data_SMR-7a9e7ed00b3aad67d452b559c6b64c49_15 _entry.id SMR-7a9e7ed00b3aad67d452b559c6b64c49_15 _struct.entry_id SMR-7a9e7ed00b3aad67d452b559c6b64c49_15 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - A6JU52/ A6JU52_RAT, RCG45495, isoform CRA_b - Q62839/ GOGA2_RAT, Golgin subfamily A member 2 Estimated model accuracy of this model is 0.032, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries A6JU52, Q62839' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 130969.240 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP GOGA2_RAT Q62839 1 ;MWPPRFPPPRPGMSEETRQSKLAAAKKKLREYQQKNSPGVPAGAKKKKKIKNGHSPERTSASDCQSAENV PTDHTAPAPPSTAAATMFLGVVPSPDADLIQSHDAGNCSNLMEETKTFSSTESLRQLSQQLNGLVSESTS YINGEGLTSSNMKELESRYQELAVALDSSYVTNKQLSSTIEELKQQNQDTLDQLEKEKKDYQQKLAKEQG ALREQLQVHIQTIGILVSEKAELQTALAHTQQAARQKAGESEDLASRLQSSRQRVGELERTLSTVSTQQK QADRYNKDLTKERDALKLELYKNGKSNEDLRQQNSELEEKLRVLVAEKAAAQLGAEELQKKLEMSELLLQ QFSSQSEASGSNEQLQQAMEERAQLESHVGQLMESLKQLQVERDQYAENLKGESAMWQQRVQQMAEQVHA LKEEKEQRESQVQELEASLAELRSQMEEPPPPEPPTGPSEAEERLQGEVEQLQKELEGLTGQLRAQVQDN ESLSHLNREQEGRLLELEREAQHWSEQAEERKQILESMQSDRTTISRALSQNRELKEQLAELQNGFVRLT NENMEITSALQSEQHVKKELARKLGELQERLGELKETVELKSQEAQGLQEQRDQCLSHLQQYAAAYQQHL TAYEQLTSEKEALHKQLLLQTQLMDQLQHEEVQGKMAAEMARQELQEAQERLKASSQENQQLQAQLSLLV LPGEDMDQEEQDEEVPQPSLTIPEDLVSREAMVAFCNAAIARAEEEQARLRVQLREQKARCRSLAHLAAP VQSKLEKEAVVPRDMGDSVSEESNQALHVAMEKLQNRFLEVMQEKVELKERVEELEHCCIQLSGETDTIG EYIALYQNQRAVLKARHLEKEEYISRLAQDKEEMKVKLLELQELVLRLVNERNEWQGKFLAVSQNPADVP APVPTGSQEFGAADQQGDLREVSLADDTEPAQGEAGVPAPQENPTAQQIMQLLREIQNPQERPGLGSNPC IPFFYRADENDEVKIMVI ; 'Golgin subfamily A member 2' 2 1 UNP A6JU52_RAT A6JU52 1 ;MWPPRFPPPRPGMSEETRQSKLAAAKKKLREYQQKNSPGVPAGAKKKKKIKNGHSPERTSASDCQSAENV PTDHTAPAPPSTAAATMFLGVVPSPDADLIQSHDAGNCSNLMEETKTFSSTESLRQLSQQLNGLVSESTS YINGEGLTSSNMKELESRYQELAVALDSSYVTNKQLSSTIEELKQQNQDTLDQLEKEKKDYQQKLAKEQG ALREQLQVHIQTIGILVSEKAELQTALAHTQQAARQKAGESEDLASRLQSSRQRVGELERTLSTVSTQQK QADRYNKDLTKERDALKLELYKNGKSNEDLRQQNSELEEKLRVLVAEKAAAQLGAEELQKKLEMSELLLQ QFSSQSEASGSNEQLQQAMEERAQLESHVGQLMESLKQLQVERDQYAENLKGESAMWQQRVQQMAEQVHA LKEEKEQRESQVQELEASLAELRSQMEEPPPPEPPTGPSEAEERLQGEVEQLQKELEGLTGQLRAQVQDN ESLSHLNREQEGRLLELEREAQHWSEQAEERKQILESMQSDRTTISRALSQNRELKEQLAELQNGFVRLT NENMEITSALQSEQHVKKELARKLGELQERLGELKETVELKSQEAQGLQEQRDQCLSHLQQYAAAYQQHL TAYEQLTSEKEALHKQLLLQTQLMDQLQHEEVQGKMAAEMARQELQEAQERLKASSQENQQLQAQLSLLV LPGEDMDQEEQDEEVPQPSLTIPEDLVSREAMVAFCNAAIARAEEEQARLRVQLREQKARCRSLAHLAAP VQSKLEKEAVVPRDMGDSVSEESNQALHVAMEKLQNRFLEVMQEKVELKERVEELEHCCIQLSGETDTIG EYIALYQNQRAVLKARHLEKEEYISRLAQDKEEMKVKLLELQELVLRLVNERNEWQGKFLAVSQNPADVP APVPTGSQEFGAADQQGDLREVSLADDTEPAQGEAGVPAPQENPTAQQIMQLLREIQNPQERPGLGSNPC IPFFYRADENDEVKIMVI ; 'RCG45495, isoform CRA_b' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 998 1 998 2 2 1 998 1 998 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . 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A6JU52_RAT A6JU52 . 1 998 10116 'Rattus norvegicus (Rat)' 2023-06-28 3AA8CBC61F98A6A4 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MWPPRFPPPRPGMSEETRQSKLAAAKKKLREYQQKNSPGVPAGAKKKKKIKNGHSPERTSASDCQSAENV PTDHTAPAPPSTAAATMFLGVVPSPDADLIQSHDAGNCSNLMEETKTFSSTESLRQLSQQLNGLVSESTS YINGEGLTSSNMKELESRYQELAVALDSSYVTNKQLSSTIEELKQQNQDTLDQLEKEKKDYQQKLAKEQG ALREQLQVHIQTIGILVSEKAELQTALAHTQQAARQKAGESEDLASRLQSSRQRVGELERTLSTVSTQQK QADRYNKDLTKERDALKLELYKNGKSNEDLRQQNSELEEKLRVLVAEKAAAQLGAEELQKKLEMSELLLQ QFSSQSEASGSNEQLQQAMEERAQLESHVGQLMESLKQLQVERDQYAENLKGESAMWQQRVQQMAEQVHA LKEEKEQRESQVQELEASLAELRSQMEEPPPPEPPTGPSEAEERLQGEVEQLQKELEGLTGQLRAQVQDN ESLSHLNREQEGRLLELEREAQHWSEQAEERKQILESMQSDRTTISRALSQNRELKEQLAELQNGFVRLT NENMEITSALQSEQHVKKELARKLGELQERLGELKETVELKSQEAQGLQEQRDQCLSHLQQYAAAYQQHL 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ALA . 1 43 GLY . 1 44 ALA . 1 45 LYS . 1 46 LYS . 1 47 LYS . 1 48 LYS . 1 49 LYS . 1 50 ILE . 1 51 LYS . 1 52 ASN . 1 53 GLY . 1 54 HIS . 1 55 SER . 1 56 PRO . 1 57 GLU . 1 58 ARG . 1 59 THR . 1 60 SER . 1 61 ALA . 1 62 SER . 1 63 ASP . 1 64 CYS . 1 65 GLN . 1 66 SER . 1 67 ALA . 1 68 GLU . 1 69 ASN . 1 70 VAL . 1 71 PRO . 1 72 THR . 1 73 ASP . 1 74 HIS . 1 75 THR . 1 76 ALA . 1 77 PRO . 1 78 ALA . 1 79 PRO . 1 80 PRO . 1 81 SER . 1 82 THR . 1 83 ALA . 1 84 ALA . 1 85 ALA . 1 86 THR . 1 87 MET . 1 88 PHE . 1 89 LEU . 1 90 GLY . 1 91 VAL . 1 92 VAL . 1 93 PRO . 1 94 SER . 1 95 PRO . 1 96 ASP . 1 97 ALA . 1 98 ASP . 1 99 LEU . 1 100 ILE . 1 101 GLN . 1 102 SER . 1 103 HIS . 1 104 ASP . 1 105 ALA . 1 106 GLY . 1 107 ASN . 1 108 CYS . 1 109 SER . 1 110 ASN . 1 111 LEU . 1 112 MET . 1 113 GLU . 1 114 GLU . 1 115 THR . 1 116 LYS . 1 117 THR . 1 118 PHE . 1 119 SER . 1 120 SER . 1 121 THR . 1 122 GLU . 1 123 SER . 1 124 LEU . 1 125 ARG . 1 126 GLN . 1 127 LEU . 1 128 SER . 1 129 GLN . 1 130 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A 1 988 ASP 988 ? ? ? A . A 1 989 GLU 989 ? ? ? A . A 1 990 ASN 990 ? ? ? A . A 1 991 ASP 991 ? ? ? A . A 1 992 GLU 992 ? ? ? A . A 1 993 VAL 993 ? ? ? A . A 1 994 LYS 994 ? ? ? A . A 1 995 ILE 995 ? ? ? A . A 1 996 MET 996 ? ? ? A . A 1 997 VAL 997 ? ? ? A . A 1 998 ILE 998 ? ? ? A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Spindle pole body component 110 {PDB ID=8qv2, label_asym_id=TB, auth_asym_id=Sb, SMTL ID=8qv2.72.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 8qv2, label_asym_id=TB' 'target-template alignment' . 4 'model 15' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-25 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-20 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A TB 6 1 Sb # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MDEASHLPNGSLKNMEFTPVGFIKSKRNTTQTQVVSPTKVPNANNGDENEGPVKKRQRRSIDDTIDSTRL FSEASQFDDSFPEIKANIPPSPRSGNVDKSRKRNLIDDLKKDVPMSQPLKEQEVREHQMKKERFDRALES KLLGKRHITYANSDISNKELYINEIKSLKHEIKELRKEKNDTLNNYDTLEEETDDLKNRLQALEKELDAK NKIVNSRKVDDHSGCIEEREQMERKLAELERKLKTVKDQVLELENNSDVQSLKLRSKEDELKNLMNELNE LKSNAEEKDTQLEFKKNELRKRTNELNELKIKSDEMDLQLKQKQNESKRLKDELNELETKFSENGSQSSA KENELKMLKNKIAELEEEISTKNSQLIAKEGKLASLMAQLTQLESKLNQRDSQLGSREEELKKTNDKLQK DIRIAREETVSKDERIIDLQKKVKQLENDLFVIKKTHSESKTITDNELESKDKLIKILENDLKVAQEKYS KMEKELKEREFNYKISESKLEDEKTTLNEKISNLAAENSQLKNKIEDNSTATHHMKENYEKQLESLRKDI EEYKESAKDSEDKIEELKIRIAENSAKVSEKRSKDIKQKDEQISDLTQNLKLQEDEISSLKSIIDRYKKD FNQLKSEQSNIQHDLNLQILNLENKLIESEDELKSLRDSQKIEIENWKRKYNNLSLENDRLLTEKESASD KEREISILNRKLDEMDKEKWNLQESKEKYKRELQKVITANDRLRREKEELNENSNNIRIMEDKMTRIKKN YLSEITSLQEENRRLEERLILNERRKDNDSTMQLNDIISYYKLKYHSEVRHNNDLKVINDYLNKVLALGT RRLRLDTRKGEHSLNISLPDDDELDRDYYNSHVYTRYHDYEYPLRFNLNRRGPYFERRLSFKTVALLVLA CVRMKRIAFYRRSDDNRLRILRDRIESSSGRISW ; ;MDEASHLPNGSLKNMEFTPVGFIKSKRNTTQTQVVSPTKVPNANNGDENEGPVKKRQRRSIDDTIDSTRL FSEASQFDDSFPEIKANIPPSPRSGNVDKSRKRNLIDDLKKDVPMSQPLKEQEVREHQMKKERFDRALES KLLGKRHITYANSDISNKELYINEIKSLKHEIKELRKEKNDTLNNYDTLEEETDDLKNRLQALEKELDAK NKIVNSRKVDDHSGCIEEREQMERKLAELERKLKTVKDQVLELENNSDVQSLKLRSKEDELKNLMNELNE LKSNAEEKDTQLEFKKNELRKRTNELNELKIKSDEMDLQLKQKQNESKRLKDELNELETKFSENGSQSSA KENELKMLKNKIAELEEEISTKNSQLIAKEGKLASLMAQLTQLESKLNQRDSQLGSREEELKKTNDKLQK DIRIAREETVSKDERIIDLQKKVKQLENDLFVIKKTHSESKTITDNELESKDKLIKILENDLKVAQEKYS KMEKELKEREFNYKISESKLEDEKTTLNEKISNLAAENSQLKNKIEDNSTATHHMKENYEKQLESLRKDI EEYKESAKDSEDKIEELKIRIAENSAKVSEKRSKDIKQKDEQISDLTQNLKLQEDEISSLKSIIDRYKKD FNQLKSEQSNIQHDLNLQILNLENKLIESEDELKSLRDSQKIEIENWKRKYNNLSLENDRLLTEKESASD KEREISILNRKLDEMDKEKWNLQESKEKYKRELQKVITANDRLRREKEELNENSNNIRIMEDKMTRIKKN YLSEITSLQEENRRLEERLILNERRKDNDSTMQLNDIISYYKLKYHSEVRHNNDLKVINDYLNKVLALGT RRLRLDTRKGEHSLNISLPDDDELDRDYYNSHVYTRYHDYEYPLRFNLNRRGPYFERRLSFKTVALLVLA CVRMKRIAFYRRSDDNRLRILRDRIESSSGRISW ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 165 283 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8qv2 2024-07-31 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 998 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 998 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 4.1e-07 16.807 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MWPPRFPPPRPGMSEETRQSKLAAAKKKLREYQQKNSPGVPAGAKKKKKIKNGHSPERTSASDCQSAENVPTDHTAPAPPSTAAATMFLGVVPSPDADLIQSHDAGNCSNLMEETKTFSSTESLRQLSQQLNGLVSESTSYINGEGLTSSNMKELESRYQELAVALDSSYVTNKQLSSTIEELKQQNQDTLDQLEKEKKDYQQKLAKEQGALREQLQVHIQTIGILVSEKAELQTALAHTQQAARQKAGESEDLASRLQSSRQRVGELERTLSTVSTQQKQADRYNKDLTKERDALKLELYKNGKSNEDLRQQNSELEEKLRVLVAEKAAAQLGAEELQKKLEMSELLLQQFSSQSEASGSNEQLQQAMEERAQLESHVGQLMESLKQLQVERDQYAENLKGESAMWQQRVQQMAEQVHALKEEKEQRESQVQELEASLAELRSQMEEPPPPEPPTGPSEAEERLQGEVEQLQKELEGLTGQLRAQVQDNESLSHLNREQEGRLLELEREAQHWSEQAEERKQILESMQSDRTTISRALSQNRELKEQLAELQNGFVRLTNENMEITSALQSEQHVKKELARKLGELQERLGELKETVELKSQEAQGLQEQRDQCLSHLQQYAAAYQQHLTAYEQLTSEKEALHKQLLLQTQLMDQLQHEEVQGKMAAEMARQELQEAQERLKASSQENQQLQAQLSLLVLPGEDMDQEEQDEEVPQPSLTIPEDLVSREAMVAFCNAAIARAEEEQARLRVQLREQKARCRSLAHLAAPVQSKLEKEAVVPRDMGDSVSEESNQALHVAMEKLQNRFLEVMQEKVELKERVEELEHCCIQLSGETDTIGEYIALYQNQRAVLKARHLEKEEYISRLAQDKEEMKVKLLELQELVLRLVNERNEWQGKFLAVSQNPADVPAPVPTGSQEFGAADQQGDLREVSLADDTEPAQGEAGVPAPQENPTAQQIMQLLREIQNPQERPGLGSNPCIPFFYRADENDEVKIMVI 2 1 2 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------IKSLKHEIKELRKEKNDTLNNYDTLEEETDDLKNRLQALEKELDAKNKIVNSRKVDDHSGCIEER-------EQMERKLAELERKLKTVKDQVLELENNSDVQSLKLRSKEDELKNLMNELNELKS------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8qv2.72' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 15' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . MET 152 152 ? A 191.467 254.428 203.843 1 1 A MET 0.630 1 ATOM 2 C CA . MET 152 152 ? A 191.434 253.208 202.965 1 1 A MET 0.630 1 ATOM 3 C C . MET 152 152 ? A 191.750 253.354 201.474 1 1 A MET 0.630 1 ATOM 4 O O . MET 152 152 ? A 191.925 252.362 200.789 1 1 A MET 0.630 1 ATOM 5 C CB . MET 152 152 ? A 190.049 252.544 203.163 1 1 A MET 0.630 1 ATOM 6 C CG . MET 152 152 ? A 189.775 252.052 204.603 1 1 A MET 0.630 1 ATOM 7 S SD . MET 152 152 ? A 191.033 250.905 205.248 1 1 A MET 0.630 1 ATOM 8 C CE . MET 152 152 ? A 190.596 249.515 204.165 1 1 A MET 0.630 1 ATOM 9 N N . LYS 153 153 ? A 191.922 254.587 200.936 1 1 A LYS 0.640 1 ATOM 10 C CA . LYS 153 153 ? A 192.179 254.824 199.521 1 1 A LYS 0.640 1 ATOM 11 C C . LYS 153 153 ? A 193.533 254.329 199.024 1 1 A LYS 0.640 1 ATOM 12 O O . LYS 153 153 ? A 193.769 254.185 197.837 1 1 A LYS 0.640 1 ATOM 13 C CB . LYS 153 153 ? A 192.060 256.346 199.259 1 1 A LYS 0.640 1 ATOM 14 C CG . LYS 153 153 ? A 193.111 257.201 199.998 1 1 A LYS 0.640 1 ATOM 15 C CD . LYS 153 153 ? A 192.950 258.709 199.730 1 1 A LYS 0.640 1 ATOM 16 C CE . LYS 153 153 ? A 194.099 259.602 200.232 1 1 A LYS 0.640 1 ATOM 17 N NZ . LYS 153 153 ? A 194.307 259.427 201.687 1 1 A LYS 0.640 1 ATOM 18 N N . GLU 154 154 ? A 194.462 253.992 199.940 1 1 A GLU 0.690 1 ATOM 19 C CA . GLU 154 154 ? A 195.732 253.415 199.577 1 1 A GLU 0.690 1 ATOM 20 C C . GLU 154 154 ? A 195.631 252.020 198.966 1 1 A GLU 0.690 1 ATOM 21 O O . GLU 154 154 ? A 196.553 251.552 198.306 1 1 A GLU 0.690 1 ATOM 22 C CB . GLU 154 154 ? A 196.626 253.300 200.801 1 1 A GLU 0.690 1 ATOM 23 C CG . GLU 154 154 ? A 197.151 254.620 201.385 1 1 A GLU 0.690 1 ATOM 24 C CD . GLU 154 154 ? A 198.136 254.243 202.494 1 1 A GLU 0.690 1 ATOM 25 O OE1 . GLU 154 154 ? A 198.781 253.158 202.359 1 1 A GLU 0.690 1 ATOM 26 O OE2 . GLU 154 154 ? A 198.210 255.023 203.469 1 1 A GLU 0.690 1 ATOM 27 N N . LEU 155 155 ? A 194.497 251.316 199.178 1 1 A LEU 0.700 1 ATOM 28 C CA . LEU 155 155 ? A 194.183 250.100 198.453 1 1 A LEU 0.700 1 ATOM 29 C C . LEU 155 155 ? A 193.920 250.367 196.972 1 1 A LEU 0.700 1 ATOM 30 O O . LEU 155 155 ? A 194.438 249.671 196.107 1 1 A LEU 0.700 1 ATOM 31 C CB . LEU 155 155 ? A 192.990 249.352 199.084 1 1 A LEU 0.700 1 ATOM 32 C CG . LEU 155 155 ? A 193.061 249.154 200.614 1 1 A LEU 0.700 1 ATOM 33 C CD1 . LEU 155 155 ? A 191.883 248.273 201.048 1 1 A LEU 0.700 1 ATOM 34 C CD2 . LEU 155 155 ? A 194.388 248.569 201.130 1 1 A LEU 0.700 1 ATOM 35 N N . GLU 156 156 ? A 193.151 251.436 196.657 1 1 A GLU 0.720 1 ATOM 36 C CA . GLU 156 156 ? A 192.937 251.959 195.318 1 1 A GLU 0.720 1 ATOM 37 C C . GLU 156 156 ? A 194.215 252.504 194.696 1 1 A GLU 0.720 1 ATOM 38 O O . GLU 156 156 ? A 194.496 252.285 193.521 1 1 A GLU 0.720 1 ATOM 39 C CB . GLU 156 156 ? A 191.837 253.038 195.294 1 1 A GLU 0.720 1 ATOM 40 C CG . GLU 156 156 ? A 190.428 252.487 195.616 1 1 A GLU 0.720 1 ATOM 41 C CD . GLU 156 156 ? A 189.355 253.578 195.609 1 1 A GLU 0.720 1 ATOM 42 O OE1 . GLU 156 156 ? A 189.715 254.781 195.534 1 1 A GLU 0.720 1 ATOM 43 O OE2 . GLU 156 156 ? A 188.162 253.197 195.710 1 1 A GLU 0.720 1 ATOM 44 N N . SER 157 157 ? A 195.068 253.186 195.491 1 1 A SER 0.760 1 ATOM 45 C CA . SER 157 157 ? A 196.402 253.595 195.057 1 1 A SER 0.760 1 ATOM 46 C C . SER 157 157 ? A 197.290 252.427 194.648 1 1 A SER 0.760 1 ATOM 47 O O . SER 157 157 ? A 197.892 252.432 193.580 1 1 A SER 0.760 1 ATOM 48 C CB . SER 157 157 ? A 197.178 254.391 196.140 1 1 A SER 0.760 1 ATOM 49 O OG . SER 157 157 ? A 196.448 255.534 196.592 1 1 A SER 0.760 1 ATOM 50 N N . ARG 158 158 ? A 197.334 251.343 195.453 1 1 A ARG 0.690 1 ATOM 51 C CA . ARG 158 158 ? A 198.030 250.121 195.083 1 1 A ARG 0.690 1 ATOM 52 C C . ARG 158 158 ? A 197.354 249.371 193.935 1 1 A ARG 0.690 1 ATOM 53 O O . ARG 158 158 ? A 198.005 248.701 193.145 1 1 A ARG 0.690 1 ATOM 54 C CB . ARG 158 158 ? A 198.240 249.175 196.289 1 1 A ARG 0.690 1 ATOM 55 C CG . ARG 158 158 ? A 199.227 249.722 197.345 1 1 A ARG 0.690 1 ATOM 56 C CD . ARG 158 158 ? A 199.442 248.760 198.518 1 1 A ARG 0.690 1 ATOM 57 N NE . ARG 158 158 ? A 200.437 249.364 199.483 1 1 A ARG 0.690 1 ATOM 58 C CZ . ARG 158 158 ? A 200.131 250.260 200.438 1 1 A ARG 0.690 1 ATOM 59 N NH1 . ARG 158 158 ? A 198.913 250.760 200.585 1 1 A ARG 0.690 1 ATOM 60 N NH2 . ARG 158 158 ? A 201.065 250.754 201.254 1 1 A ARG 0.690 1 ATOM 61 N N . TYR 159 159 ? A 196.019 249.493 193.769 1 1 A TYR 0.690 1 ATOM 62 C CA . TYR 159 159 ? A 195.309 249.024 192.589 1 1 A TYR 0.690 1 ATOM 63 C C . TYR 159 159 ? A 195.792 249.730 191.313 1 1 A TYR 0.690 1 ATOM 64 O O . TYR 159 159 ? A 196.009 249.095 190.282 1 1 A TYR 0.690 1 ATOM 65 C CB . TYR 159 159 ? A 193.778 249.180 192.798 1 1 A TYR 0.690 1 ATOM 66 C CG . TYR 159 159 ? A 192.980 248.672 191.638 1 1 A TYR 0.690 1 ATOM 67 C CD1 . TYR 159 159 ? A 192.488 249.566 190.676 1 1 A TYR 0.690 1 ATOM 68 C CD2 . TYR 159 159 ? A 192.747 247.302 191.480 1 1 A TYR 0.690 1 ATOM 69 C CE1 . TYR 159 159 ? A 191.770 249.094 189.572 1 1 A TYR 0.690 1 ATOM 70 C CE2 . TYR 159 159 ? A 192.021 246.829 190.378 1 1 A TYR 0.690 1 ATOM 71 C CZ . TYR 159 159 ? A 191.529 247.728 189.426 1 1 A TYR 0.690 1 ATOM 72 O OH . TYR 159 159 ? A 190.786 247.273 188.322 1 1 A TYR 0.690 1 ATOM 73 N N . GLN 160 160 ? A 196.021 251.058 191.363 1 1 A GLN 0.730 1 ATOM 74 C CA . GLN 160 160 ? A 196.663 251.817 190.299 1 1 A GLN 0.730 1 ATOM 75 C C . GLN 160 160 ? A 198.101 251.380 190.014 1 1 A GLN 0.730 1 ATOM 76 O O . GLN 160 160 ? A 198.496 251.252 188.858 1 1 A GLN 0.730 1 ATOM 77 C CB . GLN 160 160 ? A 196.615 253.335 190.579 1 1 A GLN 0.730 1 ATOM 78 C CG . GLN 160 160 ? A 195.185 253.918 190.553 1 1 A GLN 0.730 1 ATOM 79 C CD . GLN 160 160 ? A 195.207 255.407 190.898 1 1 A GLN 0.730 1 ATOM 80 O OE1 . GLN 160 160 ? A 196.088 255.910 191.589 1 1 A GLN 0.730 1 ATOM 81 N NE2 . GLN 160 160 ? A 194.194 256.156 190.399 1 1 A GLN 0.730 1 ATOM 82 N N . GLU 161 161 ? A 198.904 251.088 191.058 1 1 A GLU 0.720 1 ATOM 83 C CA . GLU 161 161 ? A 200.222 250.479 190.927 1 1 A GLU 0.720 1 ATOM 84 C C . GLU 161 161 ? A 200.186 249.110 190.247 1 1 A GLU 0.720 1 ATOM 85 O O . GLU 161 161 ? A 200.980 248.811 189.358 1 1 A GLU 0.720 1 ATOM 86 C CB . GLU 161 161 ? A 200.893 250.309 192.308 1 1 A GLU 0.720 1 ATOM 87 C CG . GLU 161 161 ? A 201.220 251.632 193.040 1 1 A GLU 0.720 1 ATOM 88 C CD . GLU 161 161 ? A 201.819 251.403 194.432 1 1 A GLU 0.720 1 ATOM 89 O OE1 . GLU 161 161 ? A 201.659 250.284 194.987 1 1 A GLU 0.720 1 ATOM 90 O OE2 . GLU 161 161 ? A 202.419 252.369 194.967 1 1 A GLU 0.720 1 ATOM 91 N N . LEU 162 162 ? A 199.211 248.252 190.623 1 1 A LEU 0.700 1 ATOM 92 C CA . LEU 162 162 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #