data_SMR-33c229936631ba9f02dcc2a3f2b1f5d1_3 _entry.id SMR-33c229936631ba9f02dcc2a3f2b1f5d1_3 _struct.entry_id SMR-33c229936631ba9f02dcc2a3f2b1f5d1_3 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q7TSH4/ CP110_MOUSE, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa Estimated model accuracy of this model is 0.01, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q7TSH4' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 129365.759 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP CP110_MOUSE Q7TSH4 1 ;MEEYEEFCEKALGRAQEASLSTGSFLPAQAESVSLIRFHGVAVLSPLLTIEKRKKIQEEKQKALDVQSRK QANRKKALLTRVQEILENVQVRKAPNASDFDQWATETIYSNPEVTDLNVPVRVPNSLPSPTEHCTSVKLE KITGLLPVNNEDQQTPKRVGLPGDSEVSGSLRQCESPESRQAEDGAALRLSSASPQETIISDVLGKEEQD PSCLAEVTPDPYIMSLQNLMKRSKEYVERELSSRSLRNSLKRSVNETHSDRENDAAKASDCVKEKAPPMP IGRHCGSAIPDKPSLNKSNVLLQGASQASSMGTAGLASFSKIDLPAGAAPPAAPDAGSDFTVIPTFVTEN KVKSLKGPYAKLPSPEPSMSPTMHRRHSRSASACQILINNPVNACELSPKGKEEAVDRTAPAAAETTNES ETVPKSPTDLTGVCSSNVSATKITSESTREMVVGKPSQRQQALGAHLGNNVTVERSAMEGPFIADDRGAQ KVDGTCMAVPKLHELQPSSQCVSSQTLEDVCELKSASLLAKNSCNLQMELNKSYDVKHPSPLLTQTQTSR QQMDTPPVFRGNEQFVDNSFEKVKRRLDLDVDSLQKENCPYIITAGVAEQERDRLLERRYPKGFVHINKN KMLETSPKEGQELLKSKMLAFEEMRKRLEEQHAQQLSLLIAEQEREQEQLQKEIEEQEKMLKEKAVTTDV SDLNSALEWRQRTDSALLETMLSQVDSLQTSNNSGFITSALQYSFGSAGEAPFYLWGSLTSGVTRVSGTR PCGRAQAKWSQVFNPEIHAKFNKITAVAKGFLTRKLMQTDKLKQLRQTVKDTMEFIRSFQSEAPLKRGVV SAQDASLQERVLAQLRAALYGIHDIFFVMDAAERMSILHHDREARKEKLLRQMDKMKSPRVALSVATQKS LDRKKFMKVAEMGMPNKKFLLKQNPSETRVLQPNQGQNAPVHRLLSRQGTPKTSVKGVVQNRQKPSQSRV PNRAPVSGAYAGKTQRKRPNVATI ; 'Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1004 1 1004 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . CP110_MOUSE Q7TSH4 . 1 1004 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2003-10-01 C8D81F5F2FE213A8 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no r ;MEEYEEFCEKALGRAQEASLSTGSFLPAQAESVSLIRFHGVAVLSPLLTIEKRKKIQEEKQKALDVQSRK QANRKKALLTRVQEILENVQVRKAPNASDFDQWATETIYSNPEVTDLNVPVRVPNSLPSPTEHCTSVKLE KITGLLPVNNEDQQTPKRVGLPGDSEVSGSLRQCESPESRQAEDGAALRLSSASPQETIISDVLGKEEQD PSCLAEVTPDPYIMSLQNLMKRSKEYVERELSSRSLRNSLKRSVNETHSDRENDAAKASDCVKEKAPPMP IGRHCGSAIPDKPSLNKSNVLLQGASQASSMGTAGLASFSKIDLPAGAAPPAAPDAGSDFTVIPTFVTEN KVKSLKGPYAKLPSPEPSMSPTMHRRHSRSASACQILINNPVNACELSPKGKEEAVDRTAPAAAETTNES ETVPKSPTDLTGVCSSNVSATKITSESTREMVVGKPSQRQQALGAHLGNNVTVERSAMEGPFIADDRGAQ KVDGTCMAVPKLHELQPSSQCVSSQTLEDVCELKSASLLAKNSCNLQMELNKSYDVKHPSPLLTQTQTSR QQMDTPPVFRGNEQFVDNSFEKVKRRLDLDVDSLQKENCPYIITAGVAEQERDRLLERRYPKGFVHINKN KMLETSPKEGQELLKSKMLAFEEMRKRLEEQHAQQLSLLIAEQEREQEQLQKEIEEQEKMLKEKAVTTDV SDLNSALEWRQRTDSALLETMLSQVDSLQTSNNSGFITSALQYSFGSAGEAPFYLWGSLTSGVTRVSGTR PCGRAQAKWSQVFNPEIHAKFNKITAVAKGFLTRKLMQTDKLKQLRQTVKDTMEFIRSFQSEAPLKRGVV SAQDASLQERVLAQLRAALYGIHDIFFVMDAAERMSILHHDREARKEKLLRQMDKMKSPRVALSVATQKS LDRKKFMKVAEMGMPNKKFLLKQNPSETRVLQPNQGQNAPVHRLLSRQGTPKTSVKGVVQNRQKPSQSRV PNRAPVSGAYAGKTQRKRPNVATI ; ;MEEYEEFCEKALGRAQEASLSTGSFLPAQAESVSLIRFHGVAVLSPLLTIEKRKKIQEEKQKALDVQSRK QANRKKALLTRVQEILENVQVRKAPNASDFDQWATETIYSNPEVTDLNVPVRVPNSLPSPTEHCTSVKLE KITGLLPVNNEDQQTPKRVGLPGDSEVSGSLRQCESPESRQAEDGAALRLSSASPQETIISDVLGKEEQD PSCLAEVTPDPYIMSLQNLMKRSKEYVERELSSRSLRNSLKRSVNETHSDRENDAAKASDCVKEKAPPMP IGRHCGSAIPDKPSLNKSNVLLQGASQASSMGTAGLASFSKIDLPAGAAPPAAPDAGSDFTVIPTFVTEN KVKSLKGPYAKLPSPEPSMSPTMHRRHSRSASACQILINNPVNACELSPKGKEEAVDRTAPAAAETTNES ETVPKSPTDLTGVCSSNVSATKITSESTREMVVGKPSQRQQALGAHLGNNVTVERSAMEGPFIADDRGAQ KVDGTCMAVPKLHELQPSSQCVSSQTLEDVCELKSASLLAKNSCNLQMELNKSYDVKHPSPLLTQTQTSR QQMDTPPVFRGNEQFVDNSFEKVKRRLDLDVDSLQKENCPYIITAGVAEQERDRLLERRYPKGFVHINKN KMLETSPKEGQELLKSKMLAFEEMRKRLEEQHAQQLSLLIAEQEREQEQLQKEIEEQEKMLKEKAVTTDV SDLNSALEWRQRTDSALLETMLSQVDSLQTSNNSGFITSALQYSFGSAGEAPFYLWGSLTSGVTRVSGTR PCGRAQAKWSQVFNPEIHAKFNKITAVAKGFLTRKLMQTDKLKQLRQTVKDTMEFIRSFQSEAPLKRGVV SAQDASLQERVLAQLRAALYGIHDIFFVMDAAERMSILHHDREARKEKLLRQMDKMKSPRVALSVATQKS LDRKKFMKVAEMGMPNKKFLLKQNPSETRVLQPNQGQNAPVHRLLSRQGTPKTSVKGVVQNRQKPSQSRV PNRAPVSGAYAGKTQRKRPNVATI ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 GLU . 1 3 GLU . 1 4 TYR . 1 5 GLU . 1 6 GLU . 1 7 PHE . 1 8 CYS . 1 9 GLU . 1 10 LYS . 1 11 ALA . 1 12 LEU . 1 13 GLY . 1 14 ARG . 1 15 ALA . 1 16 GLN . 1 17 GLU . 1 18 ALA . 1 19 SER . 1 20 LEU . 1 21 SER . 1 22 THR . 1 23 GLY . 1 24 SER . 1 25 PHE . 1 26 LEU . 1 27 PRO . 1 28 ALA . 1 29 GLN . 1 30 ALA . 1 31 GLU . 1 32 SER . 1 33 VAL . 1 34 SER . 1 35 LEU . 1 36 ILE . 1 37 ARG . 1 38 PHE . 1 39 HIS . 1 40 GLY . 1 41 VAL . 1 42 ALA . 1 43 VAL . 1 44 LEU . 1 45 SER . 1 46 PRO . 1 47 LEU . 1 48 LEU . 1 49 THR . 1 50 ILE . 1 51 GLU . 1 52 LYS . 1 53 ARG . 1 54 LYS . 1 55 LYS . 1 56 ILE . 1 57 GLN . 1 58 GLU . 1 59 GLU . 1 60 LYS . 1 61 GLN . 1 62 LYS . 1 63 ALA . 1 64 LEU . 1 65 ASP . 1 66 VAL . 1 67 GLN . 1 68 SER . 1 69 ARG . 1 70 LYS . 1 71 GLN . 1 72 ALA . 1 73 ASN . 1 74 ARG . 1 75 LYS . 1 76 LYS . 1 77 ALA . 1 78 LEU . 1 79 LEU . 1 80 THR . 1 81 ARG . 1 82 VAL . 1 83 GLN . 1 84 GLU . 1 85 ILE . 1 86 LEU . 1 87 GLU . 1 88 ASN . 1 89 VAL . 1 90 GLN . 1 91 VAL . 1 92 ARG . 1 93 LYS . 1 94 ALA . 1 95 PRO . 1 96 ASN . 1 97 ALA . 1 98 SER . 1 99 ASP . 1 100 PHE . 1 101 ASP . 1 102 GLN . 1 103 TRP . 1 104 ALA . 1 105 THR . 1 106 GLU . 1 107 THR . 1 108 ILE . 1 109 TYR . 1 110 SER . 1 111 ASN . 1 112 PRO . 1 113 GLU . 1 114 VAL . 1 115 THR . 1 116 ASP . 1 117 LEU . 1 118 ASN . 1 119 VAL . 1 120 PRO . 1 121 VAL . 1 122 ARG . 1 123 VAL . 1 124 PRO . 1 125 ASN . 1 126 SER . 1 127 LEU . 1 128 PRO . 1 129 SER . 1 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A 1 834 PRO 834 ? ? ? r . A 1 835 LEU 835 ? ? ? r . A 1 836 LYS 836 ? ? ? r . A 1 837 ARG 837 ? ? ? r . A 1 838 GLY 838 ? ? ? r . A 1 839 VAL 839 ? ? ? r . A 1 840 VAL 840 ? ? ? r . A 1 841 SER 841 ? ? ? r . A 1 842 ALA 842 ? ? ? r . A 1 843 GLN 843 ? ? ? r . A 1 844 ASP 844 ? ? ? r . A 1 845 ALA 845 ? ? ? r . A 1 846 SER 846 ? ? ? r . A 1 847 LEU 847 ? ? ? r . A 1 848 GLN 848 ? ? ? r . A 1 849 GLU 849 ? ? ? r . A 1 850 ARG 850 ? ? ? r . A 1 851 VAL 851 ? ? ? r . A 1 852 LEU 852 ? ? ? r . A 1 853 ALA 853 ? ? ? r . A 1 854 GLN 854 ? ? ? r . A 1 855 LEU 855 ? ? ? r . A 1 856 ARG 856 ? ? ? r . A 1 857 ALA 857 ? ? ? r . A 1 858 ALA 858 ? ? ? r . A 1 859 LEU 859 ? ? ? r . A 1 860 TYR 860 ? ? ? r . A 1 861 GLY 861 ? ? ? r . A 1 862 ILE 862 ? ? ? r . A 1 863 HIS 863 ? ? ? r . A 1 864 ASP 864 ? ? ? r . A 1 865 ILE 865 ? ? ? r . A 1 866 PHE 866 ? ? ? r . A 1 867 PHE 867 ? ? ? r . A 1 868 VAL 868 ? ? ? r . A 1 869 MET 869 ? ? ? r . A 1 870 ASP 870 ? ? ? r . A 1 871 ALA 871 ? ? ? r . A 1 872 ALA 872 ? ? ? r . A 1 873 GLU 873 ? ? ? r . A 1 874 ARG 874 ? ? ? r . A 1 875 MET 875 ? ? ? r . A 1 876 SER 876 ? ? ? r . A 1 877 ILE 877 ? ? ? r . A 1 878 LEU 878 ? ? ? r . A 1 879 HIS 879 ? ? ? r . A 1 880 HIS 880 ? ? ? r . A 1 881 ASP 881 ? ? ? r . A 1 882 ARG 882 ? ? ? r . A 1 883 GLU 883 ? ? ? r . A 1 884 ALA 884 ? ? ? r . A 1 885 ARG 885 ? ? ? r . A 1 886 LYS 886 ? ? ? r . A 1 887 GLU 887 ? ? ? r . A 1 888 LYS 888 ? ? ? r . A 1 889 LEU 889 ? ? ? r . A 1 890 LEU 890 ? ? ? r . A 1 891 ARG 891 ? ? ? r . A 1 892 GLN 892 ? ? ? r . A 1 893 MET 893 ? ? ? r . A 1 894 ASP 894 ? ? ? r . A 1 895 LYS 895 ? ? ? r . A 1 896 MET 896 ? ? ? r . A 1 897 LYS 897 ? ? ? r . A 1 898 SER 898 ? ? ? r . A 1 899 PRO 899 ? ? ? r . A 1 900 ARG 900 ? ? ? r . A 1 901 VAL 901 ? ? ? r . A 1 902 ALA 902 ? ? ? r . A 1 903 LEU 903 ? ? ? r . A 1 904 SER 904 ? ? ? r . A 1 905 VAL 905 ? ? ? r . A 1 906 ALA 906 ? ? ? r . A 1 907 THR 907 ? ? ? r . A 1 908 GLN 908 ? ? ? r . A 1 909 LYS 909 ? ? ? r . A 1 910 SER 910 ? ? ? r . A 1 911 LEU 911 ? ? ? r . A 1 912 ASP 912 ? ? ? r . A 1 913 ARG 913 ? ? ? r . A 1 914 LYS 914 ? ? ? r . A 1 915 LYS 915 ? ? ? r . A 1 916 PHE 916 ? ? ? r . A 1 917 MET 917 ? ? ? r . A 1 918 LYS 918 ? ? ? r . A 1 919 VAL 919 ? ? ? r . A 1 920 ALA 920 ? ? ? r . A 1 921 GLU 921 ? ? ? r . A 1 922 MET 922 ? ? ? r . A 1 923 GLY 923 ? ? ? r . A 1 924 MET 924 ? ? ? r . A 1 925 PRO 925 ? ? ? r . A 1 926 ASN 926 ? ? ? r . A 1 927 LYS 927 ? ? ? r . A 1 928 LYS 928 ? ? ? r . A 1 929 PHE 929 ? ? ? r . A 1 930 LEU 930 ? ? ? r . A 1 931 LEU 931 ? ? ? r . A 1 932 LYS 932 ? ? ? r . A 1 933 GLN 933 ? ? ? r . A 1 934 ASN 934 ? ? ? r . A 1 935 PRO 935 ? ? ? r . A 1 936 SER 936 ? ? ? r . A 1 937 GLU 937 ? ? ? r . A 1 938 THR 938 ? ? ? r . A 1 939 ARG 939 ? ? ? r . A 1 940 VAL 940 ? ? ? r . A 1 941 LEU 941 ? ? ? r . A 1 942 GLN 942 ? ? ? r . A 1 943 PRO 943 ? ? ? r . A 1 944 ASN 944 ? ? ? r . A 1 945 GLN 945 ? ? ? r . A 1 946 GLY 946 ? ? ? r . A 1 947 GLN 947 ? ? ? r . A 1 948 ASN 948 ? ? ? r . A 1 949 ALA 949 ? ? ? r . A 1 950 PRO 950 ? ? ? r . A 1 951 VAL 951 ? ? ? r . A 1 952 HIS 952 ? ? ? r . A 1 953 ARG 953 ? ? ? r . A 1 954 LEU 954 ? ? ? r . A 1 955 LEU 955 ? ? ? r . A 1 956 SER 956 ? ? ? r . A 1 957 ARG 957 ? ? ? r . A 1 958 GLN 958 ? ? ? r . A 1 959 GLY 959 ? ? ? r . A 1 960 THR 960 ? ? ? r . A 1 961 PRO 961 ? ? ? r . A 1 962 LYS 962 ? ? ? r . A 1 963 THR 963 ? ? ? r . A 1 964 SER 964 ? ? ? r . A 1 965 VAL 965 ? ? ? r . A 1 966 LYS 966 ? ? ? r . A 1 967 GLY 967 ? ? ? r . A 1 968 VAL 968 ? ? ? r . A 1 969 VAL 969 ? ? ? r . A 1 970 GLN 970 ? ? ? r . A 1 971 ASN 971 ? ? ? r . A 1 972 ARG 972 ? ? ? r . A 1 973 GLN 973 ? ? ? r . A 1 974 LYS 974 ? ? ? r . A 1 975 PRO 975 ? ? ? r . A 1 976 SER 976 ? ? ? r . A 1 977 GLN 977 ? ? ? r . A 1 978 SER 978 ? ? ? r . A 1 979 ARG 979 ? ? ? r . A 1 980 VAL 980 ? ? ? r . A 1 981 PRO 981 ? ? ? r . A 1 982 ASN 982 ? ? ? r . A 1 983 ARG 983 ? ? ? r . A 1 984 ALA 984 ? ? ? r . A 1 985 PRO 985 ? ? ? r . A 1 986 VAL 986 ? ? ? r . A 1 987 SER 987 ? ? ? r . A 1 988 GLY 988 ? ? ? r . A 1 989 ALA 989 ? ? ? r . A 1 990 TYR 990 ? ? ? r . A 1 991 ALA 991 ? ? ? r . A 1 992 GLY 992 ? ? ? r . A 1 993 LYS 993 ? ? ? r . A 1 994 THR 994 ? ? ? r . A 1 995 GLN 995 ? ? ? r . A 1 996 ARG 996 ? ? ? r . A 1 997 LYS 997 ? ? ? r . A 1 998 ARG 998 ? ? ? r . A 1 999 PRO 999 ? ? ? r . A 1 1000 ASN 1000 ? ? ? r . A 1 1001 VAL 1001 ? ? ? r . A 1 1002 ALA 1002 ? ? ? r . A 1 1003 THR 1003 ? ? ? r . A 1 1004 ILE 1004 ? ? ? r . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Calcium load-activated calcium channel {PDB ID=7tut, label_asym_id=BB, auth_asym_id=8, SMTL ID=7tut.1.r}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 7tut, label_asym_id=BB' 'target-template alignment' . 4 'model 3' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-25 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-20 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A BB 54 1 8 # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MSTMFADTLLIVFISVCTALLAEGITWVLVYRTDKYKRLKAEVEKQSKKLEKKKETITESAGRQQKKKIE RQEEKLKNNNRDLSMVRMKSMFAIGFCFTALMGMFNSIFDGRVVAKLPFTPLSYIQGLSHRNLLGDDTTD CSFIFLYILCTMSIRQNIQKILGLAPSRAATKQAGGFLGPPPPSGKFS ; ;MSTMFADTLLIVFISVCTALLAEGITWVLVYRTDKYKRLKAEVEKQSKKLEKKKETITESAGRQQKKKIE RQEEKLKNNNRDLSMVRMKSMFAIGFCFTALMGMFNSIFDGRVVAKLPFTPLSYIQGLSHRNLLGDDTTD CSFIFLYILCTMSIRQNIQKILGLAPSRAATKQAGGFLGPPPPSGKFS ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 34 82 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 7tut 2024-06-12 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1004 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1004 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 57.000 14.286 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MEEYEEFCEKALGRAQEASLSTGSFLPAQAESVSLIRFHGVAVLSPLLTIEKRKKIQEEKQKALDVQSRKQANRKKALLTRVQEILENVQVRKAPNASDFDQWATETIYSNPEVTDLNVPVRVPNSLPSPTEHCTSVKLEKITGLLPVNNEDQQTPKRVGLPGDSEVSGSLRQCESPESRQAEDGAALRLSSASPQETIISDVLGKEEQDPSCLAEVTPDPYIMSLQNLMKRSKEYVERELSSRSLRNSLKRSVNETHSDRENDAAKASDCVKEKAPPMPIGRHCGSAIPDKPSLNKSNVLLQGASQASSMGTAGLASFSKIDLPAGAAPPAAPDAGSDFTVIPTFVTENKVKSLKGPYAKLPSPEPSMSPTMHRRHSRSASACQILINNPVNACELSPKGKEEAVDRTAPAAAETTNESETVPKSPTDLTGVCSSNVSATKITSESTREMVVGKPSQRQQALGAHLGNNVTVERSAMEGPFIADDRGAQKVDGTCMAVPKLHELQPSSQCVSSQTLEDVCELKSASLLAKNSCNLQMELNKSYDVKHPSPLLTQTQTSRQQMDTPPVFRGNEQFVDNSFEKVKRRLDLDVDSLQKENCPYIITAGVAEQERDRLLERRYPKGFVHINKNKMLETSPKEGQELLKSKMLAFEEMRKRLEEQHAQQLSLLIAEQEREQEQLQKEIEEQEKMLKEKAVTTDVSDLNSALEWRQRTDSALLETMLSQVDSLQTSNNSGFITSALQYSFGSAGEAPFYLWGSLTSGVTRVSGTRPCGRAQAKWSQVFNPEIHAKFNKITAVAKGFLTRKLMQTDKLKQLRQTVKDTMEFIRSFQSEAPLKRGVVSAQDASLQERVLAQLRAALYGIHDIFFVMDAAERMSILHHDREARKEKLLRQMDKMKSPRVALSVATQKSLDRKKFMKVAEMGMPNKKFLLKQNPSETRVLQPNQGQNAPVHRLLSRQGTPKTSVKGVVQNRQKPSQSRVPNRAPVSGAYAGKTQRKRPNVATI 2 1 2 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DKYKRLKAEVEKQSKKLEKKKETITESAGRQQKKKIERQEEKLKNNNRD-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 7tut.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 3' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . GLU 642 642 ? A 388.231 240.017 330.750 1 1 r GLU 0.310 1 ATOM 2 C CA . GLU 642 642 ? A 387.218 239.821 329.659 1 1 r GLU 0.310 1 ATOM 3 C C . GLU 642 642 ? A 387.142 240.901 328.609 1 1 r GLU 0.310 1 ATOM 4 O O . GLU 642 642 ? A 387.131 240.581 327.429 1 1 r GLU 0.310 1 ATOM 5 C CB . GLU 642 642 ? A 385.880 239.549 330.319 1 1 r GLU 0.310 1 ATOM 6 C CG . GLU 642 642 ? A 385.896 238.213 331.089 1 1 r GLU 0.310 1 ATOM 7 C CD . GLU 642 642 ? A 384.563 238.006 331.801 1 1 r GLU 0.310 1 ATOM 8 O OE1 . GLU 642 642 ? A 383.744 238.955 331.792 1 1 r GLU 0.310 1 ATOM 9 O OE2 . GLU 642 642 ? A 384.408 236.900 332.365 1 1 r GLU 0.310 1 ATOM 10 N N . LEU 643 643 ? A 387.202 242.197 329.001 1 1 r LEU 0.320 1 ATOM 11 C CA . LEU 643 643 ? A 387.242 243.322 328.081 1 1 r LEU 0.320 1 ATOM 12 C C . LEU 643 643 ? A 388.362 243.273 327.069 1 1 r LEU 0.320 1 ATOM 13 O O . LEU 643 643 ? A 388.163 243.579 325.911 1 1 r LEU 0.320 1 ATOM 14 C CB . LEU 643 643 ? A 387.409 244.644 328.860 1 1 r LEU 0.320 1 ATOM 15 C CG . LEU 643 643 ? A 386.219 245.042 329.747 1 1 r LEU 0.320 1 ATOM 16 C CD1 . LEU 643 643 ? A 386.599 246.261 330.603 1 1 r LEU 0.320 1 ATOM 17 C CD2 . LEU 643 643 ? A 384.964 245.343 328.913 1 1 r LEU 0.320 1 ATOM 18 N N . LEU 644 644 ? A 389.584 242.873 327.473 1 1 r LEU 0.510 1 ATOM 19 C CA . LEU 644 644 ? A 390.631 242.668 326.499 1 1 r LEU 0.510 1 ATOM 20 C C . LEU 644 644 ? A 390.362 241.536 325.500 1 1 r LEU 0.510 1 ATOM 21 O O . LEU 644 644 ? A 390.444 241.731 324.296 1 1 r LEU 0.510 1 ATOM 22 C CB . LEU 644 644 ? A 391.957 242.437 327.242 1 1 r LEU 0.510 1 ATOM 23 C CG . LEU 644 644 ? A 393.163 242.263 326.307 1 1 r LEU 0.510 1 ATOM 24 C CD1 . LEU 644 644 ? A 393.387 243.482 325.394 1 1 r LEU 0.510 1 ATOM 25 C CD2 . LEU 644 644 ? A 394.424 241.923 327.109 1 1 r LEU 0.510 1 ATOM 26 N N . LYS 645 645 ? A 389.952 240.337 325.982 1 1 r LYS 0.550 1 ATOM 27 C CA . LYS 645 645 ? 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'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.573 2 1 3 0.010 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 642 GLU 1 0.310 2 1 A 643 LEU 1 0.320 3 1 A 644 LEU 1 0.510 4 1 A 645 LYS 1 0.550 5 1 A 646 SER 1 0.590 6 1 A 647 LYS 1 0.580 7 1 A 648 MET 1 0.580 8 1 A 649 LEU 1 0.630 9 1 A 650 ALA 1 0.700 10 1 A 651 PHE 1 0.610 11 1 A 652 GLU 1 0.670 12 1 A 653 GLU 1 0.680 13 1 A 654 MET 1 0.650 14 1 A 655 ARG 1 0.630 15 1 A 656 LYS 1 0.710 16 1 A 657 ARG 1 0.630 17 1 A 658 LEU 1 0.680 18 1 A 659 GLU 1 0.670 19 1 A 660 GLU 1 0.640 20 1 A 661 GLN 1 0.620 21 1 A 662 HIS 1 0.540 22 1 A 663 ALA 1 0.590 23 1 A 664 GLN 1 0.480 24 1 A 665 GLN 1 0.440 25 1 A 666 LEU 1 0.310 26 1 A 667 SER 1 0.280 27 1 A 668 LEU 1 0.240 28 1 A 669 LEU 1 0.330 29 1 A 670 ILE 1 0.390 30 1 A 671 ALA 1 0.570 31 1 A 672 GLU 1 0.550 32 1 A 673 GLN 1 0.550 33 1 A 674 GLU 1 0.570 34 1 A 675 ARG 1 0.580 35 1 A 676 GLU 1 0.640 36 1 A 677 GLN 1 0.650 37 1 A 678 GLU 1 0.680 38 1 A 679 GLN 1 0.690 39 1 A 680 LEU 1 0.700 40 1 A 681 GLN 1 0.700 41 1 A 682 LYS 1 0.720 42 1 A 683 GLU 1 0.700 43 1 A 684 ILE 1 0.680 44 1 A 685 GLU 1 0.690 45 1 A 686 GLU 1 0.660 46 1 A 687 GLN 1 0.620 47 1 A 688 GLU 1 0.620 48 1 A 689 LYS 1 0.530 49 1 A 690 MET 1 0.400 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #