data_SMR-b439a1b7f928787c0ac32c880394e524_3 _entry.id SMR-b439a1b7f928787c0ac32c880394e524_3 _struct.entry_id SMR-b439a1b7f928787c0ac32c880394e524_3 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - A0A8C6I212/ A0A8C6I212_MUSSI, Transcription elongation regulator 1 (CA150) - Q8CGF7 (isoform 2)/ TCRG1_MOUSE, Transcription elongation regulator 1 Estimated model accuracy of this model is 0.029, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries A0A8C6I212, Q8CGF7 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 141179.166 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP A0A8C6I212_MUSSI A0A8C6I212 1 ;MAERGGDGGEGERFNPGELRMAQQQALRFRGPAPPPNAVMRGPPPLMRPPPPFGMMRGPPPPPRPPFGRP PFDPNMPPMPPPGGIPPPMGPPHLQRPPFMPPPMGAMPPPPGMMFPPGMPPGTAPGAPALPPTEEIWVEN KTPDGKVYYYNARTRESAWTKPDGVKVIQQSELTPMLAAQAQVQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQ AQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQVQAQAVGAPTPTTSSPAPAVSTSTPTST PSSTTATTTTATSVAQTVSTPTTQDQTPSSAVSVATPTVSVSAPAPTATPVQTVPQPHPQTLPPAVPHSV PQPAAAIPAFPPVMVPPFRVPLPGMPIPLPGVLPGMAPPIVPMIHPQVAIAASPATLAGATAVSEWTEYK TADGKTYYYNNRTLESTWEKPQELKEKEKLDEKIKEPIKEASEEPLPMETEEEDPKEEPVKEIKEEPKEE EMTEEEKAAQKAKPVATTPIPGTPWCVVWTGDERVFFYNPTTRLSMWDRPDDLIGRADVDKIIQEPPHKK GLEDMKKLRHPAPTMLSIQKWQFSMSAIKEEQELMEEMNEDEPIKAKKRKRDDNKDIDSEKEAAMEAEIK AARERAIVPLEARMKQFKDMLLERGVSAFSTWEKELHKIVFDPRYLLLNPKERKQVFDQYVKTRAEEERR EKKNKIMQAKEDFKKMMEEAKFNPRATFSEFAAKHAKDSRFKAIEKMKDREALFNEFVAAARKKEKEDSK TRGEKIKSDFFELLSNHHLDSQSRWSKVKDKVESDPRYKAVDSSSMREDLFKQYIEKIAKNLDSEKEKEL ERQARIEASLREREREVQKARSEQTKEIDREREQHKREEAIQNFKALLSDMVRSSDVSWSDTRRTLRKDH RWESGSLLEREEKEKLFNEHIEALTKKKREHFRQLLDETSAITLTSTWKEVKKIIKEDPRCIKFSSSDRK KQREFEEYIRDKYITAKADFRTLLKETKFITYRSKKLIQESDQHLKDVEKILQNDKRYLVLDCVPEERRK LIVAYVDDLDRRGPPPPPTASEPTRRSTK ; 'Transcription elongation regulator 1 (CA150)' 2 1 UNP TCRG1_MOUSE Q8CGF7 1 ;MAERGGDGGEGERFNPGELRMAQQQALRFRGPAPPPNAVMRGPPPLMRPPPPFGMMRGPPPPPRPPFGRP PFDPNMPPMPPPGGIPPPMGPPHLQRPPFMPPPMGAMPPPPGMMFPPGMPPGTAPGAPALPPTEEIWVEN KTPDGKVYYYNARTRESAWTKPDGVKVIQQSELTPMLAAQAQVQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQ AQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQVQAQAVGAPTPTTSSPAPAVSTSTPTST PSSTTATTTTATSVAQTVSTPTTQDQTPSSAVSVATPTVSVSAPAPTATPVQTVPQPHPQTLPPAVPHSV PQPAAAIPAFPPVMVPPFRVPLPGMPIPLPGVLPGMAPPIVPMIHPQVAIAASPATLAGATAVSEWTEYK TADGKTYYYNNRTLESTWEKPQELKEKEKLDEKIKEPIKEASEEPLPMETEEEDPKEEPVKEIKEEPKEE EMTEEEKAAQKAKPVATTPIPGTPWCVVWTGDERVFFYNPTTRLSMWDRPDDLIGRADVDKIIQEPPHKK GLEDMKKLRHPAPTMLSIQKWQFSMSAIKEEQELMEEMNEDEPIKAKKRKRDDNKDIDSEKEAAMEAEIK AARERAIVPLEARMKQFKDMLLERGVSAFSTWEKELHKIVFDPRYLLLNPKERKQVFDQYVKTRAEEERR EKKNKIMQAKEDFKKMMEEAKFNPRATFSEFAAKHAKDSRFKAIEKMKDREALFNEFVAAARKKEKEDSK TRGEKIKSDFFELLSNHHLDSQSRWSKVKDKVESDPRYKAVDSSSMREDLFKQYIEKIAKNLDSEKEKEL ERQARIEASLREREREVQKARSEQTKEIDREREQHKREEAIQNFKALLSDMVRSSDVSWSDTRRTLRKDH RWESGSLLEREEKEKLFNEHIEALTKKKREHFRQLLDETSAITLTSTWKEVKKIIKEDPRCIKFSSSDRK KQREFEEYIRDKYITAKADFRTLLKETKFITYRSKKLIQESDQHLKDVEKILQNDKRYLVLDCVPEERRK LIVAYVDDLDRRGPPPPPTASEPTRRSTK ; 'Transcription elongation regulator 1' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1079 1 1079 2 2 1 1079 1 1079 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . A0A8C6I212_MUSSI A0A8C6I212 . 1 1079 10103 'Mus spicilegus (Steppe mouse)' 2022-01-19 F919AFEFAE3CAE3B 1 UNP . 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AARERAIVPLEARMKQFKDMLLERGVSAFSTWEKELHKIVFDPRYLLLNPKERKQVFDQYVKTRAEEERR EKKNKIMQAKEDFKKMMEEAKFNPRATFSEFAAKHAKDSRFKAIEKMKDREALFNEFVAAARKKEKEDSK TRGEKIKSDFFELLSNHHLDSQSRWSKVKDKVESDPRYKAVDSSSMREDLFKQYIEKIAKNLDSEKEKEL ERQARIEASLREREREVQKARSEQTKEIDREREQHKREEAIQNFKALLSDMVRSSDVSWSDTRRTLRKDH RWESGSLLEREEKEKLFNEHIEALTKKKREHFRQLLDETSAITLTSTWKEVKKIIKEDPRCIKFSSSDRK KQREFEEYIRDKYITAKADFRTLLKETKFITYRSKKLIQESDQHLKDVEKILQNDKRYLVLDCVPEERRK LIVAYVDDLDRRGPPPPPTASEPTRRSTK ; ;MAERGGDGGEGERFNPGELRMAQQQALRFRGPAPPPNAVMRGPPPLMRPPPPFGMMRGPPPPPRPPFGRP PFDPNMPPMPPPGGIPPPMGPPHLQRPPFMPPPMGAMPPPPGMMFPPGMPPGTAPGAPALPPTEEIWVEN KTPDGKVYYYNARTRESAWTKPDGVKVIQQSELTPMLAAQAQVQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQ AQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQVQAQAVGAPTPTTSSPAPAVSTSTPTST PSSTTATTTTATSVAQTVSTPTTQDQTPSSAVSVATPTVSVSAPAPTATPVQTVPQPHPQTLPPAVPHSV PQPAAAIPAFPPVMVPPFRVPLPGMPIPLPGVLPGMAPPIVPMIHPQVAIAASPATLAGATAVSEWTEYK TADGKTYYYNNRTLESTWEKPQELKEKEKLDEKIKEPIKEASEEPLPMETEEEDPKEEPVKEIKEEPKEE EMTEEEKAAQKAKPVATTPIPGTPWCVVWTGDERVFFYNPTTRLSMWDRPDDLIGRADVDKIIQEPPHKK GLEDMKKLRHPAPTMLSIQKWQFSMSAIKEEQELMEEMNEDEPIKAKKRKRDDNKDIDSEKEAAMEAEIK AARERAIVPLEARMKQFKDMLLERGVSAFSTWEKELHKIVFDPRYLLLNPKERKQVFDQYVKTRAEEERR EKKNKIMQAKEDFKKMMEEAKFNPRATFSEFAAKHAKDSRFKAIEKMKDREALFNEFVAAARKKEKEDSK TRGEKIKSDFFELLSNHHLDSQSRWSKVKDKVESDPRYKAVDSSSMREDLFKQYIEKIAKNLDSEKEKEL ERQARIEASLREREREVQKARSEQTKEIDREREQHKREEAIQNFKALLSDMVRSSDVSWSDTRRTLRKDH RWESGSLLEREEKEKLFNEHIEALTKKKREHFRQLLDETSAITLTSTWKEVKKIIKEDPRCIKFSSSDRK KQREFEEYIRDKYITAKADFRTLLKETKFITYRSKKLIQESDQHLKDVEKILQNDKRYLVLDCVPEERRK LIVAYVDDLDRRGPPPPPTASEPTRRSTK ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 ALA . 1 3 GLU . 1 4 ARG . 1 5 GLY . 1 6 GLY . 1 7 ASP . 1 8 GLY . 1 9 GLY . 1 10 GLU . 1 11 GLY . 1 12 GLU . 1 13 ARG . 1 14 PHE . 1 15 ASN . 1 16 PRO . 1 17 GLY . 1 18 GLU . 1 19 LEU . 1 20 ARG . 1 21 MET . 1 22 ALA . 1 23 GLN . 1 24 GLN . 1 25 GLN . 1 26 ALA . 1 27 LEU . 1 28 ARG . 1 29 PHE . 1 30 ARG . 1 31 GLY . 1 32 PRO . 1 33 ALA . 1 34 PRO . 1 35 PRO . 1 36 PRO . 1 37 ASN . 1 38 ALA . 1 39 VAL . 1 40 MET . 1 41 ARG . 1 42 GLY . 1 43 PRO . 1 44 PRO . 1 45 PRO . 1 46 LEU . 1 47 MET . 1 48 ARG . 1 49 PRO . 1 50 PRO . 1 51 PRO . 1 52 PRO . 1 53 PHE . 1 54 GLY . 1 55 MET . 1 56 MET . 1 57 ARG . 1 58 GLY . 1 59 PRO . 1 60 PRO . 1 61 PRO . 1 62 PRO . 1 63 PRO . 1 64 ARG . 1 65 PRO . 1 66 PRO . 1 67 PHE . 1 68 GLY . 1 69 ARG . 1 70 PRO . 1 71 PRO . 1 72 PHE . 1 73 ASP . 1 74 PRO . 1 75 ASN . 1 76 MET . 1 77 PRO . 1 78 PRO . 1 79 MET . 1 80 PRO . 1 81 PRO . 1 82 PRO . 1 83 GLY . 1 84 GLY . 1 85 ILE . 1 86 PRO . 1 87 PRO . 1 88 PRO . 1 89 MET . 1 90 GLY . 1 91 PRO . 1 92 PRO . 1 93 HIS . 1 94 LEU . 1 95 GLN . 1 96 ARG . 1 97 PRO . 1 98 PRO . 1 99 PHE . 1 100 MET . 1 101 PRO . 1 102 PRO . 1 103 PRO . 1 104 MET . 1 105 GLY . 1 106 ALA . 1 107 MET . 1 108 PRO . 1 109 PRO . 1 110 PRO . 1 111 PRO . 1 112 GLY . 1 113 MET . 1 114 MET . 1 115 PHE . 1 116 PRO . 1 117 PRO 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# loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 SEWTERKTADGKTYYYNNRTAESTWEKP SEWTERKTADGKTYYYNNRTAESTWEKP # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 1 28 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 2mwe 2024-05-01 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1079 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1079 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 1.6e-05 92.857 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MAERGGDGGEGERFNPGELRMAQQQALRFRGPAPPPNAVMRGPPPLMRPPPPFGMMRGPPPPPRPPFGRPPFDPNMPPMPPPGGIPPPMGPPHLQRPPFMPPPMGAMPPPPGMMFPPGMPPGTAPGAPALPPTEEIWVENKTPDGKVYYYNARTRESAWTKPDGVKVIQQSELTPMLAAQAQVQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQVQAQAVGAPTPTTSSPAPAVSTSTPTSTPSSTTATTTTATSVAQTVSTPTTQDQTPSSAVSVATPTVSVSAPAPTATPVQTVPQPHPQTLPPAVPHSVPQPAAAIPAFPPVMVPPFRVPLPGMPIPLPGVLPGMAPPIVPMIHPQVAIAASPATLAGATAVSEWTEYKTADGKTYYYNNRTLESTWEKPQELKEKEKLDEKIKEPIKEASEEPLPMETEEEDPKEEPVKEIKEEPKEEEMTEEEKAAQKAKPVATTPIPGTPWCVVWTGDERVFFYNPTTRLSMWDRPDDLIGRADVDKIIQEPPHKKGLEDMKKLRHPAPTMLSIQKWQFSMSAIKEEQELMEEMNEDEPIKAKKRKRDDNKDIDSEKEAAMEAEIKAARERAIVPLEARMKQFKDMLLERGVSAFSTWEKELHKIVFDPRYLLLNPKERKQVFDQYVKTRAEEERREKKNKIMQAKEDFKKMMEEAKFNPRATFSEFAAKHAKDSRFKAIEKMKDREALFNEFVAAARKKEKEDSKTRGEKIKSDFFELLSNHHLDSQSRWSKVKDKVESDPRYKAVDSSSMREDLFKQYIEKIAKNLDSEKEKELERQARIEASLREREREVQKARSEQTKEIDREREQHKREEAIQNFKALLSDMVRSSDVSWSDTRRTLRKDHRWESGSLLEREEKEKLFNEHIEALTKKKREHFRQLLDETSAITLTSTWKEVKKIIKEDPRCIKFSSSDRKKQREFEEYIRDKYITAKADFRTLLKETKFITYRSKKLIQESDQHLKDVEKILQNDKRYLVLDCVPEERRKLIVAYVDDLDRRGPPPPPTASEPTRRSTK 2 1 2 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------SEWTERKTADGKTYYYNNRTAESTWEKP-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 2mwe.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 3' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . SER 414 414 ? A -8.519 3.939 6.988 1 1 A SER 0.460 1 ATOM 2 C CA . SER 414 414 ? A -9.316 2.926 6.180 1 1 A SER 0.460 1 ATOM 3 C C . SER 414 414 ? A -9.386 3.090 4.668 1 1 A SER 0.460 1 ATOM 4 O O . SER 414 414 ? A -9.989 2.266 3.998 1 1 A SER 0.460 1 ATOM 5 C CB . SER 414 414 ? A -10.793 2.875 6.676 1 1 A SER 0.460 1 ATOM 6 O OG . SER 414 414 ? A -10.845 2.782 8.103 1 1 A SER 0.460 1 ATOM 7 N N . GLU 415 415 ? A -8.772 4.155 4.115 1 1 A GLU 0.510 1 ATOM 8 C CA . GLU 415 415 ? A -8.704 4.569 2.733 1 1 A GLU 0.510 1 ATOM 9 C C . GLU 415 415 ? A -7.414 4.097 2.075 1 1 A GLU 0.510 1 ATOM 10 O O . GLU 415 415 ? A -7.268 4.132 0.854 1 1 A GLU 0.510 1 ATOM 11 C CB . GLU 415 415 ? A -8.676 6.136 2.720 1 1 A GLU 0.510 1 ATOM 12 C CG . GLU 415 415 ? A -7.515 6.851 3.494 1 1 A GLU 0.510 1 ATOM 13 C CD . GLU 415 415 ? A -7.628 6.811 5.016 1 1 A GLU 0.510 1 ATOM 14 O OE1 . GLU 415 415 ? A -7.277 5.749 5.600 1 1 A GLU 0.510 1 ATOM 15 O OE2 . GLU 415 415 ? A -8.084 7.804 5.618 1 1 A GLU 0.510 1 ATOM 16 N N . TRP 416 416 ? A -6.436 3.621 2.872 1 1 A TRP 0.520 1 ATOM 17 C CA . TRP 416 416 ? A -5.215 3.023 2.372 1 1 A TRP 0.520 1 ATOM 18 C C . TRP 416 416 ? A -5.425 1.529 2.251 1 1 A TRP 0.520 1 ATOM 19 O O . TRP 416 416 ? A -5.668 0.841 3.238 1 1 A TRP 0.520 1 ATOM 20 C CB . TRP 416 416 ? A -3.993 3.274 3.300 1 1 A TRP 0.520 1 ATOM 21 C CG . TRP 416 416 ? A -3.670 4.747 3.498 1 1 A TRP 0.520 1 ATOM 22 C CD1 . TRP 416 416 ? A -4.216 5.600 4.412 1 1 A TRP 0.520 1 ATOM 23 C CD2 . TRP 416 416 ? A -2.732 5.503 2.726 1 1 A TRP 0.520 1 ATOM 24 N NE1 . TRP 416 416 ? A -3.741 6.868 4.206 1 1 A TRP 0.520 1 ATOM 25 C CE2 . TRP 416 416 ? A -2.810 6.852 3.197 1 1 A TRP 0.520 1 ATOM 26 C CE3 . TRP 416 416 ? A -1.855 5.161 1.706 1 1 A TRP 0.520 1 ATOM 27 C CZ2 . TRP 416 416 ? A -2.004 7.830 2.641 1 1 A TRP 0.520 1 ATOM 28 C CZ3 . TRP 416 416 ? A -1.060 6.161 1.136 1 1 A TRP 0.520 1 ATOM 29 C CH2 . TRP 416 416 ? A -1.127 7.484 1.603 1 1 A TRP 0.520 1 ATOM 30 N N . THR 417 417 ? A -5.331 0.995 1.022 1 1 A THR 0.660 1 ATOM 31 C CA . THR 417 417 ? A -5.595 -0.411 0.756 1 1 A THR 0.660 1 ATOM 32 C C . THR 417 417 ? A -4.308 -1.171 0.785 1 1 A THR 0.660 1 ATOM 33 O O . THR 417 417 ? A -3.425 -0.937 -0.031 1 1 A THR 0.660 1 ATOM 34 C CB . THR 417 417 ? A -6.156 -0.645 -0.631 1 1 A THR 0.660 1 ATOM 35 O OG1 . THR 417 417 ? A -7.443 -0.076 -0.737 1 1 A THR 0.660 1 ATOM 36 C CG2 . THR 417 417 ? A -6.331 -2.138 -0.968 1 1 A THR 0.660 1 ATOM 37 N N . GLU 418 418 ? A -4.173 -2.136 1.711 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 38 C CA . GLU 418 418 ? A -3.058 -3.047 1.720 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 39 C C . GLU 418 418 ? A -3.254 -4.112 0.634 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 40 O O . GLU 418 418 ? A -4.189 -4.908 0.647 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 41 C CB . GLU 418 418 ? A -2.826 -3.619 3.155 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 42 C CG . GLU 418 418 ? A -3.935 -4.522 3.761 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 43 C CD . GLU 418 418 ? A -3.374 -5.509 4.773 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 44 O OE1 . GLU 418 418 ? A -2.374 -6.199 4.413 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 45 O OE2 . GLU 418 418 ? A -3.995 -5.747 5.839 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 46 N N . TYR 419 419 ? A -2.395 -4.112 -0.405 1 1 A TYR 0.650 1 ATOM 47 C CA . TYR 419 419 ? A -2.532 -5.034 -1.517 1 1 A TYR 0.650 1 ATOM 48 C C . TYR 419 419 ? A -1.687 -6.256 -1.273 1 1 A TYR 0.650 1 ATOM 49 O O . TYR 419 419 ? A -0.466 -6.229 -1.402 1 1 A TYR 0.650 1 ATOM 50 C CB . TYR 419 419 ? A -2.087 -4.395 -2.847 1 1 A TYR 0.650 1 ATOM 51 C CG . TYR 419 419 ? A -3.191 -3.529 -3.358 1 1 A TYR 0.650 1 ATOM 52 C CD1 . TYR 419 419 ? A -4.186 -4.068 -4.190 1 1 A TYR 0.650 1 ATOM 53 C CD2 . TYR 419 419 ? A -3.285 -2.191 -2.967 1 1 A TYR 0.650 1 ATOM 54 C CE1 . TYR 419 419 ? A -5.221 -3.257 -4.678 1 1 A TYR 0.650 1 ATOM 55 C CE2 . TYR 419 419 ? A -4.335 -1.392 -3.431 1 1 A TYR 0.650 1 ATOM 56 C CZ . TYR 419 419 ? A -5.286 -1.912 -4.306 1 1 A TYR 0.650 1 ATOM 57 O OH . TYR 419 419 ? A -6.310 -1.074 -4.782 1 1 A TYR 0.650 1 ATOM 58 N N . LYS 420 420 ? A -2.340 -7.377 -0.920 1 1 A LYS 0.600 1 ATOM 59 C CA . LYS 420 420 ? A -1.675 -8.601 -0.541 1 1 A LYS 0.600 1 ATOM 60 C C . LYS 420 420 ? A -1.309 -9.419 -1.763 1 1 A LYS 0.600 1 ATOM 61 O O . LYS 420 420 ? A -2.087 -10.230 -2.254 1 1 A LYS 0.600 1 ATOM 62 C CB . LYS 420 420 ? A -2.592 -9.447 0.383 1 1 A LYS 0.600 1 ATOM 63 C CG . LYS 420 420 ? A -3.029 -8.692 1.651 1 1 A LYS 0.600 1 ATOM 64 C CD . LYS 420 420 ? A -4.028 -9.503 2.495 1 1 A LYS 0.600 1 ATOM 65 C CE . LYS 420 420 ? A -4.603 -8.758 3.716 1 1 A LYS 0.600 1 ATOM 66 N NZ . LYS 420 420 ? A -3.572 -8.478 4.733 1 1 A LYS 0.600 1 ATOM 67 N N . THR 421 421 ? A -0.088 -9.237 -2.295 1 1 A THR 0.540 1 ATOM 68 C CA . THR 421 421 ? A 0.378 -10.050 -3.399 1 1 A THR 0.540 1 ATOM 69 C C . THR 421 421 ? A 1.050 -11.288 -2.847 1 1 A THR 0.540 1 ATOM 70 O O . THR 421 421 ? A 1.765 -11.267 -1.848 1 1 A THR 0.540 1 ATOM 71 C CB . THR 421 421 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #