data_SMR-ce2715c1e7bd330f42a52b3424931db2_4 _entry.id SMR-ce2715c1e7bd330f42a52b3424931db2_4 _struct.entry_id SMR-ce2715c1e7bd330f42a52b3424931db2_4 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - A0A6P5P1N9/ A0A6P5P1N9_MUSCR, Structural maintenance of chromosomes protein - A0A8C6ILA6/ A0A8C6ILA6_MUSSI, Structural maintenance of chromosomes protein - Q1HL32/ Q1HL32_MOUSE, Structural maintenance of chromosomes protein - Q9CW03/ SMC3_MOUSE, Structural maintenance of chromosomes protein 3 Estimated model accuracy of this model is 0.021, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries A0A6P5P1N9, A0A8C6ILA6, Q1HL32, Q9CW03' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 163694.114 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP SMC3_MOUSE Q9CW03 1 ;MYIKQVIIQGFRSYRDQTIVDPFSSKHNVIVGRNGSGKSNFFYAIQFVLSDEFSHLRPEQRLALLHEGTG PRVISAFVEIIFDNSDNRLPIDKEEVSLRRVIGAKKDQYFLDKKMVTKNDVMNLLESAGFSRSNPYYIVK QGKINQMATAPDSQRLKLLREVAGTRVYDERKEESISLMKETEGKREKINELLKYIEERLHTLEEEKEEL AQYQKWDKMRRALEYTIYNQELNETRAKLDELSAKRETSGEKSRQLRDAQQDARDKMEDIERQVRELKTK ISAMKEEKEQLSAERQEQIKQRTKLELKAKDLQDELAGNSEQRKRLLKERQKLLEKIEEKQKELAETEPK FNSVKEKEERGIARLAQATQERTDLYAKQGRGSQFTSKEERDKWIKKELKSLDQAINDKKRQIAAIHKDL EDTEANKEKNLEQYNKLDQDLNEVKARVEELDRKYYEVKNKKDELQSERNYLWREENAEQQALAAKREDL EKKQQLLRAATGKAILNGIDSINKVLEHFRRKGINQHVQNGYHGIVMNNFECEPAFYTCVEVTAGNRLFY HIVDSDEVSTKILMEFNKMNLPGEVTFLPLNKLDVRDTAYPETNDAIPMISKLRYNPRFDKAFKHVFGKT LICRSMEVSTQLARAFTMDCITLEGDQVSHRGALTGGYYDTRKSRLELQKDVRKAEEELGELEAKLNENL RRNIERINNEIDQLMNQMQQIETQQRKFKASRDSILSEMKMLKEKRQQSEKTFMPKQRSLQSLEASLHAM ESTRESLKAELGTDLLSQLSLEDQKRVDALNDEIRQLQQENRQLLNERIKLEGIITRVETYLNENLRKRL DQVEQELNELRETEGGTVLTATTSELEAINKRVKDTMARSEDLDNSIDKTEAGIKELQKSMERWKNMEKE HMDAINHDTKELEKMTNRQGMLLKKKEECMKKIRELGSLPQEAFEKYQTLSLKQLFRKLEQCNTELKKYS HVNKKALDQFVNFSEQKEKLIKRQEELDRGYKSIMELMNVLELRKYEAIQLTFKQVSKNFSEVFQKLVPG GKATLVMKKGDVEGSQSQDEGEGSGESERGSGSQSSVPSVDQFTGVGIRVSFTGKQGEMREMQQLSGGQK SLVALALIFAIQKCDPAPFYLFDEIDQALDAQHRKAVSDMIMELAVHAQFITTTFRPELLESADKFYGVK FRNKVSHIDVITAEMAKDFVEDDTTHG ; 'Structural maintenance of chromosomes protein 3' 2 1 UNP A0A8C6ILA6_MUSSI A0A8C6ILA6 1 ;MYIKQVIIQGFRSYRDQTIVDPFSSKHNVIVGRNGSGKSNFFYAIQFVLSDEFSHLRPEQRLALLHEGTG PRVISAFVEIIFDNSDNRLPIDKEEVSLRRVIGAKKDQYFLDKKMVTKNDVMNLLESAGFSRSNPYYIVK QGKINQMATAPDSQRLKLLREVAGTRVYDERKEESISLMKETEGKREKINELLKYIEERLHTLEEEKEEL AQYQKWDKMRRALEYTIYNQELNETRAKLDELSAKRETSGEKSRQLRDAQQDARDKMEDIERQVRELKTK ISAMKEEKEQLSAERQEQIKQRTKLELKAKDLQDELAGNSEQRKRLLKERQKLLEKIEEKQKELAETEPK FNSVKEKEERGIARLAQATQERTDLYAKQGRGSQFTSKEERDKWIKKELKSLDQAINDKKRQIAAIHKDL EDTEANKEKNLEQYNKLDQDLNEVKARVEELDRKYYEVKNKKDELQSERNYLWREENAEQQALAAKREDL EKKQQLLRAATGKAILNGIDSINKVLEHFRRKGINQHVQNGYHGIVMNNFECEPAFYTCVEVTAGNRLFY HIVDSDEVSTKILMEFNKMNLPGEVTFLPLNKLDVRDTAYPETNDAIPMISKLRYNPRFDKAFKHVFGKT LICRSMEVSTQLARAFTMDCITLEGDQVSHRGALTGGYYDTRKSRLELQKDVRKAEEELGELEAKLNENL RRNIERINNEIDQLMNQMQQIETQQRKFKASRDSILSEMKMLKEKRQQSEKTFMPKQRSLQSLEASLHAM ESTRESLKAELGTDLLSQLSLEDQKRVDALNDEIRQLQQENRQLLNERIKLEGIITRVETYLNENLRKRL DQVEQELNELRETEGGTVLTATTSELEAINKRVKDTMARSEDLDNSIDKTEAGIKELQKSMERWKNMEKE HMDAINHDTKELEKMTNRQGMLLKKKEECMKKIRELGSLPQEAFEKYQTLSLKQLFRKLEQCNTELKKYS HVNKKALDQFVNFSEQKEKLIKRQEELDRGYKSIMELMNVLELRKYEAIQLTFKQVSKNFSEVFQKLVPG GKATLVMKKGDVEGSQSQDEGEGSGESERGSGSQSSVPSVDQFTGVGIRVSFTGKQGEMREMQQLSGGQK SLVALALIFAIQKCDPAPFYLFDEIDQALDAQHRKAVSDMIMELAVHAQFITTTFRPELLESADKFYGVK FRNKVSHIDVITAEMAKDFVEDDTTHG ; 'Structural maintenance of chromosomes protein' 3 1 UNP A0A6P5P1N9_MUSCR A0A6P5P1N9 1 ;MYIKQVIIQGFRSYRDQTIVDPFSSKHNVIVGRNGSGKSNFFYAIQFVLSDEFSHLRPEQRLALLHEGTG PRVISAFVEIIFDNSDNRLPIDKEEVSLRRVIGAKKDQYFLDKKMVTKNDVMNLLESAGFSRSNPYYIVK QGKINQMATAPDSQRLKLLREVAGTRVYDERKEESISLMKETEGKREKINELLKYIEERLHTLEEEKEEL AQYQKWDKMRRALEYTIYNQELNETRAKLDELSAKRETSGEKSRQLRDAQQDARDKMEDIERQVRELKTK ISAMKEEKEQLSAERQEQIKQRTKLELKAKDLQDELAGNSEQRKRLLKERQKLLEKIEEKQKELAETEPK FNSVKEKEERGIARLAQATQERTDLYAKQGRGSQFTSKEERDKWIKKELKSLDQAINDKKRQIAAIHKDL EDTEANKEKNLEQYNKLDQDLNEVKARVEELDRKYYEVKNKKDELQSERNYLWREENAEQQALAAKREDL EKKQQLLRAATGKAILNGIDSINKVLEHFRRKGINQHVQNGYHGIVMNNFECEPAFYTCVEVTAGNRLFY 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AQYQKWDKMRRALEYTIYNQELNETRAKLDELSAKRETSGEKSRQLRDAQQDARDKMEDIERQVRELKTK ISAMKEEKEQLSAERQEQIKQRTKLELKAKDLQDELAGNSEQRKRLLKERQKLLEKIEEKQKELAETEPK FNSVKEKEERGIARLAQATQERTDLYAKQGRGSQFTSKEERDKWIKKELKSLDQAINDKKRQIAAIHKDL EDTEANKEKNLEQYNKLDQDLNEVKARVEELDRKYYEVKNKKDELQSERNYLWREENAEQQALAAKREDL EKKQQLLRAATGKAILNGIDSINKVLEHFRRKGINQHVQNGYHGIVMNNFECEPAFYTCVEVTAGNRLFY HIVDSDEVSTKILMEFNKMNLPGEVTFLPLNKLDVRDTAYPETNDAIPMISKLRYNPRFDKAFKHVFGKT LICRSMEVSTQLARAFTMDCITLEGDQVSHRGALTGGYYDTRKSRLELQKDVRKAEEELGELEAKLNENL RRNIERINNEIDQLMNQMQQIETQQRKFKASRDSILSEMKMLKEKRQQSEKTFMPKQRSLQSLEASLHAM ESTRESLKAELGTDLLSQLSLEDQKRVDALNDEIRQLQQENRQLLNERIKLEGIITRVETYLNENLRKRL DQVEQELNELRETEGGTVLTATTSELEAINKRVKDTMARSEDLDNSIDKTEAGIKELQKSMERWKNMEKE HMDAINHDTKELEKMTNRQGMLLKKKEECMKKIRELGSLPQEAFEKYQTLSLKQLFRKLEQCNTELKKYS HVNKKALDQFVNFSEQKEKLIKRQEELDRGYKSIMELMNVLELRKYEAIQLTFKQVSKNFSEVFQKLVPG GKATLVMKKGDVEGSQSQDEGEGSGESERGSGSQSSVPSVDQFTGVGIRVSFTGKQGEMREMQQLSGGQK SLVALALIFAIQKCDPAPFYLFDEIDQALDAQHRKAVSDMIMELAVHAQFITTTFRPELLESADKFYGVK FRNKVSHIDVITAEMAKDFVEDDTTHG ; 'Structural maintenance of chromosomes protein' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1217 1 1217 2 2 1 1217 1 1217 3 3 1 1217 1 1217 4 4 1 1217 1 1217 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . SMC3_MOUSE Q9CW03 . 1 1217 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2003-03-25 11FF55165BE6A88E 1 UNP . A0A8C6ILA6_MUSSI A0A8C6ILA6 . 1 1217 10103 'Mus spicilegus (Steppe mouse)' 2022-01-19 11FF55165BE6A88E 1 UNP . A0A6P5P1N9_MUSCR A0A6P5P1N9 . 1 1217 10089 'Mus caroli (Ryukyu mouse) (Ricefield mouse)' 2020-12-02 11FF55165BE6A88E 1 UNP . 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A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Tektin-5 {PDB ID=8to0, label_asym_id=VO, auth_asym_id=z3, SMTL ID=8to0.412.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 8to0, label_asym_id=VO' 'target-template alignment' . 4 'model 4' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-25 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-20 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A VO 26 1 z3 # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MEFLGTTQTASFCGPKKGCGLQALPPAGQEPVVQECYQPFHLPGYRYLNAWRPSVFHKIATSQTIPEECS GIRRPPTILPSLRSALFCRYTPRDWDRSNDLQIRNAEASRLWASRLTGDSLRIMQDKDQLIHQMQEGTSR NLGQRLSDLGFWKSELCYELDRLLTENSSMDTLKRRLECAAEEVNCPLQVALECLYNREKRIGIDLVHDN VEKNLIREVDLLKCCQDQMRKLAKRIDFQIRDNRDAQHSLERDIEDKSSAQYIDENCFNLRSTSDSISFF HGVEKFDGTVSIPETWAKFSNDNIRHAQNMRANSIRLREEAEHLFETLSDQMWKQFTNTNLAFNARISEE TDVKNKLQTQLAKILQEIFQAENTIMLLERAIVAKEYPLKMAQTMLACRTRRPNVELCRDVPQFRLVNEV FTIDDTLQTLKLRLRETQDTLQLLVMTKSRLEHELAIKANTLCIDKDKCMSMRKSFPSTPRLTGYTCSAI GSGPYANHAPRISSGPCSGSALCKGPASCGGGASCGGGASCGGHAPCGSALCSHSVSRSGPGFAPVC ; ;MEFLGTTQTASFCGPKKGCGLQALPPAGQEPVVQECYQPFHLPGYRYLNAWRPSVFHKIATSQTIPEECS GIRRPPTILPSLRSALFCRYTPRDWDRSNDLQIRNAEASRLWASRLTGDSLRIMQDKDQLIHQMQEGTSR NLGQRLSDLGFWKSELCYELDRLLTENSSMDTLKRRLECAAEEVNCPLQVALECLYNREKRIGIDLVHDN VEKNLIREVDLLKCCQDQMRKLAKRIDFQIRDNRDAQHSLERDIEDKSSAQYIDENCFNLRSTSDSISFF HGVEKFDGTVSIPETWAKFSNDNIRHAQNMRANSIRLREEAEHLFETLSDQMWKQFTNTNLAFNARISEE TDVKNKLQTQLAKILQEIFQAENTIMLLERAIVAKEYPLKMAQTMLACRTRRPNVELCRDVPQFRLVNEV FTIDDTLQTLKLRLRETQDTLQLLVMTKSRLEHELAIKANTLCIDKDKCMSMRKSFPSTPRLTGYTCSAI GSGPYANHAPRISSGPCSGSALCKGPASCGGGASCGGGASCGGHAPCGSALCSHSVSRSGPGFAPVC ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 141 193 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8to0 2023-11-22 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1217 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1217 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 52.000 13.208 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MYIKQVIIQGFRSYRDQTIVDPFSSKHNVIVGRNGSGKSNFFYAIQFVLSDEFSHLRPEQRLALLHEGTGPRVISAFVEIIFDNSDNRLPIDKEEVSLRRVIGAKKDQYFLDKKMVTKNDVMNLLESAGFSRSNPYYIVKQGKINQMATAPDSQRLKLLREVAGTRVYDERKEESISLMKETEGKREKINELLKYIEERLHTLEEEKEELAQYQKWDKMRRALEYTIYNQELNETRAKLDELSAKRETSGEKSRQLRDAQQDARDKMEDIERQVRELKTKISAMKEEKEQLSAERQEQIKQRTKLELKAKDLQDELAGNSEQRKRLLKERQKLLEKIEEKQKELAETEPKFNSVKEKEERGIARLAQATQERTDLYAKQGRGSQFTSKEERDKWIKKELKSLDQAINDKKRQIAAIHKDLEDTEANKEKNLEQYNKLDQDLNEVKARVEELDRKYYEVKNKKDELQSERNYLWREENAEQQALAAKREDLEKKQQLLRAATGKAILNGIDSINKVLEHFRRKGINQHVQNGYHGIVMNNFECEPAFYTCVEVTAGNRLFYHIVDSDEVSTKILMEFNKMNLPGEVTFLPLNKLDVRDTAYPETNDAIPMISKLRYNPRFDKAFKHVFGKTLICRSMEVSTQLARAFTMDCITLEGDQVSHRGALTGGYYDTRKSRLELQKDVRKAEEELGELEAKLNENLRRNIERINNEIDQLMNQMQQIETQQRKFKASRDSILSEMKMLKEKRQQSEKTFMPKQRSLQSLEASLHAMESTRESLKAELGTDLLSQLSLEDQKRVDALNDEIRQLQQENRQLLNERIKLEGIITRVETYLNENLRKRLDQVEQELNELRETEGGTVLTATTSELEAINKRVKDTMARSEDLDNSIDKTEAGIKELQKSMERWKNMEKEHMDAINHDTKELEKMTNRQGMLLKKKEECMKKIRELGSLPQEAFEKYQTLSLKQLFRKLEQCNTELKKYSHVNKKALDQFVNFSEQKEKLIKRQEELDRGYKSIMELMNVLELRKYEAIQLTFKQVSKNFSEVFQKLVPGGKATLVMKKGDVEGSQSQDEGEGSGESERGSGSQSSVPSVDQFTGVGIRVSFTGKQGEMREMQQLSGGQKSLVALALIFAIQKCDPAPFYLFDEIDQALDAQHRKAVSDMIMELAVHAQFITTTFRPELLESADKFYGVKFRNKVSHIDVITAEMAKDFVEDDTTHG 2 1 2 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------NLGQRLSDLGFWKSELCYELDRLLTENSSMDTLKRRLECAAEEVNCPLQVALE----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8to0.412' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 4' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . GLU 390 390 ? A 293.101 399.646 429.912 1 1 A GLU 0.650 1 ATOM 2 C CA . GLU 390 390 ? A 293.518 399.936 431.327 1 1 A GLU 0.650 1 ATOM 3 C C . GLU 390 390 ? A 292.670 400.826 432.216 1 1 A GLU 0.650 1 ATOM 4 O O . GLU 390 390 ? A 292.629 400.623 433.421 1 1 A GLU 0.650 1 ATOM 5 C CB . GLU 390 390 ? A 294.991 400.406 431.294 1 1 A GLU 0.650 1 ATOM 6 C CG . GLU 390 390 ? A 295.942 399.374 430.645 1 1 A GLU 0.650 1 ATOM 7 C CD . GLU 390 390 ? A 295.615 398.021 431.264 1 1 A GLU 0.650 1 ATOM 8 O OE1 . GLU 390 390 ? A 295.823 397.870 432.492 1 1 A GLU 0.650 1 ATOM 9 O OE2 . GLU 390 390 ? A 294.953 397.184 430.573 1 1 A GLU 0.650 1 ATOM 10 N N . ARG 391 391 ? A 291.917 401.798 431.655 1 1 A ARG 0.690 1 ATOM 11 C CA . ARG 391 391 ? A 291.048 402.682 432.416 1 1 A ARG 0.690 1 ATOM 12 C C . ARG 391 391 ? A 290.020 401.967 433.302 1 1 A ARG 0.690 1 ATOM 13 O O . ARG 391 391 ? A 289.943 402.227 434.492 1 1 A ARG 0.690 1 ATOM 14 C CB . ARG 391 391 ? A 290.318 403.588 431.390 1 1 A ARG 0.690 1 ATOM 15 C CG . ARG 391 391 ? A 289.392 404.654 432.010 1 1 A ARG 0.690 1 ATOM 16 C CD . ARG 391 391 ? A 288.536 405.485 431.026 1 1 A ARG 0.690 1 ATOM 17 N NE . ARG 391 391 ? A 287.555 404.606 430.288 1 1 A ARG 0.690 1 ATOM 18 C CZ . ARG 391 391 ? A 286.361 404.198 430.741 1 1 A ARG 0.690 1 ATOM 19 N NH1 . ARG 391 391 ? A 285.887 404.547 431.925 1 1 A ARG 0.690 1 ATOM 20 N NH2 . ARG 391 391 ? A 285.661 403.283 430.070 1 1 A ARG 0.690 1 ATOM 21 N N . ASP 392 392 ? A 289.273 400.984 432.754 1 1 A ASP 0.790 1 ATOM 22 C CA . ASP 392 392 ? A 288.321 400.169 433.488 1 1 A ASP 0.790 1 ATOM 23 C C . ASP 392 392 ? A 288.933 399.394 434.644 1 1 A ASP 0.790 1 ATOM 24 O O . ASP 392 392 ? A 288.367 399.300 435.722 1 1 A ASP 0.790 1 ATOM 25 C CB . ASP 392 392 ? A 287.651 399.179 432.511 1 1 A ASP 0.790 1 ATOM 26 C CG . ASP 392 392 ? A 286.852 399.909 431.440 1 1 A ASP 0.790 1 ATOM 27 O OD1 . ASP 392 392 ? A 286.581 401.130 431.585 1 1 A ASP 0.790 1 ATOM 28 O OD2 . ASP 392 392 ? A 286.552 399.246 430.423 1 1 A ASP 0.790 1 ATOM 29 N N . LYS 393 393 ? A 290.138 398.828 434.444 1 1 A LYS 0.780 1 ATOM 30 C CA . LYS 393 393 ? A 290.884 398.146 435.480 1 1 A LYS 0.780 1 ATOM 31 C C . LYS 393 393 ? A 291.315 399.046 436.619 1 1 A LYS 0.780 1 ATOM 32 O O . LYS 393 393 ? A 291.190 398.666 437.774 1 1 A LYS 0.780 1 ATOM 33 C CB . LYS 393 393 ? A 292.151 397.486 434.909 1 1 A LYS 0.780 1 ATOM 34 C CG . LYS 393 393 ? A 291.883 396.456 433.806 1 1 A LYS 0.780 1 ATOM 35 C CD . LYS 393 393 ? A 293.211 395.906 433.268 1 1 A LYS 0.780 1 ATOM 36 C CE . LYS 393 393 ? A 293.091 394.959 432.073 1 1 A LYS 0.780 1 ATOM 37 N NZ . LYS 393 393 ? A 294.441 394.670 431.539 1 1 A LYS 0.780 1 ATOM 38 N N . TRP 394 394 ? A 291.819 400.263 436.308 1 1 A TRP 0.760 1 ATOM 39 C CA . TRP 394 394 ? A 292.154 401.279 437.294 1 1 A TRP 0.760 1 ATOM 40 C C . TRP 394 394 ? A 290.934 401.701 438.097 1 1 A TRP 0.760 1 ATOM 41 O O . TRP 394 394 ? A 290.969 401.695 439.320 1 1 A TRP 0.760 1 ATOM 42 C CB . TRP 394 394 ? A 292.813 402.515 436.608 1 1 A TRP 0.760 1 ATOM 43 C CG . TRP 394 394 ? A 293.295 403.629 437.544 1 1 A TRP 0.760 1 ATOM 44 C CD1 . TRP 394 394 ? A 294.463 403.706 438.248 1 1 A TRP 0.760 1 ATOM 45 C CD2 . TRP 394 394 ? A 292.514 404.769 437.952 1 1 A TRP 0.760 1 ATOM 46 N NE1 . TRP 394 394 ? A 294.457 404.804 439.076 1 1 A TRP 0.760 1 ATOM 47 C CE2 . TRP 394 394 ? A 293.279 405.479 438.900 1 1 A TRP 0.760 1 ATOM 48 C CE3 . TRP 394 394 ? A 291.230 405.186 437.624 1 1 A TRP 0.760 1 ATOM 49 C CZ2 . TRP 394 394 ? A 292.784 406.623 439.509 1 1 A TRP 0.760 1 ATOM 50 C CZ3 . TRP 394 394 ? A 290.723 406.330 438.253 1 1 A TRP 0.760 1 ATOM 51 C CH2 . TRP 394 394 ? A 291.493 407.047 439.175 1 1 A TRP 0.760 1 ATOM 52 N N . ILE 395 395 ? A 289.792 401.965 437.416 1 1 A ILE 0.800 1 ATOM 53 C CA . ILE 395 395 ? A 288.534 402.330 438.063 1 1 A ILE 0.800 1 ATOM 54 C C . ILE 395 395 ? A 288.077 401.253 439.029 1 1 A ILE 0.800 1 ATOM 55 O O . ILE 395 395 ? A 287.775 401.522 440.184 1 1 A ILE 0.800 1 ATOM 56 C CB . ILE 395 395 ? A 287.438 402.590 437.022 1 1 A ILE 0.800 1 ATOM 57 C CG1 . ILE 395 395 ? A 287.773 403.834 436.173 1 1 A ILE 0.800 1 ATOM 58 C CG2 . ILE 395 395 ? A 286.034 402.757 437.655 1 1 A ILE 0.800 1 ATOM 59 C CD1 . ILE 395 395 ? A 286.929 403.931 434.899 1 1 A ILE 0.800 1 ATOM 60 N N . LYS 396 396 ? A 288.091 399.977 438.596 1 1 A LYS 0.810 1 ATOM 61 C CA . LYS 396 396 ? A 287.744 398.856 439.447 1 1 A LYS 0.810 1 ATOM 62 C C . LYS 396 396 ? A 288.638 398.663 440.656 1 1 A LYS 0.810 1 ATOM 63 O O . LYS 396 396 ? A 288.171 398.262 441.713 1 1 A LYS 0.810 1 ATOM 64 C CB . LYS 396 396 ? A 287.725 397.534 438.659 1 1 A LYS 0.810 1 ATOM 65 C CG . LYS 396 396 ? A 286.606 397.463 437.617 1 1 A LYS 0.810 1 ATOM 66 C CD . LYS 396 396 ? A 286.694 396.169 436.797 1 1 A LYS 0.810 1 ATOM 67 C CE . LYS 396 396 ? A 285.635 396.092 435.698 1 1 A LYS 0.810 1 ATOM 68 N NZ . LYS 396 396 ? A 285.781 394.835 434.929 1 1 A LYS 0.810 1 ATOM 69 N N . LYS 397 397 ? A 289.954 398.909 440.524 1 1 A LYS 0.800 1 ATOM 70 C CA . LYS 397 397 ? A 290.868 398.906 441.652 1 1 A LYS 0.800 1 ATOM 71 C C . LYS 397 397 ? A 290.586 399.993 442.677 1 1 A LYS 0.800 1 ATOM 72 O O . LYS 397 397 ? A 290.536 399.718 443.872 1 1 A LYS 0.800 1 ATOM 73 C CB . LYS 397 397 ? A 292.320 399.048 441.164 1 1 A LYS 0.800 1 ATOM 74 C CG . LYS 397 397 ? A 292.826 397.824 440.395 1 1 A LYS 0.800 1 ATOM 75 C CD . LYS 397 397 ? A 294.230 398.067 439.829 1 1 A LYS 0.800 1 ATOM 76 C CE . LYS 397 397 ? A 294.744 396.895 438.995 1 1 A LYS 0.800 1 ATOM 77 N NZ . LYS 397 397 ? A 296.097 397.197 438.482 1 1 A LYS 0.800 1 ATOM 78 N N . GLU 398 398 ? A 290.335 401.234 442.211 1 1 A GLU 0.800 1 ATOM 79 C CA . GLU 398 398 ? 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'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.755 2 1 3 0.021 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 390 GLU 1 0.650 2 1 A 391 ARG 1 0.690 3 1 A 392 ASP 1 0.790 4 1 A 393 LYS 1 0.780 5 1 A 394 TRP 1 0.760 6 1 A 395 ILE 1 0.800 7 1 A 396 LYS 1 0.810 8 1 A 397 LYS 1 0.800 9 1 A 398 GLU 1 0.800 10 1 A 399 LEU 1 0.810 11 1 A 400 LYS 1 0.790 12 1 A 401 SER 1 0.790 13 1 A 402 LEU 1 0.780 14 1 A 403 ASP 1 0.780 15 1 A 404 GLN 1 0.770 16 1 A 405 ALA 1 0.820 17 1 A 406 ILE 1 0.780 18 1 A 407 ASN 1 0.810 19 1 A 408 ASP 1 0.800 20 1 A 409 LYS 1 0.780 21 1 A 410 LYS 1 0.770 22 1 A 411 ARG 1 0.720 23 1 A 412 GLN 1 0.740 24 1 A 413 ILE 1 0.720 25 1 A 414 ALA 1 0.770 26 1 A 415 ALA 1 0.780 27 1 A 416 ILE 1 0.720 28 1 A 417 HIS 1 0.720 29 1 A 418 LYS 1 0.740 30 1 A 419 ASP 1 0.740 31 1 A 420 LEU 1 0.740 32 1 A 421 GLU 1 0.740 33 1 A 422 ASP 1 0.760 34 1 A 423 THR 1 0.760 35 1 A 424 GLU 1 0.750 36 1 A 425 ALA 1 0.810 37 1 A 426 ASN 1 0.780 38 1 A 427 LYS 1 0.760 39 1 A 428 GLU 1 0.740 40 1 A 429 LYS 1 0.710 41 1 A 430 ASN 1 0.680 42 1 A 431 LEU 1 0.620 43 1 A 432 GLU 1 0.590 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #