data_SMR-61c43a6e10117276596ffa240fc9f6f8_3 _entry.id SMR-61c43a6e10117276596ffa240fc9f6f8_3 _struct.entry_id SMR-61c43a6e10117276596ffa240fc9f6f8_3 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q9ESC8/ AFF4_MOUSE, AF4/FMR2 family member 4 Estimated model accuracy of this model is 0.011, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q9ESC8' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 147730.669 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP AFF4_MOUSE Q9ESC8 1 ;MNREDRNVLRMKERERRNQEIQQGEDAFPPSSPLFAEPYKVTSKEDKLSSRIQSMLGNYDEMKDYIGDRS IPKLVAIPKPAVPTTTDEKANPNFFEQRHGGSHQSSKWTPVGPAPSTSQSQKRSSALQSGHSSQRSGAGG SGASSSGQRHDRDSYSSSRKKGQHGSEHSKSRSSSPGKPQAVSSLSSSHSRSHGNDHHSKEHQRSKSPRD PDANWDSPSRGPFSSGQHSSQSFPPSLMSKSSSMLQKPTAYVRPMDGQESVEPKLSSEHYSSQSHGNSMT ELKPSSKAHLTKLKIPSRPLDASVSGDVSCVDEILKEMTHSWPPPLTAIHTPCKTEPSKFPFPTKESQQS NFGPGEQKRYSTAKTSNGHQSKSMLKDDLKLSSSEDSDGEQDCDKTMPRSTPGSNSEPSHHNSEGADNSR DDSSSHSGSESSSGSDSESESSSSDSEANEPSQSASPEPEPPPTNKWQLDNWLNKVNPHKVSPASSVDSN IPSSQAYKKEGREQGTASNYTDPGGTKETSSATPGRDSKTIQKGSESGRGRQKSPAQSDSTTQRRTVGKK QPKKPEKSAAEEPRGGLKIESETPVDMAASMPSSRHKAATKGSRKPNIKKESKSSPRPTAEKKKYKSASK PSQKSREIIETDTSSSDSDGSESLPPSSQTPKYPESNRTPVKPSSVEEEDSFFRQRMFSPMEEKELLSPL SEPDDRYPLIVKIDLNLLTRIPGKPYKETEPPKGEKKNVPEKHSREVQKQASEKASNKGKRKHKNDDDTR ASESKKPKTEDKNSSGHKPSSSRESSKQSSTKEKDLLPSPAGPILSKDSKTEHGSRKRTVSQSSSLKSSG TSSKENSGSSSKSSSSSTAKQKKTEGKGPSSSKEAKEKAPNSSSNCPPSTPTSESSKPRRTKLAFDDRNY SADHYLQEAKKLKHNADALSDRFEKAVYYLDAVVSFIECGNALEKNAQESKSPFPMYSDTVELIKYTMKL KNYLAPDATAADKRLTVLCLRCQSLLYLRLFKLKKENALKYSKTLTEHLKNSYSNSQAPSPGLGSKAVGM PSPVSPKLSPGNSGSYSSGGSSASASGSSVTIPQKIHQMAASYVQVTSNFLYATEIWDQAEQLSKEQKEF FAELDKVMGPLIFNASIMTDLARYTRQGLHWLRQDAKLIS ; 'AF4/FMR2 family member 4' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1160 1 1160 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . AFF4_MOUSE Q9ESC8 . 1 1160 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2001-03-01 0C13253EAC9192B3 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MNREDRNVLRMKERERRNQEIQQGEDAFPPSSPLFAEPYKVTSKEDKLSSRIQSMLGNYDEMKDYIGDRS IPKLVAIPKPAVPTTTDEKANPNFFEQRHGGSHQSSKWTPVGPAPSTSQSQKRSSALQSGHSSQRSGAGG SGASSSGQRHDRDSYSSSRKKGQHGSEHSKSRSSSPGKPQAVSSLSSSHSRSHGNDHHSKEHQRSKSPRD PDANWDSPSRGPFSSGQHSSQSFPPSLMSKSSSMLQKPTAYVRPMDGQESVEPKLSSEHYSSQSHGNSMT ELKPSSKAHLTKLKIPSRPLDASVSGDVSCVDEILKEMTHSWPPPLTAIHTPCKTEPSKFPFPTKESQQS NFGPGEQKRYSTAKTSNGHQSKSMLKDDLKLSSSEDSDGEQDCDKTMPRSTPGSNSEPSHHNSEGADNSR DDSSSHSGSESSSGSDSESESSSSDSEANEPSQSASPEPEPPPTNKWQLDNWLNKVNPHKVSPASSVDSN IPSSQAYKKEGREQGTASNYTDPGGTKETSSATPGRDSKTIQKGSESGRGRQKSPAQSDSTTQRRTVGKK QPKKPEKSAAEEPRGGLKIESETPVDMAASMPSSRHKAATKGSRKPNIKKESKSSPRPTAEKKKYKSASK 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DDSSSHSGSESSSGSDSESESSSSDSEANEPSQSASPEPEPPPTNKWQLDNWLNKVNPHKVSPASSVDSN IPSSQAYKKEGREQGTASNYTDPGGTKETSSATPGRDSKTIQKGSESGRGRQKSPAQSDSTTQRRTVGKK QPKKPEKSAAEEPRGGLKIESETPVDMAASMPSSRHKAATKGSRKPNIKKESKSSPRPTAEKKKYKSASK PSQKSREIIETDTSSSDSDGSESLPPSSQTPKYPESNRTPVKPSSVEEEDSFFRQRMFSPMEEKELLSPL SEPDDRYPLIVKIDLNLLTRIPGKPYKETEPPKGEKKNVPEKHSREVQKQASEKASNKGKRKHKNDDDTR ASESKKPKTEDKNSSGHKPSSSRESSKQSSTKEKDLLPSPAGPILSKDSKTEHGSRKRTVSQSSSLKSSG TSSKENSGSSSKSSSSSTAKQKKTEGKGPSSSKEAKEKAPNSSSNCPPSTPTSESSKPRRTKLAFDDRNY SADHYLQEAKKLKHNADALSDRFEKAVYYLDAVVSFIECGNALEKNAQESKSPFPMYSDTVELIKYTMKL KNYLAPDATAADKRLTVLCLRCQSLLYLRLFKLKKENALKYSKTLTEHLKNSYSNSQAPSPGLGSKAVGM PSPVSPKLSPGNSGSYSSGGSSASASGSSVTIPQKIHQMAASYVQVTSNFLYATEIWDQAEQLSKEQKEF FAELDKVMGPLIFNASIMTDLARYTRQGLHWLRQDAKLIS ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 ASN . 1 3 ARG . 1 4 GLU . 1 5 ASP . 1 6 ARG . 1 7 ASN . 1 8 VAL . 1 9 LEU . 1 10 ARG . 1 11 MET . 1 12 LYS . 1 13 GLU . 1 14 ARG . 1 15 GLU . 1 16 ARG . 1 17 ARG . 1 18 ASN . 1 19 GLN . 1 20 GLU . 1 21 ILE . 1 22 GLN . 1 23 GLN . 1 24 GLY . 1 25 GLU . 1 26 ASP . 1 27 ALA . 1 28 PHE . 1 29 PRO . 1 30 PRO . 1 31 SER . 1 32 SER . 1 33 PRO . 1 34 LEU . 1 35 PHE . 1 36 ALA . 1 37 GLU . 1 38 PRO . 1 39 TYR . 1 40 LYS . 1 41 VAL . 1 42 THR . 1 43 SER . 1 44 LYS . 1 45 GLU . 1 46 ASP . 1 47 LYS . 1 48 LEU . 1 49 SER . 1 50 SER . 1 51 ARG . 1 52 ILE . 1 53 GLN . 1 54 SER . 1 55 MET . 1 56 LEU . 1 57 GLY . 1 58 ASN . 1 59 TYR . 1 60 ASP . 1 61 GLU . 1 62 MET . 1 63 LYS . 1 64 ASP . 1 65 TYR . 1 66 ILE . 1 67 GLY . 1 68 ASP . 1 69 ARG . 1 70 SER . 1 71 ILE . 1 72 PRO . 1 73 LYS . 1 74 LEU . 1 75 VAL . 1 76 ALA . 1 77 ILE . 1 78 PRO . 1 79 LYS . 1 80 PRO . 1 81 ALA . 1 82 VAL . 1 83 PRO . 1 84 THR . 1 85 THR . 1 86 THR . 1 87 ASP . 1 88 GLU . 1 89 LYS . 1 90 ALA . 1 91 ASN . 1 92 PRO . 1 93 ASN . 1 94 PHE . 1 95 PHE . 1 96 GLU . 1 97 GLN . 1 98 ARG . 1 99 HIS . 1 100 GLY . 1 101 GLY . 1 102 SER . 1 103 HIS . 1 104 GLN . 1 105 SER . 1 106 SER . 1 107 LYS . 1 108 TRP . 1 109 THR . 1 110 PRO . 1 111 VAL . 1 112 GLY . 1 113 PRO . 1 114 ALA . 1 115 PRO . 1 116 SER . 1 117 THR . 1 118 SER . 1 119 GLN . 1 120 SER . 1 121 GLN . 1 122 LYS . 1 123 ARG . 1 124 SER . 1 125 SER . 1 126 ALA . 1 127 LEU . 1 128 GLN . 1 129 SER . 1 130 GLY . 1 131 HIS . 1 132 SER . 1 133 SER . 1 134 GLN . 1 135 ARG . 1 136 SER . 1 137 GLY . 1 138 ALA . 1 139 GLY . 1 140 GLY . 1 141 SER . 1 142 GLY . 1 143 ALA . 1 144 SER . 1 145 SER . 1 146 SER . 1 147 GLY . 1 148 GLN . 1 149 ARG . 1 150 HIS . 1 151 ASP . 1 152 ARG . 1 153 ASP . 1 154 SER . 1 155 TYR . 1 156 SER . 1 157 SER . 1 158 SER . 1 159 ARG . 1 160 LYS . 1 161 LYS . 1 162 GLY . 1 163 GLN . 1 164 HIS . 1 165 GLY . 1 166 SER . 1 167 GLU . 1 168 HIS . 1 169 SER . 1 170 LYS . 1 171 SER . 1 172 ARG . 1 173 SER . 1 174 SER . 1 175 SER . 1 176 PRO . 1 177 GLY . 1 178 LYS . 1 179 PRO . 1 180 GLN . 1 181 ALA . 1 182 VAL . 1 183 SER . 1 184 SER . 1 185 LEU . 1 186 SER . 1 187 SER . 1 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A 1 1092 SER 1092 ? ? ? A . A 1 1093 TYR 1093 ? ? ? A . A 1 1094 VAL 1094 ? ? ? A . A 1 1095 GLN 1095 ? ? ? A . A 1 1096 VAL 1096 ? ? ? A . A 1 1097 THR 1097 ? ? ? A . A 1 1098 SER 1098 ? ? ? A . A 1 1099 ASN 1099 ? ? ? A . A 1 1100 PHE 1100 ? ? ? A . A 1 1101 LEU 1101 ? ? ? A . A 1 1102 TYR 1102 ? ? ? A . A 1 1103 ALA 1103 ? ? ? A . A 1 1104 THR 1104 ? ? ? A . A 1 1105 GLU 1105 ? ? ? A . A 1 1106 ILE 1106 ? ? ? A . A 1 1107 TRP 1107 ? ? ? A . A 1 1108 ASP 1108 ? ? ? A . A 1 1109 GLN 1109 ? ? ? A . A 1 1110 ALA 1110 ? ? ? A . A 1 1111 GLU 1111 ? ? ? A . A 1 1112 GLN 1112 ? ? ? A . A 1 1113 LEU 1113 ? ? ? A . A 1 1114 SER 1114 ? ? ? A . A 1 1115 LYS 1115 ? ? ? A . A 1 1116 GLU 1116 ? ? ? A . A 1 1117 GLN 1117 ? ? ? A . A 1 1118 LYS 1118 ? ? ? A . A 1 1119 GLU 1119 ? ? ? A . A 1 1120 PHE 1120 ? ? ? A . A 1 1121 PHE 1121 ? ? ? A . A 1 1122 ALA 1122 ? ? ? A . A 1 1123 GLU 1123 ? ? ? A . A 1 1124 LEU 1124 ? ? ? A . A 1 1125 ASP 1125 ? ? ? A . A 1 1126 LYS 1126 ? ? ? A . A 1 1127 VAL 1127 ? ? ? A . A 1 1128 MET 1128 ? ? ? A . A 1 1129 GLY 1129 ? ? ? A . A 1 1130 PRO 1130 ? ? ? A . A 1 1131 LEU 1131 ? ? ? A . A 1 1132 ILE 1132 ? ? ? A . A 1 1133 PHE 1133 ? ? ? A . A 1 1134 ASN 1134 ? ? ? A . A 1 1135 ALA 1135 ? ? ? A . A 1 1136 SER 1136 ? ? ? A . A 1 1137 ILE 1137 ? ? ? A . A 1 1138 MET 1138 ? ? ? A . A 1 1139 THR 1139 ? ? ? A . A 1 1140 ASP 1140 ? ? ? A . A 1 1141 LEU 1141 ? ? ? A . A 1 1142 ALA 1142 ? ? ? A . A 1 1143 ARG 1143 ? ? ? A . A 1 1144 TYR 1144 ? ? ? A . A 1 1145 THR 1145 ? ? ? A . A 1 1146 ARG 1146 ? ? ? A . A 1 1147 GLN 1147 ? ? ? A . A 1 1148 GLY 1148 ? ? ? A . A 1 1149 LEU 1149 ? ? ? A . A 1 1150 HIS 1150 ? ? ? A . A 1 1151 TRP 1151 ? ? ? A . A 1 1152 LEU 1152 ? ? ? A . A 1 1153 ARG 1153 ? ? ? A . A 1 1154 GLN 1154 ? ? ? A . A 1 1155 ASP 1155 ? ? ? A . A 1 1156 ALA 1156 ? ? ? A . A 1 1157 LYS 1157 ? ? ? A . A 1 1158 LEU 1158 ? ? ? A . A 1 1159 ILE 1159 ? ? ? A . A 1 1160 SER 1160 ? ? ? A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'AF4/FMR2 family member 1/Protein AF-9 chimera {PDB ID=2lm0, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=2lm0.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 2lm0, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 3' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-25 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-20 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;TRLPLPLRDTKLLSPLRDTPPPQSLMVKITLDLLSRIPQPPGKPMGSDKQIKNGECDKAYLDELVELHRR LMTLRERHILQQIVNLIEETGHFHITNTTFDFDLCSLDKTTVRKLQSYLETSGTS ; ;TRLPLPLRDTKLLSPLRDTPPPQSLMVKITLDLLSRIPQPPGKPMGSDKQIKNGECDKAYLDELVELHRR LMTLRERHILQQIVNLIEETGHFHITNTTFDFDLCSLDKTTVRKLQSYLETSGTS ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 2 50 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 2lm0 2024-05-01 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1160 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1160 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 5.2e-11 40.816 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MNREDRNVLRMKERERRNQEIQQGEDAFPPSSPLFAEPYKVTSKEDKLSSRIQSMLGNYDEMKDYIGDRSIPKLVAIPKPAVPTTTDEKANPNFFEQRHGGSHQSSKWTPVGPAPSTSQSQKRSSALQSGHSSQRSGAGGSGASSSGQRHDRDSYSSSRKKGQHGSEHSKSRSSSPGKPQAVSSLSSSHSRSHGNDHHSKEHQRSKSPRDPDANWDSPSRGPFSSGQHSSQSFPPSLMSKSSSMLQKPTAYVRPMDGQESVEPKLSSEHYSSQSHGNSMTELKPSSKAHLTKLKIPSRPLDASVSGDVSCVDEILKEMTHSWPPPLTAIHTPCKTEPSKFPFPTKESQQSNFGPGEQKRYSTAKTSNGHQSKSMLKDDLKLSSSEDSDGEQDCDKTMPRSTPGSNSEPSHHNSEGADNSRDDSSSHSGSESSSGSDSESESSSSDSEANEPSQSASPEPEPPPTNKWQLDNWLNKVNPHKVSPASSVDSNIPSSQAYKKEGREQGTASNYTDPGGTKETSSATPGRDSKTIQKGSESGRGRQKSPAQSDSTTQRRTVGKKQPKKPEKSAAEEPRGGLKIESETPVDMAASMPSSRHKAATKGSRKPNIKKESKSSPRPTAEKKKYKSASKPSQKSREIIETDTSSSDSDGSESLPPSSQTPKYPESNRTPVKPSSVEEEDSFFRQRMFSPMEEKELLSPLSEPDDRYPLIVKIDLNLLTRIPGKPYKETEPPKGEKKNVPEKHSREVQKQASEKASNKGKRKHKNDDDTRASESKKPKTEDKNSSGHKPSSSRESSKQSSTKEKDLLPSPAGPILSKDSKTEHGSRKRTVSQSSSLKSSGTSSKENSGSSSKSSSSSTAKQKKTEGKGPSSSKEAKEKAPNSSSNCPPSTPTSESSKPRRTKLAFDDRNYSADHYLQEAKKLKHNADALSDRFEKAVYYLDAVVSFIECGNALEKNAQESKSPFPMYSDTVELIKYTMKLKNYLAPDATAADKRLTVLCLRCQSLLYLRLFKLKKENALKYSKTLTEHLKNSYSNSQAPSPGLGSKAVGMPSPVSPKLSPGNSGSYSSGGSSASASGSSVTIPQKIHQMAASYVQVTSNFLYATEIWDQAEQLSKEQKEFFAELDKVMGPLIFNASIMTDLARYTRQGLHWLRQDAKLIS 2 1 2 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------RLPLPLRDTKLLSPLRDTPPPQSLMVKITLDLLSRIPQPPGKPMGSDKQ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 2lm0.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 3' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . ARG 686 686 ? A 8.826 13.150 42.978 1 1 A ARG 0.490 1 ATOM 2 C CA . ARG 686 686 ? A 9.524 12.437 41.844 1 1 A ARG 0.490 1 ATOM 3 C C . ARG 686 686 ? A 10.536 11.380 42.286 1 1 A ARG 0.490 1 ATOM 4 O O . ARG 686 686 ? A 11.556 11.196 41.644 1 1 A ARG 0.490 1 ATOM 5 C CB . ARG 686 686 ? A 10.292 13.540 41.057 1 1 A ARG 0.490 1 ATOM 6 C CG . ARG 686 686 ? A 9.443 14.680 40.432 1 1 A ARG 0.490 1 ATOM 7 C CD . ARG 686 686 ? A 10.231 15.885 39.860 1 1 A ARG 0.490 1 ATOM 8 N NE . ARG 686 686 ? A 11.172 15.384 38.788 1 1 A ARG 0.490 1 ATOM 9 C CZ . ARG 686 686 ? A 12.454 15.038 38.932 1 1 A ARG 0.490 1 ATOM 10 N NH1 . ARG 686 686 ? A 13.077 15.085 40.111 1 1 A ARG 0.490 1 ATOM 11 N NH2 . ARG 686 686 ? A 13.125 14.540 37.893 1 1 A ARG 0.490 1 ATOM 12 N N . MET 687 687 ? A 10.287 10.683 43.422 1 1 A MET 0.380 1 ATOM 13 C CA . MET 687 687 ? A 11.133 9.635 43.937 1 1 A MET 0.380 1 ATOM 14 C C . MET 687 687 ? A 10.929 8.322 43.188 1 1 A MET 0.380 1 ATOM 15 O O . MET 687 687 ? A 11.852 7.607 42.888 1 1 A MET 0.380 1 ATOM 16 C CB . MET 687 687 ? A 10.781 9.472 45.442 1 1 A MET 0.380 1 ATOM 17 C CG . MET 687 687 ? A 11.166 10.701 46.302 1 1 A MET 0.380 1 ATOM 18 S SD . MET 687 687 ? A 12.927 11.160 46.192 1 1 A MET 0.380 1 ATOM 19 C CE . MET 687 687 ? A 13.605 9.671 46.989 1 1 A MET 0.380 1 ATOM 20 N N . PHE 688 688 ? A 9.637 8.024 42.876 1 1 A PHE 0.550 1 ATOM 21 C CA . PHE 688 688 ? A 9.233 6.808 42.207 1 1 A PHE 0.550 1 ATOM 22 C C . PHE 688 688 ? A 9.333 6.910 40.679 1 1 A PHE 0.550 1 ATOM 23 O O . PHE 688 688 ? A 9.981 6.112 40.026 1 1 A PHE 0.550 1 ATOM 24 C CB . PHE 688 688 ? A 7.760 6.548 42.640 1 1 A PHE 0.550 1 ATOM 25 C CG . PHE 688 688 ? A 7.187 5.298 42.033 1 1 A PHE 0.550 1 ATOM 26 C CD1 . PHE 688 688 ? A 6.260 5.379 40.980 1 1 A PHE 0.550 1 ATOM 27 C CD2 . PHE 688 688 ? A 7.578 4.037 42.503 1 1 A PHE 0.550 1 ATOM 28 C CE1 . PHE 688 688 ? A 5.712 4.218 40.424 1 1 A PHE 0.550 1 ATOM 29 C CE2 . PHE 688 688 ? A 7.026 2.873 41.955 1 1 A PHE 0.550 1 ATOM 30 C CZ . PHE 688 688 ? A 6.089 2.964 40.918 1 1 A PHE 0.550 1 ATOM 31 N N . SER 689 689 ? A 8.697 7.950 40.088 1 1 A SER 0.610 1 ATOM 32 C CA . SER 689 689 ? A 8.718 8.223 38.660 1 1 A SER 0.610 1 ATOM 33 C C . SER 689 689 ? A 9.480 9.541 38.529 1 1 A SER 0.610 1 ATOM 34 O O . SER 689 689 ? A 8.969 10.573 38.983 1 1 A SER 0.610 1 ATOM 35 C CB . SER 689 689 ? A 7.267 8.325 38.095 1 1 A SER 0.610 1 ATOM 36 O OG . SER 689 689 ? A 7.227 8.744 36.733 1 1 A SER 0.610 1 ATOM 37 N N . PRO 690 690 ? A 10.724 9.554 38.008 1 1 A PRO 0.630 1 ATOM 38 C CA . PRO 690 690 ? A 11.506 10.765 37.803 1 1 A PRO 0.630 1 ATOM 39 C C . PRO 690 690 ? A 10.904 11.686 36.772 1 1 A PRO 0.630 1 ATOM 40 O O . PRO 690 690 ? A 10.783 12.883 37.050 1 1 A PRO 0.630 1 ATOM 41 C CB . PRO 690 690 ? A 12.895 10.269 37.331 1 1 A PRO 0.630 1 ATOM 42 C CG . PRO 690 690 ? A 13.041 8.887 37.973 1 1 A PRO 0.630 1 ATOM 43 C CD . PRO 690 690 ? 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'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.572 2 1 3 0.011 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 686 ARG 1 0.490 2 1 A 687 MET 1 0.380 3 1 A 688 PHE 1 0.550 4 1 A 689 SER 1 0.610 5 1 A 690 PRO 1 0.630 6 1 A 691 MET 1 0.650 7 1 A 692 GLU 1 0.620 8 1 A 693 GLU 1 0.640 9 1 A 694 LYS 1 0.600 10 1 A 695 GLU 1 0.590 11 1 A 696 LEU 1 0.620 12 1 A 697 LEU 1 0.620 13 1 A 698 SER 1 0.510 14 1 A 699 PRO 1 0.540 15 1 A 700 LEU 1 0.610 16 1 A 701 SER 1 0.610 17 1 A 702 GLU 1 0.600 18 1 A 703 PRO 1 0.600 19 1 A 704 ASP 1 0.600 20 1 A 705 ASP 1 0.580 21 1 A 706 ARG 1 0.490 22 1 A 707 TYR 1 0.520 23 1 A 708 PRO 1 0.600 24 1 A 709 LEU 1 0.570 25 1 A 710 ILE 1 0.470 26 1 A 711 VAL 1 0.370 27 1 A 712 LYS 1 0.470 28 1 A 713 ILE 1 0.520 29 1 A 714 ASP 1 0.570 30 1 A 715 LEU 1 0.640 31 1 A 716 ASN 1 0.630 32 1 A 717 LEU 1 0.630 33 1 A 718 LEU 1 0.650 34 1 A 719 THR 1 0.700 35 1 A 720 ARG 1 0.650 36 1 A 721 ILE 1 0.690 37 1 A 722 PRO 1 0.670 38 1 A 723 GLY 1 0.640 39 1 A 724 LYS 1 0.620 40 1 A 725 PRO 1 0.560 41 1 A 726 TYR 1 0.560 42 1 A 727 LYS 1 0.610 43 1 A 728 GLU 1 0.630 44 1 A 729 THR 1 0.660 45 1 A 730 GLU 1 0.590 46 1 A 731 PRO 1 0.540 47 1 A 732 PRO 1 0.460 48 1 A 733 LYS 1 0.340 49 1 A 734 GLY 1 0.310 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #