data_SMR-279140887d79707bcb1eb117c1d8e253_2 _entry.id SMR-279140887d79707bcb1eb117c1d8e253_2 _struct.entry_id SMR-279140887d79707bcb1eb117c1d8e253_2 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q8CH77 (isoform 2)/ NAV1_MOUSE, Neuron navigator 1 Estimated model accuracy of this model is 0.019, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q8CH77 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 151922.138 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP NAV1_MOUSE Q8CH77 1 ;MLGSSVKSVQPEVELSGGSGSGGDEGADESRGASRKAAAADGRGMLPKRAKAAGGSGSMAKASAAELKVF KSGSVDSRVPGGLPTSNLRKQKSLTNLSFLTDSEKKLQLYEPEWSDDMAKAPKGLGKLGPKGRETPLMSK TLSKSEHSLFQPKGGSTGGAKTPLAPLAPSLGKPSRIPRGPYAEVKPLSKAPEAAVSDDGKSDDELLSSK AKAQKGSGTVPSAKGQEERAFLKVDPELVVTVLGDLEQLLFSQMLDPESQRKRTVQNVLDLRQNLEETMS SLRGSQVTHSSLEMPCYDSDDANPRSVSSLSNRSSPLSWRYGQSSPRLQAGDAPSVGGSCRSEGPPAWYM HGERAHYSHTMPMRSPSKLSHISRLELVESLDSDEVDLKSGYMSDSDLMGKTMTEDDDITTGWDESSSIS SGLSDASDNLSSEEFNASSSLNSLPTTPTASRRSSTIVLRTDSEKRSLAESGLNWFSESEEKTPKKLEYD SGSLKMEPGTSKWRRERPESCDDASKGGELKKPISLGHPGSLKKGKTPPVAVTSPITHTAQSALKVAGKP EGKATDKGKLAVKNTGLQRSSSDAGRDRLSDAKKPPSGIARPSTSGSFGYKKPPPATGTATVMQTGSSAT LSKIQKSSGIPVKPVNGRKTSLDVSNSVEPGFLAPGARSNIQYRSLPRPAKSSSMSVTGRGGPRPVSSSI DPSLLSTKQGGLTPSRLKEPSKVASGRSTPAPVNQTDREKEKAKAKAVALDSDNISLKSIGSPESTPKNQ ASHPPATKLAELPPTPLRATAKSFVKPPSLANLDKVNSNSLDLPSSSDTHASKVPDLHAPSSSTGGPLPS CFTPSPAPILNINSASFSQGLELMSGFSVPKETRMYPKLSGLHRSMESLQMPMSLPSAFPSSAPIPTPPT APSEEDTEELPWSGSPRAGQLDSSQRDRNTLPKKGLRYQLQSQEETKERRHSHTAGGLPESDDQAELPSP PALSMSLSAKGQLTNIVSPTAATTPRITRSNSIPTHEAAFELYSGSQMGSTLSLAERPKGMIRSGSFRDP TDDVHGSVLSLASSASSTYSSAEERMQSEQIRKLRRELESSQEKVATLTSQLSANANLVAAFEQSLVNMT SRLRHLAETAEEKDTELLDLRETIDFLKKKNSEAQAVIQGALNASEATPKELRIKRQNSSDSISSLNSIT SHSSIGSSKDADAKKKKKKSWLRSSFNKAFSL ; 'Neuron navigator 1' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1222 1 1222 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . NAV1_MOUSE Q8CH77 Q8CH77-2 1 1222 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2007-05-15 85DBF0D3994D3008 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no T ;MLGSSVKSVQPEVELSGGSGSGGDEGADESRGASRKAAAADGRGMLPKRAKAAGGSGSMAKASAAELKVF KSGSVDSRVPGGLPTSNLRKQKSLTNLSFLTDSEKKLQLYEPEWSDDMAKAPKGLGKLGPKGRETPLMSK TLSKSEHSLFQPKGGSTGGAKTPLAPLAPSLGKPSRIPRGPYAEVKPLSKAPEAAVSDDGKSDDELLSSK AKAQKGSGTVPSAKGQEERAFLKVDPELVVTVLGDLEQLLFSQMLDPESQRKRTVQNVLDLRQNLEETMS SLRGSQVTHSSLEMPCYDSDDANPRSVSSLSNRSSPLSWRYGQSSPRLQAGDAPSVGGSCRSEGPPAWYM HGERAHYSHTMPMRSPSKLSHISRLELVESLDSDEVDLKSGYMSDSDLMGKTMTEDDDITTGWDESSSIS SGLSDASDNLSSEEFNASSSLNSLPTTPTASRRSSTIVLRTDSEKRSLAESGLNWFSESEEKTPKKLEYD SGSLKMEPGTSKWRRERPESCDDASKGGELKKPISLGHPGSLKKGKTPPVAVTSPITHTAQSALKVAGKP EGKATDKGKLAVKNTGLQRSSSDAGRDRLSDAKKPPSGIARPSTSGSFGYKKPPPATGTATVMQTGSSAT 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. 1 2 LEU . 1 3 GLY . 1 4 SER . 1 5 SER . 1 6 VAL . 1 7 LYS . 1 8 SER . 1 9 VAL . 1 10 GLN . 1 11 PRO . 1 12 GLU . 1 13 VAL . 1 14 GLU . 1 15 LEU . 1 16 SER . 1 17 GLY . 1 18 GLY . 1 19 SER . 1 20 GLY . 1 21 SER . 1 22 GLY . 1 23 GLY . 1 24 ASP . 1 25 GLU . 1 26 GLY . 1 27 ALA . 1 28 ASP . 1 29 GLU . 1 30 SER . 1 31 ARG . 1 32 GLY . 1 33 ALA . 1 34 SER . 1 35 ARG . 1 36 LYS . 1 37 ALA . 1 38 ALA . 1 39 ALA . 1 40 ALA . 1 41 ASP . 1 42 GLY . 1 43 ARG . 1 44 GLY . 1 45 MET . 1 46 LEU . 1 47 PRO . 1 48 LYS . 1 49 ARG . 1 50 ALA . 1 51 LYS . 1 52 ALA . 1 53 ALA . 1 54 GLY . 1 55 GLY . 1 56 SER . 1 57 GLY . 1 58 SER . 1 59 MET . 1 60 ALA . 1 61 LYS . 1 62 ALA . 1 63 SER . 1 64 ALA . 1 65 ALA . 1 66 GLU . 1 67 LEU . 1 68 LYS . 1 69 VAL . 1 70 PHE . 1 71 LYS . 1 72 SER . 1 73 GLY . 1 74 SER . 1 75 VAL . 1 76 ASP . 1 77 SER . 1 78 ARG . 1 79 VAL . 1 80 PRO . 1 81 GLY . 1 82 GLY . 1 83 LEU . 1 84 PRO . 1 85 THR . 1 86 SER . 1 87 ASN . 1 88 LEU . 1 89 ARG . 1 90 LYS . 1 91 GLN . 1 92 LYS . 1 93 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A 1 1069 TYR 1069 ? ? ? T . A 1 1070 SER 1070 ? ? ? T . A 1 1071 SER 1071 ? ? ? T . A 1 1072 ALA 1072 ? ? ? T . A 1 1073 GLU 1073 ? ? ? T . A 1 1074 GLU 1074 ? ? ? T . A 1 1075 ARG 1075 ? ? ? T . A 1 1076 MET 1076 ? ? ? T . A 1 1077 GLN 1077 ? ? ? T . A 1 1078 SER 1078 ? ? ? T . A 1 1079 GLU 1079 ? ? ? T . A 1 1080 GLN 1080 1080 GLN GLN T . A 1 1081 ILE 1081 1081 ILE ILE T . A 1 1082 ARG 1082 1082 ARG ARG T . A 1 1083 LYS 1083 1083 LYS LYS T . A 1 1084 LEU 1084 1084 LEU LEU T . A 1 1085 ARG 1085 1085 ARG ARG T . A 1 1086 ARG 1086 1086 ARG ARG T . A 1 1087 GLU 1087 1087 GLU GLU T . A 1 1088 LEU 1088 1088 LEU LEU T . A 1 1089 GLU 1089 1089 GLU GLU T . A 1 1090 SER 1090 1090 SER SER T . A 1 1091 SER 1091 1091 SER SER T . A 1 1092 GLN 1092 1092 GLN GLN T . A 1 1093 GLU 1093 1093 GLU GLU T . A 1 1094 LYS 1094 1094 LYS LYS T . A 1 1095 VAL 1095 1095 VAL VAL T . A 1 1096 ALA 1096 1096 ALA ALA T . A 1 1097 THR 1097 1097 THR THR T . A 1 1098 LEU 1098 1098 LEU LEU T . A 1 1099 THR 1099 1099 THR THR T . A 1 1100 SER 1100 1100 SER SER T . A 1 1101 GLN 1101 1101 GLN GLN T . A 1 1102 LEU 1102 1102 LEU LEU T . A 1 1103 SER 1103 1103 SER SER T . A 1 1104 ALA 1104 1104 ALA ALA T . A 1 1105 ASN 1105 1105 ASN ASN T . A 1 1106 ALA 1106 1106 ALA ALA T . A 1 1107 ASN 1107 1107 ASN ASN T . A 1 1108 LEU 1108 1108 LEU LEU T . A 1 1109 VAL 1109 1109 VAL VAL T . A 1 1110 ALA 1110 1110 ALA ALA T . A 1 1111 ALA 1111 1111 ALA ALA T . A 1 1112 PHE 1112 1112 PHE PHE T . A 1 1113 GLU 1113 1113 GLU GLU T . A 1 1114 GLN 1114 1114 GLN GLN T . A 1 1115 SER 1115 1115 SER SER T . A 1 1116 LEU 1116 1116 LEU LEU T . A 1 1117 VAL 1117 1117 VAL VAL T . A 1 1118 ASN 1118 1118 ASN ASN T . A 1 1119 MET 1119 1119 MET MET T . A 1 1120 THR 1120 1120 THR THR T . A 1 1121 SER 1121 1121 SER SER T . A 1 1122 ARG 1122 1122 ARG ARG T . A 1 1123 LEU 1123 1123 LEU LEU T . A 1 1124 ARG 1124 1124 ARG ARG T . A 1 1125 HIS 1125 1125 HIS HIS T . A 1 1126 LEU 1126 1126 LEU LEU T . A 1 1127 ALA 1127 1127 ALA ALA T . A 1 1128 GLU 1128 1128 GLU GLU T . A 1 1129 THR 1129 1129 THR THR T . A 1 1130 ALA 1130 1130 ALA ALA T . A 1 1131 GLU 1131 1131 GLU GLU T . A 1 1132 GLU 1132 1132 GLU GLU T . A 1 1133 LYS 1133 1133 LYS LYS T . A 1 1134 ASP 1134 1134 ASP ASP T . A 1 1135 THR 1135 1135 THR THR T . A 1 1136 GLU 1136 1136 GLU GLU T . A 1 1137 LEU 1137 1137 LEU LEU T . A 1 1138 LEU 1138 1138 LEU LEU T . A 1 1139 ASP 1139 1139 ASP ASP T . A 1 1140 LEU 1140 1140 LEU LEU T . A 1 1141 ARG 1141 1141 ARG ARG T . A 1 1142 GLU 1142 1142 GLU GLU T . A 1 1143 THR 1143 1143 THR THR T . A 1 1144 ILE 1144 1144 ILE ILE T . A 1 1145 ASP 1145 1145 ASP ASP T . A 1 1146 PHE 1146 1146 PHE PHE T . A 1 1147 LEU 1147 1147 LEU LEU T . A 1 1148 LYS 1148 1148 LYS LYS T . A 1 1149 LYS 1149 1149 LYS LYS T . A 1 1150 LYS 1150 1150 LYS LYS T . A 1 1151 ASN 1151 ? ? ? T . A 1 1152 SER 1152 ? ? ? T . A 1 1153 GLU 1153 ? ? ? T . A 1 1154 ALA 1154 ? ? ? T . A 1 1155 GLN 1155 ? ? ? T . A 1 1156 ALA 1156 ? ? ? T . A 1 1157 VAL 1157 ? ? ? T . A 1 1158 ILE 1158 ? ? ? T . A 1 1159 GLN 1159 ? ? ? T . A 1 1160 GLY 1160 ? ? ? T . A 1 1161 ALA 1161 ? ? ? T . A 1 1162 LEU 1162 ? ? ? T . A 1 1163 ASN 1163 ? ? ? T . A 1 1164 ALA 1164 ? ? ? T . A 1 1165 SER 1165 ? ? ? T . A 1 1166 GLU 1166 ? ? ? T . A 1 1167 ALA 1167 ? ? ? T . A 1 1168 THR 1168 ? ? ? T . A 1 1169 PRO 1169 ? ? ? T . A 1 1170 LYS 1170 ? ? ? T . A 1 1171 GLU 1171 ? ? ? T . A 1 1172 LEU 1172 ? ? ? T . A 1 1173 ARG 1173 ? ? ? T . A 1 1174 ILE 1174 ? ? ? T . A 1 1175 LYS 1175 ? ? ? T . A 1 1176 ARG 1176 ? ? ? T . A 1 1177 GLN 1177 ? ? ? T . A 1 1178 ASN 1178 ? ? ? T . A 1 1179 SER 1179 ? ? ? T . A 1 1180 SER 1180 ? ? ? T . A 1 1181 ASP 1181 ? ? ? T . A 1 1182 SER 1182 ? ? ? T . A 1 1183 ILE 1183 ? ? ? T . A 1 1184 SER 1184 ? ? ? T . A 1 1185 SER 1185 ? ? ? T . A 1 1186 LEU 1186 ? ? ? T . A 1 1187 ASN 1187 ? ? ? T . A 1 1188 SER 1188 ? ? ? T . A 1 1189 ILE 1189 ? ? ? T . A 1 1190 THR 1190 ? ? ? T . A 1 1191 SER 1191 ? ? ? T . A 1 1192 HIS 1192 ? ? ? T . A 1 1193 SER 1193 ? ? ? T . A 1 1194 SER 1194 ? ? ? T . A 1 1195 ILE 1195 ? ? ? T . A 1 1196 GLY 1196 ? ? ? T . A 1 1197 SER 1197 ? ? ? T . A 1 1198 SER 1198 ? ? ? T . A 1 1199 LYS 1199 ? ? ? T . A 1 1200 ASP 1200 ? ? ? T . A 1 1201 ALA 1201 ? ? ? T . A 1 1202 ASP 1202 ? ? ? T . A 1 1203 ALA 1203 ? ? ? T . A 1 1204 LYS 1204 ? ? ? T . A 1 1205 LYS 1205 ? ? ? T . A 1 1206 LYS 1206 ? ? ? T . A 1 1207 LYS 1207 ? ? ? T . A 1 1208 LYS 1208 ? ? ? T . A 1 1209 LYS 1209 ? ? ? T . A 1 1210 SER 1210 ? ? ? T . A 1 1211 TRP 1211 ? ? ? T . A 1 1212 LEU 1212 ? ? ? T . A 1 1213 ARG 1213 ? ? ? T . A 1 1214 SER 1214 ? ? ? T . A 1 1215 SER 1215 ? ? ? T . A 1 1216 PHE 1216 ? ? ? T . A 1 1217 ASN 1217 ? ? ? T . A 1 1218 LYS 1218 ? ? ? T . A 1 1219 ALA 1219 ? ? ? T . A 1 1220 PHE 1220 ? ? ? T . A 1 1221 SER 1221 ? ? ? T . A 1 1222 LEU 1222 ? ? ? T . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Tropomyosin alpha-1 chain {PDB ID=7utl, label_asym_id=T, auth_asym_id=b, SMTL ID=7utl.1.T}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 7utl, label_asym_id=T' 'target-template alignment' . 4 'model 2' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-25 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-20 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A T 2 1 b # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MDAIKKKMQMLKLDKENALDRAEQAEADKKAAEDRSKQLEDELVSLQKKLKGTEDELDKYSEALKDAQEK LELAEKKATDAEADVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIESRAQKDEEK MEIQEIQLKEAKHIAEDADRKYEEVARKLVIIESDLERAEERAELSEGKCAELEEELKTVTNNLKSLEAQ AEKYSQKEDRYEEEIKVLSDKLKEAETRAEFAERSVTKLEKSIDDLEDELYAQKLKYKAISEELDHALND MTSI ; ;MDAIKKKMQMLKLDKENALDRAEQAEADKKAAEDRSKQLEDELVSLQKKLKGTEDELDKYSEALKDAQEK LELAEKKATDAEADVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIESRAQKDEEK MEIQEIQLKEAKHIAEDADRKYEEVARKLVIIESDLERAEERAELSEGKCAELEEELKTVTNNLKSLEAQ AEKYSQKEDRYEEEIKVLSDKLKEAETRAEFAERSVTKLEKSIDDLEDELYAQKLKYKAISEELDHALND MTSI ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 189 259 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 7utl 2022-09-21 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1222 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1222 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 17.000 18.310 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MLGSSVKSVQPEVELSGGSGSGGDEGADESRGASRKAAAADGRGMLPKRAKAAGGSGSMAKASAAELKVFKSGSVDSRVPGGLPTSNLRKQKSLTNLSFLTDSEKKLQLYEPEWSDDMAKAPKGLGKLGPKGRETPLMSKTLSKSEHSLFQPKGGSTGGAKTPLAPLAPSLGKPSRIPRGPYAEVKPLSKAPEAAVSDDGKSDDELLSSKAKAQKGSGTVPSAKGQEERAFLKVDPELVVTVLGDLEQLLFSQMLDPESQRKRTVQNVLDLRQNLEETMSSLRGSQVTHSSLEMPCYDSDDANPRSVSSLSNRSSPLSWRYGQSSPRLQAGDAPSVGGSCRSEGPPAWYMHGERAHYSHTMPMRSPSKLSHISRLELVESLDSDEVDLKSGYMSDSDLMGKTMTEDDDITTGWDESSSISSGLSDASDNLSSEEFNASSSLNSLPTTPTASRRSSTIVLRTDSEKRSLAESGLNWFSESEEKTPKKLEYDSGSLKMEPGTSKWRRERPESCDDASKGGELKKPISLGHPGSLKKGKTPPVAVTSPITHTAQSALKVAGKPEGKATDKGKLAVKNTGLQRSSSDAGRDRLSDAKKPPSGIARPSTSGSFGYKKPPPATGTATVMQTGSSATLSKIQKSSGIPVKPVNGRKTSLDVSNSVEPGFLAPGARSNIQYRSLPRPAKSSSMSVTGRGGPRPVSSSIDPSLLSTKQGGLTPSRLKEPSKVASGRSTPAPVNQTDREKEKAKAKAVALDSDNISLKSIGSPESTPKNQASHPPATKLAELPPTPLRATAKSFVKPPSLANLDKVNSNSLDLPSSSDTHASKVPDLHAPSSSTGGPLPSCFTPSPAPILNINSASFSQGLELMSGFSVPKETRMYPKLSGLHRSMESLQMPMSLPSAFPSSAPIPTPPTAPSEEDTEELPWSGSPRAGQLDSSQRDRNTLPKKGLRYQLQSQEETKERRHSHTAGGLPESDDQAELPSPPALSMSLSAKGQLTNIVSPTAATTPRITRSNSIPTHEAAFELYSGSQMGSTLSLAERPKGMIRSGSFRDPTDDVHGSVLSLASSASSTYSSAEERMQSEQIRKLRRELESSQEKVATLTSQLSANANLVAAFEQSLVNMTSRLRHLAETAEEKDTELLDLRETIDFLKKKNSEAQAVIQGALNASEATPKELRIKRQNSSDSISSLNSITSHSSIGSSKDADAKKKKKKSWLRSSFNKAFSL 2 1 2 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------KCAELEEELKTVTNNLKSLEAQAEKYSQKEDRYEEEIKVLSDKLKEAETRAEFAERSVTKLEKSIDDLEDE------------------------------------------------------------------------ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.182}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 7utl.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 2' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . GLN 1080 1080 ? A 178.146 217.814 221.022 1 1 T GLN 0.760 1 ATOM 2 C CA . GLN 1080 1080 ? A 178.902 216.941 221.984 1 1 T GLN 0.760 1 ATOM 3 C C . GLN 1080 1080 ? A 179.459 217.685 223.180 1 1 T GLN 0.760 1 ATOM 4 O O . GLN 1080 1080 ? A 179.134 217.326 224.296 1 1 T GLN 0.760 1 ATOM 5 C CB . GLN 1080 1080 ? A 179.954 216.135 221.207 1 1 T GLN 0.760 1 ATOM 6 C CG . GLN 1080 1080 ? A 179.313 215.107 220.238 1 1 T GLN 0.760 1 ATOM 7 C CD . GLN 1080 1080 ? A 180.402 214.417 219.417 1 1 T GLN 0.760 1 ATOM 8 O OE1 . GLN 1080 1080 ? A 181.459 215.011 219.196 1 1 T GLN 0.760 1 ATOM 9 N NE2 . GLN 1080 1080 ? A 180.148 213.184 218.936 1 1 T GLN 0.760 1 ATOM 10 N N . ILE 1081 1081 ? A 180.204 218.803 222.979 1 1 T ILE 0.790 1 ATOM 11 C CA . ILE 1081 1081 ? A 180.773 219.606 224.062 1 1 T ILE 0.790 1 ATOM 12 C C . ILE 1081 1081 ? A 179.742 220.051 225.100 1 1 T ILE 0.790 1 ATOM 13 O O . ILE 1081 1081 ? A 179.948 219.894 226.295 1 1 T ILE 0.790 1 ATOM 14 C CB . ILE 1081 1081 ? A 181.492 220.812 223.456 1 1 T ILE 0.790 1 ATOM 15 C CG1 . ILE 1081 1081 ? A 182.695 220.332 222.604 1 1 T ILE 0.790 1 ATOM 16 C CG2 . ILE 1081 1081 ? A 181.959 221.793 224.557 1 1 T ILE 0.790 1 ATOM 17 C CD1 . ILE 1081 1081 ? A 183.323 221.436 221.743 1 1 T ILE 0.790 1 ATOM 18 N N . ARG 1082 1082 ? A 178.557 220.546 224.672 1 1 T ARG 0.530 1 ATOM 19 C CA . ARG 1082 1082 ? A 177.475 220.899 225.584 1 1 T ARG 0.530 1 ATOM 20 C C . ARG 1082 1082 ? A 176.951 219.752 226.449 1 1 T ARG 0.530 1 ATOM 21 O O . ARG 1082 1082 ? A 176.683 219.923 227.634 1 1 T ARG 0.530 1 ATOM 22 C CB . ARG 1082 1082 ? A 176.277 221.502 224.811 1 1 T ARG 0.530 1 ATOM 23 C CG . ARG 1082 1082 ? A 176.569 222.885 224.196 1 1 T ARG 0.530 1 ATOM 24 C CD . ARG 1082 1082 ? A 175.306 223.623 223.725 1 1 T ARG 0.530 1 ATOM 25 N NE . ARG 1082 1082 ? A 174.695 222.834 222.598 1 1 T ARG 0.530 1 ATOM 26 C CZ . ARG 1082 1082 ? A 175.022 222.954 221.305 1 1 T ARG 0.530 1 ATOM 27 N NH1 . ARG 1082 1082 ? A 175.945 223.815 220.889 1 1 T ARG 0.530 1 ATOM 28 N NH2 . ARG 1082 1082 ? A 174.374 222.227 220.391 1 1 T ARG 0.530 1 ATOM 29 N N . LYS 1083 1083 ? A 176.805 218.545 225.864 1 1 T LYS 0.610 1 ATOM 30 C CA . LYS 1083 1083 ? A 176.432 217.334 226.577 1 1 T LYS 0.610 1 ATOM 31 C C . LYS 1083 1083 ? A 177.465 216.901 227.612 1 1 T LYS 0.610 1 ATOM 32 O O . LYS 1083 1083 ? A 177.102 216.574 228.738 1 1 T LYS 0.610 1 ATOM 33 C CB . LYS 1083 1083 ? A 176.187 216.165 225.588 1 1 T LYS 0.610 1 ATOM 34 C CG . LYS 1083 1083 ? A 174.933 216.347 224.715 1 1 T LYS 0.610 1 ATOM 35 C CD . LYS 1083 1083 ? A 174.698 215.163 223.754 1 1 T LYS 0.610 1 ATOM 36 C CE . LYS 1083 1083 ? A 173.419 215.301 222.909 1 1 T LYS 0.610 1 ATOM 37 N NZ . LYS 1083 1083 ? A 173.253 214.155 221.980 1 1 T LYS 0.610 1 ATOM 38 N N . LEU 1084 1084 ? A 178.766 216.936 227.251 1 1 T LEU 0.590 1 ATOM 39 C CA . LEU 1084 1084 ? A 179.885 216.656 228.138 1 1 T LEU 0.590 1 ATOM 40 C C . LEU 1084 1084 ? A 180.009 217.652 229.281 1 1 T LEU 0.590 1 ATOM 41 O O . LEU 1084 1084 ? A 180.283 217.278 230.416 1 1 T LEU 0.590 1 ATOM 42 C CB . LEU 1084 1084 ? A 181.214 216.613 227.346 1 1 T LEU 0.590 1 ATOM 43 C CG . LEU 1084 1084 ? A 181.290 215.481 226.299 1 1 T LEU 0.590 1 ATOM 44 C CD1 . LEU 1084 1084 ? A 182.432 215.748 225.303 1 1 T LEU 0.590 1 ATOM 45 C CD2 . LEU 1084 1084 ? A 181.447 214.104 226.969 1 1 T LEU 0.590 1 ATOM 46 N N . ARG 1085 1085 ? A 179.774 218.959 229.024 1 1 T ARG 0.590 1 ATOM 47 C CA . ARG 1085 1085 ? A 179.707 219.971 230.070 1 1 T ARG 0.590 1 ATOM 48 C C . ARG 1085 1085 ? A 178.596 219.709 231.080 1 1 T ARG 0.590 1 ATOM 49 O O . ARG 1085 1085 ? A 178.825 219.762 232.283 1 1 T ARG 0.590 1 ATOM 50 C CB . ARG 1085 1085 ? A 179.506 221.387 229.481 1 1 T ARG 0.590 1 ATOM 51 C CG . ARG 1085 1085 ? A 180.738 221.948 228.750 1 1 T ARG 0.590 1 ATOM 52 C CD . ARG 1085 1085 ? A 180.428 223.307 228.129 1 1 T ARG 0.590 1 ATOM 53 N NE . ARG 1085 1085 ? A 181.660 223.764 227.404 1 1 T ARG 0.590 1 ATOM 54 C CZ . ARG 1085 1085 ? A 181.697 224.840 226.608 1 1 T ARG 0.590 1 ATOM 55 N NH1 . ARG 1085 1085 ? A 180.606 225.576 226.411 1 1 T ARG 0.590 1 ATOM 56 N NH2 . ARG 1085 1085 ? A 182.834 225.205 226.019 1 1 T ARG 0.590 1 ATOM 57 N N . ARG 1086 1086 ? A 177.384 219.346 230.608 1 1 T ARG 0.620 1 ATOM 58 C CA . ARG 1086 1086 ? A 176.275 218.958 231.464 1 1 T ARG 0.620 1 ATOM 59 C C . ARG 1086 1086 ? A 176.571 217.719 232.304 1 1 T ARG 0.620 1 ATOM 60 O O . ARG 1086 1086 ? A 176.239 217.635 233.483 1 1 T ARG 0.620 1 ATOM 61 C CB . ARG 1086 1086 ? A 175.031 218.640 230.593 1 1 T ARG 0.620 1 ATOM 62 C CG . ARG 1086 1086 ? A 173.777 218.243 231.407 1 1 T ARG 0.620 1 ATOM 63 C CD . ARG 1086 1086 ? A 172.551 217.839 230.576 1 1 T ARG 0.620 1 ATOM 64 N NE . ARG 1086 1086 ? A 172.884 216.584 229.799 1 1 T ARG 0.620 1 ATOM 65 C CZ . ARG 1086 1086 ? A 172.847 215.330 230.280 1 1 T ARG 0.620 1 ATOM 66 N NH1 . ARG 1086 1086 ? A 172.513 215.074 231.539 1 1 T ARG 0.620 1 ATOM 67 N NH2 . ARG 1086 1086 ? A 173.191 214.302 229.499 1 1 T ARG 0.620 1 ATOM 68 N N . GLU 1087 1087 ? A 177.204 216.696 231.693 1 1 T GLU 0.650 1 ATOM 69 C CA . GLU 1087 1087 ? A 177.645 215.503 232.385 1 1 T GLU 0.650 1 ATOM 70 C C . GLU 1087 1087 ? A 178.709 215.776 233.432 1 1 T GLU 0.650 1 ATOM 71 O O . GLU 1087 1087 ? A 178.660 215.238 234.539 1 1 T GLU 0.650 1 ATOM 72 C CB . GLU 1087 1087 ? A 178.137 214.444 231.389 1 1 T GLU 0.650 1 ATOM 73 C CG . GLU 1087 1087 ? A 178.300 213.054 232.044 1 1 T GLU 0.650 1 ATOM 74 C CD . GLU 1087 1087 ? A 178.395 211.923 231.025 1 1 T GLU 0.650 1 ATOM 75 O OE1 . GLU 1087 1087 ? A 178.340 212.200 229.799 1 1 T GLU 0.650 1 ATOM 76 O OE2 . GLU 1087 1087 ? A 178.470 210.760 231.496 1 1 T GLU 0.650 1 ATOM 77 N N . LEU 1088 1088 ? A 179.668 216.675 233.113 1 1 T LEU 0.660 1 ATOM 78 C CA . LEU 1088 1088 ? A 180.645 217.182 234.058 1 1 T LEU 0.660 1 ATOM 79 C C . LEU 1088 1088 ? 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A 175.859 222.391 234.211 1 1 T GLU 0.650 1 ATOM 93 O OE2 . GLU 1089 1089 ? A 177.570 223.774 233.897 1 1 T GLU 0.650 1 ATOM 94 N N . SER 1090 1090 ? A 176.937 217.488 236.548 1 1 T SER 0.680 1 ATOM 95 C CA . SER 1090 1090 ? A 176.306 216.398 237.285 1 1 T SER 0.680 1 ATOM 96 C C . SER 1090 1090 ? A 177.281 215.488 238.020 1 1 T SER 0.680 1 ATOM 97 O O . SER 1090 1090 ? A 177.011 215.014 239.118 1 1 T SER 0.680 1 ATOM 98 C CB . SER 1090 1090 ? A 175.505 215.436 236.374 1 1 T SER 0.680 1 ATOM 99 O OG . SER 1090 1090 ? A 174.399 216.081 235.747 1 1 T SER 0.680 1 ATOM 100 N N . SER 1091 1091 ? A 178.442 215.163 237.398 1 1 T SER 0.660 1 ATOM 101 C CA . SER 1091 1091 ? A 179.523 214.433 238.056 1 1 T SER 0.660 1 ATOM 102 C C . SER 1091 1091 ? A 180.140 215.218 239.205 1 1 T SER 0.660 1 ATOM 103 O O . SER 1091 1091 ? A 180.328 214.670 240.285 1 1 T SER 0.660 1 ATOM 104 C CB . SER 1091 1091 ? A 180.627 213.862 237.103 1 1 T SER 0.660 1 ATOM 105 O OG . SER 1091 1091 ? 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A 177.771 216.314 244.208 1 1 T GLU 0.600 1 ATOM 119 C CB . GLU 1093 1093 ? A 176.270 217.822 241.630 1 1 T GLU 0.600 1 ATOM 120 C CG . GLU 1093 1093 ? A 175.990 219.253 241.117 1 1 T GLU 0.600 1 ATOM 121 C CD . GLU 1093 1093 ? A 174.563 219.395 240.588 1 1 T GLU 0.600 1 ATOM 122 O OE1 . GLU 1093 1093 ? A 173.858 218.358 240.469 1 1 T GLU 0.600 1 ATOM 123 O OE2 . GLU 1093 1093 ? A 174.163 220.559 240.330 1 1 T GLU 0.600 1 ATOM 124 N N . LYS 1094 1094 ? A 177.780 215.166 242.277 1 1 T LYS 0.620 1 ATOM 125 C CA . LYS 1094 1094 ? A 177.954 213.860 242.894 1 1 T LYS 0.620 1 ATOM 126 C C . LYS 1094 1094 ? A 179.261 213.712 243.657 1 1 T LYS 0.620 1 ATOM 127 O O . LYS 1094 1094 ? A 179.273 213.187 244.769 1 1 T LYS 0.620 1 ATOM 128 C CB . LYS 1094 1094 ? A 177.882 212.721 241.852 1 1 T LYS 0.620 1 ATOM 129 C CG . LYS 1094 1094 ? A 176.477 212.535 241.270 1 1 T LYS 0.620 1 ATOM 130 C CD . LYS 1094 1094 ? A 176.428 211.415 240.221 1 1 T LYS 0.620 1 ATOM 131 C CE . LYS 1094 1094 ? 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A 202.258 185.225 319.505 1 1 T LYS 0.830 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O S # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.644 2 1 3 0.019 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 1080 GLN 1 0.760 2 1 A 1081 ILE 1 0.790 3 1 A 1082 ARG 1 0.530 4 1 A 1083 LYS 1 0.610 5 1 A 1084 LEU 1 0.590 6 1 A 1085 ARG 1 0.590 7 1 A 1086 ARG 1 0.620 8 1 A 1087 GLU 1 0.650 9 1 A 1088 LEU 1 0.660 10 1 A 1089 GLU 1 0.650 11 1 A 1090 SER 1 0.680 12 1 A 1091 SER 1 0.660 13 1 A 1092 GLN 1 0.600 14 1 A 1093 GLU 1 0.600 15 1 A 1094 LYS 1 0.620 16 1 A 1095 VAL 1 0.600 17 1 A 1096 ALA 1 0.640 18 1 A 1097 THR 1 0.600 19 1 A 1098 LEU 1 0.600 20 1 A 1099 THR 1 0.600 21 1 A 1100 SER 1 0.600 22 1 A 1101 GLN 1 0.580 23 1 A 1102 LEU 1 0.670 24 1 A 1103 SER 1 0.670 25 1 A 1104 ALA 1 0.740 26 1 A 1105 ASN 1 0.710 27 1 A 1106 ALA 1 0.680 28 1 A 1107 ASN 1 0.630 29 1 A 1108 LEU 1 0.670 30 1 A 1109 VAL 1 0.620 31 1 A 1110 ALA 1 0.630 32 1 A 1111 ALA 1 0.640 33 1 A 1112 PHE 1 0.570 34 1 A 1113 GLU 1 0.600 35 1 A 1114 GLN 1 0.590 36 1 A 1115 SER 1 0.610 37 1 A 1116 LEU 1 0.600 38 1 A 1117 VAL 1 0.600 39 1 A 1118 ASN 1 0.630 40 1 A 1119 MET 1 0.590 41 1 A 1120 THR 1 0.640 42 1 A 1121 SER 1 0.640 43 1 A 1122 ARG 1 0.610 44 1 A 1123 LEU 1 0.640 45 1 A 1124 ARG 1 0.610 46 1 A 1125 HIS 1 0.610 47 1 A 1126 LEU 1 0.640 48 1 A 1127 ALA 1 0.670 49 1 A 1128 GLU 1 0.620 50 1 A 1129 THR 1 0.680 51 1 A 1130 ALA 1 0.700 52 1 A 1131 GLU 1 0.660 53 1 A 1132 GLU 1 0.620 54 1 A 1133 LYS 1 0.640 55 1 A 1134 ASP 1 0.630 56 1 A 1135 THR 1 0.690 57 1 A 1136 GLU 1 0.650 58 1 A 1137 LEU 1 0.660 59 1 A 1138 LEU 1 0.670 60 1 A 1139 ASP 1 0.670 61 1 A 1140 LEU 1 0.680 62 1 A 1141 ARG 1 0.660 63 1 A 1142 GLU 1 0.670 64 1 A 1143 THR 1 0.680 65 1 A 1144 ILE 1 0.640 66 1 A 1145 ASP 1 0.630 67 1 A 1146 PHE 1 0.620 68 1 A 1147 LEU 1 0.630 69 1 A 1148 LYS 1 0.630 70 1 A 1149 LYS 1 0.810 71 1 A 1150 LYS 1 0.830 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #