data_SMR-5a69555a867082d952689c78b4bf4e01_3 _entry.id SMR-5a69555a867082d952689c78b4bf4e01_3 _struct.entry_id SMR-5a69555a867082d952689c78b4bf4e01_3 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - P51825 (isoform 2)/ AFF1_HUMAN, AF4/FMR2 family member 1 Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P51825 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 5 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 154516.755 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP AFF1_HUMAN P51825 1 ;MAFTERVNSSGNSLYNDDRNLLRIREKERRNQEAHQEKEAFPEKIPLFGEPYKTAKGDELSSRIQNMLGN YEEVKEFLSTKSHTHRLDASENRLGKPKYPLIPDKGSSIPSSSFHTSVHHQSIHTPASGPLSVGNISHNP KMAQPRTEPMPSLHAKSCGPPDSQHLTQDRLGQEGFGSSHHKKGDRRADGDHCASVTDSAPERELSPLIS LPSPVPPLSPIHSNQQTLPRTQGSSKVHGSSNNSKGYCPAKSPKDLAVKVHDKETPQDSLVAPAQPPSQT FPPPSLPSKSVAMQQKPTAYVRPMDGQDQAPSESPELKPLPEDYRQQTFEKTDLKVPAKAKLTKLKMPSQ SVEQTYSNEVHCVEEILKEMTHSWPPPLTAIHTPSTAEPSKFPFPTKDSQHVSSVTQNQKQYDTSSKTHS NSQQGTSSMLEDDLQLSDSEDSDSEQTPEKPPSSSAPPSAPQSLPEPVASAHSSSAESESTSDSDSSSDS ESESSSSDSEENEPLETPAPEPEPPTTNKWQLDNWLTKVSQPAAPPEGPRSTEPPRRHPESKGSSDSATS QEHSESKDPPPKSSSKAPRAPPEAPHPGKRSCQKSPAQQEPPQRQTVGTKQPKKPVKASARAGSRTSLQG EREPGLLPYGSRDQTSKDKPKVKTKGRPRAAASNEPKPAVPPSSEKKKHKSSLPAPSKALSGPEPAKDNV EDRTPEHFALVPLTESQGPPHSGSGSRTSGCRQAVVVQEDSRKDRLPLPLRDTKLLSPLRDTPPPQSLMV KITLDLLSRIPQPPGKGSRQRKAEDKQPPAGKKHSSEKRSSDSSSKLAKKRKGEAERDCDNKKIRLEKEI KSQSSSSSSSHKESSKTKPSRPSSQSSKKEMLPPPPVSSSSQKPAKPALKRSRREADTCGQDPPKSASST KSNHKDSSIPKQRRVEGKGSRSSSEHKGSSGDTANPFPVPSLPNGNSKPGKPQVKFDKQQADLHMREAKK MKQKAELMTDRVGKAFKYLEAVLSFIECGIATESESQSSKSAYSVYSETVDLIKFIMSLKSFSDATAPTQ EKIFAVLCMRCQSILNMAMFRCKKDIAIKYSRTLNKHFESSSKVAQAPSPCIARSTGTPSPLSPMPSPAS SVGSQSSAGSVGSSGVAATISTPVTIQNMTSSYVTITSHVLTAFDLWEQAEALTRKNKEFFARLSTNVCT LALNSSLVDLVHYTRQGFQQLQELTKTP ; 'AF4/FMR2 family member 1' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1218 1 1218 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . AFF1_HUMAN P51825 P51825-2 1 1218 9606 'Homo sapiens (Human)' 1996-10-01 8C9DCE41FF2EA841 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MAFTERVNSSGNSLYNDDRNLLRIREKERRNQEAHQEKEAFPEKIPLFGEPYKTAKGDELSSRIQNMLGN YEEVKEFLSTKSHTHRLDASENRLGKPKYPLIPDKGSSIPSSSFHTSVHHQSIHTPASGPLSVGNISHNP KMAQPRTEPMPSLHAKSCGPPDSQHLTQDRLGQEGFGSSHHKKGDRRADGDHCASVTDSAPERELSPLIS LPSPVPPLSPIHSNQQTLPRTQGSSKVHGSSNNSKGYCPAKSPKDLAVKVHDKETPQDSLVAPAQPPSQT FPPPSLPSKSVAMQQKPTAYVRPMDGQDQAPSESPELKPLPEDYRQQTFEKTDLKVPAKAKLTKLKMPSQ SVEQTYSNEVHCVEEILKEMTHSWPPPLTAIHTPSTAEPSKFPFPTKDSQHVSSVTQNQKQYDTSSKTHS NSQQGTSSMLEDDLQLSDSEDSDSEQTPEKPPSSSAPPSAPQSLPEPVASAHSSSAESESTSDSDSSSDS ESESSSSDSEENEPLETPAPEPEPPTTNKWQLDNWLTKVSQPAAPPEGPRSTEPPRRHPESKGSSDSATS QEHSESKDPPPKSSSKAPRAPPEAPHPGKRSCQKSPAQQEPPQRQTVGTKQPKKPVKASARAGSRTSLQG 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SVEQTYSNEVHCVEEILKEMTHSWPPPLTAIHTPSTAEPSKFPFPTKDSQHVSSVTQNQKQYDTSSKTHS NSQQGTSSMLEDDLQLSDSEDSDSEQTPEKPPSSSAPPSAPQSLPEPVASAHSSSAESESTSDSDSSSDS ESESSSSDSEENEPLETPAPEPEPPTTNKWQLDNWLTKVSQPAAPPEGPRSTEPPRRHPESKGSSDSATS QEHSESKDPPPKSSSKAPRAPPEAPHPGKRSCQKSPAQQEPPQRQTVGTKQPKKPVKASARAGSRTSLQG EREPGLLPYGSRDQTSKDKPKVKTKGRPRAAASNEPKPAVPPSSEKKKHKSSLPAPSKALSGPEPAKDNV EDRTPEHFALVPLTESQGPPHSGSGSRTSGCRQAVVVQEDSRKDRLPLPLRDTKLLSPLRDTPPPQSLMV KITLDLLSRIPQPPGKGSRQRKAEDKQPPAGKKHSSEKRSSDSSSKLAKKRKGEAERDCDNKKIRLEKEI KSQSSSSSSSHKESSKTKPSRPSSQSSKKEMLPPPPVSSSSQKPAKPALKRSRREADTCGQDPPKSASST KSNHKDSSIPKQRRVEGKGSRSSSEHKGSSGDTANPFPVPSLPNGNSKPGKPQVKFDKQQADLHMREAKK MKQKAELMTDRVGKAFKYLEAVLSFIECGIATESESQSSKSAYSVYSETVDLIKFIMSLKSFSDATAPTQ EKIFAVLCMRCQSILNMAMFRCKKDIAIKYSRTLNKHFESSSKVAQAPSPCIARSTGTPSPLSPMPSPAS SVGSQSSAGSVGSSGVAATISTPVTIQNMTSSYVTITSHVLTAFDLWEQAEALTRKNKEFFARLSTNVCT LALNSSLVDLVHYTRQGFQQLQELTKTP ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 ALA . 1 3 PHE . 1 4 THR . 1 5 GLU . 1 6 ARG . 1 7 VAL . 1 8 ASN . 1 9 SER . 1 10 SER . 1 11 GLY . 1 12 ASN . 1 13 SER . 1 14 LEU . 1 15 TYR . 1 16 ASN . 1 17 ASP . 1 18 ASP . 1 19 ARG . 1 20 ASN . 1 21 LEU . 1 22 LEU . 1 23 ARG . 1 24 ILE . 1 25 ARG . 1 26 GLU . 1 27 LYS . 1 28 GLU . 1 29 ARG . 1 30 ARG . 1 31 ASN . 1 32 GLN . 1 33 GLU . 1 34 ALA . 1 35 HIS . 1 36 GLN . 1 37 GLU . 1 38 LYS . 1 39 GLU . 1 40 ALA . 1 41 PHE . 1 42 PRO . 1 43 GLU . 1 44 LYS . 1 45 ILE . 1 46 PRO . 1 47 LEU . 1 48 PHE . 1 49 GLY . 1 50 GLU . 1 51 PRO . 1 52 TYR . 1 53 LYS . 1 54 THR . 1 55 ALA . 1 56 LYS . 1 57 GLY . 1 58 ASP . 1 59 GLU . 1 60 LEU . 1 61 SER . 1 62 SER . 1 63 ARG . 1 64 ILE . 1 65 GLN . 1 66 ASN . 1 67 MET . 1 68 LEU . 1 69 GLY . 1 70 ASN . 1 71 TYR . 1 72 GLU . 1 73 GLU . 1 74 VAL . 1 75 LYS . 1 76 GLU . 1 77 PHE . 1 78 LEU . 1 79 SER . 1 80 THR . 1 81 LYS . 1 82 SER . 1 83 HIS . 1 84 THR . 1 85 HIS . 1 86 ARG . 1 87 LEU . 1 88 ASP . 1 89 ALA . 1 90 SER . 1 91 GLU . 1 92 ASN . 1 93 ARG . 1 94 LEU . 1 95 GLY . 1 96 LYS . 1 97 PRO . 1 98 LYS . 1 99 TYR . 1 100 PRO . 1 101 LEU . 1 102 ILE . 1 103 PRO . 1 104 ASP . 1 105 LYS . 1 106 GLY . 1 107 SER . 1 108 SER . 1 109 ILE . 1 110 PRO . 1 111 SER . 1 112 SER . 1 113 SER . 1 114 PHE . 1 115 HIS . 1 116 THR . 1 117 SER . 1 118 VAL . 1 119 HIS . 1 120 HIS . 1 121 GLN . 1 122 SER . 1 123 ILE . 1 124 HIS . 1 125 THR . 1 126 PRO . 1 127 ALA . 1 128 SER . 1 129 GLY . 1 130 PRO . 1 131 LEU . 1 132 SER . 1 133 VAL . 1 134 GLY . 1 135 ASN . 1 136 ILE . 1 137 SER . 1 138 HIS . 1 139 ASN . 1 140 PRO . 1 141 LYS . 1 142 MET . 1 143 ALA . 1 144 GLN . 1 145 PRO . 1 146 ARG . 1 147 THR . 1 148 GLU . 1 149 PRO . 1 150 MET . 1 151 PRO . 1 152 SER . 1 153 LEU . 1 154 HIS . 1 155 ALA . 1 156 LYS . 1 157 SER . 1 158 CYS . 1 159 GLY . 1 160 PRO . 1 161 PRO . 1 162 ASP . 1 163 SER . 1 164 GLN . 1 165 HIS . 1 166 LEU . 1 167 THR . 1 168 GLN . 1 169 ASP . 1 170 ARG . 1 171 LEU . 1 172 GLY . 1 173 GLN . 1 174 GLU . 1 175 GLY . 1 176 PHE . 1 177 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A 1 1059 MET 1059 ? ? ? A . A 1 1060 ARG 1060 ? ? ? A . A 1 1061 CYS 1061 ? ? ? A . A 1 1062 GLN 1062 ? ? ? A . A 1 1063 SER 1063 ? ? ? A . A 1 1064 ILE 1064 ? ? ? A . A 1 1065 LEU 1065 ? ? ? A . A 1 1066 ASN 1066 ? ? ? A . A 1 1067 MET 1067 ? ? ? A . A 1 1068 ALA 1068 ? ? ? A . A 1 1069 MET 1069 ? ? ? A . A 1 1070 PHE 1070 ? ? ? A . A 1 1071 ARG 1071 ? ? ? A . A 1 1072 CYS 1072 ? ? ? A . A 1 1073 LYS 1073 ? ? ? A . A 1 1074 LYS 1074 ? ? ? A . A 1 1075 ASP 1075 ? ? ? A . A 1 1076 ILE 1076 ? ? ? A . A 1 1077 ALA 1077 ? ? ? A . A 1 1078 ILE 1078 ? ? ? A . A 1 1079 LYS 1079 ? ? ? A . A 1 1080 TYR 1080 ? ? ? A . A 1 1081 SER 1081 ? ? ? A . A 1 1082 ARG 1082 ? ? ? A . A 1 1083 THR 1083 ? ? ? A . A 1 1084 LEU 1084 ? ? ? A . A 1 1085 ASN 1085 ? ? ? A . A 1 1086 LYS 1086 ? ? ? A . A 1 1087 HIS 1087 ? ? ? A . A 1 1088 PHE 1088 ? ? ? A . A 1 1089 GLU 1089 ? ? ? A . A 1 1090 SER 1090 ? ? ? A . A 1 1091 SER 1091 ? ? ? A . A 1 1092 SER 1092 ? ? ? A . A 1 1093 LYS 1093 ? ? ? A . A 1 1094 VAL 1094 ? ? ? A . A 1 1095 ALA 1095 ? ? ? A . A 1 1096 GLN 1096 ? ? ? A . A 1 1097 ALA 1097 ? ? ? A . A 1 1098 PRO 1098 ? ? ? A . A 1 1099 SER 1099 ? ? ? A . A 1 1100 PRO 1100 ? ? ? A . A 1 1101 CYS 1101 ? ? ? A . A 1 1102 ILE 1102 ? ? ? A . A 1 1103 ALA 1103 ? ? ? A . A 1 1104 ARG 1104 ? ? ? A . A 1 1105 SER 1105 ? ? ? A . A 1 1106 THR 1106 ? ? ? A . A 1 1107 GLY 1107 ? ? ? A . A 1 1108 THR 1108 ? ? ? A . A 1 1109 PRO 1109 ? ? ? A . A 1 1110 SER 1110 ? ? ? A . A 1 1111 PRO 1111 ? ? ? A . A 1 1112 LEU 1112 ? ? ? A . A 1 1113 SER 1113 ? ? ? A . A 1 1114 PRO 1114 ? ? ? A . A 1 1115 MET 1115 ? ? ? A . A 1 1116 PRO 1116 ? ? ? A . A 1 1117 SER 1117 ? ? ? A . A 1 1118 PRO 1118 ? ? ? A . A 1 1119 ALA 1119 ? ? ? A . A 1 1120 SER 1120 ? ? ? A . A 1 1121 SER 1121 ? ? ? A . A 1 1122 VAL 1122 ? ? ? A . A 1 1123 GLY 1123 ? ? ? A . A 1 1124 SER 1124 ? ? ? A . A 1 1125 GLN 1125 ? ? ? A . A 1 1126 SER 1126 ? ? ? A . A 1 1127 SER 1127 ? ? ? A . A 1 1128 ALA 1128 ? ? ? A . A 1 1129 GLY 1129 ? ? ? A . A 1 1130 SER 1130 ? ? ? A . A 1 1131 VAL 1131 ? ? ? A . A 1 1132 GLY 1132 ? ? ? A . A 1 1133 SER 1133 ? ? ? A . A 1 1134 SER 1134 ? ? ? A . A 1 1135 GLY 1135 ? ? ? A . A 1 1136 VAL 1136 ? ? ? A . A 1 1137 ALA 1137 ? ? ? A . A 1 1138 ALA 1138 ? ? ? A . A 1 1139 THR 1139 ? ? ? A . A 1 1140 ILE 1140 ? ? ? A . A 1 1141 SER 1141 ? ? ? A . A 1 1142 THR 1142 ? ? ? A . A 1 1143 PRO 1143 ? ? ? A . A 1 1144 VAL 1144 ? ? ? A . A 1 1145 THR 1145 ? ? ? A . A 1 1146 ILE 1146 ? ? ? A . A 1 1147 GLN 1147 ? ? ? A . A 1 1148 ASN 1148 ? ? ? A . A 1 1149 MET 1149 ? ? ? A . A 1 1150 THR 1150 ? ? ? A . A 1 1151 SER 1151 ? ? ? A . A 1 1152 SER 1152 ? ? ? A . A 1 1153 TYR 1153 ? ? ? A . A 1 1154 VAL 1154 ? ? ? A . A 1 1155 THR 1155 ? ? ? A . A 1 1156 ILE 1156 ? ? ? A . A 1 1157 THR 1157 ? ? ? A . A 1 1158 SER 1158 ? ? ? A . A 1 1159 HIS 1159 ? ? ? A . A 1 1160 VAL 1160 ? ? ? A . A 1 1161 LEU 1161 ? ? ? A . A 1 1162 THR 1162 ? ? ? A . A 1 1163 ALA 1163 ? ? ? A . A 1 1164 PHE 1164 ? ? ? A . A 1 1165 ASP 1165 ? ? ? A . A 1 1166 LEU 1166 ? ? ? A . A 1 1167 TRP 1167 ? ? ? A . A 1 1168 GLU 1168 ? ? ? A . A 1 1169 GLN 1169 ? ? ? A . A 1 1170 ALA 1170 ? ? ? A . A 1 1171 GLU 1171 ? ? ? A . A 1 1172 ALA 1172 ? ? ? A . A 1 1173 LEU 1173 ? ? ? A . A 1 1174 THR 1174 ? ? ? A . A 1 1175 ARG 1175 ? ? ? A . A 1 1176 LYS 1176 ? ? ? A . A 1 1177 ASN 1177 ? ? ? A . A 1 1178 LYS 1178 ? ? ? A . A 1 1179 GLU 1179 ? ? ? A . A 1 1180 PHE 1180 ? ? ? A . A 1 1181 PHE 1181 ? ? ? A . A 1 1182 ALA 1182 ? ? ? A . A 1 1183 ARG 1183 ? ? ? A . A 1 1184 LEU 1184 ? ? ? A . A 1 1185 SER 1185 ? ? ? A . A 1 1186 THR 1186 ? ? ? A . A 1 1187 ASN 1187 ? ? ? A . A 1 1188 VAL 1188 ? ? ? A . A 1 1189 CYS 1189 ? ? ? A . A 1 1190 THR 1190 ? ? ? A . A 1 1191 LEU 1191 ? ? ? A . A 1 1192 ALA 1192 ? ? ? A . A 1 1193 LEU 1193 ? ? ? A . A 1 1194 ASN 1194 ? ? ? A . A 1 1195 SER 1195 ? ? ? A . A 1 1196 SER 1196 ? ? ? A . A 1 1197 LEU 1197 ? ? ? A . A 1 1198 VAL 1198 ? ? ? A . A 1 1199 ASP 1199 ? ? ? A . A 1 1200 LEU 1200 ? ? ? A . A 1 1201 VAL 1201 ? ? ? A . A 1 1202 HIS 1202 ? ? ? A . A 1 1203 TYR 1203 ? ? ? A . A 1 1204 THR 1204 ? ? ? A . A 1 1205 ARG 1205 ? ? ? A . A 1 1206 GLN 1206 ? ? ? A . A 1 1207 GLY 1207 ? ? ? A . A 1 1208 PHE 1208 ? ? ? A . A 1 1209 GLN 1209 ? ? ? A . A 1 1210 GLN 1210 ? ? ? A . A 1 1211 LEU 1211 ? ? ? A . A 1 1212 GLN 1212 ? ? ? A . A 1 1213 GLU 1213 ? ? ? A . A 1 1214 LEU 1214 ? ? ? A . A 1 1215 THR 1215 ? ? ? A . A 1 1216 LYS 1216 ? ? ? A . A 1 1217 THR 1217 ? ? ? A . A 1 1218 PRO 1218 ? ? ? A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'AF4/FMR2 family member 1/Protein AF-9 chimera {PDB ID=2lm0, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=2lm0.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by BLAST to 2lm0, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 3' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-25 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-20 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;TRLPLPLRDTKLLSPLRDTPPPQSLMVKITLDLLSRIPQPPGKPMGSDKQIKNGECDKAYLDELVELHRR LMTLRERHILQQIVNLIEETGHFHITNTTFDFDLCSLDKTTVRKLQSYLETSGTS ; ;TRLPLPLRDTKLLSPLRDTPPPQSLMVKITLDLLSRIPQPPGKPMGSDKQIKNGECDKAYLDELVELHRR LMTLRERHILQQIVNLIEETGHFHITNTTFDFDLCSLDKTTVRKLQSYLETSGTS ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 2 43 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 2lm0 2024-05-01 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1218 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1218 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'BLAST e-value' . 1.83e-18 100.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MAFTERVNSSGNSLYNDDRNLLRIREKERRNQEAHQEKEAFPEKIPLFGEPYKTAKGDELSSRIQNMLGNYEEVKEFLSTKSHTHRLDASENRLGKPKYPLIPDKGSSIPSSSFHTSVHHQSIHTPASGPLSVGNISHNPKMAQPRTEPMPSLHAKSCGPPDSQHLTQDRLGQEGFGSSHHKKGDRRADGDHCASVTDSAPERELSPLISLPSPVPPLSPIHSNQQTLPRTQGSSKVHGSSNNSKGYCPAKSPKDLAVKVHDKETPQDSLVAPAQPPSQTFPPPSLPSKSVAMQQKPTAYVRPMDGQDQAPSESPELKPLPEDYRQQTFEKTDLKVPAKAKLTKLKMPSQSVEQTYSNEVHCVEEILKEMTHSWPPPLTAIHTPSTAEPSKFPFPTKDSQHVSSVTQNQKQYDTSSKTHSNSQQGTSSMLEDDLQLSDSEDSDSEQTPEKPPSSSAPPSAPQSLPEPVASAHSSSAESESTSDSDSSSDSESESSSSDSEENEPLETPAPEPEPPTTNKWQLDNWLTKVSQPAAPPEGPRSTEPPRRHPESKGSSDSATSQEHSESKDPPPKSSSKAPRAPPEAPHPGKRSCQKSPAQQEPPQRQTVGTKQPKKPVKASARAGSRTSLQGEREPGLLPYGSRDQTSKDKPKVKTKGRPRAAASNEPKPAVPPSSEKKKHKSSLPAPSKALSGPEPAKDNVEDRTPEHFALVPLTESQGPPHSGSGSRTSGCRQAVVVQEDSRKDRLPLPLRDTKLLSPLRDTPPPQSLMVKITLDLLSRIPQPPGKGSRQRKAEDKQPPAGKKHSSEKRSSDSSSKLAKKRKGEAERDCDNKKIRLEKEIKSQSSSSSSSHKESSKTKPSRPSSQSSKKEMLPPPPVSSSSQKPAKPALKRSRREADTCGQDPPKSASSTKSNHKDSSIPKQRRVEGKGSRSSSEHKGSSGDTANPFPVPSLPNGNSKPGKPQVKFDKQQADLHMREAKKMKQKAELMTDRVGKAFKYLEAVLSFIECGIATESESQSSKSAYSVYSETVDLIKFIMSLKSFSDATAPTQEKIFAVLCMRCQSILNMAMFRCKKDIAIKYSRTLNKHFESSSKVAQAPSPCIARSTGTPSPLSPMPSPASSVGSQSSAGSVGSSGVAATISTPVTIQNMTSSYVTITSHVLTAFDLWEQAEALTRKNKEFFARLSTNVCTLALNSSLVDLVHYTRQGFQQLQELTKTP 2 1 2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------RLPLPLRDTKLLSPLRDTPPPQSLMVKITLDLLSRIPQPPGK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 2lm0.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 3' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . 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'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #