data_SMR-31c5ed885271fc7117ea6188611bf602_6 _entry.id SMR-31c5ed885271fc7117ea6188611bf602_6 _struct.entry_id SMR-31c5ed885271fc7117ea6188611bf602_6 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - O08788 (isoform 2)/ DCTN1_MOUSE, Dynactin subunit 1 Estimated model accuracy of this model is 0.008, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries O08788 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 160779.410 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP DCTN1_MOUSE O08788 1 ;MAQSRRHMSSRTPSGSRMSTEASARPLRVGSRVEVIGKGHRGTVAYVGATLFATGKWVGVILDEAKGKND GTVQGRKYFTCDEGHGIFVRQSQIQVFEDGADTTSPETPDSSASKVLKREGADAAAKTSKLRGLKPKKAP TARKTTTRRPKPTRPASTGVAGPSSSLGPSGSASAGELSSSEPSTPAQTPLAAPIIPTPALTSPGAAPPL PSPSKEEEGLRAQVRDLEEKLETLRLKRSEDKAKLKELEKHKIQLEQVQEWKSKMQEQQADLQRRLKEAR KEAKEALEAKERYMEEMADTADAIEMATLDKEMAEERAESLQQEVEALKERVDELTTDLEILKAEIEEKG SDGAASSYQLKQLEEQNARLKDALVRMRDLSSSEKQEHVKLQKLMEKKNQELEVVRQQRERLQEELSQAE STIDELKEQVDAALGAEEMVEMLTDRNLNLEEKVRELRETVGDLEAMNEMNDELQENARETELELREQLD MAGARVREAQKRVEAAQETVADYQQTIKKYRQLTAHLQDVNRELTNQQEASVERQQQPPPETFDFKIKFA ETKAHAKAIEMELRQMEVAQANRHMSLLTAFMPDSFLRPGGDHDCVLVLLLMPRLICKAELIRKQAQEKF DLSENCSERPGLRGAAGEQLSFAAGLVYSLSLLQATLHRYEHALSQCSVDVYKKVGSLYPEMSAHERSLD FLIELLHKDQLDETVNVEPLTKAIKYYQHLYSIHLAEQPEDSTMQLADHIKFTQSALDCMGVEVGRLRAF LQGGQEATDIALLLRDLETSCSDTRQFCKKIRRRMPGTDAPGIPAALAFGSQVSDTLLDCRKHLTWVVAV LQEVAAAAAQLIAPLAENEGLPVAALEELAFKASEQIYGSPSSSPYECLRQSCTILISTMNKLATAMQEG EYDAERPPSKPPPVELRAAALRAEITDAEGLGLKLEDRETVIKELKKSLKIKGEELSEANVRLSLLEKKL DSAAKDADERIEKVQTRLDETQTLLRKKEKDFEETMDALQADIDQLEAEKAELKQRLNSQSKRTIEGLVK DSPLLLQQISAMRLHISQLQHENSILRGAQMKASLAALPPLHVAKLSLPPHEGPGGNLVAGALYRKTSQL LEKLNQLSTHTHVVDITRSSPAAKSPSAQLMEQVAQLKSLSDTIEKLKDEVLKETVTQRPGATVPTDFAT FPSSAFLRAKEEQQDDTVYMGKVTFSCAAGLGQRHRLVLTQEQLHQLHSRLIS ; 'Dynactin subunit 1' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1243 1 1243 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . DCTN1_MOUSE O08788 O08788-2 1 1243 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2011-07-27 17BD5B9ED7CD2474 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MAQSRRHMSSRTPSGSRMSTEASARPLRVGSRVEVIGKGHRGTVAYVGATLFATGKWVGVILDEAKGKND GTVQGRKYFTCDEGHGIFVRQSQIQVFEDGADTTSPETPDSSASKVLKREGADAAAKTSKLRGLKPKKAP TARKTTTRRPKPTRPASTGVAGPSSSLGPSGSASAGELSSSEPSTPAQTPLAAPIIPTPALTSPGAAPPL PSPSKEEEGLRAQVRDLEEKLETLRLKRSEDKAKLKELEKHKIQLEQVQEWKSKMQEQQADLQRRLKEAR KEAKEALEAKERYMEEMADTADAIEMATLDKEMAEERAESLQQEVEALKERVDELTTDLEILKAEIEEKG SDGAASSYQLKQLEEQNARLKDALVRMRDLSSSEKQEHVKLQKLMEKKNQELEVVRQQRERLQEELSQAE STIDELKEQVDAALGAEEMVEMLTDRNLNLEEKVRELRETVGDLEAMNEMNDELQENARETELELREQLD MAGARVREAQKRVEAAQETVADYQQTIKKYRQLTAHLQDVNRELTNQQEASVERQQQPPPETFDFKIKFA ETKAHAKAIEMELRQMEVAQANRHMSLLTAFMPDSFLRPGGDHDCVLVLLLMPRLICKAELIRKQAQEKF DLSENCSERPGLRGAAGEQLSFAAGLVYSLSLLQATLHRYEHALSQCSVDVYKKVGSLYPEMSAHERSLD FLIELLHKDQLDETVNVEPLTKAIKYYQHLYSIHLAEQPEDSTMQLADHIKFTQSALDCMGVEVGRLRAF LQGGQEATDIALLLRDLETSCSDTRQFCKKIRRRMPGTDAPGIPAALAFGSQVSDTLLDCRKHLTWVVAV LQEVAAAAAQLIAPLAENEGLPVAALEELAFKASEQIYGSPSSSPYECLRQSCTILISTMNKLATAMQEG EYDAERPPSKPPPVELRAAALRAEITDAEGLGLKLEDRETVIKELKKSLKIKGEELSEANVRLSLLEKKL DSAAKDADERIEKVQTRLDETQTLLRKKEKDFEETMDALQADIDQLEAEKAELKQRLNSQSKRTIEGLVK DSPLLLQQISAMRLHISQLQHENSILRGAQMKASLAALPPLHVAKLSLPPHEGPGGNLVAGALYRKTSQL LEKLNQLSTHTHVVDITRSSPAAKSPSAQLMEQVAQLKSLSDTIEKLKDEVLKETVTQRPGATVPTDFAT FPSSAFLRAKEEQQDDTVYMGKVTFSCAAGLGQRHRLVLTQEQLHQLHSRLIS ; ;MAQSRRHMSSRTPSGSRMSTEASARPLRVGSRVEVIGKGHRGTVAYVGATLFATGKWVGVILDEAKGKND GTVQGRKYFTCDEGHGIFVRQSQIQVFEDGADTTSPETPDSSASKVLKREGADAAAKTSKLRGLKPKKAP TARKTTTRRPKPTRPASTGVAGPSSSLGPSGSASAGELSSSEPSTPAQTPLAAPIIPTPALTSPGAAPPL PSPSKEEEGLRAQVRDLEEKLETLRLKRSEDKAKLKELEKHKIQLEQVQEWKSKMQEQQADLQRRLKEAR KEAKEALEAKERYMEEMADTADAIEMATLDKEMAEERAESLQQEVEALKERVDELTTDLEILKAEIEEKG 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_entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 ALA . 1 3 GLN . 1 4 SER . 1 5 ARG . 1 6 ARG . 1 7 HIS . 1 8 MET . 1 9 SER . 1 10 SER . 1 11 ARG . 1 12 THR . 1 13 PRO . 1 14 SER . 1 15 GLY . 1 16 SER . 1 17 ARG . 1 18 MET . 1 19 SER . 1 20 THR . 1 21 GLU . 1 22 ALA . 1 23 SER . 1 24 ALA . 1 25 ARG . 1 26 PRO . 1 27 LEU . 1 28 ARG . 1 29 VAL . 1 30 GLY . 1 31 SER . 1 32 ARG . 1 33 VAL . 1 34 GLU . 1 35 VAL . 1 36 ILE . 1 37 GLY . 1 38 LYS . 1 39 GLY . 1 40 HIS . 1 41 ARG . 1 42 GLY . 1 43 THR . 1 44 VAL . 1 45 ALA . 1 46 TYR . 1 47 VAL . 1 48 GLY . 1 49 ALA . 1 50 THR . 1 51 LEU . 1 52 PHE . 1 53 ALA . 1 54 THR . 1 55 GLY . 1 56 LYS . 1 57 TRP . 1 58 VAL . 1 59 GLY . 1 60 VAL . 1 61 ILE . 1 62 LEU . 1 63 ASP . 1 64 GLU . 1 65 ALA . 1 66 LYS . 1 67 GLY . 1 68 LYS . 1 69 ASN . 1 70 ASP . 1 71 GLY . 1 72 THR . 1 73 VAL . 1 74 GLN . 1 75 GLY . 1 76 ARG . 1 77 LYS . 1 78 TYR . 1 79 PHE . 1 80 THR . 1 81 CYS . 1 82 ASP . 1 83 GLU . 1 84 GLY . 1 85 HIS . 1 86 GLY . 1 87 ILE . 1 88 PHE . 1 89 VAL . 1 90 ARG . 1 91 GLN . 1 92 SER . 1 93 GLN . 1 94 ILE . 1 95 GLN . 1 96 VAL . 1 97 PHE . 1 98 GLU . 1 99 ASP . 1 100 GLY . 1 101 ALA . 1 102 ASP . 1 103 THR . 1 104 THR . 1 105 SER . 1 106 PRO . 1 107 GLU . 1 108 THR . 1 109 PRO . 1 110 ASP . 1 111 SER . 1 112 SER . 1 113 ALA . 1 114 SER . 1 115 LYS . 1 116 VAL . 1 117 LEU . 1 118 LYS . 1 119 ARG . 1 120 GLU . 1 121 GLY . 1 122 ALA . 1 123 ASP . 1 124 ALA . 1 125 ALA . 1 126 ALA . 1 127 LYS . 1 128 THR . 1 129 SER . 1 130 LYS . 1 131 LEU . 1 132 ARG . 1 133 GLY . 1 134 LEU . 1 135 LYS . 1 136 PRO . 1 137 LYS . 1 138 LYS . 1 139 ALA . 1 140 PRO . 1 141 THR . 1 142 ALA . 1 143 ARG . 1 144 LYS . 1 145 THR . 1 146 THR . 1 147 THR . 1 148 ARG . 1 149 ARG . 1 150 PRO . 1 151 LYS . 1 152 PRO . 1 153 THR . 1 154 ARG . 1 155 PRO . 1 156 ALA . 1 157 SER . 1 158 THR . 1 159 GLY . 1 160 VAL . 1 161 ALA . 1 162 GLY . 1 163 PRO . 1 164 SER . 1 165 SER . 1 166 SER . 1 167 LEU . 1 168 GLY . 1 169 PRO . 1 170 SER . 1 171 GLY . 1 172 SER . 1 173 ALA . 1 174 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A 1 1029 GLU 1029 ? ? ? A . A 1 1030 LYS 1030 ? ? ? A . A 1 1031 ALA 1031 ? ? ? A . A 1 1032 GLU 1032 ? ? ? A . A 1 1033 LEU 1033 ? ? ? A . A 1 1034 LYS 1034 ? ? ? A . A 1 1035 GLN 1035 ? ? ? A . A 1 1036 ARG 1036 ? ? ? A . A 1 1037 LEU 1037 ? ? ? A . A 1 1038 ASN 1038 ? ? ? A . A 1 1039 SER 1039 ? ? ? A . A 1 1040 GLN 1040 ? ? ? A . A 1 1041 SER 1041 ? ? ? A . A 1 1042 LYS 1042 ? ? ? A . A 1 1043 ARG 1043 ? ? ? A . A 1 1044 THR 1044 ? ? ? A . A 1 1045 ILE 1045 ? ? ? A . A 1 1046 GLU 1046 ? ? ? A . A 1 1047 GLY 1047 ? ? ? A . A 1 1048 LEU 1048 ? ? ? A . A 1 1049 VAL 1049 ? ? ? A . A 1 1050 LYS 1050 ? ? ? A . A 1 1051 ASP 1051 ? ? ? A . A 1 1052 SER 1052 ? ? ? A . A 1 1053 PRO 1053 ? ? ? A . A 1 1054 LEU 1054 ? ? ? A . A 1 1055 LEU 1055 ? ? ? A . A 1 1056 LEU 1056 ? ? ? A . A 1 1057 GLN 1057 ? ? ? A . A 1 1058 GLN 1058 ? ? ? A . A 1 1059 ILE 1059 ? ? ? A . A 1 1060 SER 1060 ? ? ? A . A 1 1061 ALA 1061 ? ? ? A . A 1 1062 MET 1062 ? ? ? A . A 1 1063 ARG 1063 ? ? ? A . A 1 1064 LEU 1064 ? ? ? A . A 1 1065 HIS 1065 ? ? ? A . A 1 1066 ILE 1066 ? ? ? A . A 1 1067 SER 1067 ? ? ? A . A 1 1068 GLN 1068 ? ? ? A . A 1 1069 LEU 1069 ? ? ? A . A 1 1070 GLN 1070 ? ? ? A . A 1 1071 HIS 1071 ? ? ? A . A 1 1072 GLU 1072 ? ? ? A . A 1 1073 ASN 1073 ? ? ? A . A 1 1074 SER 1074 ? ? ? A . A 1 1075 ILE 1075 ? ? ? A . A 1 1076 LEU 1076 ? ? ? A . A 1 1077 ARG 1077 ? ? ? A . A 1 1078 GLY 1078 ? ? ? A . A 1 1079 ALA 1079 ? ? ? A . A 1 1080 GLN 1080 ? ? ? A . A 1 1081 MET 1081 ? ? ? A . A 1 1082 LYS 1082 ? ? ? A . A 1 1083 ALA 1083 ? ? ? A . A 1 1084 SER 1084 ? ? ? A . A 1 1085 LEU 1085 ? ? ? A . A 1 1086 ALA 1086 ? ? ? A . A 1 1087 ALA 1087 ? ? ? A . A 1 1088 LEU 1088 ? ? ? A . A 1 1089 PRO 1089 ? ? ? A . A 1 1090 PRO 1090 ? ? ? A . A 1 1091 LEU 1091 ? ? ? A . A 1 1092 HIS 1092 ? ? ? A . A 1 1093 VAL 1093 ? ? ? A . A 1 1094 ALA 1094 ? ? ? A . A 1 1095 LYS 1095 ? ? ? A . A 1 1096 LEU 1096 ? ? ? A . A 1 1097 SER 1097 ? ? ? A . A 1 1098 LEU 1098 ? ? ? A . A 1 1099 PRO 1099 ? ? ? A . A 1 1100 PRO 1100 ? ? ? A . A 1 1101 HIS 1101 ? ? ? A . A 1 1102 GLU 1102 ? ? ? A . A 1 1103 GLY 1103 ? ? ? A . A 1 1104 PRO 1104 ? ? ? A . A 1 1105 GLY 1105 ? ? ? A . A 1 1106 GLY 1106 ? ? ? A . A 1 1107 ASN 1107 ? ? ? A . A 1 1108 LEU 1108 ? ? ? A . A 1 1109 VAL 1109 ? ? ? A . A 1 1110 ALA 1110 ? ? ? A . A 1 1111 GLY 1111 ? ? ? A . A 1 1112 ALA 1112 ? ? ? A . A 1 1113 LEU 1113 ? ? ? A . A 1 1114 TYR 1114 ? ? ? A . A 1 1115 ARG 1115 ? ? ? A . A 1 1116 LYS 1116 ? ? ? A . A 1 1117 THR 1117 ? ? ? A . A 1 1118 SER 1118 ? ? ? A . A 1 1119 GLN 1119 ? ? ? A . A 1 1120 LEU 1120 ? ? ? A . A 1 1121 LEU 1121 ? ? ? A . A 1 1122 GLU 1122 ? ? ? A . A 1 1123 LYS 1123 ? ? ? A . A 1 1124 LEU 1124 ? ? ? A . A 1 1125 ASN 1125 ? ? ? A . A 1 1126 GLN 1126 ? ? ? A . A 1 1127 LEU 1127 ? ? ? A . A 1 1128 SER 1128 ? ? ? A . A 1 1129 THR 1129 ? ? ? A . A 1 1130 HIS 1130 ? ? ? A . A 1 1131 THR 1131 ? ? ? A . A 1 1132 HIS 1132 ? ? ? A . A 1 1133 VAL 1133 ? ? ? A . A 1 1134 VAL 1134 ? ? ? A . A 1 1135 ASP 1135 ? ? ? A . A 1 1136 ILE 1136 ? ? ? A . A 1 1137 THR 1137 ? ? ? A . A 1 1138 ARG 1138 ? ? ? A . A 1 1139 SER 1139 ? ? ? A . A 1 1140 SER 1140 ? ? ? A . A 1 1141 PRO 1141 ? ? ? A . A 1 1142 ALA 1142 ? ? ? A . A 1 1143 ALA 1143 ? ? ? A . A 1 1144 LYS 1144 ? ? ? A . A 1 1145 SER 1145 ? ? ? A . A 1 1146 PRO 1146 ? ? ? A . A 1 1147 SER 1147 ? ? ? A . A 1 1148 ALA 1148 ? ? ? A . A 1 1149 GLN 1149 ? ? ? A . A 1 1150 LEU 1150 ? ? ? A . A 1 1151 MET 1151 ? ? ? A . A 1 1152 GLU 1152 ? ? ? A . A 1 1153 GLN 1153 ? ? ? A . A 1 1154 VAL 1154 ? ? ? A . A 1 1155 ALA 1155 ? ? ? A . A 1 1156 GLN 1156 ? ? ? A . A 1 1157 LEU 1157 ? ? ? A . A 1 1158 LYS 1158 ? ? ? A . A 1 1159 SER 1159 ? ? ? A . A 1 1160 LEU 1160 ? ? ? A . A 1 1161 SER 1161 ? ? ? A . A 1 1162 ASP 1162 ? ? ? A . A 1 1163 THR 1163 ? ? ? A . A 1 1164 ILE 1164 ? ? ? A . A 1 1165 GLU 1165 ? ? ? A . A 1 1166 LYS 1166 ? ? ? A . A 1 1167 LEU 1167 ? ? ? A . A 1 1168 LYS 1168 ? ? ? A . A 1 1169 ASP 1169 ? ? ? A . A 1 1170 GLU 1170 ? ? ? A . A 1 1171 VAL 1171 ? ? ? A . A 1 1172 LEU 1172 ? ? ? A . A 1 1173 LYS 1173 ? ? ? A . A 1 1174 GLU 1174 ? ? ? A . A 1 1175 THR 1175 ? ? ? A . A 1 1176 VAL 1176 ? ? ? A . A 1 1177 THR 1177 ? ? ? A . A 1 1178 GLN 1178 ? ? ? A . A 1 1179 ARG 1179 ? ? ? A . A 1 1180 PRO 1180 ? ? ? A . A 1 1181 GLY 1181 ? ? ? A . A 1 1182 ALA 1182 ? ? ? A . A 1 1183 THR 1183 ? ? ? A . A 1 1184 VAL 1184 ? ? ? A . A 1 1185 PRO 1185 ? ? ? A . A 1 1186 THR 1186 ? ? ? A . A 1 1187 ASP 1187 ? ? ? A . A 1 1188 PHE 1188 ? ? ? A . A 1 1189 ALA 1189 ? ? ? A . A 1 1190 THR 1190 ? ? ? A . A 1 1191 PHE 1191 ? ? ? A . A 1 1192 PRO 1192 ? ? ? A . A 1 1193 SER 1193 ? ? ? A . A 1 1194 SER 1194 ? ? ? A . A 1 1195 ALA 1195 ? ? ? A . A 1 1196 PHE 1196 ? ? ? A . A 1 1197 LEU 1197 ? ? ? A . A 1 1198 ARG 1198 ? ? ? A . A 1 1199 ALA 1199 ? ? ? A . A 1 1200 LYS 1200 ? ? ? A . A 1 1201 GLU 1201 ? ? ? A . A 1 1202 GLU 1202 ? ? ? A . A 1 1203 GLN 1203 ? ? ? A . A 1 1204 GLN 1204 ? ? ? A . A 1 1205 ASP 1205 ? ? ? A . A 1 1206 ASP 1206 ? ? ? A . A 1 1207 THR 1207 ? ? ? A . A 1 1208 VAL 1208 ? ? ? A . A 1 1209 TYR 1209 ? ? ? A . A 1 1210 MET 1210 ? ? ? A . A 1 1211 GLY 1211 ? ? ? A . A 1 1212 LYS 1212 ? ? ? A . A 1 1213 VAL 1213 ? ? ? A . A 1 1214 THR 1214 ? ? ? A . A 1 1215 PHE 1215 ? ? ? A . A 1 1216 SER 1216 ? ? ? A . A 1 1217 CYS 1217 ? ? ? A . A 1 1218 ALA 1218 ? ? ? A . A 1 1219 ALA 1219 ? ? ? A . A 1 1220 GLY 1220 ? ? ? A . A 1 1221 LEU 1221 ? ? ? A . A 1 1222 GLY 1222 ? ? ? A . A 1 1223 GLN 1223 ? ? ? A . A 1 1224 ARG 1224 ? ? ? A . A 1 1225 HIS 1225 ? ? ? A . A 1 1226 ARG 1226 ? ? ? A . A 1 1227 LEU 1227 ? ? ? A . A 1 1228 VAL 1228 ? ? ? A . A 1 1229 LEU 1229 ? ? ? A . A 1 1230 THR 1230 ? ? ? A . A 1 1231 GLN 1231 ? ? ? A . A 1 1232 GLU 1232 ? ? ? A . A 1 1233 GLN 1233 ? ? ? A . A 1 1234 LEU 1234 ? ? ? A . A 1 1235 HIS 1235 ? ? ? A . A 1 1236 GLN 1236 ? ? ? A . A 1 1237 LEU 1237 ? ? ? A . A 1 1238 HIS 1238 ? ? ? A . A 1 1239 SER 1239 ? ? ? A . A 1 1240 ARG 1240 ? ? ? A . A 1 1241 LEU 1241 ? ? ? A . A 1 1242 ILE 1242 ? ? ? A . A 1 1243 SER 1243 ? ? ? A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Tektin-5 {PDB ID=8i7o, label_asym_id=DB, auth_asym_id=Fa, SMTL ID=8i7o.56.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 8i7o, label_asym_id=DB' 'target-template alignment' . 4 'model 6' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-25 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-20 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A DB 8 1 Fa # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MEFLGTTQTASFCGPKKGCGLQALPPAGQEPVVQECYQPFHLPGYRYLNAWRPSVFHKIATSQTIPEECS GIRRPPTILPSLRSALFCRYTPRDWDRSNDLQIRNAEASRLWASRLTGDSLRIMQDKDQLIHQMQEGTSR NLGQRLSDLGFWKSELCYELDRLLTENSSMDTLKRRLECAAEEVNCPLQVALECLYNREKRIGIDLVHDN VEKNLIREVDLLKCCQDQMRKLAKRIDFQIRDNRDAQHSLERDIEDKSSAQYIDENCFNLRSTSDSISFF HGVEKFDGTVSIPETWAKFSNDNIRHAQNMRANSIRLREEAEHLFETLSDQMWKQFTNTNLAFNARISEE TDVKNKLQTQLAKILQEIFQAENTIMLLERAIVAKEYPLKMAQTMLACRTRRPNVELCRDVPQFRLVNEV FTIDDTLQTLKLRLRETQDTLQLLVMTKSRLEHELAIKANTLCIDKDKCMSMRKSFPSTPRLTGYTCSAI GSGPYANHAPRISSGPCSGSALCKGPASCGGGASCGGGASCGGHAPCGSALCSHSVSRSGPGFAPVC ; ;MEFLGTTQTASFCGPKKGCGLQALPPAGQEPVVQECYQPFHLPGYRYLNAWRPSVFHKIATSQTIPEECS GIRRPPTILPSLRSALFCRYTPRDWDRSNDLQIRNAEASRLWASRLTGDSLRIMQDKDQLIHQMQEGTSR NLGQRLSDLGFWKSELCYELDRLLTENSSMDTLKRRLECAAEEVNCPLQVALECLYNREKRIGIDLVHDN VEKNLIREVDLLKCCQDQMRKLAKRIDFQIRDNRDAQHSLERDIEDKSSAQYIDENCFNLRSTSDSISFF HGVEKFDGTVSIPETWAKFSNDNIRHAQNMRANSIRLREEAEHLFETLSDQMWKQFTNTNLAFNARISEE TDVKNKLQTQLAKILQEIFQAENTIMLLERAIVAKEYPLKMAQTMLACRTRRPNVELCRDVPQFRLVNEV FTIDDTLQTLKLRLRETQDTLQLLVMTKSRLEHELAIKANTLCIDKDKCMSMRKSFPSTPRLTGYTCSAI GSGPYANHAPRISSGPCSGSALCKGPASCGGGASCGGGASCGGHAPCGSALCSHSVSRSGPGFAPVC ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 214 250 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8i7o 2023-12-06 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1243 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1243 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 13.000 13.514 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MAQSRRHMSSRTPSGSRMSTEASARPLRVGSRVEVIGKGHRGTVAYVGATLFATGKWVGVILDEAKGKNDGTVQGRKYFTCDEGHGIFVRQSQIQVFEDGADTTSPETPDSSASKVLKREGADAAAKTSKLRGLKPKKAPTARKTTTRRPKPTRPASTGVAGPSSSLGPSGSASAGELSSSEPSTPAQTPLAAPIIPTPALTSPGAAPPLPSPSKEEEGLRAQVRDLEEKLETLRLKRSEDKAKLKELEKHKIQLEQVQEWKSKMQEQQADLQRRLKEARKEAKEALEAKERYMEEMADTADAIEMATLDKEMAEERAESLQQEVEALKERVDELTTDLEILKAEIEEKGSDGAASSYQLKQLEEQNARLKDALVRMRDLSSSEKQEHVKLQKLMEKKNQELEVVRQQRERLQEELSQAESTIDELKEQVDAALGAEEMVEMLTDRNLNLEEKVRELRETVGDLEAMNEMNDELQENARETELELREQLDMAGARVREAQKRVEAAQETVADYQQTIKKYRQLTAHLQDVNRELTNQQEASVERQQQPPPETFDFKIKFAETKAHAKAIEMELRQMEVAQANRHMSLLTAFMPDSFLRPGGDHDCVLVLLLMPRLICKAELIRKQAQEKFDLSENCSERPGLRGAAGEQLSFAAGLVYSLSLLQATLHRYEHALSQCSVDVYKKVGSLYPEMSAHERSLDFLIELLHKDQLDETVNVEPLTKAIKYYQHLYSIHLAEQPEDSTMQLADHIKFTQSALDCMGVEVGRLRAFLQGGQEATDIALLLRDLETSCSDTRQFCKKIRRRMPGTDAPGIPAALAFGSQVSDTLLDCRKHLTWVVAVLQEVAAAAAQLIAPLAENEGLPVAALEELAFKASEQIYGSPSSSPYECLRQSCTILISTMNKLATAMQEGEYDAERPPSKPPPVELRAAALRAEITDAEGLGLKLEDRETVIKELKKSLKIKGEELSEANVRLSLLEKKLDSAAKDADERIEKVQTRLDETQTLLRKKEKDFEETMDALQADIDQLEAEKAELKQRLNSQSKRTIEGLVKDSPLLLQQISAMRLHISQLQHENSILRGAQMKASLAALPPLHVAKLSLPPHEGPGGNLVAGALYRKTSQLLEKLNQLSTHTHVVDITRSSPAAKSPSAQLMEQVAQLKSLSDTIEKLKDEVLKETVTQRPGATVPTDFATFPSSAFLRAKEEQQDDTVYMGKVTFSCAAGLGQRHRLVLTQEQLHQLHSRLIS 2 1 2 --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------NLIREVDLLKCCQDQMRKLAKRIDFQIRDNRDAQHSL---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8i7o.56' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 6' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . GLY 219 219 ? A 413.132 233.163 384.038 1 1 A GLY 0.760 1 ATOM 2 C CA . GLY 219 219 ? A 412.297 233.971 385.019 1 1 A GLY 0.760 1 ATOM 3 C C . GLY 219 219 ? A 411.467 233.150 385.987 1 1 A GLY 0.760 1 ATOM 4 O O . GLY 219 219 ? A 411.629 233.306 387.195 1 1 A GLY 0.760 1 ATOM 5 N N . LEU 220 220 ? A 410.629 232.194 385.518 1 1 A LEU 0.690 1 ATOM 6 C CA . LEU 220 220 ? A 409.928 231.204 386.344 1 1 A LEU 0.690 1 ATOM 7 C C . LEU 220 220 ? A 410.843 230.386 387.263 1 1 A LEU 0.690 1 ATOM 8 O O . LEU 220 220 ? A 410.494 230.077 388.382 1 1 A LEU 0.690 1 ATOM 9 C CB . LEU 220 220 ? A 409.092 230.246 385.459 1 1 A LEU 0.690 1 ATOM 10 C CG . LEU 220 220 ? A 407.892 230.915 384.751 1 1 A LEU 0.690 1 ATOM 11 C CD1 . LEU 220 220 ? A 407.413 230.078 383.550 1 1 A LEU 0.690 1 ATOM 12 C CD2 . LEU 220 220 ? A 406.723 231.115 385.730 1 1 A LEU 0.690 1 ATOM 13 N N . ARG 221 221 ? A 412.082 230.065 386.818 1 1 A ARG 0.740 1 ATOM 14 C CA . ARG 221 221 ? A 413.089 229.467 387.691 1 1 A ARG 0.740 1 ATOM 15 C C . ARG 221 221 ? A 413.513 230.307 388.907 1 1 A ARG 0.740 1 ATOM 16 O O . ARG 221 221 ? A 413.686 229.771 390.003 1 1 A ARG 0.740 1 ATOM 17 C CB . ARG 221 221 ? A 414.351 229.126 386.868 1 1 A ARG 0.740 1 ATOM 18 C CG . ARG 221 221 ? A 414.132 228.033 385.804 1 1 A ARG 0.740 1 ATOM 19 C CD . ARG 221 221 ? A 415.412 227.758 385.012 1 1 A ARG 0.740 1 ATOM 20 N NE . ARG 221 221 ? A 415.102 226.696 384.001 1 1 A ARG 0.740 1 ATOM 21 C CZ . ARG 221 221 ? A 415.958 226.323 383.039 1 1 A ARG 0.740 1 ATOM 22 N NH1 . ARG 221 221 ? A 417.140 226.917 382.901 1 1 A ARG 0.740 1 ATOM 23 N NH2 . ARG 221 221 ? A 415.651 225.326 382.212 1 1 A ARG 0.740 1 ATOM 24 N N . ALA 222 222 ? A 413.693 231.642 388.763 1 1 A ALA 0.840 1 ATOM 25 C CA . ALA 222 222 ? A 413.882 232.562 389.874 1 1 A ALA 0.840 1 ATOM 26 C C . ALA 222 222 ? A 412.634 232.640 390.762 1 1 A ALA 0.840 1 ATOM 27 O O . ALA 222 222 ? A 412.748 232.598 391.976 1 1 A ALA 0.840 1 ATOM 28 C CB . ALA 222 222 ? A 414.329 233.961 389.382 1 1 A ALA 0.840 1 ATOM 29 N N . GLN 223 223 ? A 411.414 232.657 390.158 1 1 A GLN 0.770 1 ATOM 30 C CA . GLN 223 223 ? A 410.153 232.580 390.897 1 1 A GLN 0.770 1 ATOM 31 C C . GLN 223 223 ? A 410.048 231.328 391.771 1 1 A GLN 0.770 1 ATOM 32 O O . GLN 223 223 ? A 409.715 231.433 392.949 1 1 A GLN 0.770 1 ATOM 33 C CB . GLN 223 223 ? A 408.921 232.624 389.948 1 1 A GLN 0.770 1 ATOM 34 C CG . GLN 223 223 ? A 408.713 233.978 389.231 1 1 A GLN 0.770 1 ATOM 35 C CD . GLN 223 223 ? A 407.533 233.905 388.256 1 1 A GLN 0.770 1 ATOM 36 O OE1 . GLN 223 223 ? A 406.480 233.350 388.544 1 1 A GLN 0.770 1 ATOM 37 N NE2 . GLN 223 223 ? A 407.687 234.495 387.049 1 1 A GLN 0.770 1 ATOM 38 N N . VAL 224 224 ? A 410.401 230.133 391.226 1 1 A VAL 0.820 1 ATOM 39 C CA . VAL 224 224 ? A 410.524 228.868 391.963 1 1 A VAL 0.820 1 ATOM 40 C C . VAL 224 224 ? A 411.516 228.960 393.100 1 1 A VAL 0.820 1 ATOM 41 O O . VAL 224 224 ? A 411.197 228.607 394.229 1 1 A VAL 0.820 1 ATOM 42 C CB . VAL 224 224 ? A 410.879 227.674 391.064 1 1 A VAL 0.820 1 ATOM 43 C CG1 . VAL 224 224 ? A 411.237 226.402 391.873 1 1 A VAL 0.820 1 ATOM 44 C CG2 . VAL 224 224 ? A 409.648 227.370 390.190 1 1 A VAL 0.820 1 ATOM 45 N N . ARG 225 225 ? A 412.720 229.514 392.861 1 1 A ARG 0.780 1 ATOM 46 C CA . ARG 225 225 ? A 413.702 229.675 393.911 1 1 A ARG 0.780 1 ATOM 47 C C . ARG 225 225 ? A 413.228 230.566 395.075 1 1 A ARG 0.780 1 ATOM 48 O O . ARG 225 225 ? A 413.223 230.145 396.226 1 1 A ARG 0.780 1 ATOM 49 C CB . ARG 225 225 ? A 414.987 230.261 393.266 1 1 A ARG 0.780 1 ATOM 50 C CG . ARG 225 225 ? A 416.139 230.432 394.268 1 1 A ARG 0.780 1 ATOM 51 C CD . ARG 225 225 ? A 417.470 231.022 393.768 1 1 A ARG 0.780 1 ATOM 52 N NE . ARG 225 225 ? A 417.254 232.434 393.314 1 1 A ARG 0.780 1 ATOM 53 C CZ . ARG 225 225 ? A 417.135 233.469 394.215 1 1 A ARG 0.780 1 ATOM 54 N NH1 . ARG 225 225 ? A 417.189 233.331 395.525 1 1 A ARG 0.780 1 ATOM 55 N NH2 . ARG 225 225 ? A 416.720 234.665 393.771 1 1 A ARG 0.780 1 ATOM 56 N N . ASP 226 226 ? A 412.733 231.791 394.774 1 1 A ASP 0.820 1 ATOM 57 C CA . ASP 226 226 ? A 412.239 232.749 395.751 1 1 A ASP 0.820 1 ATOM 58 C C . ASP 226 226 ? A 411.008 232.234 396.545 1 1 A ASP 0.820 1 ATOM 59 O O . ASP 226 226 ? A 410.913 232.421 397.763 1 1 A ASP 0.820 1 ATOM 60 C CB . ASP 226 226 ? A 411.918 234.098 395.030 1 1 A ASP 0.820 1 ATOM 61 C CG . ASP 226 226 ? A 413.113 234.853 394.432 1 1 A ASP 0.820 1 ATOM 62 O OD1 . ASP 226 226 ? A 414.291 234.585 394.778 1 1 A ASP 0.820 1 ATOM 63 O OD2 . ASP 226 226 ? A 412.844 235.755 393.598 1 1 A ASP 0.820 1 ATOM 64 N N . LEU 227 227 ? A 410.025 231.551 395.895 1 1 A LEU 0.800 1 ATOM 65 C CA . LEU 227 227 ? A 408.888 230.913 396.574 1 1 A LEU 0.800 1 ATOM 66 C C . LEU 227 227 ? A 409.267 229.733 397.483 1 1 A LEU 0.800 1 ATOM 67 O O . LEU 227 227 ? A 408.726 229.622 398.586 1 1 A LEU 0.800 1 ATOM 68 C CB . LEU 227 227 ? A 407.664 230.571 395.646 1 1 A LEU 0.800 1 ATOM 69 C CG . LEU 227 227 ? A 407.850 229.410 394.635 1 1 A LEU 0.800 1 ATOM 70 C CD1 . LEU 227 227 ? A 407.528 227.988 395.143 1 1 A LEU 0.800 1 ATOM 71 C CD2 . LEU 227 227 ? A 407.070 229.645 393.326 1 1 A LEU 0.800 1 ATOM 72 N N . GLU 228 228 ? A 410.200 228.835 397.071 1 1 A GLU 0.780 1 ATOM 73 C CA . GLU 228 228 ? A 410.715 227.731 397.884 1 1 A GLU 0.780 1 ATOM 74 C C . GLU 228 228 ? A 411.546 228.210 399.065 1 1 A GLU 0.780 1 ATOM 75 O O . GLU 228 228 ? A 411.323 227.778 400.198 1 1 A GLU 0.780 1 ATOM 76 C CB . GLU 228 228 ? A 411.517 226.711 397.033 1 1 A GLU 0.780 1 ATOM 77 C CG . GLU 228 228 ? A 410.621 225.940 396.027 1 1 A GLU 0.780 1 ATOM 78 C CD . GLU 228 228 ? A 411.354 224.928 395.140 1 1 A GLU 0.780 1 ATOM 79 O OE1 . GLU 228 228 ? A 412.608 224.881 395.148 1 1 A GLU 0.780 1 ATOM 80 O OE2 . GLU 228 228 ? A 410.624 224.195 394.418 1 1 A GLU 0.780 1 ATOM 81 N N . GLU 229 229 ? A 412.459 229.189 398.862 1 1 A GLU 0.790 1 ATOM 82 C CA . GLU 229 229 ? A 413.205 229.830 399.940 1 1 A GLU 0.790 1 ATOM 83 C C . GLU 229 229 ? A 412.259 230.485 400.944 1 1 A GLU 0.790 1 ATOM 84 O O . GLU 229 229 ? A 412.378 230.264 402.144 1 1 A GLU 0.790 1 ATOM 85 C CB . GLU 229 229 ? A 414.231 230.870 399.394 1 1 A GLU 0.790 1 ATOM 86 C CG . GLU 229 229 ? A 415.429 230.232 398.628 1 1 A GLU 0.790 1 ATOM 87 C CD . GLU 229 229 ? A 416.294 231.198 397.809 1 1 A GLU 0.790 1 ATOM 88 O OE1 . GLU 229 229 ? A 416.016 232.419 397.764 1 1 A GLU 0.790 1 ATOM 89 O OE2 . GLU 229 229 ? A 417.253 230.712 397.147 1 1 A GLU 0.790 1 ATOM 90 N N . LYS 230 230 ? A 411.217 231.219 400.480 1 1 A LYS 0.790 1 ATOM 91 C CA . LYS 230 230 ? A 410.164 231.728 401.347 1 1 A LYS 0.790 1 ATOM 92 C C . LYS 230 230 ? 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'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.752 2 1 3 0.008 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 219 GLY 1 0.760 2 1 A 220 LEU 1 0.690 3 1 A 221 ARG 1 0.740 4 1 A 222 ALA 1 0.840 5 1 A 223 GLN 1 0.770 6 1 A 224 VAL 1 0.820 7 1 A 225 ARG 1 0.780 8 1 A 226 ASP 1 0.820 9 1 A 227 LEU 1 0.800 10 1 A 228 GLU 1 0.780 11 1 A 229 GLU 1 0.790 12 1 A 230 LYS 1 0.790 13 1 A 231 LEU 1 0.770 14 1 A 232 GLU 1 0.730 15 1 A 233 THR 1 0.710 16 1 A 234 LEU 1 0.700 17 1 A 235 ARG 1 0.580 18 1 A 236 LEU 1 0.670 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #