data_SMR-14943e9946005de6a271bde4c2c25da3_1 _entry.id SMR-14943e9946005de6a271bde4c2c25da3_1 _struct.entry_id SMR-14943e9946005de6a271bde4c2c25da3_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled homo-dimer covers following UniProtKB entries: - P36956 (isoform 2)/ SRBP1_HUMAN, Sterol regulatory element-binding protein 1 Estimated model accuracy of this model is 0.031, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P36956 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 5 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 145953.310 2 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP SRBP1_HUMAN P36956 1 ;MDEPPFSEAALEQALGEPCDLDAALLTDIEGEVGAGRGRANGLDAPRAGADRGAMDCTFEDMLQLINNQD SDFPGLFDPPYAGSGAGGTDPASPDTSSPGSLSPPPATLSSSLEAFLSGPQAAPSPLSPPQPAPTPLKMY PSMPAFSPGPGIKEESVPLSILQTPTPQPLPGALLPQSFPAPAPPQFSSTPVLGYPSPPGGFSTGSPPGN TQQPLPGLPLASPPGVPPVSLHTQVQSVVPQQLLTVTAAPTAAPVTTTVTSQIQQVPVLLQPHFIKADSL LLTAMKTDGATVKAAGLSPLVSGTTVQTGPLPTLVSGGTILATVPLVVDAEKLPINRLAAGSKAPASAQS RGEKRTAHNAIEKRYRSSINDKIIELKDLVVGTEAKLNKSAVLRKAIDYIRFLQHSNQKLKQENLSLRTA VHKSKSLKDLVSACGSGGNTDVLMEGVKTEVEDTLTPPPSDAGSPFQSSPLSLGSRGSGSGGSGSDSEPD SPVFEDSKAKPEQRPSLHSRGMLDRSRLALCTLVFLCLSCNPLASLLGARGLPSPSDTTSVYHSPGRNVL GTESRDGPGWAQWLLPPVVWLLNGLLVLVSLVLLFVYGEPVTRPHSGPAVYFWRHRKQADLDLARGDFAQ AAQQLWLALRALGRPLPTSHLDLACSLLWNLIRHLLQRLWVGRWLAGRAGGLQQDCALRVDASASARDAA LVYHKLHQLHTMGKHTGGHLTATNLALSALNLAECAGDAVSVATLAEIYVAAALRVKTSLPRALHFLTRF FLSSARQACLAQSGSVPPAMQWLCHPVGHRFFVDGDWSVLSTPWESLYSLAGNPVDPLAQVTQLFREHLL ERALNCVTQPNPSPGSADGDKEFSDALGYLQLLNSCSDAAGAPAYSFSISSSMATTTGVDPVAKWWASLT AVVIHWLRRDEEAAERLCPLVEHLPRVLQESERPLPRAALHSFKAARALLGCAKAESGPASLTICEKASG YLQDSLATTPASSSIDKAVQLFLCDLLLVVRTSLWRQQQPPAPAPAAQGTSSRPQASALELRGFQRDLSS LRRLAQSFRPAMRRVFLHEATARLMAGASPTRTHQLLDRSLRRRAGPGGKGGAVAELEPRPTRREHAEAL LLASCYLPPGFLSAPGQRVGMLAEAARTLEKLGDRRLLHDCQQMLMRLGGGTTVTSS ; 'Sterol regulatory element-binding protein 1' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1177 1 1177 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . SRBP1_HUMAN P36956 P36956-2 1 1177 9606 'Homo sapiens (Human)' 2008-02-05 1C9257FFC7FC7FEB # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A,B ;MDEPPFSEAALEQALGEPCDLDAALLTDIEGEVGAGRGRANGLDAPRAGADRGAMDCTFEDMLQLINNQD SDFPGLFDPPYAGSGAGGTDPASPDTSSPGSLSPPPATLSSSLEAFLSGPQAAPSPLSPPQPAPTPLKMY PSMPAFSPGPGIKEESVPLSILQTPTPQPLPGALLPQSFPAPAPPQFSSTPVLGYPSPPGGFSTGSPPGN TQQPLPGLPLASPPGVPPVSLHTQVQSVVPQQLLTVTAAPTAAPVTTTVTSQIQQVPVLLQPHFIKADSL LLTAMKTDGATVKAAGLSPLVSGTTVQTGPLPTLVSGGTILATVPLVVDAEKLPINRLAAGSKAPASAQS RGEKRTAHNAIEKRYRSSINDKIIELKDLVVGTEAKLNKSAVLRKAIDYIRFLQHSNQKLKQENLSLRTA VHKSKSLKDLVSACGSGGNTDVLMEGVKTEVEDTLTPPPSDAGSPFQSSPLSLGSRGSGSGGSGSDSEPD SPVFEDSKAKPEQRPSLHSRGMLDRSRLALCTLVFLCLSCNPLASLLGARGLPSPSDTTSVYHSPGRNVL GTESRDGPGWAQWLLPPVVWLLNGLLVLVSLVLLFVYGEPVTRPHSGPAVYFWRHRKQADLDLARGDFAQ 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VHKSKSLKDLVSACGSGGNTDVLMEGVKTEVEDTLTPPPSDAGSPFQSSPLSLGSRGSGSGGSGSDSEPD SPVFEDSKAKPEQRPSLHSRGMLDRSRLALCTLVFLCLSCNPLASLLGARGLPSPSDTTSVYHSPGRNVL GTESRDGPGWAQWLLPPVVWLLNGLLVLVSLVLLFVYGEPVTRPHSGPAVYFWRHRKQADLDLARGDFAQ AAQQLWLALRALGRPLPTSHLDLACSLLWNLIRHLLQRLWVGRWLAGRAGGLQQDCALRVDASASARDAA LVYHKLHQLHTMGKHTGGHLTATNLALSALNLAECAGDAVSVATLAEIYVAAALRVKTSLPRALHFLTRF FLSSARQACLAQSGSVPPAMQWLCHPVGHRFFVDGDWSVLSTPWESLYSLAGNPVDPLAQVTQLFREHLL ERALNCVTQPNPSPGSADGDKEFSDALGYLQLLNSCSDAAGAPAYSFSISSSMATTTGVDPVAKWWASLT AVVIHWLRRDEEAAERLCPLVEHLPRVLQESERPLPRAALHSFKAARALLGCAKAESGPASLTICEKASG YLQDSLATTPASSSIDKAVQLFLCDLLLVVRTSLWRQQQPPAPAPAAQGTSSRPQASALELRGFQRDLSS LRRLAQSFRPAMRRVFLHEATARLMAGASPTRTHQLLDRSLRRRAGPGGKGGAVAELEPRPTRREHAEAL LLASCYLPPGFLSAPGQRVGMLAEAARTLEKLGDRRLLHDCQQMLMRLGGGTTVTSS ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 ASP . 1 3 GLU . 1 4 PRO . 1 5 PRO . 1 6 PHE . 1 7 SER . 1 8 GLU . 1 9 ALA . 1 10 ALA . 1 11 LEU . 1 12 GLU . 1 13 GLN . 1 14 ALA . 1 15 LEU . 1 16 GLY . 1 17 GLU . 1 18 PRO . 1 19 CYS . 1 20 ASP . 1 21 LEU . 1 22 ASP . 1 23 ALA . 1 24 ALA . 1 25 LEU . 1 26 LEU . 1 27 THR . 1 28 ASP . 1 29 ILE . 1 30 GLU . 1 31 GLY . 1 32 GLU . 1 33 VAL . 1 34 GLY . 1 35 ALA . 1 36 GLY . 1 37 ARG . 1 38 GLY . 1 39 ARG . 1 40 ALA . 1 41 ASN . 1 42 GLY . 1 43 LEU . 1 44 ASP . 1 45 ALA . 1 46 PRO . 1 47 ARG . 1 48 ALA . 1 49 GLY . 1 50 ALA . 1 51 ASP . 1 52 ARG . 1 53 GLY . 1 54 ALA . 1 55 MET . 1 56 ASP . 1 57 CYS . 1 58 THR . 1 59 PHE . 1 60 GLU . 1 61 ASP . 1 62 MET . 1 63 LEU . 1 64 GLN . 1 65 LEU . 1 66 ILE . 1 67 ASN . 1 68 ASN . 1 69 GLN . 1 70 ASP . 1 71 SER . 1 72 ASP . 1 73 PHE . 1 74 PRO . 1 75 GLY . 1 76 LEU . 1 77 PHE . 1 78 ASP . 1 79 PRO . 1 80 PRO . 1 81 TYR . 1 82 ALA . 1 83 GLY . 1 84 SER . 1 85 GLY . 1 86 ALA . 1 87 GLY . 1 88 GLY . 1 89 THR . 1 90 ASP . 1 91 PRO . 1 92 ALA . 1 93 SER . 1 94 PRO . 1 95 ASP . 1 96 THR . 1 97 SER . 1 98 SER . 1 99 PRO . 1 100 GLY . 1 101 SER . 1 102 LEU . 1 103 SER . 1 104 PRO . 1 105 PRO . 1 106 PRO . 1 107 ALA . 1 108 THR . 1 109 LEU . 1 110 SER . 1 111 SER . 1 112 SER . 1 113 LEU . 1 114 GLU . 1 115 ALA . 1 116 PHE . 1 117 LEU . 1 118 SER . 1 119 GLY . 1 120 PRO . 1 121 GLN . 1 122 ALA . 1 123 ALA . 1 124 PRO . 1 125 SER . 1 126 PRO . 1 127 LEU . 1 128 SER . 1 129 PRO . 1 130 PRO . 1 131 GLN . 1 132 PRO . 1 133 ALA . 1 134 PRO . 1 135 THR . 1 136 PRO . 1 137 LEU . 1 138 LYS . 1 139 MET . 1 140 TYR . 1 141 PRO . 1 142 SER . 1 143 MET . 1 144 PRO . 1 145 ALA . 1 146 PHE . 1 147 SER . 1 148 PRO . 1 149 GLY . 1 150 PRO . 1 151 GLY . 1 152 ILE . 1 153 LYS . 1 154 GLU . 1 155 GLU . 1 156 SER . 1 157 VAL . 1 158 PRO . 1 159 LEU . 1 160 SER . 1 161 ILE . 1 162 LEU . 1 163 GLN . 1 164 THR . 1 165 PRO . 1 166 THR . 1 167 PRO . 1 168 GLN . 1 169 PRO . 1 170 LEU . 1 171 PRO . 1 172 GLY . 1 173 ALA . 1 174 LEU . 1 175 LEU . 1 176 PRO . 1 177 GLN . 1 178 SER . 1 179 PHE . 1 180 PRO . 1 181 ALA . 1 182 PRO . 1 183 ALA . 1 184 PRO . 1 185 PRO . 1 186 GLN . 1 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B 1 1027 ALA 1027 ? ? ? B . B 1 1028 GLN 1028 ? ? ? B . B 1 1029 GLY 1029 ? ? ? B . B 1 1030 THR 1030 ? ? ? B . B 1 1031 SER 1031 ? ? ? B . B 1 1032 SER 1032 ? ? ? B . B 1 1033 ARG 1033 ? ? ? B . B 1 1034 PRO 1034 ? ? ? B . B 1 1035 GLN 1035 ? ? ? B . B 1 1036 ALA 1036 ? ? ? B . B 1 1037 SER 1037 ? ? ? B . B 1 1038 ALA 1038 ? ? ? B . B 1 1039 LEU 1039 ? ? ? B . B 1 1040 GLU 1040 ? ? ? B . B 1 1041 LEU 1041 ? ? ? B . B 1 1042 ARG 1042 ? ? ? B . B 1 1043 GLY 1043 ? ? ? B . B 1 1044 PHE 1044 ? ? ? B . B 1 1045 GLN 1045 ? ? ? B . B 1 1046 ARG 1046 ? ? ? B . B 1 1047 ASP 1047 ? ? ? B . B 1 1048 LEU 1048 ? ? ? B . B 1 1049 SER 1049 ? ? ? B . B 1 1050 SER 1050 ? ? ? B . B 1 1051 LEU 1051 ? ? ? B . B 1 1052 ARG 1052 ? ? ? B . B 1 1053 ARG 1053 ? ? ? B . B 1 1054 LEU 1054 ? ? ? B . B 1 1055 ALA 1055 ? ? ? B . B 1 1056 GLN 1056 ? ? ? B . B 1 1057 SER 1057 ? ? ? B . B 1 1058 PHE 1058 ? ? ? B . B 1 1059 ARG 1059 ? ? ? B . B 1 1060 PRO 1060 ? ? ? B . B 1 1061 ALA 1061 ? ? ? B . B 1 1062 MET 1062 ? ? ? B . B 1 1063 ARG 1063 ? ? ? B . B 1 1064 ARG 1064 ? ? ? B . B 1 1065 VAL 1065 ? ? ? B . B 1 1066 PHE 1066 ? ? ? B . B 1 1067 LEU 1067 ? ? ? B . B 1 1068 HIS 1068 ? ? ? B . B 1 1069 GLU 1069 ? ? ? B . B 1 1070 ALA 1070 ? ? ? B . B 1 1071 THR 1071 ? ? ? B . B 1 1072 ALA 1072 ? ? ? B . B 1 1073 ARG 1073 ? ? ? B . B 1 1074 LEU 1074 ? ? ? B . B 1 1075 MET 1075 ? ? ? B . B 1 1076 ALA 1076 ? ? ? B . B 1 1077 GLY 1077 ? ? ? B . B 1 1078 ALA 1078 ? ? ? B . B 1 1079 SER 1079 ? ? ? B . B 1 1080 PRO 1080 ? ? ? B . B 1 1081 THR 1081 ? ? ? B . B 1 1082 ARG 1082 ? ? ? B . B 1 1083 THR 1083 ? ? ? B . B 1 1084 HIS 1084 ? ? ? B . B 1 1085 GLN 1085 ? ? ? B . B 1 1086 LEU 1086 ? ? ? B . B 1 1087 LEU 1087 ? ? ? B . B 1 1088 ASP 1088 ? ? ? B . B 1 1089 ARG 1089 ? ? ? B . B 1 1090 SER 1090 ? ? ? B . B 1 1091 LEU 1091 ? ? ? B . B 1 1092 ARG 1092 ? ? ? B . B 1 1093 ARG 1093 ? ? ? B . B 1 1094 ARG 1094 ? ? ? B . B 1 1095 ALA 1095 ? ? ? B . B 1 1096 GLY 1096 ? ? ? B . B 1 1097 PRO 1097 ? ? ? B . B 1 1098 GLY 1098 ? ? ? B . B 1 1099 GLY 1099 ? ? ? B . B 1 1100 LYS 1100 ? ? ? B . B 1 1101 GLY 1101 ? ? ? B . B 1 1102 GLY 1102 ? ? ? B . B 1 1103 ALA 1103 ? ? ? B . B 1 1104 VAL 1104 ? ? ? B . B 1 1105 ALA 1105 ? ? ? B . B 1 1106 GLU 1106 ? ? ? B . B 1 1107 LEU 1107 ? ? ? B . B 1 1108 GLU 1108 ? ? ? B . B 1 1109 PRO 1109 ? ? ? B . B 1 1110 ARG 1110 ? ? ? B . B 1 1111 PRO 1111 ? ? ? B . B 1 1112 THR 1112 ? ? ? B . B 1 1113 ARG 1113 ? ? ? B . B 1 1114 ARG 1114 ? ? ? B . B 1 1115 GLU 1115 ? ? ? B . B 1 1116 HIS 1116 ? ? ? B . B 1 1117 ALA 1117 ? ? ? B . B 1 1118 GLU 1118 ? ? ? B . B 1 1119 ALA 1119 ? ? ? B . B 1 1120 LEU 1120 ? ? ? B . B 1 1121 LEU 1121 ? ? ? B . B 1 1122 LEU 1122 ? ? ? B . B 1 1123 ALA 1123 ? ? ? B . B 1 1124 SER 1124 ? ? ? B . B 1 1125 CYS 1125 ? ? ? B . B 1 1126 TYR 1126 ? ? ? B . B 1 1127 LEU 1127 ? ? ? B . B 1 1128 PRO 1128 ? ? ? B . B 1 1129 PRO 1129 ? ? ? B . B 1 1130 GLY 1130 ? ? ? B . B 1 1131 PHE 1131 ? ? ? B . B 1 1132 LEU 1132 ? ? ? B . B 1 1133 SER 1133 ? ? ? B . B 1 1134 ALA 1134 ? ? ? B . B 1 1135 PRO 1135 ? ? ? B . B 1 1136 GLY 1136 ? ? ? B . B 1 1137 GLN 1137 ? ? ? B . B 1 1138 ARG 1138 ? ? ? B . B 1 1139 VAL 1139 ? ? ? B . B 1 1140 GLY 1140 ? ? ? B . B 1 1141 MET 1141 ? ? ? B . B 1 1142 LEU 1142 ? ? ? B . B 1 1143 ALA 1143 ? ? ? B . B 1 1144 GLU 1144 ? ? ? B . B 1 1145 ALA 1145 ? ? ? B . B 1 1146 ALA 1146 ? ? ? B . B 1 1147 ARG 1147 ? ? ? B . B 1 1148 THR 1148 ? ? ? B . B 1 1149 LEU 1149 ? ? ? B . B 1 1150 GLU 1150 ? ? ? B . B 1 1151 LYS 1151 ? ? ? B . B 1 1152 LEU 1152 ? ? ? B . B 1 1153 GLY 1153 ? ? ? B . B 1 1154 ASP 1154 ? ? ? B . B 1 1155 ARG 1155 ? ? ? B . B 1 1156 ARG 1156 ? ? ? B . B 1 1157 LEU 1157 ? ? ? B . B 1 1158 LEU 1158 ? ? ? B . B 1 1159 HIS 1159 ? ? ? B . B 1 1160 ASP 1160 ? ? ? B . B 1 1161 CYS 1161 ? ? ? B . B 1 1162 GLN 1162 ? ? ? B . B 1 1163 GLN 1163 ? ? ? B . B 1 1164 MET 1164 ? ? ? B . B 1 1165 LEU 1165 ? ? ? B . B 1 1166 MET 1166 ? ? ? B . B 1 1167 ARG 1167 ? ? ? B . B 1 1168 LEU 1168 ? ? ? B . B 1 1169 GLY 1169 ? ? ? B . B 1 1170 GLY 1170 ? ? ? B . B 1 1171 GLY 1171 ? ? ? B . B 1 1172 THR 1172 ? ? ? B . B 1 1173 THR 1173 ? ? ? B . B 1 1174 VAL 1174 ? ? ? B . B 1 1175 THR 1175 ? ? ? B . B 1 1176 SER 1176 ? ? ? B . B 1 1177 SER 1177 ? ? ? B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'MICROPHTHALMIA-ASSOCIATED TRANSCRIPTION FACTOR {PDB ID=4atk, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=4atk.1.A}' 'template structure' . 2 'MICROPHTHALMIA-ASSOCIATED TRANSCRIPTION FACTOR {PDB ID=4atk, label_asym_id=B, auth_asym_id=B, SMTL ID=4atk.1.B}' 'template structure' . 3 . target . 4 'Target-template alignment by BLAST to 4atk, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 5 'Target-template alignment by BLAST to 4atk, label_asym_id=B' 'target-template alignment' . 6 'model 1' 'model coordinates' . 7 SMTL 'reference database' . 8 PDB 'reference database' . 9 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 3 2 1 7 3 1 8 4 2 9 5 3 3 6 3 1 7 3 2 8 3 4 9 3 5 10 4 1 11 4 2 12 4 4 13 4 5 14 5 6 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 7 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-25 8 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-20 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 3 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . B 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A 2 2 'reference database' polymer 1 2 B B 1 1 B # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;ANIKRELTACIFPTESEARALAKERQKKDNHNLIERRRRFNINDRIKELGTLIPKSNDPDMRWNKGTILK ASVDYIRKLQREQQRAKDLENRQKKLEHANRHLLLRVQELEMQARAHG ; ;ANIKRELTACIFPTESEARALAKERQKKDNHNLIERRRRFNINDRIKELGTLIPKSNDPDMRWNKGTILK ASVDYIRKLQREQQRAKDLENRQKKLEHANRHLLLRVQELEMQARAHG ; 2 ;ANIKRELTACIFPTESEARALAKERQKKDNHNLIERRRRFNINDRIKELGTLIPKSNDPDMRWNKGTILK ASVDYIRKLQREQQRAKDLENRQKKLEHANRHLLLRVQELEMQARAHG ; ;ANIKRELTACIFPTESEARALAKERQKKDNHNLIERRRRFNINDRIKELGTLIPKSNDPDMRWNKGTILK ASVDYIRKLQREQQRAKDLENRQKKLEHANRHLLLRVQELEMQARAHG ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 16 103 2 2 16 103 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 4atk 2023-12-20 2 PDB . 4atk 2023-12-20 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1177 2 2 B 1 1177 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 4 1 1180 'target-template pairwise alignment' local 2 5 1 1180 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'BLAST e-value' . 1.63e-07 37.647 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . 2 2 2 B 'BLAST e-value' . 1.63e-07 37.647 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MDEPPFSEAALEQALGEPCDLDAALLTDIEGEVGAGRGRANGLDAPRAGADRGAMDCTFEDMLQLINNQDSDFPGLFDPPYAGSGAGGTDPASPDTSSPGSLSPPPATLSSSLEAFLSGPQAAPSPLSPPQPAPTPLKMYPSMPAFSPGPGIKEESVPLSILQTPTPQPLPGALLPQSFPAPAPPQFSSTPVLGYPSPPGGFSTGSPPGNTQQPLPGLPLASPPGVPPVSLHTQVQSVVPQQLLTVTAAPTAAPVTTTVTSQIQQVPVLLQPHFIKADSLLLTAMKTDGATVKAAGLSPLVSGTTVQTGPLPTLVSGGTILATVPLVVDAEKLPINRLAAGSKAPASAQSRGEKRTAHNAIEKRYRSSINDKIIELKDLVVGT---EAKLNKSAVLRKAIDYIRFLQHSNQKLKQENLSLRTAVHKSKSLKDLVSACGSGGNTDVLMEGVKTEVEDTLTPPPSDAGSPFQSSPLSLGSRGSGSGGSGSDSEPDSPVFEDSKAKPEQRPSLHSRGMLDRSRLALCTLVFLCLSCNPLASLLGARGLPSPSDTTSVYHSPGRNVLGTESRDGPGWAQWLLPPVVWLLNGLLVLVSLVLLFVYGEPVTRPHSGPAVYFWRHRKQADLDLARGDFAQAAQQLWLALRALGRPLPTSHLDLACSLLWNLIRHLLQRLWVGRWLAGRAGGLQQDCALRVDASASARDAALVYHKLHQLHTMGKHTGGHLTATNLALSALNLAECAGDAVSVATLAEIYVAAALRVKTSLPRALHFLTRFFLSSARQACLAQSGSVPPAMQWLCHPVGHRFFVDGDWSVLSTPWESLYSLAGNPVDPLAQVTQLFREHLLERALNCVTQPNPSPGSADGDKEFSDALGYLQLLNSCSDAAGAPAYSFSISSSMATTTGVDPVAKWWASLTAVVIHWLRRDEEAAERLCPLVEHLPRVLQESERPLPRAALHSFKAARALLGCAKAESGPASLTICEKASGYLQDSLATTPASSSIDKAVQLFLCDLLLVVRTSLWRQQQPPAPAPAAQGTSSRPQASALELRGFQRDLSSLRRLAQSFRPAMRRVFLHEATARLMAGASPTRTHQLLDRSLRRRAGPGGKGGAVAELEPRPTRREHAEALLLASCYLPPGFLSAPGQRVGMLAEAARTLEKLGDRRLLHDCQQMLMRLGGGTTVTSS 2 1 2 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------SEARALAKER-QKKDNHNLIERRRRFNINDRIKELGTLIPKSNDPDMRWNKGTILKASVDYIRKLQREQQRAKDLENRQKKLEHANRHL------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ 3 2 1 MDEPPFSEAALEQALGEPCDLDAALLTDIEGEVGAGRGRANGLDAPRAGADRGAMDCTFEDMLQLINNQDSDFPGLFDPPYAGSGAGGTDPASPDTSSPGSLSPPPATLSSSLEAFLSGPQAAPSPLSPPQPAPTPLKMYPSMPAFSPGPGIKEESVPLSILQTPTPQPLPGALLPQSFPAPAPPQFSSTPVLGYPSPPGGFSTGSPPGNTQQPLPGLPLASPPGVPPVSLHTQVQSVVPQQLLTVTAAPTAAPVTTTVTSQIQQVPVLLQPHFIKADSLLLTAMKTDGATVKAAGLSPLVSGTTVQTGPLPTLVSGGTILATVPLVVDAEKLPINRLAAGSKAPASAQSRGEKRTAHNAIEKRYRSSINDKIIELKDLVVGT---EAKLNKSAVLRKAIDYIRFLQHSNQKLKQENLSLRTAVHKSKSLKDLVSACGSGGNTDVLMEGVKTEVEDTLTPPPSDAGSPFQSSPLSLGSRGSGSGGSGSDSEPDSPVFEDSKAKPEQRPSLHSRGMLDRSRLALCTLVFLCLSCNPLASLLGARGLPSPSDTTSVYHSPGRNVLGTESRDGPGWAQWLLPPVVWLLNGLLVLVSLVLLFVYGEPVTRPHSGPAVYFWRHRKQADLDLARGDFAQAAQQLWLALRALGRPLPTSHLDLACSLLWNLIRHLLQRLWVGRWLAGRAGGLQQDCALRVDASASARDAALVYHKLHQLHTMGKHTGGHLTATNLALSALNLAECAGDAVSVATLAEIYVAAALRVKTSLPRALHFLTRFFLSSARQACLAQSGSVPPAMQWLCHPVGHRFFVDGDWSVLSTPWESLYSLAGNPVDPLAQVTQLFREHLLERALNCVTQPNPSPGSADGDKEFSDALGYLQLLNSCSDAAGAPAYSFSISSSMATTTGVDPVAKWWASLTAVVIHWLRRDEEAAERLCPLVEHLPRVLQESERPLPRAALHSFKAARALLGCAKAESGPASLTICEKASGYLQDSLATTPASSSIDKAVQLFLCDLLLVVRTSLWRQQQPPAPAPAAQGTSSRPQASALELRGFQRDLSSLRRLAQSFRPAMRRVFLHEATARLMAGASPTRTHQLLDRSLRRRAGPGGKGGAVAELEPRPTRREHAEALLLASCYLPPGFLSAPGQRVGMLAEAARTLEKLGDRRLLHDCQQMLMRLGGGTTVTSS 4 2 2 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------SEARALAKER-QKKDNHNLIERRRRFNINDRIKELGTLIPKSNDPDMRWNKGTILKASVDYIRKLQREQQRAKDLENRQKKLEHANRHL------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.334}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 4atk.1, oligomeric state (homo-dimer) as predicted' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 1' . 6 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . THR 356 356 ? A 19.263 19.291 29.964 1 1 A THR 0.550 1 ATOM 2 C CA . THR 356 356 ? A 19.607 17.837 29.739 1 1 A THR 0.550 1 ATOM 3 C C . THR 356 356 ? A 21.079 17.657 29.393 1 1 A THR 0.550 1 ATOM 4 O O . THR 356 356 ? A 21.475 17.931 28.270 1 1 A THR 0.550 1 ATOM 5 C CB . THR 356 356 ? A 18.733 17.290 28.597 1 1 A THR 0.550 1 ATOM 6 O OG1 . THR 356 356 ? A 18.743 18.151 27.450 1 1 A THR 0.550 1 ATOM 7 C CG2 . THR 356 356 ? A 17.263 17.183 29.039 1 1 A THR 0.550 1 ATOM 8 N N . ALA 357 357 ? A 21.952 17.222 30.343 1 1 A ALA 0.560 1 ATOM 9 C CA . ALA 357 357 ? A 23.389 17.153 30.104 1 1 A ALA 0.560 1 ATOM 10 C C . ALA 357 357 ? A 23.797 16.174 29.001 1 1 A ALA 0.560 1 ATOM 11 O O . ALA 357 357 ? A 24.536 16.521 28.086 1 1 A ALA 0.560 1 ATOM 12 C CB . ALA 357 357 ? A 24.084 16.779 31.434 1 1 A ALA 0.560 1 ATOM 13 N N . HIS 358 358 ? A 23.252 14.940 29.042 1 1 A HIS 0.630 1 ATOM 14 C CA . HIS 358 358 ? A 23.549 13.888 28.075 1 1 A HIS 0.630 1 ATOM 15 C C . HIS 358 358 ? A 23.067 14.176 26.646 1 1 A HIS 0.630 1 ATOM 16 O O . HIS 358 358 ? A 23.794 14.078 25.657 1 1 A HIS 0.630 1 ATOM 17 C CB . HIS 358 358 ? A 22.919 12.548 28.550 1 1 A HIS 0.630 1 ATOM 18 C CG . HIS 358 358 ? A 23.622 11.328 28.060 1 1 A HIS 0.630 1 ATOM 19 N ND1 . HIS 358 358 ? A 24.510 11.466 27.038 1 1 A HIS 0.630 1 ATOM 20 C CD2 . HIS 358 358 ? A 23.519 10.017 28.425 1 1 A HIS 0.630 1 ATOM 21 C CE1 . HIS 358 358 ? A 24.944 10.254 26.767 1 1 A HIS 0.630 1 ATOM 22 N NE2 . HIS 358 358 ? A 24.374 9.343 27.585 1 1 A HIS 0.630 1 ATOM 23 N N . ASN 359 359 ? A 21.811 14.633 26.509 1 1 A ASN 0.660 1 ATOM 24 C CA . ASN 359 359 ? A 21.148 14.830 25.227 1 1 A ASN 0.660 1 ATOM 25 C C . ASN 359 359 ? A 21.873 15.808 24.290 1 1 A ASN 0.660 1 ATOM 26 O O . ASN 359 359 ? A 21.901 15.629 23.076 1 1 A ASN 0.660 1 ATOM 27 C CB . ASN 359 359 ? A 19.693 15.343 25.426 1 1 A ASN 0.660 1 ATOM 28 C CG . ASN 359 359 ? A 18.803 14.371 26.197 1 1 A ASN 0.660 1 ATOM 29 O OD1 . ASN 359 359 ? A 19.195 13.251 26.532 1 1 A ASN 0.660 1 ATOM 30 N ND2 . ASN 359 359 ? A 17.567 14.804 26.539 1 1 A ASN 0.660 1 ATOM 31 N N . ALA 360 360 ? A 22.448 16.879 24.865 1 1 A ALA 0.630 1 ATOM 32 C CA . ALA 360 360 ? A 23.314 17.825 24.186 1 1 A ALA 0.630 1 ATOM 33 C C . ALA 360 360 ? A 24.679 17.260 23.843 1 1 A ALA 0.630 1 ATOM 34 O O . ALA 360 360 ? A 25.236 17.645 22.798 1 1 A ALA 0.630 1 ATOM 35 C CB . ALA 360 360 ? A 23.560 19.066 25.054 1 1 A ALA 0.630 1 ATOM 36 N N . ILE 361 361 ? A 25.283 16.388 24.632 1 1 A ILE 0.600 1 ATOM 37 C CA . ILE 361 361 ? A 26.544 15.722 24.309 1 1 A ILE 0.600 1 ATOM 38 C C . ILE 361 361 ? A 26.377 14.721 23.160 1 1 A ILE 0.600 1 ATOM 39 O O . ILE 361 361 ? A 27.189 14.708 22.232 1 1 A ILE 0.600 1 ATOM 40 C CB . ILE 361 361 ? A 27.343 15.135 25.473 1 1 A ILE 0.600 1 ATOM 41 C CG1 . ILE 361 361 ? A 27.354 16.073 26.718 1 1 A ILE 0.600 1 ATOM 42 C CG2 . ILE 361 361 ? A 28.743 14.741 24.940 1 1 A ILE 0.600 1 ATOM 43 C CD1 . ILE 361 361 ? A 28.648 16.823 27.038 1 1 A ILE 0.600 1 ATOM 44 N N . GLU 362 362 ? A 25.300 13.925 23.133 1 1 A GLU 0.570 1 ATOM 45 C CA . GLU 362 362 ? A 24.983 13.035 22.035 1 1 A GLU 0.570 1 ATOM 46 C C . GLU 362 362 ? A 24.437 13.751 20.801 1 1 A GLU 0.570 1 ATOM 47 O O . GLU 362 362 ? A 24.581 13.285 19.679 1 1 A GLU 0.570 1 ATOM 48 C CB . GLU 362 362 ? A 24.009 11.933 22.489 1 1 A GLU 0.570 1 ATOM 49 C CG . GLU 362 362 ? A 24.600 11.073 23.626 1 1 A GLU 0.570 1 ATOM 50 C CD . GLU 362 362 ? A 25.876 10.374 23.173 1 1 A GLU 0.570 1 ATOM 51 O OE1 . GLU 362 362 ? A 25.773 9.420 22.365 1 1 A GLU 0.570 1 ATOM 52 O OE2 . GLU 362 362 ? A 26.967 10.824 23.616 1 1 A GLU 0.570 1 ATOM 53 N N . LYS 363 363 ? A 23.873 14.966 20.965 1 1 A LYS 0.590 1 ATOM 54 C CA . LYS 363 363 ? A 23.577 15.879 19.862 1 1 A LYS 0.590 1 ATOM 55 C C . LYS 363 363 ? A 24.824 16.261 19.065 1 1 A LYS 0.590 1 ATOM 56 O O . LYS 363 363 ? A 24.790 16.352 17.839 1 1 A LYS 0.590 1 ATOM 57 C CB . LYS 363 363 ? A 22.941 17.197 20.374 1 1 A LYS 0.590 1 ATOM 58 C CG . LYS 363 363 ? A 22.505 18.228 19.311 1 1 A LYS 0.590 1 ATOM 59 C CD . LYS 363 363 ? A 22.037 19.546 19.956 1 1 A LYS 0.590 1 ATOM 60 C CE . LYS 363 363 ? A 21.685 20.611 18.914 1 1 A LYS 0.590 1 ATOM 61 N NZ . LYS 363 363 ? A 21.187 21.847 19.560 1 1 A LYS 0.590 1 ATOM 62 N N . ARG 364 364 ? A 25.945 16.488 19.773 1 1 A ARG 0.630 1 ATOM 63 C CA . ARG 364 364 ? A 27.276 16.695 19.218 1 1 A ARG 0.630 1 ATOM 64 C C . ARG 364 364 ? A 27.869 15.457 18.573 1 1 A ARG 0.630 1 ATOM 65 O O . ARG 364 364 ? A 28.554 15.534 17.556 1 1 A ARG 0.630 1 ATOM 66 C CB . ARG 364 364 ? A 28.331 17.132 20.250 1 1 A ARG 0.630 1 ATOM 67 C CG . ARG 364 364 ? A 27.980 18.377 21.072 1 1 A ARG 0.630 1 ATOM 68 C CD . ARG 364 364 ? A 28.501 18.284 22.510 1 1 A ARG 0.630 1 ATOM 69 N NE . ARG 364 364 ? A 29.678 19.190 22.688 1 1 A ARG 0.630 1 ATOM 70 C CZ . ARG 364 364 ? A 30.611 19.026 23.638 1 1 A ARG 0.630 1 ATOM 71 N NH1 . ARG 364 364 ? 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'normalized score' global . 3 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.630 2 1 3 0.031 3 1 4 0.334 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 356 THR 1 0.550 2 1 A 357 ALA 1 0.560 3 1 A 358 HIS 1 0.630 4 1 A 359 ASN 1 0.660 5 1 A 360 ALA 1 0.630 6 1 A 361 ILE 1 0.600 7 1 A 362 GLU 1 0.570 8 1 A 363 LYS 1 0.590 9 1 A 364 ARG 1 0.630 10 1 A 365 TYR 1 0.600 11 1 A 366 ARG 1 0.670 12 1 A 367 SER 1 0.670 13 1 A 368 SER 1 0.670 14 1 A 369 ILE 1 0.730 15 1 A 370 ASN 1 0.730 16 1 A 371 ASP 1 0.710 17 1 A 372 LYS 1 0.680 18 1 A 373 ILE 1 0.700 19 1 A 374 ILE 1 0.700 20 1 A 375 GLU 1 0.730 21 1 A 376 LEU 1 0.740 22 1 A 377 LYS 1 0.680 23 1 A 378 ASP 1 0.700 24 1 A 379 LEU 1 0.760 25 1 A 380 VAL 1 0.710 26 1 A 381 VAL 1 0.360 27 1 A 382 GLY 1 0.460 28 1 A 383 THR 1 0.400 29 1 A 384 GLU 1 0.390 30 1 A 385 ALA 1 0.430 31 1 A 386 LYS 1 0.400 32 1 A 387 LEU 1 0.540 33 1 A 388 ASN 1 0.700 34 1 A 389 LYS 1 0.680 35 1 A 390 SER 1 0.640 36 1 A 391 ALA 1 0.630 37 1 A 392 VAL 1 0.720 38 1 A 393 LEU 1 0.720 39 1 A 394 ARG 1 0.630 40 1 A 395 LYS 1 0.640 41 1 A 396 ALA 1 0.770 42 1 A 397 ILE 1 0.730 43 1 A 398 ASP 1 0.670 44 1 A 399 TYR 1 0.670 45 1 A 400 ILE 1 0.720 46 1 A 401 ARG 1 0.640 47 1 A 402 PHE 1 0.610 48 1 A 403 LEU 1 0.630 49 1 A 404 GLN 1 0.620 50 1 A 405 HIS 1 0.600 51 1 A 406 SER 1 0.610 52 1 A 407 ASN 1 0.650 53 1 A 408 GLN 1 0.650 54 1 A 409 LYS 1 0.660 55 1 A 410 LEU 1 0.730 56 1 A 411 LYS 1 0.720 57 1 A 412 GLN 1 0.750 58 1 A 413 GLU 1 0.590 59 1 A 414 ASN 1 0.550 60 1 B 354 LYS 1 0.520 61 1 B 355 ARG 1 0.470 62 1 B 356 THR 1 0.620 63 1 B 357 ALA 1 0.630 64 1 B 358 HIS 1 0.610 65 1 B 359 ASN 1 0.680 66 1 B 360 ALA 1 0.650 67 1 B 361 ILE 1 0.620 68 1 B 362 GLU 1 0.590 69 1 B 363 LYS 1 0.610 70 1 B 364 ARG 1 0.620 71 1 B 365 TYR 1 0.630 72 1 B 366 ARG 1 0.650 73 1 B 367 SER 1 0.690 74 1 B 368 SER 1 0.670 75 1 B 369 ILE 1 0.720 76 1 B 370 ASN 1 0.760 77 1 B 371 ASP 1 0.710 78 1 B 372 LYS 1 0.680 79 1 B 373 ILE 1 0.710 80 1 B 374 ILE 1 0.700 81 1 B 375 GLU 1 0.720 82 1 B 376 LEU 1 0.740 83 1 B 377 LYS 1 0.690 84 1 B 378 ASP 1 0.710 85 1 B 379 LEU 1 0.740 86 1 B 380 VAL 1 0.660 87 1 B 381 VAL 1 0.380 88 1 B 382 GLY 1 0.410 89 1 B 383 THR 1 0.390 90 1 B 384 GLU 1 0.330 91 1 B 385 ALA 1 0.420 92 1 B 386 LYS 1 0.370 93 1 B 387 LEU 1 0.610 94 1 B 388 ASN 1 0.660 95 1 B 389 LYS 1 0.650 96 1 B 390 SER 1 0.630 97 1 B 391 ALA 1 0.630 98 1 B 392 VAL 1 0.690 99 1 B 393 LEU 1 0.690 100 1 B 394 ARG 1 0.640 101 1 B 395 LYS 1 0.640 102 1 B 396 ALA 1 0.770 103 1 B 397 ILE 1 0.750 104 1 B 398 ASP 1 0.700 105 1 B 399 TYR 1 0.670 106 1 B 400 ILE 1 0.720 107 1 B 401 ARG 1 0.650 108 1 B 402 PHE 1 0.650 109 1 B 403 LEU 1 0.630 110 1 B 404 GLN 1 0.620 111 1 B 405 HIS 1 0.620 112 1 B 406 SER 1 0.590 113 1 B 407 ASN 1 0.630 114 1 B 408 GLN 1 0.590 115 1 B 409 LYS 1 0.490 116 1 B 410 LEU 1 0.520 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #