data_SMR-6f06704cb7cdd91490c9c84cf6a9520b_1 _entry.id SMR-6f06704cb7cdd91490c9c84cf6a9520b_1 _struct.entry_id SMR-6f06704cb7cdd91490c9c84cf6a9520b_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled homo-dimer covers following UniProtKB entries: - P36956 (isoform 2)/ SRBP1_HUMAN, Sterol regulatory element-binding protein 1 Estimated model accuracy of this model is 0.035, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P36956 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 5 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 132951.889 2 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP SRBP1_HUMAN P36956 1 ;MDEPPFSEAALEQALGEPCDLDAALLTDIEDMLQLINNQDSDFPGLFDPPYAGSGAGGTDPASPDTSSPG SLSPPPATLSSSLEAFLSGPQAAPSPLSPPQPAPTPLKMYPSMPAFSPGPGIKEESVPLSILQTPTPQPL PGALLPQSFPAPAPPQFSSTPVLGYPSPPGGFSTGSPPGNTQQPLPGLPLASPPGVPPVSLHTQVQSVVP QQLLTVTAAPTAAPVTTTVTSQIQQVPVLLQPHFIKADSLLLTAMKTDGATVKAAGLSPLVSGTTVQTGP LPTLVSGGTILATVPLVVDAEKLPINRLAAGSKAPASAQSRGEKRTAHNAIEKRYRSSINDKIIELKDLV VGTEAKLNKSAVLRKAIDYIRFLQHSNQKLKQENLSLRTAVHKSKSLKDLVSACGSGGNTDVLMEGVKTE VEDTLTPPPSDAGSPFQSSPLSLGSRGSGSGGSGSDSEPDSPVFEDSKAKPEQRPSLHSRGMLDRSRLAL CTLVFLCLSCNPLASLLGARGLPSPSDTTSVYHSPGRNVLGTESRDGPGWAQWLLPPVVWLLNGLLVLVS LVLLFVYGEPVTRPHSGPAVYFWRHRKQADLDLARGDFAQAAQQLWLALRALGRPLPTSHLDLACSLLWN LIRHLLQRLWVGRWLAGRAGGLQQDCALRVDASASARDAALVYHKLHQLHTMGKHTGGHLTATNLALSAL NLAECAGDAVSVATLAEIYVAAALRVKTSLPRALHFLTRFFLSSARQACLAQSGSVPPAMQWLCHPVGHR FFVDGDWSVLSTPWESLYSLAGNPVDPLAQVTQLFREHLLERALNCVTQPNPSPGSADGDKEFSDALGYL QLLNSCSDAAGAPAYSFSISSSMATTTGVDPVAKWWASLTAVVIHWLRRDEEAAERLCPLVEHLPRVLQE SERPLPRAALHSFKAARALLGCAKAESGPASLTICEKASGYLQDSLATTPASSSIDKAVQLFLCDLLLVV RTSLWRQQQPPAPAPAAQGTSSRPQASALELRGFQRDLSSLRRLAQSFRPAMRRLMDVLTSESAWALPQH LGKGFPSPSGHKVPGWHGRMD ; 'Sterol regulatory element-binding protein 1' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1071 1 1071 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . SRBP1_HUMAN P36956 P36956-2 1 1071 9606 'Homo sapiens (Human)' 2008-02-05 B71B6010CDB8D1ED # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A,B ;MDEPPFSEAALEQALGEPCDLDAALLTDIEDMLQLINNQDSDFPGLFDPPYAGSGAGGTDPASPDTSSPG SLSPPPATLSSSLEAFLSGPQAAPSPLSPPQPAPTPLKMYPSMPAFSPGPGIKEESVPLSILQTPTPQPL PGALLPQSFPAPAPPQFSSTPVLGYPSPPGGFSTGSPPGNTQQPLPGLPLASPPGVPPVSLHTQVQSVVP QQLLTVTAAPTAAPVTTTVTSQIQQVPVLLQPHFIKADSLLLTAMKTDGATVKAAGLSPLVSGTTVQTGP LPTLVSGGTILATVPLVVDAEKLPINRLAAGSKAPASAQSRGEKRTAHNAIEKRYRSSINDKIIELKDLV VGTEAKLNKSAVLRKAIDYIRFLQHSNQKLKQENLSLRTAVHKSKSLKDLVSACGSGGNTDVLMEGVKTE VEDTLTPPPSDAGSPFQSSPLSLGSRGSGSGGSGSDSEPDSPVFEDSKAKPEQRPSLHSRGMLDRSRLAL CTLVFLCLSCNPLASLLGARGLPSPSDTTSVYHSPGRNVLGTESRDGPGWAQWLLPPVVWLLNGLLVLVS LVLLFVYGEPVTRPHSGPAVYFWRHRKQADLDLARGDFAQAAQQLWLALRALGRPLPTSHLDLACSLLWN LIRHLLQRLWVGRWLAGRAGGLQQDCALRVDASASARDAALVYHKLHQLHTMGKHTGGHLTATNLALSAL NLAECAGDAVSVATLAEIYVAAALRVKTSLPRALHFLTRFFLSSARQACLAQSGSVPPAMQWLCHPVGHR FFVDGDWSVLSTPWESLYSLAGNPVDPLAQVTQLFREHLLERALNCVTQPNPSPGSADGDKEFSDALGYL QLLNSCSDAAGAPAYSFSISSSMATTTGVDPVAKWWASLTAVVIHWLRRDEEAAERLCPLVEHLPRVLQE SERPLPRAALHSFKAARALLGCAKAESGPASLTICEKASGYLQDSLATTPASSSIDKAVQLFLCDLLLVV RTSLWRQQQPPAPAPAAQGTSSRPQASALELRGFQRDLSSLRRLAQSFRPAMRRLMDVLTSESAWALPQH LGKGFPSPSGHKVPGWHGRMD ; ;MDEPPFSEAALEQALGEPCDLDAALLTDIEDMLQLINNQDSDFPGLFDPPYAGSGAGGTDPASPDTSSPG SLSPPPATLSSSLEAFLSGPQAAPSPLSPPQPAPTPLKMYPSMPAFSPGPGIKEESVPLSILQTPTPQPL PGALLPQSFPAPAPPQFSSTPVLGYPSPPGGFSTGSPPGNTQQPLPGLPLASPPGVPPVSLHTQVQSVVP QQLLTVTAAPTAAPVTTTVTSQIQQVPVLLQPHFIKADSLLLTAMKTDGATVKAAGLSPLVSGTTVQTGP LPTLVSGGTILATVPLVVDAEKLPINRLAAGSKAPASAQSRGEKRTAHNAIEKRYRSSINDKIIELKDLV VGTEAKLNKSAVLRKAIDYIRFLQHSNQKLKQENLSLRTAVHKSKSLKDLVSACGSGGNTDVLMEGVKTE VEDTLTPPPSDAGSPFQSSPLSLGSRGSGSGGSGSDSEPDSPVFEDSKAKPEQRPSLHSRGMLDRSRLAL CTLVFLCLSCNPLASLLGARGLPSPSDTTSVYHSPGRNVLGTESRDGPGWAQWLLPPVVWLLNGLLVLVS LVLLFVYGEPVTRPHSGPAVYFWRHRKQADLDLARGDFAQAAQQLWLALRALGRPLPTSHLDLACSLLWN LIRHLLQRLWVGRWLAGRAGGLQQDCALRVDASASARDAALVYHKLHQLHTMGKHTGGHLTATNLALSAL NLAECAGDAVSVATLAEIYVAAALRVKTSLPRALHFLTRFFLSSARQACLAQSGSVPPAMQWLCHPVGHR FFVDGDWSVLSTPWESLYSLAGNPVDPLAQVTQLFREHLLERALNCVTQPNPSPGSADGDKEFSDALGYL QLLNSCSDAAGAPAYSFSISSSMATTTGVDPVAKWWASLTAVVIHWLRRDEEAAERLCPLVEHLPRVLQE SERPLPRAALHSFKAARALLGCAKAESGPASLTICEKASGYLQDSLATTPASSSIDKAVQLFLCDLLLVV RTSLWRQQQPPAPAPAAQGTSSRPQASALELRGFQRDLSSLRRLAQSFRPAMRRLMDVLTSESAWALPQH LGKGFPSPSGHKVPGWHGRMD ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 ASP . 1 3 GLU . 1 4 PRO . 1 5 PRO . 1 6 PHE . 1 7 SER . 1 8 GLU . 1 9 ALA . 1 10 ALA . 1 11 LEU . 1 12 GLU . 1 13 GLN . 1 14 ALA . 1 15 LEU . 1 16 GLY . 1 17 GLU . 1 18 PRO . 1 19 CYS . 1 20 ASP . 1 21 LEU . 1 22 ASP . 1 23 ALA . 1 24 ALA . 1 25 LEU . 1 26 LEU . 1 27 THR . 1 28 ASP . 1 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B 1 839 TYR 839 ? ? ? B . B 1 840 LEU 840 ? ? ? B . B 1 841 GLN 841 ? ? ? B . B 1 842 LEU 842 ? ? ? B . B 1 843 LEU 843 ? ? ? B . B 1 844 ASN 844 ? ? ? B . B 1 845 SER 845 ? ? ? B . B 1 846 CYS 846 ? ? ? B . B 1 847 SER 847 ? ? ? B . B 1 848 ASP 848 ? ? ? B . B 1 849 ALA 849 ? ? ? B . B 1 850 ALA 850 ? ? ? B . B 1 851 GLY 851 ? ? ? B . B 1 852 ALA 852 ? ? ? B . B 1 853 PRO 853 ? ? ? B . B 1 854 ALA 854 ? ? ? B . B 1 855 TYR 855 ? ? ? B . B 1 856 SER 856 ? ? ? B . B 1 857 PHE 857 ? ? ? B . B 1 858 SER 858 ? ? ? B . B 1 859 ILE 859 ? ? ? B . B 1 860 SER 860 ? ? ? B . B 1 861 SER 861 ? ? ? B . B 1 862 SER 862 ? ? ? B . B 1 863 MET 863 ? ? ? B . B 1 864 ALA 864 ? ? ? B . B 1 865 THR 865 ? ? ? B . B 1 866 THR 866 ? ? ? B . B 1 867 THR 867 ? ? ? B . B 1 868 GLY 868 ? ? ? B . B 1 869 VAL 869 ? ? ? B . B 1 870 ASP 870 ? ? ? B . B 1 871 PRO 871 ? ? ? B . B 1 872 VAL 872 ? ? ? B . B 1 873 ALA 873 ? ? ? B . B 1 874 LYS 874 ? ? ? B . B 1 875 TRP 875 ? ? ? B . B 1 876 TRP 876 ? ? ? B . B 1 877 ALA 877 ? ? ? B . B 1 878 SER 878 ? ? ? B . B 1 879 LEU 879 ? ? ? B . B 1 880 THR 880 ? ? ? B . B 1 881 ALA 881 ? ? ? B . B 1 882 VAL 882 ? ? ? B . B 1 883 VAL 883 ? ? ? B . B 1 884 ILE 884 ? ? ? B . B 1 885 HIS 885 ? ? ? B . B 1 886 TRP 886 ? ? ? B . B 1 887 LEU 887 ? ? ? B . B 1 888 ARG 888 ? ? ? B . B 1 889 ARG 889 ? ? ? B . B 1 890 ASP 890 ? ? ? B . B 1 891 GLU 891 ? ? ? B . B 1 892 GLU 892 ? ? ? B . B 1 893 ALA 893 ? ? ? B . B 1 894 ALA 894 ? ? ? B . B 1 895 GLU 895 ? ? ? B . B 1 896 ARG 896 ? ? ? B . B 1 897 LEU 897 ? ? ? B . B 1 898 CYS 898 ? ? ? B . B 1 899 PRO 899 ? ? ? B . B 1 900 LEU 900 ? ? ? B . B 1 901 VAL 901 ? ? ? B . B 1 902 GLU 902 ? ? ? B . B 1 903 HIS 903 ? ? ? B . B 1 904 LEU 904 ? ? ? B . B 1 905 PRO 905 ? ? ? B . B 1 906 ARG 906 ? ? ? B . B 1 907 VAL 907 ? ? ? B . B 1 908 LEU 908 ? ? ? B . B 1 909 GLN 909 ? ? ? B . B 1 910 GLU 910 ? ? ? B . B 1 911 SER 911 ? ? ? B . B 1 912 GLU 912 ? ? ? B . B 1 913 ARG 913 ? ? ? B . B 1 914 PRO 914 ? ? ? B . B 1 915 LEU 915 ? ? ? B . B 1 916 PRO 916 ? ? ? B . B 1 917 ARG 917 ? ? ? B . B 1 918 ALA 918 ? ? ? B . B 1 919 ALA 919 ? ? ? B . B 1 920 LEU 920 ? ? ? B . B 1 921 HIS 921 ? ? ? B . B 1 922 SER 922 ? ? ? B . B 1 923 PHE 923 ? ? ? B . B 1 924 LYS 924 ? ? ? B . B 1 925 ALA 925 ? ? ? B . B 1 926 ALA 926 ? ? ? B . B 1 927 ARG 927 ? ? ? B . B 1 928 ALA 928 ? ? ? B . B 1 929 LEU 929 ? ? ? B . B 1 930 LEU 930 ? ? ? B . B 1 931 GLY 931 ? ? ? B . B 1 932 CYS 932 ? ? ? B . B 1 933 ALA 933 ? ? ? B . B 1 934 LYS 934 ? ? ? B . B 1 935 ALA 935 ? ? ? B . B 1 936 GLU 936 ? ? ? B . B 1 937 SER 937 ? ? ? B . B 1 938 GLY 938 ? ? ? B . B 1 939 PRO 939 ? ? ? B . B 1 940 ALA 940 ? ? ? B . B 1 941 SER 941 ? ? ? B . B 1 942 LEU 942 ? ? ? B . B 1 943 THR 943 ? ? ? B . B 1 944 ILE 944 ? ? ? B . B 1 945 CYS 945 ? ? ? B . B 1 946 GLU 946 ? ? ? B . B 1 947 LYS 947 ? ? ? B . B 1 948 ALA 948 ? ? ? B . B 1 949 SER 949 ? ? ? B . B 1 950 GLY 950 ? ? ? B . B 1 951 TYR 951 ? ? ? B . B 1 952 LEU 952 ? ? ? B . B 1 953 GLN 953 ? ? ? B . B 1 954 ASP 954 ? ? ? B . B 1 955 SER 955 ? ? ? B . B 1 956 LEU 956 ? ? ? B . B 1 957 ALA 957 ? ? ? B . B 1 958 THR 958 ? ? ? B . B 1 959 THR 959 ? ? ? B . B 1 960 PRO 960 ? ? ? B . B 1 961 ALA 961 ? ? ? B . B 1 962 SER 962 ? ? ? B . B 1 963 SER 963 ? ? ? B . B 1 964 SER 964 ? ? ? B . B 1 965 ILE 965 ? ? ? B . B 1 966 ASP 966 ? ? ? B . B 1 967 LYS 967 ? ? ? B . B 1 968 ALA 968 ? ? ? B . B 1 969 VAL 969 ? ? ? B . B 1 970 GLN 970 ? ? ? B . B 1 971 LEU 971 ? ? ? B . B 1 972 PHE 972 ? ? ? B . B 1 973 LEU 973 ? ? ? B . B 1 974 CYS 974 ? ? ? B . B 1 975 ASP 975 ? ? ? B . B 1 976 LEU 976 ? ? ? B . B 1 977 LEU 977 ? ? ? B . B 1 978 LEU 978 ? ? ? B . B 1 979 VAL 979 ? ? ? B . B 1 980 VAL 980 ? ? ? B . B 1 981 ARG 981 ? ? ? B . B 1 982 THR 982 ? ? ? B . B 1 983 SER 983 ? ? ? B . B 1 984 LEU 984 ? ? ? B . B 1 985 TRP 985 ? ? ? B . B 1 986 ARG 986 ? ? ? B . B 1 987 GLN 987 ? ? ? B . B 1 988 GLN 988 ? ? ? B . B 1 989 GLN 989 ? ? ? B . B 1 990 PRO 990 ? ? ? B . B 1 991 PRO 991 ? ? ? B . B 1 992 ALA 992 ? ? ? B . B 1 993 PRO 993 ? ? ? B . B 1 994 ALA 994 ? ? ? B . B 1 995 PRO 995 ? ? ? B . B 1 996 ALA 996 ? ? ? B . B 1 997 ALA 997 ? ? ? B . B 1 998 GLN 998 ? ? ? B . B 1 999 GLY 999 ? ? ? B . B 1 1000 THR 1000 ? ? ? B . B 1 1001 SER 1001 ? ? ? B . B 1 1002 SER 1002 ? ? ? B . B 1 1003 ARG 1003 ? ? ? B . B 1 1004 PRO 1004 ? ? ? B . B 1 1005 GLN 1005 ? ? ? B . B 1 1006 ALA 1006 ? ? ? B . B 1 1007 SER 1007 ? ? ? B . B 1 1008 ALA 1008 ? ? ? B . B 1 1009 LEU 1009 ? ? ? B . B 1 1010 GLU 1010 ? ? ? B . B 1 1011 LEU 1011 ? ? ? B . B 1 1012 ARG 1012 ? ? ? B . B 1 1013 GLY 1013 ? ? ? B . B 1 1014 PHE 1014 ? ? ? B . B 1 1015 GLN 1015 ? ? ? B . B 1 1016 ARG 1016 ? ? ? B . B 1 1017 ASP 1017 ? ? ? B . B 1 1018 LEU 1018 ? ? ? B . B 1 1019 SER 1019 ? ? ? B . B 1 1020 SER 1020 ? ? ? B . B 1 1021 LEU 1021 ? ? ? B . B 1 1022 ARG 1022 ? ? ? B . B 1 1023 ARG 1023 ? ? ? B . B 1 1024 LEU 1024 ? ? ? B . B 1 1025 ALA 1025 ? ? ? B . B 1 1026 GLN 1026 ? ? ? B . B 1 1027 SER 1027 ? ? ? B . B 1 1028 PHE 1028 ? ? ? B . B 1 1029 ARG 1029 ? ? ? B . B 1 1030 PRO 1030 ? ? ? B . B 1 1031 ALA 1031 ? ? ? B . B 1 1032 MET 1032 ? ? ? B . B 1 1033 ARG 1033 ? ? ? B . B 1 1034 ARG 1034 ? ? ? B . B 1 1035 LEU 1035 ? ? ? B . B 1 1036 MET 1036 ? ? ? B . B 1 1037 ASP 1037 ? ? ? B . B 1 1038 VAL 1038 ? ? ? B . B 1 1039 LEU 1039 ? ? ? B . B 1 1040 THR 1040 ? ? ? B . B 1 1041 SER 1041 ? ? ? B . B 1 1042 GLU 1042 ? ? ? B . B 1 1043 SER 1043 ? ? ? B . B 1 1044 ALA 1044 ? ? ? B . B 1 1045 TRP 1045 ? ? ? B . B 1 1046 ALA 1046 ? ? ? B . B 1 1047 LEU 1047 ? ? ? B . B 1 1048 PRO 1048 ? ? ? B . B 1 1049 GLN 1049 ? ? ? B . B 1 1050 HIS 1050 ? ? ? B . B 1 1051 LEU 1051 ? ? ? B . B 1 1052 GLY 1052 ? ? ? B . B 1 1053 LYS 1053 ? ? ? B . B 1 1054 GLY 1054 ? ? ? B . B 1 1055 PHE 1055 ? ? ? B . B 1 1056 PRO 1056 ? ? ? B . B 1 1057 SER 1057 ? ? ? B . B 1 1058 PRO 1058 ? ? ? B . B 1 1059 SER 1059 ? ? ? B . B 1 1060 GLY 1060 ? ? ? B . B 1 1061 HIS 1061 ? ? ? B . B 1 1062 LYS 1062 ? ? ? B . B 1 1063 VAL 1063 ? ? ? B . B 1 1064 PRO 1064 ? ? ? B . B 1 1065 GLY 1065 ? ? ? B . B 1 1066 TRP 1066 ? ? ? B . B 1 1067 HIS 1067 ? ? ? B . B 1 1068 GLY 1068 ? ? ? B . B 1 1069 ARG 1069 ? ? ? B . B 1 1070 MET 1070 ? ? ? B . B 1 1071 ASP 1071 ? ? ? B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'MICROPHTHALMIA-ASSOCIATED TRANSCRIPTION FACTOR {PDB ID=4atk, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=4atk.1.A}' 'template structure' . 2 'MICROPHTHALMIA-ASSOCIATED TRANSCRIPTION FACTOR {PDB ID=4atk, label_asym_id=B, auth_asym_id=B, SMTL ID=4atk.1.B}' 'template structure' . 3 . target . 4 'Target-template alignment by BLAST to 4atk, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 5 'Target-template alignment by BLAST to 4atk, label_asym_id=B' 'target-template alignment' . 6 'model 1' 'model coordinates' . 7 SMTL 'reference database' . 8 PDB 'reference database' . 9 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 3 2 1 7 3 1 8 4 2 9 5 3 3 6 3 1 7 3 2 8 3 4 9 3 5 10 4 1 11 4 2 12 4 4 13 4 5 14 5 6 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 7 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-25 8 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-20 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 3 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . B 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A 2 2 'reference database' polymer 1 2 B B 1 1 B # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;ANIKRELTACIFPTESEARALAKERQKKDNHNLIERRRRFNINDRIKELGTLIPKSNDPDMRWNKGTILK ASVDYIRKLQREQQRAKDLENRQKKLEHANRHLLLRVQELEMQARAHG ; ;ANIKRELTACIFPTESEARALAKERQKKDNHNLIERRRRFNINDRIKELGTLIPKSNDPDMRWNKGTILK ASVDYIRKLQREQQRAKDLENRQKKLEHANRHLLLRVQELEMQARAHG ; 2 ;ANIKRELTACIFPTESEARALAKERQKKDNHNLIERRRRFNINDRIKELGTLIPKSNDPDMRWNKGTILK ASVDYIRKLQREQQRAKDLENRQKKLEHANRHLLLRVQELEMQARAHG ; ;ANIKRELTACIFPTESEARALAKERQKKDNHNLIERRRRFNINDRIKELGTLIPKSNDPDMRWNKGTILK ASVDYIRKLQREQQRAKDLENRQKKLEHANRHLLLRVQELEMQARAHG ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 16 103 2 2 16 103 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 4atk 2023-12-20 2 PDB . 4atk 2023-12-20 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1071 2 2 B 1 1071 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 4 1 1074 'target-template pairwise alignment' local 2 5 1 1074 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'BLAST e-value' . 8.83e-08 37.647 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . 2 2 2 B 'BLAST e-value' . 8.83e-08 37.647 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MDEPPFSEAALEQALGEPCDLDAALLTDIEDMLQLINNQDSDFPGLFDPPYAGSGAGGTDPASPDTSSPGSLSPPPATLSSSLEAFLSGPQAAPSPLSPPQPAPTPLKMYPSMPAFSPGPGIKEESVPLSILQTPTPQPLPGALLPQSFPAPAPPQFSSTPVLGYPSPPGGFSTGSPPGNTQQPLPGLPLASPPGVPPVSLHTQVQSVVPQQLLTVTAAPTAAPVTTTVTSQIQQVPVLLQPHFIKADSLLLTAMKTDGATVKAAGLSPLVSGTTVQTGPLPTLVSGGTILATVPLVVDAEKLPINRLAAGSKAPASAQSRGEKRTAHNAIEKRYRSSINDKIIELKDLVVGT---EAKLNKSAVLRKAIDYIRFLQHSNQKLKQENLSLRTAVHKSKSLKDLVSACGSGGNTDVLMEGVKTEVEDTLTPPPSDAGSPFQSSPLSLGSRGSGSGGSGSDSEPDSPVFEDSKAKPEQRPSLHSRGMLDRSRLALCTLVFLCLSCNPLASLLGARGLPSPSDTTSVYHSPGRNVLGTESRDGPGWAQWLLPPVVWLLNGLLVLVSLVLLFVYGEPVTRPHSGPAVYFWRHRKQADLDLARGDFAQAAQQLWLALRALGRPLPTSHLDLACSLLWNLIRHLLQRLWVGRWLAGRAGGLQQDCALRVDASASARDAALVYHKLHQLHTMGKHTGGHLTATNLALSALNLAECAGDAVSVATLAEIYVAAALRVKTSLPRALHFLTRFFLSSARQACLAQSGSVPPAMQWLCHPVGHRFFVDGDWSVLSTPWESLYSLAGNPVDPLAQVTQLFREHLLERALNCVTQPNPSPGSADGDKEFSDALGYLQLLNSCSDAAGAPAYSFSISSSMATTTGVDPVAKWWASLTAVVIHWLRRDEEAAERLCPLVEHLPRVLQESERPLPRAALHSFKAARALLGCAKAESGPASLTICEKASGYLQDSLATTPASSSIDKAVQLFLCDLLLVVRTSLWRQQQPPAPAPAAQGTSSRPQASALELRGFQRDLSSLRRLAQSFRPAMRRLMDVLTSESAWALPQHLGKGFPSPSGHKVPGWHGRMD 2 1 2 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------SEARALAKER-QKKDNHNLIERRRRFNINDRIKELGTLIPKSNDPDMRWNKGTILKASVDYIRKLQREQQRAKDLENRQKKLEHANRHL-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 3 2 1 MDEPPFSEAALEQALGEPCDLDAALLTDIEDMLQLINNQDSDFPGLFDPPYAGSGAGGTDPASPDTSSPGSLSPPPATLSSSLEAFLSGPQAAPSPLSPPQPAPTPLKMYPSMPAFSPGPGIKEESVPLSILQTPTPQPLPGALLPQSFPAPAPPQFSSTPVLGYPSPPGGFSTGSPPGNTQQPLPGLPLASPPGVPPVSLHTQVQSVVPQQLLTVTAAPTAAPVTTTVTSQIQQVPVLLQPHFIKADSLLLTAMKTDGATVKAAGLSPLVSGTTVQTGPLPTLVSGGTILATVPLVVDAEKLPINRLAAGSKAPASAQSRGEKRTAHNAIEKRYRSSINDKIIELKDLVVGT---EAKLNKSAVLRKAIDYIRFLQHSNQKLKQENLSLRTAVHKSKSLKDLVSACGSGGNTDVLMEGVKTEVEDTLTPPPSDAGSPFQSSPLSLGSRGSGSGGSGSDSEPDSPVFEDSKAKPEQRPSLHSRGMLDRSRLALCTLVFLCLSCNPLASLLGARGLPSPSDTTSVYHSPGRNVLGTESRDGPGWAQWLLPPVVWLLNGLLVLVSLVLLFVYGEPVTRPHSGPAVYFWRHRKQADLDLARGDFAQAAQQLWLALRALGRPLPTSHLDLACSLLWNLIRHLLQRLWVGRWLAGRAGGLQQDCALRVDASASARDAALVYHKLHQLHTMGKHTGGHLTATNLALSALNLAECAGDAVSVATLAEIYVAAALRVKTSLPRALHFLTRFFLSSARQACLAQSGSVPPAMQWLCHPVGHRFFVDGDWSVLSTPWESLYSLAGNPVDPLAQVTQLFREHLLERALNCVTQPNPSPGSADGDKEFSDALGYLQLLNSCSDAAGAPAYSFSISSSMATTTGVDPVAKWWASLTAVVIHWLRRDEEAAERLCPLVEHLPRVLQESERPLPRAALHSFKAARALLGCAKAESGPASLTICEKASGYLQDSLATTPASSSIDKAVQLFLCDLLLVVRTSLWRQQQPPAPAPAAQGTSSRPQASALELRGFQRDLSSLRRLAQSFRPAMRRLMDVLTSESAWALPQHLGKGFPSPSGHKVPGWHGRMD 4 2 2 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------SEARALAKER-QKKDNHNLIERRRRFNINDRIKELGTLIPKSNDPDMRWNKGTILKASVDYIRKLQREQQRAKDLENRQKKLEHANRHL-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.330}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 4atk.1, oligomeric state (homo-dimer) as predicted' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 1' . 6 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . THR 326 326 ? A 19.263 19.291 29.964 1 1 A THR 0.430 1 ATOM 2 C CA . THR 326 326 ? A 19.607 17.837 29.739 1 1 A THR 0.430 1 ATOM 3 C C . THR 326 326 ? A 21.079 17.657 29.393 1 1 A THR 0.430 1 ATOM 4 O O . THR 326 326 ? A 21.475 17.931 28.270 1 1 A THR 0.430 1 ATOM 5 C CB . THR 326 326 ? A 18.733 17.290 28.597 1 1 A THR 0.430 1 ATOM 6 O OG1 . THR 326 326 ? A 18.743 18.151 27.450 1 1 A THR 0.430 1 ATOM 7 C CG2 . THR 326 326 ? A 17.263 17.183 29.039 1 1 A THR 0.430 1 ATOM 8 N N . ALA 327 327 ? A 21.952 17.222 30.343 1 1 A ALA 0.430 1 ATOM 9 C CA . ALA 327 327 ? A 23.389 17.153 30.104 1 1 A ALA 0.430 1 ATOM 10 C C . ALA 327 327 ? A 23.797 16.174 29.001 1 1 A ALA 0.430 1 ATOM 11 O O . ALA 327 327 ? A 24.536 16.521 28.086 1 1 A ALA 0.430 1 ATOM 12 C CB . ALA 327 327 ? A 24.084 16.779 31.434 1 1 A ALA 0.430 1 ATOM 13 N N . HIS 328 328 ? A 23.252 14.940 29.042 1 1 A HIS 0.620 1 ATOM 14 C CA . HIS 328 328 ? A 23.549 13.888 28.075 1 1 A HIS 0.620 1 ATOM 15 C C . HIS 328 328 ? A 23.067 14.176 26.646 1 1 A HIS 0.620 1 ATOM 16 O O . HIS 328 328 ? A 23.794 14.078 25.657 1 1 A HIS 0.620 1 ATOM 17 C CB . HIS 328 328 ? A 22.919 12.548 28.550 1 1 A HIS 0.620 1 ATOM 18 C CG . HIS 328 328 ? A 23.622 11.328 28.060 1 1 A HIS 0.620 1 ATOM 19 N ND1 . HIS 328 328 ? A 24.510 11.466 27.038 1 1 A HIS 0.620 1 ATOM 20 C CD2 . HIS 328 328 ? A 23.519 10.017 28.425 1 1 A HIS 0.620 1 ATOM 21 C CE1 . HIS 328 328 ? A 24.944 10.254 26.767 1 1 A HIS 0.620 1 ATOM 22 N NE2 . HIS 328 328 ? A 24.374 9.343 27.585 1 1 A HIS 0.620 1 ATOM 23 N N . ASN 329 329 ? A 21.811 14.633 26.509 1 1 A ASN 0.630 1 ATOM 24 C CA . ASN 329 329 ? A 21.148 14.830 25.227 1 1 A ASN 0.630 1 ATOM 25 C C . ASN 329 329 ? A 21.873 15.808 24.290 1 1 A ASN 0.630 1 ATOM 26 O O . ASN 329 329 ? A 21.901 15.629 23.076 1 1 A ASN 0.630 1 ATOM 27 C CB . ASN 329 329 ? A 19.693 15.343 25.426 1 1 A ASN 0.630 1 ATOM 28 C CG . ASN 329 329 ? A 18.803 14.371 26.197 1 1 A ASN 0.630 1 ATOM 29 O OD1 . ASN 329 329 ? A 19.195 13.251 26.532 1 1 A ASN 0.630 1 ATOM 30 N ND2 . ASN 329 329 ? A 17.567 14.804 26.539 1 1 A ASN 0.630 1 ATOM 31 N N . ALA 330 330 ? A 22.448 16.879 24.865 1 1 A ALA 0.600 1 ATOM 32 C CA . ALA 330 330 ? A 23.314 17.825 24.186 1 1 A ALA 0.600 1 ATOM 33 C C . ALA 330 330 ? A 24.679 17.260 23.843 1 1 A ALA 0.600 1 ATOM 34 O O . ALA 330 330 ? A 25.236 17.645 22.798 1 1 A ALA 0.600 1 ATOM 35 C CB . ALA 330 330 ? A 23.560 19.066 25.054 1 1 A ALA 0.600 1 ATOM 36 N N . ILE 331 331 ? A 25.283 16.388 24.632 1 1 A ILE 0.550 1 ATOM 37 C CA . ILE 331 331 ? A 26.544 15.722 24.309 1 1 A ILE 0.550 1 ATOM 38 C C . ILE 331 331 ? A 26.377 14.721 23.160 1 1 A ILE 0.550 1 ATOM 39 O O . ILE 331 331 ? A 27.189 14.708 22.232 1 1 A ILE 0.550 1 ATOM 40 C CB . ILE 331 331 ? A 27.343 15.135 25.473 1 1 A ILE 0.550 1 ATOM 41 C CG1 . ILE 331 331 ? A 27.354 16.073 26.718 1 1 A ILE 0.550 1 ATOM 42 C CG2 . ILE 331 331 ? A 28.743 14.741 24.940 1 1 A ILE 0.550 1 ATOM 43 C CD1 . ILE 331 331 ? A 28.648 16.823 27.038 1 1 A ILE 0.550 1 ATOM 44 N N . GLU 332 332 ? A 25.300 13.925 23.133 1 1 A GLU 0.590 1 ATOM 45 C CA . GLU 332 332 ? A 24.983 13.035 22.035 1 1 A GLU 0.590 1 ATOM 46 C C . GLU 332 332 ? A 24.437 13.751 20.801 1 1 A GLU 0.590 1 ATOM 47 O O . GLU 332 332 ? A 24.581 13.285 19.679 1 1 A GLU 0.590 1 ATOM 48 C CB . GLU 332 332 ? A 24.009 11.933 22.489 1 1 A GLU 0.590 1 ATOM 49 C CG . GLU 332 332 ? A 24.600 11.073 23.626 1 1 A GLU 0.590 1 ATOM 50 C CD . GLU 332 332 ? A 25.876 10.374 23.173 1 1 A GLU 0.590 1 ATOM 51 O OE1 . GLU 332 332 ? A 25.773 9.420 22.365 1 1 A GLU 0.590 1 ATOM 52 O OE2 . GLU 332 332 ? A 26.967 10.824 23.616 1 1 A GLU 0.590 1 ATOM 53 N N . LYS 333 333 ? A 23.873 14.966 20.965 1 1 A LYS 0.620 1 ATOM 54 C CA . LYS 333 333 ? A 23.577 15.879 19.862 1 1 A LYS 0.620 1 ATOM 55 C C . LYS 333 333 ? A 24.824 16.261 19.065 1 1 A LYS 0.620 1 ATOM 56 O O . LYS 333 333 ? A 24.790 16.352 17.839 1 1 A LYS 0.620 1 ATOM 57 C CB . LYS 333 333 ? A 22.941 17.197 20.374 1 1 A LYS 0.620 1 ATOM 58 C CG . LYS 333 333 ? A 22.505 18.228 19.311 1 1 A LYS 0.620 1 ATOM 59 C CD . LYS 333 333 ? A 22.037 19.546 19.956 1 1 A LYS 0.620 1 ATOM 60 C CE . LYS 333 333 ? A 21.685 20.611 18.914 1 1 A LYS 0.620 1 ATOM 61 N NZ . LYS 333 333 ? A 21.187 21.847 19.560 1 1 A LYS 0.620 1 ATOM 62 N N . ARG 334 334 ? A 25.945 16.488 19.773 1 1 A ARG 0.620 1 ATOM 63 C CA . ARG 334 334 ? A 27.276 16.695 19.218 1 1 A ARG 0.620 1 ATOM 64 C C . ARG 334 334 ? A 27.869 15.457 18.573 1 1 A ARG 0.620 1 ATOM 65 O O . ARG 334 334 ? A 28.554 15.534 17.556 1 1 A ARG 0.620 1 ATOM 66 C CB . ARG 334 334 ? A 28.331 17.132 20.250 1 1 A ARG 0.620 1 ATOM 67 C CG . ARG 334 334 ? A 27.980 18.377 21.072 1 1 A ARG 0.620 1 ATOM 68 C CD . ARG 334 334 ? A 28.501 18.284 22.510 1 1 A ARG 0.620 1 ATOM 69 N NE . ARG 334 334 ? A 29.678 19.190 22.688 1 1 A ARG 0.620 1 ATOM 70 C CZ . ARG 334 334 ? A 30.611 19.026 23.638 1 1 A ARG 0.620 1 ATOM 71 N NH1 . ARG 334 334 ? 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A 26.034 13.144 17.125 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 86 C CA . ARG 336 336 ? A 25.290 13.078 15.884 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 87 C C . ARG 336 336 ? A 25.554 14.111 14.818 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 88 O O . ARG 336 336 ? A 25.505 13.764 13.631 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 89 C CB . ARG 336 336 ? A 23.786 13.096 16.136 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 90 C CG . ARG 336 336 ? A 23.248 11.946 16.999 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 91 C CD . ARG 336 336 ? A 23.938 10.585 16.857 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 92 N NE . ARG 336 336 ? A 22.905 9.561 16.527 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 93 C CZ . ARG 336 336 ? A 22.678 9.078 15.298 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 94 N NH1 . ARG 336 336 ? A 23.340 9.534 14.233 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 95 N NH2 . ARG 336 336 ? A 21.727 8.153 15.137 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 96 N N . SER 337 337 ? A 25.782 15.368 15.189 1 1 A SER 0.690 1 ATOM 97 C CA . SER 337 337 ? A 26.167 16.418 14.259 1 1 A SER 0.690 1 ATOM 98 C C . SER 337 337 ? A 27.497 16.039 13.599 1 1 A SER 0.690 1 ATOM 99 O O . SER 337 337 ? 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'normalized score' global . 3 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.636 2 1 3 0.035 3 1 4 0.330 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 326 THR 1 0.430 2 1 A 327 ALA 1 0.430 3 1 A 328 HIS 1 0.620 4 1 A 329 ASN 1 0.630 5 1 A 330 ALA 1 0.600 6 1 A 331 ILE 1 0.550 7 1 A 332 GLU 1 0.590 8 1 A 333 LYS 1 0.620 9 1 A 334 ARG 1 0.620 10 1 A 335 TYR 1 0.630 11 1 A 336 ARG 1 0.660 12 1 A 337 SER 1 0.690 13 1 A 338 SER 1 0.670 14 1 A 339 ILE 1 0.700 15 1 A 340 ASN 1 0.720 16 1 A 341 ASP 1 0.700 17 1 A 342 LYS 1 0.680 18 1 A 343 ILE 1 0.710 19 1 A 344 ILE 1 0.730 20 1 A 345 GLU 1 0.760 21 1 A 346 LEU 1 0.750 22 1 A 347 LYS 1 0.710 23 1 A 348 ASP 1 0.710 24 1 A 349 LEU 1 0.770 25 1 A 350 VAL 1 0.730 26 1 A 351 VAL 1 0.420 27 1 A 352 GLY 1 0.460 28 1 A 353 THR 1 0.400 29 1 A 354 GLU 1 0.390 30 1 A 355 ALA 1 0.440 31 1 A 356 LYS 1 0.400 32 1 A 357 LEU 1 0.550 33 1 A 358 ASN 1 0.710 34 1 A 359 LYS 1 0.690 35 1 A 360 SER 1 0.660 36 1 A 361 ALA 1 0.650 37 1 A 362 VAL 1 0.740 38 1 A 363 LEU 1 0.710 39 1 A 364 ARG 1 0.650 40 1 A 365 LYS 1 0.680 41 1 A 366 ALA 1 0.790 42 1 A 367 ILE 1 0.740 43 1 A 368 ASP 1 0.690 44 1 A 369 TYR 1 0.690 45 1 A 370 ILE 1 0.740 46 1 A 371 ARG 1 0.650 47 1 A 372 PHE 1 0.630 48 1 A 373 LEU 1 0.660 49 1 A 374 GLN 1 0.680 50 1 A 375 HIS 1 0.620 51 1 A 376 SER 1 0.650 52 1 A 377 ASN 1 0.670 53 1 A 378 GLN 1 0.700 54 1 A 379 LYS 1 0.680 55 1 A 380 LEU 1 0.760 56 1 A 381 LYS 1 0.750 57 1 A 382 GLN 1 0.750 58 1 A 383 GLU 1 0.450 59 1 A 384 ASN 1 0.470 60 1 B 324 LYS 1 0.490 61 1 B 325 ARG 1 0.490 62 1 B 326 THR 1 0.640 63 1 B 327 ALA 1 0.640 64 1 B 328 HIS 1 0.610 65 1 B 329 ASN 1 0.660 66 1 B 330 ALA 1 0.640 67 1 B 331 ILE 1 0.590 68 1 B 332 GLU 1 0.610 69 1 B 333 LYS 1 0.620 70 1 B 334 ARG 1 0.610 71 1 B 335 TYR 1 0.620 72 1 B 336 ARG 1 0.640 73 1 B 337 SER 1 0.690 74 1 B 338 SER 1 0.670 75 1 B 339 ILE 1 0.700 76 1 B 340 ASN 1 0.720 77 1 B 341 ASP 1 0.690 78 1 B 342 LYS 1 0.680 79 1 B 343 ILE 1 0.720 80 1 B 344 ILE 1 0.710 81 1 B 345 GLU 1 0.740 82 1 B 346 LEU 1 0.760 83 1 B 347 LYS 1 0.730 84 1 B 348 ASP 1 0.730 85 1 B 349 LEU 1 0.760 86 1 B 350 VAL 1 0.690 87 1 B 351 VAL 1 0.430 88 1 B 352 GLY 1 0.470 89 1 B 353 THR 1 0.470 90 1 B 354 GLU 1 0.400 91 1 B 355 ALA 1 0.450 92 1 B 356 LYS 1 0.410 93 1 B 357 LEU 1 0.650 94 1 B 358 ASN 1 0.690 95 1 B 359 LYS 1 0.670 96 1 B 360 SER 1 0.650 97 1 B 361 ALA 1 0.650 98 1 B 362 VAL 1 0.710 99 1 B 363 LEU 1 0.690 100 1 B 364 ARG 1 0.640 101 1 B 365 LYS 1 0.670 102 1 B 366 ALA 1 0.780 103 1 B 367 ILE 1 0.760 104 1 B 368 ASP 1 0.710 105 1 B 369 TYR 1 0.700 106 1 B 370 ILE 1 0.740 107 1 B 371 ARG 1 0.670 108 1 B 372 PHE 1 0.660 109 1 B 373 LEU 1 0.650 110 1 B 374 GLN 1 0.660 111 1 B 375 HIS 1 0.620 112 1 B 376 SER 1 0.620 113 1 B 377 ASN 1 0.630 114 1 B 378 GLN 1 0.600 115 1 B 379 LYS 1 0.370 116 1 B 380 LEU 1 0.350 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #