 1 862 GLU 862 ? ? ? U . A 1 863 PRO 863 ? ? ? U . A 1 864 ASN 864 ? ? ? U . A 1 865 PRO 865 ? ? ? U . A 1 866 PHE 866 ? ? ? U . A 1 867 SER 867 ? ? ? U . A 1 868 LYS 868 ? ? ? U . A 1 869 TYR 869 ? ? ? U . A 1 870 LEU 870 ? ? ? U . A 1 871 GLU 871 ? ? ? U . A 1 872 ASP 872 ? ? ? U . A 1 873 ASN 873 ? ? ? U . A 1 874 SER 874 ? ? ? U . A 1 875 GLY 875 ? ? ? U . A 1 876 LEU 876 ? ? ? U . A 1 877 PHE 877 ? ? ? U . 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A 1 916 ASP 916 ? ? ? U . A 1 917 CYS 917 ? ? ? U . A 1 918 LEU 918 ? ? ? U . A 1 919 THR 919 ? ? ? U . A 1 920 PRO 920 ? ? ? U . A 1 921 GLY 921 ? ? ? U . A 1 922 SER 922 ? ? ? U . A 1 923 PHE 923 ? ? ? U . A 1 924 SER 924 ? ? ? U . A 1 925 HIS 925 ? ? ? U . A 1 926 LEU 926 ? ? ? U . A 1 927 SER 927 ? ? ? U . A 1 928 SER 928 ? ? ? U . A 1 929 PHE 929 ? ? ? U . A 1 930 SER 930 ? ? ? U . A 1 931 VAL 931 ? ? ? U . A 1 932 ARG 932 ? ? ? U . A 1 933 ASP 933 ? ? ? U . A 1 934 GLU 934 ? ? ? U . A 1 935 GLN 935 ? ? ? U . A 1 936 GLU 936 ? ? ? U . A 1 937 LYS 937 ? ? ? U . A 1 938 SER 938 ? ? ? U . A 1 939 PRO 939 ? ? ? U . A 1 940 THR 940 ? ? ? U . A 1 941 LEU 941 ? ? ? U . A 1 942 LEU 942 ? ? ? U . A 1 943 SER 943 ? ? ? U . A 1 944 GLN 944 ? ? ? U . A 1 945 ASP 945 ? ? ? U . A 1 946 THR 946 ? ? ? U . A 1 947 TYR 947 ? ? ? U . A 1 948 ASN 948 ? ? ? U . A 1 949 LYS 949 ? ? ? U . A 1 950 LEU 950 ? ? ? U . A 1 951 GLY 951 ? ? ? U . A 1 952 HIS 952 ? ? ? U . A 1 953 PRO 953 ? ? ? U . A 1 954 MET 954 ? ? ? U . A 1 955 VAL 955 ? ? ? U . A 1 956 THR 956 ? ? ? U . A 1 957 ILE 957 ? ? ? U . A 1 958 PRO 958 ? ? ? U . A 1 959 GLU 959 ? ? ? U . A 1 960 HIS 960 ? ? ? U . A 1 961 ASP 961 ? ? ? U . A 1 962 THR 962 ? ? ? U . A 1 963 LEU 963 ? ? ? U . A 1 964 ASP 964 ? ? ? U . A 1 965 SER 965 ? ? ? U . A 1 966 LYS 966 ? ? ? U . A 1 967 GLU 967 ? ? ? U . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Troponin I, cardiac muscle {PDB ID=6kn8, label_asym_id=U, auth_asym_id=U, SMTL ID=6kn8.1.U}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 6kn8, label_asym_id=U' 'target-template alignment' . 4 'model 1' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-25 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-20 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A U 5 1 U # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;ISASRKLQLKTLLLQIAKQELEREAEERRGEKGRALSTRCQPLELAGLGFAELQDLCRQLHARVDKVDEE RYDIEAKVTKNITEIADLTQKIFDLRGKFKRPTLRRVRISADAMMQALLGARAKES ; ;ISASRKLQLKTLLLQIAKQELEREAEERRGEKGRALSTRCQPLELAGLGFAELQDLCRQLHARVDKVDEE RYDIEAKVTKNITEIADLTQKIFDLRGKFKRPTLRRVRISADAMMQALLGARAKES ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 45 74 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 6kn8 2024-03-27 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 967 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 967 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 320.000 23.333 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MTSCILAGSLETTPKVSPGDPEAKPLIFTFVPTLRRLPTHIQLADTSKFLVKIPEEPTDKSPETVNRFEYSDHMTFSSESKQERVQRILDYPSEVSGRNSQQKEFNTKEPQGMQKGDLFKAEYVFIVDSDGEDEATCRQGEQGPPGGPGNIATRPKSLAISSSLASDVVRPKVRGADLKTSSHPEIPHGIAPQQKHGLLISPTTSEQLAHKPPAFSFVSPTNQKTPPVPANVSGATVLREFHTRRLDVTGASEEETTTYFHSTAHDSPLSAWKGASTLVVSPSAQLSGSSLCGSNVTDHTRGLASEAQKKMSTSNVLNPKEDVRTCPAPASGASLTSPSASYIPVRIVMHSLSPSPKPLTSSSHGSLSTVCSQMSSSGSLSKSGLKSPVPSRLSLLTAILKSNPSHQRPLSPASCPTFSLNSLASSTLALDQKVKQTPPTSKKSLSSGSLTTGSTEQEHQASAASYQPCHLPFFSKTTPLSQAQPLSPLALASNSCASMDIEKIPGSTLRSNTTSPQPQTDTFSLADVPSVTPVLSPLSSSKGRKDGDSRTPEKNRNICIQPSTLASTPPVDESLALSSSGKGFHPSPALSDLIDRSKRACSQQHPGQRPSPSALPTPPVSRAASASHPHLGCSILPLQSSLTQTLQPSPSALRPSCGSATCPSRTQMPENTASNHSSRVSTPSLPVSLTRTKELFSPCALSMSAGPENKKPKQYKTMSSYKAFAAIPTNTLLLEQKALDEPARTESNSKASVLDLPVEFCFPAQLRQQTEELCATIDKVLQDSLSMHSSDSPSRPPQTMLGSETIKTPTTHPRAAGRETKYANLSSSSSTASESQLTKPGVIRPVPVKSKLLLRKDEEVYEPNPFSKYLEDNSGLFSEQDMAIPHKPVSLHPLYQSKLYPPAKSLLHPQTLSHADCLTPGSFSHLSSFSVRDEQEKSPTLLSQDTYNKLGHPMVTIPEHDTLDSKE 2 1 2 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------LAGLGFAELQDLCRQLHARVDKVDEERYDI------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 6kn8.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 1' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . VAL 758 758 ? A 224.149 148.293 215.498 1 1 U VAL 0.360 1 ATOM 2 C CA . VAL 758 758 ? A 222.676 148.030 215.685 1 1 U VAL 0.360 1 ATOM 3 C C . VAL 758 758 ? A 222.302 146.652 216.162 1 1 U VAL 0.360 1 ATOM 4 O O . VAL 758 758 ? A 221.198 146.475 216.661 1 1 U VAL 0.360 1 ATOM 5 C CB . VAL 758 758 ? A 221.908 148.251 214.382 1 1 U VAL 0.360 1 ATOM 6 C CG1 . VAL 758 758 ? A 222.021 149.723 213.936 1 1 U VAL 0.360 1 ATOM 7 C CG2 . VAL 758 758 ? A 222.339 147.263 213.267 1 1 U VAL 0.360 1 ATOM 8 N N . GLU 759 759 ? A 223.194 145.630 216.027 1 1 U GLU 0.390 1 ATOM 9 C CA . GLU 759 759 ? A 222.955 144.311 216.552 1 1 U GLU 0.390 1 ATOM 10 C C . GLU 759 759 ? A 222.751 144.408 218.048 1 1 U GLU 0.390 1 ATOM 11 O O . GLU 759 759 ? A 223.415 145.254 218.695 1 1 U GLU 0.390 1 ATOM 12 C CB . GLU 759 759 ? A 224.136 143.371 216.230 1 1 U GLU 0.390 1 ATOM 13 C CG . GLU 759 759 ? A 223.859 141.888 216.567 1 1 U GLU 0.390 1 ATOM 14 C CD . GLU 759 759 ? A 225.042 140.991 216.213 1 1 U GLU 0.390 1 ATOM 15 O OE1 . GLU 759 759 ? A 224.915 139.764 216.446 1 1 U GLU 0.390 1 ATOM 16 O OE2 . GLU 759 759 ? A 226.063 141.526 215.709 1 1 U GLU 0.390 1 ATOM 17 N N . PHE 760 760 ? A 221.803 143.661 218.598 1 1 U PHE 0.380 1 ATOM 18 C CA . PHE 760 760 ? A 221.460 143.552 220.003 1 1 U PHE 0.380 1 ATOM 19 C C . PHE 760 760 ? A 220.536 144.638 220.514 1 1 U PHE 0.380 1 ATOM 20 O O . PHE 760 760 ? A 220.049 144.548 221.636 1 1 U PHE 0.380 1 ATOM 21 C CB . PHE 760 760 ? A 222.657 143.423 220.989 1 1 U PHE 0.380 1 ATOM 22 C CG . PHE 760 760 ? A 223.475 142.210 220.692 1 1 U PHE 0.380 1 ATOM 23 C CD1 . PHE 760 760 ? A 222.971 140.952 221.047 1 1 U PHE 0.380 1 ATOM 24 C CD2 . PHE 760 760 ? A 224.728 142.296 220.065 1 1 U PHE 0.380 1 ATOM 25 C CE1 . PHE 760 760 ? A 223.716 139.793 220.811 1 1 U PHE 0.380 1 ATOM 26 C CE2 . PHE 760 760 ? A 225.467 141.135 219.805 1 1 U PHE 0.380 1 ATOM 27 C CZ . PHE 760 760 ? 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'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.511 2 1 3 0.003 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 758 VAL 1 0.360 2 1 A 759 GLU 1 0.390 3 1 A 760 PHE 1 0.380 4 1 A 761 CYS 1 0.490 5 1 A 762 PHE 1 0.410 6 1 A 763 PRO 1 0.450 7 1 A 764 ALA 1 0.530 8 1 A 765 GLN 1 0.520 9 1 A 766 LEU 1 0.500 10 1 A 767 ARG 1 0.480 11 1 A 768 GLN 1 0.590 12 1 A 769 GLN 1 0.620 13 1 A 770 THR 1 0.660 14 1 A 771 GLU 1 0.600 15 1 A 772 GLU 1 0.600 16 1 A 773 LEU 1 0.610 17 1 A 774 CYS 1 0.670 18 1 A 775 ALA 1 0.620 19 1 A 776 THR 1 0.630 20 1 A 777 ILE 1 0.570 21 1 A 778 ASP 1 0.590 22 1 A 779 LYS 1 0.630 23 1 A 780 VAL 1 0.580 24 1 A 781 LEU 1 0.490 25 1 A 782 GLN 1 0.510 26 1 A 783 ASP 1 0.470 27 1 A 784 SER 1 0.420 28 1 A 785 LEU 1 0.380 29 1 A 786 SER 1 0.300 30 1 A 787 MET 1 0.280 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #